生物化学 氨基酸

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生物化学氨基酸

生物化学氨基酸

第十章生物化学氨基酸代谢植物、微生物从环境中吸收氨、铵盐、亚硝酸盐、硝酸盐等无机氮,合成各种氨基酸、蛋白质、含氮化合物。

人和动物消化吸收动、植物蛋白质,得到氨基酸,合成蛋白质及含氮物质。

有些微生物能把空气中的N2转变成氨态氮,合成氨基酸。

第一节蛋白质消化、降解及氮平衡一、蛋白质消化吸收哺乳动物的胃、小肠中含有胃蛋白酶、胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、羧肽酶、氨肽酶、弹性蛋白酶。

经上述酶的作用,蛋白质水解成游离氨基酸,在小肠被吸收。

被吸收的氨基酸(与糖、脂一样)一般不能直接排出体外,需经历各种代谢途径。

肠粘膜细胞还可吸收二肽或三肽,吸收作用在小肠的近端较强,因此肽的吸收先于游离氨基酸。

二、蛋白质的降解人及动物体内蛋白质处于不断降解和合成的动态平衡。

成人每天有总体蛋白的1%~2%被降解、更新。

不同蛋白的半寿期差异很大,人血浆蛋白质的t1/2约10天,肝脏的t1/2约1~8天,结缔组织蛋白的t1/2约180天,许多关键性的调节酶的t1/2均很短。

真核细胞中蛋白质的降解有两条途径:一条是不依赖A TP的途径,在溶酶体中进行,主要降解外源蛋白、膜蛋白及长寿命的细胞内蛋白。

另一条是依赖A TP和泛素的途径,在胞质中进行,主要降解异常蛋白和短寿命蛋白,此途径在不含溶酶体的红细胞中尤为重要。

泛素是一种8.5KD(76a.a.残基)的小分子蛋白质,普遍存在于真核细胞内。

一级结构高度保守,酵母与人只相差3个a.a残基,它能与被降解的蛋白质共价结合,使后者活化,然后被蛋白酶降解。

三、氨基酸代谢库食物蛋白中,经消化而被吸收的氨基酸(外源性a.a)与体内组织蛋白降解产生的氨基酸(内源性a.a)混在一起,分布于体内各处,参与代谢,称为氨基酸代谢库。

氨基酸代谢库以游离a.a总量计算。

肌肉中a.a占代谢库的50%以上。

肝脏中a.a占代谢库的10%。

肾中a.a占代谢库的4%。

血浆中a.a占代谢库的1~6%。

肝、肾体积小,它们所含的a.a浓度很高,血浆a.a是体内各组织之间a.a转运的主要形式。

生物化学第3章 氨基酸

生物化学第3章 氨基酸
生物化学 第三章 氨基酸 (amino acid)
一、氨基酸——蛋白质的构件分子
氨基酸(amino acid) :α-氨基酸是一切蛋白质的组成单位。氨基酸是与羧酸 相邻α-碳原子上连有一个氨基,故称α-氨基酸。 利用酸水解、碱水解、酶解可把蛋白质分子水解释放氨基酸。
不变部分(除脯氨酸) 可变部分 L型 α -氨基酸
氨基酸
芳香族氨基酸 Phe、Tyr、Trp 杂环氨基酸 His、Pro
脂肪族氨基酸:一氨基一羧基(中性氨基酸)
甘氨酸
丙氨酸
缬氨酸
亮氨酸
异亮氨酸
脂肪族氨基酸:一氨基一羧基(中性氨基酸):含有羟基
丝氨酸Ser的-OH在生理条件下不解离,但是个极性基团,能与其 他基团形成氢键,常出现在酶的活性中心; 苏氨酸Thr的-OH是仲醇,具有亲水性;
水中心)
极性氨基酸侧链能与水形成氢键,易溶于水 带电荷和极性氨基酸一般位于蛋白表面 蛋白的活性中心:His,Ser,Cys
2.3氨基酸的分类——不常见蛋白质氨基酸
2.4氨基酸的分类——非蛋白质氨基酸
150 多种,不是蛋白质组成,但是有特定生理功能
(1)大多是L型α氨基酸衍生物
(2)有D型氨基酸 (3)还有β-、γ-、δ-氨基酸
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用强酸型阳离子交换树脂分离氨基酸
氨基酸与树脂的亲和力取决于:
气液层析
高效液相层析
蛋白质的水解条件及优缺点
第一章糖课后题 第6题
高碘酸及其盐可以定量的氧 化断裂邻二羟基、α-羟基醛等 的碳碳键,产生相应的羰基 化合物。该反应可以用来区 分糖苷是呋喃还是吡喃型的。 侧翼测定直连多糖的相对分 子量和支链淀粉的非还原末 端残基数,即分支数目。

生物化学第3章 氨基酸分析

生物化学第3章 氨基酸分析
氨基酸首尾脱水聚合成肽键。
180多种天然氨基酸; 20种蛋白质氨基酸
二、氨基酸的分类、性质
各种氨基酸的区别在于侧链R基的不同 20种蛋白质氨基酸按R的极性可分为非极性氨基酸、不带电荷极性氨基酸、 带正电R基氨基酸和带负电R基氨基酸
按R基的结构可分为脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸及杂环氨基酸3大类
脂肪族氨基酸:一氨基一羧基(中性氨基酸):含有硫
Cysteine Methionine (Cys,C) (Met,M)
(1) 两个半胱氨酸的巯基氧化生成二硫键,生成胱氨酸,Cys-S-SCys
(2) 蛋氨酸的甲硫基的硫原子有亲核性,容易发生极化,在生物合成
中是重要的甲基供体
脂肪族氨基酸:一氨基二羧基(酸性氨基酸)
水中心)
极性氨基酸侧链能与水形成氢键,易溶于水 带电荷和极性氨基酸一般位于蛋白表面 蛋白的活性中心:His,Ser,Cys
2.3氨基酸的分类——不常见蛋白质氨基酸
2.4氨基酸的分类——非蛋白质氨基酸
150 多种,不是蛋白质组成,但是有特定生理功能
(1)大多是L型α氨基酸衍生物
(2)有D型氨基酸 (3)还有β-、γ-、δ-氨基酸
四、氨基酸的化学反应
ɑ-氨基参与的反应: 亚硝酸、酰化试剂、烃基、 醛基氧化酶 氨基酸的 化学反应
茚三酮、肽键形成!
ɑ-羧基参与的反应: 成盐、成酯、成酰氯、脱 羧、叠氮
侧链R基参与的反应: 取决于R侧链的官能团
ɑ-氨基参与的反应:
与亚硝酸反应:
通过测定N2的量而计算氨基酸的量,可衡量蛋白质的水解程度 与酰化试剂反应: X=Cl, OH, -OCOR; 可多肽合成中保护氨基;丹磺酰氯可以与肽的N-端氨基 酸反应,生成丹磺酰-肽,水解得到有强烈荧光的丹磺酰-氨基酸,用电泳法 或层析法分析即可得知N-端是何种氨基酸,被广泛用于蛋白质N端测定。 烃基化反应:

生物化学名词解释1

生物化学名词解释1

1.氨基酸:蛋白质的构件分子,有20种标准氨基酸。

丙氨酸、精氨酸、天门冬酰胺、天门冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、蛋氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸、丝氨酸、苏氨酸、色氨酸、酪氨酸、缬氨酸2.脂肪族基团氨基酸:侧链为脂肪烃侧链的氨基酸,包括甘氨酸侧链基团为氢原子、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸。

甘氨酸侧链基团为氢原子,丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸带有饱和脂肪烃链。

脯氨酸有一个环状饱和烃侧链。

3.芳香族基团氨基酸:含有芳香环侧链的氨基酸。

苯丙氨酸有苯基的氨基酸,酪氨酸带有酚基的氨基酸,色氨酸带有双环的吲哚基。

4.含硫基团的氨基酸:侧链含有硫的氨基酸,蛋氨酸侧链上带有一个非极性甲硫醚基,是疏水氨基酸,半胱氨酸侧链上含有一个巯基。

5.含醇基基团氨基酸:侧链含不带电荷的β-羟基的氨基酸。

丝氨酸和苏氨酸具有一级和二级醇的弱的离子化特性。

6.碱性基团的氨基酸:侧链带有含氮碱基基团的氨基酸,在生理pH下带净正电荷。

包括组氨酸、赖氨酸、精氨酸。

组氨酸侧链有一个咪唑环,赖氨酸是一个双氨基酸,精氨酸侧链含有胍基基团。

7.酸性基团的氨基酸:侧链带有羧基的氨基酸,生理pH下带净负电荷。

都含有α-羧基,天冬氨酸还有β-羧基,谷氨酸还有γ-羧基。

8.含酰胺基团的氨基酸:天冬酰胺(α-氨基- β-羧基丙酰胺)和谷氨酰胺(α-氨基- γ-羧基丁酰胺)分别是天冬氨酸和谷氨酸的酰胺化产物,侧链不带电荷,但极性很强,可与水相互作用,因而经常出现在蛋白质表面,可以与其他的极性氨基酸的侧链上的原子形成氢键9.谷胱甘肽:动植物细胞中都含有的一种三肽,即-谷氨酸-半胱氨酸-甘氨酸,谷胱甘肽有还原型和氧化型两种类型,还原型谷胱甘肽在体内主要作用是保护含巯基的蛋白质脑肽:Met-及Leu-脑啡呔,都是五肽,它们在中枢神经系统中形成,是体内自己产生的一类鸦片剂。

Met-脑啡呔的氨基酸序列是:酪氨酸-甘氨酸-甘氨酸-苯丙氨酸-蛋氨酸Leu-脑啡呔的氨基酸序列是:酪氨酸-甘氨酸-甘氨酸-苯丙氨酸-亮氨酸10.肽键:一个氨基酸的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基缩合脱去一分子水形成酰胺键,将两个氨基酸连接在一起,这个酰胺键称为肽键11.肽单位:肽键是一种酰胺键,通常用羧基碳和酰胺氮之间的单键表示,肽键中的酰胺基(-CO-NH-)称为肽基或肽单位12.肽平面:羰基氧原子,酰胺氢原子以及两个相邻的Cα原子构成了一个肽平面。

生物化学-生化知识点_第一章氨基酸与蛋白质

生物化学-生化知识点_第一章氨基酸与蛋白质

第一章氨基酸与蛋白质上册 P1231. 1 氨基酸①①①蛋白质水解最后成为氨基酸混合物酸水解得19种 L-AA,色氨酸破坏。

碱水解得色氨酸,其余氨基酸消旋破坏。

酶水解不消旋破坏,但水解不彻底。

①①①α-氨基酸的一般结构生物体内已发现氨基酸180种,常见氨基酸20种1. 2 氨基酸的分类:常见蛋白质氨基酸,不常见蛋白质氨基酸,非蛋白氨基酸①①①常见蛋白质氨基酸,或称基本氨基酸。

每个氨基酸可用三个字母或单字母简写表示。

按侧链R基不同进行分类。

①1①按R基化学结构分类1.脂肪族氨基酸15个①.中性氨基酸5个甘氨酸 Glycine 氨基乙酸 Gly G 无旋光丙氨酸 Alanine α-氨基丙酸 Ala A缬氨酸 Valine α-氨基-β-甲基丁酸 Val V亮氨酸 Leusine α-氨基-γ-甲基戊酸 Leu L异亮氨酸 Isoleucine α-氨基-β-甲基戊酸 Ile I①.含羟基或硫氨基酸4个丝氨酸 Serine α-氨基-β-羟基丙酸 Ser S苏氨酸 Threonine α-氨基-β-羟基丁酸 Thr T半胱氨酸 Cysteine α-氨基-β-基丙酸 Cys C甲硫氨酸 Methionine α-氨基-γ-甲硫基丁酸 Met M③.酸性氨基酸及其酰胺4个天冬氨酸 Aspartic acid α-氨基丁二酸 Asp D谷氨酸 Glutamic acid α-氨基戊二酸 Glu E天冬酰胺 Asparagine α-氨基丁二酸一酰胺 Asn N谷氨酸胺 Glutamine α-氨基戊二酸一酰胺 Gln Q④. 碱性氨基酸2个赖氨酸 Lysine α,ε-二氨基已酸 Lys K精氨酸 Arginine α-氨基-δ-胍基戊酸 Arg R2.芳香族氨基酸3个苯丙氨酸 Phenylalanine α-氨基-β-苯基丙酸 Phe F酪氨酸 Tyrosine α-氨基-β-对羟苯基丙酸 Tyr Y色氨酸 Tryptophan α-氨基-β-吲哚基丙酸 Trp W3.杂环族氨基酸2个组氨酸 Histidine α-氨基-β-咪唑基丙酸 His H脯氨酸 Proline α-吡咯烷羧酸 Pro P①2①按R基极性性质分类1.非极性R基8个Ala(A) Val(V) Leu(L) Ile(I) Pro(P)Phe(F) Trp(W) Met(M)1。

《生物化学》氨基酸

《生物化学》氨基酸

氨基酸的两性解离:
阳离子
两性离子
阴离子
以甘氨酸为例: pK1= 2.34 pK2 = 9.60
+
H3N-CH2-COOH
[Gly+]
K’1
+H3N-CH2-COO- +[ H+] [ Gly±]
pI = 5.97
[Gly±][H+]
K1’=
[Gly+]
+H3N-CH2-COO- K’2 [Gly±]
苯丙氨酸
Phenylalanine Phe F
— CH 2— CH— COO-
NHN3H+ 3+
酪氨酸
Tyrosine Tyr Y
HO —
— CH 2— CH— COO-
NH3+ NH3+
组氨酸
Histidine His H
HC C — CH 2— CH— COO-
+HN
NH
C H
咪唑基
NH3+
如图所示
H3N+
COOH CH2
(Gly+)
COO-
H3N+ CH (G2 ly±)
COO-
H2N
CH2
(Gly-)
pH 14 12 10 8
[Gly+ ] = [Gly±]
6 4 2 0
0.1
pK1=2.34
0.05
加入的H+ mol数甘Βιβλιοθήκη 氨pK2=9.60


pI=5.97

[Gly ±] = [Gly-]
[Gly±][H+] K1’
= K2’ [Gly±]

生物化学第2章 氨基酸(共77张PPT)

生物化学第2章  氨基酸(共77张PPT)

• Ala Arg Asp
Asn
Cys Glu Gln Gly
His
Ile
Leu
Lys
Met Phe Pro
Ser
Thr
Trp
Tyr
Val
、 20种氨基酸可按其侧链分类
• 氨基酸的侧链可以按照它们的化学结构分为 三类,即:脂肪族氨基酸;芳香族氨基酸; 杂环氨基酸。
1)脂肪族氨基酸(中性)
甘氨酸 Glycine
非极性氨基酸(八种)
不带电何的极性氨基酸(八种)
带负电荷的氨基酸(2种)
带正电荷的氨基酸(2种)
➢第21种基本氨基酸是硒代半胱氨酸(Selenocysteine, Sec) ➢第22种基本氨基酸是吡咯赖氨酸(Pyrrolysine, Pyr) ➢两种罕见基本氨基酸是在特定生物的特定调控条件下生成。
O
H 2N CH C OH
CH 2
SH
C
( α-氨基-β-巯基丙酸 )
两个半胱氨酸氧化可生成胱氨酸
人头发的电子显微镜照片与模型
烫发过程:
1、加还原剂(巯基乙醇) 打开二硫键。
2、加氧化剂(双氧水) 重新生成错位二硫键。
1)、脂肪族氨基酸(含羟基或硫)
丝氨酸 Serine 苏氨酸 Threonine 半胱氨酸 Cysteine 甲硫氨酸 Methionine
O H 2N CH C OH
CH OH CH 3
T
( α-氨基-β-羟基丁酸 )
L-Threonine D-Threonine
L-alloThreonine
D-allo-
Threonine
苏氨酸的光学异构体
1)、脂肪族氨基酸(含羟基或硫)

专业课生物化学第三章 氨基酸

专业课生物化学第三章 氨基酸
是一个很强的亲核基团,与烃化试剂如甲基碘容 易形成锍盐。
此反应可被巯基试剂逆转
6、半胱氨酸侧链上的巯基:
反应性能很高,在微碱性条件下,巯基发生解离形 成硫醇阴离子(-CH2-S-),能与卤化烷例如碘乙酸,碘 乙酰胺,甲基碘等迅速反应,生成相应的稳定烷基衍 生物。
半胱氨酸的巯基能打开乙撑亚胺,即氨丙啶的环.
第3章:氨基酸
第一节:氨基酸的结构与分类
第二节:氨基酸的酸碱化学
第三节:氨基酸的化学性质
第四节:氨基酸的光学活性和光谱性质
第一节(一):氨基酸的结构
一、氨基酸—— 组成蛋白质的基本单位
1、酸水解: 盐酸或硫酸回流煮沸20小时。 不引起消旋作用,得到L-氨基酸。色氨酸完全被破坏;羟基氨 基酸、天冬酰胺、谷胺酰胺部分被破坏。 2、碱水解:氢氧化钠共煮10—20小时。 产物是D型和L型氨基酸的混合物。产生消旋现象。多数氨基酸 遭到破坏。色氨酸稳定。 3、酶水解: 胰蛋白酶、糜蛋白酶、胃蛋白酶水解。 不产生消旋作用,也不破坏氨基酸。水解不彻底。
反应中1分子的半胱氨酸引起1分子的硫硝基苯甲酸的 释放。它在pH8.0时,在412nm波长处有强烈的光吸收, 因此可利用比色法定量测定-SH基。
二硫键的形成和打开 1、二硫键的形成
在痕量的金属离子如Cu2+,Fe2+,C02+和Mn2+ 存在下,巯基在空气中氧化显著提高。这些离子 可能是反应所需的催化剂。
3. 碱性氨基酸(+)
1、非极性R基(中性-非极性氨基酸)
共8种氨基酸,4种带脂肪烃侧链的氨基酸;2种含芳香环 氨基酸;1种含巯基氨基酸和1种甘氨酸。它们在水中的溶 解度比极性氨基酸小。
2、不带电荷的极性R基(中性-极性氨基酸)

考研必背生物化学20种蛋白质氨基酸

考研必背生物化学20种蛋白质氨基酸
Leu
L
5.98
异亮氨酸
(Isoleucine)
α-氨基-β-甲基戊酸
Ile
I
6.02
含羟基或硫氨基酸
丝氨酸
(Serine)
α-氨基-β-羟基丙酸
Ser
S
5.68
苏氨酸
(Threonine)
α-氨基-β-羟基丁酸
Thr
T
6.53
半胱氨酸
(Cysteine)
α-氨基-β-巯基丙酸
Cys
C
5.02
甲硫氨酸/蛋氨酸
考研必背生物化学20种蛋白质氨基酸
分类
氨基酸名称
化学名称
三字符号
单字符号
化学结构
等电点
脂肪族氨基酸
中性氨基酸
甘氨酸
(Glycine)
α-氨基乙酸
Gly
G
5.97
丙氨酸
(Alanine)
α-氨基丙酸
Ala
A
6.02
缬氨酸
(Valine)
α-氨基-β-甲基丁酸
Val
V
5.97
亮氨酸
(Leucine)
α-氨基-γ-甲基戊酸
(Methionine)
α-氨基-γ-甲硫基丁酸
Met
M
5.75
酸性氨基酸及其酰胺
天冬氨酸
(Aspartic acid)
α-氨基丁二酸
Asp
D
2.97
谷氨酸
(Glutamic acid)
α-氨基戊二酸
Glu
E
3.22
天冬酰胺
(Asparagine)
Asn
N
5.41
谷氨酰胺

生物化学 第三章 氨基酸(共92张PPT)

生物化学 第三章 氨基酸(共92张PPT)
Tyrosine
色氨酸
Trytophan
氨基酸的结构
芳香族氨基酸
H 2N
O
CH
C
OH
CH 2 CH 2 CH 2 NH
C
NH
NH 2
氨基酸的结构
精氨酸 Arginine
碱性氨基酸
O H 2 N CH C OH
CH 2 CH 2 CH 2 CH 2 NH 2
氨基酸的结构
精氨酸 Arginine
赖氨酸 Lysine
光性。而且发现主要是L型的(也有D型的,但很少)。
-氨基酸的分子构型
1、氨基酸的分类
各种氨基酸的区别在于侧链R基的不同。
20种蛋白质氨基酸按R的极性可分为非极性氨基酸 、极性性氨基酸、酸性氨基酸和碱性氨基酸;按R基的结 构可分为脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸及杂环氨基酸3大 类。
氨基酸的三字母简写符号必背熟,单字母符号 要求认识。
芳香族氨基酸: Phe Trp Tyr
1、氨基酸的分类
组成蛋白质的氨基酸按其α-碳原子上侧链R的结构
2缬.氨酸-羧分基V参a为l与ine的反2应0种,20种氨基酸按R的结构和极性的不同有以下
生成烷基咪唑衍生物,并引起酶活性的降低或丧失
两种分类方法。 酪氨酸 tyrosine
Try Y
提问:大 多 数 氨 基 酸 在 中 性(pH=7) 时, 带
[质子供体]
乙酸
+ H
COOH
-
COO
+ H
CO-O
+ K1
H3N CH2
+
H3N CH2
K2
H2N CH2
Gl+y
Gl+-y

生物化学第八章氨基酸代谢

生物化学第八章氨基酸代谢

碱性氨基酸转运蛋白
七种转运蛋白 (transporter) 亚氨基酸转运蛋白 β氨基酸转运蛋白 二肽转运蛋白 三肽转运蛋白
目录
γ-谷氨酰基循环对氨基酸的转运作用 γ-谷氨酰基循环(γ-glutamyl cycle) : • 谷胱甘肽对氨基酸的转运 • 谷胱甘肽再合成
目录
细胞外
细胞膜
细胞液
COOH CHNH2 CH2 CH2 C NH
依赖ATP和泛素; 降解异常蛋白和短寿蛋白质。
目录

泛素(Ub)
76个氨基酸组成的多肽(8.5kD)
普遍存在于真核生物而得名
一级结构高度保守
目录

泛素介导的蛋白质降解过程
靶蛋白的泛素化:泛素与选择性被降解蛋白质 形成共价连接,并使其激活,包括三种酶参与 的3步反应,并消耗ATP。 泛素化蛋白质在蛋白酶体(proteasome)中降解。
要途径。
通过此种方式并未产生游离的氨。
目录
(二)氧化脱氨基作用
• 氧化脱氨基包括脱氢和水解两步反应。其 中,脱氢反应需酶催化,而水解反应则不 需酶的催化。
2H H2O R-C-COOH NH R-C-COOH + NH3 O

R-CH-COOH NH2
目录
催化氧化脱氨基的酶
1. L-氨基酸氧化酶:
目录
2.氨的生成 未被吸收的氨基酸
脱氨基作用

渗入肠道的尿素
尿素酶
目录
临床上用酸性灌肠降低肠道pH,NH3 转 变为NH4+以铵盐形式排出,可减少氨的吸 收,防止血氨升高。
目录
3. 其它有害物质的生成
酪氨酸 半胱氨酸 苯酚 硫化氢 吲哚

生物化学 第三章 氨基酸

生物化学 第三章 氨基酸
COOH H3N
+
C H R
-H pK1' +H
+
+
COO H3N
+
-
C H R
-H pK2' +H
+
+
COO R
-
H2N C H
PH 1 净电荷 +1 正离子
7 0 两性离子 等电点PI 等电点
10 -1 负离子
( ) 与 亚 硝 酸 反 应
四. 氨基酸的化学反应
1.α-氨基参与的反应 氨基参与的反应
异亮氨酸 Ileucine 脯氨酸 Proline
甲硫氨酸 Methionine 半胱氨酸 Cysteine
氨基酸的结构
芳香族氨基酸
苯丙氨酸 Phenylalanine
H 2N CH 2 O CH C OH
氨基酸的结构
芳香族氨基酸
苯丙氨酸 Phenylalanine 酪氨酸 Tyrosine
H 2N CH CH
天冬氨酸 Aspartic acid
酸性氨基酸
O H2N CH C CH2 C OH O OH
氨基酸的结构
天冬氨酸 Aspartic acid 谷氨酸 Glutamic acid
H2N
酸性氨基酸
O CH C CH2 CH2 C OH O OH
氨基酸的结构
丝氨酸 Serine
含羟基氨基酸 含羟基氨基酸
一. 氨基酸—蛋白质的构件分子 蛋白质的水解作用提供了关于 蛋白质的水解——蛋白质的水解作用提供了关于
α-氨基酸的一般结构— 氨基酸的一般结构—
20种氨基酸除脯氨酸外,其他均具如下结构通式。 20种氨基酸除脯氨酸外,其他均具如下结构通式。 种氨基酸除脯氨酸外

生物化学名词解释

生物化学名词解释

生物化学名词解释1.氨基酸(amino acid):是含有一个碱性氨基(-NH2)和一个酸性羧基(-COOH)的有机化合物,氨基一般连在α-碳上。

氨基酸是蛋白质的构件分子。

2.必需氨基酸(essential amino acid):指人(或其它脊椎动物)自己不能合成,需要从食物中获得的氨基酸。

3.非必需氨基酸(nonessential amino acid):指人(或其它脊椎动物)自己能由简单的前体合成,不需要从食物中获得的氨基酸。

4.等电点(pI,isoelectric point):使氨基酸处于兼性离子状态,在电场中不迁移(分子的静电荷为零)的pH值。

5.茚三酮反应(ninhydrin reaction):在加热条件下,氨基酸或肽与茚三酮反应生成紫色(与脯氨酸及羟脯氨酸反应生成黄色)化合物的反应。

6.层析(chromatography):按照在移动相和固定相(可以是气体或液体)之间的分配比例将混合成分分开的技术。

7.离子交换层析(ion-exchange column):一种用离子交换树脂作支持剂的层析技术。

8.透析(dialysis):利用蛋白质分子不能通过半透膜的性质,使蛋白质和其他小分子物质如无机盐、单糖等分开的一种分离纯化技术。

9.凝胶过滤层析(gel filtration chromatography,GPC):也叫做分子排阻层析/凝胶渗透层析。

一种利用带孔凝胶珠作基质,按照分子大小分离蛋白质或其它分子混合物的层析技术。

10.亲合层析(affinity chromatograph):利用共价连接有特异配体的层析介质,分离蛋白质混合物中能特异结合配体的目的蛋白质或其它分子的层析技术。

11.高压液相层析(HPLC):使用颗粒极细的介质,在高压下分离蛋白质或其他分子混合物的层析技术。

12.凝胶电泳(gel electrophoresis):以凝胶为介质,在电场作用下分离蛋白质或核酸的分离纯化技术。

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氨基酸的化学反应
烃基化反应
CH2 CH2 Cl S: R1
Cl CH2 CH2 S+
R2 H2N CH COO-
R1
R1SCH2NHCH(R2)COO-
用途:是鉴定多肽N-端氨基酸的重要方法。
氨基酸的化学反应
生成西佛碱的反应
COOH
CH2OPO3-
HOCH2CHNH2 + O C
+ H+
CH2OH
•酶水解
– 优点:不产生消旋,不破坏氨基酸
– 缺点:水解时间长,单一酶水解不完全
氨基酸概述
蛋白质一般结构
• 构成蛋白质的氨基酸有20种 • 均为α-氨基酸(脯氨酸例外) • 共同结构为在同一碳原子上
有羧基、氨基与氢
• 不同点为侧链R不同
赖氨酸
脯氨酸 (亚氨基酸)
氨基酸分类
非极性,脂肪族侧链氨基酸
➢氨基酸使水的介电常数增高,一般有机物如乙 醇、丙酮等使水的介电常数降低
结论
➢氨基酸主要是以两性离子形式存在
两性解离
pH1 净电荷+1
甘氨酸的解离
pH7 净电荷 0
pH13 净电荷-1
阳离子
两性离子
阴离子
等电点
等电点

(等电pH,pI)


➢ 两性电解质净电荷为零
时溶液的pH

➢ 等电点时,两性电解质
H2N
R1 O CC
R2 N C COOH
H
HH
H
HH
肽键
用途:氨基酸形成多肽的反应。
氨基酸的化学反应
与茚三酮的反应
O
O
茚三酮
C CO
H2O
C
H2O
C C
OH
水合茚三酮
C OH
O O
O O
C OH
C C
+ OH
H2N
O
CHCOOH R
O
O
C C
H
+ RCHO + NH2 + CO2
C OH
O O-NH4+O

在电场中不移动

➢ 侧链不含解离基团的中

性氨基酸,其等电点是
线
它的pK1和pK2的算术
平均值pI=(pK1+pK2)/2
等电点
• 对于侧链含有可解离基
团 的 氨 基 酸 , 其 pI 值 也 决定于两性离子两边的 pK值的算术平均值。
• 酸性氨基酸
pI = (pK1 + pKR-COO- )/2
透射光 I
光源
单色透镜
样品
检测器
混合物层析分离技术
溶液
(动相) 蛋白质

样品 多孔固体

(固相)


固相隔膜
渗出液
蛋白质
混合物ABC在 液相和固相 中分配系数 不同
因此ABC随着 液相的流动 而被分层
分段收集渗 出液实现ABC 的最终分离
混合物层析分离技术
带有负电 荷的固相 聚合物球
蛋白质混合物加 入到交换柱上并 与阳离子交换
大的正电荷分子 小的正电荷分子 小的负电荷分子 大的负电荷分子
离子交换层析
蛋白质按照在相应pH条 件下所带电荷的不同而 以不同的速率向下移动
带有更多负电荷的蛋白 质以更快的速率被洗脱
分段收集渗出液,实现蛋 白质的分离
混合物层析分离技术
微孔凝胶 颗粒(球)
蛋白质混合物加 入到交换柱上并 与凝胶交联
氨基酸的两性电离
pH1 净电荷+1
甘氨酸的解离
pH7 净电荷 0
pH13 净电荷-1
阳离子
两性离子
阴离子
氨基酸的等电点
等电点

(等电pH,pI)


➢ 两性电解质净电荷为零
时溶液的pH

➢ 等电点时,两性电解质

在电场中不移动

➢ 氨基酸的等电点值pI,

是两性离子两边的pK
线
值的算术平均值
pI=(pK1+pK2)/2
赖氨酸
脯氨酸 (亚氨基酸)
20种编码氨基酸
• 构成蛋白质的20
种氨基酸
–Gly 甘氨酸 –Ala 丙氨酸 –Val 缬氨酸 –Leu 亮氨酸 –Met 蛋氨酸 –Ile 异亮氨酸 –Ser 丝氨酸 –Thr 苏氨酸 –Cys 半胱氨酸 –Pro 脯氨酸 –Asn 天冬酰胺 –Gln 谷氨酰胺 –Phe 苯丙氨酸 –Tyr 酪氨酸 –Trp 色氨酸 –Lys 赖氨酸 –Arg 精氨酸 –His 组氨酸 –Asp 天冬氨酸 –Glu 谷氨酸
酪氨酸
氨基酸分类
极性,非电离侧链氨基酸
丝氨酸
苏氨酸
半胱氨酸
• 侧链亲水 • 脯氨酸之侧链
应为非极性
• 缩写符号
–丝Ser –苏Thr –半胱Cys –脯Pro –天冬酰胺Asn –谷氨酰胺Gln
脯氨酸
天冬酰胺 谷氨酰胺
氨基酸分类
碱性电离侧链氨基酸
赖氨酸
精氨酸
组氨酸
• 侧链亲水 • 侧链碱性基团 • 缩写符号
凝胶层析
凝胶一般由葡 聚糖制成,含有 很多微孔
小分子蛋白质 进入微孔内,因 而滞流时间长
大分子蛋白质 不能进入微孔 而径直流出
混合物层析分离技术
蛋白质混合物
亲合 蛋白 配体
配体 吸附 微球
配体 溶液
蛋白质混 合物加入 到含特定 配体的柱
上 不能与配 体吸附的 蛋白质流 出 吸附的蛋白质 被配体交换洗
氨基酸的化学反应
与亚硝酸的反应
NH2 R-CH-COOH + HNO2
OH R-CH-COOH + N2 + H2O
用途:范斯来克法定量测定氨基酸的基本反应。
酰化反应
O
R2
R1 C X + H2N CH COO-
X=-Cl, OH,-OCOR
OH-
O
R2
R1 C HN CH COO-
用途:用于保护氨基以及肽链的氨基端测定等。
COOH HOCH2CH N+
H
CH2OPO32 -
C
+ H2O
CH2OH
用途:是多种酶促反应的中间过程。
氨基酸的化学反应
脱氨基反应
NH3+ R CH COO-
O R CH COO- + NH4+
NH3+ CH COO-
CH3 +C O
CH2CH2COO-
COO-
O C COO- + CH2CH2COO-
• 硷性氨基酸
pI = (pK2 + pKR-NH2 )/2
组氨酸的两性离子
两边的pK值的平均值
pI=(6.0+9.17)/2 =7.59
氨基酸的甲醛滴定
COOCH2
pK'2
COOH+ + CH2
HCHO
COOCH2
COOHCHO
CH2
NH3+
NH2
NHCH2OH
N (CH2OH)2
用途:可以的一个重要反应。
氨基酸的化学反应
叠氮反应
NHPG R CHCOOCH3
NH2NH2
NHPG
HNO3
R CHCOONHNH2
NHPG R CHCON3
CH3OH
H2O,N2
用途:氨基酸叠氮化合物常用于肽的人工合成。
成肽反应
H2N
R1 O CC
OH
+
HN
R2 C
COOH
- H2O

亲合层析
利用蛋白质分子对 其配体分子特有的 识别能力(生物学亲 合力)分离蛋白质的 方法
能与配体结合的蛋 白质被最后洗出
不能结合的蛋白质 更快地被洗出
氨基酸的一般结构
• 构成蛋白质的氨基酸有20种 • 均为α-氨基酸(脯氨酸例外) • 共同结构为在同一碳原子上
有羧基、氨基与氢
• 不同点为侧链R不同
氨基酸分类
半胱氨酸
半胱氨酸
胱氨酸
• 构成蛋白质的编码氨基酸为20种 • 编码氨基酸经过化学修饰产生非编码氨基酸,例如5-羟赖氨酸、磷酸丝
氨酸、磷酸精氨酸
• 除蛋白质中的氨基酸外,迄今发现了150余种非蛋白质氨基酸,例如
鸟氨酸、瓜氨酸、γ-氨基丁酸,这些非蛋白质氨基酸有些是代谢中间 产物,有些是结构成分等
• 碱性氨基酸
pI = (pK2 + pKR-NH2 )/2
谷氨酸的两性离子
两边的pK值的平均值
pI=(2.19+4.25)/2 =3.22
等电点
• 对于侧链含有可解离基
团 的 氨 基 酸 , 其 pI 值 也 决定于两性离子两边的 pK值的算术平均值。
• 酸性氨基酸
pI = (pK1 + pKR-COO- )/2
C
HO C
C C
O + 2NH3 + H
C C
C
C
CN C
C
C
+ 2H2O
O
O
OO
紫色复合物
用途:用于氨基酸的定性定量分析。
氨基酸的紫外吸收
含有共轭双键的化合物有吸收紫外光的特性 最大吸收峰
✓苯丙氨酸 257nm ✓色氨酸 280nm ✓酪氨酸 275nm 分光光度计测定有色物质浓度原理
入射光 I0
–赖Lys –精Arg –组His
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