蛋白质的折叠

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在原核生物和真核生物中,均存在另一 种携带蛋氨酸的tRNA,识别非起动部位 的蛋氨酸密码,AUG。
四、rRNA和核蛋白体
原 核 生 物 中 的 核 蛋 白 体 大 小 为 70S , 可 分 为 30S 小 亚 基 和 50S 大 亚 基 。 小 亚 基 由 16SrRNA 和 21 种 蛋 白 质 构 成 , 大 亚 基 由 5SrRNA,23SRNA和35种蛋白质构成。 真核生物中的核蛋白体大小为80S,也分为 40S小亚基和60S大亚基。小亚基由 18SrRNA和30多种蛋白质构成,大亚基则由 5S rRNA,28S rRNA和50多种蛋白质构成, 在哺乳动物中还含有5.8 S rRNA。
核 蛋 白 体 的 组 装
大肠杆菌核蛋白体
的空间结构为一椭 圆球体,其30S亚 基呈哑铃状,50S 亚基带有三角,中
间凹陷形成空穴, 将30S小亚基抱住, 两亚基的结合面为
蛋白质生物合成的 场所。
核蛋白体的大、小亚基分别有不同的功能:
1.小亚基:可与mRNA、GTP和起动tRNA结 合。
2.大亚基:
64个密码子中有61个编码氨基酸,3个不 编码任何氨基酸而起肽链合成的终止作用,称 为终止密码子,它们是UAG、UAA、UGA, 密码子AUG(编码Met)又称起始密码子。
密码子:mRNA上由三个相邻的核苷酸组 成一个密码子,代表肽链合成中的某种氨基酸 或合成的起始与终止信号。
(1)方向性:从mRNA的5’到3’ (2)连读性:编码一个肽链的所有密码子是一
(2)许多原核mRNA是多顺反子。
转译时,各个基因都有自己的SD序列、起始密码 子、终止密码子,分别控制其合成的起始与终止,也 就是说,每个基因的翻译都是相对独立的。
如E.coli,一个7000bp的mRNA编码5种与Trp合成有关 的酶
(二)、 真核生物mRNA的结构
(1) 真核mRNA5’端具有m7GpppN帽子结构, 无SD序列。
个接着一个地线形排列,密码子之间既不重叠 也不间隔,从起始密码子到终止密码子(不包 括终止子)构成一个完整的读码框架,又称开 放阅读框架(ORF)。
如果在阅读框中插入或删除一个碱基就会 使其后的读码发生移位性错误(称为移码)。
两个基因之间或两个ORF之间可能会互相 部分重叠(共用部分序列)。
(3)简并性 几种密码子编码一种氨基酸的现象称为
第十五章 蛋白质的合成
DNA: ATGCATGCATGC
什么样的碱基序列决定什么 样的氨基酸序列呢?
RNA: AUGCAUGCAUGC
如何实现碱基序列到氨基 酸序列的转变?
PROTEIN: aa1 aa2 aa3 aa4
第一节
ຫໍສະໝຸດ Baidu蛋白质生物合成的理论基础
一、 mRNA
(一)、 原核生物mRNA的结构
(1) 5’端SD序列
密 码 子 的 简 并 性 。 如 GGN ( GGA 、 GGU 、 GGG、GGC)都编码Gly,那么这4种密码子 就称为Gly的简并密码。
只有Met和Trp没有简并密码。
一般情况下密码子的简并性只涉及第三位 碱基。
(4)摇摆性 密码子中第三位碱基与反密码子第一位碱基的配
对有时不一定完全遵循A-U、G-C的原则,Crick把这 种情况称为摇摆性,有人也称摆动配对或不稳定配 对。
密码子的第三位和反密码子的第一位是摇摆位点。
反密码子第一位的G可以与密码子第三位的C、 U配对,U可以与A、G配对,I可以和密码子的U、C、 A配对,这使得该类反密码子的阅读能力更强。
(5)通用性:密码子在不同物种间几乎是 完全通用的。
目前只发现线粒体和叶绿体内有列外 情况,这也是如火如荼的转基因的前提。 但要注意的是不同生物往往偏爱某一种密 码子。
在起始密码子AUG上游9-13个核苷酸处,有一 段可与核糖体16S rRNA配对结合的、富含嘌呤的39个核苷酸的共同序列,一般为AGGA,此序列称SD 序列。
它与核糖体小亚基内16S rRNA的3’端一段富 含嘧啶的序列 GAUCACCUCCUUA-OH互补,使得 结 合 于 30S 亚 基 上 的 起 始 tRNA 能 正 确 地 定 位 于 mRNA的起始密码子AUG。
帽子结构具有增强翻译效率的作用。若 起始AUG与帽子结构间的距离太近(小于12 个核苷酸),就不能有效利用这个AUG,会 从下游适当的AUG起始翻译。当距离在17-80 个核苷酸之间时,离体翻译效率与距离成正比。
(2) 真核生物mRNA通常是单顺反子。
真核mRNA具有“第一AUG规律”,即 当5’端具有数个AUG时,其中只有一个AUG 为主要开放阅读框架的翻译起点。起始AUG 具有二个特点:
反密码的第一个核苷酸与第三核苷酸之
间的配对,并不严格遵循碱基互补原则。 如反密码第一个核苷酸为Ⅰ,则可与A、 U或C配对,如为U,则可与A或G配对, 这种配对称为不稳定配对。
能够识别mRNA中5′端起动密码AUG的 tRNA 是 一 种 特 殊 的 tRNA , 称 为 起 动 tRNA。在原核生物中,起动tRNA是一 种携带甲酰蛋氨酸的tRNA,即tRNAifmet; 而在真核生物中,起动tRNA是一种携带 蛋氨酸的tRNA,即tRNAimet。
三、tRNA
在氨基酸tRNA合成酶催化下,特定的 tRNA可与相应的 氨基酸结合,生成氨 基酸tRNA,从而携带氨基酸参与蛋白质 的生物合成。 tRNA反密码环中部的三个核苷酸构成三 联体,可以识别mRNA上相应的密码, 此三联体就称为反密码(anticoden)。
反密码对密码的识别,通常也是根据碱 基互补原则,即A—U,G—C配对。但
#AUG上游的 -3经常是嘌呤,尤其是A。
#紧跟AUG的 +4常常是G。
起 始 AUG 邻 近 序 列 中 , 以 ANNAUGGN 的频率最高。若-3不是A,则+4必须是G。无 此规律的AUG,则无起始功能。
二、 遗传密码
3个碱基编码1个氨基酸,称为三联体密码 或密码子 (一)、 遗传密码的特点
( 1 ) 具 有 两 个 不 同 的 tRNA 结 合 点 。 A 位 (右)—— 受位或氨酰基位,可与新进入的氨 基酰tRNA结合;P位(左)——给位或肽酰基 位,可与延伸中的肽酰基tRNA结合。
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