MicroRNA研究进展
miRNA的研究进展
miRNA的研究进展microRNA又称miRNA,是真核生物细胞中固有的一类不编码蛋白的小分子RNA。
生物体中,miRNA能够转录后调控基因的表达,影响着几乎所有的信号通路,参与多种生理病理过程,在肿瘤的发生和发展中也发挥了重要的调节作用。
研究miRNA与肿瘤的关系是近年来备受关注的热点之一,其影响肿瘤发生和发展的作用机制将为肿瘤的诊断和治疗提供新的思路。
[Abstract] microRNA, also called miRNA, is a class of small non-protein coding RNA in eukaryotic cells. In many organisms, miRNA can post-transcriptional control gene expression and effect almost all of the signaling pathway. It parcitipates in many physiological and pathological processes and plays a important role in regulation of tumor occurrence and development. The study of the relationship between miRNA and tumor is one of the hotspots in recent years, the mechanisms of impact of tumor occurrence and development may provide new ideas for diagnosis and treatment.[Key words] miRNA; Tumor; Gene regulation; Target gene研究发现,人类和其他高级真核生物的基因组中只有一小部分基因编码蛋白质,而超过97%的转录产物是非编码RNA[1]。
microRNA及其应用研究进展
19 9 3年 , e L e等 首 先 在 秀 丽 新 小 杆 线 虫 ( a nradt l a s 中发 现 了第一 个可 时序 调 C e o b isee n ) h i g 控 胚胎 后期 发育 的基 因 l 一 l7年 之 后 , en at i 4i n l , R ih r 等 又 在 同类 线 虫 中发 现 了第 二 个 异 时 性 开 关 基 因
【 键 词 ] m co N 基 因表 达 ; 关 irR A; 干细 胞 ; 疫 ; 病 免 疾
[ 中图分类号 ] Q 4 7
[ 文献标识码 ] A
[ 文章编号] 10 — 0 22 1)10 9 — 6 0 9 0 0 (0 1 — 0 8 0 0
m ir RNA nd Re e Adv nc s i Ap ia i ns co a c nt a e n plc to
p o e s i h e e r h o h u cin o c o NA r u rg s n t e r s a c n t e f n t f mi r R r o we e s mma z d i re .
[ y wo d ] mi o N g n x rsi ; tm cl m u i ; i ae Ke r s c R A; e e e pes n s e ;i m n y ds s r o e l t e
[ s at mi o N m R A r n oeo snn po i-o ig R A o p rx ae 2 n c o ds hu Abt c】 r c R A(iN 1ae e dgnu o - r e cdn N fapoi tl 2 ul t e.T o— r tn m y ei
9 8
生
MicroRNA靶基因的寻找及鉴定方法研究进展
MicroRNA靶基因的寻找及鉴定方法探究进展miRNA靶基因的寻找是一个复杂而具有挑战性的任务。
目前,已经开发了多种计算机算法和试验方法来猜测和验证miRNA的靶基因。
计算机算法主要基于miRNA与靶基因mRNA序列的互补性原则进行猜测。
最常用的算法包括TargetScan、miRanda和PicTar等。
这些算法通过思量miRNA与靶基因之间的碱基配对状况、保守性、自由能和二级结构等因素,猜测潜在的miRNA靶基因。
虽然这些计算机算法能够高通量地猜测大量的潜在靶基因,但其准确性和可靠性依旧存在一定的局限性。
试验验证是必不行少的,可以通过miRNA靶基因的表达调控以及miRNA与靶基因的结合来验证猜测结果。
例如,常用的试验方法包括荧光素酶报告基因系统、蛋白质表达分析以及miRNA与靶基因mRNA之间的结合试验等。
近年来,随着高通量测序技术的进步,通过系统生物学的方法来鉴定miRNA靶基因也受到了广泛关注。
这些方法主要包括microRNA-mRNA结合体免疫沉淀(RIP)、RNA交叉链接免疫沉淀(CLIP)以及肿瘤相关基因芯片等。
其中,RIP和CLIP 技术通过miRNA结合蛋白的抗体沉淀miRNA靶基因的mRNA,然后通过测序或芯片分析,找到miRNA的靶基因。
肿瘤相关基因芯片可以同时测定上千种miRNA和mRNA的表达水平,通过对肿瘤样本和非肿瘤样本进行比较,筛选出与miRNA调控相关的靶基因。
miRNA靶基因的鉴定工作不仅限于单个miRNA的探究,也可以进行全基因组的分析。
近年来,探究人员发现多种miRNAs靶向同一个基因的现象,这些miRNAs被称为“miRNA网络”。
探究miRNA网络有助于全面了解miRNA参与的调控网络,从而揭示更为复杂的miRNA调控机制。
综上所述,miRNA靶基因的寻找和鉴定方法经历了从计算机算法到试验验证、再到高通量测序和全基因组分析的进步过程。
随着技术的不息进步,我们对miRNA调控的熟识将变得更加深度。
大肠癌相关microRNA研究进展
200 8
年第 3 5 卷 第
16
期
中国 肿瘤临 床
综
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microRNA与冠心病的研究进展
microRNA与冠心病的研究进展微小RNA(microRNA)是一类真核生物内源性小分子单链RNA,通过与靶mRNA特异性结合来调节基因表达,其表达具有组织特异性。
功能学研究发现microRNA参与冠心病的众多病理生理过程。
最近研究发现microRNA不仅在血中以微泡、外核体、调亡小体及蛋白复合物等形式能稳定存在,而且具有样木易于采集、保存期长及检测手段简便等特点,临床应用价值也更明显,己成为冠心病生物标志物研究的热点领域。
现就microRNA在冠心病的发病机制、疾病诊断、治疗及预后判断等方而的关系及其作为生物标志物的应用前景进行综述。
关键词:microRNA;冠心病;研究进展1、microRNA的来源及特性1.1 microRNA的来源在正常人中己经测序出100多种microRNAs。
对于microRNA准确的来源和其病理、生理情况下的生物功能还仍在研究,目前有关microRNA的来源主要有两种观点:来源于组织损伤后的被动释放,如microRNA-208 (micro-208)在心脏组织特异性表达,当心肌组织损伤后可在血清中检测到[1]。
microRNA由细胞主动释放。
成熟的microRNA在细胞内被脂质或脂蛋白包被成外核体或超微小泡后分泌至胞外并进入血液,可经内吞作用进入受体细胞并去包被,释放microRNA发挥生物学功能。
1.2microRNA的特性microRNA能稳定存在于人血浆中,不会被内源性RNA酶降解。
通过高通量测序技术发现,男性、女性microRNA种类相似,且在恶劣环境下(如高温、极低或极高的pH环境、多次冻融等)仍能保持稳定[2]。
microRNA保持稳定性的机制主要有:形成微泡,分泌到中的microRNA被包裹在脂质泡中,形成微泡,从而免受中RNA酶的降解,且微泡表而带有识别靶细胞的特异性受体或配体,可转运microRNA到靶细胞,发挥调节功能。
形成蛋白复合物,microRNA以蛋白复合体的形式存在。
蜜蜂microRNA的研究进展
现其中 81 个 miRNA 在其他昆虫中有同系物, 表明 它们是真实存在的 miRNA, 并与同系物具有相似的 功能。这一研究结果为研究蜜蜂发育、 级型分化等 方 面 的 miRNA 调 控 网 络 提 供 了 基 础。 Shi 等 ( 2012 ) 分别对中华蜜蜂 Apis cerana cerana 与意大利 蜜蜂 Apis mellifera ligustica 蜂王浆中 miRNA 表达谱 进行检测, 发现两者存在着差异, 由此推测 miRNA 在蜜蜂级型分化发挥着调控作用 。Guo 等( 2013 ) 则 运用高通量测序技术 Solexa 检测了意蜂工蜂浆和蜂 王浆中的小 RNA 表达谱, 发现工蜂浆中的 miRNA 表达量是蜂王浆中的 7 ~ 215 倍, 而且在幼虫发育的 4 - 6 , 第 天 工蜂幼虫食物和蜂王浆中 miRNA 表达 在给蜂王幼虫饲喂添 量有明显的动态变化。 另外, 结果不仅导致其 加了特异性 miRNA 的蜂王浆之后, 体内 mRNA 的表达出现明显的变化, 而且发育而成 的新蜂王的形态特征也有明显的变化, 特别是添加 184 的 蜂 王 浆, 了 miR变 化 尤 为 明 显。 Guo 等 ( 2013 ) 的 研 究 进 一 步 证 明 了 哺 育 蜂 分 泌 物 中 的 miRNA 是蜜蜂级型分化调控机制的重要组成部分 。
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昆虫学报 Acta Entomologica 人们运用各种生物技术在哺 乳动物、 昆虫、 病毒体等生物中发现已鉴定注册的 miRNAs 共有 24 521 个, 其中在蜜蜂中发现 218 个 ( http: / / www. mirbase. org / ) 。 蜜蜂是重要的社会性经济昆虫, 一直是国际上 特别在社会性结构相关的诸多领 热门的研究对象, 域是研究热点。 充分认识 miRNA 对蜜蜂各方面的 调控机制, 对于养蜂生产具有重要的指导意义。 例 如, 了解 miRNA 对蜜蜂免疫系统方面的调控机制, 就能针对性地有效地采取相关措施防治蜂群病虫害 及细菌病毒感染; 了解 miRNA 对蜜蜂劳动分工行为 的调节机制, 便能更好地掌握蜂群发展的规律 , 根据 从而达 需要控制蜂群中各种不同分工蜜蜂的数量 , 而且也可以为人类认 到增加蜂产品的产量的目的, 识动物行为的可塑性提供重要的线索 。随着蜜蜂基 因组 测 序 的 完 成 ( Honey Bee Genome Sequencing Consortium, 2006 ) , Weaver 等 ( 2007 ) 运用 3 种独立 的计算方法在蜜蜂基因组中确认了 65 个非冗余候 选的 miRNA, 通过对蜜蜂 miRNA 转录差异分析发 更有可能是蜜 现 miRNA 可能参与调节蜜蜂的发育, 蜂级 型 分 化 的 关 键 性 调 控 因 子。 自 此 蜜 蜂 领 域 miRNA 的研究随之展开。 近年的研究发现 miRNA 对蜜蜂级型分化、 劳动分工行为、 免疫系统等方面都 可能发挥着重要的调控作用, 本文就其最新的研究 进展进行了综述。
microRNA 在免疫系统中的研究进展
microRNA 在免疫系统中的研究进展摘要: micro RNA (miRNA)是真核细胞中一类内源性长度约18—24个核苷酸的非编码蛋白质的单链小分子RNA , 广泛存在于多细胞生物和病毒体内, miRNA本身不编码蛋白,其主要是通过核酸序列互补配对到特定的靶mRNA 上, 抑制靶mRNA翻译过程或降解靶mRNA , 从而抑制蛋白质的合成,调控基因表达。
据相关报道显示,microRNA广泛参与生物体内多种生理生化的免疫反应过程,其功能失调可能导致肿瘤发生、病毒感染、造血细胞的异常表达及免疫性疾病(RA、SLE)等多种病理现象。
本文主要阐述mirna的相关机制及在免疫系统中的一些研究进展情况。
关键词: micro RNA (miRNA) ; 靶基因; 免疫系统微小RNA (microRNA, miRNA)是一类内源性的长度约22个核苷酸的非编码小分子RNA,能够在转录后水平调节mRNA表达,广泛存在于病毒、线虫、植物、动物体内。
成熟的miRNA 能够通过核酸序列互补识别特定的目标mRNA , 使之降解或抑制其翻译,从而抑制蛋白质的合成, 达到调控基因表达的目的。
miRNA基因以单拷贝、多拷贝或基因簇等多种形式存在于基因组中,而且绝大部分定位于基因间隔区,其转录独立于其他基因。
这类小RNA分子表达具有空间和时间上的特异性, 是调控其他功能基因表达的重要分子, 目前已发现在人类800多种miRNA序列中有100多种是由免疫细胞表达,研究证明,miRNAs参与细胞的产生、分化、凋亡、天然免疫和获得性免疫应答反应,与免疫系统疾病密切相关。
1.mirRNA的发现1993 年, Lee 等在秀丽新小杆线虫中发现了第一个可时序调控胚胎后期发育的基因lin-4[1],1998年美国科学家Andrew Fire和Craig C. Mello发现dsRNA能诱导基因沉默,2000 年, Reinhart 等又在该线虫中发现第二个异时性开关基因let-7[2 ],。
微小RNA生物学研究进展
微小RNA生物学研究进展微小RNA生物学是分子生物学研究领域中的一个热点,目前取得了许多的研究进展。
微小RNA是一类长度在18-25个核苷酸左右的非编码RNA分子,可以通过靶向蛋白质编码基因、干扰RNA和诱导基因剪接等多种方式发挥作用。
这些微小RNA可以通过调控细胞发育、生命周期和代谢等生物过程,而影响生物体的健康状态。
本文将详细介绍微小RNA的分类、功能及其在各种疾病中的作用。
一、微小RNA的分类微小RNA分为siRNA、miRNA和piRNA这三大类。
其中,siRNA全称small interfering RNA,它由基因水解形成,在RNA干扰(RNA interference)过程中靶向蛋白编码基因;miRNA全称microRNA,是由基因转录而成,在细胞质内调节蛋白编码基因表达;piRNA全称PIWI-interacting RNA,是只在生殖细胞中表达的小RNA分子。
二、微小RNA的功能微小RNA的主要功能是对转录后的mRNA进行稳定性和翻译抑制作用。
siRNA通过靶向序列特异性识别细胞核中异源RNA并去除它们;miRNA参与了基因表达、细胞分化、细胞增殖、凋亡、免疫细胞发育和表观遗传等多种生物过程;piRNA起着维持生殖细胞基因组稳定性的作用。
三、微小RNA与疾病微小RNA在多种疾病的发生和发展中都发挥了重要作用。
如在心血管疾病中,“肥胖型”miRNA可以影响血管新生、血管内皮细胞的损伤和氧化应激反应等过程,从而导致血管狭窄和动脉粥样硬化。
在肝病中,miRNA也起着重要的作用。
研究发现,miRNA可以参与肝脏细胞的增殖、凋亡、纤维化、胆汁酸合成及代谢等生物过程。
在肝细胞癌中,某些miRNA表达上调,而某些则表达下调,不同的miRNA组合呈现出不同的诊断与预后价值。
在神经退行性疾病中,miRNA也发挥了一定的作用。
miRNA在调节突触形成、神经元大小和生成等生物过程中发挥着重要作用。
许多神经退行性疾病都和miRNA异常表达有关,如阿尔茨海默病、帕金森病和脊髓性肌萎缩症等。
MicroRNA—21相关靶基因的研究进展
MicroRNA—21相关靶基因的研究进展MicroRNA是一类非编码小分子RNA,表达于机体的各个组织和器官,主要通过与相关靶基因结合在转录后水平负性调控约60%的人类基因[1]。
其中,miRNA-21在心脑血管、肝脏、肺脏、肾脏等多种疾病中异常表达,明确其所调控的靶基因对阐明miRNA-21的功能及在各种生命过程和疾病发生机制中的作用非常关键。
从而确定miRNA与靶基因的对应关系。
这种方法可本文就目前国内外关于miRNA-21靶基因的研究进展做一综述。
1 实验证实的miR-21靶基因1.1 PTEN 目前研究证明了miRNA是通过与PTEN的3’ UTR端直接结合而抑制其表达[2]。
Ou等分别通过上调及敲低miR-21在鼻咽癌CNE1和CNE2细胞系中的表达水平,发现miR-21可诱导鼻咽癌细胞生长并抑制细胞凋亡;在创伤性脑损伤体外实验中,Wang等证实了miR-21可通过PTEN/Akt信号通路,调节其下游凋亡相关蛋白Caspase-3,Caspase-9,Bcl-2和Bax的表达水平来减少神经元细胞的凋亡,提供了新的创伤性脑损伤神经元凋亡的分子机制,并且提示miR-21可能为其治疗的潜在靶点。
1.2 PDCD4 Angelo Ferraro等在一组结肠肿瘤标本研究中,对miR-21、ITGβ4、PDCD4定量PCR数据集进行ROC曲线分析,结果显示,miR-21表达水平增高、ITGβ4、PDCD4表达水平降低,且三基因组合能够预测结直肠癌的转移[3]。
在宫颈癌hela细胞中转染miRNA21抑制剂后,检测到细胞中PDCD4表达明显上升,进一步研究证实miRNA-21上存在一个与PDCD4 mRNA 3’ UTR相结合的位点,抑制miRNA-21可导致PDCD4的表达上调。
1.3原肌球蛋白1 TPM1 Wang.M证明TPM1 mRNA 3’-UTR是miR-21的直接作用靶点,miR-21通过TPM1来调节血管平滑肌细胞的功能。
MicroRNA_在骨骼发育与修复中的功能研究进展
1472022年2月上 第03期 总第375期学术研究China Science & Technology Overview0.引言骨骼是由骨、软骨、脂肪、成纤维细胞、神经、血管和造血细胞等组成的器官,它不仅为哺乳动物身体提供了物理支架,还可以通过再生来修复使其恢复完全功能状态。
骨的细胞在不停地进行着细胞代谢,在骨代谢中有两种细胞起着重要的作用,一种是吸收骨基质的破骨细胞,另一种是合成骨基质的成骨细胞。
成骨细胞的骨生成与破骨细胞的骨吸收相互协调使得哺乳动物得以保持正常骨量及骨骼完整性[1]。
MicroRNA(miRNA)是由真核细胞产生的一类,长约19nt ~24nt,具有调节功能的、保守的、单链非编码RNA,对基因表达进行转录中或者转录后调节。
近年来,随着对miRNA 包括其靶基因涉及信号通路研究的深入,发现越来越多的miRNA 及靶基因在哺乳动物生理过程中具有重要功能,在骨骼发育与修复上更具有不可忽视的作用。
1. miRNA 调控骨骼细胞生长发育1.1 miRNA 调控成骨细胞成骨细胞是骨骼发育的重要细胞,miRNA 与成骨细胞分化及骨形成有着密不可分的联系。
miRNA 在干细胞成骨分化过程中发挥了重要作用[2],已经被广泛用于骨再生方面的研究,多种miRNA 对间充质干细胞及骨髓干细胞的成骨分化具有调控作用。
研究表明,部分miRNA 能抑制骨分化,逆转骨丢失:miR-146a 能抑制骨髓间充质干细胞的成骨分化[3],而miR-214抑制人脂肪干细胞的成骨分化过程[4]。
随着对miRNA及骨骼发育与修复相关生理过程研究的深入,miRNA 对成骨细胞分化的影响呈现出多维度、多角度的特点。
Pei 通过细胞实验证明在骨髓间充质干细胞的表达下调的miR-22可以促进成骨细胞的形成。
随后验证miR-22的antagomir 将前成骨细胞转化为更分化和矿化的表型,ALP、CBFA1和COL1A1蛋白表达水平的上调。
microRNA在甲状腺癌中的研究进展
microRNA在甲状腺癌中的研究进展甲状腺癌是近年来发病率显著增加的一种癌症,其发病机制十分复杂。
随着分子生物学和基因组学领域的不断发展,越来越多的研究发现,microRNA(miRNA)在甲状腺癌中的作用受到广泛关注。
miRNA是一类长约22个核苷酸的小分子RNA,能够通过与mRNA结合调控基因表达,从而影响细胞增殖、凋亡、转移等生物学过程。
本文将对目前miRNA在甲状腺癌中的研究进展进行综述。
miRNA对甲状腺癌分子亚型的识别和分类起到了关键作用。
一项研究发现,在不同的甲状腺癌亚型中,miRNA的表达模式存在显著差异。
例如,Papillary thyroid carcinoma (PTC)瘤组织中miRNA-146b-5p和miRNA-221的表达显著上调,而miRNA-375、miRNA-148b 和miRNA-10a的表达则显著下调。
miRNA-222在Follicular thyroid carcinoma(FTC)中表达显著上调,而miRNA-148a、miRNA-542-3p和miRNA-29c的表达则下调。
另外,miRNA-34a和miRNA-181a在各种甲状腺癌亚型中也表现出不同的表达模式。
这些miRNA的表达改变对PTC和FTC的分类有一定帮助。
miRNA对甲状腺癌的发生发展起到了重要的调控作用。
miRNA通过抑制或促进靶基因的表达发挥作用,从而影响甲状腺癌的细胞增殖、侵袭和转移。
例如,miRNA-222和miRNA-221能够通过调控p27Kip1的表达促进PTC的增殖和侵袭。
另外,miRNA-146b-5p也是PTC组织中高表达的miRNA之一,其能够通过抑制SMAD4表达增强TGF-β信号通路,从而促进PTC的侵入和血管生成。
miRNA-138和miRNA-139通过抑制Bmi-1和 HMGA2等基因表达,抑制FTC和ATC的增殖和侵袭。
miRNA-29a通过抑制MCL1和CDK6等基因表达,从而促进ATC细胞凋亡和抑制其增殖。
脓毒症相关的microRNA的研究进展
脓毒症相关的microRNA的研究进展阮正上【摘要】微RNA(microRNA)是一系列单链非编码RNA,可以使mRNA降解或抑制其翻译,来最终达到调控基因表达.Toll样受体介导的信号通路被认为与脓毒性休克的发生发展有重要的关系.一些microRNA(miR-223、miR-146、miR-150、miR-4772家族等)能够区分脓毒症患者与正常患者.microRNA存在于血液和尿中,容易获得,并且可以快速测定,这些与细菌学培养相比有很大的优势.这些优势使得microRNA可以作为潜在的判断脓毒症预后的指标.许多研究显示部分mircoRNA(miR-200家族、miR-149、miR-146家族等)作用于TLR-NF-κB信号通路,从而在脓毒症的发病中起到了重要的作用.更重要的是,部分microRNA体现出可能干预脓毒症发展的应用前景.因此,积极研究microRNA在脓毒症中的作用机制不仅可以加深对脓毒症了解,同时对于可能产生的新的治疗方法有相当重要意义.【期刊名称】《医学综述》【年(卷),期】2016(022)001【总页数】4页(P41-44)【关键词】脓毒症;微RNA;炎症反应【作者】阮正上【作者单位】上海交通大学医学院附属新华医院麻醉与重症医学科,上海200092【正文语种】中文【中图分类】R631.3脓毒症是指由感染引起的全身炎症反应,是导致多器官功能障碍综合征的重要原因。
脓毒症的发病机制中占主导地位的主要是炎症“瀑布”反应学说:当致病原侵入或损伤组织后可迅速激活人体的非特异性免疫系统,导致释放大量糖皮质激素、儿茶酚胺以及白细胞介素(interleukin,IL)1、肿瘤坏死因子α等促炎细胞因子,并且导致特异性免疫功能障碍,即免疫麻痹。
虽然针对Toll样受体-核因子κB(Toll-like receptor/nuclear factor-κB,TLR-NF-κB)信号通路参与脓毒症发展过程研究颇多,但根据此理论使用抗炎药物如皮质类固醇激素、抗内毒素抗体、白细胞介素1受体拮抗剂以及肿瘤坏死因子拮抗剂使用的效果并没有想像的那么有效[1]。
microRNA概述及在胎盘中表达研究进展
RNA—et.7,该基因可以通过调控其靶基因lin.4l与hbl—l促进线虫幼虫向成虫转变。
此后,科学家又陆续发现与克隆出了大量的19.25nt长度的miRNA,并建立了专门的 miRNA注册网站(http://microma.sanger.ac.uk)。近几年内,miRNA已成为生命科学
界研究的热点。 Lin-4与let.7最初被发现时命名为小分子时序性RNA(small
②翻译抑制:当miRNA与其靶mRNA不完全互补时,miRNA贝I通过抑制其靶基
因的翻译过程从而调控基因表达。大多数哺乳动物的miRNA都是通过这一作用方式 来实现翻译沉默。 ⑨同时兼有以上两种作用方式:例OlHela细胞中的Iet.7与靶基因完全互补结合, 能直接介导RISC分裂切割靶mRNA,而线虫的let.7与靶基因不完全互补,只能抑制其 靶基因的翻译过程。
3、miRNA的生物合成与作用机制
(1)miRNA的转录成熟机制 miRNA的形成需要经历如下步骤: ①基因转录:编码miRNA的基因大多位于细胞核内基因间区或基因内含子中, 在RNA聚合酶Il的作用下转录生成原始转录本,即miRNA的初级转录产物(primary
miRNA,pri・miRNA)。
②pri.miRNA的加工:pri.miRNA长达几千个碱基,具有帽子结构和多聚A尾以 及一个或几个局部的发夹状结构,以多顺反子形式存在。在细胞核中,核RNaselIl酶 (Drosha)与一个双链RNA结合蛋白(DGCR8)[121形成一个复合体,剪切pri.miRNA 包含茎环结构的部分,生成长度为70nt左右的前体miRNA(miRNA
1993年,Lee等12】在应用遗传筛选方法寻找线虫胚胎后发育的缺损体时,发现了 一个调控线虫发育的基因lin-4,该基因长度为22nt,并不编码蛋白质,而是通过调控 其靶基因1in.14与1in.28促进线虫从发育L1期向L2期转化。之后的七年内该发现并未引 起科学界的重视。直至2000年,Reihart BJ等fⅫ’在线虫体内又发现了另一个非编码
microRNA在非酒精性脂肪性肝病中的研究进展
microRNA在非酒精性脂肪性肝病中的研究进展miRNA是一类长度约为22个核苷酸的非编码RNA,能够通过与靶基因的3'UTR结合,从而抑制靶基因的翻译或促使靶基因mRNA的降解,起到负向调节基因表达的作用。
miRNA在细胞生物学中扮演着重要的角色,在肝脏的脂质代谢、炎症反应、纤维化等方面也发挥着重要的调控作用。
在NAFLD/NASH的研究中,科研人员发现,miRNA在NAFLD/NASH的发病机制中起到了非常重要的作用。
在NAFLD的发病过程中,miRNA在脂质代谢方面发挥重要作用。
研究发现miR-122、miR-33等miRNA与NAFLD/NASH的发病密切相关。
miR-33通过抑制ABCA1和ABCG1来调节胆固醇代谢与运输,进而对NAFLD的发生发展产生影响。
miR-122是肝脏中最丰富的miRNA,它通过调节胆固醇合成和脂肪酸代谢对NAFLD的发生发展具有重要影响。
通过调节这些miRNA的表达水平,可以对NAFLD的发病过程产生调控作用。
miRNA还参与了NAFLD/NASH的炎症反应调节。
研究表明,miR-155、miR-21等miRNA的表达水平在NAFLD/NASH患者中出现改变。
miR-155能够通过抑制SOCS1、PPARγ等靶基因表达来加剧肝脏炎症反应,进一步诱导NASH的发生。
miR-21也能够通过抑制PDCD4、PTEN等靶基因表达来增强炎症反应,加剧NAFLD的发展。
miRNA对炎症因子的表达调节对NAFLD的发生发展具有重要的影响。
miRNA在NAFLD/NASH的发病机制中发挥了非常重要的作用,通过调节脂质代谢、炎症反应和纤维化等环节对NAFLD/NASH的发生发展产生了重要影响。
miRNA可能成为治疗NAFLD/NASH的新靶点。
近年来,一些研究也已经开始尝试利用miRNA进行NAFLD/NASH的治疗。
通过甲基化抑制剂、miRNA拮抗剂等手段调节miRNA的表达水平,已经在动物实验中显示出一定的效果。
植物microRNA的研究进展,河北农业大学学生
抗 环境 胁 迫 在 抗 环 境 胁 迫 方 面 , m i R N A 可以使植物抵抗寒冷 、 高 浓度 A B A 、 干旱、 高盐等极 端 自然 环境 及抵抗 环境 引起 的 自 身氧化 胁 迫
展望
人们在 miRNA 领域已经取得了一些重要的研究进展,然而,还有许多地方有待阐 明。尤其是在植物 miRNA 领域,对于拟南芥等模式植物甚至一些谷类作物中的 miRNA 与胁迫反应的关系还需要进一步研究。现有的研究表明 miRNA 的表达也受到 转录水平的调控,然 而,似乎与其它 RNA 分子一样,在转录后的加工处理过程中 miRNA 也受到调控,但这方面的证据还太少。 另一个重要的问题是,在胁迫反应中 miRNA 的表达是如何受到转录水平调控的。 在一个营养素缺乏的研究中,一个 MYB 样转录因子磷酸盐饥饿蛋白 1表达量增加, miR399 表达量也增加;而对于 phr1 突变株,在缺乏磷酸盐的条件下,miR399 的表 达降低但没有被完全阻遏,分析表明,PHR1 是一种能在缺乏磷酸盐的时候诱导 miR399 表达的蛋白质。miRNA 基因启动子元件对 miRNA 基因的转录调控作用在以后 的研究中也将是一个重点。 虽然已经发现了一些胁迫相关的 miRNA,但是还不能判断 miRNA 在植物胁迫耐 受中的重要性究竟有多大。到目前为止,还没有关于超量表达相关 miRNA 能提高转基 因植物胁迫耐性的报到。但是,通过研究 miRNA 之间以及与靶基因的相互作用关系, 还是能发现一些胁迫耐受中的关键的 miRNA 靶基因,如果采用适当的方法调控关键靶 基因的表达也有可能提高植物 谢 平 衡 硫 也 是 植 物 生 长发 育必不可少的元素 , 且在植 物体 内不易流动 , 故缺硫 植株 首先 在幼 叶表 现缺绿 症状 , 呈淡 绿 色 , 新 叶呈黄白色 , 叶 片渐趋皱 缩 、 脱落 。实验证 明 , m iR 395 在 高 硫 条 件 下 不 表 达 , 在 硫 缺 失 胁 迫 下 表 达 。 N orthern blot杂 交发 现 , m iR 395 可 与编 码 A T P 硫 酸化 酶 的 m R N A 结合 。 m iR 395 的过量 表 达导致 A PS 水平降低 , 使过表达 m iR 395 的植物体 内保 持 比野 生型较 高 的硫浓 度
microRNA的生物发生及作用机制研究进展
•综述・microRNA的生物发生及作用机制研究进展*王宁范志朋【摘要】miRNA是一种小的非编码RNA。
在细胞转录时,DNA双链打开,在RNA聚合酶II的作用下转录形成发卡样结构pri-miRNA,经过DGCR8和Drosha酶微处理器的作用后,剪切成pre-miRNA,在转运蛋白的协助下出核后,经酶的进一步剪切形成成熟的miRNA。
成熟的miRNA负载到AGO蛋白后,通过碱基互补配对的原则与下游靶向mRNA结合,沉默或降解下游mRNA部分miRNA在细胞质内未发挥作用,再次入核,结合到下游靶基因的启动子上,使下游靶基因的组蛋白发生甲基化。
若下游靶基因组蛋白H3K4发生甲基化,会促进转录,促进下游靶基因的表达。
若下游靶基因发生H3K9或H3727的甲基化,会导致转录抑制,抑制下游靶基因的表达。
此外,miRNA还可被包裹进外泌体内,分泌到细胞外,发挥其生物学作用。
miRNA在细胞质内还可与其他非编码RNA相互作用,如miRNA与miRNA,miRNA与LncRNA,miRNA与circRNA 的相互作用,抑制其他非编码RNA发挥其生物学功能,最终影响细胞的功能。
miRNA在细胞的生长发育,分化和疾病中都发挥重要的功能,本文就miRNA形成的生物学过程及作用机制的研究现状作一综述。
关键词:miRNA;pre-miRNA;生物发生;作用机制[中国图书分类号]R782[文献标识码]A D01:10.19749/.cjgd.l672-2973.2021.03.013Progress in the study of biogenesis and mechanism of microRNAWANG Ni'g,FAN Zhi—peng.(Beijing Stomatological Hospital affiliated to Capital Medical University,Beijing100050, China J[Abstract]miRNAs are small non-coding RNAs.During cell transcription,the DNA double strand is opened and transcribed into hair-like structure pri-miRNAs under the action of RNA polymerase II.After the action of DGCR8and Dicer enzyme microprocessor,pre-miRNAs are cut into.After nucleation with the assistance of transporters,mature miRNAs are formed through further cleavage by enzymes.When mature miRNA are loaded into AGO proteins,they bind to downstream targeted mRNA,silence or degrade downstream mRNA.through the principle of base complementary pairing.Some miRNAs do not play a role in the cytoplasm,but re-enter the nucleus and bind to the promoter of t he downstream target gene,thus methylating the histones of the downstream target gene.If the downstream target genomic protein H3K4is methylated,transcription will be promoted and the expression of downstream target genes will be promoted.The methylation of H3K9and K27of downstream target genes will lead to transcriptional inhibition and inhibit the expression of downstream target genes.In addition,miRNAs can also be encapsulated in exosomes and secreted into cells to play its biological role.In the cytoplasm, miRNAs can also interact with other non-coding RNAs,such as miRNA and miRNA,miRNA and LncRNA,and miRNA and CircRNA,which inhibit other non-coding RNAs from playing their biological functions and ultimately affect cell functions.miRNAs play an important role in cell growth,development,differentiation and disease.This paper reviews the current research status of the biological process and mechanism of miRNA formation.Key words:miRNA;pre-miRNA;biogenic;mechanism水基金项目:中国医学科学院医学与健康科技创新工程(项目编号:2019-12M-5-031)王宁首都医科大学附属北京口腔医院博士生北京100050范志朋通讯作者首都医科大学附属北京口腔医院教授北京100050miRNA是一种小的非编码RNA,长度约22个碱基,主要的生物学功能是通过结合目的mRNA 来沉默靶基因。
microRNA在非酒精性脂肪性肝病中的研究进展
microRNA在非酒精性脂肪性肝病中的研究进展随着现代生活水平的提高和饮食结构的变化,非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)正在成为全球范围内一种流行病学问题。
NAFLD是一种常见的慢性肝病,主要特征是肝内脂肪在没有明显酒精滥用的情况下,积累超过5%。
随着NAFLD的不断增加,研究人员开始关注微小RNA(microRNA,miRNA)在NAFLD中的作用和作用机制。
本文将对microRNA在NAFLD中的研究进展进行综述。
miRNA是一类短链非编码RNA,在基因表达调控中发挥重要作用。
miRNA通过与靶基因的3'非翻译区结合来调控靶基因的表达,从而影响细胞的生长、分化和凋亡等生物学过程。
越来越多的研究发现,miRNA在肝脏脂质代谢和NAFLD的发生发展中起着关键作用。
miRNA在NAFLD中的作用主要表现在以下几个方面:1. 脂质代谢调控:miRNA参与调控脂质代谢相关基因的表达,影响肝脏脂质代谢平衡。
miR-122是肝脏中最丰富的miRNA,可以调控脂质代谢途径中的多个关键基因,包括脂质合成酶、脂肪酸氧化酶等。
研究表明,miR-122的表达水平与NAFLD的严重程度呈正相关,提示miR-122可能在NAFLD的发生发展中发挥重要作用。
2. 炎症反应调控:miRNA参与调控肝脏炎症反应,影响NAFLD的炎症程度和肝脏损伤。
如miR-155、miR-146a等miRNA在肝脏炎症反应中发挥重要作用,通过调控炎症因子的表达水平来影响NAFLD的炎症反应。
近年来,研究人员对miRNA在NAFLD中的作用机制进行了深入探索,发现miRNA与NAFLD的发生发展密切相关。
miRNA不仅参与调控肝脏脂质代谢、炎症反应和纤维化过程,还与NAFLD的临床表现和预后密切相关。
miRNA可能成为NAFLD诊断、治疗和预后评估的重要生物标志物。
针对miRNA在NAFLD中的作用,研究人员提出了一些相关的治疗策略和观点。
《2024年MicroRNA靶基因的寻找及鉴定方法研究进展》范文
《MicroRNA靶基因的寻找及鉴定方法研究进展》篇一一、引言MicroRNA(miRNA)是一类内源性的、非编码的小RNA分子,它们在生物体内起着重要的调控作用,通过与靶基因的mRNA进行碱基互补配对,进而抑制基因的表达。
随着基因组学和生物信息学的发展,miRNA靶基因的寻找及鉴定方法日益受到研究者的关注。
本文旨在探讨当前MicroRNA靶基因的寻找及鉴定方法的研究进展。
二、MicroRNA靶基因的寻找方法1. 生物信息学预测法生物信息学预测法是当前最常用的miRNA靶基因寻找方法。
通过分析miRNA与mRNA的序列互补性,结合各种算法和软件,如TargetScan、miRanda、PicTar等,可以预测出潜在的miRNA 靶基因。
这些算法的准确性和灵敏度随着技术的发展而不断提高,使得预测的靶基因更为精确。
2. 基因芯片技术基因芯片技术可用于检测特定细胞或组织中miRNA的表达情况,结合已知的miRNA序列,可确定哪些基因可能是miRNA 的潜在靶基因。
此技术具有高通量、高灵敏度的特点,为大规模筛选miRNA靶基因提供了可能。
3. 报告基因法报告基因法是一种通过构建含有miRNA靶位点的报告基因载体,检测miRNA对报告基因表达的影响,从而确定miRNA的靶基因的方法。
此方法具有较高的灵敏度和特异性,但操作相对复杂。
三、MicroRNA靶基因的鉴定方法1. 荧光素酶报告实验荧光素酶报告实验是一种常用的鉴定miRNA靶基因的方法。
通过构建含有miRNA靶位点的荧光素酶报告载体,检测miRNA 对荧光素酶活性的影响,从而确定miRNA的靶基因。
此方法具有较高的准确性和灵敏度。
2. 突变体分析突变体分析是通过构建miRNA靶位点的突变体,观察突变后对miRNA调控的影响,从而确定miRNA的靶基因。
此方法可以验证生物信息学预测结果的准确性。
3. 蛋白质印迹法蛋白质印迹法是一种通过检测蛋白质表达水平的变化来确定miRNA靶基因的方法。
microRNA在非酒精性脂肪性肝病中的研究进展
microRNA在非酒精性脂肪性肝病中的研究进展近年来,非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)已成为全球范围内最常见的肝脏疾病。
NAFLD 是一种以肝脏脂肪堆积和炎症为特征的肝脏疾病,严重程度从脂肪肝到脂肪性肝炎、肝纤维化和肝硬化不等。
NAFLD的发病机制极为复杂,涉及多种细胞因子、调节因子和信号传导通路的异常改变。
最近的研究表明,microRNA(miRNA)在NAFLD的发生和发展中发挥着重要的作用。
miRNA是一类长度约为20-24个核苷酸的非编码RNA,能够通过与mRNA结合,影响蛋白质的合成。
miRNA通过调节基因的表达水平,参与调控几乎所有生物学过程,包括细胞增殖、分化、凋亡、细胞周期等。
在近年来的研究中,miRNA已被证实在NAFLD的病理生理过程中扮演着关键的角色。
miRNA与NAFLD的发生和发展密切相关。
实验研究表明,miRNA参与了肝细胞脂质代谢的调节,包括脂肪合成、氧化、运输和分解等过程。
在NAFLD患者的肝脏组织中,miRNA 的表达水平发生明显改变,其中一些miRNA的表达水平与NAFLD的严重程度呈正相关。
miR-122和miR-34a的表达水平与NAFLD的肝脏病变和纤维化程度密切相关。
miRNA还参与了炎症因子、纤维化因子和趋化因子的表达调控,影响了NAFLD的炎症和纤维化过程。
miRNA在NAFLD的发生和发展中发挥着重要的作用,涉及了NAFLD的发病机制、诊断和治疗等多个方面。
未来,随着对miRNA作用机制的进一步解析和技术的不断进步,miRNA 可能成为NAFLD诊断治疗的重要靶点和工具,为NAFLD的治疗带来新的策略和希望。
希望未来能够有更多的研究深入探究miRNA在NAFLD中的作用机制,为临床应用提供更为可靠和有效的依据。
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·综述与专论·生物技术通报B I O T EC H N O L O G Y B U L L E T I N2010年第12期Mi c r o R N A 研究进展赵奎 庞全海(山西农业大学动物科技学院,太谷030801) 摘 要: M i c r o R N A (m i R N A )是生物体内源长度约为21-25个核苷酸的非编码小R N A ,通过与靶m R N A 互补配对而在转录水平上对基因的表达进行负调控,导致m R N A 的翻译抑制或降解。
m i R N A 虽然微小,但它在真核生物发育和基因表达中通过与靶m R N A 形成完全或不完全互补配对从而扮演着重要角色。
它们参与动物体发育、细胞增殖与死亡、细胞分化等各种过程。
综述了m i R N A 的发现、生物合成、特征与功能、靶基因的预测等方面的研究进展。
关键词: m i R N A 生物学功能 靶基因预测T h e R e s e a r c hP r o g r e s s o f Mi c r o R N AZ h a o K u i P a n g Q u a n h a i(C o l l e g e o f A n i m a l S c i e n c e a n d V e t e r i n a r y M e d i c i n e ,S h a n x i A g r i c u l t u r e U n i v e r s i t y ,T a i g u 030801) A b s t r a c t : M i c r o R N A (m i R N A )a r e a c l a s s o f e n d o g e n o u s n o n c o d i n g s i n g l e -s t r a n d e d R N Aw i t h a b o u t 21-25n u c l e o t i d e s l e n g t h .M i c r o R N Af u n c t i o n a s s e q u e n c e -s p e c i f i c n e g a t i v e r e g u l a t o r s i np o s t -t r a n s c r i p t i o n a l g e n e s i l e n c i n g b y b a s e p a i r i n gw i t ht a r g e t m R N A s ,w h i c hl e a d s t om R N A c l e a v a g e o r t r a n s l a t i o n a l r e p r e s s i o n .A l t h o u g h t h e y a r e t i n y ,i n e u k a r y o t e s ,m i c r o R N Ap l a y i m p o r t a n t r o l e s i n g e n e e x p r e s s i o nr e g u l a t i o n ,t y p i c a l l y b yf o r m i n gp e r f e c t o r i m p e r f e c t d u p l e x e s w i t ht a r g e t m e s s e n g e r R N A s .T h e s em i R N Aa r ei n v o l v e di n p h y s i c a l d e v e l o p m e n t ,d e a t hp r o l i f e r a t i o n ,a n d d i f f e r e n t i a t i o n o f c e l l .T h i s r e v i e wt r i e s t o h a v ea b r i e f i n t r o d u c t i o no nt h e p r o g r e s s e s o f m i R N As t u d y ,s u c ha s t h e d i s c o v e r y ,b i o g e n e s i s ,f e a t u r e a n df u n c t i o n s ,a n dg e n e p r e d i c t i o n .K e y w o r d s : m i R N A B i o l o g i c a l f u n c t i o n G e n e p r e d i c t i o n 收稿日期:2010-06-07基金项目:国家自然科学基金项目(30972223),山西农业大学基金项目(412528,614114)作者简介:赵奎,男,硕士研究生,研究方向:动物临床疾病的细胞及分子生物学研究;E -m a i l :z h a o k u i h a p p y @163.c o m 通讯作者:庞全海,教授,博士生导师,E -m a i l :p a n g q u a n h a i @126.c o mM i c r o R N A (m i R N A )是一类大小约21-25个核苷酸(n t )的R N A 分子,一般来源于染色体的非编码区域,由大约70n t 大小的可形成发夹结构的前体加工而来,其作用是在转录水平上对基因表达产生抑制性作用[1]。
作为21世纪生命科学研究重大发现之一,越来越多的资料显示,m i R N A 在动物的基因表达调控、细胞分化等过程中起着重要的作用。
1 m i R N A 的发现和命名1993年,L e e 等[2]在秀丽隐杆线虫中利用定位克隆法克隆了第1个能阶段性调控胚胎后期发育的基因l i n -4,该基因不编码蛋白质,但是编码长度约22n t 的m i R N A 。
L i n -4的发现及其翻译抑制作用提示,在生长发育过程中存在着一种新的基因调节机制。
L i n -4是在生物生长发育过程中起重要作用的l i n -14和l i n -28的负性调节因子。
2000年,R e i n h a r t 等[3]又在线虫中找到了第2个调控时序性发育的基因l e t -7,其转录物也被加工成大小为21个核苷酸的m i R N A ,也是一个负调节因子。
人们逐渐认识到m i R N A 是一类进化保守,在生物进化和疾病发展过程中起着调控作用的重要分子,通过抑制靶基因的表达产生基因沉默效应[4-6]。
此后,人们逐渐在人类、果蝇、小鼠等多种生物中开展了m i R N A s 的研究,结果发现了数以百计的m i R N A s 。
到2009年3月,m i R B a s e 数据库已更新到13.0版本,共发布9539种m i R N A 。
英国的S a n g e r 中心专门成立了m i R N A 的数据库(h t t p ://w w w .s a n g e r .a c .u k /S o f t w a r e /R f a m /m i r -生物技术通报B i o t e c h n o l o g y B u l l e t i n2010年第12期n a),以对发现的m i R N A进行统一的归类和编号。
所有m i R N A以“m i R”作为前缀,在其后加上唯一的标示性识别号码,如m i R-2、m i R-89等,而编码m i R-N A的基因也用同样的三字母前缀,但应当注意的是,根据生物体惯用的不同,有的生物体中需要大写,用连字符。
如在线虫和果蝇体内为m i R-1,而在拟南芥中,应为M I R156。
识别码是按顺序给出,不同的生物体,同样的m i R N A有相同的识别码,非常相近的同源物也可以有相同的识别码,如果蝇体内的m i R-1和线虫及人类的m i R-1。
同一物种中相同或非常相近的m i R N A序列可以有相同的识别码,用字母或数字后缀区别,如果蝇的m i R-13a和m i R-13b,指序列有轻微差异的转录本;而m i R-6-1和m i R-6-2则为相同的转录本[7]。
2 m i R N A的生物合成过程研究发现,动物细胞内的m i R N A都是一组非编码蛋白质的短序列R N A[8],具有较高的保守性[9]。
m i R N A是由R N A聚合酶I I在基因组的不同区域转录形成较长的p r e-m i R N A,通常有几百至上千个核苷酸,含有帽子和p o l y A尾巴结构,二级结构呈特殊的发夹形茎环,然后加工而成[10]。
经过核酸内切酶Ⅲ-D r o s h a及其辅助因子D G C R8的识别和作用,p r i-m i R-N A去除帽子和尾巴结构,形成了60-75n t的m i R-N A前体(p r e-m i R N A)。
p r e-m i R N A的5′带有磷酸基团,3′有2n t的突出。
p r e-m i R N A被核内转运蛋白e x-p o r t i n-5转运出细胞核进入细胞质。
第二个核酸内切酶Ⅲ-D i c e r和T R B P[T a r(H I V-1)R N A b i n d i n gp r o-t e i n]复合物对p r e-m i R N A进行切割形成短小的m i R-N A双链体,然后双链体降解成为单链的成熟m i R-N A[11],成熟的m i R N A通过与一种类似R I S C(R N A-i n d u c e d s i l e n c i n g c o m p l e x)的核糖核蛋白结合形成m i R N P,识别靶基因从而发挥生物功能[12](图1)。
3 m i R N A的特征与功能3.1 m i R N A的特征m i R N A有几个明显的特征:(1)广泛存在于真核生物中,是一组不编码蛋白质的短序列R N A,它本身不具有开放阅读框架(0R F)及蛋白质编码基因的特点,而是由不同于m R N A的独立转录单位表达的;(2)通常的长度为21-25n t,但在3′端可以有1-2个碱基的长度变化;(3)成熟的m i R N A是由D i c e r酶从折叠的发夹状转录前体的一条臂上切割得来;(4)m i R N A定位于能潜在编码其前体发夹结构的蛋白质非编码区域;(5)成熟m i R N A的序列和预测的发夹结构在不同物种间具有高度的进化保守性,在线虫中所发现的m i R N A85%都可以在C.b r i g g s a e基因组中找到同源序列,同样,拟南芥中也有m i R N A与水稻中的m i R N A找到了完全一样的序列,在拟南芥、水稻和烟草中也发现m i R-171相似序列[14];(6)表达具有严格的时空性和组织特异性,试验证明,m i R-3-m i R-7基因只在果蝇早期胚胎形成时表达,而m i R-l、m i R-8和m i R-12的含量在果蝇幼虫阶段急剧上升并在成虫期维持在较高水平,与此同时,m i R-9和m i R-1l的含量却急剧减少。