数量遗传学基础讲稿
合集下载
动物遗传学-数量遗传学基础教学文案
2.数量性状
在孟德尔遗传规律被重新发现后的二十世纪初, 形成了以Bateson和Devries为首的Mendel学派以及以 Pearson和Weldon为首的Galton学派。
在遗传和进化问题上,Mendel学派认为不连续性 变异是重要因素,孟德尔原理可以普遍用于遗传变异 的研究,而连续性变异之所以不符合这些规律是因为 它是不能遗传的;而Galton学派则认为连续性变异是 可遗传的,是进化的重要因素,在研究上必须采用统 计学的方法,而Mendel法则对于连续性变异不适用。
Johannsen W.L.的“纯系学说”对遗传学的贡献为如 下三点: ①确认了数量性状是可以真实遗传的; ②分清了可遗传的变异和不可遗传的变异。 ③分清了基因型(genotype)和表现型(phenotype)的概 念。基因型并不等于表现型,而是P=G+E。
他发现数量性状同时受遗传和非遗传因素的控制,基 因型的不连续的效应可以为环境效应所修饰而在表型 上表现为连续变异。
每个因子的效应较小,相互间无显隐性关系。
多基因假说的要点是: 1.数量性状是许多微效多基因(Minor effect polygenes)的联 合效应造成的,它们的效应相等可累加,所以微效基因又称加 性基因(Additive gene )。
2.微效基因之间大多数缺乏显隐性(Dominant-recessive effect )。虽然可用大小写字母表示等位基因,但大写基因并不掩盖 小写基因的表现,大写只代表表示增效,小写表示减效。
这场争论直到1909年才结束。该年约翰逊(Johannsen WL)发表了“纯系学说(Pure line theory)”,尼尔逊. 埃尔(Nilsson-Ehle H)提出“多基因假说(polygene hypothesis or multiple-factor hypothesis)”;这两个理 论的建立,标志着数量遗传学的诞生。
动物育种学-第-数量遗传学基础-PPT精选
X和Y是两个亲属个体,
2
,
,Φ和
Φ‘分别是两个体的父系和母系基因同源的概率,下
标A和D表示加性方差和显性方差。
忽略各种显性效应和高阶加性协方差,可近似
地认为,在随机交配(非近交)时有:
CoG(vXY ,)A 2
(2.11)
因此,如果忽略基因的上位效应和显性效应,
可以得到亲属间因同源一致性造成的遗传相关,即
假定基因型效应、永久性环境效应和暂时性环境效应之间
都不存在相关,可以将表型方差( V P )剖分为:
VPVGVEPVET
故重复力 re 可定义为:
reVGV P VEP
VGVEP VGVEP VET
重复力的作用
重复力可用于验证遗传力估计的正确性 重复力可用于确定性状需要度量的次数
同源一致性(identity by descent,IBD)
(Malé cot,1948):指亲属个体带有的基因是由某一 共同祖先同一基因复制而来的 。
遗传协方差的实际构成比较复杂,在忽略上位效 应和基因连锁时,它由一系列加性效应和显性效应以 及各种互作效应构成,即:
C G ( X o Y ) v ,A 2 D 2 2A 2 A 2D 2 D A 2 D (2.10)
所有的基因效应 持久性环境效应 指时间上持久或空间上非局部效应
的环境因素对个体性状表现所产生的影响。
暂时性环境效应 一些暂时的或局部的特殊环境因素
对个体性状的某次度量值产生影响
重复力估计原理
从效应剖分看,可将环境效应( E)剖分为持久性环境效
应( E P ) 暂时性环境效应( E T )两部分 EEPET ,因此 P G E G E P E T
《数量遗传》课件
遗传方差与变异方差
01
遗传方差是指由于遗传因素所引 起的表型变异,包括基因方差和 基因型方差。
02
变异方差是指由于环境因素所引 起的表型变异,包括环境方差和 残差方差。
遗传相关与相关系数
遗传相关是指两个性状在遗传上的关联程度,可以用相关系 数表示。
相关系数是指两个性状之间的关联程度,可以用相关系数r表 示,其值介于-1和1之间,正值表示正相关,负值表示负相关 。
基因治疗
利用基因编辑技术治疗遗 传性疾病,改善人类健康 状况。
人工智能在数量遗传学中的应用
数据挖掘和分析
利用人工智能技术处理大规模数据,挖掘数量性状的 遗传规律。
预测模型
基于人工智能算法构建预测模型,预测数量性状的表 现和遗传趋势。
辅助育种
利用人工智能技术优化育种方案,提高育种效率和成 功率。
转录组学和蛋白质组学分析
通过比较不同组织、发育阶段或不同处理条件下 的转录组和蛋白质组数据,筛选与目标性状相关 的差异表达基因和蛋白质。
04
数量遗传学在育种中的应用
BIG DATA EMPOWERS TO CREATE A NEW
ERA
作物育种
作物产量
数量遗传学在作物育种中可用于提高作物的产量。通过研究数量性状基因座(QTL),可 以定位控制产量性状的基因,进而通过分子标记辅助选择(MAS)等方法,将有益基因 聚合到一起,培育出高产的作物品种。
肉质和乳制品品质
数量遗传学在动物肉质和乳制品品质改良方面也有应用。 通过研究与肉质和乳制品品质相关的QTL,可以定位控制 这些性状的基因,进而利用MAS等技术,将有益基因聚合 到一起,培育出具有优良肉质和乳制品品质的动物品种。
人类医学研究
《数量遗传学基础》课件
03
人类健康与疾病研 究
利用数量遗传学方法研究人类复 杂疾病的发生机制,为疾病预防 和治疗提供新的思路和方法。
THANKS
感谢观看
3
疾病抵抗力增强
通过研究动物的疾病抗性基因,提高动物的疾病 抵抗力,降低养殖成本和动物疾病发生率。
人类遗传学研究
疾病预测与预防
利用数量遗传学方法,研究人类遗传性疾病的发病风险相关基因 ,为疾病的预测和预防提供科学依据。
个体差异研究
通过研究人类的数量性状基因,了解个体差异的遗传基础,为个性 化医疗和健康管理提供支持。
《数量遗传学基础》ppt课件
• 数量遗传学概述 • 数量遗传学的基本概念 • 数量性状的遗传模型 • 数量遗传学的研究方法 • 数量遗传学的应用 • 展望与未来发展
01
数量遗传学概述
定义与特点
定义
数量遗传学是研究生物群体中数量性状遗传规律的科学。
特点
数量性状是受多基因控制的,其遗传变异规律比质量性状复 杂。
04
数量遗传学的研究方法
统计分析方法
统计分析方法
QTL分析
关联分析
元分析
这是数量遗传学中最为常见和 基础的研究方法。通过统计分 析,可以对遗传数据进行分析 和解释,探究遗传变异的来源 、分布和作用机制。
数量性状位点(QTL)分析是 利用统计学方法定位控制数量 性状的基因位点,分析基因位 点对表型变异的贡献。
表型组学研究
结合新一代测序技术和成像技术,对动植物表型组进行深入研究, 以揭示表型变异与遗传变异之间的关系。
未来发展方向与挑战
01
跨物种比较研究
比较不同物种间的遗传差异,以 揭示物种进化的机制和规律,为 生物多样性保护提供科学依据。
数量遗传学讲稿
遗传上受许多微效基因控制,性状变异连 续,表型易受环境因素影响的性状,如生长速 度、产肉量、产奶量等。
The generalized growth curve of young animals
The Generalized Lactation Curve
质量性状 (Qualitative traits or characters)
数量遗传学发展简史
1859年:Charles Darwin (达 尔 文 ) 发 表 《 物 种 起 源 , The Origin of Species 》,提出生物进 化的自然选择学说。
1866 年 : 奥 地 利 学 者 Gregor Mendel(孟德尔)根据他的豌豆 杂交试验结果发表了《植物杂交 试验》,揭示了现在称为孟德尔 定律的遗传规律,奠定了遗传学 的基础。
杨纪珂先生简介
杨纪珂教授,江苏松江(今属上海市)人。 1944年毕业于交通大学唐山工程学院。1948年美 国俄亥俄州立大学获冶金硕士学位。1955年回国。 历任中科院生物物理所副研究员、中国科技大学 教授、安徽省副省长、安徽省人大常委会副主任、 中央社会主义学院院长、致公党中央副主席,全 国人大常委,全国政协委员。 著有《生物数学概论》、《数量遗传基础知 识》等。
数量遗传学的研究对象
数量遗传学的研究对象是数量性状的遗传变异
性状的分类 性状 (trait, character):生物体的形态、结构 和生理生化特征与特性的统称。如毛色、角 型、产奶量、日增重等。
根据性状的表型变异、遗传机制和受环境影响 的程度可将性状分为数量性状、质量性状和阈 性状3类。
ห้องสมุดไป่ตู้
数量性状 (Quantitative traits)
数量遗传学的基础 第一节 性状的分类
对性状必须进行度量而不是进行简单的区分; 必须应用生物统计的方法进行分析归纳,方能了解数量
性状遗传变异的动态; 必须以群体为研究对象。
数量性状的特点
变异的连续性 对环境的敏感性 分布的正态性 多基因作用的微效性
数量性状的特征
对质量性状而言: • 不易受环境的影响而发生变异 • F1有显隐性之分 • F2代可明显分组,不会出现超亲遗传的现象
对数量性状而言:
玉米穗长(表)
• 易受环境的影响而发生变异 • 两个纯合的亲本杂交,F1代一般是双亲的中间类型,但有时
人的身ห้องสมุดไป่ตู้(图)
遗传特征:两个有差异的亲本杂交
1. F1为双亲中值,但有时会偏向某一亲本; 2. F2均值、F1均值、双亲中值相近 3. F2变幅增大,但是变异程度远远超过F1 4.易受环境条件影响 5.有超亲遗传的现象:当杂交的亲本不是极端类型的时候,杂 交后代中有可能会出现高于高值亲本或低于低值亲本的类型
质量性状与数量性状的关系
1 由于区分的着眼点不同 2由于杂交亲本的差别基因对数不同。数量性状一般由微效 多基因控制,但在某些情况下,也可由单一的主基因控制。 3 一因多效,一个基因可以同时控制质量性状和数量性状, 控制数量性状的基因与控制质量性状的基因可能连锁。
三、 阈性状
可以用等级或分类表示的性状,如猪肉 颜色分为5级;蛋黄颜色分为9级。
第十四章 数量遗传学基础
一、数量遗传学(quantitative genetics)
1.概念 “是遗传学原理与统计学方法相结合,研究
群体数量性状的遗传学分支科学。” 遗传学 统计学 群体 数量性状
动物生产中需要改良的性状大多是数量性状。
第一节 性状的分类
性状遗传变异的动态; 必须以群体为研究对象。
数量性状的特点
变异的连续性 对环境的敏感性 分布的正态性 多基因作用的微效性
数量性状的特征
对质量性状而言: • 不易受环境的影响而发生变异 • F1有显隐性之分 • F2代可明显分组,不会出现超亲遗传的现象
对数量性状而言:
玉米穗长(表)
• 易受环境的影响而发生变异 • 两个纯合的亲本杂交,F1代一般是双亲的中间类型,但有时
人的身ห้องสมุดไป่ตู้(图)
遗传特征:两个有差异的亲本杂交
1. F1为双亲中值,但有时会偏向某一亲本; 2. F2均值、F1均值、双亲中值相近 3. F2变幅增大,但是变异程度远远超过F1 4.易受环境条件影响 5.有超亲遗传的现象:当杂交的亲本不是极端类型的时候,杂 交后代中有可能会出现高于高值亲本或低于低值亲本的类型
质量性状与数量性状的关系
1 由于区分的着眼点不同 2由于杂交亲本的差别基因对数不同。数量性状一般由微效 多基因控制,但在某些情况下,也可由单一的主基因控制。 3 一因多效,一个基因可以同时控制质量性状和数量性状, 控制数量性状的基因与控制质量性状的基因可能连锁。
三、 阈性状
可以用等级或分类表示的性状,如猪肉 颜色分为5级;蛋黄颜色分为9级。
第十四章 数量遗传学基础
一、数量遗传学(quantitative genetics)
1.概念 “是遗传学原理与统计学方法相结合,研究
群体数量性状的遗传学分支科学。” 遗传学 统计学 群体 数量性状
动物生产中需要改良的性状大多是数量性状。
第一节 性状的分类
《数量遗传 》课件
。
05
数量遗传学展望
新技术与新方法的发展
基因组学技术
随着基因组学技术的不断进步, 数量遗传学将能够更深入地研究 基因与表型之间的关联,揭示更 多复杂的遗传现象。
大数据分析方法
利用大数据分析方法,对海量的 遗传数据进行分析,能够更准确 地识别基因与性状之间的关系。
人工智能与机器学
习
人工智能和机器学习技术的发展 将为数量遗传学提供更强大的工 具,用于预测和解析复杂的遗传 模式。
3
数量遗传学在植物育种中还涉及到基因组学和表 型组学的研究,以加速新品种的培育进程。
人类医学研究
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
数量遗传学在人类医学研究中主 要用于疾病易感性和复杂性疾病
的研究。
通过数量遗传学的方法,可以鉴 定与疾病相关的基因和变异位点 ,为疾病的预防和治疗提供理论
依据。
数量遗传学在人类医学研究中还 涉及到基因组学和表型组学的研 究,以揭示人类复杂的疾病机制
适用范围
适用于研究多个变量之间的相互关系和因果关 系。
分析步骤
构建因果模型,通过回归分析计算路径系数,然后评估模型的拟合度和解释力 度。
主成分分析
主成分分析
用于降低数据的维度,将多个相关变量转化为少数几 个不相关的主成分。
适用范围
适用于处理大量数据,特别是当变量之间存在多重共 线性时。
分析步骤
计算变量的相关系数矩阵,通过特征值和特征向量提 取主成分,然后解释主成分的意义和作用。
研究内容与领域
研究内容
数量遗传学主要研究数量性状的遗传 基础、遗传变异和进化过程,包括基 因型和表型关系的分析、遗传力和方 差组分的估计、选择反应和遗传进展 的预测等。
领域
05
数量遗传学展望
新技术与新方法的发展
基因组学技术
随着基因组学技术的不断进步, 数量遗传学将能够更深入地研究 基因与表型之间的关联,揭示更 多复杂的遗传现象。
大数据分析方法
利用大数据分析方法,对海量的 遗传数据进行分析,能够更准确 地识别基因与性状之间的关系。
人工智能与机器学
习
人工智能和机器学习技术的发展 将为数量遗传学提供更强大的工 具,用于预测和解析复杂的遗传 模式。
3
数量遗传学在植物育种中还涉及到基因组学和表 型组学的研究,以加速新品种的培育进程。
人类医学研究
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
数量遗传学在人类医学研究中主 要用于疾病易感性和复杂性疾病
的研究。
通过数量遗传学的方法,可以鉴 定与疾病相关的基因和变异位点 ,为疾病的预防和治疗提供理论
依据。
数量遗传学在人类医学研究中还 涉及到基因组学和表型组学的研 究,以揭示人类复杂的疾病机制
适用范围
适用于研究多个变量之间的相互关系和因果关 系。
分析步骤
构建因果模型,通过回归分析计算路径系数,然后评估模型的拟合度和解释力 度。
主成分分析
主成分分析
用于降低数据的维度,将多个相关变量转化为少数几 个不相关的主成分。
适用范围
适用于处理大量数据,特别是当变量之间存在多重共 线性时。
分析步骤
计算变量的相关系数矩阵,通过特征值和特征向量提 取主成分,然后解释主成分的意义和作用。
研究内容与领域
研究内容
数量遗传学主要研究数量性状的遗传 基础、遗传变异和进化过程,包括基 因型和表型关系的分析、遗传力和方 差组分的估计、选择反应和遗传进展 的预测等。
领域
第七章数量遗传学基础PPT资料61页
dy.x1+dy.x2=1 Py.x1=ry.x1, Py.x2=ry.x2
如果原因不完全,则决定系数之和小于1
12.05.2020
13
通径系数的性质(一)
yx1x2
Py .x1
y .x1 2
x1
x1 y
第13张幻灯片
(
y
y ( x1
)(
x1 x1
)2
x1
)
x1 y
( x1
以产生31060,000种基因型 2. 新的类型不是新的突变,而是由于稀少基因分
离造成的(返祖)。
12.05.2020
4
Johannsen 和 Payne
Johannsen(1903,1909),纯系的变异不可 遗传
环境因素可引起数量性状的变异 提出基因型和表型的概念
Payne(1918):果蝇刚毛数可以超过基础群 最极端的表型
12.05.2020
2
Shull(1908)
玉米:纯系的变异比远交群小得多。利用今 天的遗传学解释:
普通玉米的基因型很复杂,自交可以产生纯合 基因型个体,因此,近交系的变异很低
12.05.2020
3
Nilsson-Ehle(1909)
研究谷类作物
F2 1. 多数性状符合3:1 2. 个别64:1,AaBbCc, (1/2)6=1/64 结论: 1. 有性繁殖可以产生大量的基因型。10个座位可
因果关系: 单箭头线,方向由因到果,称为通径 线 平行关系:双箭头线,称为相关线
每条线的相对重要性称为系数
通径线的系数称为通径系数 相关线的系数称为相关系数
12.05.2020
10
概念
猪的屠宰体重(Y),由一长速度(X1)和 4月龄体重(X2)决定,而它们又是由饲养 条件(X3)决定。
如果原因不完全,则决定系数之和小于1
12.05.2020
13
通径系数的性质(一)
yx1x2
Py .x1
y .x1 2
x1
x1 y
第13张幻灯片
(
y
y ( x1
)(
x1 x1
)2
x1
)
x1 y
( x1
以产生31060,000种基因型 2. 新的类型不是新的突变,而是由于稀少基因分
离造成的(返祖)。
12.05.2020
4
Johannsen 和 Payne
Johannsen(1903,1909),纯系的变异不可 遗传
环境因素可引起数量性状的变异 提出基因型和表型的概念
Payne(1918):果蝇刚毛数可以超过基础群 最极端的表型
12.05.2020
2
Shull(1908)
玉米:纯系的变异比远交群小得多。利用今 天的遗传学解释:
普通玉米的基因型很复杂,自交可以产生纯合 基因型个体,因此,近交系的变异很低
12.05.2020
3
Nilsson-Ehle(1909)
研究谷类作物
F2 1. 多数性状符合3:1 2. 个别64:1,AaBbCc, (1/2)6=1/64 结论: 1. 有性繁殖可以产生大量的基因型。10个座位可
因果关系: 单箭头线,方向由因到果,称为通径 线 平行关系:双箭头线,称为相关线
每条线的相对重要性称为系数
通径线的系数称为通径系数 相关线的系数称为相关系数
12.05.2020
10
概念
猪的屠宰体重(Y),由一长速度(X1)和 4月龄体重(X2)决定,而它们又是由饲养 条件(X3)决定。
数量遗传学基础
基本概念-数量性状基因座(QTL)
对数量性状有较大影响的基因座称为数量 性状基因座(quantitative trait locus,QTL),它 是影响数量性状的一个染色体片段,而不一定是 一个单基因座。
有限的基因如何控制众多的数量性状?
一般可以归结为下列三个原因: 1、基因仅仅是性状表现的遗传基础,它与性状的关系并非
位基因久间性一的环定上的境位随效机效应性应,和(一暂般e时p均i将性st它a环们t境i归c 并效e到f应f环ec境t效)。应偏差值中,统称
为剩余值 ,记为 R。
控制数量性状基因具有各种效应,主要有:
加性效应(additive effect,A):等位基因 (allele)的累加效应;
显性效应(dominance effect,D):等位基因之 间的互作效应。
群体遗传结构影响因素——迁移
迁移(migration):不同群体间由于个体转移 引起的基因流动过程
在家畜育种实践中,迁移主要体现为引种,即 引入优良基因加快群体的遗传改良,是提高育 种效率的有效途径。
群体遗传结构影响因素—选择
选择(selection):群体内个体参与繁殖的机会不均等, 从而导致不同个体对后代的贡献不一致。造成这种繁殖机 会不均等的原因主要有个体适应性和生活力的差异、个体 繁殖力不同及人为的选择,前两者是自然选择的主要因素, 而人工选择是动物育种改良最重要的手段。
上位效应(epitasis effect,I):非等位基因之 间的相互作用。
基因型值是各种基因效应的总和。 G=A+D+I ,
表现型值������ P=A+D+I+E
基因效应和育种值
考察一个具有等位基因A1和A2的基因座,假 设纯合子A1A1的基因型值为+a,A2A2的基因型值 为-a,杂合子A1A2的基因型值为d,它取决于基因 的显性程度大小,无显性时d=0,完全显性时
数量遗传学-PPT课件
永久性环境和暂时性环境的剖分 是针对重复测定性状而言的
均数、方差与协方差
数量性状表型方差的剖分
假定,遗传效应间、环境效应间及遗传及 环境效应间无互作,则:
VP = VA + VD + VI + VEg + VEs
群体平均基因型值和基因型值方差
显性水平 (Dominance level) 与显性度
设一对等位基因A1、A2的频率分别为p和q, 三种基因型A1A1、 A1A2 、A2A2的基因型值分别 为+a、d、和-a。其中d决定于基因的显性程度大 小,即显性水平。
不同显性水平下的d值
显性水平 负向超显性 负向完全显性 负向部分显性 无显性 正向部分显性 正向完全显性 正向超显性 显性基因
d
配子相(Gametic phase)或连锁相(Linkage phase)
两个基因座A和B,每个基因座两个等位基因, 分别为A1、A2和B1、B2:可形成4种配子: A1B1、A1B2、A2B1、A2B2 相引相(Coupling phase): A1B1/ A2B2 相斥相(Repulsion phase):A1B2/ A2B1
质量性状、数量性状与阈性状的比较
质量性状 数量性状 阈性状
性状主要 品种特征、 类 型 外貌特征 遗传基础 单个或少数 主基因 变异表现 间断型 方 式 考察方式 描述 环境影响 不敏感
研究水平 家系
生产、生长 性状 微效多基因
连续型
生产、生长性 状 微效多基因
间断型
度量 敏感
群体
描述 敏感或不敏感
连锁不平衡( Linkage disequlibrium ):一 个基因座上的一个等位基因与另一基因座上的 一个等位基因不相互独立,即不同基因座的等 位基因间存在非随机关联: p (AB) p (A) p(B) D= p (AB) - p (A) p(B) D的取值范围是-0.25~0.25。 连锁不平衡系数随世代的变化: Dt = Do (1-r) t
动物育种学-第二章-数量遗传学基础-PPT精品
阈性状(threshold trait):表现型呈非连续变
异,与质量性状类似,但不是由单基因决定,性状 具有一个潜在的连续型变量分布,遗传基础是多基 因控制的,与数量性状类似。
数量性状的特征
区分性状的依据:
性状是描述性的,还是可以度量的; 性状是呈间断性分布,还是连续性分布; 性状的表现是否容易受到环境的影响; 控制性状的遗传基础是单基因还是多基因。
假定基因型效应、永久性环境效应和暂时性环境效应之间
都不存在相关,可以将表型方差( V P )剖分为:
VPVGVEPVET
故重复力 re 可定义为:
reVGV P VEP
VGVEP VGVEP VET
重复力的作用
重复力可用于验证遗传力估计的正确性 重复力可用于确定性状需要度量的次数
若定义A1和A2基因的平均效应值分别为 1
和, 2 则有:
1 2 p p [ q d (q d [ (p p ) q ] ) 2 p]q q [d d (q p )] (2.8)
基因的平均效应 是指该基因随机地与群体
第三节 亲属间相关分析
亲属相关,有两类概念:一是亲属间的遗传相关 二是亲属间的表型相关。
亲属间的遗传相关 是从整体而言的,用亲属
个体的基因来自共同祖先的概率计算,描述亲属间 整体上的亲缘相关程度,与具体的性状没有关系。
亲属间的表型相关 是描述亲属间性状表型值
间的相关系数,由于只有特定的数量性状才有表型 值,因此这种相关在不同性状、不同群体都是有所 不同的。
假设一个个体度量了 k 次,用这些度量值的平
均数作为该个体的平均表型值,记为 Pk ,可以得到 多次度量均值方差与单次度量值方差的关系为:
数量遗传学基础讲稿
• (2)体重受三对基因决定的遗传动态
多基因控制的数量遗传中等位基因数目 和基因型、表型数及分离比的关系
等位基因 分离的等 F2中性状极端 对的数目 位基因数 表达的比率
1
2
(1/4)1=1/4
F2中的基 F2中的 F2各表型比为二 因型数 表型数 项式各项系数
(3)1=3
3
(a+b)2
2
4
(1/4)2=1/16
数量性状有三个特征:
1、数量性状的变异表现为连续的, 杂交后的分离世代不能明确分组。
例如:对虾、鲤鱼等水产动物 的体长、繁殖能力、产量高低等 性状,后代群体都有广泛的变异 类型,杂交后代难以明确分组, 只能用度量单位进行测量,并采 用统计学方法加以分析。
数量性状有三个特征: 2、数量性状一般容易受到环境的影响而发生变异。
如果不考虑环境条件的作用,控制某一 数量性状的微效基因的数目愈多,子二 代表型的等级区别就愈小,其变异范围 也就愈大,也就更接近“正态分布”。
• 在进行杂交时,杂种后代往往出现一种超亲遗传的现 象。这个现象可用多基因假说予以解释。这就出现比 原亲本生产性能更高和更低的类型,通过选择,就有 可能育成比原来品种(或品系)生产性能更高的新品 种(或品系)。
三、相关系数(correlation coefficient)
协方差(covariance)
四、 回归(regressim)
一. 均值(mean)又称为平均值(average)
均数是某一性状全部观察数(表现型值)的平均。通过把 全部资料中各个观察的数据总加起来,然后除以观察总 个数。表示一组资料的集中性。
标准差决定了表型分布的特点。
三、协方差(covariance,C)和相关系数 (correlation coefficient,r) :
2数量遗传学基础-文档资料62页
1 2
0
14A2 116A2A
1 4
0 81A2 614A2A
1 8
1 16
1 4A 2 1 16 D 2 1 16 A 2 A2 15D 26 D 6 14 A 2 D
1 4
0
12A2 14A2A
1 2
0
14A2 116A2A
10
数量性状数学模型
数量性状表型值剖分
数量性状表型值(P)线性剖分为基因型值 (G)和环境效应值(E)两个部分,即:
P=G+E+IGE
(2.5)
IGE是基因型与环境的互作偏差效应值
假设 E 0 ,则在同一固定环境条件下可认
为
。
P G
影响数量性状表型值的环境效应,又可分为
系统性环境效应(或称固定环境效应)和随机环
若定义A1和A2基因的平均效应值分别为 1
和, 2 则有:
1 2 p p [ q d (q d [ (p p ) q ] ) 2 p]q q [d d (q p )] (2.8)
14
基因的平均效应 是指该基因随机地与群体
所有的基因效应 持久性环境效应 指时间上持久或空间上非局部效应
的环境因素对个体性状表现所产生的影响。
暂时性环境效应 一些暂时的或局部的特殊环境因素
对个体性状的某次度量值产生影响
26
重复力估计原理
从效应剖分看,可将环境效应( E)剖分为持久性环境效
应( E P ) 暂时性环境效应( E T )两部分 EEPET ,因此 P G E G E P E T
一般情况 Φ Φ '
1 A 2 A 2 D 2 D 2 2A 2 A 2 A A 2D 2 D 2D D A 2A 2 D D 1
第七章-数量遗传学-基础课件(1)
层的系数求得。(n为基因对数)
如
1
n=1,2n+1=3(层) n=2,2n+1=5(层) n=3,2n+1=7(层)
11 121 13 31
14641
1 5 10 10 5 1
1 6 15 20 15 6 1
如用图形表示,随着n的增加,二项分布逐渐成为 正态分布,从间断变异过渡为连续变异。环境对 基因型的影响,增加了表型变异的连续性。
决定数量性状的基因有加性效应,也有 显性效应和上位效应,更多的情况是几 种基因效应同时存在;
应用现代生物技术和统计方法,可以对 控制数量性状的基因从整体到局部进行 研究,如QTL。
2024/9/17
第三节 数量性状遗传分析的统计学方法
一、 表型值剖分的数学模型
1.表型值的剖分 P=G+E P:表型值 G:基因型值 E:环境离差
1
8
10
7
9 13
2
8
10
8
9 14
3
9
11
8 11
9
4
9
11 10 11
9
5
10
12
———————————————————————————
Σx
44
54 23 40 45
216
Σx2
390 586 277 404 527
2184
( Σx)2/ki 387.2 583.2 272.3 400 506.3 2149
2024/9/17
Re VG VEg VP
Re:重复力
(2)生物统计学概念 性状多次度量值之间的组内相关系数。
t MbSMw S MbS(k01)Mw S
相关主题