化学工具软件简介共45页PPT资料
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《ChemDraw用法》PPT课件
11
ChemDraw 起始界面
12
菜单栏
工具栏
图形工具板 编辑区
状态/信息栏
滚动栏
13
14
套索
蓬罩
实键
橡皮
双键
文本
虚键
笔
切割键
箭头
切割楔键
轨道
黑体键
绘图元素
黑体楔键
基元
空心楔键
化学符号
波浪键
弧形
表格
原子反应
长链
模板
环丙烷环
环丁烷环
环戊烷环
环己烷环
环庚烷环
环辛烷环
环己烷椅式
环己烷椅式
15
环戊二烯环
苯环
16
键工具 模板工具
箭头工具
轨道工具
画图工具
基元工具
符号工具
弧形工具
17
原子反应工具
画碳链
具体用法为:用鼠标左键点中所选择的工具箱中的工具, 18 然后在右边用鼠标拖动,至到画出你所需要的碳链
便捷地画出各种各样的环状结构
19
•模板按钮
氨基酸(Amino Acids),
芳族(Aromatics),
2H.0
1.05
OH 6.642.0
7.36 7.66
7.23 7.29
Estimation Quality: blue = good, magenta = medium, red = rough
8
7
6
5
4
3
2
1
0
PPM
Protocol of the H-1 NMR Prediction:
Node
6 DARC-F1 Query(*.flq)——Questel DARC系统中存储查询的原本 文件格式
ChemDraw 起始界面
12
菜单栏
工具栏
图形工具板 编辑区
状态/信息栏
滚动栏
13
14
套索
蓬罩
实键
橡皮
双键
文本
虚键
笔
切割键
箭头
切割楔键
轨道
黑体键
绘图元素
黑体楔键
基元
空心楔键
化学符号
波浪键
弧形
表格
原子反应
长链
模板
环丙烷环
环丁烷环
环戊烷环
环己烷环
环庚烷环
环辛烷环
环己烷椅式
环己烷椅式
15
环戊二烯环
苯环
16
键工具 模板工具
箭头工具
轨道工具
画图工具
基元工具
符号工具
弧形工具
17
原子反应工具
画碳链
具体用法为:用鼠标左键点中所选择的工具箱中的工具, 18 然后在右边用鼠标拖动,至到画出你所需要的碳链
便捷地画出各种各样的环状结构
19
•模板按钮
氨基酸(Amino Acids),
芳族(Aromatics),
2H.0
1.05
OH 6.642.0
7.36 7.66
7.23 7.29
Estimation Quality: blue = good, magenta = medium, red = rough
8
7
6
5
4
3
2
1
0
PPM
Protocol of the H-1 NMR Prediction:
Node
6 DARC-F1 Query(*.flq)——Questel DARC系统中存储查询的原本 文件格式
化学工具软件简介
1.简单图形和方程式的书写 1.简单图形和方程式的书写
(3)长链状分子结构的输入
图标后作图, 先点按 图标后作图,在拉长的同时 会显示碳原子的个数。 会显示碳原子的个数。 同时按住Shift Shift键 可使键线长度变小, 同时按住Shift键,可使键线长度变小, 碳原子数增多。 碳原子数增多。 的结构, 画C=C或C≡C的结构,只需在原有链烃 = 或 的结构 结构的基础上,再点按工具箱中的“ 结构的基础上,再点按工具箱中的“直 元件,并用鼠标点击所要产生C= 线”元件,并用鼠标点击所要产生 =C 的键线之中间部位。 或C≡C的键线之中间部位。 的键线之中间部位
1. 关于ChemWindow
2. ChemWindow的特点 的特点
1.
关于ChemWindow 关于
版本介绍 Chemwindow 由 Softshell Intern Ltd.于 于 1989年推出首版,到1993年发行了 年推出首版, 年发行了3.0 年推出首版 年发行了 目前以发展到6.0版 版 ,目前以发展到 版。 (3.0版 有一个汉化补丁。) 版 有一个汉化补丁。 运行环境 Chemwindow可Windows9X 下运行。 可 下运行。
例:丁二烯类化合物的电环化反应
R R hν R R
R R= C O O C H3
R
丁二烯的分子轨道图
LUMO
HOMO
电环化
6.对齐命令 6.对齐命令
7.图形文件格式的转换 7.图形文件格式的转换
要把绘制成的图形应用于其它软件, 要把绘制成的图形应用于其它软件,Chemwindow 能输出文件格式为*.WMF、 .CHM、 .MOL、 能输出文件格式为*.WMF、*.CHM、*.MOL、 .SCF、 .WPG,其中*.WMF文件格式能直接被 *.SCF、*.WPG,其中*.WMF文件格式能直接被 WORD软件调用 软件调用。 WORD软件调用。 选择Edit菜单中的 菜单中的Copy命令,再切换至 命令, 文档中, 选择 菜单中的 命令 再切换至WORD文档中, 文档中 将光标移到文本中需嵌入图形的位置, 将光标移到文本中需嵌入图形的位置,在WORD的 的 编辑”菜单中选择“粘贴”命令。 “编辑”菜单中选择“粘贴”命令。 图形复制粘贴到画笔中, 将Chemwindow图形复制粘贴到画笔中,然后将其 图形复制粘贴到画笔中 转换成BMP或JPG文件。 文件。 转换成 或 文件
化学常用软件应用简介(ChemOffice)
➢ 画好的图形也可以旋转和缩放。用选取框或套索选中 图形,此时图形被一灰色框笼罩,上方中央一点为旋转 控制点,鼠标移至此会变成双箭头,单击鼠标可以旋转 图形。右下角为缩放控制点,拖动这个角可以按比例改 变图形大小。
➢ 撤销操作,单击 【Undo】
旋转控制点
缩放控制点
• 3.1.3.4 检查结构错误和整理结构式
•3.1.1 主界面
状态栏
• ChemDraw主界面自上而下分为菜单栏、工具 栏和绘图窗口。绘图窗口左侧是垂直工具栏,其 中的工具和模板是化学专用的。有些模板按钮下 面带有 箭头,单击该按钮不松开,会在其右侧 弹出子工具栏。
【询问工具】 【箭头】 【轨道】 【绘图元素】 【括弧】【化学符号】
• 3.1.2 模板
Window】,弹出分析窗口,包含该化合物的分子简式、 摩尔质量、同位素分布图,元素分析组成比例等数据。 【View】/【Show Chemical Properties Window】, 弹出化学性质窗口,包含该化合物的沸点、熔点、临界 温度、临界压力、临街体积、Gibbs自由能、LogP、 MR、Herry’s Law、生成热、ClogP、CMR等。
• 3.1.3.12 快捷菜单和 快捷键
(1)快捷菜单
ChemDraw快捷菜单包 含了多种选项,使用快捷菜 单能完成常用编辑、属性设 置、模板选择等功能。
在选中的结构上单击鼠标 右键,会弹出快捷菜单。
• 3.1.3.6 根据结构得出化合物命名
如果确定了化合物的结构,想知道其系统命名,可 以借助ChemDraw。 ➢ 绘制化合物结构式 ➢ 选中此结构,【Structure】/【Convert Structure to Name】,即可在结构式下面出现系统命名。 ➢ 并非所有的结构式都能给出化合物名称,如果无法由 结构产生系统命名,ChemDraw会弹出窗口给出提示 信息。
➢ 撤销操作,单击 【Undo】
旋转控制点
缩放控制点
• 3.1.3.4 检查结构错误和整理结构式
•3.1.1 主界面
状态栏
• ChemDraw主界面自上而下分为菜单栏、工具 栏和绘图窗口。绘图窗口左侧是垂直工具栏,其 中的工具和模板是化学专用的。有些模板按钮下 面带有 箭头,单击该按钮不松开,会在其右侧 弹出子工具栏。
【询问工具】 【箭头】 【轨道】 【绘图元素】 【括弧】【化学符号】
• 3.1.2 模板
Window】,弹出分析窗口,包含该化合物的分子简式、 摩尔质量、同位素分布图,元素分析组成比例等数据。 【View】/【Show Chemical Properties Window】, 弹出化学性质窗口,包含该化合物的沸点、熔点、临界 温度、临界压力、临街体积、Gibbs自由能、LogP、 MR、Herry’s Law、生成热、ClogP、CMR等。
• 3.1.3.12 快捷菜单和 快捷键
(1)快捷菜单
ChemDraw快捷菜单包 含了多种选项,使用快捷菜 单能完成常用编辑、属性设 置、模板选择等功能。
在选中的结构上单击鼠标 右键,会弹出快捷菜单。
• 3.1.3.6 根据结构得出化合物命名
如果确定了化合物的结构,想知道其系统命名,可 以借助ChemDraw。 ➢ 绘制化合物结构式 ➢ 选中此结构,【Structure】/【Convert Structure to Name】,即可在结构式下面出现系统命名。 ➢ 并非所有的结构式都能给出化合物名称,如果无法由 结构产生系统命名,ChemDraw会弹出窗口给出提示 信息。
chemdraw课件PPT
绘制立体化学结构
通过使用ChemDraw的高级绘图技能,用户可以绘制立体化学结 构,展示分子的三维空间排列。
绘制反应机理
使用ChemDraw的高级绘图技能,用户可以绘制反应机理图,展 示化学反应的详细进程。
04 Chemdraw实例演示
绘制有机分子
总结词
通过实例演示,学习如何使用ChemDraw绘制常见的有机分子结构,包括烷烃 、烯烃、炔烃、芳香烃等。
还可以使用各种模板来快速绘 制常见的化学结构。
添加文本和标签
01
选择"Draw"工具栏中的"Text"选项,然后在画布上添加 文本或标签。
02
用户可以设置文本的字体、大小、颜色和对齐方式等属 性。
03
还可以使用各种标注工具来对分子结构进行标注和说明 。
保存和导出文件
01 在完成绘制后,选择"File"菜单中的"Save"来保存 文件。
Chemdraw的应用领域
化学教育
用于绘制化学教材、课件和实验报告中的化学 图谱。
科学研究
用于绘制化学论文、专利和项目报告中的化学 图谱。
化工生产
用于绘制化工流程图、实验装置图和工艺流程图。
02 Chemdraw基本操作
打开和创建画布
打开ChemDraw软件后,点击 "File"菜单,选择"New"来创
支持多种类型的化学键、环、轴等,方便用 户绘制复杂的化学结构式。
支持反应箭头的添加、删除和修改,方便用 户绘制化学反应式。
支持3D分子模型的展示,方便用户从不同角 度视察分子结构。
支持各种化学符号和注释的添加,方便用户 对图谱进行标注和说明。
通过使用ChemDraw的高级绘图技能,用户可以绘制立体化学结 构,展示分子的三维空间排列。
绘制反应机理
使用ChemDraw的高级绘图技能,用户可以绘制反应机理图,展 示化学反应的详细进程。
04 Chemdraw实例演示
绘制有机分子
总结词
通过实例演示,学习如何使用ChemDraw绘制常见的有机分子结构,包括烷烃 、烯烃、炔烃、芳香烃等。
还可以使用各种模板来快速绘 制常见的化学结构。
添加文本和标签
01
选择"Draw"工具栏中的"Text"选项,然后在画布上添加 文本或标签。
02
用户可以设置文本的字体、大小、颜色和对齐方式等属 性。
03
还可以使用各种标注工具来对分子结构进行标注和说明 。
保存和导出文件
01 在完成绘制后,选择"File"菜单中的"Save"来保存 文件。
Chemdraw的应用领域
化学教育
用于绘制化学教材、课件和实验报告中的化学 图谱。
科学研究
用于绘制化学论文、专利和项目报告中的化学 图谱。
化工生产
用于绘制化工流程图、实验装置图和工艺流程图。
02 Chemdraw基本操作
打开和创建画布
打开ChemDraw软件后,点击 "File"菜单,选择"New"来创
支持多种类型的化学键、环、轴等,方便用 户绘制复杂的化学结构式。
支持反应箭头的添加、删除和修改,方便用 户绘制化学反应式。
支持3D分子模型的展示,方便用户从不同角 度视察分子结构。
支持各种化学符号和注释的添加,方便用户 对图谱进行标注和说明。
AspenPlus史上最全最好的教程ppt课件
全球各大化工全球各大化工石化石化炼油等过程工炼油等过程工业制造企业及著名的工程公司都是业制造企业及著名的工程公司都是aspenaspenplusplus的用以以aspenaspenplusplus严格机理模型为基础严格机理模型为基础还逐步发展起来还逐步发展起来4455aspenaspen工程系列软件工程系列软件计计划划研研发发概念概念设计设计工工艺设计艺设计详细设计详细设计施工施工开车开车操作操作资产资产管理管理经济评价投资估算进度管理热交换器设计稳态动态模拟和优化物性数据和模型在线应用工艺知识和数据管理comthermoaspenpropertiesaspenolidethermhysysaspenplusoptimizerdynamicscustommodeleraspenwebmodelshetranaerotranhtfsaspenhetranaerotranteamsrtooptionaspenonlineconceptdistilhxnetaspensplitpinchwaterutilitiespinchwaterutilitiesaspenicarusaxsysaspenzyqadaspenfcccatrefhydrocrackerhydrotreatertraflowflarenetpolymersplusaspenplusdynamicscustommodelerbasysbdkprocessmanualsprocesstoolsaspenplusbatchpluschromatographyaspenadsim医药精细化工石油精制管道聚合物工艺合成和分析按功能分类生命周期66aspenplusaspenplus具有最完备的物性系具有最完备的物性系统统物性模型和数据是得到精确可靠的模拟结果的关键物性模型和数据是得到精确可靠的模拟结果的关键
《chemsketch简介》课件
1 2 3
绘制化学结构图
使用ChemSketch可以轻松绘制各种类型的化学 结构图,包括有机、无机、络合物和晶体结构等 。
制作分子模型
通过ChemSketch,用户可以制作三维分子模型 ,并对其进行旋转、缩放和平移等操作,以便更 好地观察分子结构。
绘制反应流程
除了绘制分子结构,ChemSketch还支持绘制化 学反应流程图,帮助用户更好地理解化学反应过 程。
06
ChemSketch的应用实 例
化学论文中的分子结构绘制
总结词:精确绘制
详细描述:在化学论文中,分子结构的准确绘制至关重要 。使用ChemSketch,研究者可以轻松绘制出高精度的分 子结构图,为论文提供有力的可视化支持。
化学教育中的分子模型展示
总结词:直观教学
VS
详细描述:在化学教育中,分子模型 的展示有助于学生更好地理解化学反 应和分子结构。通过ChemSketch, 教师可以制作出生动、直观的分子模 型,提高学生的学习兴趣和效果。
调整结构样式
用户可以根据需要,调 整化学结构的样式,包 括颜色、大小和形状等
。
01
用户可以通过选择化学 结构,然后在属性面板 中调整其颜色、大小和
形状等属性。
03
此外,用户还可以通过 选择原子,来调整其大 小、颜色和类型等属性
。
05
用户还可以通过选择化
•·
02
04 学键,来调整其颜色、
长度和类型等属性。
化学数据可视化
强大的数据可视化功能
ChemSketch不仅支持化学结构的绘制和展示,还提 供了强大的数据可视化功能。用户可以通过导入数据 文件(如Excel、CSV等格式),将化学数据可视化呈 现在图表中。这些图表包括但不限于柱状图、折线图 、饼图等,用户可以根据需要选择合适的图表类型进 行展示。此外,用户还可以对图表进行自定义设置, 如调整颜色、样式等,以满足不同的可视化需求。
化学软件ChemOffice的使用说明
•文件命令对话框
图4 文件命令的对话框
(2)
主 工 具 图 标 板
图 5主工具图标板
主 工 具 图 表 板
图6 主工具图表板的子图标板
2、模板
图7 模板工具图标板示例
3、绘制与编辑典型化学物质结构式
(1)键工具: 主工具图标板上提供了九个键操作的命令,其中双
键命令板中的子菜单中还包 括12个键命令。利用键工 具进行结构绘制操作的基本操作:首先在命令面板中选 取键命令,绘制的基本操作是“点位”、 “拖动”和 “点击”。
(2)方程式的建立
•箭头的选择 •利用绘图工具选择合适的阴影框罩住方程式
(3)化学反应方程式绘制举例
乙酰水杨酸又称为阿司匹林,为常用的退热镇痛药物。制备乙酰水杨酸 最常用的方法是将水杨酸与乙酐作用,生成乙酰水杨酸。
OH
(CH3CO)2 70°C80°C 15min水浴
COOH
OOCCH3 COOH
一概述
ChemOffice软件是由剑桥化学软件公司开发的集 成化学软件桌面系统,集成了Chem3D、ChemDraw、 ChemFinder和ChemInfo,以及Chem TableEditor等软 件,具有强大的高端开发功能。
ChemDraw Ultra 8.0 化学结构绘图 Chem3D Ultra 8.0 分子模型及仿真 ChemFinder Pro8.0 化学信息搜寻整合系统
图18 复制修改得到的乙酰水杨酸结构式
图19 乙酰水杨酸合成反应方程式
图20 符号窗口
图21 字体选项
图22 “Color”菜单选项
图23 调色板
6、绘制实验装置
利用实验仪器模板工具1和实验仪器模板工具2进行实验装置的绘制,在模板 中选择所需的实验仪器,单击产生相应的玻璃仪器。玻璃仪器连接处为阴影。通 过旋转选择框改变角度和大小进行玻璃仪器的连接。示范图例见下图4-24。
化学软件 ChemOffice 的使用
蓬罩 橡皮 文本 笔 箭头 轨道 绘图元素 基元 化学符号 弧形 原子反应 模板 环丁烷环 环己烷环 环辛烷环 环己烷椅式 苯环
ChemDraw——工具 键工具
模板工具
8
箭头工具
轨道工具
画图工具
基元工具符号工具Leabharlann 弧形工具原子反应工具
键及元素文本属性的设置
4. ChemDraw——主要操作
主要绘制一些结构式、反应方程式、搭建化学反应仪器等。
13CNMR预测
13CNMR预测结果
部分预测结果
四、绘制化学反应方程式:
化学反应方程式的绘制
四、搭建实验装置:
化学软件 ChemOffice 的使用
2013/09/24
主要内容
1
Chemoffice 的概述
2
ChemDraw 介绍及操作
ChemDraw 的界面
ChemDraw 的工具
ChemDraw 主要操作
1. ChemOffice 概述
ChemOffice 软件是由剑桥化学软件公司开发的集成化学软件桌面系 统,集成了Chem3D、ChemDraw、ChemFinder 和 ChemInfo,以及Chem TableEditor等软件,具有强大的高端开发功能。
➢ ChemDraw Ultra 11.0 化学结构绘图 ➢ Chem3D Ultra 11.0 分子模型及仿真 ➢ ChemFinder Pro11.0 化学信息搜寻整合系统 ➢ E2Notebook Ultra11.0 ➢ BioAssay Pro11.0 ➢ 量化软件MOPAC、Gaussian 和GAMESS 的界面 ➢ ChemSAR Server Exce ➢ ClogP,CombiChemPExcel
ChemSketch教程.ppt
分子量及元素百分比含量折射率摩尔折射率及摩尔体积等张比容表面张力及密度介电常数及极化率单一同位素质量标称分子量和平均分子质量除了以上主要功能外chemsketch还包括3dviewer用于观察所绘制分子的
ChemSketch软件应用
主讲人:谭燕平 万谦 陈明
ChemSketch简介 简介
ACD/ChemSketch 是高级化学发展有限公司(ACD)开发的用于化学 结构式绘制软件包,该软件包可单独使用或与其他软件共同使用。该软件 的主要功能包括: 结构模式:用于化学结构式的绘制 绘图模式:用于图片及文字的处理 分子性质模式:用于计算分子的一些基本性质,主要包括以下几个方面: 分子量及元素百分比含量 折射率、摩尔折射率及摩尔体积 等张比容、表面张力及密度 介电常数及极化率 单一同位素质量, 标称分子量和平均分子质量 除了以上主要功能外,ChemSketch还包括3D Viewer,用于观察所绘 制分子的三维结构。CNMR DB和HNMR DB可用于预测和查看所绘制化学 结构式的碳、氢核磁谱图,并与所带相关数据库相联,进行检索比对处理。
一 绘制简单结构
1 使用常用画图
当程序开始时,常用画图工具 是默认的。在 这种模式下,您可以很容易地画直链和分支结构, 并用元素周期表中的原子取代所画的原子。 单击CH4以增加一个CH3基团,并以标准键长连 接。再双击同一个碳原子,画出
如果想让分子以某个键为基准改变位置,如让 某一键处于垂直状态,可点击工具栏上的按钮,然后 点击某一键,即可使分子旋转至该键处理垂直的位置:
ChemSketch内置的元素同期表可以查看元素的基本信息和核磁数据。有 机分子结构字典只有商业版本才能使用,输入分子名称(系统命名或商品名) 可得到其化学结构式。 化学文件夹(ChemFolder)可方便用户建立自己的试剂与化学反应数据库。 GC和LC模拟器(GC Simulator and LC Simulator)可以模拟所绘制化学结构的气 相和液相色谱。 LogD和LogP用于计算所绘制结构的醇—水(辛醇—水)分配系数,其中 LogD适用于酸碱性物质,LogP适用于中性物质。 Name模块用来对所绘制的结构按IUPAC规则命名。 SolDB模块可用来计算所绘制结构在不同pH条件下的溶解度。 SpecManager用于处理各种谱图,包括核磁、质谱、紫外、红外等。 Spectrum DataBases提供了各种谱图的数据库,供检索查询之用。 XNMR提供了对含P、F、N同位素化合物的核磁预测功能。 pKa模块可对所绘制的结构进行酸碱解离常数的预测计算功能。 和其它的Windows软件一样,ChemSketch也具有页面设置、打印设置、输 出模式、输入模式、页眉页脚设置等功能。 这里主要介绍如何利用该软件绘制化学结构式并对所绘制结构的基本化 学性质进行预测和计算。
ChemSketch软件应用
主讲人:谭燕平 万谦 陈明
ChemSketch简介 简介
ACD/ChemSketch 是高级化学发展有限公司(ACD)开发的用于化学 结构式绘制软件包,该软件包可单独使用或与其他软件共同使用。该软件 的主要功能包括: 结构模式:用于化学结构式的绘制 绘图模式:用于图片及文字的处理 分子性质模式:用于计算分子的一些基本性质,主要包括以下几个方面: 分子量及元素百分比含量 折射率、摩尔折射率及摩尔体积 等张比容、表面张力及密度 介电常数及极化率 单一同位素质量, 标称分子量和平均分子质量 除了以上主要功能外,ChemSketch还包括3D Viewer,用于观察所绘 制分子的三维结构。CNMR DB和HNMR DB可用于预测和查看所绘制化学 结构式的碳、氢核磁谱图,并与所带相关数据库相联,进行检索比对处理。
一 绘制简单结构
1 使用常用画图
当程序开始时,常用画图工具 是默认的。在 这种模式下,您可以很容易地画直链和分支结构, 并用元素周期表中的原子取代所画的原子。 单击CH4以增加一个CH3基团,并以标准键长连 接。再双击同一个碳原子,画出
如果想让分子以某个键为基准改变位置,如让 某一键处于垂直状态,可点击工具栏上的按钮,然后 点击某一键,即可使分子旋转至该键处理垂直的位置:
ChemSketch内置的元素同期表可以查看元素的基本信息和核磁数据。有 机分子结构字典只有商业版本才能使用,输入分子名称(系统命名或商品名) 可得到其化学结构式。 化学文件夹(ChemFolder)可方便用户建立自己的试剂与化学反应数据库。 GC和LC模拟器(GC Simulator and LC Simulator)可以模拟所绘制化学结构的气 相和液相色谱。 LogD和LogP用于计算所绘制结构的醇—水(辛醇—水)分配系数,其中 LogD适用于酸碱性物质,LogP适用于中性物质。 Name模块用来对所绘制的结构按IUPAC规则命名。 SolDB模块可用来计算所绘制结构在不同pH条件下的溶解度。 SpecManager用于处理各种谱图,包括核磁、质谱、紫外、红外等。 Spectrum DataBases提供了各种谱图的数据库,供检索查询之用。 XNMR提供了对含P、F、N同位素化合物的核磁预测功能。 pKa模块可对所绘制的结构进行酸碱解离常数的预测计算功能。 和其它的Windows软件一样,ChemSketch也具有页面设置、打印设置、输 出模式、输入模式、页眉页脚设置等功能。 这里主要介绍如何利用该软件绘制化学结构式并对所绘制结构的基本化 学性质进行预测和计算。
常用化学软件与资源简介
B、键、链、原子基团的绘制:单击左边垂直工具条上 “Bond”或“Chain”工具按钮,选取单、双、叁键或链,在绘 图区单击鼠标左键或按住左键拖动鼠标即可绘制键或链。单 击左边垂直工具条上“Atom”工具按钮,在欲绘部位单击左键, 即出现文本输入框,可以直接从键盘输人或从下拉菜单中选 取欲输人的原子基因。 C、键、链、原子基团的编辑:点击左边工具条上的 “Select”按钮,双击欲编辑的键、链和原子基团,即弹出编 辑对话框,在对话框中修改完毕后点击“OK”即可。
☺
3、插入到word 方法一:首先,运行word,选择 “插入”——“对象”,在出现的对 话框中,选择“化学分子式文件”, 单击确定,出现一个方框,双击方框, 就可以像上面一样编辑方程式,编辑 完毕后单击对象外任一文档区返回 word编辑状态。单击对象,把鼠标移 到矩形框上的黑点上,拖动鼠标可以 改变对象大小。
4、 图文混排 ISIS/Draw2.4支持图文混排方式。有的反应式需在一定的 反应条件下进行,反应条件的描述只有通过文字表达。点击左 边工具栏上“Text”按钮,鼠标即变为“+”字形,在欲写文本 处单击左键,输人所需的文本,输完后在任一处单击左键即可 (不可回车,否则程序认为你在换行)。若双击文本,弹出文 本编辑框,同其他文字处理软件一样,你可以选取字体、大小、 颜色等等修改文本属性。修改完毕,点击“Select”按钮,选中 结构式及文本。点击菜单栏“object”、“Group”,即将结构式 与文本组合为一个完整对象,进行整体拷贝、剪切、粘贴等等。
常用化学软件与网络资源简介
广东工业大学材料与能源学院 艾娇艳
引言
本文简单介绍了常用的几种化学作图、数据查 询与计算软件和一些常见的化学数据查询和软件下 载的网络资源,方便大家了解在专业学习中应当如 何使用这些软件和网络资源。
《chemsketch简介》PPT课件_OK
2021/8/20
8
8
Chemsketch简介
ACD/预测溶解度软件 计算不同pH值下的溶解性 (必须作为ACD/ChemSketch 的附件购买)。
包括第二排和第三排元素的化合物性质的预测 更加准确,如折射率、摩尔体积、密度的估算等。
2021/8/20
9
9
Chemsketch简介
3 安装、启动ACD/ChemSketch
Chemsketch简介
2021/8/20
49
49
创建一个十二面体结构
Chemsketch简介
2021/8/20
50
50
Chemsketch简介
2021/8/20
51
51
2021/8/20
Chemsketch简介
[4,6]Fullerene-C24
[5,6]Fullerene-C24
52
52
7 高级画法
22
22
翻转结构
水平键 垂直键 翻转键 上下翻转键 左右翻转键
2021/8/20
Chemsketch简介
设定水平健、垂直健
或健的翻转,首先选择相 应的按钮,再点击相应的 健即可。
进行上下翻转和左右
翻转,首先选择目标结构 和或图象,点击相应的按 钮即可。
23
23
5 画复杂结构
Chemsketch简介
ACD/Tautomers 检查并生成有机结构的最常 见的异构体。
2021/8/20
6
6
Chemsketch简介
ACD/Dictionary包含48,000个化学和生物中常见
的系统和非系统命名的化合物。全部覆盖200多个领域
常用化学软件新版本简介
山西煤化所 天津药物所 上海有机化学院研究所 上海通用电气(中国) 四川抗菌素工业研究所 武汉物理数学研究所 沈阳中科院金属所 浙江工程式学院 福建物质结构研究所 大连化学物理研究所 安徽光机所
中国工程物理研究院化工材料所 中国科技大学
中科院化学研究所 中科院研究生院 中科院金属所(沈阳) 中科院长春光学物理研究所 中科院兰州化学物理研究所 中科院武汉物理与数学所 中科院福建物质结构研究所 中科院上海技术物理所 中科院昆明植物所 中国药品生物制品检定所 中国中医药大学 中南工业大学冶金系
湘潭大学化学化工学院 云南大学化学系 云南大学生化公司
昆明医学院基础医学部 浙江大学化学系玉泉校区
浙江工程学院 浙江化工研究院
浙江绍兴文理学院理学院化 学系
福州大学化学化工学院 大连理工大学化工学 河北工业大学理学院
安徽工业大学 中山大学理工学院
用户群
北京微量化学所 北京药物研究所 解放军防化指挥工程学院 军事医学科学院 西安核技术物理研究所
CH3
2.35
CH3
2.35
7.26 -0.20 -0.19 -0.20
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0.86 1.49 0.86 1.49 0.86 1.49
1-benzene 1 -C 1 -C 1 -C 1-benzene 1 -C 1 -C 1 -C 1-benzene 1 -C 1 -C 1 -C methyl 1 alpha -1:C*C*C*C*C*C*1 methyl 1 alpha -1:C*C*C*C*C*C*1 methyl 1 alpha -1:C*C*C*C*C*C*1
2.35
中国工程物理研究院化工材料所 中国科技大学
中科院化学研究所 中科院研究生院 中科院金属所(沈阳) 中科院长春光学物理研究所 中科院兰州化学物理研究所 中科院武汉物理与数学所 中科院福建物质结构研究所 中科院上海技术物理所 中科院昆明植物所 中国药品生物制品检定所 中国中医药大学 中南工业大学冶金系
湘潭大学化学化工学院 云南大学化学系 云南大学生化公司
昆明医学院基础医学部 浙江大学化学系玉泉校区
浙江工程学院 浙江化工研究院
浙江绍兴文理学院理学院化 学系
福州大学化学化工学院 大连理工大学化工学 河北工业大学理学院
安徽工业大学 中山大学理工学院
用户群
北京微量化学所 北京药物研究所 解放军防化指挥工程学院 军事医学科学院 西安核技术物理研究所
CH3
2.35
CH3
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常用软件
ChemSketch
去除原子、 去除原子、基团
10
8.2.2 绘制复杂结构式
1. 利用化学基团表 Table of Radicals 利用化学基团表
有 Chains, Cycles, C-Groups, Miscellaneous, Amino Acids, Protecting Groups
• 绘制过程
对象), 模板), 选项), Tools (工具 ,Object(对象 Templates (模板 ,Options (选项 ,Documents 工具), 工具 对象 模板 选项 (文档 ,I-Lab, ACD/Labs, Help. 文档), 文档
• 图形化按钮 • 选择图形 结构模式 ——选择原子、化学键、分子和图象。 选择图形(结构模式) 原子、化学键、分子和图象。 图形 结构模式
第
8 章
• 主要内容 五大常用化学绘图软件
ChemSketch, Origin基本操作 基本操作 其它常用化学化工软件简介 ChemOffice, ISIS/Draw, ChemWindow
第 8
8.1 8.2 8.3 8.4 8.5 ChemSketch 基本操作 ChemSketch 绘制化学结构式和反应方程式 ChemSketch其它功能 ISIS/Draw ChemWindow ChemOffice简介 科技绘图及数据分析软件Origin简介 Origin简介
2
• 本章主要参考文献
1. 李梦龙等. 化学软件及其应用. 化学工业出版社,2004. 李梦龙等 化学软件及其应用 化学工业出版社, 2. 李欣等 基础化学信息学. 哈尔滨工业大学出版社 2003. 李欣等. 基础化学信息学. 哈尔滨工业大学出版社, 3. 冉鸣 化学教育工具软件 化学工业出版社,2006. 冉鸣. 化学教育工具软件. 化学工业出版社, 实用教程(7.5版). 西安交通大学出版社 2007. 4. 周剑平 Origin实用教程 周剑平. 实用教程 版 西安交通大学出版社, 5. 相关软件的帮助文件
去除原子、 去除原子、基团
10
8.2.2 绘制复杂结构式
1. 利用化学基团表 Table of Radicals 利用化学基团表
有 Chains, Cycles, C-Groups, Miscellaneous, Amino Acids, Protecting Groups
• 绘制过程
对象), 模板), 选项), Tools (工具 ,Object(对象 Templates (模板 ,Options (选项 ,Documents 工具), 工具 对象 模板 选项 (文档 ,I-Lab, ACD/Labs, Help. 文档), 文档
• 图形化按钮 • 选择图形 结构模式 ——选择原子、化学键、分子和图象。 选择图形(结构模式) 原子、化学键、分子和图象。 图形 结构模式
第
8 章
• 主要内容 五大常用化学绘图软件
ChemSketch, Origin基本操作 基本操作 其它常用化学化工软件简介 ChemOffice, ISIS/Draw, ChemWindow
第 8
8.1 8.2 8.3 8.4 8.5 ChemSketch 基本操作 ChemSketch 绘制化学结构式和反应方程式 ChemSketch其它功能 ISIS/Draw ChemWindow ChemOffice简介 科技绘图及数据分析软件Origin简介 Origin简介
2
• 本章主要参考文献
1. 李梦龙等. 化学软件及其应用. 化学工业出版社,2004. 李梦龙等 化学软件及其应用 化学工业出版社, 2. 李欣等 基础化学信息学. 哈尔滨工业大学出版社 2003. 李欣等. 基础化学信息学. 哈尔滨工业大学出版社, 3. 冉鸣 化学教育工具软件 化学工业出版社,2006. 冉鸣. 化学教育工具软件. 化学工业出版社, 实用教程(7.5版). 西安交通大学出版社 2007. 4. 周剑平 Origin实用教程 周剑平. 实用教程 版 西安交通大学出版社, 5. 相关软件的帮助文件
ChemOffice-软件的操作与使用课件
苯环
ChemOffice-软件的操作与使用
模
垂直工具栏上的【模板】按钮包含了常
板
用的和重要的模板如多种较复杂的分子 种类和玻璃仪器模板
箭头、轨道、绘图元素、括弧、 化学符号、询问工具模板
氨基酸模板 芳香族、双环、生物艺术模板 玻璃仪器模板 构象异构体模板 环戊二烯、环烷模板 DNA、RNA模板
官能团模板 己糖模板 苯环模板
ChemOffice-软件的操作与使用
ChemDraw结构式与3D模型间的转换
ChemDraw结构式转换为3D模型 选中结构式,复制到3D窗口中,自动转变成3D模型。
直接打开ChemDraw文件 在3D窗口中执行【File】/【Open】菜单命令,在【文件类
型】窗口中选中“ChemDraw(*.cdx,*chm)”类型,单击“打开” 按钮打开文件。 3D模型转换为平面结构式
• 2.Chem 3D
• 3.ChemFinder
• 第三部分:数学公式及长篇文章排版
• 1.Mathtype
• 2.长篇文章排版
ChemOffice-软件的操作与使用
2.1 简介
美国剑桥(CambridgeSoft)公司()其最新版本ChemOffice Ultra 2010是目前世界上最优秀、最重要和最权威的桌面化学办公 应用软件,集强大的应用功能于一身,为化学工作者提供了 优秀的化学辅助系统。 ➢它既可以轻松的绘出分子结构图和化学反应方程式、实验室 仪器装置和化学工艺流程图等,并应用到字处理软件中; ➢而且可以将化合物名称直接转为结构图,省却绘图的麻烦; ➢也可以对已知结构的化合物命名,给出正确的化合 物名称。
ChemOffice-软件的操作与使用
垂直工具栏
Chem3D常用功能使用教程PPT课件
缩放
用户可以使用缩放工具来放大或缩小分子视图,以便更好地观察分子的细节或全局 结构。通过滚动鼠标滚轮或使用快捷键(如“+”和“-”)可以实现分子的缩放操 作。
03 分子性质计算
分子几何性质计算
01
02
03
分子几何性质
计算分子的键长、键角、 二面角等几何参数,了解 分子的基本结构特征。
分子几何优化
分子动力学模拟是一种基于物理的模拟方法,通过模拟分子体系的运动轨迹来研 究分子的结构和性质。在Chem3d中,可以使用分子动力学模拟来预测分子的热 力学性质、反应机理以及药物分子的药效等。
分子动力学模拟的基本步骤包括建立模型、设置模拟参数、运行模拟和结果分析 。在Chem3d中,用户可以通过简单的界面来设置模拟参数,并自动进行模拟计 算。
05 数据可视化与分析
数据导入与处理
导入数据
支持多种格式的数据导入,如 CSV、Excel、TXT等,方便用户
快速导入所需数据。
数据清洗
提供数据清洗功能,对缺失值、异 常值进行处理,确保数据准确性。
数据转换
支持数据格式转换,满足不同分析 需求。
数据可视化
图表类型
提供多种图表类型,如折线图、柱状 图、散点图等,满足不同数据可视化 需求。
模拟过程常见问题
总结词
模拟过程卡顿、计算时间过长、收敛困难
解决方案
优化计算参数和设置,降低模拟规模或精度,检查硬件性能是否满足要求,尝试使用不 同的算法或方法。
THANKS FOR WATCHING
感谢您的观看
Chem3d常用功能使用教程
目 录
• Chem3d软件简介 • 分子建模与显示 • 分子性质计算 • 分子模拟与动力学 • 数据可视化与分析 • 常见问题与解决方案
用户可以使用缩放工具来放大或缩小分子视图,以便更好地观察分子的细节或全局 结构。通过滚动鼠标滚轮或使用快捷键(如“+”和“-”)可以实现分子的缩放操 作。
03 分子性质计算
分子几何性质计算
01
02
03
分子几何性质
计算分子的键长、键角、 二面角等几何参数,了解 分子的基本结构特征。
分子几何优化
分子动力学模拟是一种基于物理的模拟方法,通过模拟分子体系的运动轨迹来研 究分子的结构和性质。在Chem3d中,可以使用分子动力学模拟来预测分子的热 力学性质、反应机理以及药物分子的药效等。
分子动力学模拟的基本步骤包括建立模型、设置模拟参数、运行模拟和结果分析 。在Chem3d中,用户可以通过简单的界面来设置模拟参数,并自动进行模拟计 算。
05 数据可视化与分析
数据导入与处理
导入数据
支持多种格式的数据导入,如 CSV、Excel、TXT等,方便用户
快速导入所需数据。
数据清洗
提供数据清洗功能,对缺失值、异 常值进行处理,确保数据准确性。
数据转换
支持数据格式转换,满足不同分析 需求。
数据可视化
图表类型
提供多种图表类型,如折线图、柱状 图、散点图等,满足不同数据可视化 需求。
模拟过程常见问题
总结词
模拟过程卡顿、计算时间过长、收敛困难
解决方案
优化计算参数和设置,降低模拟规模或精度,检查硬件性能是否满足要求,尝试使用不 同的算法或方法。
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Chem3d常用功能使用教程
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• Chem3d软件简介 • 分子建模与显示 • 分子性质计算 • 分子模拟与动力学 • 数据可视化与分析 • 常见问题与解决方案
相关主题
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2.组合图形的绘制
(2)文字和结构组合
一般先画出所需的环状结构,再把文字 或化学式加在相应的环状结构位置上。
3.物质相互转化关系图的绘制
此操作除结合以上所述方法外,还需协 调好箭头、直线、汉字、化学式和结构 的相互关系。
画直线和箭头的方法:选取在工具箱中 的“箭头”或“直线”图标,即可直接 画出直线、斜线、单向箭头、双向箭头 等。若同时按住“Shift”键,可任意改变 直线和箭头的长度和角度。
1.简单图形和方程式的书写
(1)分子式的输入
输入有上下标的分子
– 点击工具箱中的 – 点击绘图区中的任一处,再按分子式或离
子形式输入
输入中文或没有上下标的分子式
– 点击 – 点击绘图区中的任一处,再输入所需的中
文或分子式即可。
输入完分子式后可改变其字体和大小。
1.简单图形和方程式的书写
(2)环状分子结构式的输入
不足之处
①文件保存格式为*.CWG,不能直接被 office等软件识别。
②软件使用时必须保证系统中安装有打印 机,否则拒绝运行。但只要安装打印机 驱动程序后,没有打印机也行。
二、窗口介绍
窗口2
三、应用技巧
1.简单图形和方程式的书写 2.组合图形的绘制 3.物质相互转化关系图的绘制 4.特殊图形的绘制 5.图形的组合和拆分 6.对齐命令 7.图形文件格式的转换 8.颜色的选择 9.批注
1. 界面友好、操作方便。
具有标准的Window窗口风格,提供下拉 菜单和工具箱,形象直观,并提供相应的帮 助文件。
2. 功能强大、基本结构丰富
功能强大,足以应付一般化学教学或论 文撰写的要求,能画出各种复杂的脂肪环烃、 芳香烃、化学方程式、二维立体空间结构、 电子云、分子的构象结构等。
功能
①提供大量分子式或分子图形的基本“元件” 。 ②提供模板功能,能以平时积累的分子结构为基
将Chemwindow图形复制粘贴到画笔中,然后将其 转换成BMP或JPG文件。
一、 ACD/ChemSketch简介
1. 关于ACD/ChemSketch
2. ACD/ChemSketch的功能
1. 关于ACD/ChemSketch
版本介绍
ACD是软件开发公司Advanced Chemistry Development Inc.的简称。 ACD/ChemSketch是该公司所作软件中 的出色代表,其版本从1.0 、2.5、3.5 到目前的5.0版。 运行环境
1. 关于ChemWindow
版本介绍 Chemwindow 由 Softshell Intern Ltd.于
1989年推出首版,到1993年发行了3.0 版 ,目前以发展到6.0版。
(3.0版 有一个汉化补丁。) 运行环境
Chemwindow可Windows9X 下运行。
2. ChemWindow的特点
ACD/ChemSketch 可Windows9X 下运。
2. ACD/ChemSketch的功能
ACD/ChemSketch是用来画化学结构式、 反应式与各种化学反应图表的应用软件。 也可用来设计与化学有关的报告与简报。 具有以下主要功能:
1.简单图形和方程式的书写
(4)化学方程式的输入
点击 后在绘图区输入“Cl2 OH-=ClClO- H2O” 再点击 后另输入2和+, 再移入方程式中即可。
2.组合图形的绘制
(1)多种环状结构组合
在一个环状结构的基础上,点击环上的 结点,会以一根键连接另一个环;点击 环上的边,则共边连接一个环。
R
R
hν
R
R R= COOCH3
丁二烯的分子轨道图
R R
LUM O
HOMO
电环化
6.对齐命令
7.图形文件格式的转换
要把绘制成的图形应用于其它软件,Chemwindow 能输出文件格式为*.WMF、*.CHM、*.MOL、 *.SCF、*.WPG,其中*.WMF文件格式能直接被 WORD软件调用。 选择Edit菜单中的Copy命令,再切换至WORD文档中, 将光标移到文本中需嵌入图形的位置,在WORD的 “编辑”菜单中选择“粘贴”命令。
点击工具箱中的结构元件 再在绘图区点击即可 若同时按住“Shift”键可调整环的大 小 点按鼠标后并转动鼠标可旋转环的排 列方向。
1.简单图形和方程式的书写
(3)长链状分子结构的输入
先点按 图标后作图,在拉长的同时 会显示碳原子的个数。
同时按住Shift键,可使键线长度变小, 碳原子数增多。
画C=C或C≡C的结构,只需在原有链烃 结构的基础上,再点按工具箱中的“直 线”元件,并用鼠标点击所要产生C=C 或C≡C的键线之中间部位。
本“元件”,减少重复劳动时间。 ③智能识别化学分子式输入中的上下标。 ④对图形能进行组合、翻转、任意角度旋转、拉
缩、分块处理。 ⑤可任意设定输入文字的大小、结构线条的粗细
和它们的颜色。 ⑥能取消前一次的操作和恢复取消的操作。 ⑦提供复制和粘贴功能及OLE(对象链接和嵌入)
功能,便于与其它软件共享交流。
例1
例2
例1:氯气及氯的重要化合物之间的关系
PCl3(PCl5)
Ca(ClO)2 HClO
Cl2 HCl
NaCl AgCl
例2:加成-消去反应历程
O RCG
Nu
-O RCG
Nu
O R C Nu
G = X OCOR OR NH2 N u 为亲核试剂
4.特殊图形的绘制
(1)电子式的绘制
一般先输入它的组成原子,然后在其 中心原子周围画出表示最外层电子的 小黑点,再移动小黑点和其它原子至 合适的位置,最后画上“[ ]”或 “+”“-”电荷及所带电荷的数目
第二讲 化学工具软件简介
2.1 ChemWindow (化学之窗)
一、 ChemWindow 简介 二、窗口介绍 三、应用技巧
2.2 ACD/ChemSketch (化学绘图)
一、 ACD/ChemSketch 简介 二、窗口介绍 三、应用技巧
一、 ChemWindow简介
1. 关于ChemWindow 2. ChemWindow的特点
小黑点的绘制
点击并按住 后会出现一个子工具 箱,其中有横式“..”和竖式“:”。
[ ]的绘制
点击并按住 后选择子工具箱中的“[ ]”元 件就行了。
4.特殊图形的绘制
(2)电子云和分子轨道的绘制
它们的绘制方法同上。其元件在 图 标下的子工具箱中。先画出雏形后,再 拉伸放大。
例:丁二烯类化合物的电环化反应