37303730xl中文简明使用手册(40页)
ABI3730xl型测序仪日常维护标准操作规程(SOP)
检查胶瓶中的胶以确认有足够的胶完成实验
每天或每次实验前
检查泵胶块和下胶块以确认其未松动
每天
清洁仪器表面、实验台表面
每天
检查毛细管旋钮，连接管螺帽和阀门以防止泄露
每天
每星期
维护工作
频率
使用Change Polymer向导换胶
每星期或需要时
检查旧毛细管的储存条件
每星期
使用注射器抽取20ml去离子水，清洗泵头的密封圈
每次实验前
更换溶液槽中的Buffer和水，确认槽的外围是干燥的
每48小时或每20个runs
更换water和waste溶液槽中的水，确认槽的外围是干燥的
每天或每20个runs
检查泵上下block、连接管、胶管和各通道中是否有气泡，使用Bubble Remove向导除去气泡
每天或每次实验前
检查毛细管的取样末端以确认其未损坏
每星期
使用去离子水浸泡胶垫，用自来水冲洗后再用去离子水洗一遍
每星期或需要时
每月
维护工作
频率
运行Water Wash向导，不管有无气泡，冲洗毛细管端口
每月或需要时
检查旧毛细管的储存条件
每月或需要时
每年
维护工作
频率
对机器内部进行除尘清洁，光路校正等整体保养
每年或需要时
需要时
维工作
频率
清洁漏液托盘
需要时
更换毛细管
需要时
去除毛细管末端已经干掉的胶，使用双蒸水湿润的无纤维布
需要时
使用无屑的棉球沾上无水乙醇轻轻擦拭毛细管检查窗口两端
每季度或空间、光谱校正时
ABI3730xl型测序仪日常维护标准操作规程(SOP)
Epson WF-3730 产品说明书
IMPORTANT: Before using this product, make sure you read these instructions and the safety instructions in the online User’s Guide .The illustrations show the WF-3730, but the steps are the same for all models, unless otherwise specified.Note for Spanish speakers/Nota para hispanohablantes:Para obtener instrucciones de configuración en español, visite la página de soporte de su producto en /support (EE.UU.) o www.epson.ca/support (Canadá) y consulte la Guía de instalación (requiere una conexión a Internet).Important Safety Instructions: When using telephone equipment, you should always follow basic safety precautions to reduce the risk of fire, electric shock, and personal injury, including the following:• Do not use the Epson ® product near water.• Always keep this guide handy.• A void using a telephone during an electrical storm. There may be a remote risk of electric shock from lightning.• Do not use a telephone to report a gas leak in the vicinity of the leak.Caution: To reduce the risk of fire, use only a No. 26 AWG or largertelecommunication line cord.Note: Do not open the ink cartridge packages until you are ready toinstall the ink. Cartridges are vacuum packed to maintain reliability.1 Remove all protective materials from the product.6Lower the scanner unit.7 I approximately 5 minutes. When you see a completion message on the printer’s LCD screen, charging is complete.C aution: Don’t turn off the printer or raise the scanner unit whilethe printer is charging or you’ll waste ink.N ote:• T he printer is designed for use with Epson cartridges only, not third-party cartridges or ink.• T he cartridges included with the printer are designed for printer setup and not for resale. After some ink is used for charging, the rest is available for printing.• A s part of setup, your product’s serial number will be sent to a secure Epson server so that you can be eligible to participate in programs we may offer from time to time, including the Epson ink replenishment program. You will have a separateopportunity to consent to participating in such programs.1 M ake sure the product is done charging the ink, and thenclose the control panel, lift the output tray, and pull out apaper cassette.2 SNote: If you are using a Mac or your computer does not have a CD/DVD drive, an Internet connection is required to obtain the product software.To print from a Chromebook™, go to /support/gcp (U.S.) or www.epson.ca/support/gcp (Canada) for instructions.1 M ake sure the product is NOT CONNECTED to yourcomputer.Windows ®: If you see a Found New Hardware screen, click Cancel and disconnect the USB cable.2 I nsert the product CD (Windows only) or download andrun your product’s software package. For the latestsoftware, visit /support (U.S.) or www.epson.ca/support (Canada) and search for your product.3 F ollow the instructions on the computer screen to run the setup program.4 W hen you see the Select Your Connection screen, selectone of the following and follow the on-screen instructions:• Wireless connectionIn most cases, the software installer automaticallyattempts to set up your wireless connection. If setup is unsuccessful, you may need to enter your network name (SSID) and password.• Direct USB connectionMake sure you have a USB cable (not included).• Wired network connectionMake sure you have an Ethernet cable (not included).Mobile printingConnect wirelessly from your smartphone, tablet, or computer. Print documents and photos from across the room or around the world:• Print directly from your iOS device. Simply connect your device to the printer’s network and tap the action icon to print.• Use Epson Print Enabler (free from Google Play™) with Android™ devices (v4.4 or later). Then connect your printer and device to the same network and tap the menu icon to print.• Print remotely with Epson Connect™ and Google Cloud Print™. See your online User’s Guide for instructions or learn more at /connect (U.S.) or www.epson.ca/connect (Canada).3Insert paper with the glossy or printable side down.N ote: Make sure the paper is loaded against the front edge guide and not sticking out from the end of the cassette.4 S lide the edge guides against the paper, but not tootightly.5 K eep the cassette flat as you insert it all the way, thenlower the output tray.6Pull out the output tray extension.7 S elect the paper settings on the product’s control panel.For information on loading different paper types or envelopes, see the online User’s Guide .press Set Up Laterto set it up later.SupportVisit /support (U.S.) orwww.epson.ca/support (Canada) and search for your product to download drivers, view manuals, get FAQs, or contact Epson.Call (562) 276-4382 (U.S.) or (905) 709-3839 (Canada), 6 am to Need paper and ink?Ensure peak performance and brilliant results with Genuine Epson Ink and specialty papers, engineered specifically for Epson printers. Find Genuine Epson Ink and specialty papers at (U.S. sales) or www.epson.ca (Canadian sales) and at Epson authorizedresellers. Call 800-GO-EPSON (800-463-7766).WF-3730 Series replacement ink cartridgesEPSON and DURABRITE are registered trademarks, EPSON Exceed Your Vision is a registered logomark, and Epson Connect is a trademark of Seiko Epson Corporation.Designed for Excellence is a trademark of Epson America, Inc.Mac is a trademark of Apple Inc., registered in the U.S. and other countries. iOS is a trademark or registered trademark of Cisco in the U.S. and other countries and is used under license.Android, Google Cloud Print, Chromebook, and Google Play are trademarks of Google Inc.General Notice: Other product names used herein are for identification purposes only and may be trademarks of their respective owners. Epson disclaims any and all rights in those marks.CPD-55749This information is subject to change without notice. © 2018 Epson America, Inc., 5/18。
3730xl测序简介PPT课件
Templates
•
模板跳转转移机制
• 利用逆转录酶的末端转移酶活性，经巧妙设计而 成为有力武器。
2021/4/8
43
S M A R T M eth o d
P o ly A + R N A
P o ly A 3 1
51
GGG
M o d ifie d o lig o (d T ) P rim e r
F irs t-stra n d sy n th e sis c o u p le d w ith (d C ) ta ilin g b y R T
胞
• 粘质粒载体（cosmid)
具有质粒和λ噬菌体两种载体的性质
• 人工染色体
能容纳大片段的外源DNA。如YAC(酵母人工染色体），BAC(细菌人工 染色体），PAC(P1来源的人工染色体），MAC（哺乳动物人工染色体）
2021/4/8
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各种克隆载体的比较
载体
pUC18/19质 粒 λ噬菌体 粘质粒 BAC PAC YAC
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Top beam Blocked
Bottom Beam Blocked
Both Beams 21
检测：光栅+低温CCD
同步成像
低温CCD实时检测
支持4色或5色以上荧光，适用于多种商品化试剂盒。
更新荧光化学时无需更换任何硬 件设备
低温CCD有效提高信噪比，准确度高。
光栅全波长分光
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14
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15
Capillary
2021/4/8
16
3730xl测序仪的特点
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17
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samson 3730系列电气阀门定位器 安装说明
EB 8384-4 ZH13730系列 电气阀门定位器 3730-4型PROFIBUS-PA 通信 图1：3730-4型 安装与操作说明 EB 8384-4 ZH固件版本K 1.12/R 1.45 2008年7月版EB 8384-4 ZH 2目录目录页码1 设计与工作原理 (9)1.1 附加的设备 (10)1.2 通信 (10)1.3 技术数据 (11)2 装配到控制阀-安装件和附件 (14)2.1 直接集成装配 (18)2.1.1 3277-5型执行器 (18)2.1.2 3277型执行器 (20)2.2 根据IEC60534-6标准进行装配 (22)2.3 装配到3510型微流量控制阀 (24)2.4 装配到角行程执行器 (26)2.5 用于双动作执行器的反向放大器 (28)2.5.1 安装压力表 (28)2.6 安装一个分体式阀位传感器 (30)2.6.1 直接集成安装阀位传感器 (30)2.6.2 根据IEC60534-6标准安装阀位传感器 (30)2.6.3 将阀位传感器安装到3510型微流量控制阀 (32)2.6.4 将阀位传感器安装到角行程执行器 (34)2.7 安装有不锈钢壳体的定位器 (36)2.8 单动作执行器的吹扫气功能 (36)3 连接 (38)3.1 气动连接 (38)3.1.1 信号压力表 (38)3.1.2 供气压力 (38)3.2 电气连接 (40)3.2.1 建立通讯 (42)4 操作 (44)4.1 使用调整和显示 (44)4.2 确认和选择参数 (46)4.3 操作模式 (47)4.3.1 自动及手动操作模式 (47)4.3.2 SAFE—故障-安全位置 (48)5 启动与设置 (48)5.1 确定故障-安全位置 (49)EB 8384-4 ZH 3目录5.2 设置输出气量限制Q (49)5.3 调整显示方向 (50)5.4 信号压力限制 (50)5.5 检查定位器的工作范围... (50)5.6 初始化 (52)5.6.1 初始化模式 (54)5.7 出错/故障 (60)5.8 零点校正 (61)5.9 复位到默认值 (61)5.10 通过本机接口启动（SSP） (62)5.11 设定总线地址 (62)6 状态和诊断报警 (64)6.1 标准版EXPERT自诊断 (64)6.2 增强版EXPERT＋自诊断 (64)6.3 状态报警的分类和缩写状态 (65)7 调整限位开关 (68)8 快速启动指南 (69)8.1 安装 (69)8.2 启动 (70)8.3 初始化 (71)8.3.1 最简单的方法（M A X） (71)8.3.2 精确方法（NOM） (71)8.3.3 手动方法（MAN） (72)9 安装感应限位开关 (73)10 维护 (74)11 防爆型设备的维护 (74)12 PROFI BUS-PA通信 (75)12.1 综述 (75)12.2 循环数据交换 (75)12.2.1 GSD文件 (76)12.2.2 数据交换 (77)12.2.3 应用在PC37控制系统上 (81)12.2.4 定位器启动常规指导 (81)12.3 CHE CKBACK-设备状态 (81)EB 8384-4 ZH4目录 12.4 所测量数值的状态编码 (83)12.4.1 行规 3.01的状态报警 (83)12.4.2 行规 3.01的状态报警的缩写状态 (87)12.5 带PROFIBUS-DP的自诊断 (92)12.6 非循环数据交换 (98)13 通过TROVIS-VIEW软件设置 (99)13.1 概述 (99)13.1.1 系统要求 (99)13.2 TROVIS-VIE W 软件的安装 (100)13.3 启动TROVIS-VIEW和完成基本设置 (101)13.4 数据传输 (103)13.4.1 离线操作（间接的数据传送） (104)13.4.2 在线操作（直接的数据传输） (104)13.4.3 设定参数 (105)13.5 初始化定位器 (107)14 附录 (110)14.1 代码表 (110)14.2 参数表 (130)15 尺寸mm (184)鉴定证书 (185)EB 8384-4 ZH 5定位器版本修改阀门定位器软硬件版本修改通信旧版本新版本K 1.00 K 1.01内容修改K 1.01 K1.10FEATURE_SELECT参数支持以下设定：激活的诊断功能可以通过GOOD_FUNCTION_CHECK或BAD_FUNCTION_CHECK来报告K1.10 K1.11-更多数据记录状态显示（见144页）-更多附加功能（FEATURE_SELECT）(见144页)-可以按照需求定义离散的阀位（POS_D_LIMIT_LOW,POS_D_LIMIT_UP）（见75页）K1.11 K1.12重新设置设别参数会将控制器内的所有参数复位。
ABI_3730xl测序仪简介-01
基因分型
2008年基因分型样本量为30000个； STR,SNP,CNV遗传标记
ABI 3730xl测பைடு நூலகம்仪简介
生物医学研究院 5楼 联系电话：54237651 联系人：夏明英，李士林
主要特性（一）
- 内置一体化自动进样器及样品孔打孔装置； - 内置样品板条形码自动识别； - 100次（9600个样品）运行试剂一次上机； - 自动碱基识别与质量评分判定； - 动态铂金内镀毛细管壁；
12406G
4833T 10646G 4491C
7028T
12705T 14569G
5301T 15607A 9824A 5178A
4715T 5417G 3010T 4216T 663A 11719A
3730xl的总结
基因检测：
2008年对4万个样本进行测序
检测碱基数达到2千4百万个
现可检测的PCR产物长度为600-1000bp
- 氩离子激光光源； 实现实时的、空间连续的测量；可以保证返回的光信息能够达到探测的量级。 激发波长为488nm和514.5nm
毛细管规格: 96道毛细管 毛细管长度: 50cm 凝胶的规格: POP-7液体分离胶
配套的试剂: 基因测序(BigDye3.1v和5×Sequence buffer)
1000样本
10小时
测序的原理
DNA测序的双脱氧链末端合成终止法. Sanger法测序的原理：
用DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物，直到掺入一种链终 止核苷酸为止。 每一次序列测定由一套四个单独的反应构成，每个反应含有所有四种脱 氧核苷酸三磷酸(dNTP)，并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸 (ddNTP)。 由于ddNTP缺乏延伸所需要的3‘-OH基团，使延长的寡聚核苷酸选择性地 在G、A、T或C处终止，终止点由反应中相应的双脱氧而定。每一种 dNTPs和ddNTPs的相对浓度可以调整，使反应得到一组长几百至几千碱 基的链终止产物。 它们具有共同的起始点，但终止在不同的的核苷酸上，可通过高分辨率 变性凝胶电泳分离大小不同的片段进行检测。
3730系列电气阀门定位器使用手册
M
50
L
70
L
100
XL
200
表1
直接装配到 3277-5 型执行器
订货号
安装件 用于膜片有效面积 120cm2 的执行器，见图 4
1400－7452
切换板(旧)用于 3277-5xxxxxx.00 型执行器(旧),见图 4
1400－6819
切换板(新)用于 3277-5xxxxxx.01 型执行器(新)
要求的供气压力在 1.4 到 6 巴之间。作为 参考变量的电流输入信号应在 4 到 20mA。
定位器可以直接装配在 3277 型执行器 上，或符合 IEC60534-6（NAMUR）标准 装配到相应的执行器上。每种方式都有相 应的安装件。
3730-0 型定位器主要由阀位传感器（阀 位—电阻线性转换）、模拟量电气转换器 和气动放大器以及模拟控制器等部件组 成。
连接…………………………………………………………..23 气动连接……………………………………………………..23 信号压力表…………………………………………………..24 供气压力……………………………………………………..24 电连接………………………………………………………..25
操作…………………………………………………………..27 操作员控制…………………………………………………..27
2 EB 8384-0 ZH
目录
5.12 6 7 8
激活紧闭关断功能……………………………………………….30 维护……………………………………………………………..31 防爆装置的维修………………………………………………..31 尺寸（单位：mm）……………………………………………..32 检测证书…………………………………………………….…33
Snapshot技术平台中文
S n a p s h o t技术平台中文文档编制序号：[KKIDT-LLE0828-LLETD298-POI08]Snapshot技术平台SnaPshot技术平台是Applied Biosystems,ABI公司推出了专为检测 SNP 设计的分析软件和试剂盒可对多个 SNP 位点同时进行基因分型 ,也被称为 minisequencing 。
该方法针对不同突变位点设计不同长度的引物SNaPshot 反应后 ,产物通过电泳分离、五色荧光检测、Gene mapper 分析 ,可在一次电泳胶内检测多个 SNP位点。
这个平台是建立在3730，3130等PCR测序仪上的技术。
3730XL型DNA序列检测仪一. SnaPshot工作原理应用 SNaPshot 进行定点的序列分析 ,其基本原理遵循了DNA 直接测序中的双脱氧终止法 ,所不同的是 PCR 反应中只有不同荧光标记的ddNTP。
由于每个 SNP 位点的引物 3′端都紧靠SNP点 ,因此每一种引物在聚合酶作用下 ,根据模板的的序列 ,只延伸一个核苷酸。
然后用先进的荧光检测系统 ,检测延伸的那个核苷酸的种类。
1．多重SNaPshot反应的工作原理：在一个SNaPshot反应体系中，针对每个待测SNP 位点在其上游或下游设计一条单向的寡核苷酸引物（正向引物或反向引物），引物的Tm 值要求在50度以上，在 AmpliTaq聚合酶和 4种不同荧光标.记的ddNTP存在的情况下,各条引物与各自互补的DNA 模板结合, 聚合酶在引物的3’末端延伸单个碱基反应即告终止,产物的长度为引物长度+1bp。
延伸的碱基就是该样本在该位点上的基因型，其中纯合子表现为单峰，杂合子表现为双峰。
为了能够分辨不同SNP的不同基因型，可在引物的5’末端加上不同长度的Poly C 或Poly T，使各条引物以长度区分。
经电泳将其分开。
最短的引物一般设定为20bp, 相邻两个SNP的引物之间长度一般相差 4-6个核苷酸，以便区分。
快速启动指南 XL370 XL375说明书
XL370/XL375Note * In multi-handset packs, there are additional handsets, chargers and power adapters.** In some countries, you have to connect the line adapter to the line cord, then plug the line cord to the telephone socket.Caution Use only the supplied batteries • and power adapter.What’s in the box*****User manual Quick start guide Guarantee1Connect2Install3 EnjoyCallT o make a call, press • and dial the phone number.T o answer a call, press • when the phone rings.T o end a call, press • .Adjust the earpiece volume Press or to adjust the volume during a call.Add a contact in the phonebook Press 1 MENU .Select 2 [PHONEBOOK] > [NEW ENTRY], then press [OK] to confirm.Enter the name then press 3 [OK] to confirm.Enter the number, then press 4 [OK] to confirm.Record an announcement (for XL375 only)Press 1 MENU .Select 2 [ANSWER MACHINE] > [ANNOUNCEMENT], then press [OK] to confirm.Select 3 [ANSWER & REC.] or [ANSWER ONLY], then press [OK] to confirm.Select 4 [RECORD], then press [OK] to confirm.Start recording close to the microphone after the beep.5 Press 6 [OK] to stop recording.Y ou can listen to the newly recorded »announcement on the handset.Need help?User ManualRefer to the user manual that came with your new phone.Online help /supportWelcome to PhilipsRegister your product at /welcome Reproduction in whole or in part is prohibited without the written consent of the copyright owner.Trademarks are the property of Koninklijke Philips Electronics N.V. or their respective owners.© 2009 Koninklijke Philips Electronics N.V. All rights reserved.Printed in China QSG_XL370-375_05_EN_V1.11WK9491 0168。
SAMSON 3730-2、4调节阀定位器基本操作
态动作，则已启用的可组态状态将转为不允许组态，显示恢复为代码
0。
编辑课件
16
• 自动及手动操作模式
初始化之前，若定位器未初始化，则不能选择AUtO 自动操
作模式。只能手动操作定位器为控制阀定位。步骤为：顺时针转动
旋钮按钮至显示代码1，按下旋钮按钮，确定代码1。若代码数字与
连接在网段里的每台定位器都必须分配一个唯一的在0 到125 之间的
总线地址。在循环数据交换期间，定位器新设定的地址被保存并且在
循环数据交换完成之后被接受。
编辑课件
27
四、常见故障处理
• 故障/出错
定位器将所有状态和出错报警进行分类处理。为了更号概
况，定位器的分类的报警信息归纳为缩写状态
编辑课件
28
化模式MAX，NOM，MAN 或者SUb 来启动初始化。
• MAX – 基于最大行程范围的初始化
定位器确定行程/转角，其范围是从全关（CLOSED）位置到相反
的另一端，并且采用该行程/转角作为从0 到100%的工作范围。
编辑课件
21
• NOM – 基于工作行程范围的初始化
用于最大行程比额定行程范围更大的控制阀。对于该种初始化
根据当前显示，转动旋钮按钮至代码3 和OFF 出现。按一下
确认，代码3 闪烁。转动旋钮按钮至显示屏上显示ON。按下旋钮按钮，
确定设置。在显示屏上出现允许组态符号表明允许组态。现在可以转
动旋钮按键，按照任何需要的次序调整控制阀的代码、参数及数值。
然后按下按钮，确定设置。
编辑课件
15
要取消刚刚按照代码输入的数值，转动旋钮按钮至代码4至
最新3730xl测序仪简易维护汇总
低温CCD实时检测
支持4色或5色以上荧光，适用于多种商品化试剂盒。 更新荧光化学时无需更换任何硬 件设备 低温CCD有效提高信噪比，准确度高。
光栅全波长分光
3730xl型遗传分析仪
Fully Integrated System
• 双光束激光实时激发荧光 • 全波长实时荧光检测：光栅分
光，后置超簿型CCD检测 • 96个样品自动进样及一体化16
ACGT
ACCGTCTTGACCTCGTACGCATGA
ACCGTCCTGACCTCGTACGCATGA
杂合子检测：发现新突变位点
再测序
• 人类基因组计划的完成，为遗传分析开创了新 的研究领域
• 其他物种的测序项目已经启动 • 再测序项目的特点
– 可以更好的理解遗传多样性在疾病中的作用 – 可以在各种规模的实验室中进行，而不是仅
➢ 基因表达定量
TaqMan探针法与荧光染料法类型及特点基因（Gene L心 – 要求更高质量的数据
基因分析技术
在生物、医学、农牧业领域的应用
➢ DNA测序
人类功能基因再测序 细菌、真菌等微生物鉴定； HLA配型 基因突变检测
➢ SNP检测
SNaPshot Multiplex SNPlex 二重TaqMan探针
➢ 片段分析
基于STR的法医个体识别与亲子鉴定：HID 基于STR的致病基因连锁定位：LMS 基因突变筛选 ：SSCP 农牧业育种：AFLP
各种克隆载体的比较
载体
pUC18/19质 粒 λ噬菌体 粘质粒 BAC PAC YAC
受体细 胞
E.coli
E.coli E.coli E.coli E.coli 酵母细胞
结构
3730XL 测序仪器操作指南说明书
3730XL 测序仪器操作指南开机：（1）打开显示器和电脑的电源开关，按键Ctrl+Alt+Delete ，输入密码125；（2）打开仪器电源开关，仪器初始化过程中电源旁指示灯由黄色闪烁20秒变为绿色；（3）双击打开桌面上Data Collection 软件，等待Service Console 窗口中的指示灯全部变成绿色后，DC 软件打开弹出。
关机：（1）与开机顺序相反，先点击Service Console 窗口上Stop ALL 按钮，等4个绿色小方框都变为红色圆圈时即可点击“X ”，关闭Run 3730 Data Collection 软件；（2）关闭仪器电源；（3）关闭电脑主机。
测序模板导入：（1） 当Data Collection 软件打开后，点击GA Instruments 3730, 点开“+”号；（2） 然后点击plate manager ，点击import 导入已经编辑好的模板（E:/plate manager ），最后点击open 就ok 了。
E: Plate manger (如何编辑模板)A. Copy 上一个编辑好的模板，按当天日期修改文件名（如20150630）B. 双击点击“是”（激活窗口点“关闭”）C. 将打开的EXCEL 表格中Container Name 和ID Plate 改为文件名（20150630）D. 将Sample Name 先修改为blankE.按列的顺序依次输入A1H1……A2H2，以此类推，空白孔不改，仍为blankF.点击左上角保存，点击是，跳出窗口G.点击右上角“X”关闭，跳出的窗口点击“不保存”运行程序：（1）打开Data Collection软件中的run schedule search advanced plate ID start with（例如20150630找到相应的测序表）点击add Done；（2）当软件左上方三角星由灰色变为绿色时，点击ok就开始运行程序，大约测序反应需要2.5小时，微卫星分析需要1小时。
ABI 3730xl测序仪简介-01
基因分型
2008年基因分型样本量为30000个； STR,SNP,CNV遗传标记
测序的原理
DNA测序的双脱氧链末端合成终止法. Sanger法测序的原理：
用DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物，直到掺入一种链终 止核苷酸为止。 每一次序列测定由一套四个单独的反应构成，每个反应含有所有四种脱 氧核苷酸三磷酸(dNTP)，并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸 (ddNTP)。 由于ddNTP缺乏延伸所需要的3‘-OH基团，使延长的寡聚核苷酸选择性地 在G、A、T或C处终止，终止点由反应中相应的双脱氧而定。每一种 dNTPs和ddNTPs的相对浓度可以调整，使反应得到一组长几百至几千碱 基的链终止产物。 它们具有共同的起始点，但终止在不同的的核苷酸上，可通过高分辨率 变性凝胶电泳分离大小不同的片段进行检测。
- 氩离子激光光源； 氩离子激光光源； 实现实时的、空间连续的测量；可以保证返回的光信息能够达到探测的量级。 激发波长为488nm和514.5nm 毛细管规格: 毛细管规格 96道毛细管 道毛细管 毛细管长度: 毛细管长度 50cm 凝胶的规格: 凝胶的规格 POP-7液体分离胶 液体分离胶 配套的试剂: 基因测序(BigDye3.1v和5×Sequence buffer) 配套的试剂 基因测序 和 × 基因分型(Liz120, Liz500, ROX500) 基因分型
SNP遗传标记在SnapSHot反应的结果
原理： 单碱基延伸,单碱基测序.利用延伸引物对PCR产物进行单个碱基的延伸,并引 入尾部的荧光.其荧光的颜色及其荧光出现的位置进行区分其基因型 SnapSHot技术优点： 可以研究样本量少,snp位点多,位点间物理距离较远的SNP检测.
13010G
13263A
GeneMapperV4.1_中文说明书
第一节 GeneMapper V4.1 综述
GeneMapper 软件支持各种以片段分析为基础的基因分型应用,例
如 Microsatellite Analysis、SNaPshot Analysis、AFLP Analysis、LOH
Analysis。GeneMapper 软件支持 Applied Biosystems (part of
选择 Microsatellite Default
选择显示 plot 数
通过拖拉放大图例
第四节 SNaPshot 分析流程
SNaPshot 是同时检测多达 10 个 SNP 位点的一种方法，来自 SNaPshot 数 据 如 何 在 GeneMapper 软 件 里 进 行 分 析 ， 下 面 介 绍
SNaPshot Kit SNaPshot 点击 OK，软件界 面显示右测的形式
然后选准 SNaPshot Kit，点击 File>New Panel，在 Panel Manager 右侧 New Panel 处输入 SNaPshot 6Plex Panel,接着点击 Bins>New Bin Set 进入 New Bin Set 对话框，在 New Bin Set 对话框输入 SNaPshot Bin Set 并点击 OK，再点击 Bins>Add Reference Data 把 SNaPshot Ref Data Project 里 SNaPshot 数据导入。接下来选准 SNaPshot 6Plex Panel，点 击 Bins>Panel Reference Data 把 SNaPshot 数据导入。
表格显示形式。 在 Analysis Method 栏，选择 New Analysis Method,在 New Analysis Method 对话框中选择 Microsatellite，点击 OK。然后在 Analysis Method 编 辑 对 话 框 中 有 5 个 分 项 ， 分 别 为 General （ 在 Name 处 输 入 Microsatellite Analysis Method）、Allele（在 Bin Set 处选择 None,其他 保持默认）、Peak Detecto（r 在 Peak Detection Algorithm 处选择 Basic）、 Peak Quality（在 Homozygous min peak height 处输入 140.0，在 Heterozygous min peak height 处输入 85.0，在 Min peak height ratio 处 输入 0.4,其他保持默认）、Quality Flag（所有保持默认），点击 OK 保 存 Analysis Method。在 Panel 栏选择前面创建好的 Microsatellite Panel。 在 Size Standard 栏选择正确的内标 GS500(-250)LIZ。并确保所有的样 品 选 择 对 应 的 Analysis Method 、 Panel 以 及 Size Standard 。 在 GeneMapper 操作界面顶部 Table Setting 下拉菜单中选择 Microsatellite Default。然后点击 File>Save Project,在 Save Project 对话框中输入 Microsatellite Project。 第五步：进行初始分析，初始分析的目的有五个，一是分析 Project， 二是查看 SQ 和有贡献的 PQV（ 标记表示通过， 需要检查， 表示失败），三是检查 Size Standard（查看 SQ 值、内标峰、内标峰标 记以及 Size Calling Curve），四是查看样品信息，五是查看样品图。 第六步：创建 Bin Set 并自动生成 Bin。点击 Tools>Panel Manager,进 入 Panel Manager 操作界面，选准 Microsatellite Kit,点击 Bins>New Bin Set,在 New Bin Set 对话框中输入 Microsatellite Bin Set 并点击 OK。确
微卫星序列分析GeneMapper 使用教程(中文版)
ABI PRISM® GeneMapper™ Software Version 3.0微卫星分析使用教程（中文版）SSR条带读取设置向导© Copyright 2002, Applied Biosystems. All rights reserved.For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.Information in this document is subject to change without notice. Applied Biosystems assumes no responsibility for any errors thatmay appear in this document. This document is believed to be complete and accurate at the time of publication. In no event shallApplied Biosystems be liable for incidental, special, multiple, or consequential damages in connection with or arising from the useof this document.Notice to Purchaser: License DisclaimerPurchase of this software product alone does not imply any license under any process, instrument or other apparatus,system, composition, reagent or kit rights under patent claims owned or otherwise controlled by Applera Corporation,either expressly, or by estoppel.TRADEMARKS:ABI PRISM and its design, Applied Biosystems, GeneScan, Genotyper, SNaPshot, LIZ, and VIC are registered trademarks ofApplera Corporation or its subsidiaries in the U.S. and certain other countries.AB (Design), ABI, Applera, GeneMapper, NED, PET, ROX, and 6-FAM are trademarks of Applera Corporation or its subsidiariesin the U.S. and certain other countries.Macintosh is a registered trademark of Apple Computer, Inc.All other trademarks are the sole property of their respective owners.Part Number 4335525 Rev. B09/2002目录：第一章总论关于微卫星分析使用教程------------------------1-1数据提供---------------------------------------------1-2操作流程---------------------------------------------1-3第二章创建Custom Kits，Panels，and Markers 操作流程--------------------------------------------2-1创建Kits，Panels，and Markers----------------2-2第三章运用Panels，Bins进行数据分析操作流程--------------------------------------------3-1导入Panels------------------------------------------3-2导入和设定相关数据------------------------------3-3创建Bits---------------------------------------------3-4附录：Panel，Bin结构认识总论本章内容主要包括：关于微卫星分析使用教程-----------------------1-1数据提供--------------------------------------------1-2操作流程--------------------------------------------1-3关于微卫星分析使用教程概述：微卫星分析方法可以让您高效快速的运用ABIPRISM®GeneMapper™ Software Version 3.0.对微卫星进行分析目标：通过学习微卫星分析方法，您可以●建立GeneMapper 分析项目●导入样本文件进行数据分析●利用自动bin功能创建bin如何使用此教程：当您按照后面几个章节中的流程操作时，切记：●按照顺序进行每一步操作●不要导入其他无关样本和bins所有的操作过程都按照菜单操作方式编写，如：选择Tools > GeneMapper Manager当然您也可以点击工具菜单上的快捷按钮教程中的术语：教程中使用以下术语表格1-1 术语和定义表格1-1 术语和定义数据提供概述：GeneMapper Software Version 3.0包括以下数据Panel 信息：主要提供：●LMS-HD5 Version 2.5 and LMS-MD10 Version 2.5 kits●GeneScan™ Installation Standard DS-33 (6-FAM™, VIC®,NED™, and PET™ dyes)●GeneScan™ Installation Standard DS-30 (6-FAM™, HEX™,NED™, and ROX™ dyes)●This tutorial注意：更多信息请阅读您说使用的Kit所对应Panel信息，若要需要创建Custom Kit，请阅读第二章Bin 信息：Bin 信息对应GeneScan Installation Standard DS-33, 采用GeneScan™ 500LIZ_3730 标准，只用于Applied Biosystems3730/3730xl DNA Analyzer默认设置：提供下列默认设置表1-2 默认设置带型标准设置：为微卫星数据分析提供下列带型标准：●GeneScan™ 400HD size standard●GeneScan™ 500 size standard●GeneScan™ 500 (-250) size standard●GeneScan™ 500 (-250) LIZ® size standard●GeneScan™ 500 LIZ® size standard注意：可以设定用户带型标准，阅读ABI PRISM® GeneMapper™Genotyping Software User’s Manual (PN 4335526). 样本文件：本教程提供四种微卫星样本文件，它们均采用5个客户PETmarker ，利用LMSMD-10 panel 9在3100型仪器上产生操作流程：分析微卫星数据：以下表格为运用GeneMapper 软件分析微卫星数据的流程概述，请链接相关章节，阅读详细流程。
37303730xl中文简明使用手册(40页)
Step3：上样前设置
3A. 确认下胶块，泵胶块，胶块连接管及胶管已安装到位 3B. 确认阴极Buffer，Water，Waste槽的液面不低于刻度线（约80ml） 并已安装到位 3C. 确认阳极Buffer杯中液面不低于刻度线（约67ml）并已安装到位 3D. 确认毛细管已安装到位，空间定位已完成 3E. 确认Dye Set相应光谱校正已完成 3F. 确认样品已正确放置于样品舱内 3G. 在Plate Manager内编辑样品板，准备上样
CCD检测器把检测到的荧光信号转换为电信号，并把它传送给安装了Data Collection（简称 DC）软件的计算机工站。工作站接收到信号后，用预先设置好的方式进行初步处理，并把 这些数据存贮在计算机的数据库里
7. 自动数据提取和分析
工作站会自动地从数据库中提取这些数据，并根据不同的运行模式，完成对样品DNA的碱 基序列或片段信息的分析，然后把分析完成后的结果数据以样品文件的形式保存于计算机的 硬盘中
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Applied Biosystems 3730/3730xl DNA Analyzer 简明使用手册 白色固定器 灰色橡胶垫 溶液槽盖 溶液槽
可加热基座
普通基座
供电接头
Water/Waste 槽组件
Buffer/Water/Waste槽组件组装示意图 注意： 1. 组装溶液槽盖的时候，注意周围的橡皮垫正确安装
黄灯闪烁
红灯长亮
·确认已进入Windows界面 ·确认网线连接正确 ·确认仪器门已关闭 ·确认各溶液槽位置正确 ·确保电脑名未更改，否则请改回原电脑名 ·确保电脑防火墙已关闭 · 确 保 电 脑 与 仪 器 连 接 的 IP 地 址 为 ： 192.168.0.1 ·确保电脑用于通讯的用户名3730User，密码 为3730User，并且设置为永不过期 ·确认仪器门及加热炉门已关闭 ·确认毛细管及缓冲液槽已安装
3730系列数字式电气阀门定位器3730-3型HART通信安装与操作说明说明书
3730系列数字式电气阀门定位器 3730-2型2008年9月版EB 8384-3 ZH固件（软件和硬件）版本 1.5x 图1 · 3730-3 型3730系列 数字式电气阀门定位器 3730-3型HART ®通信安装与 操作说明 翻译原文 原文已更新本手册中关键词的定义2 EB 8384-3 ZH 2008年9月版目录目录 页1 重要的安全说明 (8)2 型号代码 (9)3 结构和工作原理 (10)3.1 应用类型 (11)3.2 附加设备 (12)3.3 通信 (13)3.3.1 使用TROVIS-VIEW软件组态 (13)3.4 技术数据 (14)4 装配到控制阀-安装件和附件 (18)4.1 直接集成安装连接 (20)4.1.1 安装到3277-5型气动执行机构 (20)4.1.2 安装到3277型气动执行机构 (22)4.2 按照IEC 60534-6（NAMUR）标准安装连接 (24)4.3 安装到3510型微流量控制阀 (26)4.4 安装到角行程气动执行机构 (28)4.5 用于双作用气动执行机构的反向气动放大器 (30)4.5.1 安装压力表 (30)4.6 安装分体式阀位传感器 (30)4.6.1 直接集成安装连接方式的阀位传感器安装 (32)4.6.2 按IEC 60534-6标准装配连接方式的阀位传感器安装 (34)4.6.3 3510型微流量控制阀的阀位传感器安装 (35)4.6.4 角行程气动执行机构的阀位传感器安装 (36)4.7 安装不锈钢外壳的阀门定位器 (37)4.8 用于单作用气动执行机构的吹扫气功能 (37)4.9 所需的安装件和附件 (38)5 连接 (42)5.1 气动连接 (42)5.1.1 信号压力表 (42)5.1.2 气源压力 (42)5.1.3 信号压力（输出） (43)5.2 电气连接 (43)5.2.1 隔离放大器 (45)5.2.2 建立通信 (46)6 使用操作和显示 (48)6.1 串行接口 (50)6.2 HART®通信 (50)EB 8384-3 ZH 2008年9月版 3目录7 启动-设置 (51)7.1 确定故障-安全位置 (51)7.2 设定输出气量限制Q (52)7.3 显示读数方向调整 (52)7.4 输出信号压力限制 (53)7.5 检查阀门定位器工作范围 (53)7.6 初始化 (54)7.6.1 MAX-基于最大行程范围的初始化 (56)7.6.2 NOM-基于工作行程范围的初始化 (57)7.6.3 MAN-基于手动选择范围的初始化 (58)7.6.4 SUb在线替换校验 (59)7.7 零点校验 (62)7.8 对开/关型控制阀设置 (63)7.9 复位到缺省值 (65)8 操作 (66)8.1 确认和选择参数 (66)8.2 操作模式 (67)8.2.1 自动和手动模式 (67)8.2.2 故障-安全位置（SAFE） (68)8.3 故障/维护报警 (68)8.3.1 确认出错信息 (69)9 调整阀位开关 (70)9.1 加装感应式阀位开关 (72)10 维护 (73)11 维护防爆型设备 (73)12 代码表 (74)13 使用TROVIS-VIEW软件设置 (99)13.1 概述 (99)13.1.1 系统要求 (99)13.2 安装TROVIS-VIEW软件 (100)13.3 启动TROVIS-VIEW和基本设置 (101)13.4 数据传输 (103)13.4.1 离线操作（间接传输数据） (104)13.4.2 在线操作（直接传输数据） (104)13.4.3 设置参数 (105)13.5 初始化阀门定位器 (107)13.6 状态分类 (109)4 EB 8384-3 ZH 2008年9月版目录14 尺寸（mm） (111)15 控制阀特性选择 (112)检验证书 (114)注：EXPERT plus控制阀自诊断的功能在安装与操作手册EB 8389 ZH中叙述。
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7. 自动数据提取和分析
工作站会自动地从数据库中提取这些数据，并根据不同的运行模式，完成对样品DNA的碱 基序列或片段信息的分析，然后把分析完成后的结果数据以样品文件的形式保存于计算机的 硬盘中
激光管散热风扇
数据线接口
仪器主电源
激光管散热风扇不能被堵塞！ 3. 主要部件功能
电源开关：打开或关闭仪器电源； 照明灯开关：打开或关闭仪器内部的照明灯； 进样器按钮：使进样器抓取缓冲液槽到毛细管针端（或相反）； 样品舱：放置等待上样的样品； 阳极缓冲液杯：内装1X缓冲液（约67ml），电泳时作为阳极介质； 缓冲液槽：装1X缓冲液（约80ml），电泳时作为阴极介质； 水槽/废液槽：装去离子水，清洗毛细管用或放置废胶； 泵胶块：泵入胶并将其灌入毛细管； 下胶块：上装有阳极，阳极缓冲液杯装在此处； 恒温加热炉：保证电泳时，毛细管处于一个均一、稳定的温度环境中； 数据线：不是普通Ethernet网线，有一定方向性，主要用于仪器和电脑通讯
Buffer 槽组件
2. 组装灰色橡胶垫和白色固定器的时候，注意橡胶垫要平整以及进样孔要对齐
3. 1XBuffer在2~8℃可保存1个月，室温为1个星期 4. 建议24至48小时或每次实验前，更换Buffer及去离子水，以保证良好的实验灵敏度
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Applied Biosystems 3730/3730xl DNA Analyzer 简明使用手册
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Applied Biosystems 3730/3730xl DNA Analyzer 简明使用手册 B 安装毛细管
· 打 开 Data Collection 软 件 ， 选 择 在 GA Instruments > ga3730 > instrument name ·在菜单栏里选择Wizards> Install Array Wizard ·根据向导提示，完成毛细管的安装 ·运行空间定位（Spatial Calibration），校正毛细管 的位置 注意： 1. 安装毛细管的全程需要带无粉手套 2. 不要拉扯毛细管 3. 拆下来暂时不用的毛细管需要使用原始包装保 存，毛细管末端放在缓冲液槽及玻璃小瓶中，使用 1XBuffer浸泡，使用保护罩保护毛细管的检测窗口
（加热炉内的） Capillary Array
毛细管整列
照明灯开关 状态指示灯
电源开关
进样器 按钮
缓冲液槽 水槽 Buffer Water
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样品舱门
加热炉门
废液槽 Waste 样品舱门 指示灯
2. 仪器后视图
Applied Biosystems 3730/3730xl DNA Analyzer 简明使用手册 仪器通风散热风扇
启动3730/3730xl DNA Analyzer流程
Step 1：启动电脑系统
1A. 打开显示器电源 1B. 打开电脑电源，直至出现登录界面 1C. 输入Windows操作系统用户名及密码
Step 2：启动仪器
2A. 确认电脑系统已经启动 2B. 确认仪器
·加热炉门已关闭 ·仪器门已关闭 ·样品舱门已关闭 ·Buffer，Water，Waste槽已安装
是
编制片段分析样品板 第 31 页
上机运行 第 35 页 结果分析，参考相关手册
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Applied Biosystems 3730/3730xl DNA Analyzer 简明使用手册
一、DNA 测序或片段分析的流程
1. 样品制备
样品制备即是在DNA片段上用化学的方法标记 荧光素。 标记上荧光素后就可以对DNA片段进 行检测和确认了，一般每一 DNA分子标记一个 荧光素分子，最多有五种荧光素可用于DNA样品 的标记。 不同的样品制备方法选用不同的荧光 素和试剂的组合，样品制备可在96孔或384孔板 进行
毛细管安装图解
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Applied Biosystems 3730/3730xl DNA Analyzer 简明使用手册
C 更换POP胶（3730系列仅支持POP7胶）
·打开Data Collection软件，选择在 GA Instruments
> ga3730 > instrument name
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Applied Biosystems 3730/3730xl DNA Analyzer 简明使用手册 白色固定器 灰色橡胶垫 溶液槽盖 溶液槽
可加热基座
普通基座
供电接头
Water/Waste 槽组件
Buffer/Water/Waste槽组件组装示意图 注意： 1. 组装溶液槽盖的时候，注意周围的橡皮垫正确安装
荧光信号
电信号
DC 软件数据库
结果文件
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Applied Biosystems 3730/3730xl DNA Analyzer 简明使用手册
8. 结果
分析好的样品文件可以用序列分析软件或片段分析软件来打开查看结果，如有必要，这些数 据可以改用不同的分析参数进行重新分析。 电泳信号图的X轴表示时间，Y轴表示相对荧光 强度，图上不同颜色的信号线代表了样品制备时所使用的不同的荧光素（对于测序结果，每 种颜色代表一种碱基），图中的每个峰代表一个DNA片段
5. 激发和检测
当标记有荧光素的DNA片段移动到检测窗口时，荧光素受到激光束的激发而产生荧光信号， 此荧光信号被CCD检测器所检测并被转化为电信号传递到计算机
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Applied Biosystems 3730/3730xl DNA Analyzer 简明使用手册
6. 数据采集和处理
黄灯闪烁
红灯长亮
·确认已进入Windows界面 ·确认网线连接正确 ·确认仪器门已关闭 ·确认各溶液槽位置正确 ·确保电脑名未更改，否则请改回原电脑名 ·确保电脑防火墙已关闭 · 确 保 电 脑 与 仪 器 连 接 的 IP 地 址 为 ： 192.168.0.1 ·确保电脑用于通讯的用户名3730User，密码 为3730User，并且设置为永不过期 ·确认仪器门及加热炉门已关闭 ·确认毛细管及缓冲液槽已安装
·关闭仪器，30秒后重新启动 ·打开Data Collection软件，在
GA Instruments >
ga3730 >
instrument name > Instrument Status > Event Log察看日志中的信息 ·联系AB技术支持
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Applied Biosystems 3730/3730xl DNA Analyzer 简明使用手册 ·点击桌面Data Collection软件快捷方式
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Applied Biosystems 3730/3730xl DNA Analyzer Nhomakorabea简明使用手册
仪器准备 第 9 页
是 需要空间定位？
否
进行空间定位 第 14 页
需要光谱校正？ 是 否
进行光谱校正 第 16 页
运行测序样品？ 是 否
编制测序样品板 第 24 页
运行片段 分析样品？
Applied Biosystems 3730/3730xl DNA Analyzer 简明使用手册
Applied Biosystems 3730/3730xl DNA Analyzer 简明使用手册
爱普拜斯应用生物系统公司
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Applied Biosystems 3730/3730xl DNA Analyzer 简明使用手册
测序样品的结果图
片段分析的结果图
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二、仪器硬件结构
Applied Biosystems 3730/3730xl DNA Analyzer 简明使用手册
1. 仪器前视图
Polymer Delivery Pump (PDP) 灌胶泵系统
泵胶块 胶管
胶瓶 阳极缓冲液杯
连接管 下胶块
2. 软件设置
操作人员根据所使用的标记方法、电泳的毛细管长度、电泳胶的种类等，在数据采集（Data Collection）软件中选择正确的运行模块和分析模块
3. 开始运行
操作人员把样品板放到仪器上并开始运行，仪器便会根据设定好的顺序，用相应的电泳程序 分析样品板上的样品
4. 电泳
用“电进样”的方法将带电的样品分子 加到灌好电泳胶的毛细管的进样端 （负极）， 然后在毛细管两端加上 直流电压，样品中不同大小的DNA片 段开始从负极向正极移动， 移动的 速度受到片段自身大小影响，片段越 短移动得越快。电泳的结果是使长度 不同的 带电 DNA 片段互相分离，并且按片段的长短的顺序通过检测窗口，产生信号，短 片段先到达检测窗口
6. 使用去离子水清洗Buffer/Water/Waste槽
7. 更换Buffer及去离子水（约80ml/槽） 8. 组装Buffer/Water/Waste槽组件，擦干外表面液体 9. 取下阳极杯，将原废液倒入废液缸 10. 使用去离子水清洗阳极杯 10. 更换阳极杯1XBuffer（约67ml） 11. 安装各槽组件及阳极缓冲液杯
或
> All Programs >Applied Biosystems >Unified Data Collection
>Run Unified Data Collection v3.0，运行软件 ·等待Service Console窗口中的指示灯全部变成绿色后，DC软件打开