细菌种属

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细菌种属分类

细菌种属分类

细菌种属分类细菌是一类单细胞微生物,它们广泛存在于自然界中,包括土壤、水体、空气、动植物体内等各种环境中。

细菌种属分类是对细菌进行分类的一种方法,它是根据细菌的形态、生理特征、生态习性等方面的差异来进行分类的。

本文将介绍几种常见的细菌种属分类。

1. 革兰氏阳性菌革兰氏阳性菌是一类细菌,它们的细胞壁含有大量的肽聚糖和穿过细胞壁的脂肪酸,这使得它们在革兰染色中呈现出紫色。

革兰氏阳性菌包括许多病原菌,如金黄色葡萄球菌、链球菌、炭疽杆菌等。

此外,革兰氏阳性菌还包括一些产生抗生素的菌株,如放线菌属、链霉菌属等。

2. 革兰氏阴性菌革兰氏阴性菌是一类细菌,它们的细胞壁相对较薄,不含有大量的肽聚糖和脂肪酸,这使得它们在革兰染色中呈现出红色。

革兰氏阴性菌包括许多病原菌,如大肠杆菌、沙门氏菌、克雷伯菌等。

此外,革兰氏阴性菌还包括一些产生抗生素的菌株,如铜绿假单胞菌属、鲍曼不动杆菌属等。

3. 厌氧菌厌氧菌是一类不能在氧气存在下生长的细菌,它们需要在缺氧或微氧的环境中生长。

厌氧菌包括许多产生有机酸、酒精、气体等化合物的菌株,如乳酸菌属、酵母菌属、甲烷菌属等。

此外,厌氧菌还包括一些产生毒素的菌株,如肉毒杆菌属、产气荚膜梭菌属等。

4. 嗜热菌嗜热菌是一类能够在高温环境下生长的细菌,它们的生长温度通常在50℃以上。

嗜热菌包括许多生活在地热泉、海底热液等高温环境中的菌株,如嗜热菌属、嗜热蓝菌属等。

此外,嗜热菌还包括一些产生酶类的菌株,如热稳定性蛋白酶的产生菌株。

5. 光合细菌光合细菌是一类能够进行光合作用的细菌,它们能够利用光能将二氧化碳转化为有机物质。

光合细菌包括许多生活在水体中的菌株,如蓝藻属、紫细菌属等。

此外,光合细菌还包括一些生活在土壤中的菌株,如光合细菌属等。

细菌种属分类是对细菌进行分类的一种方法,它能够帮助我们更好地了解细菌的形态、生理特征、生态习性等方面的差异。

通过对细菌种属分类的研究,我们能够更好地认识细菌的生态、生物学特性,为细菌的应用和控制提供科学依据。

16S鉴定细菌的种属

16S鉴定细菌的种属

16S rDNA在原核生物中普遍存在。
16 S rDNA的相对分子量大小适中,约1500 bp,便于序列分析。 在16S rRNA分子中, 既含有高度保守的序列区域,又有中度保
守和高度变化的序列区域,因而它适用于进化距离不同的各类
生物亲缘关系的研究。 bp=base pair
图 16S rDNA基因组成(灰色为保守区,绿色为可变区)
16S rDNA基因全长1542 bp,由9个可变区和10个保守区组成。其中保守区反 映了生物物种间的亲缘关系,而可变区则表明物种间的差异,且变异程度与细 菌的系统发育密切相关。
DNA的提取
挑取单菌落,然后置于装有100 μLPrepMan Ultra的离心管中, 涡旋震荡混匀30s左右,然后100℃水浴10min 后,以离心机 最大转速离心 3min ,取 10μL 上清液与 490μL ddH2O (即稀 释50 倍),混匀作为下步PCR 的模板DNA 。提取的DNA 于-20℃保存。
利用16S rDNA鉴定细菌 的种属
1.什么是 16S rDNA? 16SrRNA 为原核生物核糖体 RNA 的一个亚基, 16SrDNA 就是编
码该亚基的基因。 原核生物的rRNA含有3种类型:23S、16S、5S rRNA,它们分别
含有2900、1540和120个核苷酸。
2.用16S rDNA进行细菌鉴定的原因
检测:核酸蛋白仪/琼脂糖凝胶电泳
525R 5' AAG GAG GTG WTC CAR CC 3'
试剂使用量( 20μL体系)
模板DNA (10ng~100ng) 2μL
PCR 反应条件
Taq 酶(5U/μL)
10×Taq Buffer(Mg2+) dNTPs(2.5mM) 引物F(10 μM) 引物R(10 μM) ddH2O

16S鉴定细菌的种属 PPT

16S鉴定细菌的种属 PPT
守和高度变化的序列区域,因而它适用于进化距离不同的各类 生物亲缘关系的研究。 bp=base pair
图 16S rDNA基因组成(灰色为保守区,绿色为可变区)
16S rDNA基因全长1542 bp,由9个可变区和10个保守区组成。其中保守区反 映了生物物种间的亲缘关系,而可变区则表明物种间的差异,且变异程度与细 菌的系统发育密切相关。
码该亚基的基因。 原核生物的rRNA含有3种类型:23S、16S、5S rRNA,它们分别
含有2900、1540和120个核苷酸。
2.用16S rDNA进行细菌鉴定的原因 16S rDNA在原核生物中普遍存在。 16 S rDNA的相对分子量大小适中,约1500 bp,便于序列分析。 在16S rRNA分子中, 既含有高度保守的序列区域,又有中度保
检测:核酸蛋白仪/琼脂糖凝胶电泳
1525R 5' AAG GAG GTG WTC CAR CC 3'
试剂使用量( 20μL体系)
PCR 反应条件
模板DNA (10ng~100ng) Taq 酶(5U/μL) 10×Taq Buffer(Mg2+) dNTPs(2.5mM) 引物F(10 μM) 引物R(10 μM) ddH2O
2μL 0.2 μL 2 μL 1 μL 0.5 μL 0.5 μL 13.8 μL
1min30s
判断16Sr DNA序列扩增是否成功:经琼脂糖凝胶电泳在1500 bp附近 出现条带,说明16s rDNA已经扩增成功。
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精选pptdna的提取挑取单菌落然后置于装有100lprepmanultra的离心管中涡旋震荡混匀30s左右然后100水浴10min后以离心机最大转速离心3min取10l上清液与490lddh2o即稀释50倍混匀作为下步pcr的模板dna

细菌学:第二章 细菌的分类形态和进化

细菌学:第二章 细菌的分类形态和进化
• 用于沙门氏菌、葡萄球菌毒素、 E.ColiO157 和单核细胞增生李斯特氏菌等 快速检测
免疫学技术
• 2、酶免疫技术 • 利用抗原、抗体反应高度特异性和酶
促反应高度敏感性,通过肉眼或显微 镜观察及分光光度计测定,达到在细 胞或亚细胞水平上示踪抗原或抗体部 位,及对其进行定量目的。
免疫学技术
• 3、免疫印迹技术
↓ cDNA序列测定
↓ 反推rRNA序列 – 细菌基因组16S rDNA 可以直接以PCR 放大,然后测序
Eubacteria (真细菌界)
Archaebacteria (古细菌界)
Eukarya (真核生物界)
利用16SrRNA建立分子进化树
• 同一菌种的各个细菌,在某些方面仍有一定的差异, 可再分成亚种(subspecies)
☆分类是根据微生物的相似性和亲缘关系,将微生物归入不同的分类类群。 ☆鉴定是确定一个新的分离物属于已经确认的分类单元的过程。
☆命名是根据国际命名法规给微生物分类单元以科学的名称。
5 界 论
6 界 论
8 界 论
三域学说
古古生生菌菌
– 系统分类学Phylogenetic Classification
• 亚种以下的分类等级为型(type),以区别某些特殊 的特征。
• 例如:抗原结构不同而分的血清型(serotype);对 噬菌体敏感性不同的噬菌体型(phagetype);对细菌 素敏感性不同的细菌素型(bacteriocin-type),生化 反应和某些生物学性状不同的生物型(biotype)。
4)rRNA在细胞中含量大(约占细胞中RNA的90%),也易于提取;
5)16SrRNA普遍存在于真核生物和原核生物中(真核生物中其同 源分子是18SrRNA)。因此它可以作为测量各类生物进化的工具。

细菌的结构与类型

细菌的结构与类型

球菌( 球菌(coccus) )
双球菌
链球菌
葡萄球菌
杆菌( 杆菌(bacillus) )
杆菌形态多数呈直杆状
多种形态的杆菌
双歧杆菌
棒状杆菌
分枝杆菌
螺形菌( 螺形菌(spiral bacterium) )
弧菌
螺菌
螺杆菌
第二节 细菌的结构
基本结构 细胞壁、细胞膜、细胞质、 细胞壁、细胞膜、细胞质、核质 特殊结构 荚膜、鞭毛、菌毛、 荚膜、鞭毛、菌毛、芽孢
第一章 细菌的形态与结构
细菌( 细菌(bacterium):是属原核生物界 ) 的一种单细胞微生物。 广义细菌: 包括细菌、衣原体、支原体、立 克次体、螺旋体、放线菌 狭义细菌: 专指其中数量最大、种类最多、 具有典型代表性的细菌
第一节 细菌的大小与形态
测量单位: 测量单位: 微米 (µm) ) 基本形态三种: 基本形态三种: 球菌;杆菌; 球菌;杆菌;螺形菌
形态大小不一, 形态大小不一,G- 临床意义: 临床意义:
慢性和反复感染 常规细菌检查阴性
(二)细胞膜
组成:脂质双层,蛋白质(无胆固醇) 组成:脂质双层,蛋白质(无胆固醇) 功能: 功能: 物质转运 呼吸作用 合成作用 参与细菌分裂
中介体(mesosome) )
细胞膜内陷、折叠形成的囊状膜性结 构,多见于G+菌。 功能:与分裂有关;类似真核细胞线粒体。
(四)核质(nuclear material) 核质( )
细菌的遗传物质; 集中于细胞质的某一区域; 无核膜、核仁;
单一密闭环状DNA.
二、细菌的特殊结构
1.荚膜(capsule) 1.荚膜(capsule) 荚膜
某些细菌细胞壁外包绕一层粘 某些细菌细胞壁外包绕一 层粘 液样物质, 液样物质 , 牢固地与细胞壁结 分为荚膜和薇荚膜。 合,分为荚膜和薇荚膜。 普通染色不易着色 不易着色, 普通染色 不易着色 , 光镜下可 见透明环。 见透明环。

细菌总论

细菌总论

Plasma Membrane Structure
中介体(mesosome):
细胞膜向细胞浆内凹陷,折叠形成 的囊状物,一端连在细胞膜上,令一端 与核质相连,参与细菌的分裂,起着 类似纺锤丝的作用(细菌分裂时一分 为二)。 G+多见,其扩大了细胞膜的表面积, 加强了细胞呼吸,其功能类似真核细 胞线粒体,故有拟线粒体(chondroid) 之称。
(1)形态:多形态性 (2)培养:须在高渗、低琼脂含血清的培 养基中生长,多呈油煎蛋状菌落 (3)原生质体:革兰阳性菌(仅有细胞膜) 原生质球:革兰阴性菌(有外膜保护) (4) 对作用于细胞壁的抗生素无效 (5) 常规细菌培养阴性 (6) 细菌L型仍有一定的致病能力 ,引起慢性感 染
The conversion of walled bacterial cells to L forms

肽聚糖(Peptidoglycan),又称粘肽。 细菌细胞壁的主要成分. 由聚糖骨架、四肽侧链和五肽交联 桥3部分组成(G-菌肽聚糖无交联桥) 形成坚韧的三维立体结构。各种细菌聚 糖骨架均相同,但四肽侧链的组成极其 联结方式随菌种而异。
G-与G+肽聚糖结构区别
聚糖骨架
聚糖骨架
G +菌
四肽侧链
G-菌
㈠ 细菌的基本 结构: 1、细胞壁 2、细胞膜 3、细胞质 4、核质
一、细胞壁(Cell wall)
1、细胞壁的主要功能:
在体菌细胞的最外层,坚韧而有弹性. (1) 维持细菌固有形态,保护细菌抵抗低渗 环境,起到屏障作用。 (2) 参与细胞内外物质交换。 (3) 带有多种表位,决定细菌的抗原性。
细胞壁(cell wall) 的主要成分
对人体细胞无毒性作用。

2009—2012年发现的人口腔细菌新种属简介

2009—2012年发现的人口腔细菌新种属简介

2009—2012年发现的人口腔细菌新种属简介细菌是人口腔微生物的优势种群,不断有新的种属被发现和命名。

本文介绍2009—2012年从人口腔分离的5个新菌属和16个新菌种的主要生物学特性。

标签:新菌属;新菌种;人口腔细菌是人口腔内微生物的优势种群,与口腔健康和疾病密切相关。

随着医学理论和技术的发展和完善,人口腔内不断有新的细菌种属被发现和命名,其在微生物系统内的分类位置也会发生变动。

了解这些新的种属有助于全面了解口腔微生物的分类现状,对口腔基础和临床研究也具有重要意义。

新的细菌种属被发现后,在《国际微生物分类进化学杂志》(International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology)上发表后才能被业界认可,本文即介绍2009—2012年发表在该期刊上,从人口腔分离的5个新菌属和16个新菌种的主要生物学特性。

1 新菌属1.1 锥形杆菌属(Pyramidobacter)(Downes,et al.2009)[1]命名:因在培养基上形成锥形样菌落而得名。

特性:革兰阴性杆菌,专性厌氧、无芽胞、无动力;蛋白胨-酵母提取物-葡萄糖(peptone yeast ex-tract glucose,PYG)肉汤培养物的主要终末代谢产物是乙酸、少量的异戊酸和痕迹量到少量的丙酸、异丁酸、琥珀酸、苯乙酸。

模式种:鱼腥味锥形杆菌(Pyramidobacter pisco-lens),DNA的G+C摩尔分数为59%,分离自人的口腔。

1.2 拟普雷沃菌属(Alloprevotella)(Downes,et al.2012)[2]命名:因与普雷沃菌有相似性而被命名为拟普雷沃菌属。

特性:革兰阴性杆菌,专性厌氧、无芽胞、无动力;发酵碳水化合物的终末代谢产物是乙酸和琥珀酸。

模式种:坦纳拟普雷沃菌(Alloprevotella tanne-rae),DNA的G+C摩尔分数为45%~47%,分离自人的口腔。

简述细菌种属的分类鉴定流程

简述细菌种属的分类鉴定流程

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进行细菌种属分类鉴定首先要进行样本采集。

16SrDNA鉴定菌株的标准操作规程

16SrDNA鉴定菌株的标准操作规程

16SrDNA鉴定菌株的标准操作规程1.适用范围本标准规定了通过特定引物对细菌的16SrDNA片段进行PCR扩增,然后对扩增片段进行序列分析比对,快速获得细菌种属信息的操作规程.本标准适用于未知细菌的快速种属分析,以及为细菌的生化鉴定提供指导信息。

2.方法和原理16SrDNA鉴定是指用利用细菌16SrDNA序列测序的方法对细菌进行种属鉴定。

包括细菌基因组DNA提取、16SrDNA特异引物PCR扩增、扩增产物纯化、DNA测序、序列比对等步骤。

是一种快速获得细菌种属信息的方法。

细菌rRNA(核糖体RNA)按沉降系数分为3种,分别为5S、16S和23S rRNA。

16S rDNA是细菌染色体上编码16S rRNA相对应的DNA序列。

16S rDNA由于大小适中,约1.5Kb左右,既能体现不同菌属之间的差异,又能利用测序技术较容易地得到其序列,故被细菌学家和分类学家接受。

在16S rRNA分子中,可变区序列因细菌不同而异,恒定区序列基本保守,所以可利用恒定区序列设计引物,将16S rDNA片段扩增出来,利用可变区序列的差异来对不同菌属、菌种的细菌进行分类鉴定。

16SrDNA序列的前500bp序列变化较大,包含有丰富的细菌种属的特异性信息,所以对于绝大多数菌株来说,只需要第一对引物测前500bp序列即可鉴别出细菌的菌属。

针对科学论文发表或是前500bp无法鉴别的情况,需要进行16SrDNA的全序列扩增和测序,得到较为全面的16SrDNA的序列信息。

由于测序仪一次反应最多只能测出700bp的有效序列,为了结果的可靠性,通常将16SrDNA全长序列分成3部分进行测序。

3.设备和材料1.1器材移液器(1000μL、200μL 、100μL、10μL);涡旋振荡器;Eppendorf MixMate;离心机;水浴锅;电泳仪;制冰机;低温冰箱;PCR仪:Veriti 96 Well Thermal Cycler;凝胶成像仪:VersaDoc MP 4000;基因分析仪:AB3500、AB31301.2试剂DNA快速提取试剂:PrepMan Ultra;琼脂糖;PCR试剂:Taq酶,10×Taq Buffer (Mg2+),dNTPs,ddH2O等;ExoSAP-IT;测序试剂:BigDye Terminator,5×Sequencing Buffer;BigDye XTerminator Purification Kit;1.3耗材移液器吸头:1000μL、200μL、10μL;离心管:1.5mL、200μL;Micro Amp TM Optical 96—Well Reaction Plate;Micro Amp TM Optical Adhesive Film;1.4引物16SrDNA 名称序列扩增长度第1部分正向引物27F 5’—AGA GTT TGA TCC TGG CTC AG—3'500 bp左右反向引物519R 5’- GWA TTA CCG CGG CKG CTG —3’第2部分正向引物357F 5'—CTC CTA CGG GAG GCA GCA G—3’750bp左右反向引物1115R 5'-AGG GTT GCG CTC GTT GC—3’第3部分正向引物926F5'- AAA CTY AAA KGA ATT GAC GG —3’560 bp 左右反向引物1492R5'—TAC GGC TAC CTT GTT ACG ACT T —3’其中M=C:A , Y=C :T 。

实验二常见细菌种属的鉴定

实验二常见细菌种属的鉴定
采用DNA提取试剂盒或传统方法提取细菌DNA。
16S rRNA基因测序
对细菌16S rRNA基因进行测序,通过比对数据库中的序列信息确 定细菌种属。
其他分子生物学实验
根据不同细菌种属的基因特征,进行其他分子生物学实验,如PCR 扩增、基因芯片检测等。
04 结果分析
形态学结果分析
总结词
通过观察细菌的形态、染色特性等,初步判断细菌种属。
THANKS FOR WATCHING
感谢您的观看
02
大肠杆菌在部分样本中检出,其数量 相对较少,表明该菌在实验样本中的 存在具有一定的偶然性。金黄色葡萄 球菌、沙门氏菌、绿脓杆菌和志贺氏 菌则在部分样本中呈现出较高的检出 率,表明这些细菌种属在实验样本中 具有一定的普遍性和稳定性。
03
在鉴定的细菌种属中,金黄色葡萄球 菌、沙门氏菌和志贺氏菌属于人类致 病菌,其中金黄色葡萄球菌和志贺氏 菌可引起严重的食物中毒和腹泻等临 床症状,沙门氏菌可导致伤寒和副伤 寒等严重疾病。绿脓杆菌则是一种条 件致病菌,常引起伤口感染和败血症 等症状。
血杆菌等。
了解常见化脓性细菌种属的生物 学特性,如金黄色葡萄球菌、表
皮葡萄球菌等。
02 实验原理
形态学鉴定法
总结词
基于细菌的形态、大小、染色反 应等表型特征进行鉴定。
详细描述
通过显微镜观察细菌的形态、大 小、排列方式、染色反应等表型 特征,与已知的标准菌株进行比 较,从而确定细菌的种属。
生理生化鉴定法
对实验结果的分析与讨论
实验结果表明,部分样本中存在较高检出率的致病菌,如金黄色葡萄球菌、沙门氏菌和志贺 氏菌等,这可能会对实验参与者和环境造成潜在的健康风险。因此,在实验过程中应采取有 效的防护措施,避免交叉感染和环境污染。

16S鉴定细菌的种属

16S鉴定细菌的种属

84
Enterococcus avium ATCC 14025T (DQ411811) Enterococcus devriesei LMG 14595T (AJ891167) 98 Enterococcus pseudoavium ATCC 49372T (DQ411809) 99 Enterococcus hermanniensis LMG 12317T (AY396047) Enterococcus pallens ATCC BAA-351T (DQ411812) Enterococcus asini AS2T (Y11621) Enterococcus canintestini LMG 13590T (AJ888906) 99 Enterococcus dispar LMG 13521T (AJ301829) Enterococcus phoeniculicola JLB-1T (AY028437) Enterococcus thailandicus FP48-3T (EF197994) Enterococcus canis LMG 12316T (X76177) Enterococcus durans DSM 20633T (AJ276354) Enterococcus mundtii LMG 10748T (AJ301836) Enterococcus villorum LMG 12287T (AJ271329)2 03 04

16SrDNA的定义及其应用于细菌 鉴定的原因 鉴定的一般步骤 文本目录
鉴定存在的不足及其解决办法
文本目录 16SrDNA 在细菌鉴定中的应用
1.16SrDNA的定义
16SrRNA为原核生物核糖体RNA的一个亚基,16SrDNA就是编码该亚基的基因。

生活中有哪些常见的致病菌

生活中有哪些常见的致病菌

生活中有哪些常见的致病菌一、人体中的常见的致病菌:1、葡萄球菌:属革兰氏阳性球菌。

是人体皮肤上寄居最多的致病菌,也见于鼻咽等处。

金黄色葡萄球菌致病力最强,主要产生溶血素、杀白细胞素和血浆凝固酶等,造成许多种感染,如疖、痈、脓肿和伤口感染等。

金黄色葡萄球菌感染的特点是局限性组织坏死,脓液稠厚、黄色、不臭。

也能引起全身性感染。

2、链球菌:属革兰氏染色阳性球菌。

存在于口、鼻、咽和肠腔内。

链球菌的种类很多,溶血性链球菌、绿色链球菌和粪链球菌是常见的致病菌。

溶血性链球菌能产生溶血素和透明质酸酶、链激酶等,溶解破坏细胞间质中的透明质酸、纤维蛋白和其他蛋白质,使炎症易扩散而缺乏局限化的倾向。

脓液特点是比较稀薄,淡红色,量较多。

典型的感染是急性蜂窝织炎、淋巴管炎等。

绿色链球菌是一些胆道感染和亚急性心内膜炎的致病菌。

粪链球菌属厌氧菌,常和大肠杆菌一同引起混合感染。

3、大肠杆菌:革兰氏染色阴性。

寄居于肠道内。

对维生素K的合成有重要作用。

它的单独致病力不大,若和其他致病菌在一起时,可造成严重的混合感染,如大面积烧伤感染、阑尾脓肿、急性胆囊炎等,产生的脓液稠厚,有粪臭。

4、绿脓杆菌:革兰氏染色阴性。

常寄居于肠道和皮肤上,它对大多数抗菌药物不敏感,故成为继发感染中的重要致病菌,特别是大面积烧伤感染时,可引起难以控制的绿脓杆菌败血症。

绿脓杆菌感染的伤口常不易愈合,其脓液呈淡绿色,有腥臭味。

5、变形杆菌:革兰氏染色阴性。

存在于肠道和前尿道,为尿路感染、急性腹膜炎和大面积烧伤感染的致病菌之一。

变形杆菌对大多数抗菌药物有耐药性。

脓液具有特殊的恶臭。

6、无芽胞厌氧菌:革兰氏染色阴性的专性厌氧菌。

在一般外科感染中,此类细菌为重要的病原体之一。

具有临床意义的有脆弱类杆菌、核梭形菌、消化球菌和消化链球菌等多种。

这些无芽胞厌氧菌寄生在人体内的腔道,特别是胃肠道(结肠内的数量最多)、口腔、阴道等处。

它们与需氧菌共同构成机体的正常菌群。

正常情况下保持菌群相对平衡,对人体无害。

细菌种属分类

细菌种属分类

细菌种属分类细菌(Bacteria)是生物的主要类群之一,属于细菌域。

细菌是所有生物中数量最多的一类依据分类标准不同,细菌的分类有所差异。

1、根据形状分为三类,即:球菌(包括单球菌、双球菌、链球菌、葡萄球菌等)、杆菌(比如肠杆菌)和螺旋菌(包括弧菌、螺菌、螺杆菌)。

2、按细菌的生活方式来分类,分为两大类:自养菌和异养菌,其中异养菌包括腐生菌和寄生菌。

3、按细菌对氧气的需求来分类,可分为需氧(完全需氧和微需氧)和厌氧(不完全厌氧、有氧耐受和完全厌氧)细菌。

4、按细菌生存温度分类,可分为喜冷、常温和喜高温三类。

5、根据细菌阴阳分类:革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。

例如:化脓性球菌都属于革兰氏氏阳性菌,它们能产生外毒素使人致病,而肠道菌多属于革兰氏阴性菌,它们产生内毒素,靠内毒素使人致病。

常见的革兰氏阳性菌有:葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等。

补注:①国际上最具权威性的细菌分类系统专著有“伯杰氏系统细菌学手册”和“伯杰鉴定细菌学手册”。

②细菌的分类层次与其他生物一样,也是界、门、纲、目、科、属、种,但细菌常用的是“属和种”,种是细菌分类的基本单位。

③细菌的结构分为基本结构和特殊结构。

基本结构是各种细菌都具有的结构,包括细菌的细胞壁、细胞膜、细胞质、核质。

某些细菌特有的结构称为特殊结构,包括细菌的荚膜、鞭毛、菌毛、芽胞。

④细菌主要以无性二分裂方式繁殖(裂殖),即细菌生长到一定时期,在细胞中间逐渐形成横隔,由一个母细胞分裂为两个大小相等的子细胞。

⑤微生物划分为以下8大类——细菌、病毒、真菌、放线菌、立克次氏体、支原体、衣原体、螺旋体。

中国农业植物病原菌物常见种属名录

中国农业植物病原菌物常见种属名录

中国农业植物病原菌物常见种属名录本文旨在介绍中国农业植物病原菌物中的一些常见种属,包括其名称、研究意义和分布情况。

这些病原菌物对农业植物的生长发育产生重要影响,对农业生产构成潜在威胁。

通过了解这些常见病原菌物的特征和分布情况,有助于采取有效的防治措施,提高农业生产的稳定性。

名称:稻瘟病菌属,包括多种水稻瘟病菌种,如稻瘟病菌(Piricularia oryzae)等。

研究意义:稻瘟病是水稻生产中的重要病害之一,对水稻产量和质量造成严重影响。

研究稻瘟病菌属及其相关病害的防治措施,对保障水稻安全生产具有重要意义。

分布情况:稻瘟病菌属在中国分布广泛,尤其在长江流域和华南地区发生较为严重。

名称:轮纹病菌属,包括多种植物病原菌种,如梨轮纹病菌(Macrophomina phaseolina)等。

研究意义:轮纹病是果树生产中的一种重要病害,可导致果实品质下降和产量损失。

研究轮纹病菌属及其病害的防治措施,对保障果树安全生产具有重要意义。

分布情况:轮纹病菌属在中国果树产区有广泛分布,其中部分地区发生较为严重。

名称:枯萎病菌属,包括多种植物病原菌种,如香蕉枯萎病菌4号小种(Fusarium oxysporum f.sp. cubense)等。

研究意义:枯萎病是农作物生产中的一种毁灭性病害,可导致植物生长衰弱甚至死亡。

研究枯萎病菌属及其病害的防治措施,对保障农作物安全生产具有重要意义。

分布情况:枯萎病菌属在中国农作物产区有广泛分布,其中部分地区发生较为严重。

名称:疫病菌属,包括多种植物病原菌种,如大豆疫病菌(Phytophthora sojae)等。

研究意义:疫病是农作物生产中的一种常见病害,可导致植物叶片黄化、植株死亡等。

研究疫病菌属及其病害的防治措施,对保障农作物安全生产具有重要意义。

分布情况:疫病菌属在中国农作物产区有广泛分布,其中部分地区发生较为严重。

炭疽病菌属(Colletotrichum)名称:炭疽病菌属,包括多种植物病原菌种,如香蕉炭疽病菌(Colletotrichum musae)等。

细菌种属的分子鉴定

细菌种属的分子鉴定

用16S rDNA方法鉴定细菌种属一、目的1. 掌握16S rDNA对细菌进行分类的原理及方法;2. 掌握DNA提取、PCR原理及方法、DNA片段回收等实验操作。

二、原理随着分子生物学的迅速发展,细菌的分类鉴定从传统的表型、生理生化分类进入到各种基因型分类水平,如(G+C)mol%、DNA杂交、rDNA指纹图、质粒图谱和16S rDNA序列分析等。

细菌中包括有三种核糖体RNA,分别为5S rRNA、16S rRNA、23S rRNA,rRNA基因由保守区和可变区组成。

16S rRNA对应于基因组DNA上的一段基因序列称为16S rDNA。

5S rRNA虽易分析,但核苷酸太少,没有足够的遗传信息用于分类研究;23S rRNA含有的核苷酸数几乎是16S rRNA的两倍,分析较困难。

而16S rRNA相对分子量适中,又具有保守性和存在的普遍性等特点,序列变化与进化距离相适应,序列分析的重现性极高,因此,现在一般普遍采用16S rRNA作为序列分析对象对微生物进行测序分析。

利用16S rDNA鉴定细菌的技术路线:三、操作步骤(一)细菌基因组DNA提取1. 挑单菌落接种到10 mL LB培养基中37℃振荡过夜培养。

2. 取2 mL培养液到2 mLEppendorf管中,8000 rpm离心2分钟后倒掉上清液。

3. 加140 μL TE打散细菌,再加入60 μL 10 mg/ml的溶菌酶。

37℃放置10分钟。

4. 加入400 μL Digestion Buffer,混匀。

再加入3 μL Protein K,混匀,55℃温育5分钟。

5. 加入260 μL乙醇,混匀,全部转入UNIQ-10柱中。

10000 rpm离心1分钟,倒去收集管内的液体。

6. 加入500 μL 70%乙醇(Wash Solution),10000 rpm离心0.5分钟。

7. 重复第六步。

8. 再10000 rpm离心2分钟彻底甩干乙醇。

吸附柱转移到一个新的1.5 mL的离心管。

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需氧革兰 阴性杆菌 —发酵菌 (非肠杆 菌科) 巴斯德菌 巴斯德菌属 科 假单胞菌属 昏迷单胞菌属 窄食单胞菌属 产碱杆菌属 需氧革兰 伯克霍尔德菌 阴性杆菌 假单胞菌 金色杆菌属 —非发酵 科 黄杆菌属 菌、非肠 杆菌科 莫拉菌属 不动杆菌属 玫瑰单胞菌 鞘氨醇单胞菌 放线杆菌属 阿菲菌属 巴尔通体属 鲍特菌属 鞘杆菌属 弯曲杆菌属 二氧化碳嗜纤 维菌属 心杆菌属
厌氧革兰 韦荣球菌 韦荣球菌属 阴性球菌 科 放线菌属 Actinomyces 隐秘杆菌属 阿托波菌属 革兰阳性 双歧杆菌属 无芽胞杆 放线菌科 菌 真杆菌属 乳杆菌属 动弯杆菌属 丙酸杆菌属 厌氧革兰 阴性杆菌 —形成芽 梭菌科 梭菌属 线状杆菌属 孪生球菌属 消化球菌属 消化链球菌属 厌氧革兰 阳性球菌
多杀巴斯德菌 铜绿假单胞菌(绿脓杆菌) 微小假单胞菌 睾酮单胞菌 粪产碱杆菌 洋葱伯克霍尔德菌 脑膜败血症金色杆菌 IIe群黄杆菌 卡他莫拉菌 非液化莫拉菌 鲍曼不动杆菌 洛菲不动杆菌 颈玫瑰单胞菌 血神经鞘单胞菌 人放线菌 克利夫兰阿菲菌 杆状巴尔通体 百日咳杆菌 肉芽肿鞘杆菌 大肠弯曲杆菌 芽龈二氧化碳嗜纤维菌 人心杆菌 肺炎衣原体 沙眼衣原体 鹦鹉热衣原体 伯氏考克斯体(Q热病原体) 犬埃里希体 土拉热弗朗西丝菌 流感嗜血杆菌 幽门螺杆菌 金氏菌 嗜肺菌团菌 静止嗜冷杆菌 斑疹伤寒立克次体 念珠状链杆菌 产吲哚萨顿菌 脆弱拟杆菌 核梭杆菌 不解糖卟啉单胞菌 口颊普雷活菌 产琥珀酸厌氧螺菌 叉型棍状厌氧菌 简明弯曲杆菌 惰性脱硫单胞菌
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支原体
需氧革兰 阳性球菌
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需氧革兰 阴性杆菌
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