酶促反应动力学
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( 2)
说明:设[E]为酶的总浓度;[ES]为中间产物浓度;[S]为底物 浓度;[E]—[ES]为游离状态酶的浓度。并且由于底物的量通常 要比酶的量高很多,所以在最初反应时间内,[S]浓度的减少可 忽略不计。同时,由于在最初反应时间内,产物的生成很少, 所以其逆反应可忽略不计。 因此根据中间产物学说的反应有: [ES]的生成速度为:v1=k1([E]—[ES])([S]) [ES]分解的速度为:v2+v3=[ES](k2+k3) 根据恒态理论,ES形成的速度应等于分解的速度,所以: k1([E]—[ES])([S]) = [ES](k2+k3) 即:
Km=
所以1/Km表示形成ES的趋势大小 所以1/Km表示形成ES的趋势大小 1/Km表示形成ES
特例: Km=K2/K1=Ks(在K3<<K1,K2时) <<K1 特例: Km=K2/K1=Ks(在K3<<K1,K2时
5. Km与Ks Km不等于Ks。在K3<<K1、K2时, Km看 也只有此时1/ 1/Km 作Ks,也只有此时1/Km 才可以近似表示酶与底
3、米氏方程式的分析
(1)当[S]Km时,v = Vmax[S]/Km ,反应为一级反应。 (2)当[S]Km时, v =Vmax,反应为零级反应。 (3)当v=Vmax/2时,Km=[S],即米氏常数的含义为反应达 到最大反应速度一半时的底物浓度。它的单位是摩尔/升,与 底物浓度的单位一样。
4、米氏常数的意义
木瓜蛋白酶 胆碱脂酶
PH影响酶活力的原因可能有以下几个方面 : 1、过酸过碱会影响酶蛋白的构象,甚至使酶 变性失活。 2、PH影响底物分子和酶分子的解离状态。最 适PH与酶活性中心结合底物的基团及参与催化的 基团PK值有关,往往只有一种解离状态最有利于 与底物结合,在此PH下酶活力最高;也可能影响 到中间产物ES的解离状态。总之,都影响到ES 的形成,从而降低酶活性。 3、PH可影响酶分子中另一些基团的解离,这 些基团的离子化状态与酶的专一性及酶分子中活 力中心的构象有关。
(1) Km值是酶的特征性常数之一。它一般与酶的性质有关, 而与酶的浓度无关。不同的酶, Km值不同。 (2)如果一个酶有几个底物,则对每一种底物各有一个特 定的Km值。并且 Km值还受PH及温度的影响。因此,测定酶 的Km值可以作为鉴别酶的一种手段,但必须在指定的实验条 件下进行。
。
(3) Km值可表示酶与底物的亲和力(当k3k1或k2k3 时)。 Km值愈大,亲和力越小; Km值愈小,亲和力越 大。一般Km值最小的底物称为该酶的最适底物或天然底 物。 Km值随不同底物而异的现象可以帮助判断没的专一 性,并有助于研究酶的活性中心。 (4)可用来判断某一反应所用底物浓度的大小。即可 根据所要求的反映速度求出应当加入底物的合理浓度;也 可根据已知的底物浓度,求出该条件下的反应速度
c.Hanes-Woolf作图法 c.Hanes-Woolf作图法
Km 1 1 1 = × + V Vmax [S] Vmax
Eisenthal和Cornish-Bowden直接线性作图 d. EisenthaFra Baidu bibliotek和Cornish-Bowden直接线性作图 将米氏方程改写为: 将米氏方程改写为:
最适PH可因底物浓度、种类及缓冲液浓度不同而不 同,而且常与酶的等电点不一致,所以该值也不是 常数。
动物:6.5-8.0;植物及微生物:4.5-6.5,但 有例外。如胃蛋白酶为1.5;精氨酸酶为9.7
应当指出的是酶在试管反应的最适PH 与它所在正常生理的PH并不一定完全相同。 这是因为一个细胞内可能会有几百种酶。不 同的酶对此细胞内的生理PH的敏感性不同; 也就是说PH对一些酶是最适PH,而对另一 些酶则不是,不同的酶表现出不同的活性。 这种不同对于控制细胞内复杂的代谢途径可 能具有很重要的意义。
E+A ←→ EA ←→ FP ←→ F ←→ FB ←→ EQ ←→ E+Q 可用以下图式来说明: A P B Q
E——————————————————————→E EA ←→ FP F FB ←→ EQ
米氏方程最初是有Michaelis和Menten提出,然后有 Briggs和Haldane又加以补充与发展。 其公式的推导: 按照酶被底物的饱和现象出发,依据“稳态平 衡”假说理论,推导如下:
米氏方程的推导: 米氏方程的推导:
Michaelis和Menten的酶促反应动力学基础上 的酶促反应动力学基础上, 在Michaelis和Menten的酶促反应动力学基础上, 1925年 Briggs和Haldane提出酶反应分两步进行 提出酶反应分两步进行, 1925年,Briggs和Haldane提出酶反应分两步进行,即 稳态平衡”理论: “稳态平衡”理论: ES的浓度与 的浓度与( )(2 ES的浓度与(1)(2)都有关系 第一步: 第一步: ( 1) 第二步: 第二步:
用图式来说明: A B Q P ↓ ↓ ↑ ↑ E———EA———EAB ←→EPQ———EP———E 或者是: B A P Q ↓ ↓ ↑ ↑ E———EB———EBA ←→EPQ———EQ———E 如磷酸化酶催化的反应就属此类: 磷酸化酶 糖原+P————G—1—P+糖原 (3)乒乓反应机理(ping pong mechanism) P B
四、酶促反应动力学 酶促反应动力学(kinetics ofenzymecatalyzed reaction )是研究酶促反应的速度 以及影响此速度的各种因素的科学。
Michaelis 与 Menten 发展出酶动力学 展出酶动力学
Nelson & Cox (2000) Lehninger Principles of Biochemistry (3e) p.258
Michaelis Menten
(一)温度的影响
温度对酶促反应速度的影响具有双重效应。其一是当 温度升高时,随温度的升高反应速度加快(温度系数Q10为 1-2;每增加10 ℃ ,反应速度为原反应速度的1-2倍);其 二是当温度升高到一定限度时,随温度的升高,酶发生变 性而使速度降低。 [ 说明:温度系数(tempperature coefficient)是指反应温度 升高10度,其反应速度与原来的反应速度之比。] 每种酶都有其最适温度,在温血动物提取的酶,其最适 温度一般为35-40℃;植物的为40-50℃;某些细菌的酶可 高达70℃ 。 最适温度不是酶的特征性常数,随环境因素而变化。 酶干燥状态下和低温下保存较好。
最适温度
T℃
(二)PH的影响
在一定的pH 在一定的pH 下, 酶具 有最大的催化活性, 有最大的催化活性,通 胃蛋白酶 常称此pH 常称此pH 为最适 pH)。 pH(optimum pH)。 a.过酸或过碱影响酶蛋白 a.过酸或过碱影响酶蛋白 的构象,使酶变性失活。 的构象,使酶变性失活。 b.影响酶分子中某些基团 b.影响酶分子中某些基团 的解离状态( 的解离状态(活性中心 的基团或维持构象的一 些基团) 些基团) c.影响底物分子的解离状 c.影响底物分子的解离状 态 缓冲液体系
(k2+k3)/k1=
([E]—[ES])([S]) /[ES]
令Km= (k2+k3)/k1 ,则有 Km= ([E]—[ES])([S]) /[ES] 也就是 [ES]=[E][S]/(Km+[S]) 因为反应速度的大小与[ES]成正比,即v=k3[ES],将 其带入上式则变换为: v=k3[E][S]/(Km+[S]) 而当底物浓度很高时,酶全部被底物所饱和,此时 [E]=[ES],而反应速度达到最大反应速度,即: Vmax=k3[ES]=k3[E],所以将其带入上式即可得到以下 表达式: v=Vmax[S]/(Km+[S]) 即米氏方程式。
6、多种底物的反应
实际上大多数酶反应的机理是比较复杂的,一般包含有一种以上的底物,至 少也是两种底物,即双底物反应: E A+B——→P+Q 目前认为大部分双底物反应可能有三种反应机理: (1)依次反应机理(ordered mechanism) B P
E+A ←—→EA ←—→EAB ←→EPQ ←—→EQ ←—→E+Q 用图式说明: A B P Q ↓ ↓ ↑ ↑ E———— ———— ———— ———— ————→E EA EAB ←—→EPQ EQ 需要NAD+或NADP+的脱氢酶的反应就属此类型。 (2)随机机理(random mechanism ) 加入底物A及B后,产物P及Q以随机的方式释放出来。 同时,底物的加入也是随机的,E可以先和A结合,也可以先和B结合,其结 果都是形成中间产物EAB。在产物释放时,可先释放P,也可先释放Q。
底物浓度对反应速度的影响
提 高 底 物 浓 度 增 强 酶 活 性 表 現
80 60 0 1 2 3 4 5 6 7 8
生 成 40 物 浓 20 度
0 0 2 4 6 8
S + E ↓ P
在 固 定 時 間 內 反 應 (
底物浓度 mole
2、米氏方程式 人们曾提出各种假说来解释上述现象,其中比较合理的解 释是“中间产物学说”。按此学说,1913年前后Michaelis and Menten在前人工作的基础上,作了大量的定量研究,积累了足 够的实验证据,从而提出酶促动力学的基本原理,并归纳出一 个数学表达式,即: =Vmax[S]/ Km+[S] v =Vmax[S]/(Km+[S]) 此式即为米氏方程式,它的前提是酶与底物的“快速平衡 说”——开始反应速度快,迅速地建立平衡。米氏方程式圆 满地表示了底物浓度与酶反应速度间的定量关系。这就使 “中间产物学说”得到了人们的普遍承认,现在一般称为 “米氏学说”。
1、底物浓度对反应速度的影响 底物浓度(substrate concentration)对反应速度的影响比较复杂。在一定的酶浓 度下,如将初速度对底物浓度的关系作图,可以发现:当底物浓度较低时,反应速 度与底物浓度成正比,表现为一级反应(first order reaction)。随着底物浓度的升 高,反应速度不再按正比升高,表现为混合级反应(mixed order reaction)。若再增 加底物浓度,曲线表现为零级反应(zero order reaction),这时尽管底物浓度还可 以不断增加,但反应速度却不再增加,说明酶已被底物所饱和,反应速度达到了最 大反应速度。如下图。
物结合的难易程度。 物结合的难易程度。 无抑制剂时,ES的分解速度与形成速 6.Km与Km′ 无抑制剂时,ES的分解速度与形成速 度的比值符合米氏方程, 度的比值符合米氏方程,为Km; 而有抑制剂时发 生变化,则不符合米氏方程, 生变化,则不符合米氏方程,为Km′ 。
7.Km可以帮助推断某一反应的方向和途径 7.Km可以帮助推断某一反应的方向和途径 Km Km=1.7x10-5mol/L 乳酸脱氢酶 乳酸
a.双倒数作图法
(Lineweaver-Burk) Lineweaver1.0 0.8
斜率=Km/Vmax 斜率
0.6 1/v 0.4
-1/Km
0.2
1/Vmax
0 2 4
-1
0.0 -4 -2 6 8 10 1/[S](1/m ol.L ) m
v-v/[S]作图法 b. v-v/[S]作图法 Eadie(Eadie-Hofstee) 将米氏方程改写: 将米氏方程改写:
三)酶浓度的影响 在酶促反应中,如果底物 浓度足够大,足以使酶饱和, 则反应速度与酶浓度成正比。 如右图。 这种正比关系可由下式表 示: V=K[E] 该式也可以由米氏方程推 导出来。式中的K表示K3[S]/ (Km+[S])。 注意:使用的酶必须是纯酶制 剂或不含抑制物的粗酶制剂。
(四)底物浓度的影响
丙酮酸
丙酮酸脱氢酶
乙酰CoA 乙酰CoA 乙醛
Km=1.3x10-3 mol/L Km=1.0x10-3mol/L
丙酮酸脱羧酶
米氏常数Km和Vmax的求法的求法 5. 米氏常数 的求法
V m ax [S ] V= K m + [S]
Km 1 1 1 = × + V Vmax [S] Vmax