现代微生物遗传学第三章质粒详解演示文稿

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现代微生物遗传学-第三单元授课-课件

现代微生物遗传学-第三单元授课-课件
在DNA复制过程中,由 于DNA聚合酶的错误, 导致碱基对的增添、缺
失或替换。
化学诱变
物理诱变
生物诱变
某些化学物质可以引起 碱基对的替换,导致基
因突变。
某些物理因素如紫外线、 X射线等可以引起基因突
变。
某些病毒或细菌可以引 起基因突变。
基因重组过程
01
02
03
同源重组
指两个同源DNA分子之间 的重组,涉及到DNA的断 裂、交换和修复。
基因突变
基因突变产生遗传变异,为微生物提供进化基础。
3
基因重组
微生物通过基Βιβλιοθήκη 重组,交换遗传物质,加速进化 过程。
系统发育分析方法
分子生物学方法
01
利用分子生物学技术,如DNA测序和基因组学分析,研究微生
物的系统发育关系。
形态学特征
02
通过比较微生物的形态学特征,如细胞形态、染色特性等,进
行系统发育分析。
级联调节
通过一系列的级联反应,使基因 表达得到精细调控。
基因表达调控应用
疾病治疗
通过调控特定基因的表达,治疗遗传性疾病和癌 症等疾病。
生物工程
通过调控微生物的基因表达,改良微生物生产性 能,生产药物和生物燃料等。
生物进化研究
通过研究基因表达的调控机制,揭示生物进化的 奥秘。
04
微生物进化与系统发育
生物地理学方法
03
利用生物地理学方法,研究微生物在全球范围内的分布和演化
历程。
系统发育研究意义
揭示生命起源与演化
系统发育研究有助于揭示生命起源与演化的历程,理解生物多样 性的形成机制。
疾病防控与治疗
通过系统发育分析,有助于发现病原微生物的演化规律,为疾病 防控和治疗提供科学依据。

三质粒与载体ppt课件

三质粒与载体ppt课件

Transcription beyond oriV Hybridisation at/near oriV
-445 - 555
RNAaseH cleaves at oriV 2/3 bp accuracy
-445
ONLY 580 bps needed and ONLY 13 after oriV
火灾袭来时要迅速疏散逃生,不可蜂 拥而出 或留恋 财物, 要当机 立断, 披上浸 湿的衣 服或裹 上湿毛 毯、湿 被褥勇 敢地冲 出去
分子量小的(如ColE1质粒)拷贝数高,每个细胞中有10~100个 拷贝的质粒,说明它们的复制不受到严格控制,称为松弛型 质粒(relaxed plasmids)或高拷贝质粒。基因工程中为获得大 量的基因产物所用的载体质粒便是这类松弛型质粒。
火灾袭来时要迅速疏散逃生,不可蜂 拥而出 或留恋 财物, 要当机 立断, 披上浸 湿的衣 服或裹 上湿毛 毯、湿 被褥勇 敢地冲 出去
火灾袭来时要迅速疏散逃生,不可蜂 拥而出 或留恋 财物, 要当机 立断, 披上浸 湿的衣 服或裹 上湿毛 毯、湿 被褥勇 敢地冲 出去
( P202)
质粒的主要类型
质粒所编码 的功能和赋 予宿主的表 型效应
致育因子(Fertility factor,F因子) 抗性因子(Resistance factor,R因子) 产细菌素的质粒(Bacteriocin production plasmid) 毒性质粒(virulence plasmid) 代谢质粒(Metabolic plasmid) 隐秘质粒(cryptic plasmid)
质粒编码的两个负调控因子Rop蛋白质和反义RNA (RNAⅠ) ,控制了DNA复制过程中所必需的引物 的合成。
在ColE1复制原点上游方向445 bp处(相当于RNAⅡ 的第111个碱基的位置)处起始转录另一个RNA分子, 其转录方向与RNAⅡ相反,它是由双链DNA链上的 另一条链(C-链)为模板进行转录的,这个RNA分子称 为RNA I,属于反义RNA。

《质粒和噬菌体》课件

《质粒和噬菌体》课件
根据质粒的复制子可分为滚环复制型质粒和复制环复制型质粒。
根据质粒的用途可分为抗生素抗性基因质粒、代谢缺陷型质粒、温度敏感型质粒等 。
02
质粒的复制和传播
质粒的复制
自主复制
质粒能够独立于宿主染色体进行复制,并保持稳定的遗传特性。
复制起点
质粒复制起始于特定的DNA序列,称为复制起点或Ori。
复制酶
质粒复制需要特定的复制酶,这些酶能够识别并催化Ori序列,启动DNA复制。
自我复制
噬菌体在宿主细胞内复制 增殖,最终导致宿主细胞 裂解,释放出子代噬菌体 。
无独立生活能力
噬菌体没有独立的代谢和 能量转化能力,只能在宿 主细胞内才能进行正常的 生命活动。
噬菌体的种类
根据基因组的不同,噬菌体可以分为 DNA噬菌体和RNA噬菌体两大类。
根据形态的不同,噬菌体可以分为蝌 蚪形、微球形、丝形、棒形等不同类 型。
生物信息学研究
质粒和噬菌体的基因序列 可用于生物信息学分析, 研究基因组学、进化关系 等生物学问题。
THANKS
感谢观看
质粒复制和传播的机制
复制与传播的关联
质粒复制和传播机制密切相关, 复制酶在复制过程中也参与质粒
的传播。
接合作用
在转化过程中,质粒DNA通过细 菌的膜通道进入受体细胞,与受体 细胞染色体整合或独立复制。
重组与整合
在转导过程中,质粒DNA与噬菌体 DNA发生重组,通过噬菌体的感染 和整合酶的作用,将质粒DNA整合 到受体细胞染色体中。
04
噬菌体的复制和生命周期
噬菌体的复制周期
侵入
噬菌体通过融合、出芽或注入 等方式将遗传物质注入宿主细 胞内。
组装
新的噬菌体DNA与蛋白质外壳 结合,形成完整的噬菌体粒子 。

质粒种类与应用-PPT精品文档139页

质粒种类与应用-PPT精品文档139页

质粒的基本特征
质粒
质粒的不相容性:分子机制 两种含有不同复制子结构的不同质粒,在复制时各受自己的 拷贝数控制系统的调节,致使两种质粒的最终拷贝数恒定, 因此在经过若干复制周期和细胞分裂周期后仍能共处于同一 细胞内 两种含有相似复制子结构的不同质粒,在复制时受到同一种 拷贝数控制系统的干扰,致使两种质粒的最终拷贝数不同, 其中拷贝数多的质粒在以后的细胞分裂周期中更具优势
克隆载体
基因载体是一类能自我复制的DNA分子,其中的一段 DNA被切除而不影响其复制,可用以置换或插入外源(目 的) DNA而将目的DNA带入宿主细胞。
常用的载体有质粒、噬菌体、病毒等
基因工程载体的构建必需应用表达调控 的基本理论知识,应用已知的调控序列进行 重组、改造。
基因载体应具备的条件:
Cop
Rep
Pcop
cop
P/Orep
rep
ori
质粒
质粒的基本特征
质粒的不相容性
任何两种含有相似复制子结构的不同质粒,不能同时存在于 一个细胞中,这种现象称为质粒的不相容性,不相容性的质 粒组成不相容性群 以大肠杆菌的质粒为例:
ColE1、pMB1 拥有相似的复制子结构,彼此不相容 pSC101、F、RP4 拥有相似的复制子结构,彼此不相容 p15A及其衍生质粒拥有相似的复制子结构,彼此不相容
E c o R I S a c I K p n I S m a I B a m H I X b a I S a lI P stI S p h I H in d I II
pU C 19
LacZ
Apr
(2.68kb)
Ori
三个显著特点:
(1)分子量更小,仅为2.7KB,容纳外源DNA量增大;具有更 高的拷贝数(每个细胞含500-700个拷贝)。 (2)含易于检测是否有外源DNA插入的标记基因LacZα,可利 用-互补原理进行蓝白筛选。 (3)多克隆位点区(MCS)由人工合成的多个单一酶切位点构 成。

微生物遗传学 第三章PPT课件

微生物遗传学 第三章PPT课件
❖ 功能等位性: 对于基因等位性的判断不来自基因位置的测定,而 来自基因功能的测定,这种等位性称为功能等位性。
❖ 互补测验的基本要求: 1. 能使2个突变型的基因同处1个细胞,形成二倍体
获局部合子。 2. 同处1个细胞的2个突变型的基因不可以重组。
可用于互补测验的系统
1. 沙门氏菌的流产转导 2. HFT中的杂基因子: gal - / dgal – 3. F’ 转导: lac - / F-lac 4. 异核体 5. 噬菌体的共感染
形成机制证明
二、T4噬菌体的基因重组
S.Benzer 对T4噬菌体的rIIA和 rIIB2个基因进行了 结构分析,证明1个基因内有大量的突变子和重组 子。遗传重组可以发生在基因内部。
S.Benzer实验:
E.Coli B
Wild type T4 +
T4rII
+
E.coli K + -
❖ S.Benzer 巧妙的利用野生型和突变型T4对 寄主的要求不同,设计了实验:
❖ 所有的反转录病毒RNA基因组和mRNA都具有相同 的5’端。在5’端形成cap结构:m7GpppGmp 。
❖ 初级转录本在3’端的R序列中含有加尾信号: AAUAAA,在3’端生成poly(A) 尾巴。
❖ 加工后的RNA转移到细胞质中,一些作为基因组 RNA,一些作为mRNA,翻译产生病毒所需的蛋白 质。
可以持续的表达。 ❖ LTR不但提供了整合所需的末端序列,而且也提供
了转录及转录后加工的信号。 ❖ 图3-30 ❖ 由原病毒DNA转录的RNA既可以作为mRNA进一步
合成病毒的蛋白质,也可以作为子代病毒的RNA基 因组。
2 转录后加工
❖ 反转录病毒RNA基因组以及大多数病毒mRNA并非 一次合成的,而是经由1个初级转录本加工而成。

优选现代微生物遗传学第三章质粒

优选现代微生物遗传学第三章质粒
中被淘汰
– 选择性抑制带有质粒的菌的生长。
– 2.原生质体消除法
• 使待消除质粒的菌株在一定条件下形成原生质体, 在再生后生长的菌株中可出现高频率质粒消除菌。
• 二、遗传转移
– 将质粒导入已经消除了该质粒的原宿主细胞,比较 导入前后表型性状的差异或恢复程度。
• 三、分子杂交
– 在初步确定某菌株可能含有质粒的情况下,利用已 知表型性状的基因片段作探针进行分子杂交,来检 测其菌株是否含有该种质粒。
第二节 质粒编码的遗传表型
• 大多数质粒均控制着宿主细胞的一种或几种特殊性状, 具有一定的表型,质粒可依据其表型不同可划分为以 下几类: – 1.致育质粒 – 2.抗药性质粒 • 组成:转移区和抗性决定子 • 抗药的机制:改变抗生素作用的靶点;修饰抗生 素;组织抗生素进入;产生一种酶能代替宿主细 胞中被抗生素作用的靶点。
• 二、质粒的复制
– 1.质粒复制的方式(P120)
• 质粒的复制起点称 为oriV,大肠杆菌为 oriC。
• 复制主要通过型复
制和滚环复制之一
进行。其中以型复
制为主(包括单向 和双向)。
• 质粒只编码一种或 少数几种与复制有 关的蛋白质,其他 复制蛋白都来自宿 主。
– 2.复制起点区oriV的 功能和pBR322质粒 • 复制起点区oriV 功能与质粒载体 的构建、寄主范 围
– 3.产生抗生素的质粒
• 细菌素:细菌产生的一般只能抑制或杀死种内不同 亚种或菌株中敏感细菌的特殊多肽类代谢产物。
• Col质粒:10种,有非接合型和接合型之分。 – 4.产生毒性的质粒(BT) – 5.降解质粒:
• 假单胞菌属是一类能广泛利用有机化合物进行生长 的细菌。其体内含有大量的降解质粒。

现代微生物遗传学-第三章质粒课件

现代微生物遗传学-第三章质粒课件

质粒在生物能源开发中的应用
要点一
总结词
要点二
详细描述
质粒在生物能源开发中具有重要作用,可以用于构建高效 生物燃料生产菌株。
质粒可以携带与生物燃料生产相关的基因,将其转移至微 生物中,从而构建出能够高效生产生物燃料的菌株。例如 ,可以利用质粒将油脂合成酶基因转移至酵母菌中,构建 出能够高效生产生物柴油的菌株。此外,质粒还可以用于 提高微生物对光能的利用率,从而构建出能够高效生产太 阳能的微生物。因此,质粒在生物能源开发中具有重要作 用。
详细描述
20世纪60年代,科学家们开始对质粒进行更深入的研究,探索其复制机制和遗传特性。他们发现质粒可以在细菌 细胞内独立于染色体复制,并且可以在不同细菌之间转移和遗传。这些发现为后来的基因工程和分子生物学研究 奠定了基础。
质粒的遗传学研究
总结词
质粒的遗传学研究涉及到多个方面,包括质粒的复制、转录、表达以及质粒与宿主细胞 的相互关系等。
代谢能力
质粒携带的基因可以影响细菌的 代谢能力,帮助细菌在特定环境 下生存和繁殖。
质粒与细菌的进化
基因水平转移
质粒是细菌间基因水平转移的主要载体,有 助于细菌获得新的遗传物质和进化。
协同进化
质粒上的基因与其他细菌基因协同进化,形成复杂 的基因网络,影响细菌的进化方向。
适应性进化
质粒携带的基因可以促进细菌的适应性进化 ,使其更好地适应不断变化的环境。
终止子的作用
终止子是一个特殊的DNA序列,它能够终止复制子的复 制,确保质粒的复制不会无限进行下去。
质粒的复制
复制的起始
复制的调控
质粒的复制起始于复制起始位点,该 位点通常是一个特定的DNA序列,能 够被质粒编码的复制蛋白识别并与之 结合。

质粒载体的概况及构建PPT课件

质粒载体的概况及构建PPT课件

典型的质粒克隆技术:
① 用限制性内切酶消化DNA样品 ② 用限制性内切酶消化质粒DNA ③ 连接样品DNA和质粒DNA的消化产物 ④ 用连接产物转化大肠杆菌感受态细胞 ⑤ 涂布在琼脂平板上进行耐抗菌素筛选
④ 用连接产物转化大肠杆菌感受态细胞时转化细菌 有两个基本方法:
一是化学法,即用CaCl₂处理并加热激以促进DNA进入 菌体;
You Know, The More Powerful You Will Be
结束语
当你尽了自己的最大努力时,失败也是伟大的, 所以不要放弃,坚持就是正确的。
When You Do Your Best, Failure Is Great, So Don'T Give Up, Stick To The End 演讲人:XXXXXX 时 间:XX年XX月XX日
★ 质粒不是细菌生长所必须的 ★ 可赋予细菌抵御外界因素不利影响的能力 ★ 分子量在1~200kb之间
质粒(plasmid)
特点: 能在宿主细胞内独立复制;带有某些遗传信息,会赋予
宿主细胞一些遗传性状。
(二)质粒的基本特性
(1) 自主复制性 质粒DNA携带有自己的复制起始区(ori) 控制质粒拷贝数的基因 能独立于宿主细胞的染色体DNA而自主复制
质粒载体的概况及制备
质粒载体的概况
1 质粒的定义、命名 2 质粒的基本特性 3 质粒的分类
质粒的定义、命名(:一) 质粒的定义、命名
• 定义:质粒(plasmid)是细菌或细胞染色质以外的,能 自主复制的,与细菌或细胞共生的遗传成分。
• 命名:小写字母p代表质粒,两个大写字母代表发明者,后 面接实验编号。
二是电激法,即施加短脉冲的电荷以促进DNA吸收。

质粒plasmPPT课件

质粒plasmPPT课件

质粒DNA的复制过程
RNAⅠ是复制的负调节物 RNAⅠ可以通过同RNAⅡ结合, 以阻止其与模板DNA发生杂交作用。
➢colE1复制子不能影响质粒复制所必需的宿主酶的活性, 因此,一旦DNA合成启动后,便不能改变其速度或进程。 故而拷贝数的控制必须在DNA复制启动时或启动前进行。
➢质粒DNA的合成依赖于复制起点处稳定的DNA-RNA II 杂交体的形成。正常情况下,复制的起始是由正确折叠与 不当折叠的RNA II间相互转化的平衡来控制的,前者可形 成稳定的杂交体,后者则不能。
质粒对宿主细胞是非必需的,但在某些条件下,质粒能赋予 宿主细胞以特殊的机能,从而使宿主得到生长的优势。
如抗药性质粒和降解性质粒就能使宿主细胞在有相应药物或 化学毒物的环境中生存。
质粒也像染色体一样携带编码多种遗传性状的基因,并授予 宿主细胞一定的遗传特性,许多与医学、农业、工业和环境 密切相关的重要细菌的特殊特征便是由质粒编码的,如植物 结瘤、固氮、对有机物的代谢等。
1)ColE1质粒的复制调控
ColE1为6.6kb的小质粒,拷贝数10~20。其复制 不需任何质粒编码的蛋白质,而是完全依赖于宿主提 供的寿命较长的酶和蛋白质,包括分子伴侣、DNA聚 合酶I和Ⅲ, DNA依赖的RNA聚合酶、核糖核酸酶H (RNase H), DNA促旋酶和拓扑异构酶I。
ColE1质粒DNA的复制,是从一个特定的复制起点 oriV开始,并单向进行。控制此种质粒DNA复制启动的 两种关键因素RNAI和RNAⅡ,以及另一种负调控因子 Rop蛋白,都是由ColE1 DNA转录产生的。
相反,RP4、RK2和RSFl010及从G+细菌中分离的滚环复制 的质粒都属于广寄主范围(broad host range)质粒。广寄主范 围的质粒一般能编码与复制起始有关的所有蛋白,这样就不 依赖于寄主的功能。

质粒分子生物学与质粒技术PPT课件

质粒分子生物学与质粒技术PPT课件
② 平板杂交:在选择平板上涂布供体菌和受体菌的 混合物或分别划线受体菌和供体菌,培养过夜, 长出的菌落为接合体。
③ 液体杂交:静止培养供体菌和受体菌的混合物, 然后涂选择平板,筛选接合体。
例:PpG378 (Leu-Nah+) × PpG376 (Leu+Nah-)
第23页/共35页
5 质粒的限制酶作图
第4页/共35页
2 质粒的复制、分配和不相容性
2.1 复制 (Replication)
质粒的复制起始和拷贝数是由质粒DNA序列 控制的。质粒分子中为质粒复制所必需的最小 区段称为基本复制子,它由两部分组成,一是 复制原点(ori),二是调节复制起始的基因(编码 蛋白质或RNA)。
第5页/共35页
2.3 不相容性 (Incompatibility)
第6页/共35页
3 质粒的接合转移
通过细胞与细胞之间的接触,使DNA从一 个细胞转移到另外一个细胞的现象叫接合 (Conjugation) 。这一过程由接合性质粒的转移 (tra) 基因区编码。被转移的DNA可以是接合质 粒本身,也可以是染色体或可诱动的非接合性 质粒。得到供体DNA的受体细胞称为接合体或 接合子。每个供体细胞所产生的接合体数称为 接合频率。
1570 1 0
表面多糖
基因组 6691694
6204 54 3
固氮
第18页/共35页
第2讲 质粒技术
1. 质粒的分离和纯化
2. 质粒的拷贝数测定
3. 质粒DNA转化
4. 细菌杂交实验
5. 质粒的限制酶作图
6. 质粒基因定位
7. 质粒测序和基因注释
8. 质粒克隆载体
第19页/共35页
1 质粒的分离和纯化

质粒载体解析.pptx

质粒载体解析.pptx
第43页/共99页
第三节质粒载体的构建
• 1.天然质粒用作克隆载体的局限性
• 2.质粒载体必须具备的基本条件
• 3.质粒载体的选择记号
• 4.不同类型的质粒载体

(1)高拷贝数的质粒载体

(2)低拷贝数的质粒载体

(3)失控的质粒载体

(4)插入失活型的质粒载体

(5)正选择的质粒载体

(6)表达型的质粒载体
第69页/共99页
pBR32 2
EcoRI
EcoRI Klenow
HaeⅢ λ pla c
EcoR I
HaeⅢ
EcoR I
HaeIII
ligation HindIII
pBH20
第70页/共99页
BamHI
lac
Hha HindIII
EcoRI
pBH2 0
HindII I
lac
Hha HindIII
III
EcoRI PstI
EcoRI PstI
ligation PstI
Amp
EcoRI
pSomII
Somastetin
BamHI
第72页/共99页
EcoRI
Samast etin BamH I
PstI Amp
EcoRI
pSomII
Somastetin
BamHI
EcoRI
EcoRI
EcoRI
Lac-β-gal

(2)杂种质粒拷贝数的控制
第39页/共99页
Co1El、pSCl 01及其杂种质粒pSCl34的DNA复制
第40页/共99页
4.质粒复制控制的分子模型

基因工程载体(质粒-3章)幻灯片(1)

基因工程载体(质粒-3章)幻灯片(1)

非接合型质粒的寄主细胞中同时存在一 种接合型质粒,那么它们通常也是可以 被转移的。这种由共存的接合型质粒引 发的非接合型质粒的转移过程,叫质粒 的迁移作用(mobiligation)又叫质粒 的诱动。
带有大肠杆菌素基因的Col质粒和带有抗菌素抗性基因的R 质粒既有属于接合型的,也有属于非接合型的。
如果在非接合型质粒的寄主细胞中同时存在一种接合 型质粒,那么它们通常也是可以被转移的。这种由共存的 接合型质粒引发的非接合型质粒的转移过程,叫质粒的迁 移作用(mobilization)又叫质粒的诱动。ColE1是一种可以 迁移但属于非接合型质粒。
2)F 因子
F因子是最有代表性的接合型质粒,又称致育因子 (fertility factor)或性质粒(Sex plasmid)。它在寄主细胞中有 三种存在方式:①独立于染色体之外,闭环双链DNA形式 存在。这种细胞称F+细胞。②独立于染色体之外,闭环双 链DNA形式存在,但其DNA上还携带有寄主菌染色体基因 或DNA区段。这种细胞称之为F-细胞。③以线性DNA形式, 从不同位点整合到寄主菌染色体上,这种细胞称为Hfr细胞 (高频重组细胞)。
如加入不同启动子序列,用于生产单链 DNA或RNA,外源基因的大量表达。又加 入COS位点,使载体能容纳更大的DNA片 段等等。
质粒载体的选择标记:
外源DNA片段与质粒载体DNA连接,再转化入 宿主菌,经培养后需筛选鉴定转化子。这就需 要利用质粒载体的可选择标记。
质粒载体的选择标记
抗生素抗性基因选择标记
蓝-白斑实验
构建的质粒人工载体,应用最广的是 PBR322,分子量为2.6×106,含46332bp。 含有选择标记抗氨苄青霉素(Apr)基因来 自天然质粒RSF2124和抗四环素(Ter)基因 来自PSC101质粒。复制子部分来自PMB9 (一类Co1E1质粒)。多克隆限制性内节切 酶位点有9个

《质粒plasm》课件

《质粒plasm》课件

质粒在基因工程中的应用
1
基因突变
利用质粒打破特定的DNA序列,进而激活
基因替换
2ห้องสมุดไป่ตู้
或衰变细胞中的基因表达方式。
将某种基因表达模式完整地替换到人类
基因内,实现对候选基因的修复、增强
和操纵。
3
基因合成
在质粒中合成外源DNA序列,然后使其by 转化到细胞中,进行基因工程操作。
测定纯度和浓度
通过分光光度计等设备对提取的DNA进行 浓度和纯度的分析,最终得到足够纯度 的DNA模板。
质粒受体的构建
设计外源基因
质粒扩增
根据所研究的蛋白质或基因序列, 设计需要插入到质粒中的外源 DNA序列。
利用分子克隆技术,扩增质粒, 在特定位点上将筛选的外源结构 DNA序列一起轨迹插 入质粒中。
2 复制
质粒具有独立于细胞核的 自主复制能力,可以在细 胞内快速复制複数份。
3 多样性
不同种类的质粒具有各自 不同的基因功能,可以将 人工合成或其他来源的 DNA序列插入质粒中。
质粒的特点和功能
适应性广 表达调控 分子克隆
质粒可以介导携带外源DNA的细胞转化,广泛用 于不同物种和不同类型的细胞中。
基因疗法
质粒是基因治疗的主要载体, 可以将缺失或变异的基因在人 体内表达,达到修补基因的目 的。
质粒提取的步骤和方法
1
DNA纯化
2
通过凝胶电泳或扫描电镜等技术分离出
DNA,并进行纯化和检验。可以使用各种
方法如组织组分析、板基础C离子交换等
3
来进行。
细胞破碎
使用缓冲液对待提取的菌落进行处理, 进行细胞破裂和DNA释放。
《质粒plasm》PPT课件

第三章--质粒载体PPT课件

第三章--质粒载体PPT课件
(ocDNA),即OC构型; L构型: 质粒DNA经酶切,发生双链断裂而形成线 性分子(LDNA),L构型。(见图)
2021
8
环形双链DNA质粒分子的三种构型
OC L
SC
2021
9
不同质粒DNA分子量差异显著,最小的仅能编码2-3 种蛋白质,分子量约为106 ,最大的可达108。
基因克隆载体的质粒DNA分子,必定包括三种共同的 组成部分,即复制基因、选择性记号和克隆位点。
2021
35
2021
36
2021
37
四、不同类型的质粒载体
➢ 高拷贝数的质粒载体 ➢ 低拷贝数的质粒载体 ➢ 失控的质粒载体 ➢ 插入失活型的质粒载体 ➢ 正选择的质粒载体 ➢ 表达型的质粒载体
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
2021
38
1、高拷贝数的质粒载体
克隆的目的若仅仅是为了分离大量的高纯度的克隆基 因的DNA片断,通常选择COLE1、PMB1或它们的派生质 粒。这些质粒在没有蛋白质合成的条件下仍能继续复 制。因此,若在处于对数生长晚期的含有COLE1一类 质粒的大肠杆菌培养物中,加入适量的蛋白质抑制剂 出来之后,经过10-12小时的培养,每个细胞中的质 粒拷贝数可扩增到1000-3000个之多。
2021
22
2、碱裂解法
原理:是根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA片断之间, 在拓扑学上的差异发展出来的。
加热或PH介于12.0-12.5的范围内,线性DNA会被变性,两条链会完 全分开。而超螺旋DNA由于双螺旋主链骨架的彼此盘绕作用,互补 的两条链仍会紧密结合在一起,不会被变性。
致冷或恢复中性PH值,变性处理的质粒和染色体DNA混合物便会迅 速复性。共价闭合环状的质粒DAN,由于两条链在形体上仍保持在 一起,复性迅速准确。随机断裂产生的线性的染色体DNA分子,互 补链彼此已分开,复性就不会那么迅速而准确,它们聚集形成网状 结构,通过离心会与变性的蛋白质及RNA沉淀下来。滞留在上清液 中的质粒DAN则可通过乙醇沉淀法收集。
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– 6.致病性质粒: • 根癌土壤农杆菌的Ti质粒;以及破伤风梭菌、肉毒 梭菌和大肠杆菌等都存在致病性质粒。
– 7. 共生固氮质粒 • 根瘤菌普遍喊有该类质粒。
• 包括共生质粒和非共生质粒,非共生质粒对共生作 用可有正或负的调节作用。
– 8. 隐蔽质粒(cryptic plasmid) • 酵母的2m质粒(p171) – 长为2m的6kb的环状双链DNA分子 – 位于酵母细胞核内,50~100拷贝 – 只携带与复制和重组有关的4 个基因,无遗传表 型
– 3.产生抗生素的质粒
• 细菌素:细菌产生的一般只能抑制或杀死种内不同 亚种或菌株中敏感细菌的特殊多肽类代谢产物。
• Col质粒:10种,有非接合型和接合型之分。 – 4.产生毒性的质粒(BT) – 5.降解质粒:
• 假单胞菌属是一类能广泛利用有机化合物进行生长 的细菌。其体内含有大量的降解质粒。
现代微生物遗传学第三章质粒详解演 示文稿
优选现代微生物遗传学第三章质粒
• 一、质粒的发现
– F质粒(1946年),第一个被发现的质粒
– 20世纪50-70年代:抗性质粒的大量研究,以及其他 质粒的发现
– 20世纪70年代后,质粒广泛应用于遗传工程和分子 生物学研究中。
• 二、质粒的命名原则
– 最初发现的质粒由研究者根据表型、大小等特征自行 命名。(F因子、R质粒、Col质粒等)
– 纯化和检测方法 • 琼脂糖凝胶电泳(质粒3种构型泳动速度不同,琼 脂糖浓度,EB染色,分子量的判断) • 氯化铯-EB密度梯度离心 • 电镜观察
第四节 质粒的复制与调节
• 一、质粒的大小和拷贝数 – 1.大小测定 • 表示方式:MD或kb,1MD的双链DNA≈1.65kb。 • 测定方法:电泳、电镜、测序。 • 大小范围:1~200kb,个别800~1000。 – 2.质粒的拷贝数 • 严紧型质粒(stringent plasmid)或低拷贝质粒; • 松弛型质粒(relaxed plasmid)或高拷贝质粒。(氯霉 素可抑制细胞分离,终止染色体复制,但松弛型质 粒可持续复制,其拷贝数可达到1000~3000)。
• 四、质粒的分离、检测与纯化
– 质粒分离方法:碱变性法
• 菌体的培养和收集
• 溶菌
• 碱变性处理
• 离心分离
• 有时为了快速提取质粒DNA,可以在提取液碱变性 后,用pH4.8的醋酸钠高盐缓冲液调节pH到中性, 这时染色体DNA不能复性而形成缠连的网状结构, 而即使变性的质粒可以恢复到原来的构型,再通过 离心,这样可以缩短提取质粒的时间。
三、质粒复制的调控
• 质粒的调控一般采用直接或间接的负调控机制。 • 负调控因子可是蛋白质、RNA或DNA重复序列。 • 调控类型可分两类:
– 抑制物-靶位调控(inhibitor-target regulation) – 重复子-竞争结合调控(iteron-binding regulation)
• 1.抑制物-靶位调控
• 依赖一小段反向转录的 RNA作为抑制物,通过它 与质粒DNA复制引物或编 码Rep蛋白(复制蛋白) 的mRNA的互补结合以阻 止质粒复制的起始。
– (1) ColE1质粒复制调控 (P122图5-7)
– 质粒上有两个600bp长的IR,被一个2.7kb区域和 一个2.3kb小区域所间隔
– 两个IR上都有一个专一重组位点(FRT),经过重 组,可使质粒互变异构成A型和B型。
第三节 质粒的检测
• 检测质粒的方法主要根据质粒的(遗传学特性)和 (分子结构特性)。 – 遗传特性:独特的表型、转移、人为消除等。 – 分子结构:cccDNA和染色体相比对理化因子有更 强的抗性。
• 二、质粒的复制
– 1.质粒复制的方式(P120)
• 质粒的复制起点称 为oriV,大肠杆菌为 oriC。
• 复制主要通过型复
制和滚环复制之一
进行。其中以型复
制为主(包括单向 和双向)。
• 质粒只编码一种或 少数几种与复制有 关的蛋白质,其他 复制蛋白都来自宿 主。
– 2.复制起点区oriV的 功能和pBR322质粒 • 复制起点区oriV 功能与质粒载体 的构建、寄主范 围
第二节 质粒编码的遗传表型
• 大多数质粒均控制着宿主细胞的一种或几种特殊性状, 具有一定的表型,质粒可依据其表型不同可划分为以 下几类: – 1.致育质粒 – 2.抗药性质粒 • 组成:转移区和抗性决定子 • 抗药的机制:改变抗生素作用的靶点;修饰抗生 素;组织抗生素进入;产生一种酶能代替宿主细 胞中被抗生素作用的靶点。
• 一、质粒消除(理化因子和生物学方法) – 理化因子消除法 • 消除剂:吖啶类,EB,某些抗生素,高温,UV等 • 如何判断某一遗传性状的丧失是质粒消除的结果还 是染色体基因突变的结果呢?
– 回复突变情况 – 突变率 • 理化因子消除质粒的作用机制: – 对质粒本身的复制和分离产生抑制作用,在生长
中被淘汰
– 选择性抑制带有质粒的菌的生长。
– 2.原生质体消除法
• 使待消除质粒的菌株在一定条件下形成原生质体, 在再生后生长的菌株中可出现高频率质粒消除菌。
• 二、遗传转移
– 将质粒导入已经消除了该质粒的原宿主细胞,比较 导入前后表型性状的差异或恢复程度。
• 三、分子杂交
– 在初步确定某菌株可能含有质粒的情况下,利用已 知表型性状的基因片段作探针进行分子杂交,来检 测其菌株是否含有该种质粒。
– 1976年Novick提出了质粒命名原则: • 质粒名称一般由三个英文字母及编号组成; • 第一个字母一律小写p表示(plasmid)
• 后两他特征的英文缩写。
• 编号为阿拉伯数字,用于区分同一类型的不同质粒。 (pUC18, pUC19等)
• pBR322质粒:pMB1的ori和rop(ROP蛋白对质粒的复
制负调控)区;pSC101的tetr;Tn3的ampr。属中等拷 贝质粒,10~30个/细胞 • pUC类:高拷贝质粒(100~300个/细胞),也是pMB1
的ori,但是没有rop。
• 质粒的寄主范围和质粒的拷贝数均决定
于质粒的ori区域。
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