细菌分类
初一生物细菌的分类总结
初一生物细菌的分类总结细菌是一类微生物，广泛存在于自然界中。
它们的分类可以根据形态、结构、代谢方式和氧需求等多个方面进行划分。
本文将对初一生物课程中所学的细菌分类进行总结。
一、形态分类细菌的形态分类是根据它们的形状和结构特征来区分的。
1. 球状细菌（Coccus）：这类细菌呈圆形，在显微镜下观察，它们看起来像小颗粒。
常见的球状细菌有葡萄球菌和链球菌。
2. 杆状细菌（Bacillus）：这类细菌呈长柱状，外形像细长的棍子。
大肠杆菌和炭疽杆菌就属于杆状细菌。
3. 螺旋细菌（Spirillum）：这类细菌呈螺旋状，外形像一根螺旋线。
铜绿假单胞菌和酿酒酵母就属于螺旋细菌。
二、结构分类细菌的结构分类主要考虑细菌体内是否有细胞壁和细胞膜的组成。
1. 革兰氏阳性菌（Gram-positive）：这类细菌的细胞壁含有厚厚的脂肪酸，显著染紫色。
革兰氏阳性菌包括葡萄球菌和链球菌。
2. 革兰氏阴性菌（Gram-negative）：这类细菌的细胞壁相对较薄，不易染色。
革兰氏阴性菌包括大肠杆菌和沙门氏菌。
三、代谢方式分类细菌的代谢方式分类是根据细菌的能量来源和碳源来区分的。
1. 好氧菌（Aerobic）：这类细菌需要氧气来进行代谢。
好氧菌包括绿色光合细菌和蓝藻菌。
2. 厌氧菌（Anaerobic）：这类细菌在缺氧环境下进行代谢，无需氧气。
厌氧菌包括产气荚膜梭菌和硫酸还原细菌。
四、氧需求分类细菌的氧需求分类考虑到细菌对氧气的需求量。
1. 嗜氧菌（Obligate aerobes）：这类细菌只能在充足的氧气条件下生长和繁殖。
典型的嗜氧菌有拟杆菌和放线菌。
2. 厌氧菌（Obligate anaerobes）：这类细菌只能在无氧环境中生长和繁殖。
典型的厌氧菌有产气荚膜梭菌和柱状硫杆菌。
3. 兼性厌氧菌（Facultative anaerobes）：这类细菌既可以在有氧条件下生长，也可以在无氧条件下生长。
典型的兼性厌氧菌是大肠杆菌和乳酸菌。
食品细菌的分类和鉴定
食品细菌的分类和鉴定一、细菌的分类细菌是一类微生物，广泛存在于自然界中的各个环境中，包括土壤、水体、空气以及人类和动物的体内。
根据细菌的形态、生理特征和遗传特征，可以将细菌分为不同的分类群。
目前，细菌的分类主要基于其形态特征、代谢方式和基因组序列等方面。
1. 形态分类根据细菌的形态特征，细菌可以分为球菌（如链球菌、葡萄球菌）、杆菌（如大肠杆菌、结核杆菌）、弯曲菌（如弯曲菌属）和螺旋菌（如梅毒螺旋菌）等。
形态分类是最早也是最常见的细菌分类方法之一。
2. 代谢分类根据细菌的代谢方式，细菌可以分为厌氧菌和好氧菌。
厌氧菌是指只能在无氧条件下生长和繁殖的细菌，而好氧菌则是指只能在有氧条件下生长和繁殖的细菌。
此外，还有一类兼性厌氧菌，即可以在有氧或无氧条件下生长的细菌。
3. 基因组分类近年来，随着基因测序技术的发展，基因组序列成为细菌分类的重要依据之一。
通过比较不同细菌的基因组序列，可以确定它们之间的亲缘关系，进而将它们分为不同的分类群。
这种基于基因组序列的分类方法被称为系统发育分类。
二、细菌的鉴定细菌的鉴定是指通过对细菌进行一系列的实验和观察，以确定其属于哪个分类群的过程。
细菌的鉴定对于食品安全和疾病防控具有重要意义。
1. 形态鉴定形态鉴定是最直观、最常用的细菌鉴定方法之一。
通过观察细菌的形态特征，如大小、形状、颜色等，可以初步确定细菌的分类群。
例如，链球菌是一种球形细菌，呈成串状排列；大肠杆菌是一种杆状细菌，呈短杆状。
2. 生理鉴定生理鉴定是通过观察细菌的生理特征，如代谢产物、酶活性等，来判断其分类群的方法。
例如，大肠杆菌可以产生酸和气体，而结核杆菌则不能。
这种方法需要在实验室中进行一系列的生理实验，需要一定的实验技巧和经验。
3. 分子鉴定随着分子生物学技术的进步，分子鉴定成为了细菌鉴定的重要手段之一。
通过提取细菌的基因组DNA，并使用特定的引物扩增目标基因，然后通过测序和比对，可以确定细菌的分类群。
常用的分子鉴定方法包括PCR、16S rRNA测序等。
常见细菌分类
肠杆菌1.肠杆菌属产气肠杆菌、阴沟肠杆菌、聚团肠杆菌、阿斯布肠杆菌、河生肠杆菌生物1群、河生肠杆菌生物2群、中间肠杆菌、格高非肠杆菌、阪崎肠杆菌、泰洛肠杆菌2.埃希菌属大肠埃希菌、福格森氏埃希菌、不活跃大肠埃希菌、伤口大肠埃希菌、赫尔曼氏埃希菌3.沙雷菌属粘质沙雷菌、深红沙雷菌、无花果沙雷菌、泉居沙雷菌、芳香沙雷菌1群、芳香沙雷菌2群、晋城沙雷菌、液化沙雷菌4.克雷伯菌属肺炎克雷伯菌、臭鼻克雷伯菌、鼻硬节克雷伯菌、产酸克雷伯菌、解鸟氨酸克雷伯菌5.变形杆菌属奇异变形杆菌属、普通变形杆菌、潘尼变形杆菌6.普罗威登斯菌属产碱普罗威登菌、斯图普罗威登菌、雷极普罗威登菌、拉氏普罗威登菌7.沙门菌属猪霍乱沙门菌、甲型副伤寒沙门菌、伤寒沙门菌、雏白利沙门菌8.枸橼酸杆菌弗旁地枸橼酸杆菌、异型枸橼酸杆菌、丙二酸盐阴性枸橼酸杆菌美洲爱文菌10.布特维西菌属水生布特维西菌11.爱德华菌属迟缓爱德华菌、保科爱德华菌12.巴提奥杆菌属乡间巴提奥杆菌13.哈夫尼亚菌属蜂房哈夫菌属14.西地西菌属戴氏西地西菌、拉氏西地西菌、奈氏西地西菌15.摩根菌属摩根摩根菌16志贺菌属志贺菌A，B，C 群、宋内志贺菌17.克吕沃菌属抗坏血酸克吕沃菌、栖冷克吕沃菌不脱羧莱克勒菌19 .默勒菌属威斯康星默勒菌20 拉恩菌属水生拉恩菌21.塔特姆菌属、痰塔特姆菌22．耶尔森菌属假结核耶尔森菌、小结肠炎耶尔森菌、中间耶尔森菌、克氏耶尔森菌、费氏耶尔森菌23．不动杆菌属洛菲不动杆菌、溶血不动杆菌、鲍曼不动杆菌、醋酸钙不动杆菌24. 寡养单胞菌属嗜麦芽窄单胞菌非发酵菌1.假单胞菌属铜绿假单胞菌、荧光假单胞菌、恶臭假单胞菌、施氏假单胞菌、门多萨假单胞菌、产碱假单胞菌、假产碱假单胞菌3.丛毛单胞菌属食酸丛毛单胞菌、睾丸酮丛毛单胞菌4.短波单胞菌属缺陷短波单胞菌、波囊短波单胞菌5.窄食单胞菌属嗜麦芽窄单胞菌6.产碱杆菌属木糖氧化产碱杆菌反硝化亚种、木糖氧化产碱杆菌木糖氧化亚种、粪产碱杆菌7. 不动杆菌属洛菲不动杆菌、醋酸钙不动杆菌、溶血不动杆菌、鲍曼不动杆菌8.黄杆菌属脑膜败血性黄杆菌、芳香黄杆菌、Ⅱb群黄杆菌、产吲哆黄杆菌9.威克斯菌属有毒威克斯菌、动物溃疡威克斯菌10.金色单胞菌属浅黄假单胞菌11.黄色单胞菌属12.弧菌属霍乱弧菌、副溶血弧菌、溶藻弧菌、河流弧菌、创伤弧菌13气单胞菌属嗜水气单胞菌、温和气单胞菌、杀鲑气单胞菌、舒伯特气单胞菌、豚鼠气单胞菌14邻单胞菌属类志贺邻单胞菌15巴斯德菌属多杀巴斯德菌、溶血巴斯德菌16莫拉氏菌属莫拉氏菌17谢瓦纳拉菌属腐败谢瓦纳拉菌.葡萄球菌/微球菌1．葡萄球菌属金黄色葡萄球菌，金黄色葡萄球菌厌氧亚种，表皮葡萄球菌，头葡萄球菌，解糖葡萄球菌，华纳葡萄球菌，溶血葡萄球菌，人葡萄球菌、路邓葡萄球菌、斯莱福葡萄球菌、耳葡萄球菌、腐生葡萄球菌、孔氏葡萄球菌、木糖葡萄球菌、阿莱特葡萄球菌、模仿葡萄球菌、中间葡萄球菌、猪葡萄球菌、缓慢葡萄球菌2. 微球菌属微球菌，易变微球菌，玫瑰微球菌，克里斯汀微球菌链球菌/肠球菌1肠球菌属酪黄肠球菌，粪肠球菌，屎肠球菌，鸟肠球菌，母鸡肠球菌，坚韧肠球菌2.草绿色链球菌属牛链球菌，唾液链球菌，血液链球菌，中间链球菌，缓症链球菌，变异链球菌群3.β溶血链球菌群化脓性链球菌，无乳链球菌，马链球菌，兽瘟链球菌，似马链球菌，停乳链球菌，β溶血链球菌4.咽峡炎链球菌群星座链球菌，咽峡炎链球菌5.孪生球菌属溶血孪生球菌，麻疹孪生球菌6.肺炎链球菌属肺炎链球菌7.气球菌属绿色气球菌真菌1.隐球菌属新型隐球菌，白色隐球菌，罗伦隐球菌，地生隐球菌，指甲隐球菌2.假丝酵母菌属白假丝酵母菌，白色假丝酵母菌生物变种，季也蒙假丝酵母菌，乳酒假丝酵母菌，克柔假丝酵母菌，溶脂假丝酵母菌，葡萄牙假丝酵母菌，近平滑假丝酵母菌、伪热带蒙假丝酵母菌、皱褶假丝酵母菌、热带假丝酵母菌、光滑假丝酵母菌、涏沫假丝酵母菌3.酵母属酿酒酵母菌4.丝孢酵母属白吉利丝孢酵母菌5.地霉属白地霉菌6.红酵母属粘红酵母菌，深红酵母菌7.毛孢子菌属白杰尔毛孢子菌8.地丝菌属念珠地丝菌。
(完整版)常见细菌分类
肠杆菌1.肠杆菌属产气肠杆菌、阴沟肠杆菌、聚团肠杆菌、阿斯布肠杆菌、河生肠杆菌生物1群、河生肠杆菌生物2群、中间肠杆菌、格高非肠杆菌、阪崎肠杆菌、泰洛肠杆菌2.埃希菌属大肠埃希菌、福格森氏埃希菌、不活跃大肠埃希菌、伤口大肠埃希菌、赫尔曼氏埃希菌3.沙雷菌属粘质沙雷菌、深红沙雷菌、无花果沙雷菌、泉居沙雷菌、芳香沙雷菌1群、芳香沙雷菌2群、晋城沙雷菌、液化沙雷菌4.克雷伯菌属肺炎克雷伯菌、臭鼻克雷伯菌、鼻硬节克雷伯菌、产酸克雷伯菌、解鸟氨酸克雷伯菌5.变形杆菌属奇异变形杆菌属、普通变形杆菌、潘尼变形杆菌6.普罗威登斯菌属产碱普罗威登菌、斯图普罗威登菌、雷极普罗威登菌、拉氏普罗威登菌7.沙门菌属猪霍乱沙门菌、甲型副伤寒沙门菌、伤寒沙门菌、雏白利沙门菌8.枸橼酸杆菌弗旁地枸橼酸杆菌、异型枸橼酸杆菌、丙二酸盐阴性枸橼酸杆菌9.爱文菌属美洲爱文菌10.布特维西菌属水生布特维西菌11.爱德华菌属迟缓爱德华菌、保科爱德华菌12.巴提奥杆菌属乡间巴提奥杆菌13.哈夫尼亚菌属蜂房哈夫菌属14.西地西菌属戴氏西地西菌、拉氏西地西菌、奈氏西地西菌15.摩根菌属摩根摩根菌16志贺菌属志贺菌A，B，C 群、宋内志贺菌17.克吕沃菌属抗坏血酸克吕沃菌、栖冷克吕沃菌18．莱克勒菌属不脱羧莱克勒菌19 .默勒菌属威斯康星默勒菌20 拉恩菌属水生拉恩菌21.塔特姆菌属、痰塔特姆菌22．耶尔森菌属假结核耶尔森菌、小结肠炎耶尔森菌、中间耶尔森菌、克氏耶尔森菌、费氏耶尔森菌23．不动杆菌属洛菲不动杆菌、溶血不动杆菌、鲍曼不动杆菌、醋酸钙不动杆菌24. 寡养单胞菌属嗜麦芽窄单胞菌非发酵菌1.假单胞菌属铜绿假单胞菌、荧光假单胞菌、恶臭假单胞菌、施氏假单胞菌、门多萨假单胞菌、产碱假单胞菌、假产碱假单胞菌2.伯克霍尔德氏菌属鼻疽伯克霍尔德氏菌、假鼻疽伯克霍尔德氏菌、洋葱伯克霍尔德氏菌、唐菖蒲伯克霍尔德氏菌3.丛毛单胞菌属食酸丛毛单胞菌、睾丸酮丛毛单胞菌4.短波单胞菌属缺陷短波单胞菌、波囊短波单胞菌5.窄食单胞菌属嗜麦芽窄单胞菌6.产碱杆菌属木糖氧化产碱杆菌反硝化亚种、木糖氧化产碱杆菌木糖氧化亚种、粪产碱杆菌7. 不动杆菌属洛菲不动杆菌、醋酸钙不动杆菌、溶血不动杆菌、鲍曼不动杆菌8.黄杆菌属脑膜败血性黄杆菌、芳香黄杆菌、Ⅱb群黄杆菌、产吲哆黄杆菌9.威克斯菌属有毒威克斯菌、动物溃疡威克斯菌10.金色单胞菌属浅黄假单胞菌11.黄色单胞菌属栖稻假单胞菌12.弧菌属霍乱弧菌、副溶血弧菌、溶藻弧菌、河流弧菌、创伤弧菌13气单胞菌属嗜水气单胞菌、温和气单胞菌、杀鲑气单胞菌、舒伯特气单胞菌、豚鼠气单胞菌14邻单胞菌属类志贺邻单胞菌15巴斯德菌属多杀巴斯德菌、溶血巴斯德菌16莫拉氏菌属莫拉氏菌17谢瓦纳拉菌属腐败谢瓦纳拉菌.葡萄球菌/微球菌1．葡萄球菌属金黄色葡萄球菌，金黄色葡萄球菌厌氧亚种，表皮葡萄球菌，头葡萄球菌，解糖葡萄球菌，华纳葡萄球菌，溶血葡萄球菌，人葡萄球菌、路邓葡萄球菌、斯莱福葡萄球菌、耳葡萄球菌、腐生葡萄球菌、孔氏葡萄球菌、木糖葡萄球菌、阿莱特葡萄球菌、模仿葡萄球菌、中间葡萄球菌、猪葡萄球菌、缓慢葡萄球菌2. 微球菌属微球菌，易变微球菌，玫瑰微球菌，克里斯汀微球菌链球菌/肠球菌1肠球菌属酪黄肠球菌，粪肠球菌，屎肠球菌，鸟肠球菌，母鸡肠球菌，坚韧肠球菌2.草绿色链球菌属牛链球菌，唾液链球菌，血液链球菌，中间链球菌，缓症链球菌，变异链球菌群3.β溶血链球菌群化脓性链球菌，无乳链球菌，马链球菌，兽瘟链球菌，似马链球菌，停乳链球菌，β溶血链球菌4.咽峡炎链球菌群星座链球菌，咽峡炎链球菌5.孪生球菌属溶血孪生球菌，麻疹孪生球菌6.肺炎链球菌属肺炎链球菌7.气球菌属绿色气球菌真菌1.隐球菌属新型隐球菌，白色隐球菌，罗伦隐球菌，地生隐球菌，指甲隐球菌2.假丝酵母菌属白假丝酵母菌，白色假丝酵母菌生物变种，季也蒙假丝酵母菌，乳酒假丝酵母菌，克柔假丝酵母菌，溶脂假丝酵母菌，葡萄牙假丝酵母菌，近平滑假丝酵母菌、伪热带蒙假丝酵母菌、皱褶假丝酵母菌、热带假丝酵母菌、光滑假丝酵母菌、涏沫假丝酵母菌3.酵母属酿酒酵母菌4.丝孢酵母属白吉利丝孢酵母菌5.地霉属白地霉菌6.红酵母属粘红酵母菌，深红酵母菌7.毛孢子菌属白杰尔毛孢子菌8.地丝菌属念珠地丝菌。
(完整)细菌分类
环丝菌属（Brochothrix)李斯特氏菌属(Listeria) (Paenibacillaceae) (Ammoniphilus）（Aneurinibacillus) (Brevibacillus)(Cohnella)（Oxalophagus）（Paenibacillus)（Thermicanus)（Thermobacillus）(Planococcaceae)(Filibacter）(Kurthia）(Planococcus)（Planomicrobium)（Sporosarcina)芽孢乳杆菌科(Sporolactobacillaceae) (Marinococcus)（Sinococcus）芽孢乳杆菌属(Sporolactobacillus) （Tuberibacillus)葡萄球菌科（Staphylococcaceae）孪生菌属(Gemella)(Joetgalicoccus) （Macrococcus）(Salinicoccus）葡萄球菌属(Staphylococcus）（Thermoactinomycetaceae）(Laceyella）(Mechercharimyces) （Planifilum）(Seinonella) （Shimazuella) （Thermoactinomyces) (Thermoflavimicrobium）(Turicibacteraceae）（Turicibacter)科未定（Pullulanibacillus)乳杆菌目（Lactobacillales) 气球菌科(Aerococcaceae）（Abiotrophia）气球菌属（Aerococcus) (Dolosicoccus）（Eremococcus）（Facklamia）（Globicatella)（Ignavigranum）肉杆菌科（Carnobacteriaceae)（Agitococcus）(Alkalibacterium）(Allofustis)（Alloiococcus）(Atopococcus)（Atopostipes)肉杆菌属（Carnobacterium）德库菌属(Desemzia) （DSMZ,德国微生物与细胞保藏中心) （Dolosigranulum）（Granulicatella）（Isobaculum）(Lactosphaera)（Marinilactibacillus）（Trichococcus)肠球菌科(Enterococcaceae）（Atopobacter)（Catellicoccus)肠球菌属(Enterococcus）（Melissococcus）（Pilibacter)(Tetragenococcus)漫游球菌属（Vagococcus）乳杆菌科(Lactobacillaceae)乳杆菌属（Lactobacillus）(Paralactobacillus)片球菌属（Pediococcus)明串珠菌科（Leuconostocaceae）明串珠菌属（Leuconostoc) (Oenococcus）(Weissella)颤螺旋菌科(Oscillospiraceae）颤杆菌克（Oscillibacter)颤螺旋菌属(Oscillospira)链球菌科(Streptococcaceae）乳球菌属(Lactococcus）（Lactovum）链球菌属(Streptococcus）科未定（Acetoanaerobium）互营球菌属(Syntrophococcus）梭菌纲（Clostridia）梭菌目(Clostridiales）梭菌科(Clostridiaceae) (Acetanaerobacterium) (Acetivibrio）(Acidaminobacter)(Alkaliphilus) （Anaerobacter) （Anaerotruncus）(Anoxynatronum）(Bryantella) （Caloramator) (Caloranaerobacter) （Caminicella）(Clostridiisalibacter）梭菌属（Clostridium）(Coprobacillus）(Dorea）(Ethanoligenens）（Faecalibacterium) （Fastidiosipila) （Garciella）（Gracilibacter）(Guggenheimella）(Hespellia) (Natronincola）（Oxobacter) （Parasporobacterium）八叠球菌属（Sarcina) （Soehngenia）（Sporacetigenium）（Sporobacter) （Subdoligranulum) （Tepidibacter) (Tepidimicrobium) (Thermobrachium) (Thermohalobacter) (Tindallia）优杆菌科(Eubacteriaceae)醋杆菌属(Acetobacterium) （Alkalibacter) (Anaerofustis）（Anaerovorax)优杆菌属(Eubacterium) (Mogibacterium）（Pseudoramibacter)太阳杆菌科(Heliobacteriaceae）太阳杆状菌属（Heliobacillus) 太阳杆菌属(Heliobacterium)嗜日菌属（Heliophilum）(Heliorestis)毛螺旋菌科（Lachnospiraceae) (Acetitomaculum）(Anaerofilum）(Anaerostipes）丁酸弧菌属(Butyrivibrio）（Catenibacterium)(Catonella)粪球菌属(Coprococcus) （Johnsonella）(Lachnobacterium）毛螺旋菌属(Lachnospira) （Moryella)(Oribacterium）假丁酸弧菌属（Pseudobutyrivibrio）(Roseburia)瘤胃球菌属(Ruminococcus）(Shuttleworthia）(Sporobacterium)消化球菌科（Peptococcaceae）(Carboxydothermus）(Cryptanaerobacter）（Dehalobacter）(Desulfitobacterium）(Desulfonispora) （Desulfosporosinus) （Desulfotomaculum) (Pelotomaculum)消化球菌属（Peptococcus) (Syntrophobotulus）（Thermincola)(Thermoterrabacterium)消化链球菌科(Peptostreptococcaceae）（Anaerococcus)(Filifactor）（Finegoldia)(Fusibacter）（Gallicola)（Helcococcus）微单胞菌属（Parvimonas）（原名Micromonas）(Peptoniphilus)消化链球菌属(Peptostreptococcus）(Sedimentibacter)（Sporanaerobacter)（Tissierella）互营单胞菌科(Syntrophomonadaceae）(Aminiphilus）（Aminobacterium）（Aminomonas）（Anaerobaculum)(Anaerobranca)（Caldicellulosiruptor)（Carboxydocella) （Dethiosulfovibrio）（Pelospora）互营单胞菌属(Syntrophomonas) （Syntrophospora）互营热菌属(Syntrophothermus) （Thermaerobacter）(Thermanaerovibrio) （Thermohydrogenium）(Thermosyntropha）（Thermovirga）韦荣氏菌科(Veillonellaceae）（Acetonema）氨基酸球菌属(Acidaminococcus）(Allisonella）（Anaeroarcus) （Anaeroglobus) (Anaeromusa）(Anaerosinus) (Anaerovibrio）(Centipeda）（Dendrosporobacter) （Dialister）（Megamonas）(Megasphaera)光冈菌属(Mitsuokella) （Papillibacter）(Pectinatus）(Pelosinus) （Phascolarctobacterium) （Propionispira) (Propionispora）(Quinella)(Schwartzia）新月形单胞菌属（Selenomonas) 鼠孢菌属(Sporomusa）（Sporotalea) （Succiniclasticum）（Succinispira) (Thermosinus)韦荣氏菌属（Veillonella) （Zymophilus)科未定（Anaerovirgula）(Dethiosulfatibacter）（Geosporobacter) （Howardella) (Proteiniborus)盐厌氧菌目(Halanaerobiales）盐厌氧菌科（Halanaerobiaceae)盐厌氧菌属（Halanaerobium) (Halocella)（Haloincola)(Halothermothrix)盐拟杆菌科（Halobacteroidaceae）(Acetohalobium）（Halanaerobacter)盐拟杆菌属(Halobacteroides) (Halonatronum)（Natroniella）（Orenia）(Selenihalanaerobacter）（Sporohalobacter）盐碱厌氧菌目（Natranaerobiales）盐碱厌氧菌科（Natranaerobiaceae)盐碱厌氧菌属(Natranaerobius）热厌氧杆菌目(Thermoanaerobacteriales）热厌氧杆菌科(Thermoanaerobacteriaceae）(Acetogenium)(Ammonifex）(Caldanaerobacter）(Carboxydibrachium)（Coprothermobacter) (Desulfovirgula）(Gelria）（Mahella）(Moorella）(Sporotomaculum) （Tepidanaerobacter）（Thermacetogenium)热厌氧单胞菌属(Thermanaeromonas) （Thermoanaerobacter) (Thermoanaerobium) (Thermoanaerobacterium)热厌氧菌属（Thermoanaerobium) (Thermobacteroides）（Thermosediminibacter) （Thermovenabulum)热脱硫菌科（Thermodesulfobiaceae）热脱硫菌属（Thermodesulfobium）目未定(Desulfitibacter) （Symbiobacterium）热石杆菌纲(Thermolithobacteria)热石杆菌目（Thermolithobacterales）热石杆菌科(Thermolithobacteraceae）热石杆菌属（Thermolithobacter）梭杆菌门（Fusobacteria)梭杆菌纲（Fusobacteria）梭杆菌目（Fusobacteriales）梭杆菌科（Fusobacteriaceae)梭杆菌属(Fusobacterium）(Ilyobacter)纤毛菌属（Leptotrichia）（Propionigenium)（Sebaldella）（Sneathia)(Streptobacillus)科未定(Cetobacterium)芽单胞菌门(Gemmatimonadetes）芽单胞菌纲（Gemmatimonadetes)芽单胞菌目（Gemmatimonadales）芽单胞菌科(Gemmatimonadaceae）芽单胞菌属(Gemmatimonas）黏胶球形菌门（Lentisphaerae)黏胶球形菌纲(Lentisphaerae）黏胶球形菌目(Lentisphaerales)黏胶球形菌科（Lentisphaeraceae) 黏胶球形菌属（Lentisphaera)食物谷菌目（Victivallales）食物谷菌科（Victivallaceae）食物谷菌属(Victivallis)硝化螺旋菌门（Nitrospirae)硝化螺旋菌纲（Nitrospira)硝化螺旋菌目（Nitrospirales）硝化螺旋菌科（Nitrospiraceae）钩端螺菌属(Leptospirillum)硝化螺旋菌属(Nitrospira）磁杆菌属（Magnetobacterium）*热脱硫弧菌属(Thermodesulfovibrio）浮霉菌门（Planctomycetes）浮霉菌纲（Planctomycetacia）浮霉菌目(Planctomycetales）浮霉菌科(Planctomycetaceae) (Blastopirellula)(Gemmata)(Isosphaera）小梨形菌属(Pirellula)浮霉菌属（Planctomycetes)红小梨形菌属（Rhodopirellula）（Schlesneria）科未定（均未能分离培养，见厌氧氨氧化菌）(Brocadia)*(Kuenenia)＊(Scalindua）＊海绵杆菌门(Poribacteria)*变形菌门（Proteobacteria)α—变形菌纲（Alphaproteobacteria)柄杆菌目（Caulobacterales)柄杆菌科(Caulobacteraceae）(Asticcacaulis）短波单胞菌属(Brevundimonas)柄杆菌属（Caulobacter）苯基杆菌属(Phenylobacterium）（Kordiimonadales）（Kordiimonadaceae）（Kordiimonas）短小盒菌目（Parvularculales)短小盒菌科(Parvularculaceae）短小盒菌属(Parvularcula)根瘤菌目(Rhizobiales)橙单胞菌科（Aurantimonadaceae）橙单胞菌属（Aurantimonas）（Fulvimarina）（Martelella）巴通体科（Bartonellaceae)巴通体属(Bartonella) （Grahamella）（Rochalimaea）拜叶林克氏菌科（Beijerinckiaceae) 拜叶林克氏菌属(Beijerinckia) （Chelatococcus）(Methylocapsa)(Methylocella）慢生根瘤菌科（Bradyrhizobiaceae) 阿菲波菌属（Afipia)农单胞菌属（Agromonas) （Balneimonas)芽生杆菌属（Blastobacter）（Bosea)慢生根瘤菌属（Bradyrhizobium)硝化杆菌属(Nitrobacter）(Oligotropha）（Rhodoblastus)红假单胞菌属(Rhodopseudomonas）布鲁氏菌科（Brucellaceae）布鲁氏菌属（Brucella) （Crabtreella)（Daeguia）支动菌属(Mycoplana)苍白杆菌属（Ochrobactrum) （Pseudochrobactrum)黏着杆菌科(Cohaesibacteraceae) 黏着杆菌属（Cohaesibacter）生丝微菌科（Hyphomicrobiaceae) (Ancalomicrobium）(Angulomicrobium)水杆菌属(Aquabacter）芽绿菌属(Blastochloris）（Devosia）（Dichotomicrobium) (Filomicrobium)(Gemmiger)生丝微菌属(Hyphomicrobium）(Methylorhabdus)土微菌属（Pedomicrobium）突柄微菌属（Prosthecomicrobium) 红微菌属（Rhodomicrobium）（Rhodoplanes）（Seliberia）甲基杆菌科(Methylobacteriaceae）(Meganema)甲基杆菌属（Methylobacterium）（Microvirga）（Protomonas)甲基孢囊菌科（Methylocystaceae）(Albibacter)甲基孢囊菌属(Methylocystis) （Methylopila) （Methylosinus）（Pleomorphomonas）（Terasakiella）叶杆菌科（Phyllobacteriaceae) (Aminobacter）（Aquamicrobium）（Defluvibacter）（Hoeflea）中慢生根瘤菌属（Mesorhizobium) （Nitratireductor)叶杆菌属（Phyllobacterium) （Pseudaminobacter）根瘤菌科（Rhizobiaceae)土壤杆菌属(Agrobacterium）异根瘤菌属（Allorhizobium)嗜碳菌属(Carbophilus)螯合杆菌属(Chelatobacter)剑菌属（Ensifer)(Kaistia)韧皮杆菌属（Liberibacter)*根瘤菌属(Rhizobium）中华根瘤菌属(Sinorhizobium)红菌科(Rhodobiaceae) (Anderseniella) （Parvibaculum)红菌属(Rhodobium）玫瑰螺菌属(Roseospirillum）黄色杆菌科（Xanthobacteraceae) (Ancylobacter) (Azorhizobium)(Labrys）（Pseudolabrys）(Starkeya)黄色杆菌属（Xanthobacter)科未定（Sneathiella）红杆菌目（Rhodobacterales)生丝单胞菌科(Hyphomonadaceae) (Hirschia）生丝单胞菌属（Hyphomonas）(Maricaulis)（Oceanicaulis) （Robiginitomaculum)红杆菌科（Rhodobacteraceae）（Ahrensia）(Albidovulum）（Amaricoccus）(Antarctobacter) (Catellibacterium）（Citreicella）（Citreimonas）（Dinoroseobacter) （Donghicola）(Gemmobacter）(Haematobacter) （Jannaschia）（Ketogulonicigenium) (Labrenzia)(Leisingera）（Loktanella）（Maribius）（Marinovum) （Maritimibacter）（Methylarcula）（Nereida)（Nesiotobacter) (Oceanibulbus)海洋生菌属(Oceanicola) （Octadecabacter）（Palleronia) （Pannonibacter)副球菌属（Paracoccus) （Pelagibaca)(Phaeobacter）假红杆菌属（Pseudorhodobacter) （Pseudovibrio）（Rhodobaca）红杆菌属（Rhodobacter) (Rhodothalassium）小红卵菌属(Rhodovulum）(Roseibacterium) (Roseibium）（Roseicyclus）（Roseinatronobacter）(Roseisalinus）（Roseivivax）玫瑰杆菌属（Roseobacter）(Roseovarius）（Rubellimicrobium）(Rubrimonas）(Ruegeria)(Sagittula）(Salipiger)(Shimia)(Silicibacter）(Staleya)(Stappia）（Sulfitobacter) (Tateyamaria）（Thalassobacter) （Thalassobius）(Thalassococcus) (Thioclava)硫球形菌属（Thiosphaera) (Wenxinia)木洞菌属(Woodsholea)杨氏菌属(Yangia）红螺菌目(Rhodospirillales) 醋杆菌科(Acetobacteraceae)醋杆菌属(Acetobacter) (Acidicaldus)嗜酸菌属(Acidiphilium)酸球形菌属（Acidisphaera）酸胞菌属(Acidocella）酸单胞菌属（Acidomonas) (Asaia)(Belnapia)脆弱球菌属(Craurococcus）葡糖醋杆菌属（Gluconacetobacter) 葡糖杆菌属（Gluconobacter) (Granulibacter)(Kozakia）鼠球菌属（Muricoccus）（Neoasaia）(Paracraurococcus）红球状菌属（Rhodopila）(Rhodovarius)玫瑰球菌属(Roseococcus)玫瑰单胞菌属(Roseomonas) (Rubritepida)（Saccharibacter)(Stella)（Swaminathania）(Teichococcus) (Zavarzinia）红螺菌科（Rhodospirillaceae) 固氮螺菌属（Azospirillum) （Conglomeromonas）(Defluviicoccus）(Inquilinus）磁螺菌属(Magnetospirillum）(Phaeospirillum) (Rhodocista）红螺旋菌属（Rhodospira)红螺菌属(Rhodospirillum）红弧菌属（Rhodovibrio)玫瑰螺旋菌属（Roseospira) （Skermanella) (Telmatospirillum) （Thalassospira）（Tistrella）立克次体目(Rickettsiales）无形体科(Anaplasmataceae）(Aegyptianella)无形体属(Anaplasma) （Cowdria)埃里希体属（Ehrlichia）新立克次体属(Neorickettsia）沃巴赫体属（Wolbachia）（Xenohaliotis)*全孢菌科(Holosporaceae）全孢菌属（Holospora）立克次体科(Rickettsiaceae) (Orientia）立克次体属（Rickettsia）SAR 11群*远洋杆菌属（Pelagibacter)*科未定(Lyticum）（Odyssella)＊(Pseudocaedibacter）（Symbiotes）(Tectibacter)鞘脂单胞菌目(Sphingomonadales) 赤杆菌科（Erythrobacteraceae）（Altererythrobacter)赤杆菌属(Erythrobacter）赤微菌属（Erythromicrobium）紫杆菌属（Porphyrobacter）鞘脂单胞菌科（Sphingomonadaceae）芽单胞菌属(Blastomonas）柠檬酸微菌属（Citromicrobium）＊赤单胞菌属（Erythromonas）新鞘脂菌属（Novosphingobium）(Sandaracinobacter）(Sandaracinorhabdus）鞘脂菌属（Sphingobium）鞘脂单胞菌属（Sphingomonas) (Sphingopyxis）（Sphingosinicella）发酵单胞菌属(Zymomonas）目未定（Albimonas）(Caenispirillum）(Insolitispirillum）(Novispirillum)β-变形菌纲(Betaproteobacteria) 伯克氏菌目（Burkholderiales)产碱菌科(Alcaligenaceae)无色杆菌属（Achromobacter）(Advenella）产碱菌属(Alcaligenes) (Azohydromonas)博德氏菌属(Bordetella）(Brackiella）(Castellaniela)德克斯氏菌属（Derxia) (Kerstersia）（Oligella）(Pelistega) （Pigmentiphaga）（Pusillimonas）(Sutterella）（Taylorella）（Tetrathiobacter）伯克氏菌科（Burkholderiaceae）伯克氏菌属（Burkholderia) (Chitinimonas) (Cupriavidus）（Lautropia)(Limnobacter)(Pandoraea）(Paucimonas）（Polynucleobacter)青枯菌属（Ralstonia）(Thermothrix)沃特氏菌属（Wautersia）丛毛单胞菌科（Comamonadaceae) 食酸菌属（Acidovorax）(Alcycliphilus）（Brachymonas) (Caenibacterium) (Caldimonas）丛毛单胞菌属（Comamonas) (Curvibacter)代尔夫特菌属(Delftia) (Diaphorobacter）（Giesbergeria）噬氢菌属（Hydrogenophaga) (Hylemonella) (Lampropedia) (Macromonas）(Malikia)（Ottowia）(Pelomonas）(Polaromonas）（Ramlibacter)红育菌属（Rhodoferax）（Schlegelella）(Simplicispira）贪食菌属（Variovorax) （Xenophilus)草酸杆菌科(Oxalobacteraceae)(Collimonas) （Duganella) （Herbaspirillum）（Herminiimonas）（Janthinobacterium) (Massilia) （Naxibacter) (Oxalicibacterium）草酸杆菌属(Oxalobacter) (Telluria）(Undibacterium）科未定（Aquabacterium）（Aquincola）(Ideonella)纤发菌属（Leptothrix）（Methylibium）(Mitsuaria) （Paucibacter) (Roseateles)红长命菌属(Rubrivivax) (Sphaerotilus）(Tepidicella）（Tepidimonas）(Thiobacter)硫单胞菌属（Thiomonas) （Xylophilus）嗜氢菌目(Hydrogenophilales）嗜氢菌科（Hydrogenophilaceae）嗜氢菌属（Hydrogenophilus）(Petrobacter）（Tepidiphilus)硫杆状菌属(Thiobacillus）嗜甲基菌目(Methylophilales) 嗜甲基菌科(Methylophilaceae）(Methylobacillus）嗜甲基菌属（Methylophilus) (Methylotenera）（Methylovorus）奈瑟菌目(Neisseriales）奈瑟菌科(Neisseriaceae) （Alysiella）（Andreprevotia）水螺菌属（Aquaspirillum) （Aquitalea）(Bergeriella) (Chitinibacter) （Chitinilyticum)色杆菌属（Chromobacterium) （Conchiformibius）(Deefgea）艾肯氏菌属（Eikenella) （Formivibrio）(Gulbenkiania）(Iodobacter）金氏菌属（Kingella)鸥杆菌属(Laribacter)（Leeia）（Microvirgula）(Morococcus）奈瑟菌属（Neisseria) （Paludibacterium) （Prolinoborus）(Silvimonas）(Simonsiella）（Uruburuella）（Vitreoscilla）(Vogesella)亚硝化单胞菌目（Nitrosomonadales) 嘉利翁氏菌科（Gallionellaceae）嘉利翁氏菌属(Gallionella)亚硝化单胞菌科（Nitrosomonadaceae)亚硝化叶菌属（Nitrosolobus）亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)亚硝化螺旋菌属(Nitrosospira)螺菌科（Spirillaceae)螺菌属（Spirillum)普罗卡杆菌目（Procabacteriales)＊普罗卡杆菌科(Procabacteriaceae）＊普罗卡杆菌属（Procabacter）*红环菌目(Rhodocyclales）红环菌科(Rhodocyclaceae）固氮弓菌属(Azoarcus）(Azonexus)(Azospira）(Azovibrio)(Dechloromonas）（Dechlorosoma）（Denitratisoma）（Ferribacterium) (Methyloversatilis)丙酸杆菌属（Propionibacter）（Propionivibrio）(Quatrionicoccus）红环菌属(Rhodocyclus）(Shinella)(Sterolibacterium）陶厄氏菌属(Thauera) （Uliginosibacterium)动胶菌属（Zoogloea)δ—变形菌纲(Deltaproteobacteria）蛭弧菌目(Bdellovibrionales) (Bacteriovoracaceae) （Bacteriovorax)(Peredibacter）蛭弧菌科（Bdellovibrionaceae）蛭弧菌属（Bdellovibrio) （Micavibrio)(Vampirovibrio）脱硫盒菌目(Desulfarculales)脱硫盒菌科（Desulfarculaceae)脱硫盒菌属（Desulfarculus)脱硫杆菌目（Desulfobacterales）脱硫杆菌科(Desulfobacteraceae）(Desulfatibacillum) （Desulfatiferula）（Desulfatirhabdium)脱硫杆菌属（Desulfobacter) (Desulfobacterium) (Desulfobacula)（Desulfocella) （Desulfococcus) (Desulfofaba) (Desulfofrigus) (Desulfomusa）（Desulfonema）（Desulforegula）(Desulfosarcina）（Desulfospira）（Desulfotignum) （Desulfobulbaceae) （Desulfobulbus) (Desulfocapsa) （Desulfofustis）(Desulfopila) （Desulforhopalus）（Desulfotalea）(Nitrospinaceae) （Nitrospina)脱硫弧菌目(Desulfovibrionales) (Desulfohalobiaceae) （Desulfohalobium) （Desulfonatronovibrio)(Desulfothermus）（Desulfovermiculus) （Desulfomicrobiaceae）（Desulfomicrobium）（Desulfonatronaceae）（Desulfonatronum）脱硫弧菌科（Desulfovibrionaceae) (Bilophila）（Desulfomonas）脱硫弧菌属(Desulfovibrio) （Lawsonia）硫还原菌目（Desulfurellales)硫还原菌科（Desulfurellaceae）硫还原菌属(Desulfurella）（Hippea）除硫单胞菌目(Desulfuromonadales）除硫单胞菌科(Desulfuromonadaceae) 除硫单胞菌属（Desulfuromonas）（Desulfuromusa）(Malonomonas)(Pelobacter)地杆菌科（Geobacteraceae) （Geoalkalibacter)地杆菌属(Geobacter）（Geopsychrobacter）(Geothermobacter) (Trichlorobacter）黏球菌目(Myxococcales)孢囊杆菌亚目（Cystobacterineae) 孢囊杆菌科(Cystobacteraceae) （Anaeromyxobacter）(Archangium）孢囊杆菌属(Cystobacter）(Hyalangium)（Melittangium）(Stigmatella)黏球菌科（Myxococcaceae）(Angiococcus）(Corallococcus)黏球菌属（Myxococcus）(Pyxidicoccus)侏囊菌亚目（Nannocystineae）（Haliangiaceae) （Haliangium）(Kofleriaceae)（Kofleria）侏囊菌科(Nannocystaceae)(Enhygromyxa)侏囊菌属（Nannocystis）(Plesiocystis）堆囊菌亚目（Sorangineae）多囊菌科(Polyangiaceae) (Byssovorax）（Chondromyces) （Haploangium）*（Jahnella）多囊菌属(Polyangium）堆囊菌属(Sorangium)互营杆菌目(Syntrophobacterales) 互营菌科(Syntrophaceae) （Desulfobacca) （Desulfomonile)(Smithella)互营菌属(Syntrophus）互营杆菌科(Syntrophobacteraceae）(Desulfacinum) （Desulfoglaeba) (Desulforhabdus) （Desulfovirga)互营杆菌属（Syntrophobacter）(Thermodesulforhabdus)弯曲菌目(Campylobacterales）弯曲菌科(Campylobacteraceae）弓形杆菌属(Arcobacter）弯曲菌属（Campylobacter) (Dehalospirillum）硫磺单胞菌属(Sulfurospirillum）螺杆菌科（Helicobacteraceae）螺杆菌属(Helicobacter) （Sulfuricurvum) (Sulfurimonas）（Sulfurovum)（Thiovulum)沃林氏菌属(Wolinella)氢单胞菌科（Hydrogenimonadaceae）氢单胞菌属（Hydrogenimonas）(Nautiliales）（Nautiliaceae）(Caminibacter）(Lebetimonas)(Nautilia)（Nitratifractor) (Nitratiruptor）(Thioreductor)酸硫杆状菌目（Acidithiobacillales) 酸硫杆状菌科（Acidithiobacillaceae）酸硫杆状菌属(Acidithiobacillus)热硫杆状菌科（Thermithiobacillaceae）热硫杆状菌属（Thermithiobacillus）气单胞菌目（Aeromonadales）气单胞菌科（Aeromonadaceae)气单胞菌属（Aeromonas) （Oceanimonas)(Oceanisphaera）（Tolumonas）(Zobellella)琥珀酸弧菌科（Succinivibrionaceae）厌氧螺菌属(Anaerobiospirillum）反刍杆菌属（Ruminobacter）琥珀酸单胞菌属(Succinimonas）琥珀酸弧菌属（Succinivibrio)交替单胞菌目（Alteromonadales)交替单胞菌科（Alteromonadaceae）(Aestuariibacter)（Agarivorans）（Alishewanella）交替单胞菌属（Alteromonas)（Glaciecola）（Marinimicrobium）海杆菌属（Marinobacter)海细菌属（Marinobacterium)产微球茎菌属（Microbulbifer）（Saccharophagus）（Salinimonas)(Colwelliaceae）（Colwellia)（Thalassomonas）(Ferrimonadaceae）（Ferrimonas）（Paraferrimonas）（Idiomarinaceae)(Idiomarina)(Pseudidiomarina)(Moritellaceae)（Moritella）假交替单胞菌科(Pseudoalteromonadaceae) (Algicola)假交替单胞菌属（Pseudoalteromonas)冷单胞菌科(Psychromonadaceae）冷单胞菌属（Psychromonas）希万氏菌科（Shewanellaceae)希万氏菌属(Shewanella）科未定(Teredinibacter）(Endobugula）*心杆菌目(Cardiobacteriales) 心杆菌科(Cardiobacteriaceae）心杆菌属（Cardiobacterium) （Dichelobacter) （Suttonella）着色菌目(Chromatiales)着色菌科（Chromatiaceae) （Allochromatium) （Amoebobacter）着色菌属(Chromatium)盐着色菌属（Halochromatium) (Isochromatium) （Lamprobacter) (Lamprocystis）(Marichromatium)亚硝化球菌属(Nitrosococcus) 芬尼氏菌属(Pfennigia)棍着色菌属（Rhabdochromatium) (Rheinheimera)热着色菌属(Thermochromatium）硫橄榄菌属(Thiobaca）硫匣菌属(Thiocapsa)硫球菌属(Thiococcus）硫囊菌属（Thiocystis)硫网菌属（Thiodictyon)硫黄球菌属（Thioflavicoccus）硫盐匣菌属（Thiohalocapsa）(Thiolamprovum）（Thiopedia)硫红球菌属（Thiorhodococcus）硫红弧菌属（Thiorhodovibrio）硫螺菌属（Thiospirillum)外硫红螺旋菌科(Ectothiorhodospiraceae) 碱湖生菌属（Alkalilimnicola)碱螺菌属(Alkalispirillum) (Aquisalimonas）(Arhodomonas)(Ectothiorhodosinus)外硫红螺旋菌属（Ectothiorhodospira)盐红螺旋菌属(Halorhodospira）(Natronocella）硝化球菌属（Nitrococcus)硫碱螺旋菌属(Thioalkalispira）硫红螺旋菌属(Thiorhodospira)颗粒状球菌科（Granulosicoccaceae）颗粒状球菌属（Granulosicoccus)盐硫杆状菌科（Halothiobacillaceae)盐硫杆状菌属(Halothiobacillus) (Thiovirga）肠杆菌目（Enterobacteriales）肠杆菌科(Enterobacteriaceae) （Arsenophonus)（Brenneria)布赫纳氏菌属（Buchnera)(Budvicia)布丘氏菌属(Buttiauxella) (Calymmatobacterium）西地西菌属(Cedecea)柠檬酸杆菌属（Citrobacter)（Dickeya)爱德华氏菌属（Edwardsiella）肠杆菌属（Enterobacter)欧文氏菌属（Erwinia）埃希氏菌属（Escherichia）（包含大肠杆菌）(Ewingella)哈夫尼菌属(Hafnia）克雷伯氏菌属（Klebsiella）克吕沃氏菌属(Kluyvera) （Leclercia）(Leminorella）(Levinea）(Moellerella）（Morganella）（Obesumbacterium)泛菌属（Pantoea）（Pectobacterium）（Phlomobacter）* （Photorhabdus)邻单胞菌属(Plesiomonas）(Pragia)变形杆菌属(Proteus)普罗维登斯菌属（Providencia）（Rahnella)（Raoultella)糖杆菌属（Saccharobacter)沙门氏菌属(Salmonella) (Samsonia）沙雷氏菌属（Serratia)志贺氏菌属（Shigella) (Sodalis)(Tatumella）（Thorsellia)（Trabulsiella)(Wigglesworthia)致病杆菌属（Xenorhabdus）耶尔辛氏菌属（Yersinia）（包含鼠疫杆菌）（Yokenella)军团菌目(Legionellales)柯克斯体科（Coxiellaceae）（Aquicella）柯克斯体属（Coxiella）立克次小体属（Rickettsiella）军团菌科(Legionellaceae）（Fluoribacter)军团菌属(Legionella)(Sarcobium）(Tatlockia）甲基球菌目（Methylococcales)甲基球菌科(Methylococcaceae）甲基杆菌属（Methylobacter）甲基暖菌属（Methylocaldum）甲基球菌属(Methylococcus)甲基盐菌属（Methylohalobius）甲基微菌属（Methylomicrobium）甲基单胞菌属（Methylomonas)甲基八叠球菌属（Methylosarcina) (Methylosoma)甲基球形菌属(Methylosphaera)甲基热菌属（Methylothermus）海洋螺菌目(Oceanospirillales）食碱菌科（Alcanivoraceae）食碱菌属（Alcanivorax）（Fundibacter)（Kangiella）河氏菌科(Hahellaceae）（Endozoicomonas）河氏菌属(Hahella)(Halospina)（Zooshikella）盐单胞菌科(Halomonadaceae）（Carnimonas)色盐杆菌属(Chromohalobacter）(Cobetia）(Deleya）盐单胞菌属（Halomonas）（Halotalea)（Halovibrio）（Modicisalibacter)（Salicola)(Volcaniella)发酵杆菌属（Zymobacter)岸生菌科(Litoricolaceae）岸生菌属(Litoricola）海洋螺菌科(Oceanospirillaceae）(Amphritea）巴氏发菌属(Balneatrix）海单胞菌属（Marinomonas）海螺菌属(Marinospirillum）(Neptuniibacter）(Neptunomonas）(Nitrincola）海洋杆菌属（Oceanobacter)海洋螺菌属(Oceanospirillum）油螺旋菌属(Oleispira)假螺菌属(Pseudospirillum）(Reinekea)(Thalassolituus）嗜油菌科（Oleiphilaceae)嗜油菌属（Oleiphilus)糖螺菌科(Saccharospirillaceae）糖螺菌属（Saccharospirillum) 巴斯德氏菌目（Pasteurellales）巴斯德氏菌科（Pasteurellaceae）放线杆菌属(Actinobacillus）（Aggregatibacter) (Avibacterium）（Bibersteinia) (Gallibacterium)嗜血菌属（Haemophilus）（Histophilus）(Lonepinella)(Mannheimia）（Nicoletella）巴斯德氏菌属（Pasteurella）（Phocoenobacter) （Volucribacter)假单胞菌目（Pseudomonadales) 莫拉菌科(Moraxellaceae）不动杆菌属（Acinetobacter）（Alkanindiges）布兰汉氏菌（Branhamella) (Enhydrobacter)莫拉菌属（Moraxella) （Perlucidibaca）冷杆菌属（Psychrobacter)假单胞菌科(Pseudomonadaceae）（Azomonas）（Azomonotrichon）（Azorhizophilus)(Azotobacter）纤维弧菌属（Cellvibrio) （Chryseomonas)(Flavimonas）(Mesophilobacter)假单胞菌属(Pseudomonas)根瘤杆菌属(Rhizobacter)皱纹单胞菌属(Rugamonas）蛇形菌属（Serpens）咸水球形菌目（Salinisphaerales)咸水球形菌科（Salinisphaeraceae) 咸水球形菌属(Salinisphaera)硫发菌目(Thiotrichales）（Francisellaceae)(Francisella)鱼立克次体科（Piscirickettsiaceae) （Cycloclasticus）(Hydrogenovibrio) (Methylophaga)鱼立克次体属(Piscirickettsia) （Sulfurivirga）(Thioalkalimicrobium) (Thiomicrospira）硫发菌科(Thiotrichaceae) 无色菌属（Achromatium) 贝扎托菌属（Beggiatoa）亮发菌属(Leucothrix)硫杆菌属(Thiobacterium）硫珠菌属(Thiomargarita）硫辫菌属(Thioploca)硫螺旋菌属(Thiospira)硫发菌属(Thiothrix)科未定(Caedibacter)(Fangia）弧菌目(Vibrionales）弧菌科（Vibrionaceae) （Aliivibrio）异单胞菌属(Allomonas) （Beneckea)链状球菌属(Catenococcus）肠弧菌属(Enterovibrio) （Grimontia) (Listonella）（Lucibacterium）。
细菌的分类和鉴定
（一）生理学与生化学分类法
主要以细菌的形态、染色以及细菌的特 殊结条件等等。 主要有两种方法 1、传统分类法
2、数值分类法
1、传统分类法
主要以细菌的形态、生理特征为分类基 础，选择一些较稳定的生物学性状如细菌的 形态结构、染色性、培养特性、生化反应、 抗原性等作为依据，然后按主次顺序逐级区 分。
（二）生理生化特征
包括营养类型、与氧的关系、对温度的适应 性、碳水化合物的代谢试验、蛋白质和氨基酸的 代谢试验及的碳源和氮源利用试验、各种酶类试 验、抑菌试验等等。 生理生化特征特点： 对微生物生理生化特征的比较也是对微生物 基因组的间接比较； 测定生理生化特征比直接分析基因组要容易；
六、微生物分类鉴定的依据
根据微生物分类学中使用的技术和方法，可 把它们分成四个不同的水平：
①细胞形态和行为水平； ②细胞组分水平； ③蛋白质水平； ④基因组水平。
在微生物分类学发展的早期，主要的分类鉴 定指标是以在细胞形态和习性为主，可称为经典 的分类鉴定法
七、细菌的分类方法
生物分类的传统指标
1、DNA G+C mol%测定
DNA分子两条链上4种碱基的总分子量 为100，测定其中G+C或A+T摩尔百分比， 能反应出细菌间DNA分子的同源程度，习惯 上以G+C 作为细菌的分类标记。 不同菌属间的G+C mol%范围很大，在 25%~75%之间，但同一种细菌G+C mol% 相当稳定，不受菌龄、培养条件和其它外界 因素影响，亲缘关系越近的细菌，它们G+C mol%越接近（但并非G+C mol%越接近， 亲缘关系就越近？？？）。
细菌的命名依据“国际细菌命名法规” 的规 定，学名用拉丁文，遵循“双名法”。即每一种 细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分构成，属
细菌的定义知识点总结图
细菌的定义知识点总结图一、细菌的基本概念1.1 细菌的定义细菌是一类原核生物，是一种单细胞微生物。
它们通常是微小的，单细胞的生物，与真核生物不同，细菌的遗传物质不包含在细胞核内，而是存在于细菌细胞质内的核糖体。
1.2 细菌的分类细菌根据形态、生理特征和代谢方式可分为球菌、杆菌、螺旋菌等几类。
根据生存环境的不同，细菌又可分为需氧细菌和厌氧细菌。
根据代谢方式的不同，细菌可分为光合细菌和化能细菌。
1.3 细菌在自然界的重要性细菌在自然界中扮演着举足轻重的角色，它们参与了生物圈中的多种生物过程，如有机质的分解、氮循环等，无论是对地球环境还是对人类健康都有着重要的影响。
二、细菌的形态和结构2.1 细菌的形态细菌的形态有球形、杆状、螺旋状等不同的形态，不同的形态反映了细菌在生存环境中的适应性。
2.2 细菌的结构细菌的结构包括细胞壁、细胞膜、质粒、核糖体等组成部分。
这些结构对细菌的生存、营养获取和繁殖都起着重要的作用。
2.3 细菌的运动结构细菌的运动结构包括鞭毛和纤毛，它们能够帮助细菌在环境中自由移动，并找到适合自己生存的环境。
三、细菌的生理特征3.1 细菌的营养方式细菌的营养方式包括化能细菌和光合细菌。
化能细菌通过有机物或无机物代谢产生能量，而光合细菌则通过光合作用产生能量。
3.2 细菌的呼吸方式细菌的呼吸方式有需氧呼吸和厌氧呼吸。
需氧细菌需要氧气来进行呼吸作用，而厌氧细菌则在没有氧气的情况下进行呼吸。
3.3 细菌的代谢方式细菌的代谢方式包括异养和自养，异养细菌是指无机物作为碳源的细菌，而自养细菌是指有机物作为碳源的细菌。
四、细菌的繁殖方式4.1 细菌的有丝分裂细菌的有丝分裂是最常见的细菌繁殖方式，通过细胞质分裂使得一个细胞分裂成两个细胞。
4.2 细菌的孢子形成在恶劣环境下，细菌会形成孢子以进行保存，孢子能够在极端的环境条件下存活并在条件适宜时再次发育成细菌。
五、细菌的应用与危害5.1 细菌在食品工业中的应用细菌可以用来进行食品发酵，如酸奶、面包等的制作。
细菌的生活方式与分类
细菌的生活方式与分类细菌作为生物界中最简单的有机体之一，广泛存在于各个生态系统中，对地球生命的演化和生态平衡起着重要的作用。
本文将探讨细菌的生活方式与分类，深入了解这些微小生物的多样性和适应能力。
一、细菌的生活方式1. 自养细菌自养细菌通过光合作用或化学反应来获取能量和合成有机物质。
光合自养细菌利用光能将二氧化碳和水转化为有机物，并释放氧气。
典型的光合自养细菌包括青藻和细菌类蓝藻。
化学自养细菌则利用无机化合物（如硫化物或氨氮）作为电子供体，进行能量和有机物的合成。
2. 异养细菌异养细菌无法通过光合作用或直接从无机物中获取能量和碳源。
它们依赖于有机物质作为能量来源和碳源，通常在其他生物的周围或内部寄生或共生。
异养细菌可以包括一些致病菌，如结核菌和霍乱弧菌。
3. 极端环境细菌极端环境细菌（又称为古菌）是一类生存在极端环境中的细菌。
它们可以在高温、高压、强酸碱或高盐环境下生存，并拥有独特的代谢途径和酶系统。
极端环境细菌的研究对于我们理解生命的极限和地球生物多样性的演化具有重要意义。
二、细菌的分类细菌的分类是基于细菌的形态、生理特征和遗传信息等方面进行的。
传统上，细菌被分为以下几个主要类群：1. 革兰氏阳性细菌革兰氏阳性细菌的细胞壁结构较为简单，细胞壁属于革兰氏阳性细菌的特征。
这类细菌多数为球状菌，如葡萄球菌和链球菌，也有一些为杆状菌，如炭疽杆菌。
它们在医学、食品工业和生物技术等领域中具有重要的应用价值。
2. 革兰氏阴性细菌革兰氏阴性细菌的细胞壁结构相对复杂，包含外膜和细胞壁的两层膜。
这类细菌构成了细菌界中最多的类群，包括许多人类病原菌，如大肠杆菌和沙门氏菌，以及一些环境细菌，如假单胞菌。
3. 放线菌与真核细胞内共生细菌放线菌是一类特殊的细菌，它们形成复杂的菌丝体结构，并产生多种有机化合物和抗生素。
这些细菌在土壤中起着重要的生态和环境功能。
而真核细胞内共生细菌则居住在其他生物体的细胞内部，并与宿主共生。
细菌的分类和鉴定(2021精选文档)
一、微生物的分类
根据微生物的大小、结构、组成等分三类
原核细胞 如：细菌、放线菌、螺旋体、支原体、 型 衣原体、立克次体。（也称广义的细菌） 如：病毒、亚病毒、朊粒
二、细菌的分类方法
根据每种细菌各自特征，并按照它们的 亲缘关系分类，分类方法有两类
1.生理学与生化学分类法（传统方法）
（二）生理生化特征
包括营养类型、与氧的关系、对温度的适应 性、碳水化合物的代谢试验、蛋白质和氨基酸的 代谢试验及的碳源和氮源利用试验、各种酶类试 验、抑菌试验等等。
生理生化特征特点： 对微生物生理生化特征的比较也是对微生物
基因组的间接比较； 测定生理生化特征比直接分析基因组要容易；
27.生活是公平的，哪怕吃了很多苦，只要你坚持下去，一定会有收获，即使最后失败了，你也获得了别人不具备的经历。 59.生命注定只有一个结果，活好今天才是最重要的。 92.如果你具备开始的勇气，就有了成功的豪情。 68.舞台再大，自己不上台 ，永远是个观众；平台再好，自己不参与，永远是局外人；能力再大，自己不行动，只能看别人成功。只有参与、实干、拼搏的人才会收获！ 45.没有一颗珍珠的闪光，是靠别人涂抹上去的。 1.输在犹豫，赢在行动。 51.即使道路坎坷不平，车轮也要前进；即使江河波涛汹涌，船只也航行。 12.你热爱生命吗？那么别浪费时间，因为时间是构成生命的材料。——富兰克林 91.在人生的大海中，我们虽然不能把握风的大小，却可以调整帆的方向。不怕重头再来，就怕没有未来!成功是送给有准备的人，成功是送给有付出的人，相信是成功的开始，让我们携手共进， 创造人生新的辉煌。
1、DNA G+C mol%测定
DNA分子两条链上4种碱基的总分子量 为100，测定其中G+C或A+T摩尔百分比， 能反应出细菌间DNA分子的同源程度，习惯 上以G+C 作为细菌的分类标记。
细菌分类大全
革兰氏阳性菌革兰氏阳性菌革兰氏染色法的意义就在于鉴别细菌，把众多的细菌分为两大类，革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。
大多数化脓性球菌都属于革兰氏氏阳性菌，它们能产生外毒素使人致病，而大多数肠道菌多属于革兰氏阴性菌，它们产生毒素，靠毒素使人致病。
常见的革兰氏阳性菌有：葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等；常见的革兰氏阴性菌有痢疾杆菌、伤寒杆菌、大肠杆菌、变形杆菌、绿脓杆菌、百日咳杆菌、霍乱弧菌及脑膜炎双球菌等。
在治疗上，大多数革兰氏阳性菌都对青霉素敏感（结核杆菌对青霉素不敏感）；而革兰氏阴性菌则对青霉素不敏感（但奈瑟氏菌中的流行性脑膜炎双球菌和淋病双球菌对青霉素敏感），而对链霉素、氯霉素等敏感。
所以首先区分病原菌是革兰氏阳性菌还是阴性菌，在选择抗生素方面意义重大。
革兰氏阴性菌,大多数肠道菌多属于革兰氏阴性菌，它们产生毒素，靠毒素使人致病.常见的革兰氏阴性菌有痢疾杆菌、伤寒杆菌、大肠杆菌、变形杆菌、绿脓杆菌、百日咳杆菌、霍乱弧菌及脑膜炎双球菌等。
革兰氏阴性菌则对青霉素不敏感,可以选择氟喹诺酮类药物如诺氟沙星，左氧氟沙星等，也可以选择大环酯类比如克拉霉素、罗红霉素等。
革兰氏阳性菌，大多数化脓性球菌都属于革兰氏阳性菌，它们能产生外毒素使人致病，常见的革兰氏阳性菌有：葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等。
可以选择青霉素族，头孢曲松钠等。
革兰氏阴性菌，以[大肠杆菌]为代表。
大肠杆菌为兼气性菌种，一般生存于肠道中及厌氧的还境中。
革兰氏阴性菌细胞壁的特征为有一层outer membrane 与阳性菌种不同。
目前对大肠杆菌的研究很多，除了它是一般食物中是否有被污染的指标外，很多分子生物学方面的研究皆需要使用到大肠杆菌当作实验宿主。
除了大肠杆菌外，变形杆菌、痢疾杆菌、肺炎杆菌、布氏杆菌、产气夹膜杆菌、流感(嗜血)杆菌、副流感(嗜血)杆菌、卡他(摩拉)菌、不动杆菌属、耶尔森菌属、嗜肺军团菌、百日咳杆菌、副百日咳杆菌、志贺菌属、巴斯德菌属、霍乱弧菌、副溶血性杆菌、类志贺吡邻单胞菌等也是革兰氏阴性菌革兰氏阳性菌与阴性菌常见的革兰氏阳性菌葡萄球菌属，链球菌属，式杆菌属，丹毒丝菌属，肾杆菌属，芽孢杆菌属，梭菌属，分支杆菌属，放线菌属，奴卡菌属，棒状杆菌属，红球菌属，炭疽杆菌丹毒杆菌破伤风杆菌氏杆菌产气荚莫杆菌气肿疽杆菌结核杆菌。
细菌种属分类
细菌种属分类细菌（Bacteria）是生物的主要类群之一，属于细菌域。
细菌是所有生物中数量最多的一类依据分类标准不同，细菌的分类有所差异。
1、根据形状分为三类，即：球菌（包括单球菌、双球菌、链球菌、葡萄球菌等）、杆菌（比如肠杆菌）和螺旋菌（包括弧菌、螺菌、螺杆菌）。
2、按细菌的生活方式来分类，分为两大类：自养菌和异养菌，其中异养菌包括腐生菌和寄生菌。
3、按细菌对氧气的需求来分类，可分为需氧（完全需氧和微需氧）和厌氧（不完全厌氧、有氧耐受和完全厌氧）细菌。
4、按细菌生存温度分类，可分为喜冷、常温和喜高温三类。
5、根据细菌阴阳分类：革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。
例如：化脓性球菌都属于革兰氏氏阳性菌，它们能产生外毒素使人致病，而肠道菌多属于革兰氏阴性菌，它们产生内毒素，靠内毒素使人致病。
常见的革兰氏阳性菌有：葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等。
补注：①国际上最具权威性的细菌分类系统专著有“伯杰氏系统细菌学手册”和“伯杰鉴定细菌学手册”。
②细菌的分类层次与其他生物一样，也是界、门、纲、目、科、属、种，但细菌常用的是“属和种”，种是细菌分类的基本单位。
③细菌的结构分为基本结构和特殊结构。
基本结构是各种细菌都具有的结构，包括细菌的细胞壁、细胞膜、细胞质、核质。
某些细菌特有的结构称为特殊结构，包括细菌的荚膜、鞭毛、菌毛、芽胞。
④细菌主要以无性二分裂方式繁殖(裂殖)，即细菌生长到一定时期，在细胞中间逐渐形成横隔，由一个母细胞分裂为两个大小相等的子细胞。
⑤微生物划分为以下8大类——细菌、病毒、真菌、放线菌、立克次氏体、支原体、衣原体、螺旋体。
细菌的分类与生活习性
细菌的分类与生活习性细菌是一类微小的单细胞生物，它们广泛存在于地球上的各个角落，包括土壤、水体、空气以及人体等。
细菌的分类体系非常复杂，科学家们通过对其形态、生理特征和基因序列等方面的研究，将其分为多个不同的类群。
本文将从细菌的分类和生活习性两个方面进行探讨。
细菌的分类可以根据其形态特征进行划分。
最常见的分类方式是根据细菌的形状，将其分为球菌、杆菌和螺旋菌三类。
球菌通常呈圆形，如葡萄球菌和链球菌；杆菌则呈长条状，如大肠杆菌和炭疽杆菌；螺旋菌则呈螺旋状，如梅毒螺旋体和钩端螺旋体。
此外，还有一些细菌具有特殊的形态，如产孢杆菌和弧菌等。
除了形态特征，细菌的分类还可以根据其生理特征进行划分。
其中一个重要的分类标准是细菌的营养方式。
根据细菌对碳源和能源的利用方式，可以将其分为自养细菌和异养细菌两类。
自养细菌能够通过光合作用或化学反应合成有机物质，如光合细菌和硫化细菌；而异养细菌则需要从外界获取有机物质作为碳源和能源，如厌氧细菌和好氧细菌。
细菌的生活习性也是其分类的重要依据之一。
细菌可以根据其生长环境的需求，分为厌氧细菌和好氧细菌。
厌氧细菌能够在无氧环境中生存和繁殖，如产气荚膜梭菌和乳酸菌；而好氧细菌则需要氧气来进行呼吸作用，如大肠杆菌和铁细菌。
此外，还有一些细菌能够在极端环境下存活，如耐酸菌和耐热菌，它们可以在酸性或高温的环境中生存。
细菌的分类和生活习性对我们理解和探索微生物世界具有重要意义。
通过对细菌的分类，我们可以更好地了解它们的形态和生理特征，为研究细菌的生态学、病原学和应用学等提供基础。
同时，对细菌的生活习性的研究也有助于我们认识到细菌在自然界中的重要性，以及它们与其他生物之间的相互作用。
细菌的分类和生活习性的研究不仅对科学研究有重要意义，也对人类的生活和健康产生着深远影响。
细菌不仅是自然界中的重要组成部分，还是人体内的共生菌群。
一些细菌可以帮助人类消化食物、合成维生素和抵抗病原微生物的侵袭，而另一些细菌则是人类疾病的致病因子。
生物学 细菌有哪些分类
生物学细菌有哪些分类？细菌是一类原核生物，按照细菌的形态、代谢方式、生态特征和遗传关系等方面的差异，可以将细菌分为多个分类单位。
目前，细菌的分类系统主要基于其基因序列和进化关系的研究结果。
下面将介绍细菌的主要分类单位及其特征。
1. 基于形态特征的分类：-球菌（Coccus）：球状细菌，以分裂方式繁殖，如链球菌（Streptococcus）和葡萄球菌（Staphylococcus）等。
-杆菌（Bacillus）：长条状细菌，以分裂方式繁殖，如大肠杆菌（Escherichia coli）和炭疽杆菌（Bacillus anthracis）等。
-螺旋菌（Spirillum）：螺旋状细菌，如螺旋菌属（Spirillum）和钩端螺旋体属（Leptospira）等。
2. 基于代谢方式的分类：-厌氧菌（Anaerobes）：在缺氧条件下生长和繁殖的细菌，如产乙酸菌（Acetobacterium）和产丙酸菌（Propionibacterium）等。
-好氧菌（Aerobes）：需要氧气进行呼吸作用的细菌，如假单胞菌属（Pseudomonas）和链霉菌属（Streptomyces）等。
-兼性厌氧菌（Facultative anaerobes）：既可以在有氧条件下进行呼吸作用，也可以在无氧条件下利用发酵代谢，如大肠杆菌（Escherichia coli）和黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）等。
3. 基于生态特征的分类：-水生细菌（Aquatic bacteria）：生活在水体中的细菌，如水藻细菌（Cyanobacteria）和水生放线菌（Actinobacteria）等。
-土壤细菌（Soil bacteria）：生活在土壤中的细菌，参与了土壤有机物分解和养分循环，如枯草杆菌属（Bacillus subtilis）和拟杆菌属（Pseudomonas）等。
-肠道细菌（Gut bacteria）：寄生在动物消化道内的细菌，与宿主的消化和免疫系统密切相关，如乳酸菌属（Lactobacillus）和肠球菌属（Enterococcus）等。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
细菌分类表（按“界门纲目科属种”分类）生物分类总表生物病毒分类表古菌分类表细菌分类表原生生物分类表藻类分类表 (NCBI)真菌分类表植物分类表植物分类表 (NCBI)APG I、II、III克朗奎斯特分类动物分类表软体动物分类表环节动物分类表昆虫分类表鱼类分类表两栖动物分类表爬行动物分类表鸟类传统分类系统鸟类DNA分类系统鹦形目分类表哺乳动物分类表翼手目分类表• 1 酸杆菌门(Acidobacteria)o 1.1 酸杆菌纲(Acidobacteria)o 1.2 全噬菌纲(Holophagae)• 2 放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌）o 2.1 放线菌纲(Actinobacteria)• 3 产水菌门(Aquificae)o 3.1 产水菌纲(Aquificae)• 4 拟杆菌门(Bacteroidetes)o 4.1 拟杆菌纲(Bacteroidetes)o 4.2 黄杆菌纲(Flavobacteria)o 4.3 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria)o 4.4 纲未定• 5 衣原体门(Chlamydiae)o 5.1 衣原体纲(Chlamydiae)• 6 绿菌门(Chlorobi)o 6.1 绿菌纲(Chlorobia)•7 绿弯菌门(Chloroflexi)o7.1 厌氧绳菌纲(Anaerolineae)o7.2 暖绳菌纲(Caldilineae)o7.3 绿弯菌纲(Chloroflexi)•8 产金菌门(Chrysiogenetes)o8.1 产金菌纲(Chrysiogenetes)•9 蓝藻门(Cyanobacteria)o9.1 蓝藻纲(Cyanobacteria)•10 脱铁杆菌门(Deferribacteres)o10.1 脱铁杆菌纲(Deferribacteres)•11 异常球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus) o11.1 异常球菌纲(Deinococci)•12 网团菌门(Dictyoglomi)o12.1 网团菌纲(Dictyoglomi)•13 纤维杆菌门(Fibrobacteres)o13.1 纤维杆菌纲(Fibrobacteres)•14 厚壁菌门(Firmicutes)（低G+C革兰氏阳性菌）o14.1 芽孢杆菌纲(Bacilli)o14.2 梭菌纲(Clostridia)o14.3 热石杆菌纲(Thermolithobacteria)•15 梭杆菌门(Fusobacteria)o15.1 梭杆菌纲(Fusobacteria)•16 芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)o16.1 芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes)•17 黏胶球形菌门(Lentisphaerae)o17.1 黏胶球形菌纲(Lentisphaerae)•18 硝化螺旋菌门(Nitrospirae)o18.1 硝化螺旋菌纲(Nitrospira)•19 浮霉菌门(Planctomycetes)o19.1 浮霉菌纲(Planctomycetacia)•20 海绵杆菌门(Poribacteria)*•21 变形菌门(Proteobacteria)o21.1 α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)o21.2 β-变形菌纲(Betaproteobacteria)o21.3 δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)o21.4 ε-变形菌纲(Epsilonproteobacteria)o21.5 γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)•22 螺旋体门(Spirochaetes)o22.1 螺旋体纲(Spirochaetes)•23 柔膜菌门(Tenericutes)o23.1 柔膜菌纲(Mollicutes)•24 热脱硫杆菌门(Thermodesulfobacteria)o24.1 热脱硫杆菌纲(Thermodesulfobacteria)•25 热微菌门(Thermomicrobia)o25.1 热微菌纲(Thermomicrobia)•26 热袍菌门(Thermotogae)o26.1 热袍菌纲(Thermotogae)•27 疣微菌门(Verrucomicrobia)o27.1 丰祐菌纲(Opitutae)o27.2 疣微菌纲(Verrucomicrobiae)•28 门未定o28.1 纤线杆菌纲(Ktedonobacteria)酸杆菌门(Acidobacteria)酸杆菌纲(Acidobacteria)1.酸杆菌目(Acidobacteriales)1.酸杆菌科(Acidobacteriaceae)1.酸杆菌属(Acidobacterium)2.(Edaphobacter)3.(Terriglobus)全噬菌纲(Holophagae)1.石鳖杆菌目(Acanthopleuribacterales)1.石鳖杆菌科(Acanthopleuribacteraceae)1.石鳖杆菌属(Acanthopleuribacter)2.全噬菌目(Holophagales)1.全噬菌科(Holophagaceae)1.地发菌属(Geothrix)2.全噬菌属(Holophaga)放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌）放线菌纲(Actinobacteria)1.酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)1.酸微菌目(Acidimicrobiales)1.酸微菌亚目(Acidimicrobineae)1.酸微菌科(Acidimicrobiaceae)1.酸微菌属(Acidimicrobium)2.(Iamiaceae)1.(Iamia)2.放线菌亚纲(Actinobacteridae)1.放线菌目(Actinomycetales)1.放线菌亚目(Actinomycineae)1.放线菌科(Actinomycetaceae)1.放线棒菌属(Actinobaculum)2.放线菌属(Actinomyces)3.隐秘杆菌属(Arcanobacterium)4.(Falcivibrio)5.动弯杆菌属(Mobiluncus)6.(Varibaculum)2.(Actinopolysporineae)1.(Actinopolysporaceae)1.(Actinopolyspora)3.(Catenulisporineae)1.(Actinospicaceae)1.(Actinospica)2.(Catenulisporaceae)1.(Catenulispora)4.棒杆菌亚目(Corynebacterineae)1.棒杆菌科(Corynebacteriaceae)1.(Bacterionema)2.(Caseobacter)3.棒杆菌属(Corynebacterium)4.(Turicella)2.迪茨氏菌科(Dietziaceae)1.迪茨氏菌属(Dietzia)3.分枝杆菌科(Mycobacteriaceae)1.分枝杆菌属(Mycobacterium) （含结核杆菌）4.诺卡氏菌科(Nocardiaceae)1.戈登氏菌属(Gordonia)2.(Micropolyspora)3.(Millisia)4.诺卡氏菌属(Nocardia)5.红球菌属(Rhodococcus)6.斯科曼氏菌属(Skermania)7.(Williamsia)8.(Smaragdicoccus)5.(Segniliparaceae)1.(Segniliparus)6.束村氏菌科(Tsukamurellaceae)1.束村氏菌属(Tsukamurella)5.弗兰克氏菌亚目(Frankineae)1.酸热菌科(Acidothermaceae)1.酸热菌属(Acidothermus)2.弗兰克氏菌科(Frankiaceae)1.弗兰克氏菌属(Frankia)3.地嗜皮菌科(Geodermatophilaceae)1.芽球菌属(Blastococcus)2.地嗜皮菌属(Geodermatophilus)3.(Modestobacter)4.(Kineosporiaceae)1.(Cryptosporangium)2.(Kineococcus)3.(Kineosporia)5.(Nakamurellaceae)1.(Humicoccus)2.(Nakamurella)3.(Quadrisphaera)6.孢鱼菌科(Sporichthyaceae)1.孢鱼菌属(Sporichthya)6.糖霉菌亚目(Glycomycineae)1.糖霉菌科(Glycomycetaceae)1.糖霉菌属(Glycomyces)2.(Stackerbrandtia)7.微球菌亚目(Micrococcineae)1.获山氏菌科(Beutenbergiaceae)1.获山氏菌属(Beutenbergia)2.乔治菌属(Georgenia)3.萨勒河菌属(Salana)2.博戈里亚湖菌科(Bogoriellaceae)1.博戈里亚湖菌属(Bogoriella)3.短杆菌科(Brevibacteriaceae)1.短杆菌属(Brevibacterium)4.纤维素单胞菌科(Cellulomonadaceae)1.纤维素单胞菌属(Cellulomonas)2.厄氏菌属(Oerskovia)3.(Tropheryma)5.(Dermabacteraceae)1.(Brachybacterium)2.(Dermabacter)6.(Dermacoccaceae)1.(Demetria)2.(Dermacoccus)3.(Kytococcus)7.(Dermatophilaceae)1.(Dermatophilus)2.(Kineosphaera)8.(Intrasporangiaceae)1.(Arsenicicoccus)2.(Humihabitans)3.(Intrasporangium)4.(Janibacter)5.(Knoellia)6.(Kribbia)7.(Lapillicoccus)8.(Ornithinicoccus)9.(Ornithinimicrobium)10.(Oryzihumus)11.(Serinicoccus)12.(Terrabacter)13.(Terracoccus)14.(Tetrasphaera)9.(Jonesiaceae)1.(Jonesia)10.(Microbacteriaceae)1.(Agreia)2.(Agrococcus)3.(Agromyces)4.(Aureobacterium)5.(Clavibacter)6.(Cryobacterium)7.(Curtobacterium)8.(Frigoribacterium)9.(Frondicola)10.(Gulosibacter)11.(Labedella)12.(Leifsonia)13.(Leucobacter)14.(Microbacterium)15.(Microcella)16.(Mycetocola)17.(Okibacterium)18.(Plantibacter)19.(Pseudoclavibacter)20.(Rathayibacter)21.(Rhodoglobus)22.(Salinibacterium)23.(Subtercola)24.(Yonghaparkia)25.(Zimmermannella)11.微球菌科(Micrococcaceae)1.(Acaricomes)2.节杆菌属(Arthrobacter)3.(Citricoccus)4.(Kocuria)5.微球菌属(Micrococcus)6.(Nesterenkonia)7.(Renibacterium)8.罗氏菌属(Rothia)9.口腔球菌属(Stomatococcus)10.刘志恒菌属(Zhihengliuella)12.(Promicromonosporaceae)1.(Cellulosimicrobium)2.(Isoptericola)3.(Myceligenerans)4.(Promicromonospora)5.(Xylanibacterium)6.(Xylanimonas)13.(Rarobacteraceae)1.(Rarobacter)14.(Sanguibacteraceae)1.血杆菌属(Sanguibacter)15.(Yaniaceae)1.(Yania)16.科未定1.(Actinotalea)2.(Demequina)3.(Phycicoccus)4.(Ruania)8.微单孢菌亚目(Micromonosporineae)1.微单孢菌科(Micromonosporaceae)1.(Actinocatenispora)2.(Actinoplanes)3.(Amorphosporangium)4.(Ampullariella)5.(Asanoa)6.(Catellatospora)7.(Catenuloplanes)8.(Couchiolanes)9.(Dactylosporangium)10.(Krasilnikovia)11.(Longispora)12.(Luedemannella)13.微单孢菌属(Micromonospora)14.(Pilimelia)15.(Planopolyspora)16.(Polymorphospora)17.(Salinispora)18.(Spirilliplanes)19.(Verrucosispora)20.(Virgisporangium)9.丙酸杆菌亚目(Propionibacterineae)1.(Nocardioidaceae)1.(Actinopolymorpha)2.(Aeromicrobium)3.(Friedmanniella)4.(Hongia)5.(Kribbella)6.(Marmoricola)7.(Micropruina)8.(Nocardioides)9.(Pimelobacter)10.(Propionicicella)11.(Propionicimonas)2.丙酸杆菌科(Propionibacteriaceae)1.河口微菌属(Aestuariimicrobium)2.(Arachnia)3.(Brooklawnia)4.(Granulicoccus)5.江氏菌属(Jiangella)6.(Luteococcus)7.(Microlunatus)8.丙酸杆菌属(Propionibacterium)9.(Propioniferax)10.(Propionimicrobium)11.(Tessaracocccus)10.(Pseudonocardineae)1.(Actinosynnemataceae)1.(Actinokineospora)2.(Actinosynnema)3.(Lechevalieria)4.(Lentzea)5.(Saccharothrix)6.(Umezawaea)2.(Pseudonocardiaceae)1.(Actinoalloteichus)2.(Actinobispora)3.(Amycolata)4.(Amycolatopsis)5.(Crossiella)6.(Faenia)7.(Goodfellowia)8.(Kibdelosporangium)9.(Kutzneria)10.(Prauserella)11.(Pseudoamycolata)12.(Pseudonocardia)13.(Saccharomonospora)14.(Saccharopolyspora)15.(Streptoalloteichus)16.(Thermobispora)17.(Thermocrispum)11.链霉菌亚目(Streptomycineae)1.链霉菌科(Sterptomycetaceae)1.(Actinopycnidium)2.(Actinosporangium)3.(Chainia)4.(Elytrosporangium)5.北里菌属(Kitasatoa)6.北里孢菌属(Kitasatospora)7.(Microellobosporia)8.(Streptacidiphilus)9.链霉菌属(Streptomyces)10.(Streptoverticillium) 12.(Streptosporangineae)1.(Nocardiopsaceae)1.(Nocardiopsis)2.(Streptomonospora)3.(Thermobifida)2.(Streptosporangiaceae)1.(Acrocarpospora)2.(Herbidospora)3.(Microbispora)4.(Microtetraspora)5.(Nonomuraea)6.(Planobispora)7.(Planomonospora)8.(Planotetraspora)9.(Sphaerisporangium)10.(Streptosporangium)11.(Thermopolyspora)3.(Thermomonosporaceae)1.珊瑚状放线菌属(Actinocorallia)2.(Actinomadura)3.(Excellospora)4.(Spirillospora)5.(Thermomonospora)2.双歧杆菌目(Bifidobacteriales)1.双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)1.(Aeriscardovia)2.(Alloscardovia)3.双歧杆菌属(Bifidobacterium)4.(Gardnerella)5.(Metascardovia)6.(Parascardovia)7.(Scardovia)2.科未定3.(Coriobacteridae)1.(Coriobacteriales)1.(Coriobacterineae)1.(Coriobacteriaceae)1.奇异菌属(Atopobium)2.(Collinsella)3.(Coriobacterium)4.(Cryptobacterium)5.(Denitrobacterium)6.(Eggerthella)7.(Olsenella)8.(Slackia)4.红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae)1.红色杆菌目(Rubrobacterales)1.红色杆菌亚目(Rubrobacterineae)1.(Conexibacteraceae)1.(Conexibacter)2.(Patulibacteraceae)1.(Patulibacter)3.红色杆菌科(Rubrobacteraceae)1.红色杆菌属(Rubrobacter)4.(Solirubrobacteraceae)1.(Solirubrobacter)5.(Thermoleophilaceae)1.(Thermoleophilum)5.球形杆菌亚纲(Sphaerobacteridae)1.球形杆菌目(Sphaerobacterales)1.球形杆菌亚目(Sphaerobacterineae)1.球形杆菌科(Sphaerobacteraceae)1.球形杆菌属(Sphaerobacter) 产水菌门(Aquificae)产水菌纲(Aquificae)1.产水菌目(Aquificales)1.产水菌科(Aquificaceae)1.产水菌属(Aquifex)2.(Calderobacterium)3.(Hydrogenivirga)4.(Hydrogenobacter)5.(Hydrogenobaculum)6.(Thermocrinis)2.除硫杆菌科(Desulfurobacteriaceae)1.(Balnearium)2.除硫杆菌属(Desulfurobacterium)3.热弧菌属(Thermovibrio)3.(Hydrogenothermaceae)1.(Hydrogenothermus)2.(Persephonella)3.(Sulfurihydrogenibium)拟杆菌门(Bacteroidetes)拟杆菌纲(Bacteroidetes)1.拟杆菌目(Bacteroidales)1.拟杆菌科(Bacteroidaceae)1.(Acetomicrobium)2.(Anaerophaga)3.(Anaerorhabdus)4.拟杆菌属(Bacteroides)5.(Pontibacter)2.紫单胞菌科(Porphyromonadaceae)1.(Barnesiella)2.(Capsularis)3.(Dysgonomonas)4.(Hallella)5.(Odoribacter)6.(Oribaculum)7.(Paludibacter)8.(Parabacteroides)9.紫单胞菌属(Porphyromonas) （多译作“卟啉单胞菌”，但porphyro-应来源于希腊语“紫色”）10.(Proteiniphilum)11.(Tannerella)12.(Xylanibacter)3.普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)1.普雷沃氏菌属(Prevotella) （或译作“普氏菌”）4.理研菌科(Rikenellaceae)1.(Alistipes)2.(Alkaliflexus)3.(Marinilabilia)4.(Petrimonas)5.理研菌属(Rikenella) （注：Riken是日语“理化学研究所”简称）5.科未定1.(Acetofilamentum)2.(Acetothermus)黄杆菌纲(Flavobacteria)1.黄杆菌目(Flavobacteriales)1.蟑螂杆状体科(Blattabacteriaceae)1.蟑螂杆状体属(Blattabacterium)2.(Cryomorphaceae)1.(Algoriphagus)2.(Brumimicrobium)3.(Crocinitomix)4.(Cryomorpha)5.(Fluviicola)6.李时珍菌属(Lishizhenia)7.(Owenweeksia)3.黄杆菌科(Flavobacteriaceae)1.(Actibacter)2.(Aequorivita)3.(Algibacter)4.(Aquimarina)5.(Arenibacter)6.伯杰菌属(Bergeyella)7.(Bizionia)8.碳酸噬胞菌属(Capnocytophaga) （注：多译作“二氧化碳噬纤维菌属”）9.噬纤维素菌属(Cellulophaga)10.金黄杆菌属(Chryseobacterium)11.(Cloacibacterium)12.(Coenonia)13.(Costertonia)14.(Croceibacter)15.独岛菌属(Dokdonia)16.东海菌属(Donghaeana)17.(Elizabethkingia)18.(Empedobacter)19.(Epilithonimonas)20.(Flaviramulus)21.黄杆菌属(Flavobacterium)22.(Formosa)23.泥滩杆菌属(Gaetbulibacter)24.泥滩微菌属(Gaetbulimicrobium)25.(Galbibacter)26.(Gelidibacter)27.(Gillisia)28.(Gilvibacter)29.革兰菌属(Gramella)30.(Kaistella)31.(Kordia)32.(Krokinobacter)33.(Lacinutrix)34.列文虎克菌属(Leeuwenhoekiella)35.(Lutibacter)36.(Maribacter)37.(Mariniflexile)38.(Marixanthomonas)39.(Mesonia)40.(Muricauda)41.(Myroides)42.(Nonlabens)43.(Olleya)44.(Ornithobacterium)45.(Persicivirga)46.(Pibocella)47.极地杆菌属(Polaribacter)48.冷弯菌属(Psychroflexus)49.(Psychroserpens)50.(Riemerella)51.(Robiginitalea)52.(Salegentibacter)53.(Sandarakinotalea)54.(Sediminibacter)55.(Sediminicola)56.世宗菌属(Sejongia)57.(Stanierella)58.(Stenothermobacter)59.(Subsaxibacter)60.(Subsaximicrobium)61.(Tamlana)62.(Tenacibaculum)63.(Ulvibacter)64.(Vitellibacter)65.(Wautersiella)66.(Weeksella)67.(Winogradskyella)68.丽水菌属(Yeosuana)69.(Zeaxanthinibacter)70.周氏菌属(Zhouia)71.(Zobellia)72.王祖农菌属(Zunongwangia) 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria)1.鞘脂杆菌目(Sphingobacteriales)1.泉发菌科(Crenotrichaceae)1.(Balneola)2.(Chitinophaga)3.泉发菌属(Crenothrix)4.(Rhodothermus)5.(Salinibacter)6.(Terrimonas)7.(Toxothrix)2.(Flammeovirgaceae)1.(Flammeovirga)2.(Flexithrix)3.(Perexilibacter)4.(Persicobacter)5.(Rapidithrix)6.(Sediminitomix)7.(Thermonema)3.屈挠杆菌科(Flexibacteraceae)1.(Adhaeribacter)2.(Aquiflexum)3.(Arcicella)4.(Belliella)5.(Chimaereicella)6.(Cyclobacterium)7.噬胞菌属(Cytophaga) （注：目前多称此属为“噬纤维菌属”，此处依拉丁文）8.(Dyadobacter)9.(Echinicola)10.(Effluviibacter)11.(Emticicia)12.(Fabibacter)13.(Flectobacillus)14.屈挠杆菌属(Flexibacter)15.(Hongiella)16.(Hymenobacter)17.(Larkinella)18.(Leadbetterella)19.(Marinicola)20.(Meniscus)21.(Microscilla)22.(Niastella)23.(Persicitalea)24.(Reichenbachiella)25.(Rhodonellum)26.(Roseivirga)27.(Runella)28.(Spirosoma)29.生孢噬胞菌属(Sporocytophaga)4.腐螺旋菌科(Saprospiraceae)1.(Aureispira)2.(Haliscomenobacter)3.(Lewinella)4.腐螺旋菌属(Saprospira)5.鞘脂杆菌科(Sphingobacteriaceae)1.(Mucilaginibacter)2.(Olivibacter)3.(Parapedobacter)4.(Pedobacter)5.(Pseudosphingobacterium)6.鞘脂杆菌属(Sphingobacterium)6.科未定1.(Niabella)纲未定1.(Flavisolibacter)2.(Fulvivirga)3.(Prolixibacter)4.(Segetibacter)衣原体门(Chlamydiae)衣原体纲(Chlamydiae)1.衣原体目(Chlamydiales)1.衣原体科(Chlamydiaceae)1.衣原体属(Chlamydia)2.嗜衣体属(Chlamydophila)2.副衣原体属(Parachlamydiaceae)1.新衣原体属(Neochlamydia)2.副衣原体属(Parachlamydia)3.芯卡体科(Simkaniaceae)1.芯卡体属(Simkania) （注：人名缩写简称，此处用音译）2.棍衣原体属(Rhabdochlamydia)*4.华诊体科(Waddliaceae)1.华诊体属(Waddlia) （注：WADDL为“华盛顿动物病诊断实验室”缩写）绿菌门(Chlorobi)绿菌纲(Chlorobia)1.绿菌目(Chlorobiales)1.绿菌科(Chlorobiaceae)1.臂绿菌属(Ancalochloris)2.绿棒菌属(Chlorobaculum)3.绿菌属(Chlorobium)4.绿爬菌属(Chloroherpeton)5.暗网菌属(Pelodictyon)6.突柄绿菌属(Prosthecochloris)绿弯菌门(Chloroflexi)厌氧绳菌纲(Anaerolineae)1.厌氧绳菌目(Anaerolineales)1.厌氧绳菌科(Anaerolineaceae)1.厌氧绳菌属(Anaerolinea)2.(Bellilinea)3.纤绳菌属(Leptolinea)4.(Levilinea)5.长绳菌属(Longilinea)暖绳菌纲(Caldilineae)1.暖绳菌目(Caldilineales)1.暖绳菌科(Caldilineaceae)1.暖绳菌属(Caldilinea)绿弯菌纲(Chloroflexi)1.绿弯菌目(Chloroflexales)1.绿弯菌科(Chloroflexaceae)1.绿弯菌属(Chloroflexus)2.绿线菌属(Chloronema)3.太阳发菌属(Heliothrix)4.玫瑰弯菌属(Roseiflexus)2.颤绿菌科(Oscillochloridaceae)1.颤绿菌属(Oscillochloris)2.爬管菌目(Herpetosiphonales)1.爬管菌科(Herpetosiphonaceae)1.爬管菌属(Herpetosiphon) 产金菌门(Chrysiogenetes) 产金菌纲(Chrysiogenetes)1.产金菌目(Chrysiogenales)1.产金菌科(Chrysiogenaceae)1.产金菌属(Chrysiogenes)蓝藻门(Cyanobacteria)蓝藻纲(Cyanobacteria)1.第一目（色球藻目(Chroococcales)）@1.第一科@1.管孢藻属(Chamaesiphon)@2.色球藻属(Chroococcus)@3.(Cyanobacterium)@4.(Cyanobium)@5.(Cyanothece)@6.蓝纤维藻属(Dactylococcopsis)@7.(Gloeobacter)@8.黏球藻属(Gloeocapsa)@9.黏杆藻属(Gloeothece)@10.微囊藻属(Microcystis)@11.原绿球藻属(Prochlorococcus)@12.原绿藻属(Prochloron)@13.聚球藻属(Synechococcus)@14.集胞藻属(Synechocystis)@2.第二目（宽球藻目(Pleurocapsales)）@1.第一科@1.(Cyanocystis)@2.(Dermocarpella)@3.(Stanieria)@4.异球藻属(Xenococcus)@2.第二科@1.拟色球藻属(Chroococcidiopsis)@2.黏囊藻属(Myxosarcina)@3.宽球藻属(Pleurocapsa)@3.第三目（颤藻目(Oscillatoriales)）@1.第一科@1.节螺藻属(Arthrospira)@ （包含商业化螺旋藻）2.(Borzia)@3.(Crinalium)@4.(Geitlerinema)@5.盐螺旋藻属(Halospirulina)6.(Leptolyngbya)@7.(Limnothrix)@8.鞘丝藻属(Lyngbya)@9.微鞘藻属(Microcoleus)@10.颤藻属(Oscillatoria)@11.(Planktothrix)@12.原绿发藻属(Prochlorothrix)@13.(Pseudanabaena)@14.螺旋藻属(Spirulina)@15.(Starria)@16.束藻属(Symploca)@17.束毛藻属(Trichodesmium)18.(Tychonema)@4.第四目（念珠藻目(Nostocales)）@1.第一科@1.鱼腥藻属(Anabaena)@2.项圈藻属(Anabaenopsis)@3.束丝藻属(Aphanizomenon)@4.(Cyanospira)@5.(Cylindrospermopsis)@6.筒孢藻属(Cylindrospermum)@7.节球藻属(Nodularia)@8.念珠藻属(Nostoc)@9.伪枝藻属(Scytonema)@2.第二科@1.眉藻属(Calothrix)@2.胶须藻属(Rivularia)@3.单歧藻属(Tolypothrix)@5.第五目（真枝藻目(Stigonematales)）@1.第一科@1.(Chlorogloeopsis)@2.费氏藻属(Fischerella)@3.(Geitleria)@4.(Iyengariella)@5.拟念珠藻属(Nostochopsis)@6.真枝藻属(Stigonema)@脱铁杆菌门(Deferribacteres) 脱铁杆菌纲(Deferribacteres)1.脱铁杆菌目(Deferribacterales)1.脱铁杆菌科(Deferribacteraceae)1.脱铁杆菌属(Deferribacter)2.(Denitrovibrio)3.(Flexistipes)4.地弧菌属(Geovibrio)5.(Mucispirillum)2.科未定1.暖发菌属(Caldithrix)2.(Synergistes)异常球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus)异常球菌纲(Deinococci)1.异常球菌目(Deinococcales)1.异常球菌科(Deinococcaceae)1.异常杆菌属(Deinobacter)2.异常球菌属(Deinococcus)2.特吕珀菌科(Trueperaceae)1.特吕珀菌属(Truepera)2.栖热菌目(Thermales)1.栖热菌科(Thermaceae)1.海栖热菌属(Marinithermus)2.亚栖热菌属(Meiothermus)3.海洋栖热菌属(Oceanithermus)4.栖热菌属(Thermus)5.火山栖热菌属(Vulcanithermus)网团菌门(Dictyoglomi)网团菌纲(Dictyoglomi)1.网团菌目(Dictyoglomales)1.网团菌科(Dictyoglomaceae)1.网团菌属(Dictyoglomus)纤维杆菌门(Fibrobacteres)纤维杆菌纲(Fibrobacteres)1.纤维杆菌目(Fibrobacterales)1.纤维杆菌科(Fibrobacteraceae)1.纤维杆菌属(Fibrobacter)厚壁菌门(Firmicutes)（低G+C革兰氏阳性菌）芽孢杆菌纲(Bacilli)1.芽孢杆菌目(Bacillales)1.(Alicyclobacillaceae)1.(Alicyclobacillus)2.(Pasteuria)3.(Sulfobacillus)2.芽孢杆菌科(Bacillaceae)1.(Alkalibacillus)2.(Amphibacillus)3.(Anoxybacillus)4.芽孢杆菌属(Bacillus)5.(Caldalkalibacillus)6.(Cerasibacillus)7.(Exiguobacterium)8.(Filobacillus)9.(Geobacillus)10.(Gracilibacillus)11.(Halalkalibacillus)12.(Halobacillus)13.(Haloactibacillus)14.(Jeotgalibacillus)15.(Lentibacillus)16.(Lysinibacillus)17.(Marinibacillus)18.(Oceanobacillus)19.(Ornithinibacillus)20.(Paraliobacillus)21.(Paucisalibacillus)22.(Pelagibacillus)23.(Piscibacillus)24.(Pontibacillus)25.糖球菌属(Saccharococcus)26.(Salibacillus)27.(Salimicrobium)28.(Salinibacillus)29.(Salirhabdus)30.(Sasuginibacillus)31.(Tenuibacillus)32.(Terribacillus)33.(Thalassobacillus)34.(Ureibacillus)35.(Virgibacillus)36.(Vulcanibacillus)3.(Caryophanaceae)1.(Caryophanon)4.李斯特氏菌科(Listeriaceae)1.环丝菌属(Brochothrix)2.李斯特氏菌属(Listeria)5.(Paenibacillaceae)1.(Ammoniphilus)2.(Aneurinibacillus)3.(Brevibacillus)4.(Cohnella)5.(Oxalophagus)6.(Paenibacillus)7.(Thermicanus)8.(Thermobacillus)6.(Planococcaceae)1.(Filibacter)2.(Kurthia)3.(Planococcus)4.(Planomicrobium)5.(Sporosarcina)7.芽孢乳杆菌科(Sporolactobacillaceae)1.(Marinococcus)2.(Sinococcus)3.芽孢乳杆菌属(Sporolactobacillus)4.(Tuberibacillus)8.葡萄球菌科(Staphylococcaceae)1.孪生菌属(Gemella)2.(Joetgalicoccus)3.(Macrococcus)4.(Salinicoccus)5.葡萄球菌属(Staphylococcus)9.(Thermoactinomycetaceae)1.(Laceyella)2.(Mechercharimyces)3.(Planifilum)4.(Seinonella)5.(Shimazuella)6.(Thermoactinomyces)7.(Thermoflavimicrobium)10.(Turicibacteraceae)1.(Turicibacter)11.科未定1.(Pullulanibacillus)2.乳杆菌目(Lactobacillales)1.气球菌科(Aerococcaceae)1.(Abiotrophia)2.气球菌属(Aerococcus)3.(Dolosicoccus)4.(Eremococcus)5.(Facklamia)6.(Globicatella)7.(Ignavigranum)2.肉杆菌科(Carnobacteriaceae)1.(Agitococcus)2.(Alkalibacterium)3.(Allofustis)4.(Alloiococcus)5.(Atopococcus)6.(Atopostipes)7.肉杆菌属(Carnobacterium)8.德库菌属(Desemzia) （DSMZ，德国微生物与细胞保藏中心）9.(Dolosigranulum)10.(Granulicatella)11.(Isobaculum)12.(Lactosphaera)13.(Marinilactibacillus)14.(Trichococcus)3.肠球菌科(Enterococcaceae)1.(Atopobacter)2.(Catellicoccus)3.肠球菌属(Enterococcus)4.(Melissococcus)5.(Pilibacter)6.(Tetragenococcus)7.漫游球菌属(Vagococcus)4.乳杆菌科(Lactobacillaceae)1.乳杆菌属(Lactobacillus)2.(Paralactobacillus)3.片球菌属(Pediococcus)5.明串珠菌科(Leuconostocaceae)1.明串珠菌属(Leuconostoc)2.(Oenococcus)3.(Weissella)6.颤螺旋菌科(Oscillospiraceae)1.颤杆菌克(Oscillibacter)2.颤螺旋菌属(Oscillospira)7.链球菌科(Streptococcaceae)1.乳球菌属(Lactococcus)2.(Lactovum)3.链球菌属(Streptococcus)8.科未定1.(Acetoanaerobium)2.互营球菌属(Syntrophococcus) 梭菌纲(Clostridia)1.梭菌目(Clostridiales)1.梭菌科(Clostridiaceae)1.(Acetanaerobacterium)2.(Acetivibrio)3.(Acidaminobacter)4.(Alkaliphilus)5.(Anaerobacter)6.(Anaerotruncus)7.(Anoxynatronum)8.(Bryantella)9.(Caloramator)10.(Caloranaerobacter)11.(Caminicella)12.(Clostridiisalibacter)13.梭菌属(Clostridium)14.(Coprobacillus)15.(Dorea)16.(Ethanoligenens)17.(Faecalibacterium)18.(Fastidiosipila)19.(Garciella)20.(Gracilibacter)21.(Guggenheimella)22.(Hespellia)23.(Natronincola)24.(Oxobacter)25.(Parasporobacterium)26.八叠球菌属(Sarcina)27.(Soehngenia)28.(Sporacetigenium)29.(Sporobacter)30.(Subdoligranulum)31.(Tepidibacter)32.(Tepidimicrobium)33.(Thermobrachium)34.(Thermohalobacter)35.(Tindallia)2.优杆菌科(Eubacteriaceae)1.醋杆菌属(Acetobacterium)2.(Alkalibacter)3.(Anaerofustis)4.(Anaerovorax)5.优杆菌属(Eubacterium)6.(Mogibacterium)7.(Pseudoramibacter)3.太阳杆菌科(Heliobacteriaceae)1.太阳杆状菌属(Heliobacillus)2.太阳杆菌属(Heliobacterium)3.嗜日菌属(Heliophilum)4.(Heliorestis)4.毛螺旋菌科(Lachnospiraceae)1.(Acetitomaculum)2.(Anaerofilum)3.(Anaerostipes)4.丁酸弧菌属(Butyrivibrio)5.(Catenibacterium)6.(Catonella)7.粪球菌属(Coprococcus)8.(Johnsonella)9.(Lachnobacterium)10.毛螺旋菌属(Lachnospira)11.(Moryella)12.(Oribacterium)13.假丁酸弧菌属(Pseudobutyrivibrio)14.(Roseburia)15.瘤胃球菌属(Ruminococcus)16.(Shuttleworthia)17.(Sporobacterium)5.消化球菌科(Peptococcaceae)1.(Carboxydothermus)2.(Cryptanaerobacter)3.(Dehalobacter)4.(Desulfitobacterium)5.(Desulfonispora)6.(Desulfosporosinus)7.(Desulfotomaculum)8.(Pelotomaculum)9.消化球菌属(Peptococcus)10.(Syntrophobotulus)11.(Thermincola)12.(Thermoterrabacterium)6.消化链球菌科(Peptostreptococcaceae)1.(Anaerococcus)2.(Filifactor)3.(Finegoldia)4.(Fusibacter)5.(Gallicola)6.(Helcococcus)7.微单胞菌属(Parvimonas) （原名Micromonas）8.(Peptoniphilus)9.消化链球菌属(Peptostreptococcus)10.(Sedimentibacter)11.(Sporanaerobacter)12.(Tissierella)7.互营单胞菌科(Syntrophomonadaceae)1.(Aminiphilus)2.(Aminobacterium)3.(Aminomonas)4.(Anaerobaculum)5.(Anaerobranca)6.(Caldicellulosiruptor)7.(Carboxydocella)8.(Dethiosulfovibrio)9.(Pelospora)10.互营单胞菌属(Syntrophomonas)11.(Syntrophospora)12.互营热菌属(Syntrophothermus)13.(Thermaerobacter)14.(Thermanaerovibrio)15.(Thermohydrogenium)16.(Thermosyntropha)17.(Thermovirga)8.韦荣氏菌科(Veillonellaceae)1.(Acetonema)2.氨基酸球菌属(Acidaminococcus)3.(Allisonella)4.(Anaeroarcus)5.(Anaeroglobus)6.(Anaeromusa)7.(Anaerosinus)8.(Anaerovibrio)9.(Centipeda)10.(Dendrosporobacter)11.(Dialister)12.(Megamonas)13.(Megasphaera)14.光冈菌属(Mitsuokella)15.(Papillibacter)16.(Pectinatus)17.(Pelosinus)18.(Phascolarctobacterium)19.(Propionispira)20.(Propionispora)21.(Quinella)22.(Schwartzia)23.新月形单胞菌属(Selenomonas)24.鼠孢菌属(Sporomusa)25.(Sporotalea)26.(Succiniclasticum)27.(Succinispira)28.(Thermosinus)29.韦荣氏菌属(Veillonella)30.(Zymophilus)9.科未定1.(Anaerovirgula)2.(Dethiosulfatibacter)3.(Geosporobacter)4.(Howardella)5.(Proteiniborus)2.盐厌氧菌目(Halanaerobiales)1.盐厌氧菌科(Halanaerobiaceae)1.盐厌氧菌属(Halanaerobium)2.(Halocella)3.(Haloincola)4.(Halothermothrix)2.盐拟杆菌科(Halobacteroidaceae)1.(Acetohalobium)2.(Halanaerobacter)3.盐拟杆菌属(Halobacteroides)4.(Halonatronum)5.(Natroniella)6.(Orenia)7.(Selenihalanaerobacter)8.(Sporohalobacter)3.盐碱厌氧菌目(Natranaerobiales)1.盐碱厌氧菌科(Natranaerobiaceae)1.盐碱厌氧菌属(Natranaerobius)4.热厌氧杆菌目(Thermoanaerobacteriales)1.热厌氧杆菌科(Thermoanaerobacteriaceae)1.(Acetogenium)2.(Ammonifex)3.(Caldanaerobacter)4.(Carboxydibrachium)5.(Coprothermobacter)6.(Desulfovirgula)7.(Gelria)8.(Mahella)9.(Moorella)10.(Sporotomaculum)11.(Tepidanaerobacter)12.(Thermacetogenium)13.热厌氧单胞菌属(Thermanaeromonas)14.(Thermoanaerobacter)15.(Thermoanaerobium)16.(Thermoanaerobacterium)17.热厌氧菌属(Thermoanaerobium)18.(Thermobacteroides)19.(Thermosediminibacter)20.(Thermovenabulum)2.热脱硫菌科(Thermodesulfobiaceae)1.热脱硫菌属(Thermodesulfobium) 5.目未定1.(Desulfitibacter)2.(Symbiobacterium)热石杆菌纲(Thermolithobacteria)1.热石杆菌目(Thermolithobacterales)1.热石杆菌科(Thermolithobacteraceae)1.热石杆菌属(Thermolithobacter) 梭杆菌门(Fusobacteria)梭杆菌纲(Fusobacteria)1.梭杆菌目(Fusobacteriales)1.梭杆菌科(Fusobacteriaceae)1.梭杆菌属(Fusobacterium)2.(Ilyobacter)3.纤毛菌属(Leptotrichia)4.(Propionigenium)5.(Sebaldella)6.(Sneathia)7.(Streptobacillus)2.科未定1.(Cetobacterium)芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes)1.芽单胞菌目(Gemmatimonadales)1.芽单胞菌科(Gemmatimonadaceae)1.芽单胞菌属(Gemmatimonas)黏胶球形菌门(Lentisphaerae)黏胶球形菌纲(Lentisphaerae)1.黏胶球形菌目(Lentisphaerales)1.黏胶球形菌科(Lentisphaeraceae)1.黏胶球形菌属(Lentisphaera)2.食物谷菌目(Victivallales)1.食物谷菌科(Victivallaceae)1.食物谷菌属(Victivallis)硝化螺旋菌门(Nitrospirae)硝化螺旋菌纲(Nitrospira)1.硝化螺旋菌目(Nitrospirales)1.硝化螺旋菌科(Nitrospiraceae)1.钩端螺菌属(Leptospirillum)2.硝化螺旋菌属(Nitrospira)3.磁杆菌属(Magnetobacterium)*4.热脱硫弧菌属(Thermodesulfovibrio) 浮霉菌门(Planctomycetes)浮霉菌纲(Planctomycetacia)1.浮霉菌目(Planctomycetales)1.浮霉菌科(Planctomycetaceae)1.(Blastopirellula)2.(Gemmata)3.(Isosphaera)4.小梨形菌属(Pirellula)5.浮霉菌属(Planctomycetes)6.红小梨形菌属(Rhodopirellula)7.(Schlesneria)2.科未定（均未能分离培养，见厌氧氨氧化菌）1.(Brocadia)*2.(Kuenenia)*3.(Scalindua)*海绵杆菌门(Poribacteria)*变形菌门(Proteobacteria)α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)1.柄杆菌目(Caulobacterales)1.柄杆菌科(Caulobacteraceae)1.(Asticcacaulis)2.短波单胞菌属(Brevundimonas)3.柄杆菌属(Caulobacter)4.苯基杆菌属(Phenylobacterium)2.(Kordiimonadales)1.(Kordiimonadaceae)1.(Kordiimonas)3.短小盒菌目(Parvularculales)1.短小盒菌科(Parvularculaceae)1.短小盒菌属(Parvularcula)4.根瘤菌目(Rhizobiales)1.橙单胞菌科(Aurantimonadaceae)1.橙单胞菌属(Aurantimonas)2.(Fulvimarina)3.(Martelella)2.巴通体科(Bartonellaceae)1.巴通体属(Bartonella)3.(Rochalimaea)3.拜叶林克氏菌科(Beijerinckiaceae)1.拜叶林克氏菌属(Beijerinckia)2.(Chelatococcus)3.(Methylocapsa)4.(Methylocella)4.慢生根瘤菌科(Bradyrhizobiaceae)1.阿菲波菌属(Afipia)2.农单胞菌属(Agromonas)3.(Balneimonas)4.芽生杆菌属(Blastobacter)5.(Bosea)6.慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)7.硝化杆菌属(Nitrobacter)8.(Oligotropha)9.(Rhodoblastus)10.红假单胞菌属(Rhodopseudomonas) 5.布鲁氏菌科(Brucellaceae)1.布鲁氏菌属(Brucella)2.(Crabtreella)3.(Daeguia)4.支动菌属(Mycoplana)5.苍白杆菌属(Ochrobactrum)6.(Pseudochrobactrum)6.黏着杆菌科(Cohaesibacteraceae)1.黏着杆菌属(Cohaesibacter)7.生丝微菌科(Hyphomicrobiaceae)1.(Ancalomicrobium)2.(Angulomicrobium)3.水杆菌属(Aquabacter)4.芽绿菌属(Blastochloris)5.(Devosia)6.(Dichotomicrobium)7.(Filomicrobium)8.(Gemmiger)9.生丝微菌属(Hyphomicrobium)10.(Methylorhabdus)11.土微菌属(Pedomicrobium)12.突柄微菌属(Prosthecomicrobium)13.红微菌属(Rhodomicrobium)14.(Rhodoplanes)15.(Seliberia)8.甲基杆菌科(Methylobacteriaceae)。