生物样本库的建立与管理PPT课件
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重要性
人体生物样本为联系日益发现的分子(基 因、蛋白等)信息与临床疾病关系的桥梁。尤 其应用于:鉴定、验证药物靶点;研究疾病发 病机制;疾病相关分子标记物筛选;分子分型 与个性化治疗等。标准化生物样品库是基因组、 功能基因组等生命科学研究与生物医药研发的 关键源头,是众多重要基因、蛋白等科研成果 快速产业化、应用到临床(分子分型检测、诊 断与疾病的预测、预防及个性化治疗等的重要 保证,毫无疑问的也是生命科学与生物医药技 术自主创新体系中至关重要的环节与保证。
样本处理
DNA提取和纯化操作规程 RNA提取和纯化操作规程 蛋白质提取和保存操作规程 细胞系建立操作规程 血液样本处理操作规程
样本储存
不同生物样本对于低温储存的温度要求
肿瘤组织库建立中一个非常重要的问题是生物样本对于储存温度的要求。多数科学家认 为。低温有利于长期保存生物大分子的完整性,如经高温加工处理的石蜡包埋组织块内的 RNA分子会出现严重降解。理论上讲,组织储存温度越低越好。理想的组织储存环境是大 型液氮罐,但并非所有医疗中心均有这样的设备,因此,目前仍以低温冰箱储存为主。由 于多数机构手术取材地点与组织标本库并不在同一楼内,组织标本的转移、运输也需一定 时间,故各单位可酌情配备一些不太昂贵的组织储存设备。如活检组织在-20℃环境中至 少可保存6个月:在-40 ℃的环境中则可保存3年;若将组织保存在高浓度甘油中,则在10℃ ~0的条件下也可保存2年。若将组织保存在高浓度甘油中,再储存于-80℃的低温冰 箱中,则可长期保存,但这些组织不适用于RNA等研究。此外,组织标本库建立中提倡采 用不间断性电源设备,以确保标本库内标本在短时断电情况下不会受到影响。肿瘤组织样 本一般在离体后应尽快收集,并保存于-80℃的深低温冰箱内:血液样本与其他临床检验 项目应一起采集,采集后先置于4 ℃冰箱内保存,尽量在3~5 h内离心,分离血清、血浆, 最长不得超过12 h。分离获得的血清、血浆则需储存于-40℃的环境中,血清或血浆分离时 一般予2500 r/min离心15 min。血液的离心沉淀物或提取后的DNA样本可长期储存于145℃下。将组织样本存放于-196℃的液氮中则可储存多年,但若置于-80℃下,则其生物 大分子活性保持时间会明显缩短。
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生物样本长期保存的质量控制
低温冻存被公认为是组织与器官长期保存最有效的方法之一。其原理是通过 降低细胞的代谢率起到保护组织细胞的作用。但样本库内的生物样本是否可 被持续使用还依赖于对储存样本的质量控制,该项工作主要由病理学家进行。 病理学家需对提取的组织先进行病理切片观察.若其中肿瘤成分超过75%则 认为质量良好,如不足65%则应从研究中剔除。对样本得以储存的病例应进 行定期临床随访,以便获得疾病治疗效果、临床进展及是否生存等重要资料。 从有关单位获得的知情同意书看,92%的患者同意出院以后接受随访。当前 发展起来的分子生物学新技术大多要求研究样本中的核酸或蛋白质保存完好, 故对于组织样本质量要求很高。目前,国内外大型肿瘤组织库以采用一80℃ 深低温冰箱储存为主,但在这样的低温环境下生物大分子活力究竟能保存多 久仍无定论。众多研究显示,长期冻存对于DNA大分子的稳定性影响不大, 甚至石蜡包埋组织块中的DNA也可进行分子生物学分析。RNA分子则易被广 泛存在于细胞内、皮肤、唾液、汗液及周围环境中的RNA酶所降解。使用液 氮保存是保存RNA活性的最理想方法,当温度降至液氮温度时,细胞组织中 所有的生物化学、生物物理过程均处于停止状态 但限于空间及经费等原因, 大型液氮储藏罐或液氮冰箱尚难以推广普及。对于组织RNA的质量分析主要 依据28S与18S的比值进行,比值如在2左右认为质量好,比值小于l则认为RNA 已降解。有关长期低温冻存对于蛋白质分子的影响还缺乏系统性研究报道, 需各生物样本库在今后的质量控制分析研究中不断积累经验加以阐明。
生物标本库 (biological specimen bank, BSB):
是指标准化地收集、保存用于各种研究的正常 或病理标本,包括人体器官组织、全血、血浆、 血清、生物体液或经处理过的生物样本(DNA、 RNA、蛋白等)以及与这些生物样本相关的临 床、病理、治疗、随访、知情同意等资料及其 质量控制、信息管理与应用系统。
伦理
赫尔辛基宣言 涉及人类为研究对象的生物医学研究了国际伦理方针指南 关于DNA序列申请专利的声明:专利 关于早期发布原始序列数据有关专利申请问题的声明 关于DNA取样的声明:控制与获取 世界人类基因组与人权宣言 涉及人体的生物医学研究伦理审查办法(试行) 人类基因治疗申报临床试验指导原则 关于利益共享的声明 关于基因治疗的声明 关于人类基因组数据库的声明 国际涉及人类的生物医学研究伦理准则 人类遗传数据国际宣言纲要 人体生物医学研究国际伦理指南
ISO15189:2003 医学实验室质量和能力的专用要求 CNAS-CL02 医学实验室-质量和能力的认可准则 ISO/IEC17025:2005 检测和校准实验室能力的通用要求 CNAS-CL01 检测和校准实验室认可准则 ISO9001:2008/GBT19001-2008 质量管理系统 要求 GB/T1.1-2009 标准化工作导则:标准的结构和编写规则
政策法规
ISO标准 实验室安全 临床实验室 伦理 运输
生 物 样 技术标准 本 库
标准操作规范 (SOPs)
质量控制标准
知情同意书
伦理规范
伦理委员会 伦理审查
质量审查
ຫໍສະໝຸດ Baidu
样本运输
样本采集 样本处理 样本质量检验 样本储存 样本运输
DNA质量鉴定、RNA质量 鉴定、蛋白质质量鉴定
样本转移协议
ISO标准
公众对于肿瘤组织库建立的认知程度
有调查显示,多数公众对于利用外科手术切除组织进行肿瘤发病 机制或分子标志物的研究持肯定态度,并认为这是对手术切除组 织的最好利用。在一项对住院、门诊、急诊5 000例患者的随机调 查中发现,89.3%的患者同意将其样本的遗传信息用于研究,但 要求采用匿名形式。美国的Vanderbilt大学医学中心2005年启动了 一项旨在将准备丢弃的患者血样再收集以建立DNA数据库计划。 该计划估计,未来5年内可收到30万份以上的患者血样,以进行 疾病的基因型与表型相关性分析。越是大规模的人群遗传学研究 越是需要大样本的生物资源,故得到社会公众的认可很有必要。 目前,许多国家的大型医疗机构已建立组织样本库与数据库,但 因遗传信息属个人隐私,应当受到保护,也招致不少担忧。1998 至2002年间就曾有8个国际机构提出建立以群体为基础的遗传资 源库计划,主要内容是收集与储存血液及组织等生物样本,并收 集与这些样本相关联的医学与生活方式等信息。该计划的共同目 标是通过此项计划的实施,阐明某些疾病的遗传易感性和基因的 复杂性,从而达到改善人类健康与医学诊疗水平的目的。但由于 伦理学、涉及个人隐私等原因,该计划在一些国家搁浅。
运输
物流术语 液氮生物容器 中国民用航空危险品运输管理规定 危险物品航空安全运输技术细则
样本采集
生物标本采集和储存 研究成功的关键
要求 在采集和储存过程中不能受到“污染” 储存的生物标本在任何时候进行检测都可以获得一致的结果 所有的生物标本都应有详细的背景材料和鉴别标识
血液样本采集操作规程
组织样本采集操作规程