生物化学)教案:第十三章 基因表达调控
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2.什么是基因表达(gene expression)?试述基因表达变化的特点及其调控对生物体的重要性。
3.为什么说转录起始的调控是基因表达调控的中心环节?
4.举实际例子说明操纵元(0peron)的组成元件及其作用,并分析可阻遏的操纵元和可诱导的操纵元的调控方式。
5.真核生物基因组(genome in eukaryote)的结构特点有哪些?
(3)阻碍蛋白与阻碍机制的普遍性。
在很多原核操纵子系统,特异性的阻遏蛋白是控制原核启动序活性的重要因素。当阻遏蛋白与操纵序列结合或解散时,就会发生特异基因的阻遏或去阻遏。原核基因调控普遍涉及特异阻遏蛋白参与的开、关调节机制。
2、乳糖操纵子和色氨酸操纵子的结构。
(1)乳糖操纵子的结构
乳糖操纵子包括ZYA三个结构基因及其上游的调节序列:操纵子序列O、启动子序列P及一个调节基因I。
原核生物细胞仅有一种RNA聚合酶,核心酶参与转录延长,全酶具转录起始作用。在转录起始阶段,sigma因子识别特异启动子序列;不同的sigma因子孙决定特异基因的转录激活。
(2)操纵子模型的普遍性;
除个别基因外,原核生物绝大多数基因按功能相关性成簇串联、密集于染色体上,共同组成一个转录单位—操纵(operon),因此,操纵子机制在原核基因调控中具有普遍意义。
6.比较真核和原核生物的基因表达和基因表达调控相似和不同之处。
7.论述启动子(promotor)、增强子(enhancer)和转录因子(transcriptional factors)的概念、结构、功能及其相互关系。
8.什么沉默子(silencer)、衰减子(attenuater),各有什么作用?
授课特点
1.首先把第十二章的内容进行概要复习,再通过生物界遗传进化的规律导入至本篇所要学习的内容,承上启下;
2.先介绍本章内容概要,教学目标和要求,使学生明了本章应该学习哪些内容和重点内容;
3.就相应内容联系临床和生活实例,提高学习兴趣;
4.采用启发式教学,适当提问,启迪学生思维;
5.突出重点,将难点讲清楚。
(2)反式作ห้องสมุดไป่ตู้因子
参与基因表达调控的蛋白质部分,如基本转录因子、亮氨酸拉链、锌指结构。
5.转录后水平的调节
(1)hnRNA加工成熟的调节;
(2)mRNA动输、胞浆内稳定性的调节
6.翻译水平的调节
(1)翻译起始因子(eIF)活性的调节;
(2)RNA结合蛋白对翻译起始的调节。
思考题:
1.什么是基因(gene),什么是结构基因(structural gene),什么是假基因(pseudo-gene),什么是断裂基因(splitting gene),什么是跳跃基因(jumping gene)?
A.基因表达的多级调控。
B.基因转录激活调节基因要素:特异DNA序列;顺式作用元件(启动子序列,如TATA box、CCAAT box);调节蛋白;DNA-蛋白质、蛋白质-蛋白质相互作用;RNA聚合酶
二、原核生物基因表达调节
1、原核生物基因转录调节特点
(1)sigma因子决定RNA聚合酶识别特异性;
授课章节
第三篇 基因信息传递·第十三章 基因表达调控
授课对象
2007级本科
临床专业1、2、3班
学时
4
时间
2008.11.10/17
授课地点
5315、5506、2301教室
教材
《生物化学》·第七版·人民卫生出版社
教学
目的
要求
1、掌握:基因及其基因表达的概念,原核生物表达调控的特点,操纵子的结构与功能,真核基因组结构特点,顺式作用元件,反式作用因子定义、类型,启动子、增强子、沉默子的含义。
总结10mins
教 学 主 要 内 容
备 注
一、基因表达调控基本概念与原理
1.基因、基因组的概念
(1)基因概念的多样性
A.断裂基因(splitting gene):编码序列为不编码序列隔开,B。其中,编码序列为外元,不编码序列为内元。真核生物的基因大多数为断裂基因,或称不连续基因。
C.假基因(pseudogene):失去了基因功能的DNA序列。
三、基因表达调控的基本原理15mins
第二节原核生物基因表达调控
一、原核生物基因表达调控特点20mins
二、乳糖操纵子的调节机制25mins
三、其它转录调节机机制15mins
第三节真核生物基因表达调控
一、真核生物基因组结构特点15mins
二、真核生物基因表达调控特点15mins
三、真核基因转录激活调节20mins
D.重复基因(repeat gene):一个基因含有两个或两个以上的拷贝数。
E.重叠基因(overlapping gene):基因部分重叠。
F.跳跃基因(transposon):跳跃基因也称转座子,指基因复制到染色体的另一位置。
(2)基因:染色体上的DNA片段;
(3)基因组:一个物种的一整套遗传信息;
2、熟悉:真核基因表达调控的特点,基因表达调控的四个层次,基因表达调控的生物学意义,乳糖操纵子调节机制。
3、了解:基因表达调控的基本原理,基因表达的时间性及空间性。
教学
重点
难点
1.重点:乳糖操纵子和色氨酸操纵子的结构与功能,真核基因组结构特点,顺式作用元件,反式作用因子定义、类型,启动子或启动序列、增强子、沉默子的含义。
2.难点:基因表达的时间性及空间性,基因表达调控的基本原理,真核基因表达调控的特点。
教学
方法
大课讲授,适当结合临床和生活实际实例
教具
多媒体教学课件
授课
提纲
导入,概述5mins
第一节基因表达调控的基本概念与原理
一、基因表达的概念,基因表达的时间性及空间性10mins
二、基因表达的方式,基因表达调控的生物学意义10mins
(5)转录后修饰、加工。
鉴于真核基因结构特点,转录后剪接及修饰等过程比原核生物基因复杂。
3、RNA polⅠ和polⅢ的转录调节。
(1)RNA pol I转录体系的控制;
(2)RNA pol III转录体系的控制。
4、RNA polⅡ对转录的调节
(1)顺式作用元件
指调节基因表达的DNA序列,主要包括启动子、增强子及沉默子
2.基因表达
(1)基因表达的概念:
基因表达就是基因转录及翻译过程,其中转录是基因表达的第一步。
(2)基因表达的时空特异性
基因表达的特导性包括时间特异性和空间特异性。
(3)基因表达的方式
包括组成性表达、诱导和阻遏。
(4)基因表达调控的生物学意义
适应环境、维持生长和增殖;维持个体发育与分化;
(5)基因表达调控的基本原理
(2)真核基因转录的产物为单顺反子;
原核生物大多数基因按功能相关性成簇串联成操纵子,由操纵子机制控制转录生成的mRNA为多顺反子(poly-cistron)
(3)真核生物的基因组中有重复序列;
(4)真核生物的基因为不连续基因。
真核生物的基因大多数为不连续基因,即编码序列为不编码的序列所隔开。
2、真核生物基因表达调控特点。
(2)阻遏蛋白的负性调节
(3)CAP的正性调节
分解代谢物基因激活蛋白CAP是同二聚体,在其分子内有DNA结合位点。当没有葡萄糖及cAMP浓度较高时,cAMP与CAP结合,这时CAP结合在lac启动序列附近的CAP位点,可促进转录。
3、原核生物翻译水平的调节。
(1)蛋白质分子的自我调节
(2)反义RNA对翻译的调节作用
4.其它转录调节机制
(1)转录衰减
(2)基因重组
(3)SOS反应
大肠杆菌经紫外线照射会发生染色体损伤或DNA复制抑制,诱发一系列表型变化,这一现象或过程称为SOS反应(SOS response)。
三、真核生物基因表达调节
1、真核生物基因组结构特点。
(1)真核基因组结构庞大;
哺乳动物基因组DNA约由3×109碱基对组成,而大肠杆菌的基因组DNA大约只有4.2×106碱基对。
(1)RNA聚合酶;
真核生物有三种RNA聚酶,分别负责三种RNA的转录。
(2)活性染色体结构变化;
当基因被激活时,可观察到染色体相应区域发生某些结构和性质变化。
(3)正性调节占主导;
真核生物广泛地采用正性调节,其原因有:一、正性调节机制更有效;负性调节不经济。
(4)转录与翻译分隔进行;
真核细胞有细胞核及胞浆等区间分布,转录与翻译在不同亚细胞结构中进行。
3.为什么说转录起始的调控是基因表达调控的中心环节?
4.举实际例子说明操纵元(0peron)的组成元件及其作用,并分析可阻遏的操纵元和可诱导的操纵元的调控方式。
5.真核生物基因组(genome in eukaryote)的结构特点有哪些?
(3)阻碍蛋白与阻碍机制的普遍性。
在很多原核操纵子系统,特异性的阻遏蛋白是控制原核启动序活性的重要因素。当阻遏蛋白与操纵序列结合或解散时,就会发生特异基因的阻遏或去阻遏。原核基因调控普遍涉及特异阻遏蛋白参与的开、关调节机制。
2、乳糖操纵子和色氨酸操纵子的结构。
(1)乳糖操纵子的结构
乳糖操纵子包括ZYA三个结构基因及其上游的调节序列:操纵子序列O、启动子序列P及一个调节基因I。
原核生物细胞仅有一种RNA聚合酶,核心酶参与转录延长,全酶具转录起始作用。在转录起始阶段,sigma因子识别特异启动子序列;不同的sigma因子孙决定特异基因的转录激活。
(2)操纵子模型的普遍性;
除个别基因外,原核生物绝大多数基因按功能相关性成簇串联、密集于染色体上,共同组成一个转录单位—操纵(operon),因此,操纵子机制在原核基因调控中具有普遍意义。
6.比较真核和原核生物的基因表达和基因表达调控相似和不同之处。
7.论述启动子(promotor)、增强子(enhancer)和转录因子(transcriptional factors)的概念、结构、功能及其相互关系。
8.什么沉默子(silencer)、衰减子(attenuater),各有什么作用?
授课特点
1.首先把第十二章的内容进行概要复习,再通过生物界遗传进化的规律导入至本篇所要学习的内容,承上启下;
2.先介绍本章内容概要,教学目标和要求,使学生明了本章应该学习哪些内容和重点内容;
3.就相应内容联系临床和生活实例,提高学习兴趣;
4.采用启发式教学,适当提问,启迪学生思维;
5.突出重点,将难点讲清楚。
(2)反式作ห้องสมุดไป่ตู้因子
参与基因表达调控的蛋白质部分,如基本转录因子、亮氨酸拉链、锌指结构。
5.转录后水平的调节
(1)hnRNA加工成熟的调节;
(2)mRNA动输、胞浆内稳定性的调节
6.翻译水平的调节
(1)翻译起始因子(eIF)活性的调节;
(2)RNA结合蛋白对翻译起始的调节。
思考题:
1.什么是基因(gene),什么是结构基因(structural gene),什么是假基因(pseudo-gene),什么是断裂基因(splitting gene),什么是跳跃基因(jumping gene)?
A.基因表达的多级调控。
B.基因转录激活调节基因要素:特异DNA序列;顺式作用元件(启动子序列,如TATA box、CCAAT box);调节蛋白;DNA-蛋白质、蛋白质-蛋白质相互作用;RNA聚合酶
二、原核生物基因表达调节
1、原核生物基因转录调节特点
(1)sigma因子决定RNA聚合酶识别特异性;
授课章节
第三篇 基因信息传递·第十三章 基因表达调控
授课对象
2007级本科
临床专业1、2、3班
学时
4
时间
2008.11.10/17
授课地点
5315、5506、2301教室
教材
《生物化学》·第七版·人民卫生出版社
教学
目的
要求
1、掌握:基因及其基因表达的概念,原核生物表达调控的特点,操纵子的结构与功能,真核基因组结构特点,顺式作用元件,反式作用因子定义、类型,启动子、增强子、沉默子的含义。
总结10mins
教 学 主 要 内 容
备 注
一、基因表达调控基本概念与原理
1.基因、基因组的概念
(1)基因概念的多样性
A.断裂基因(splitting gene):编码序列为不编码序列隔开,B。其中,编码序列为外元,不编码序列为内元。真核生物的基因大多数为断裂基因,或称不连续基因。
C.假基因(pseudogene):失去了基因功能的DNA序列。
三、基因表达调控的基本原理15mins
第二节原核生物基因表达调控
一、原核生物基因表达调控特点20mins
二、乳糖操纵子的调节机制25mins
三、其它转录调节机机制15mins
第三节真核生物基因表达调控
一、真核生物基因组结构特点15mins
二、真核生物基因表达调控特点15mins
三、真核基因转录激活调节20mins
D.重复基因(repeat gene):一个基因含有两个或两个以上的拷贝数。
E.重叠基因(overlapping gene):基因部分重叠。
F.跳跃基因(transposon):跳跃基因也称转座子,指基因复制到染色体的另一位置。
(2)基因:染色体上的DNA片段;
(3)基因组:一个物种的一整套遗传信息;
2、熟悉:真核基因表达调控的特点,基因表达调控的四个层次,基因表达调控的生物学意义,乳糖操纵子调节机制。
3、了解:基因表达调控的基本原理,基因表达的时间性及空间性。
教学
重点
难点
1.重点:乳糖操纵子和色氨酸操纵子的结构与功能,真核基因组结构特点,顺式作用元件,反式作用因子定义、类型,启动子或启动序列、增强子、沉默子的含义。
2.难点:基因表达的时间性及空间性,基因表达调控的基本原理,真核基因表达调控的特点。
教学
方法
大课讲授,适当结合临床和生活实际实例
教具
多媒体教学课件
授课
提纲
导入,概述5mins
第一节基因表达调控的基本概念与原理
一、基因表达的概念,基因表达的时间性及空间性10mins
二、基因表达的方式,基因表达调控的生物学意义10mins
(5)转录后修饰、加工。
鉴于真核基因结构特点,转录后剪接及修饰等过程比原核生物基因复杂。
3、RNA polⅠ和polⅢ的转录调节。
(1)RNA pol I转录体系的控制;
(2)RNA pol III转录体系的控制。
4、RNA polⅡ对转录的调节
(1)顺式作用元件
指调节基因表达的DNA序列,主要包括启动子、增强子及沉默子
2.基因表达
(1)基因表达的概念:
基因表达就是基因转录及翻译过程,其中转录是基因表达的第一步。
(2)基因表达的时空特异性
基因表达的特导性包括时间特异性和空间特异性。
(3)基因表达的方式
包括组成性表达、诱导和阻遏。
(4)基因表达调控的生物学意义
适应环境、维持生长和增殖;维持个体发育与分化;
(5)基因表达调控的基本原理
(2)真核基因转录的产物为单顺反子;
原核生物大多数基因按功能相关性成簇串联成操纵子,由操纵子机制控制转录生成的mRNA为多顺反子(poly-cistron)
(3)真核生物的基因组中有重复序列;
(4)真核生物的基因为不连续基因。
真核生物的基因大多数为不连续基因,即编码序列为不编码的序列所隔开。
2、真核生物基因表达调控特点。
(2)阻遏蛋白的负性调节
(3)CAP的正性调节
分解代谢物基因激活蛋白CAP是同二聚体,在其分子内有DNA结合位点。当没有葡萄糖及cAMP浓度较高时,cAMP与CAP结合,这时CAP结合在lac启动序列附近的CAP位点,可促进转录。
3、原核生物翻译水平的调节。
(1)蛋白质分子的自我调节
(2)反义RNA对翻译的调节作用
4.其它转录调节机制
(1)转录衰减
(2)基因重组
(3)SOS反应
大肠杆菌经紫外线照射会发生染色体损伤或DNA复制抑制,诱发一系列表型变化,这一现象或过程称为SOS反应(SOS response)。
三、真核生物基因表达调节
1、真核生物基因组结构特点。
(1)真核基因组结构庞大;
哺乳动物基因组DNA约由3×109碱基对组成,而大肠杆菌的基因组DNA大约只有4.2×106碱基对。
(1)RNA聚合酶;
真核生物有三种RNA聚酶,分别负责三种RNA的转录。
(2)活性染色体结构变化;
当基因被激活时,可观察到染色体相应区域发生某些结构和性质变化。
(3)正性调节占主导;
真核生物广泛地采用正性调节,其原因有:一、正性调节机制更有效;负性调节不经济。
(4)转录与翻译分隔进行;
真核细胞有细胞核及胞浆等区间分布,转录与翻译在不同亚细胞结构中进行。