His-GFP蛋白的纯化步骤

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以His-GFP为例简述His-tag蛋白的纯化

His-tag是重组蛋白中最常用的融合标签之一。使用镍柱纯化His-tag融合蛋白的原理为:组氨酸的咪唑侧链可亲和结合镍、锌和钴等金属离子,在中性和弱碱性条件下带组氨酸标签的目的蛋白与镍柱结合,在低pH下用咪唑竞争洗脱。实验中一般选用6个组氨酸(His6-tag)的标签。His6标签有许多优点:

(1)由于只有6个氨基酸,分子量很小,对蛋白结构和活性的影响较小,一般不需要酶切去除;

(2)可以在变性条件下纯化蛋白,在高浓度的尿素和胍中仍能保持结合力;

(3)His6标签无免疫原性,重组蛋白可直接用来注射动物,也不影响免疫学分析。

His6标签也有一些不足,如目的蛋白易形成包涵体、难以溶解、稳定性差及错误折叠等。镍柱纯化时金属镍离子容易脱落,混入蛋白溶液,不但会通过氧化破坏目的蛋白的氨基酸侧链,而且柱子也会非特异吸附蛋白质,影响纯化效果。

本实验将以His-GFP(绿色荧光蛋白)为例,阐述His-tag蛋白的纯化过程。

1. E. coli重组菌体破碎

表达完成的E. coli重组菌体,经超声或细胞破碎仪进行破碎。当需要破碎的细胞沉淀较少(<1 g)时,通常在Eppendorf管中,用超声法完成细胞裂解。而当细胞沉淀较多时,可选用细胞破碎仪进行破碎。本实验采用细胞破碎仪法。

细胞破碎仪法:

称量细胞沉淀的湿重,加入细胞湿重10倍体积的裂解缓冲液。如,1 g细胞沉淀加入约10 ml的裂解缓冲液,使得细胞在溶液中的终浓度为10-15%,在此范围内细胞破碎的效果较好。过浓或过稀的细胞浓度均不利于破碎效率。裂解缓冲液的组成如下:

Lysis buffer:20 mM Tris-HCl, pH 7.4

100 mM NaCl

10 mM imidazole

0.1% Triton X-100

1 × protease inhibitor

将细胞沉淀在裂解buffer中充分搅拌至没有结块后,进行高压破碎。

细胞破碎仪的使用方法:首先加水至规定线后,开压缩机,将冷却水制冷至4o C,方可

使用。本过程可能要要持续20 min左右。

待水冷却至4o C后,开始破碎。为保证破碎效果,一般重复三次。破碎完成后,一定要卸压、放水、清洗样品槽。

2.离心

细胞裂解液15000 rpm、4o C离心45 min,去除细胞碎片。离心完成后,得到的上清即细胞裂解液上清用来做进一步的纯化。对于GFP来说,由于折叠好的GFP本身具有颜色,因此可以通过颜色来判断在细胞裂解液上清、沉淀中是否具有GFP。

在本实验中,ml的培养物最终得到了g的细胞沉淀,加入ml的裂解缓冲液,最终得到ml的细胞裂解液上清。

3.His-GFP蛋白的纯化

Ni sepharose 6 FF凝胶的预处理:在直径2.5 cm的层析柱中装入适量的凝胶。本实验中选用2 ml凝胶(CV = 2 ml)。待液体流完后,分别用5 CV H2O和5 CV平衡缓冲液处理凝胶。平衡好的凝胶以待使用。

平衡缓冲液的配制:

20 mM Tris-HCl, pH 7.4

100 mM NaCl

10 mM imidazole

吸附:将平衡好的凝胶加入到细胞裂解液上清中。将此混合物在4o C层析柜的混匀器上混匀30 min。

装柱:将层析柱的下端打开,让未结合的蛋白随液体流出,收集流穿(flow through)。如果GFP完全吸附到柱子上,那么流穿中应该没有颜色,而柱子上应该有较重的黄绿色。流穿中的黄绿色越重,说明蛋白的吸附不理想。这种情况下,需要考虑调整平衡缓冲液的pH、NaCl的浓度、咪唑的浓度;以及吸附时间、细胞裂解液上清:凝胶的体积比等。

洗脱非特异吸附的蛋白:用10 ml的10 mM imidazole(溶解在20 mM Tris-HCl, pH 7.4,500 mM NaCl中)洗脱非特异吸附的蛋白,自然流速洗脱,每1 ml一收集。

目的蛋白的洗脱:分别用10 ml的50 mM、250 mM、500 mM的imidazole(溶解在20 mM Tris-HCl, pH 7.4,100 mM NaCl中)洗脱目的蛋白,自然流速洗脱,每1 ml一收集。

洗脱级分的检测:10% SDS-PAGE检测各洗脱级分。

镍柱的清洗:如果柱子上仍有残留的蛋白或者是脂类等物质未被洗脱下来,可以用2 M NaCl或0.5 M NaOH在自然流速下洗2 cv,然后用5 cv H2O继而5 cv平衡缓冲液冲洗。

镍柱的再生:如果镍柱已使用超过5次,或明显可看到镍柱颜色变浅,或纯化其它蛋白担心引起交叉污染,可对镍柱进行再生,程序如下:

1)5 cv binding buffer

2)5 cv EDTA(in 20 mM Tris-HCl,pH 7.4,500 mM NaCl)

3)5 cv H2O

4)5 cv binding buffer

5)2 cv 0.1 M NiSO4

6)5 cv H2O

7)5 cv binding buffer

此时,柱子再生完毕,可继续使用。

蛋白纯化中应注意的事项:

1.缓冲液的选择:应根据目标蛋白的pI值和pH稳定性等条件来选择。例如,GFP的

等电点是5.67,那么我们估测GFP在pH7.5附近应该为稳定的,因此我们首先尝试pH7.4的Tris-HCl缓冲液。如果实验结果表明该pH条件不稳定,那么我们再考虑换用其它缓冲体系。注意选择缓冲液时应避开蛋白质的等电点,因为蛋白质在其等电点时溶解度最小,容易沉淀,不利于蛋白质的稳定。此外,在进行融合表达时,计算目标蛋白的pI时,应考虑到融合标签的影响。

2.平衡缓冲液中NaCl及imidazole浓度的选择:在平衡缓冲液中加入NaCl及imidazole

均是为了尽可能减少非特异吸附。具体浓度应根据Ni柱说明书及具体蛋白的特性进行调节。

3.吸附时间的选择:对于镍柱而言,一般30 min的吸附时间即已足够。但是对于一

些吸附较差的蛋白,可酌情延长吸附时间。但需要注意的是,吸附时间过长,可能会增加非特异吸附。因此需要在目的蛋白的吸附和非特异吸附之间做出平衡。

4.细胞裂解液上清:凝胶的体积比:可根据Ni柱说明书中的每ml凝胶的蛋白载量进

行适量调节。凝胶过少,则目标蛋白不能完全吸附,从流穿中流出;凝胶过多,则导致洗脱体积变大,以及不必要的非特异吸附。

5.目标蛋白的洗脱:用高浓度的imidazole进行目标蛋白的洗脱时,如果对该蛋白没

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