第三十四讲 诊断性试验的Meta分析
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诊断性meta分析手把教你做临床Meta 分析——诊断试验性Meta-Disc 分析导读：诊断性meta分析,手把教你做临床Meta 分析——诊断试验性meta分析stata诊断性试验meta手把教你做临床Meta 分析——诊断试验性Meta-Disc 分析临床治疗的基础首先是需要准确的诊断，准确诊断性Meta 分析是Meta 分析的一个重要部分，本次想向大家推荐的是一款专用于诊断性试验的免费Meta 分析软件，临床医学、临床检验、临床病理、临床科研人员、临床康复科及临床影像科等工作人员可用它写上一篇高大上的诊断准确性试验的Meta 分析文章。
安装软件Meta-DiSc 是一个免费的下载软件，登录http://www.hrc.es/investigacion/metadisc_en.htm，下载安装软件，目前最新版本是1.4 版。
运行软件在试行此软件之前，必须明确和熟悉准确诊断性Meta 分析里结果计算的经典四格表（可能不会在您所纳入的文献中出现，需要研究人自己总结并准确的填写在四格表内，不易混淆而且方便分析）。
TP：True positive 表示真阳性的结果，用数字表示；FP：False positive 表示假阳性的结果，用数字表示；FN：False negative 表示假阴性的结果，用数字表示；TN：True negative 表示真阴性的结果，用数字表示。
1打开软件，可以看到如下界面Author：第一作者名+ 文章年限，如Rachow 2013；StudyID：纳入文献的排序编号，亦可以按照自己理想的排名排序；2数据的输入有三种方法可以输入，我们掌握其中两种就足够运用，一种是当纳入的文献较多的时候，可以按照软件中表格的形式对应写在Excel 表上，点击复制Ctrl+c，并点击黏贴Ctrl+v，便可以copy 至软件中的表格内；另一种当纳入的文献数量较少时，则可以直接用手动输入到Meta-disc 数据表内，如下图。
R软件：诊断试验的meta分析
R软件：诊断试验的meta分析 诊断试验的meta分析。
在诊断试验中，通过金标准诊断为患者和非患者，采用某种试验方法诊断为阳性或阴性，列成四格表的形式，计算相关指标评价该试验方法的价值。
单个诊断试验中，常用灵敏度、特异度、似然比、预测值等评价诊断试验的价值。
除上述我们熟悉的指标外，我们需要了解下列指标： 诊断优势比(DOR)=真阳性*真阴性/(假阳性*假阴性)，主要用于诊断试验meta分析中，作为meta分析合并时每个诊断试验权重的依据。
SROC曲线是根据单个诊断试验中的诊断优势比的权重，绘制的集成ROC曲线。
从SROC曲线上可以得到每一个研究的灵敏度和特异度，在存在阈值效应时，该方法最适合。
在绘制SROC 曲线的基础上，可计算SROC曲线下面积以及Q指数。
Q指数为在SROC曲线上，灵敏度=特异度，且最靠近左上角的坐标。
接下来，我们看看诊断试验meta分析的步骤。
与其他类型的meta分析不同的是，诊断试验meta分析中，阈值效应是异质性的重要来源。
阈值效应是因为单个诊断试验中采用不同的诊断界值引起的。
当存在阈值效应时，随着灵敏度的增加，特异度逐渐减小，反之亦然。
我们常通过计算灵敏度与特异度的Spearman相关系数探讨阈值效应，二者之间若存在强负相关则提示存在阈值效应。
但需要注意的是，灵敏度与特异度的相关并不一定都是由阈值效应引起。
当不存在阈值效应时，可以直接合并灵敏度、特异度等单一评价指标;当存在阈值效应时，应采用SROC曲线法，计算SROC曲线下面积和Q指数。
目前，可用来进行诊断试验meta分析的软件有RevMan、meta-DiSc、Stata、R软件等。
今天，我们以R软件的meta4diag程序包为例，演示下如何做诊断试验的meta分析。
meta4diag程序包的功能是基于INLA实现的，因此在使用时还需同时安装相关程序包，即INLA 程序包和sp程序包，程序如下： (1)下载程序包，若运行出错，可通过R/RStudio的工具栏，手动安装。
诊断性实验的Meta分析分解
阳性
阴性
阳性
TP（a）
FP（b）
a+b
阴性
FN（c）
TN（d）
c+d
1.2 单个诊断性实验的评价指标
灵敏度
特异度
指标
假阴性率（漏诊率）
假阳性率（误诊率）
灵敏度=a/a+c；特异度=b/b+d； 假阴性率=c/a+c；假阳性率=d/b+d
• 这个四格表衍生的各种指标：真阳性率（敏感度）、假阳 性率、假阴性率、真阴性率（特异度）等等都是评估替代
3. 诊断性试验meta分析方法在统计 软件中的实现
• RevMan5.0软件和Meta-DiSc 都是在国际上权威的用来做 诊断试验meta分析的软件，在这里仅介绍Meta-Disc软件 的使用方法。
• 下载地址：
http://www.hrc.es/investigacion/metadisc_en.htm
诊断性试验meta分析方法在统 计软件中的实现
3.1 数据录入 3.2 选择项 设置 3.3 阈值效应 检验 3.4 非阈值效应 检验 3.5 合并各诊断试 验评价指标
3.1 数据录入
3.2 选择项设置
3.3 阈值效应检验
3.4 非阈值效应检验
探讨异质性
3.5 合并各诊断试验评价指标
绘制森林图
诊断性实验的Meta分析
刘延青 研究生
前言
临床医生在接诊的过程中，经常考虑的问题就是如何把可 以有病与实际无病的人区别开来，以及如何将患某种疾病 的患者于其他疾病鉴别出来，这个过程中就需要合理运用
诊断试验。广义诊断包括实验室检查、影像学诊断、仪器
检查、病史询问、体格检查等。 对于某个诊断性试验，可能已有多位研究者进行了研究， 为了对不同的研究结果进行综合性分析，获得综合的结论， 需要采用诊断性实验的Meta分析。
诊断试验准确性的Meta分析
诊断试验准确性的Meta分析一、问题与数据某肿瘤科大夫希望了解CT对某肿瘤的诊断准确性，他查阅了很多国内外文献，发现文献中各研究样本量都偏小，且对该方法的准确性评价结果不一，因此想通过Meta分析的方法对其准确性进行较为可靠的评价。
通过对相关文献的检索，共获得以下数据：表1 部分研究数据变量意义及赋值情况如下：表2 变量意义与赋值情况二、对问题分析要进行诊断试验准确性的Meta分析，至少应当收集真阳性、假阳性、假阴性与真阴性的人数。
然而，Meta分析并不是简单的进行数据的加权合并，因为各研究结果不同的原因通常不仅仅是因为样本量小造成的结果不稳定，还可能是因为研究的设计、执行等多方面的因素存在差异所导致，因此Meta分析的一个重要的任务便是对可能的因素进行探讨，找出文献结果不一的原因，这也是证据评价的过程。
表1中，是否是前瞻性研究（predesign）、金标准是否是同一个（samemth）、是否详细描述待评价试验（index）、是否详细描述金标准（reftest）和是否详细描述待评价人群（subject）是本研究中研究者认为可能的影响因素。
三、Stata分析1. 安装分析包一般认为，诊断试验准确性的数据异质性比较明显，因此推荐使用随机效应模型进行分析。
Stata中有专门针对诊断试验准确性Meta分析的分析包midas和metandi，均是采用两水平的随机效应模型进行分析。
由于后者不支持meta回归功能，因此本文仅介绍midas包的使用。
在command窗口，依次输入以下命令，安装必需的分析包：ssc install midasssc install mylabels2. 数据录入在Stata窗口点击数据编辑按钮，弹出数据编辑窗口。
在变量名位置双击，弹出新建变量窗口。
如果变量是字符型，则变量类型（Variable type）选择str，是数值型则选择double（小数）或int （整数）。
设定好变量名后，从excel中将数据复制到新建变量窗口中即可，部分数据如下图。
诊断准确性Meta分析
诊断准确性Meta分析
疾病治疗前需对疾病进行准确诊断，诊断方法的准确度将直接影响后续治疗的合理性。
类似于干预性研究，单个的诊断准确性试验（diagnostic test accuracy，DTA）也存在样本量过小等局限性。
DTA的Meta分析可以克服这一局限性，为临床医生和卫生技术评估机构提供定量合成的科学证据，从而将各种新的检查引进到医学领域。
循证医学创始人之一、加拿大 McMaster 大学 Gordon Guyatt 教授指出循证诊断是未来循证医学发展的重要方向之一。
诊断准确性试验（diagnostic test accuracy，DTA）的 Meta 分析是循证诊断高质量证据的重要来源。
本节PPT将对DTA相关的Meta分析进行进行详细阐述。
诊断性试验Meta分析
Revman,Stata,Meta-disc在診斷試驗準確性（DTA）系統評價中的應用文獻數據摘自《ProGRP與NSE對小細胞肺癌診斷價值的meta 分析》文中提取數據GAGGAGAGGAFFFFAFAFGAGGAGAGGAFFFFAFAFSun中國------病理105016.3251968915658Yang 中國------病理1444616.346491617237265注：表中 10 個原始研究均使用酶聯免疫吸附測定法檢測陽性界值； TP= 真陽性數； FP= 假陽性數； FN= 假陰性數； TN= 真陰性數a:ProGRP,b: NSERevman5.2新建診斷試驗準確性(DTA)系統評價模板GAGGAGAGGAFFFFAFAFGAGGAGAGGAFFFFAFAF添加所有納入研究GAGGAGAGGAFFFFAFAFGAGGAGAGGAFFFFAFAFGAGGAGAGGAFFFFAFAF此處對每篇文獻QUADAS2質量特征進行描述，以便探討異質性來源及作表圖數據分析里面添加所要研究的待評價診斷試驗GAGGAGAGGAFFFFAFAFGAGGAGAGGAFFFFAFAF可計算相關指標（似然比及診斷比值比和單獨在干預系統評價里面作森林圖）添加分析里面制作SEN和SPE森林圖及SROC曲線，可對數據進行重新制定GAGGAGAGGAFFFFAFAFGAGGAGAGGAFFFFAFAFStudyLamy 2000Molina 2009Nissan 2009Schneider 2003Shibayama 2001Stieber 1999Sun 2005Takada 1996Yamaguchi 1995Yang 2005TP3541134297411773802546FP18979611222669FN164641840292847917TN229218548119234972034696072Sensitivity (95% CI)0.69 [0.54, 0.81]0.47 [0.36, 0.58]0.77 [0.70, 0.83]0.78 [0.62, 0.90]0.65 [0.55, 0.74]0.80 [0.73, 0.86]0.72 [0.62, 0.81]0.63 [0.54, 0.71]0.74 [0.56, 0.87]0.73 [0.60, 0.83]Specificity (95% CI)0.93 [0.89, 0.96]0.96 [0.93, 0.98]0.87 [0.85, 0.90]0.95 [0.90, 0.98]0.96 [0.92, 0.98]0.98 [0.93, 1.00]0.90 [0.86, 0.94]0.99 [0.97, 1.00]0.91 [0.81, 0.97]0.89 [0.80, 0.95]Sensitivity (95% CI)00.20.40.60.81Specificity (95% CI)00.20.40.60.81設置參數GAGGAGAGGAFFFFAFAF若用戶對上圖窗口中的統計分析顯示的結果不滿意，可點擊右上角的屬性按鈕); 或依次展开树形目录分支"Data and Analyses→Analyses→ProGRP"，选中"ProGRP"并单击右键，选择"Properties … "，弹出属性设置对话框。
诊断性实验Meta分析
1.3 ROC曲线定义
• 对某一诊断试验方法，通过改变诊断临界点，可以获得多 对灵敏度和特异度，以敏感度为纵坐标，1-特异度为横坐 标绘制曲线，横轴与纵轴长度相等，形成正方形，在图中 将ROC曲线工作点标出，用直线连接各相邻两点构建ROC曲 线。通过计算ROC曲线下面积，可以评定该诊断方法的准 确性。
• 在国际上质量评价有一个QUADAS标准(quality assessment of diagnostic accuracy studies)来评价纳入诊 断试验的质量
2.3 资料提取
研究资料的基本情况 • 包括纳入研究的作者、发表时间、研究对象的病例数、对
照数目、SEN、SPE、计算获得的真阳性( TP) 、假阳性 (FP) 、真阴性( TN) 、假阴性(FN)、检测的方法、检测试 剂的来源、诊断的临界值等基本情况，都用表表示出来。
1.4 ROC曲线的解读
灵敏度
1
0.8
0.6
0.4
0.2
0
0
0.2
0.4
0.6
0.8
1
1-特异度
机会线
所谓的“曲线左上角”至少可以找出3 种判断方式：
（1）
曲线与斜率为1 的斜线的切点；
（2）
曲线与经过 （0,1）和 （1,0）两点直 线的交点；
（3）
曲线上与 （0,1）点绝 对距离最近 的点。
2.4.2 非阈值效应检验
• 在诊断性试验的meta分析中，除了阈值效应引起研究间异 质性外，其他原因：人群（如疾病严重程度和伴发疾病）、 试验条件（如不同的技术、化验、操作者）、标准试验等， 在软件中用诊断比值比DOR的Cochran-Q检验来检测是否 存在非阈值效应引起的变异。
诊断性meta分析 手把教你做临床 Meta 分析——诊断试验性 Meta-Disc 分析
导读：诊断性meta分析,手把教你做临床 Meta 分析——诊断试验性 Meta-Discstata诊断性试验meta手把教你做临床 Meta 分析——诊断试验性Meta-Disc 分析临床治疗的基础首先是需要准确的诊断，准确诊断性 Meta 分析是 Meta 分析的一个重要部分，本次想向大家推荐的是一款专用于诊断性试验的免费 Meta 分析软件，临床医学、临床检验、临床病理、临床科研人员、临床康复科及临床影像科等工作人员可用它写上一篇高大上的诊断准确性试验的 Meta 分析文章。
安装软件Meta-DiSc 是一个免费的下载软件，登录，下载安装软件，目前最新版本是版。
运行软件在试行此软件之前，必须明确和熟悉准确诊断性 Meta 分析里结果计算的经典四格表（可能不会在您所纳入的文献中出现，需要研究人自己总结并准确的填写在四格表内，不易混淆而且方便分析）。
TP：True positive 表示真阳性的结果，用数字表示；FP：False positive 表示假阳性的结果，用数字表示；FN：False negative 表示假阴性的结果，用数字表示；TN：True negative 表示真阴性的结果，用数字表示。
1打开软件，可以看到如下界面Author：第一作者名 + 文章年限，如 Rachow 2013；StudyID：纳入文献的排序编号，亦可以按照自己理想的排名排序；2数据的输入有三种方法可以输入，我们掌握其中两种就足够运用，一种是当纳入的文献较多的时候，可以按照软件中表格的形式对应写在 Excel 表上，点击复制 Ctrl+c，并点击黏贴 Ctrl+v，便可以 copy 至软件中的表格内；另一种当纳入的文献数量较少时，则可以直接用手动输入到 Meta-disc 数据表内，如下图。
3数据的分析（1）合并统计量的分析运行如下图点击 Analyze，在下拉窗口中选择 Tabular Results，并点击向右指示的三角箭头，可出现 Sensitivity/Specificity；Likelihood Ratio；Diagnostic OR 和灰色的 SROC Area（SROC 面积）。
[转载]诊断性实验META分析在STATA中的实现过程（转）
![[转载]诊断性实验META分析在STATA中的实现过程（转）](https://img.taocdn.com/s3/m/10fa105fe418964bcf84b9d528ea81c758f52e7b.png)
[转载]诊断性实验META分析在STATA中的实现过程（转）原⽂地址：诊断性实验META分析在STATA中的实现过程（转）作者：数据统计服务中⼼⼀、问题与数据某肿瘤科⼤夫希望了解CT对某肿瘤的诊断准确性，他查阅了很多国内外⽂献，发现⽂献中各研究样本量都偏⼩，且对该⽅法的准确性评价结果不⼀，因此想通过Meta分析的⽅法对其准确性进⾏较为可靠的评价。
通过对相关⽂献的检索，共获得以下数据：表1 部分研究数据变量意义及赋值情况如下：表2 变量意义与赋值情况⼆、对数据结构的分析要进⾏诊断试验准确性的Meta分析，⾄少应当收集真阳性、假阳性、假阴性与真阴性的⼈数。
然⽽，Meta分析并不是简单的进⾏数据的加权合并，因为各研究结果不同的原因通常不仅仅是因为样本量⼩造成的结果不稳定，还可能是因为研究的设计、执⾏等多⽅⾯的因素存在差异所导致，因此Meta分析的⼀个重要的任务便是对可能的因素进⾏探讨，找出⽂献结果不⼀的原因，这也是证据评价的过程。
表1中，是否是前瞻性研究（predesign）、⾦标准是否是同⼀个（samemth）、是否详细描述待评价试验（index）、是否详细描述⾦标准（reftest）和是否详细描述待评价⼈群（subject）是本研究中研究者认为可能的影响因素。
三、Stata分析与结果解读1. 安装分析包⼀般认为，诊断试验准确性的数据异质性⽐较明显，因此推荐使⽤随机效应模型进⾏分析。
Stata中有专门针对诊断试验准确性Meta分析的分析包midas和metandi，均是采⽤两⽔平的随机效应模型进⾏分析。
由于后者不⽀持meta回归功能，因此本⽂仅介绍midas包的使⽤。
在command窗⼝，依次输⼊以下命令，安装必需的分析包：ssc install midasssc install mylabels2. 数据录⼊在Stata窗⼝点击数据编辑按钮，弹出数据编辑窗⼝。
在变量名位置双击，弹出新建变量窗⼝。
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诊断性meta分析手把教你做临床Meta 分析——诊断试验性 Meta-Disc分析导读：诊断性meta分析,手把教你做临床 Meta 分析——诊断试验性 Meta-Disc 分析,诊断性meta分析stata,诊断性试验meta，推荐访问：诊断性meta分析stata诊断性试验meta手把教你做临床 Meta 分析——诊断试验性Meta-Disc 分析临床治疗的基础首先是需要准确的诊断，准确诊断性 Meta 分析是 Meta 分析的一个重要部分，本次想向大家推荐的是一款专用于诊断性试验的免费 Meta 分析软件，临床医学、临床检验、临床病理、临床科研人员、临床康复科及临床影像科等工作人员可用它写上一篇高大上的诊断准确性试验的 Meta 分析文章。
安装软件Meta-DiSc 是一个免费的下载软件，登录http://www.hrc.es/investigacion/metadisc_en.htm，下载安装软件，目前最新版本是 1.4 版。
运行软件在试行此软件之前，必须明确和熟悉准确诊断性 Meta 分析里结果计算的经典四格表（可能不会在您所纳入的文献中出现，需要研究人自己总结并准确的填写在四格表内，不易混淆而且方便分析）。
TP：True positive 表示真阳性的结果，用数字表示；FP：False positive 表示假阳性的结果，用数字表示；FN：False negative 表示假阴性的结果，用数字表示；TN：True negative 表示真阴性的结果，用数字表示。
1打开软件，可以看到如下界面Author：第一作者名 + 文章年限，如 Rachow 2013；StudyID：纳入文献的排序编号，亦可以按照自己理想的排名排序；2数据的输入有三种方法可以输入，我们掌握其中两种就足够运用，一种是当纳入的文献较多的时候，可以按照软件中表格的形式对应写在 Excel 表上，点击复制 Ctrl+c，并点击黏贴 Ctrl+v，便可以 copy 至软件中的表格内；另一种当纳入的文献数量较少时，则可以直接用手动输入到 Meta-disc 数据表内，如下图。
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运行软件在试行此软件之前，必须明确和熟悉准确诊断性Meta 分析里结果计算的经典四格表（可能不会在您所纳入的文献中出现，需要研究人自己总结并准确的填写在四格表内，不易混淆而且方便分析）。
TP：True positive 表示真阳性的结果，用数字表示；FP：False positive 表示假阳性的结果，用数字表示；FN：False negative 表示假阴性的结果，用数字表示；TN：True negative 表示真阴性的结果，用数字表示。
1 打开软件，可以看到如下界面Author ：第一作者名+ 文章年限，如Rachow 2013 ；StudyID ：纳入文献的排序编号，亦可以按照自己理想的排名排序；2 数据的输入有三种方法可以输入，我们掌握其中两种就足够运用，一种是当纳入的文献较多的时候，可以按照软件中表格的形式对应写在Excel 表上，点击复制Ctrl+c ，并点击黏贴Ctrl+v ，便可以copy 至软件中的表格内；另一种当纳入的文献数量较少时，则可以直接用手动输入到Meta-disc 数据表内，如下图。