环境生物技术实验讲义
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实验一细菌淀粉酶和过氧化氢酶定性测定
一、实验目的
①了解过氧化氢酶试验的反应原理和用途。
②了解淀粉酶试验的反应原理和用途。
③通过对淀粉酶和过氧化氢酶的定性测定,加深对酶和酶促反应的感性认识。
二、实验原理
酶是微生物机体内生物合成的一种生物催化剂,它是高分子蛋白质,具有催化生物化学反应加速进行,并具有传递电子、原子和化学基团的作用。微生物的酶按它所在细胞的部位分为胞外酶、胞内酶及表面酶。本实验对胞外酶中的两种即淀粉酶和过氧化氢酶(亦叫接触酶)进行定性测定。
细菌淀粉酶能将遇碘呈蓝色的淀粉水解为遇碘不显色的糊精,并进一步转化为糖,淀粉被酶催化分解后用碘检测不到其变色现象;过氧化氢酶能将过氧化氢快速分解为水和氧气,能用肉眼很容易的观测到产生的气泡。
三、实验仪器和试剂
①试管(15mm-150mm)5支、试管架1个、培养皿(90mm)3套、接种环。
②肉膏胨淀粉琼脂培养基(1L) : 蛋白胨10g、Nacl 5g、牛肉膏5g、可溶性淀粉2g、琼脂15g、蒸馏水定容到1000ml 121℃灭菌20min。
③4%淀粉溶液1滴瓶:4g可溶性淀粉加水至100ml
④革氏碘液1滴瓶:碘1g、KI 2g、蒸馏水300ml (将I与KI先行混合,加入蒸馏水少许充分振摇,待完全溶解后,再加蒸馏水至300ml。
⑤9%过氧化氢1滴瓶:30%过氧化氢30ml 蒸馏水70ml
⑥枯草杆菌和大肠杆菌斜面各一支。
⑦活性污泥
四、实验方法
(一)生活污水活性污泥混合液中淀粉酶的测定
①取3支干净的试管,按1、2、3对照编号。放在试管架上备用。
②在1号、2号试管内分别加入5ml、10ml的活性污泥混合液,再在1号和2号试管中分别加10 ml和5 ml蒸馏水。在对照管内加15 ml 蒸馏水。
③在1号、2号、3号及对照管中分别加入4%的淀粉液4滴(淀粉液的用量,在做预备实验时根据样品中淀粉酶含量多少而定),迅速摇匀并记下反应的初始时间。
④在上述3个管内分别加4滴碘液(碘液用量在预备实验时酌定),迅速摇匀,这时各管均呈蓝色。
⑤观察结果。注意各管的变化,记下各管蓝色完全消失时的时间(即淀粉酶和淀粉反应完全的时间),并对结果进行分析。
(二)细菌淀粉酶在固体培养基中的扩散实验
①将肉膏胨淀粉琼脂培养基加热融化,待冷至45℃左右倒入无菌培
养皿内(每皿约10 ml),共倒3个,静置待冷凝即成平板。
②在无菌操作条件下,用接种环分别挑取枯草杆菌、大肠杆菌和活性污泥各一环分别在3个平板上点种5个点。倒置于37℃恒温箱内过夜培养。
③观察结果,取出碘液,分别在3个平板内菌落周围滴加20ul碘液,观察菌落周围颜色的变化。若在菌落周围有一个无色的透明圈,说明该细菌产生淀粉酶并扩散到基质中去。若菌落周围仍为蓝色,说明该细菌不产生淀粉酶。
(三)过氧化氢酶的定性测定
①将配备的斜面培养基接种枯草杆菌、大肠杆菌37℃恒温箱内过夜培养。
②用滴管吸取过氧化氢滴加入到菌落上,观察菌落是否有气泡。
五、实验报告
把所观察到的现象记录下来,进行分析。
六、思考题
①淀粉酶定性测定中对照应呈什么颜色?为什么?各菌落呈什么颜色?为什么?
②各菌落滴加过氧化氢后呈什么现象?说明什么问题?
实验二处理生活污水的活性污泥微生物总DNA的提取一、实验目的:
①掌握环境样品DNA提取技术。
②掌握琼脂糖电泳的检测原理和方法。
二、实验原理:活性污泥是一种以好氧性细菌为主体的微生物和水中的悬浮物质、胶体物质混杂在一起形成的肉眼可见的絮状颗粒,它是废水生物处理过程的主体。
环境样品的微生物总DNA的提取和纯化方法主要由两部分组成:1.温和裂解细胞及溶解DNA的技术,包括物理、化学或酶解作用裂解细胞,是DNA释放出来。2.在环境样品DNA得到充分释放后,通常采用几种化学和酶学方法中的任一种来去除杂蛋白、RNA及其他的大分子。
琼脂糖是一种天然聚合长链状分子,可以形成具有刚性的滤孔,凝胶孔径的大小决定于琼脂糖的浓度DNA分子在碱性缓冲液中带负电荷,在外加电场作用下向正极泳动DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时,有电荷效应与分子筛效应。不同DNA的分子量大小及构型不同,电泳时的泳动率就不同,从而分出不同的区带。琼脂糖凝胶电泳法分离DNA,主要是利用分子筛效应使不同大小的DNA分子分离,把分子量标准参照物和样品一起进行电泳而得到检测。溴化乙锭(EB)在紫外光照射下发射荧光,EB可与DNA分子形成EB-DNA复合物。
三、实验仪器和试剂:
仪器:核酸电泳系统,凝胶成像分析系统,离心机,移液器,水浴锅,
涡旋振荡器,EP管。
试剂:
1、0.1%磷酸钠缓冲液(PH 8.0)100ml :1M Na2HPO4 93.2ml、1M NaH2PO4 6.8 ml,加热配制。
2、溶菌酶。
3、20% SDS 100ml:20g SDS 加灭菌水定容至100ml,加热。
4、70%乙醇:70ml无水乙醇,加灭菌水30ml。
5、TE缓冲液(PH 8.0):1M Tris-cl 500ul,0.2M EDTA 250ul,灭菌水49250ul
6、异丙醇,
7、8mol/LKAc溶液:392.56g KAC 加灭菌水500ml,121℃灭菌20min。
8、1kb DNA分子量标准。
9、1%琼脂糖:0.5g 琼脂糖加5ml 10×TBE,45ml水。
10、10×TBE:Tris-base 54g、Boric Acid 27.5g、Na2EDTA 4.65g 加蒸馏水定容至500ml,用HCL调PH 8.3
11、核酸上样缓冲液:10×ladder
四、实验方法:
1、取1g活性污泥,离心12000rpm 3min 去上清,灭菌水洗涤2
次,10000rpm 3min,去上清。加1ml 0.1mol/L PH8磷酸钠缓冲
液,漩涡震荡器震荡20min。
2、加溶菌酶5mg,使终浓度为2.5mg/ml,振荡5min,37℃水浴
30min。