金属离子与蛋白质的相互作用
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金属离子与血清白蛋白的相互作用
一、实验目的:
测定过渡金属离子对蛋白质功能的影响
二、实验原理:
金属离子在许多生命过程中发挥关键作用,研究金属离子与蛋白质的结合作用是生命科学的重要内容,是化学和生命科学研究的前沿领域。血清白蛋白是哺乳动物血浆中含量最丰富的蛋白质,它能够储存和转运众多的内源性和外源性物质。由于血清白蛋白在生理上的重要性和易于分离、提纯,从上世纪50年度(国内80年代末)开始,人们对血清白蛋白与金属离子(和药物分子等)的相互作用展开了大量研究,以期在分子水平上揭示相关生命过程的奥秘。
许多蛋白质含有金属离子,金属离子对蛋白质发挥生物学功能起着关键性的作用。在人体基因组编码的蛋白质中,超过30%的蛋白质含有一个或多个金属离子;所有酶中,超过40%的蛋白质含有金属离子,它们在生命活动过程中发挥着各样的生物学功能。许多人类的疾病与金属离子-蛋白质的异常相互作用相关。
目前用于研究金属离子与蛋白质相互作用的研究方法主要有:(1)紫外-可见吸收光谱法;(2)荧光光谱法;(3)平衡透析法;(4)毛细管电泳法;(5)电泳法等。
(一)紫外-可见光谱法
蛋白质通常有3个明显不同的紫外吸收带:(1)210nm以下的吸收来自肽键的吸收以及许多构象因素;(2)210-250nm为芳香族和其他残基的吸收、某些氢键的吸收、与其他构象和螺旋相关的相互作用等多种因素;(3)250-290nm附近为芳香族的残基,其中酪氨酸残基在278nm(Tyr,260-290nm)附近有强吸收,色氨酸残基(Trp)在290nm附近有强吸收,而苯丙氨酸(Phe,250-260nm)的吸收较弱。外界因素如溶剂极性以及pH等会影响吸收光谱。
当金属离子与蛋白质结合时,蛋白质或金属离子吸收光谱的强度或者谱带位置会发生变化,可分为两种情况:(1)蛋白质微扰的金属离子光谱变化,可以推断金属离子的配位环境;(2)金属离子微扰的蛋白质光谱变化,可以推断生色基微环境及蛋白质结构的变化。通过对光谱的比较分析和计算,可以推断金属离子与蛋白质的结合情况。若蛋白质的吸收峰增强,则可认为小分子进入蛋白质的疏
水腔,导致肽链伸展,疏水环境下降。单纯的溶剂效应下,峰的蓝移表示原先深埋于蛋白质非极性区的生色基被暴露于极性溶剂,红移则表示生色基被翻转到极性较小的区域。
图1 芳香酸的紫外吸收图谱
(二)荧光光谱法
荧光光谱法是研究蛋白质分子构象的一种有效方法,具有灵敏度高、选择性强、用样量少、方法简便等优点。血清白蛋白中含有色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸残基,因此能发出荧光。在通常条件下,色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸的荧光强度比为100:9:0.5,因此蛋白质的天然荧光主要来自色氨酸。当金属离子与血清白蛋白结合后,可引起蛋白质或少数金属离子荧光的改变,由此可进行定性定量研究。常用荧光猝灭法测定金属离子与蛋白质的结合数和结合常数,用共振能量转移法测定金属离子与蛋白质分子中色氨酸残基之间的距离。
1、荧光猝灭
荧光淬灭的原因是溶液中淬灭剂分子和荧光物质之间发生相互作用致使荧光效率降低或激发态寿命缩短,特异性的淬灭是由于荧光物质与淬灭物质之间发生了特异性的化学作用所引起的。许多过程可引起荧光猝灭,如:激发态反应、能量转移、配合物形成和碰撞猝灭。荧光猝灭的机制主要静态猝灭和动态猝灭。(1)动态猝灭
动态猝灭又称为碰撞猝灭,是由于荧光体与猝灭体之间的扩散作用导致的。假设猝灭为动态猝灭,则按照斯特恩-沃尔默(Stern-V olmer)方程:F0 / F = 1 + K q τ0 [Q] = 1 + K D [Q]计算K q。其中F0为猝灭体不存在猝灭体的荧光强度,F为
加入猝灭体后的荧光强度,K q为双分子猝灭常数,[ Q] 为猝灭体浓度,τ0为猝灭体不存在时荧光体的荧光寿命,K D为Stern-V olmer 常数,K D = K qτ0。
当按照Stern-V olmer方程作图得到一条直线时,表明只存在一种荧光体,并且都是猝灭体可接近的;如果存在两种荧光体,则按Stern-V olmer方程作图会偏离直线,并且逐渐偏向横轴。即使按照Stern-V olmer方程作图是直线,也并不一定是发生了碰撞猝灭。
(2)静态猝灭
猝灭体与荧光体之间形成不发荧光的基态配合物所导致的猝灭,符合方程
F0 / F = 1 + K s [ Q] ,K s为荧光体与猝灭体之间的结合常数。对于静态猝灭通常采用Lineweaver-Burk双倒数函数关系,即由上式变形可得F0 / ( F0 - F) = 1 + K d (1/ [ Q]),K d为离解常数,K d = 1/ K s,静态猝灭常数就是配合物的结合常数K s。
静态猝灭方程与动态猝灭方程表观上一样,静态猝灭用配合物的结合常数
K s表示,而动态猝灭则用Stern-V olmer 常数K D表示。
(3)如何区分动态猝灭和静态猝灭
1)通过荧光寿命计算猝灭常数K q。生物分子的荧光寿命约为10 ns数量级,各种猝灭剂对生物分子的最大扩散碰撞猝灭常数约为2.0×1010(L ·mol- 1·s- 1)。当K q大于2.0×1010(L ·mol- 1·s- 1)时,则认为是静态猝灭。
2)观察温度对猝灭常数(K q或者K s)的影响。动态猝灭依赖扩散,升高温度则导致扩散加快,因此猝灭常数则随温度升高而增大;升高温度会导致配合物稳定性降低,因此静态猝灭常数随温度升高而减小。
3)观察荧光体的吸收光谱。碰撞猝灭仅仅影响荧光体的激发态,因此动态猝灭不影响荧光体的吸收光谱;而基态配合物的形成会引起荧光体的吸收光谱不断变化,则可以判断该体系为静态猝灭。
2、福斯特(Forster)共振能量转移
当血清白蛋白分子的发射光谱与金属离子的吸收光谱有相互重叠时,通过分子间偶极-偶极的共振偶合可使能量从色氨酸(给体)转移到金属离子(受体)。按照福斯特(Forster)共振能量转移理论,可以求出金属离子与蛋白质中色氨酸残基的距离r,并由r的变化分析其它物质对血清白蛋白构象的影响。给体-受体间能量转移效率E与给体-受体间距离r和能量转移距离R0存在如下关系: