分子生物学实验理论考试
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2012-2013学年第二学期分子生物实验考试题库
1、PCR原理是什么?
答:PCR技术是一种在体外快速扩增特定基因或DNA序列的方法。它的特异性是由两个人工合成的引物序列决定。引物就是与待扩增DNA片段两侧互补的寡核苷酸。双链DNA是在临近沸点的温度下加热时便会分离成两条单链DNA分子(变性),两引物分别与两条DNA的两侧序列特异复性,在适宜条件下,DNA 聚合酶以单链DNA为模板,利用反应混合物中的4种脱氧核苷三磷酸,在引物的引导下,按5'→3'方向复制互补DNA,即引物的延伸。在适宜的条件下,这种热变性→复性→延伸的过程不断循环重复,前一个循环的产物DNA可作为后一个循环的模板DNA参与DNA合成,使产物DNA的量按2^n方式扩增。
2、PCR一般体系应加入哪些试剂?
答:10*PCR缓冲液(含Mg+)、模板DNA、四种dNTP、一对引物、耐热Taq 聚合酶。
3、PCR防止其它DNA污染,应注意哪些问题?
答:标本放置时密封要严避免溢于容器外,容器要清洁避免造成相互间交叉污染;移液器使用要规范避免污标本间污染;无菌工作台操作,避免气体中有杂菌。
4、影响PCR产物产量的因素主要有哪些?
答:引物、酶的种类及浓度、dNTP的质量(优劣)与浓度、模板核酸的量与纯化程度、Mg2+浓度、温度与时间、循环次数。
5、引物设计应注意哪些问题?
答:①引物长度不宜过长20bp左右较佳;②引物扩增片段的长度以200-500为宜;③引物碱基的中G+C的含量应在40-60%为宜,G+C太少则扩增效果不佳,G+C过多则易出现非特异条带;④避免引物内部出现二级结构,避免两天引物间互补,特别是3'端的互补否则会形成二聚体结构;⑤引物3'端的碱基,特别是最末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致PCR 失败。
6、简述克隆某一原核生物基因片段一般操作步骤?
答:克隆某一原核生物基因片段是可用PCR技术对基因进行大量扩增,首先准备好实验材料大体为:需扩增的模板DNA、DNA聚合酶、dNTP混合液、PCR 缓冲液、引物等、其过程大体分为3个步骤:第一步:变形:通过加热使DNA 模板双螺旋链解离为单链,第二步:退火:当温度突然降低时。由于模板DNA 结构复杂难再互补,而引物建构简单且数量巨多易于模板DNA互补杂交从而使引物结合到模板上DNA上,第三部:延生:在DNA聚合酶和四种底物及镁离子存在条件下DNA连开始延伸。以上3个步骤为一个循环,数小时后即可得到大量扩增的目的片段。
7、什么是质粒?质粒的基本性质有哪些?
答:a质粒是染色体外能够进行自主复制的遗传单位,包括真核生物的细胞器和细菌细胞中染色体以外的脱氧核糖核酸(DNA)分子。现在习惯上用来专指细菌、酵母菌和放线菌等生物中染色体以外的DNA分子。在基因工程中质粒常被用做基因的载体。b具有复制起点。携带易于筛选的选择标记。具有多种限制性内切酶的切割位点。具有较小的相对分子质量和较高的拷贝数。
8、质粒抽提实验中溶液I、II、III各有什么作用?
答:溶液I:由葡萄糖,EDTA,Tris Cl组成.葡萄糖的作用是增加溶液的粘度,减少抽提过程中的机械剪切作用,防止破坏质粒DNA;EDTA的作用是络和掉Mg2+等二价金属离子,防止DNA酶对质粒分子的降解作用;Tris Cl能使溶菌液维持溶菌作用的最适PH范围。溶液II:由SDS与NaOH组成.SDS的作用是解聚核蛋白并与蛋白质分子结合使之变性;NaOH(pH>12)的作用是破坏氢键,使DNA分子变性。
溶液III:由KAc与HAc组成,是pH值为5.5的高盐溶液.能中和溶液II的碱性,使染色体DNA复性而发生缠绕并使质粒DNA复性.K+离子会与SDS形成溶解度很低的盐并与蛋白质形成沉淀而除去.溶液中的染色体DNA也会与蛋白质-SDS形成相互缠绕的大分子物质,很容易与小分子的质粒DNA分离,此外,高盐溶液也有利于各种沉淀的形成。
9、碱裂解法抽提质粒DNA的基本原理是什么?
答:碱裂解法提取质粒是根据共价闭合环状质粒DNA之间在拓扑学上的差异而达到分离目的。PH介于12.0~12.5时,线性DNA变性,双链打开,而质粒DNA 虽变性,但两条互补链彼此缠绕,当PH恢复到中性时,质粒DNA可迅速准确的完成复性,而线性DNA复性较困难,缠绕成网状,通过离心可沉淀除去。10、在碱裂解法提取质粒DNA操作中应注意哪些问题?
答:(1)正确使用移液器。(2)溶液ll必须新鲜配制。(3)加入酚-氯仿后必须充分混匀。(4)混匀的过程不能太过剧烈。(5)每次弃上清液时都应用移液器吸去管壁上黏附的水珠。(6)吸取酚-氯仿溶液时要将Tip头插入液体分层的下侧。【可根据第一次试验自己写的注意事项进行补充】
11、在碱裂解法提取质粒DNA时,酚/氯仿的作用是什么?
答:酚是强烈的蛋白质变性剂,能有效使蛋白质变性而除去,氯仿有强烈的脂溶性,去除脂类杂质,本身酚:氯仿:异戊醇=25:24:1的主要作用是抽提蛋白质
12、碱裂解法提取的质粒DNA分子一般有几种构象?电泳时移动速率有何差异?
答:超螺旋DNA>线性DNA>开环DNA
13、提取植物基因组DNA的基本原理是什么?在操作过程中应该注意什么?
答:①基本原理:利用液氮对植物组织进行研磨,从而破碎细胞。细胞提取液中含有的SDS溶解膜蛋白而破坏细胞膜,使蛋白质变性而沉淀下来。EDTA抑制DNA酶的活性。再用酚、氯仿抽提的方法去除蛋白,得到的DNA溶液经异丙醇沉淀。②注意事项:⑴材料要新鲜娇嫩,叶片研磨地越细越好;⑵操作应为无菌操作;⑶操作应温和,不宜剧烈晃动;⑷注意移液器的正确使用。
14、在植物基因组提取过程中,DNA 降解的可能原因?
答:原因:⑴从植物中提取DNA时没对细胞内的DNA酶进行灭活;⑵操作过程中被细菌污染了;⑶口水等含酶物质飞入样品中;⑷温度、PH等变化过于剧烈。
15、在植物基因组提取过程中,提高DNA 产量的措施?
答:应当选取幼嫩的叶片,因为幼嫩叶片中的DNA含量高些;组织抽提前要保存在液氮中,以免DNA被破坏;纯化时注意抑制核酸酶污染,使用EDTA等防止DNA降解;整个实验过程应该温和操作,不能剧烈振荡,混合过程要轻缓,减少抽提,减少DNA片段被认为降解,因为过度振荡会使DNA断裂成小片段。
16、在使用苯酚进行DNA提取时应该注意什么?
答:酚一定要进行碱平衡,苯酚具有高度腐蚀性,飞溅到皮肤、粘膜、眼睛会对人体造成损伤,应当注意防护;它是出去蛋白质的,要充分振荡使蛋白质变性,但不能太剧烈而打断DNA;离心后应该避免再次吸入有机相的苯酚—氯仿,尽量只取上清,不应该让苯酚最后仍有残留,需抽提干净。
17、在提取植物基因组DNA过程中,使用苯酚与氯仿的作用是什么?
答:用苯酚和氯仿抽取,去除多余的蛋白,保证提取的基因组较纯净。
18、在植物基因组提取过程中,该如何检测和保证基因组DNA的质量?
答:检测:琼脂糖凝胶电泳;保证DNA活性:用EDTA抑制DNA酶活性,从而保证DNA不被破坏。
19、什么是限制性内切酶?
答:限制性内切酶是一类能够识别双链DNA分子中的某种特定核苷酸序列,并由此切割DNA双链结构的核酸内切酶,有三种类型,Ⅰ类,Ⅱ类,Ⅲ类,他们都有甲基化修饰功能和限制酶功能,Ⅱ类常用于分子克隆
20、常见的Ⅱ型限制性内切酶切割双链DNA后会产生末端或末端。答:粘性,平
21、下列有关限制性内切酶的描述,错误的是:(C)
A.一种限制性内切酶只能识别一种特定的脱氧核苷酸序列
B.限制性内切酶的活性受温度的影响
C.限制性内切酶能识别和切割RNA
D.限制性内切酶可以从原核中提取
22、现有一长度为l 000 bp的DNA分子,用限制性核酸内切酶EcoR I酶切后得到
的DNA分子仍是l 000 bp,用Kpn I单独酶切得到400 bp和600 bp 2种长度的