条件性基因敲除的基本原理Cre
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条件性基因敲除的基本原理Cre/loxP重组系统条件性基因敲除主要是通过Cre/10xP或者Ftp/FRT重组系统来实现的。这
两个系统都是位点特异性重组酶系统,已发展成为在体内、外进行遗传操作的有力工具。这两个系统的应用,可以使靶基因的表达或缺失发生在试验动物发育的某一阶段或某一特定的组织器官。此外,若与控制Cre或Flp表达的其他诱导系统相结合,还可以对某一基因同时实现时空两方面的调控。
1.Cre/loxP系统的原理
Cre/loxP系统来源于F1噬菌体,可以介导位点特异的DNA重组。该系统含有两种成分:①一段长34bp的DNA序列,含有两个13 bp的反向重复序列和一个8 bp的核心序列。这段34bp序列是重组酶识别的位点,被称为loxP位点(10cus of X—over in P1)。②Cre重组酶(cyclizationrecombination),它是一种由343个氨基酸组成的单体蛋白,可以引发loxP位点的DNA重组。任何序列的DNA,当其位于两个loxP位点之间的时候,在Cre重组酶的作用下要么被缺失(两个loxP 位点的方向相同),要么方向发生倒转(两loxP位点的方向相反),如图所示。
Cre/loxP系统的作用机制
2.Cre/loxP系统优点
Cre/10xP系统之所以在基因敲除中获得了非常广泛的应用,是由该系统的诸多优点决定的:①Cre重组酶与具有loxP位点的DNA片断形成复合物后,可以提供足够的能量引发之后的DNA重组过程,因此该系统不需要细胞或者生物体提供其他的辅助因子;②loxP位点是一段较短的DNA序列,因此非常容易合成;
③Cre重组酶是一种比较稳定的蛋白质,因此可以在生物体不同的组织、不同的生理条件下发挥作用;④Cre重组酶的编码基因可以置于任何一种启动子的调控之下,从而使这种重组酶在生物体不同的细胞、组织、器官,以及不同的发育阶段或不同的生理条件下产生,进而发挥作用,这一点也是该系统在应用过程中最为重要的一点。
3.Cre/loxP系统的工作流程
利用Cre/loxP系统实现体内某特定基因在特定条件下的敲除,需要两只转基因小鼠。第一只小鼠一般采用胚胎干细胞技术获得,首先在体外构建一个在目的
基因两端分别含有一个loxP位点的基因序列,之后将体外构建好的这段基因序列转入胚胎干细胞内,使其通过同源重组替代细胞基因组内原来的基因序列。经过这样处理的胚胎干细胞被重新植入到假孕小鼠的子宫内,使其重新发育成为一个完整的胚胎,最终成为一只转基因小鼠。在这只转基因小鼠中,loxP位点被引入到相应基因的内含子内,理论上不会对相应基因的功能产生影响,因此一般情况下,该小鼠的表型是正常的。第二只转基因小鼠一般采用卵母细胞注射或者胚胎干细胞技术获得,在这只小鼠中,Cre重组酶被置于某特定基因启动子的调控之下,可以使其在某特定的条件下表达。最后,让这两只小鼠进行交配,产生的同时含有上述两种基因型的子代小鼠就会在某一特定类型的细胞中缺失某一特定的基因。
很明显,在何种组织细胞或器官中敲除某一特定的基因取决于所选择的启动子。只要选择合适的启动子调控Cre重组酶的表达,使其在生物体特定的部位、特定的条件下产生,就可以实现相应条件下某一特定基因的敲除。迄今为止,研究者们已经成功地利用多个不同的启动子实现了在不同条件下的基因敲除,这些启动子可以是细胞类型特异的,如lck启动子(胸腺细胞)、alphaA晶状体球蛋白启动子(眼晶状体)、钙调素依赖性激酶Ⅱ启动子(海马和大脑新皮质)、乳清酸性蛋白启动子(乳腺)、aP2启动子(脂肪组织)、AQP2启动子(肾脏集合管)和肌浆蛋白启动子(骨骼肌)等。启动子也可以受某些外源性化学物质的调控,外源性调控的基因敲除可以避免在胚胎发育早期由于基因功能的异常所产生的副作用,如干扰素反应Mxl启动子、他莫西酚依赖的雌激素突变体启动子和四环素调节系统等。