2012生物信息学题库
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一、选择题:
1.以下哪一个是mRNA条目序列号:
A. J01536
B. NM_15392
C. NP_52280
D. AAB134506
2.确定某个基因在哪些组织中表达的最直接获取相关信息方
式是:
A. Unigene
B. Entrez
C. LocusLink
D. PCR
3.一个基因可能对应两个Unigene簇吗?
A. 可能
B. 不可能
4.下面哪种数据库源于mRNA信息:
A. dbEST
B. PDB
C. OMIM
D. HTGS
5.下面哪个数据库面向人类疾病构建:
A. EST
B. PDB
C. OMIM
D. HTGS
6.Refseq和GenBank有什么区别:
A. Refseq包括了全世界各个实验室和测序项目提交的DNA
序列
B. GenBank提供的是非冗余序列
C. Refseq源于GenBank,提供非冗余序列信息
D. GenBank源于Refseq
7.如果你需要查询文献信息,下列哪个数据库是你最佳选择:
A. OMIM
B. Entrez
C. PubMed
D. PROSITE
8.比较从Entrez和ExPASy中提取有关蛋白质序列信息的方
法,下列哪种说法正确:
A. 因为GenBank的数据比EMBL更多,Entrez给出的搜索
结果将更多
B. 搜索结果很可能一样,因为GenBank和EMBL的序列数
据实际一样
C. 搜索结果应该相当,但是ExPASy中的SwissProt记录的
输出格式不同
9.天冬酰胺、色氨酸和酪氨酸的单字母代码分别对应于:
A. N/W/Y
B. Q/W/Y
C. F/W/Y
D. Q/N/W
10.直系同源定义为:
A. 不同物种中具有共同祖先的同源序列
B. 具有较小的氨基酸一致性但是有较大的结构相似性的
同源序列
C. 同一物种中由基因复制产生的同源序列
D. 同一物种中具有相似的并且通常是冗余的功能的同源
序列
11.下列那个氨基酸最不容易突变:
A. 丙氨酸
B. 谷氨酰胺
C. 甲硫氨酸
D.半胱氨酸
12.PAM250矩阵定义的进化距离为两同源序列在给定的时间
有多少百分比的氨基酸发生改变:
A. 1%
B. 20%
C. 80%
D. 250%
13.下列哪个句子最好的描述了两个序列全局比对和局部比对
的不同:
A. 全局比对通常用于比对DNA序列,而局部比对通常用于
比对蛋白质序列
B. 全局比对允许间隙,而局部比对不允许
C. 全局比对寻找全局最大化,而局部比对寻找局部最大化
D. 全局比对比对整体序列,而局部比对寻找最佳匹配子序
列
14.假设你有两条远源相关蛋白质序列。为了比较它们,最好使
用下列哪个BLOSUM和PAM矩阵:
A. BLOSUM45和PAM250
B. BLOSUM45和PAM1
C. BLOSUM80和PAM250
D. BLOSUM10和PAM1
15.与PAM打分矩阵比较,BLOSUM打分矩阵的最大区别是:
A. 最好用于比对相关性高的蛋白
B. 它是基于近相关蛋白的全局多序列比对
C. 它是基于远相关蛋白的局部多序列比对
D. 它结合了全局比对和局部比对
16.如果有一段DNA序列,它可能编码多少种蛋白质序列:
A. 1
B. 2
C. 3
D. 6
17.要在数据库查询一段与某DNA序列编码蛋白质最相似的序
列,应选择:
A. blastn
B. blastp
C. tblastn
D. tblastp
E. blastx
18.为什么ClustalW(一个采用了Feng-Doolittle渐进比对算法
的程序)不报告E值:
A. ClustalW报告E值
B. 使用了全局比对
C. 使用了局部比对
D. 因为是多序列比对
19.Feng-Doolittle方法提出“一旦是空隙,永远是空隙”规则
的依据是:
A. 保证空隙不会引物序列加入而填充
B. 假定进化早期分歧的序列有较高优先级别
C. 假定最近序列空隙应该保留
D. 假定最远序列空隙应该保留
20.根据分子钟假说:
A. 所有蛋白质都保持一个相同的恒定进化速率
B. 所有蛋白质的进化速率都与化石记录相符合
C. 对于每一个给定的蛋白质,分子进化的速率是逐渐减慢
的,就如同不准时的钟
D. 对于每一个给定的蛋白质,其分子进化的速率在所有的
进化分支上大致是恒定的
21.系统发生树的两个特征是:
A. 进化分支和进化节点
B. 树的拓扑结构和分支长度
C. 进化分支和树根
D. 序列比对和引导检测方法
22.下列哪一个是基于字母特征的系统发生分析的算法:
A. 邻位连接法(NJ法)
B. Kimura算法
C. 最大似然法(ML)
D. 非加权平均法(UPGMA)
23.基于字母特征和基于距离的系统发生分析的算法的基本差
异是:
A. 基于字母特征的算法没有定义分支序列的中间数据矩
阵
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