基因克隆的基本实验流程
基因克隆实验报告
基因克隆实验报告基因克隆实验报告引言基因克隆是一项重要的生物技术,它可以通过复制和转移特定基因来研究基因功能、生物发育和疾病治疗等方面。
本实验旨在通过基因克隆技术,将一个目标基因从一个宿主生物转移到另一个宿主生物中,并观察其表达情况和功能。
材料与方法1. 实验材料:目标基因序列、质粒、限制酶、DNA连接酶、细菌宿主等。
2. 实验步骤:a. 提取目标基因序列:通过PCR技术,从源DNA中扩增目标基因序列。
b. 制备质粒:选择合适的质粒,将其线性化。
c. 酶切与连接:使用限制酶切割目标基因序列和质粒,然后使用DNA连接酶将两者连接。
d. 转化:将连接好的质粒转移到细菌宿主中。
e. 筛选与鉴定:通过筛选培养基和PCR等方法,鉴定宿主细菌中是否成功克隆了目标基因。
结果与讨论在本实验中,我们成功地将目标基因从一个宿主生物转移到了另一个宿主生物中。
通过PCR技术,我们扩增得到了目标基因的特异片段,并在质粒上进行了酶切与连接。
随后,我们将连接好的质粒转移到了细菌宿主中,并进行了筛选与鉴定。
在筛选培养基中,我们观察到了对抗特定抗生素的细菌生长,这表明成功转化了质粒。
此外,通过PCR检测,我们也验证了目标基因的存在。
这些结果表明,我们成功地进行了基因克隆实验,并成功地将目标基因转移到了新的宿主生物中。
基因克隆的成功不仅仅是一项实验技术,它还具有广泛的应用前景。
基因克隆技术可以用于生物学研究,例如研究基因功能、生物发育和疾病机制等。
此外,基因克隆还可以用于生产重组蛋白、制备基因工程药物等方面。
然而,基因克隆技术也存在一些挑战和争议。
首先,基因克隆需要复杂的实验操作和昂贵的设备,对实验者的技术要求较高。
其次,基因克隆可能引发伦理和道德问题,例如克隆人类等。
因此,在进行基因克隆实验时,必须遵守伦理规范和法律法规,确保实验的合法性和安全性。
结论通过本实验,我们成功地进行了基因克隆,并将目标基因转移到了新的宿主生物中。
基因克隆技术在生物学研究和应用中具有重要意义,但也面临一些挑战和争议。
外源基因原核系统克隆表达的基本流程
外源基因原核系统克隆表达的基本流程
外源基因原核系统克隆表达的基本流程如下:
1. 设计引物:根据外源基因的序列,设计引物,其中至少包括一个启动子和一个终止子。
2. 基因克隆:使用PCR或其他克隆技术,将外源基因与载体DNA连接起来,形成重组质粒。
3. 转化:将重组质粒转化到适当的宿主细胞中,如大肠杆菌。
4. 筛选:通过选择性培养基或其他筛选方法,筛选出带有重组质粒的转化菌落。
5. 培养:将筛选出的转化菌落进行扩增培养,在适当的培养条件下培养细菌。
6. 表达:在培养过程中,外源基因会被宿主细胞转录和翻译,产生目标蛋白质。
7. 提取:收集细菌培养物,利用细胞破裂或其他细胞提取方法,提取目标蛋白质。
8. 纯化:通过各种纯化技术,如柱层析、电泳等,纯化目标蛋白质。
9. 鉴定:利用各种方法,如SDS-PAGE、Western blot等,对
目标蛋白质进行鉴定和定量分析。
10. 应用:利用纯化的目标蛋白质进行后续的研究或应用,如
功能鉴定、结构分析、抗原制备等。
这是一个基本的流程,根据不同的实验目的和具体情况,可能还会涉及到一些其他的步骤和操作。
基因克隆的基本原理和流程 cdna
基因克隆的基本原理和流程 cdna下载温馨提示:该文档是我店铺精心编制而成,希望大家下载以后,能够帮助大家解决实际的问题。
文档下载后可定制随意修改,请根据实际需要进行相应的调整和使用,谢谢!并且,本店铺为大家提供各种各样类型的实用资料,如教育随笔、日记赏析、句子摘抄、古诗大全、经典美文、话题作文、工作总结、词语解析、文案摘录、其他资料等等,如想了解不同资料格式和写法,敬请关注!Download tips: This document is carefully compiled by theeditor.I hope that after you download them,they can help yousolve practical problems. The document can be customized andmodified after downloading,please adjust and use it according toactual needs, thank you!In addition, our shop provides you with various types ofpractical materials,such as educational essays, diaryappreciation,sentence excerpts,ancient poems,classic articles,topic composition,work summary,word parsing,copy excerpts,other materials and so on,want to know different data formats andwriting methods,please pay attention!基因克隆:基本原理与CDNA克隆流程基因克隆是现代生物学中的核心技术,它使得科学家能够分离、复制和研究特定的基因。
基因克隆实验手册
插入片段 线性化载体
推荐使用的试剂盒
产品信息
DNA Ligation Kit <Mighty Mix> P4
Blunting Kination Ligation (BKL) Kit
P6
TaKaRa DNA Ligation Kit LONG P4
Mighty TA-cloning Kit
P6
Mighty TA-cloning Reagent Set for PrimeSTAR®
↓ ③42℃反应45秒后,在冰中放置1~2分钟
↓ ④加入已预先37℃保温的SOC培养基,使终体积为1 ml。
↓ ⑤37℃振荡培养1小时(160~225 rpm)
↓ ⑥取适量涂布于LB选择培养基、37℃过夜静置培养
5. PCR扩增确认插入片段DNA 6. 培养、纯化质粒
PCR扩增确认插入片段DNA请参考第5页
TCGA 5’ Hin d Ⅲ
线性化载体 ※
C TAG A G C T
※ 利用限制性内切酶酶将环状载体DNA切断后,切胶 回收、或必要时进行去磷酸化反应
转化
·感受态细胞
形成菌落
进行菌落PCR 确认插入片段
·EmeraldAmp® MAX PCR Master Mix等
·电泳相关制品
— 1—
基因克隆实验手册
※ PCR扩增产物是平滑末端时进行dA加尾反应。
【目的DNA片段】 带有限制性内切酶的
酶切末端
In-Fusion克隆
5×In-Fusion® HD In-Fusion酶使 Enzyme Premix 末端15个相同
碱基无缝融合
TA克隆
3’ A
A 3’
T载体
基因克隆具体实验报告
一、实验目的1. 学习基因克隆的基本原理和方法。
2. 掌握PCR扩增、酶切、连接等基因克隆实验技术。
3. 验证目的基因的克隆是否成功。
二、实验原理基因克隆是指将目的基因片段从基因组中分离出来,并插入到载体中,使其在宿主细胞中复制、表达的过程。
实验过程中,主要涉及PCR扩增、酶切、连接、转化、筛选等步骤。
三、实验材料1. 模板DNA:含有目的基因的基因组DNA。
2. 引物:根据目的基因序列设计的上下游引物。
3. Taq DNA聚合酶:用于PCR扩增。
4. 酶切体系:限制性内切酶、缓冲液、连接酶等。
5. 连接载体:线性化载体。
6. 转化宿主菌:大肠杆菌DH5α。
7. 筛选培养基:含抗生素的LB培养基。
8. PCR扩增试剂:10×PCR缓冲液、dNTPs、MgCl2等。
四、实验方法1. PCR扩增(1)设计引物:根据目的基因序列设计上下游引物,长度约为20-30bp,分别位于目的基因的上下游。
(2)PCR反应体系:取模板DNA 1μl,上下游引物各1μl,10×PCR缓冲液5μl,dNTPs 4μl,MgCl2 2μl,Taq DNA聚合酶0.5μl,加ddH2O至50μl。
(3)PCR反应程序:95℃预变性5min,95℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min,共35个循环,最后延伸10min。
2. 酶切连接(1)酶切:取PCR产物5μl,加限制性内切酶(如EcoRI)1μl,10×酶切缓冲液2μl,ddH2O 2μl,混匀后置于37℃水浴酶切2h。
(2)连接:取线性化载体5μl,酶切产物5μl,10×连接缓冲液2μl,T4 DNA 连接酶1μl,混匀后置于16℃连接过夜。
3. 转化(1)制备感受态细胞:将大肠杆菌DH5α在LB培养基中培养至对数生长期,按照1:100的比例加入CaCl2,混匀后冰浴30min。
(2)热激转化:将连接产物加入感受态细胞中,混匀后置于42℃水浴45s,迅速转移至冰浴中。
cdna基因克隆的基本原理和流程
一、CDNA基因克隆的基本原理CDNAplementary DNA)是DNA的互补序列,通过反转录酶将mRNA作为模板合成的一种DNA。
CDNA基因克隆是利用逆转录酶将mRNA逆转录合成cDNA,并通过PCR或其他方法将cDNA插入到质粒载体中,实现对目标基因的克隆。
二、CDNA基因克隆的流程1. RNA提取:首先需要从细胞中提取出总RNA,可以使用TRIzol等试剂进行RNA的提取纯化工作。
2. 反转录合成cDNA:将提取得到的RNA作为模版,利用逆转录酶进行cDNA的合成。
反转录反应通常包括RNA模版、随机引物、dNTPs、逆转录酶和缓冲液,并经过一系列温度循环反应,将mRNA 逆转录成cDNA。
3. cDNA纯化:为了避免反转录反应中产生的非特异性产物和杂质,需要对反转录反应产物进行纯化。
4. cDNA扩增:对cDNA进行PCR扩增,以获得目标基因的cDNA 片段。
PCR反应体系包括cDNA模板、引物、dNTPs、Taq聚合酶和缓冲液,通过一系列温度循环反应,扩增目标基因cDNA片段。
5. 酶切与连接:将PCR扩增得到的cDNA片段与质粒载体进行酶切,并在两者的黏端上连接。
6. 转化:将连接得到的质粒转化入大肠杆菌等细菌中,使其进行复制。
7. 筛选与鉴定:通过筛选和鉴定,选出携带目标基因cDNA片段的质粒,进行测序和分析,最终确定目标基因序列。
三、CDNA基因克隆的应用CDNA基因克隆技术已广泛应用于基因克隆、基因表达等多个领域。
在科研领域中,通过CDNA基因克隆技术可以方便快捷地获得目标基因的cDNA,实现对目标基因的研究和功能分析;在医药领域,CDNA基因克隆技术也被应用于基因治疗、蛋白表达等方面。
总结:CDNA基因克隆是一种重要的基因工程技术,通过反转录酶合成cDNA并将其插入到质粒中,可以方便地获取目标基因序列,具有广泛的应用前景。
掌握CDNA基因克隆的基本原理和流程对于开展相关实验研究具有重要意义。
基因工程中的基因克隆与基因表达实验总结
基因工程中的基因克隆与基因表达实验总结基因工程作为一门新兴的交叉学科,已经广泛应用于生物医学、农业、环境保护等领域。
其中,基因克隆和基因表达实验是基因工程的核心技术,对于研究基因功能和开发新药已经起到了重要作用。
本文将对基因工程中的基因克隆和基因表达实验进行总结,并探讨其在科学研究和应用中的前景。
一、基因克隆实验基因克隆是通过重组DNA技术,将感兴趣的基因从一个生物体中复制并插入到另一个生物体中的过程。
它是研究基因功能、生物制药和转基因等领域的基础。
基因克隆实验主要包括以下几个步骤:1. DNA提取与限制性内切酶切割:通过提取DNA样品,使用限制性内切酶切割将目标基因和载体DNA切割成相应片段。
2. 基因插入:将目标基因与载体DNA片段进行连接,常用的方法是使用DNA连接酶将两者黏合。
3. 转化与筛选:将连接后的DNA转入到宿主细胞中,使其成为转基因细胞。
通过选择性培养基进行筛选,可以获得拥有目标基因的转基因细胞。
通过基因克隆实验,我们可以获得不同生物体的目标基因,并进行后续的研究和应用。
例如,通过将某种植物的耐旱基因克隆到其他作物中,可以提高作物的抗旱能力,增加农作物产量。
二、基因表达实验基因表达实验是将目标基因在宿主细胞中进行转录和翻译,产生具有特定功能的蛋白质的过程。
基因表达实验是研究基因功能和制备重组蛋白等领域的重要手段。
基因表达实验主要包括以下几个步骤:1. 选择合适的表达系统:根据需要表达的蛋白质的性质和规模,选择合适的表达系统。
常用的表达系统包括细菌、酵母、哺乳动物细胞等。
2. 构建表达载体:将目标基因插入到表达载体中,通常使用限制性内切酶和DNA连接酶进行连接,并通过测序确保插入正确。
3. 细胞转染:将构建好的表达载体导入到宿主细胞中。
不同表达系统有不同的转染方法,如细菌的化学转型、酵母的电转染等。
4. 表达和纯化:经过一定时间的培养,宿主细胞会表达目标基因,合成目标蛋白质。
可以通过蛋白质纯化技术,如亲和层析、凝胶电泳等手段获得纯度较高的目标蛋白质。
简述基因克隆的基本过程
简述基因克隆的基本过程
基因克隆是指利用生物学技术进行繁殖某一抗原性基因组片段实现基因复制的过程。
主要由下面几个步骤组成:
一、启动物获取:
1. 从细胞中分离出DNA片段;
2. 使用酶切技术将DNA片段的‘钩子’附加到对应的载体上;
二、基因克隆扩增:
1. 把完美结合的细菌进行培养,促进DNA分子的复制;
2. 使用克隆抗体来处理载体以防止它们散发;
三、基因克隆分离:
1. 使用特定的限制酶进行裂解,将前面复制的DNA分离出来;
2. 使用水和石蜡将克隆体分离;
四、基因克隆实验:
1. 实验研究克隆DNA片段表达的基因;
2. 用PCR微量实验研究克隆体的表达水平;
五、基因突变:
1. 对克隆的DNA片段进行诱变;
2. 使用嵌合子技术将变异的片段插入到载体中;
六、基因表达检测:
1. 检测新插入的基因是否有正常表达;
2. 研究新基因对于抗性或者功能的影响;
七、生成抗原性基因组片段:
1. 用PCR实验研究整个新基因的表达水平;
2. 使用基因合成技术进一步改善新基因的特性;
基因克隆技术的应用有很大的广度,能够有效地增强病原体与病毒的抗体力,提升受抗原抗药的抵抗力,为生物科学的发展提供更多的研究材料。
基因克隆的基本原理和流程
基因克隆的基本原理和流程
基因克隆是一种技术,它使用质粒或DNA片段来复制一个特定的基因序列。
这种技术可以被用来产生大量相同的基因,以改变物种的表型特征,也可以用来研究有关基因的功能、结构和表达的有关信息。
基因克隆的基本原理是使用一种叫做酶切的酶,通过限制性内切酶将DNA片段分割成较小的片段,然后使用DNA 聚合酶将它们连接在一起。
这样,就可以生成几乎完全相同的DNA序列。
基因克隆的流程可以分为三个主要步骤:
1. 提取DNA:首先,由于想要克隆的基因位于一个细胞上,所以必须提取该细胞中的DNA。
常见的提取方法有水解法和溶剂提取法,其中水解法主要通过分解细胞壁和细胞质来提取DNA。
2. 克隆:其次,在提取出DNA后,使用限制性内切酶将DNA分割成较小的片段,然后使用DNA聚合酶将它们连接在一起。
3. 将克隆的DNA植入宿主:最后,将克隆的DNA植入一个宿主细胞,使其可以在宿主体内进行表达。
这里,一般会使用一种叫做质粒的DNA载体,它可以将克隆的基因植入宿主细胞中,从而使细胞获得克隆的基因。
基因克隆是一个复杂的流程,其中包括对基因的提取、克隆和植入宿主体等步骤,而且要完成克隆,还需要使用一系列不同的技术和工具,如限制性内切酶、DNA聚合酶和质粒等。
基因克隆技术在生物学、医学和农业等领域都有着重要的应用,它们已经成为研究基因功能、结构和表达的重要工具。
简述外源基因原核系统克隆表达的基本流程
简述外源基因原核系统克隆表达的基本流程外源基因在原核系统中的克隆表达是通过一系列步骤来实现的。
以下是基本的流程:1. 选择质粒载体(Plasmid Vector):-选择一个合适的质粒,通常是圆形DNA 分子,具有自主复制的能力。
质粒通常包含选择标记(例如抗生素抗性基因)和表达调控元件(例如启动子、终止子等)。
2. 准备目标基因:-获取外源基因,这可以是从其他生物中克隆得到的DNA 片段。
这个基因应该编码所需的蛋白质或RNA。
3. 限制性内切酶切割:-使用限制性内切酶切割质粒载体和目标基因。
选择适当的酶,以确保两者切口相互兼容。
4. 连接(Ligation):-将切割后的质粒和目标基因连接在一起,形成重组质粒。
这一步通常涉及DNA 连接酶。
5. 转化(Transformation):-将重组质粒导入宿主细菌中。
这可以通过热激冲击、电穿孔或其他方法实现。
质粒包含抗生素抗性基因,使得只有带有重组质粒的细菌能够在含有抗生素的培养基中生长。
6. 筛选(Screening):-鉴定带有正确重组质粒的细菌。
这可以通过PCR、酶切鉴定等技术来进行。
7. 培养:-将筛选出的正常克隆株培养起来,以增大其数量。
8. 表达:-利用宿主细菌的生物机制,使得外源基因在细菌中表达。
这通常涉及到适当的启动子和终止子,以及其他调控元件。
9. 纯化:-如有必要,对表达的蛋白质进行纯化。
这可以通过各种方法,如层析、电泳等来实现。
整个流程的成功依赖于实验室技术的熟练操作和对基因工程原理的深刻理解。
这些步骤的每一步都需要谨慎操作,以确保最终得到具有期望表达产物的克隆。
PCR技术克隆目的基因全过程
实验:目的基因克隆PCR技术课前预习PCR polymerase chain reaction 反应的基本原理;目的要求1.学习和掌握PCR 反应的基本原理与实验技术方法;2.认真完成每一步实验操作,详细记录实验现象和结果并加以分析和总结;基本原理类似于DNA 的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物;PCR 由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:①模板DNA的变性:模板DNA 经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR 扩增形成的双链DNA 解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;②模板DNA 与引物的退火复性:模板DNA 经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA 单链的互补序列配对结合;③引物的延伸:DNA 模板--引物结合物在TaqDNA 聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA 链互补的半保留复制链重复循环变性--退火--延伸三过程,就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板;每完成一个循环需2~4 分钟,2~3 小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍;到达平台期Plateau所需循环次数取决于样品中模板的拷贝;实验用品1.材料:重组质粒DNA作为模板2.器材和仪器:移液器及吸头,硅烷化的PCR 小管,DNA扩增仪PE 公司,琼脂糖凝胶电泳所需设备电泳槽及电泳仪,台式高速离心机3.试剂:①10×PCR 反应缓冲液:500mmol/L KCl, 100mmol/L Tris·Cl, 在25℃下, , %Triton X-100;②MgCl2 :25mmol/L;③ 4 种dNTP 混合物:每种L;④Taq DNA聚合酶5U/μl;⑤T4 DNA连接酶及连接缓冲液:方法步骤一PCR反应1. 依次混匀下列试剂35μl H2 O 5μl 10×PCR反应缓冲液4μl 25mmol/L MgCl2 4μl 4种dNTP μl 上游引物引物1μl 下游引物引物2μl 模板DNA约1ng 混匀后离心5秒;2. 将混合物在94℃下加热5分钟后冰冷,迅速离心数秒, 使管壁上液滴沉至管底,加入Taq DNA聚合酶μl约,混匀后稍离心,加入一滴矿物油覆盖于反应混合物上;3. 用94℃变性1分钟,45℃退火1分钟, 72℃延伸2分钟, 循环35轮,进行PCR;最后一轮循环结束后, 于72℃下保温10分钟,使反应产物扩增充分;4 电泳按前所述,取10μl扩增产物用1%琼脂糖凝胶进行电泳分析,检查反应产物及长度; 注意1. PCR非常灵敏, 操作应尽可能在无菌操作台中进行;2. 吸头、离心管应高压灭菌, 每次吸头用毕应更换, 不要互相污染试剂;3. 加试剂前, 应短促离心10秒钟, 然后再打开管盖, 以防手套污染试剂及管壁上的试剂污染吸头侧面;4. 应设含除模板DNA所有其它成分的负对照;实验结果注意事项微量操作、PCR 反应体系的设计、引物设计、扩增条件的优化思考题1. 降低退火温度对反应有何影响2. 延长变性时间对反应有何影响3. 循环次数是否越多越好为何4. PCR有哪些用途举例说明;附:PCR知识供参考一PCR 反应体系与反应条件标准的PCR 反应体系:10×扩增缓冲液10ul4 种dNTP 混合物各200umol/L引物各10~100pmol模板DNA ~2ugTaq DNA聚合酶Mg2+ L加双或三蒸水至100ulPCR 反应五要素:参加PCR 反应的物质主要有五种即引物、酶、dNTP、模板和Mg2+引物:引物是PCR 特异性反应的关键,PCR 产物的特异性取决于引物与模板DNA互补的程度;理论上,只要知道任何一段模板DNA序列,就能按其设计互补的寡核苷酸链做引物,利用PCR 就可将模板DNA在体外大量扩增;设计引物应遵循以下原则:①引物长度:15-30bp,常用为20bp左右;②引物扩增跨度:以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb 的片段;③引物碱基:G+C 含量以40-60%为宜,G+C 太少扩增效果不佳,G+C 过多易出现非特异条带;ATGC最好随机分布,避免5 个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列;④避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是3’端的互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异的扩增条带;⑤引物3’端的碱基,特别是最末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致PCR 失败;⑥引物中有或能加上合适的酶切位点,被扩增的靶序列最好有适宜的酶切位点,这对酶切分析或分子克隆很有好处;⑦引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其它序列无明显同源性;引物量:每条引物的浓度~1umol 或10~100pmol,以最低引物量产生所需要的结果为好,引物浓度偏高会引起错配和非特异性扩增,且可增加引物之间形成二聚体的机会;酶及其浓度:目前有两种Taq DNA聚合酶供应, 一种是从栖热水生杆菌中提纯的天然酶,另一种为大肠菌合成的基因工程酶;催化一典型的PCR 反应约需酶量指总反应体积为100ul 时,浓度过高可引起非特异性扩增,浓度过低则合成产物量减少;dNTP 的质量与浓度:dNTP 的质量与浓度和PCR 扩增效率有密切关系,dNTP 粉呈颗粒状,如保存不当易变性失去生物学活性;dNTP 溶液呈酸性,使用时应配成高浓度后,以1M NaOH 或1M Tris;HCl的缓冲液将其PH调节到~,小量分装,-20℃冰冻保存;多次冻融会使dNTP 降解;在PCR 反应中,dNTP 应为50~200umol/L, 尤其是注意 4 种dNTP 的浓度要相等等摩尔配制, 如其中任何一种浓度不同于其它几种时偏高或偏低,就会引起错配;浓度过低又会降低PCR 产物的产量;dNTP 能与Mg2+结合,使游离的Mg2+浓度降低;模板靶基因核酸:模板核酸的量与纯化程度,是PCR 成败与否的关键环节之一,传统的DNA 纯化方法通常采用SDS 和蛋白酶K 来消化处理标本;SDS 的主要功能是:溶解细胞膜上的脂类与蛋白质,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜,并解离细胞中的核蛋白,SDS 还能与蛋白质结合而沉淀;蛋白酶K 能水解消化蛋白质,特别是与DNA 结合的组蛋白,再用有机溶剂酚与氯仿抽提掉蛋白质和其它细胞组份,用乙醇或异丙醇沉淀核酸;提取的核酸即可作为模板用于PCR 反应;一般临床检测标本,可采用快速简便的方法溶解细胞,裂解病原体,消化除去染色体的蛋白质使靶基因游离,直接用于PCR 扩增;RNA 模板提取一般采用异硫氰酸胍或蛋白酶K 法,要防止RNase降解RNA;Mg2+浓度:Mg2+对PCR 扩增的特异性和产量有显著的影响,在一般的PCR 反应中,各种dNTP 浓度为200umol/L时,Mg2+浓度为~L为宜;Mg2+浓度过高,反应特异性降低,出现非特异扩增,浓度过低会降低Taq DNA聚合酶的活性,使反应产物减少;PCR 反应条件的选择PCR 反应条件为温度、时间和循环次数;温度与时间的设置:基于PCR 原理三步骤而设置变性-退火-延伸三个温度点;在标准反应中采用三温度点法,双链DNA 在90~95℃变性,再迅速冷却至40 ~60℃,引物退火并结合到靶序列上,然后快速升温至70~75℃,在Taq DNA 聚合酶的作用下,使引物链沿模板延伸;对于较短靶基因长度为100~300bp 时可采用二温度点法, 除变性温度外、退火与延伸温度可合二为一,一般采用94℃变性,65℃左右退火与延伸此温度Taq DNA酶仍有较高的催化活性;①变性温度与时间:变性温度低,解链不完全是导致PCR 失败的最主要原因;一般情况下,93℃~94℃lmin足以使模板DNA变性,若低于93℃则需延长时间,但温度不能过高,因为高温环境对酶的活性有影响;此步若不能使靶基因模板或PCR 产物完全变性,就会导致PCR 失败;②退火复性温度与时间:退火温度是影响PCR 特异性的较重要因素;变性后温度快速冷却至40℃~60℃,可使引物和模板发生结合;由于模板DNA 比引物复杂得多,引物和模板之间的碰撞结合机会远远高于模板互补链之间的碰撞;退火温度与时间,取决于引物的长度、碱基组成及其浓度,还有靶基序列的长度;对于20 个核苷酸,G+C 含量约50%的引物,55℃为选择最适退火温度的起点较为理想;引物的复性温度可通过以下公式帮助选择合适的温度:Tm值解链温度=4G+C+2A+T复性温度=Tm值-5~10℃在Tm值允许范围内, 选择较高的复性温度可大大减少引物和模板间的非特异性结合,提高PCR 反应的特异性;复性时间一般为30~60sec,足以使引物与模板之间完全结合;③延伸温度与时间:Taq DNA聚合酶的生物学活性:70~80℃150核苷酸/S/酶分子70℃60 核苷酸/S/酶分子55℃24 核苷酸/S/酶分子高于90℃时, DNA合成几乎不能进行;PCR 反应的延伸温度一般选择在70~75℃之间,常用温度为72℃,过高的延伸温度不利于引物和模板的结合;PCR 延伸反应的时间,可根据待扩增片段的长度而定,一般1Kb以内的DNA片段,延伸时间1min是足够的;3~4kb 的靶序列需3~4min;扩增10Kb 需延伸至15min;延伸进间过长会导致非特异性扩增带的出现;对低浓度模板的扩增,延伸时间要稍长些;循环次数:循环次数决定PCR 扩增程度;PCR 循环次数主要取决于模板DNA的浓度;一般的循环次数选在30~40 次之间,循环次数越多,非特异性产物的量亦随之增多;PCR 反应特点特异性强PCR 反应的特异性决定因素为:①引物与模板DNA 特异正确的结合;②碱基配对原则;③Taq DNA 聚合酶合成反应的忠实性;④靶基因的特异性与保守性;其中引物与模板的正确结合是关键;引物与模板的结合及引物链的延伸是遵循碱基配对原则的;聚合酶合成反应的忠实性及Taq DNA 聚合酶耐高温性,使反应中模板与引物的结合复性可以在较高的温度下进行,结合的特异性大大增加,被扩增的靶基因片段也就能保持很高的正确度;再通过选择特异性和保守性高的靶基因区,其特异性程度就更高;灵敏度高PCR 产物的生成量是以指数方式增加的,能将皮克pg=10 -12 g量级的起始待测模板扩增到微克ug=10 -6 g水平;能从100 万个细胞中检出一个靶细胞;在病毒的检测中,PCR 的灵敏度可达3 个RFU空斑形成单位;在细菌学中最小检出率为3 个细菌;简便、快速PCR 反应用耐高温的Taq DNA 聚合酶,一次性地将反应液加好后,即在DNA 扩增液和水浴锅上进行变性-退火-延伸反应,一般在2~4 小时完成扩增反应;扩增产物一般用电泳分析,不一定要用同位素,无放射性污染、易推广;对标本的纯度要求低不需要分离病毒或细菌及培养细胞,DNA 粗制品及总RNA均可作为扩增模板;可直接用临床标本如血液、体腔液、洗嗽液、毛发、细胞、活组织等粗制的DNA 扩增检测;PCR 扩增产物分析PCR 产物是否为特异性扩增,其结果是否准确可靠,必须对其进行严格的分析与鉴定,才能得出正确的结论;PCR产物的分析,可依据研究对象和目的不同而采用不同的分析方法;凝胶电泳分析:PCR产物电泳,EB 溴乙锭染色紫外仪下观察,初步判断产物的特异性;PCR产物片段的大小应与预计的一致,特别是多重PCR,应用多对引物,其产物片断都应符合预讦的大小,这是起码条件;琼脂糖凝胶电泳:通常应用1~2%的琼脂糖凝胶,供检测用;聚丙烯酰胺凝胶电泳:6~10%聚丙烯酰胺凝胶电泳分离效果比琼脂糖好,条带比较集中,可用于科研及检测分析;酶切分析:根据PCR 产物中限制性内切酶的位点,用相应的酶切、电泳分离后,获得符合理论的片段,此法既能进行产物的鉴定,又能对靶基因分型,还能进行变异性研究;分子杂交:分子杂交是检测PCR 产物特异性的有力证据,也是检测PCR 产物碱基突变的有效方法;Southern 印迹杂交:在两引物之间另合成一条寡核苷酸链内部寡核苷酸标记后做探针,与PCR 产物杂交;此法既可作特异性鉴定,又可以提高检测PCR 产物的灵敏度,还可知其分子量及条带形状,主要用于科研;斑点杂交:将PCR 产物点在硝酸纤维素膜或尼膜薄膜上,再用内部寡核苷酸探针杂交,观察有无着色斑点,主要用于PCR 产物特异性鉴定及变异分析;核酸序列分析:是检测PCR 产物特异性的最可靠方法;PCR 常见问题总结PCR 产物的电泳检测时间一般为48h 以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h 后带型不规则甚致消失;假阴性,不出现扩增条带PCR 反应的关键环节有①模板核酸的制备,②引物的质量与特异性,③酶的质量及活性④PCR循环条件;寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究;模板:①模板中含有杂蛋白质,②模板中含有Taq 酶抑制剂,③模板中蛋白质没有消化除净,特别是染色体中的组蛋白,④在提取制备模板时丢失过多,或吸入酚;⑤模板核酸变性不彻底;在酶和引物质量好时,不出现扩增带,极有可能是标本的消化处理,模板核酸提取过程出了毛病,因而要配制有效而稳定的消化处理液,其程序亦应固定不宜随意更改;酶失活:需更换新酶,或新旧两种酶同时使用,以分析是否因酶的活性丧失或不够而导致假阴性;需注意的是有时忘加Taq 酶或溴乙锭;引物:引物质量、引物的浓度、两条引物的浓度是否对称,是PCR 失败或扩增条带不理想、容易弥散的常见原因;有些批号的引物合成质量有问题,两条引物一条浓度高,一条浓度低,造成低效率的不对称扩增,对策为:①选定一个好的引物合成单位;②引物的浓度不仅要看OD值,更要注重引物原液做琼脂糖凝胶电泳,一定要有引物条带出现,而且两引物带的亮度应大体一致,如一条引物有条带,一条引物无条带,此时做PCR 有可能失败,应和引物合成单位协商解决;如一条引物亮度高,一条亮度低,在稀释引物时要平衡其浓度;③引物应高浓度小量分装保存,防止多次冻融或长期放冰箱冷藏部分,导致引物变质降解失效;④引物设计不合理,如引物长度不够,引物之间形成二聚体等;Mg2+浓度:Mg2+离子浓度对PCR 扩增效率影响很大,浓度过高可降低PCR扩增的特异性,浓度过低则影响PCR 扩增产量甚至使PCR扩增失败而不出扩增条带;反应体积的改变:通常进行PCR 扩增采用的体积为20ul、30ul、50ul;或100ul,应用多大体积进行PCR 扩增,是根据科研和临床检测不同目的而设定,在做小体积如20ul 后,再做大体积时,一定要模索条件,否则容易失败;物理原因:变性对PCR 扩增来说相当重要,如变性温度低,变性时间短,极有可能出现假阴性;退火温度过低,可致非特异性扩增而降低特异性扩增效率退火温度过高影响引物与模板的结合而降低PCR扩增效率;有时还有必要用标准的温度计,检测一下扩增仪或水溶锅内的变性、退火和延伸温度,这也是PCR失败的原因之一;靶序列变异:如靶序列发生突变或缺失,影响引物与模板特异性结合,或因靶序列某段缺失使引物与模板失去互补序列,其PCR 扩增是不会成功的;假阳性出现的PCR 扩增条带与目的靶序列条带一致,有时其条带更整齐,亮度更高;引物设计不合适:选择的扩增序列与非目的扩增序列有同源性, 因而在进行PCR 扩增时, 扩增出的PCR产物为非目的性的序列;靶序列太短或引物太短,容易出现假阳性;需重新设计引物;靶序列或扩增产物的交叉污染:这种污染有两种原因:一是整个基因组或大片段的交叉污染,导致假阳性;这种假阳性可用以下方法解决:①操作时应小心轻柔,防止将靶序列吸入加样枪内或溅出离心管外;②除酶及不能耐高温的物质外,所有试剂或器材均应高压消毒;所用离心管及样进枪头等均应一次性使用;③必要时,在加标本前,反应管和试剂用紫外线照射,以破坏存在的核酸;二是空气中的小片段核酸污染,这些小片段比靶序列短,但有一定的同源性;可互相拼接,与引物互补后,可扩增出PCR产物,而导致假阳性的产生,可用巢式PCR 方法来减轻或消除;出现非特异性扩增带PCR 扩增后出现的条带与预计的大小不一致,或大或小,或者同时出现特异性扩增带与非特异性扩增带;非特异性条带的出现,其原因:一是引物与靶序列不完全互补、或引物聚合形成二聚体;二是Mg2+离子浓度过高、退火温度过低,及PCR 循环次数过多有关;其次是酶的质和量,往往一些来源的酶易出现非特异条带而另一来源的酶则不出现,酶量过多有时也会出现非特异性扩增;其对策有:①必要时重新设计引物;②减低酶量或调换另一来源的酶;③降低引物量,适当增加模板量,减少循环次数;④适当提高退火温度或采用二温度点法93℃变性,65℃左右退火与延伸;出现片状拖带或涂抹带PCR 扩增有时出现涂抹带或片状带或地毯样带;其原因往往由于酶量过多或酶的质量差,dNTP浓度过高,Mg2+浓度过高,退火温度过低,循环次数过多引起;其对策有:①减少酶量,或调换另一来源的酶;②减少dNTP的浓度;③适当降低Mg2+浓度;④增加模板量,减少循环次数;PCR 污染与对策PCR 反应的最大特点是具有较大扩增能力与极高的灵敏性,但令人头痛的问题是易污染,极其微量的污染即可造成假阳性的产生;污染原因一标本间交叉污染:标本污染主要有收集标本的容器被污染,或标本放置时,由于密封不严溢于容器外,或容器外粘有标本而造成相互间交叉污染;标本核酸模板在提取过程中,由于吸样枪污染导致标本间污染;有些微生物标本尤其是病毒可随气溶胶或形成气溶胶而扩散,导致彼此间的污染;二PCR 试剂的污染:主要是由于在PCR 试剂配制过程中,由于加样枪、容器、双蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染.三PCR扩增产物污染:这是PCR反应中最主要最常见的污染问题, 因为PCR产物拷贝量大一般为1013拷贝/ml,远远高于PCR 检测数个拷贝的极限,所以极微量的PCR 产物污染,就可造成假阳就可形成假阳性;还有一种容易忽视,最可能造成PCR 产物污染的形式是气溶胶污染;在空气与液体面摩擦时就可形成气溶胶,在操作时比较剧烈地摇动反应管,开盖时、吸样时及污染进样枪的反复吸样都可形成气溶胶而污染;据计算一个气溶胶颗粒可含48000 拷贝,因而由其造成的污染是一个值得特别重视的问题;四实验室中克隆质粒的污染:在分子生物学实验室及某些用克隆质粒做阳性对照的检验室,这个问题也比较常见;因为克隆质粒在单位容积内含量相当高,另外在纯化过程中需用较多的用具及试剂,而且在活细胞内的质粒,由于活细胞的生长繁殖的简便性及具有很强的生命力,其污染可能性也很大;污染的监测一个好的实验室,要时刻注意污染的监测,考虑有无污染是什么原因造成的污染,以便采取措施,防止和消除污染;对照试验1. 阳性对照:在建立PCR 反应实验室及一般的检验单位都应设有PCR 阳性对照,它是PCR 反应是否成功、产物条带位置及大小是否合乎理论要求的一个重要的参考标志;阳性对照要选择扩增度中等、重复性好,经各种鉴定是该产物的标本,如以重组质粒为阳性对照,其含量宜低不宜高100 个拷贝以下,但阳性对照尤其是重组质粒及高浓度阳性标本,其对检测或扩增样品污染的可能性很大;因而当某一PCR 试剂经自己使用稳定,检验人员心中有数时,在以后的实验中可免设阳性对照;2. 阴性对照:每次PCR 实验务必做阴性对照;它包括①标本对照:被检的标本是血清就用鉴定后的正常血清作对照;被检的标本是组织细胞就用相应的组织细胞作对照;②试剂对照:在PCR 试剂中不加模板DNA或RNA,进行PCR 扩增,以监测试剂是否污染;3. 重复性试验4. 选择不同区域的引物进行PCR 扩增防止污染的方法一合理分隔实验室:将样品的处理、配制PCR 反应液、PCR 循环扩增及PCR产物的鉴定等步骤分区或分室进行,特别注意样本处理及PCR产物的鉴定应与其它步骤严格分开;最好能划分①标本处理区;②PCR 反应液制备区;③PCR 循环扩增区;④PCR 产物鉴定区;其实验用品及吸样枪应专用,实验前应将实验室用紫外线消毒以破坏残留的DNA 或RNA;二吸样枪:吸样枪污染是一个值得注意的问题;由于操作时不慎将样品或模板核酸吸入枪内或粘上枪头是一个严重的污染源,因而加样或吸取模板核酸时要十分小心,吸样要慢,吸样时尽量一次性完成,忌多次抽吸,以免交叉污染或产生气溶胶污染;三预混和分装PCR试剂:所有的PCR 试剂都应小量分装,如有可能,PCR 反应液应预先配制好,然后小量分装,-20℃保存;以减少重复加样次数,避免污染机会;另外,PCR 试剂,PCR 反应液应与样品及PCR产物分开保存,不应放于同一冰盒或同一冰箱;四防止操作人员污染,使用一次性手套、吸头、小离心管应一次性使用;五设立适当的阳性对照和阴性对照,阳性对照以能出现扩增条带的最低量的标准病原体核酸为宜,并注意交叉污染的可能性,每次反应都应有一管不加模板的试剂对照及相应不含有被扩增核酸的样品作阴性对照;六减少PCR 循环次数,只要PCR 产物达到检测水平就适可而止;七选择质量好的Eppendorf管,以避免样本外溢及外来核酸的进入,打开离心管前应先离心,将管壁及管盖上的液体甩至管底部;开管动作要轻,以防管内液体溅出;参考文献一、主要教学参考书:1.基因工程原理第二版.吴乃虎编著,科学出版社2.分子克隆实验指南第三版.黄培堂等译,科学出版社3.基因克隆和DNA分析.魏群等译,高等教育出版社4.最新分子生物学实验技术梁国栋主编,科学出版5分子生物学实验指导主编:魏群高等教育出版社施普林格出版社二、主要参考文献:, SN, ACY Chang and L Hsu, 1972, Sci. 69:2110., HC and J Doly. 1979.,Nucleic Acids Res. 7:1513., C and P Borst, 1972.,Biochim. Biophys. Acta 269:192.F, RL Rodriguez, PJ Greene, MC Betlach, HL Heyneker, HW Boyer, JH Crosa, and S Falkow, 1977b,,Gene 2:95.K, F Faloona, S Scharf, R Saiki, G Horn and H Erlich, 1986.,Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 51:263.。
基因克隆实验报告
基因克隆实验报告摘要:本实验旨在通过基因克隆技术,将特定基因从一个细胞中复制并插入到另一个细胞中,以实现基因的传递和表达。
实验采用了大肠杆菌作为模型生物,利用质粒载体和限制酶切技术完成了基因的克隆和转移。
通过本实验的操作,成功地将目标基因从一个细胞复制并转移到另一个细胞中,验证了基因克隆技术的有效性。
一、实验材料和方法1. 实验材料:- 大肠杆菌菌种- 目标基因DNA样本- 质粒载体- 限制酶- DNA连接酶- 抗生素培养基2. 实验步骤:步骤一:菌液制备1. 取一支滤漏筒,加入适量的LB培养基,用移液管取一小部分大肠杆菌菌种,接种于LB培养基中,静置在37℃恒温摇床中培养过夜。
步骤二:DNA提取1. 取LB培养基中的大肠杆菌菌液,用离心机进行离心分离,将上清液去除,留取沉淀。
步骤三:DNA酶切1. 取目标基因DNA样本和质粒载体,分别加入限制酶,按照限制酶切反应的条件进行反应。
步骤四:DNA连接1. 取等体积的酶切后的目标基因DNA和质粒载体,加入DNA连接酶,按照连接酶反应条件进行反应。
步骤五:转化1. 将连接后的DNA溶液加入已经制备好的培养基中,用恒温摇床静置培养。
步骤六:筛选1. 取一块含有抗生素的琼脂平板,将转化后的菌液均匀涂布在平板上,放入恒温箱培养。
步骤七:分离1. 从琼脂平板上挑选抗生素抵抗的单个菌落,进行培养。
二、实验结果与分析通过本实验的操作,成功地将目标基因从一个细胞复制并转移到另一个细胞中。
在转化后的琼脂平板上,观察到一些菌落的形成,这些菌落对抗生素具有抗性。
说明转化后的细胞成功地表达了目标基因,并能产生相应的蛋白质。
三、讨论与总结基因克隆技术是现代生物学研究中常用的实验手段之一。
通过限制酶切和DNA连接,可以实现基因的克隆和转移。
本实验结果表明,大肠杆菌是一个有效的模型生物,可用于基因克隆实验。
通过对转化菌落的筛选和培养,可以得到具有抗生素抵抗能力的菌落,进一步验证了实验结果的有效性。
基因克隆转化实验报告
一、实验目的1. 掌握基因克隆的基本原理和操作步骤;2. 学习基因克隆转化实验技术;3. 验证目的基因在受体细胞中的表达。
二、实验原理基因克隆是指将目的基因从基因组中提取出来,并在受体细胞中稳定复制、表达的过程。
基因克隆转化实验主要包括以下步骤:目的基因的提取、克隆载体构建、目的基因与克隆载体的连接、转化受体细胞、筛选阳性克隆、鉴定阳性克隆等。
三、实验材料1. 材料:大肠杆菌DH5α、克隆载体pUC19、目的基因片段、DNA连接酶、限制性内切酶、DNA聚合酶、质粒提取试剂盒等;2. 仪器:PCR仪、电泳仪、凝胶成像仪、离心机、恒温培养箱等;3. 试剂:LB培养基、氨苄青霉素、IPTG、X-gal等。
四、实验方法1. 目的基因的提取:采用PCR技术扩增目的基因片段,利用限制性内切酶将目的基因片段与克隆载体连接;2. 克隆载体构建:将目的基因片段与克隆载体pUC19连接,构建重组克隆载体;3. 转化受体细胞:将重组克隆载体转化到大肠杆菌DH5α中;4. 筛选阳性克隆:在含有氨苄青霉素的LB培养基上培养转化后的菌落,挑选白色菌落进行PCR验证;5. 鉴定阳性克隆:对PCR验证阳性的菌落进行菌落PCR,将扩增产物进行电泳,观察条带是否与预期大小一致。
五、实验结果1. 目的基因提取:PCR扩增产物电泳结果显示,目的基因片段大小与预期一致;2. 克隆载体构建:重组克隆载体转化到大肠杆菌DH5α后,在含有氨苄青霉素的LB培养基上培养,观察到白色菌落;3. 筛选阳性克隆:PCR验证结果显示,白色菌落中含有目的基因片段;4. 鉴定阳性克隆:菌落PCR结果显示,阳性克隆中含有与预期大小一致的目的基因片段。
六、实验讨论1. 实验过程中,DNA连接酶和限制性内切酶的用量、转化效率等因素对实验结果有一定影响,需根据实际情况调整;2. 实验中,菌落PCR验证和鉴定阳性克隆是确保实验结果准确的关键步骤;3. 基因克隆转化实验技术在生物科研和生物医药领域具有广泛的应用前景。
基因克隆实验流程
U PT OOF F40% 卓越速度 触手可及基因克隆实验流程特惠活动时间:2011年2月1日-4月30日特惠活动时间:2011年2月1日-4月30日© 2011 Roche Diagnostics LimitedS A LE如需订货或是了解本次活动详情,请联系我们免费订货热线: 800-820-3361 400-820-3361技术咨询: 800-820-0577 | *********************传真*************邮箱:******************更多优惠活动,请登陆罗氏网站查询/specials 本次活动最终解释权归罗氏应用科学部。
40% Off PCR 扩增试剂盒40% Off DNA 分离纯化试剂盒40% Off 克隆产品Up to 40% Off X-tremeGENE 转染试剂20% Off cOmplete ULTRA 蛋白酶抑制剂40% Off 逆转录产品上海市淮海中路1045号淮海国际广场12楼 邮编: 200031Tel: +86 21 3397 1000Fax: +86 21 3397 1188订货热线:800-820-3361 400-820-3361技术服务:800-820-0577|*********************邮箱:******************罗氏诊断产品(上海)有限公司罗氏应用科学部北京市东城区东长安街1号东方广场东方经贸城中二办公楼六层09室 邮编: 100738Tel: +86 10 8515 4100Fax: +86 10 8515 4188北京广州市环市东路403号广州国际电子大厦25楼邮编: 510095Tel: +86 20 8713 2600Fax: +86 20 8713 2700广州基因克隆实验流程手动核酸分离纯化目标核酸类型原始样本实验用时产量/得率推荐产品DNA 片段PCR 混合物, 限制性酶切产物, 琼脂糖凝胶切片, 经标记和修饰的反应混合物10 min5 -25 µg 大于 100 bp DNA 的回收率> 80% High Pure PCR Product Purification Kit 回收率> 85% ,最高可回收20 µg DNA High Pure PCR Cleanup Micro Kit 放射性标记的 DNA, 去除多余的荧光标记终止子7 min20 - 75 µl 标记混合物的回收率 > 80%mini Quick Spin DNA Columns质粒 DNA E. coli 质粒30 min2ml E. coli XL1菌液可分离pUC19质粒DNA 达 12 µg High Pure Plasmid Isolation Kit 60 min 30 ml E. coli DH5α 菌液可分离pBS 质粒DNA> 85 µg Genopure Plasmid Midi Kit 75 min150 ml E. coli XL1 blue 菌液可分离pUC19质粒DNA> 420 µgGenopure Plasmid Maxi Kit基因组DNA组织、培养细胞、细菌、酵母、血20 - 200 min ,取决于样本来源 3 - 20 µg ,取决于样本来源High Pure PCR Template PreparationKit哺乳类/人血1.5 hour ,不含重悬时间570 µg ,从10ml 鼠/兔全血浆中分离DNA Isolation for Mammlian Blood DNA 片段琼脂糖凝胶切片60 min0.4 - 9.5kb 的DNA 片断回收率为80%Agarose Gel DNA Extraction Kit产品选择指南更多信息,欢迎登录:/sis/napure核酸分离纯化■节省时间 – 更短的时间处理更多的样本。
基因克隆实验流程
基因克隆实验流程基因克隆技术,又称重组 DNA 技术,是将目的基因与具有自主复制能力的载体DNA 进行体外重组,获得新的重组DNA后导入受体细胞中表达相应蛋白,以研究蛋白结构与功能及其与其他分子的相互作用。
一、获取目的基因目的基因就是需要研究的特定基因或DNA片段。
获取目的基因的主要方法: 1、用限制性内切酶解染色体DNA,构建基因组文库,再从基因组文库中筛选目的基因。
该法的优点是获得的目的基因的组织结构与天然基因完全相同,在结构基因中也含有内含子序列,但是也正因为这一点构成了该法最大缺点,即含有内含子的基因在原核细胞中不能表达。
原因是原核细胞不能识别并剪切插入顺序(内含子),因而也不能表达出正确的基因产物。
2、分离纯化细胞中的mRNA,以mRNA为模板,在反转录酶作用下生成cDNA第一链,再以cDNA第一链为模板在DNA聚合酶作用下生成双链cDNA,构建cDNA文库,从中筛选所需的目的基因。
此法仅用于筛选为蛋白质编码的结构基因。
因成熟的mRNA分子中已经切除了内含子序列,具有完整的阅读框架,可在原核细胞中正确表达。
3、人工体外合成基因:由于当前人工体外合成DNA的长度有限,此法仅用于制备小分子生物活性多肽基因和小分子量蛋白基因。
在基因较大情况下,常需先合成多个DNA片段,然后拼接成完整的基因,此法还要求目的基因的全部碱基顺序已被阐明。
4、PCR法扩增基因:PCR(聚合酶链式反应)技术的出现和发展,为目的基因的寻找提供了有力技术工具。
用PCR法可选择性扩增基因组中所要研究的个别基因或DNA片段,或用反向PCR技术,先将特定mRNA反转录为cDNA第一链,然后再进行扩增。
用PCR法筛选基因,需要对目的基因的DNA序列至少有部分了解。
二、选择适当的载体按上述方法制备的目的基因如果没有合适的载体协助,很难进入受体细胞,即使能进入,往往也不能进行复制和表达,因为这些外源性DNA一般不带有复制调控系统。
为了保证目的基因或外源DNA片段能在细胞内克隆,必须将它们与适当的载体连接。
原核或真核细胞基因克隆的实验方案
原核或真核细胞基因克隆的实验方案
基因克隆是指将一个生物体的基因序列复制并导入到另一个生物体中。
下面是一个原核或真核细胞基因克隆的实验方案的概述:
原核细胞基因克隆实验方案如下:
1. 选择一个合适的质粒(vector),如pUC19。
2. 从原核细胞中提取目标基因的DNA序列。
3. 将目标基因的DNA序列连接至质粒上的适当限制酶切位点,形成重组质粒。
4. 将重组质粒转化至宿主细菌中,如大肠杆菌。
5. 在含有适当选择性培养基的培养皿中培养转化后的细菌。
6. 通过筛选克隆检测获得目标基因被成功插入质粒的细菌。
7. 最后,提取重组质粒中的目标基因。
真核细胞基因克隆实验方案如下:
1. 选择一个合适的真核细胞载体(vector),如pCDNA3.
2. 将目标基因的DNA序列放入真核细胞载体中,形成重组载体。
3. 将重组载体转染入真核细胞中,如哺乳动物细胞。
4. 在培养基中培养转染后的真核细胞。
5. 筛选和收集含有目标基因的克隆细胞。
6. 验证克隆细胞中目标基因的存在,如通过PCR或DNA测序等方法。
7. 最终,可通过克隆细胞培养、提取目标基因的方式获得目标基因。
在进行任何实验操作前,请确保遵守实验室的安全规范和伦理要求,并获得相应的研究伦理审批。
基因的克隆纯化实验报告
一、实验目的1. 学习并掌握基因克隆的基本原理和操作方法。
2. 掌握基因纯化的实验技术。
3. 熟悉实验器材和试剂的使用。
二、实验原理基因克隆是指将目的基因片段插入到载体中,形成重组DNA分子,并使其在宿主细胞中复制和表达。
基因纯化是指从复杂的混合物中提取目的基因片段,并去除其他非目的物质。
本实验以人颗粒酶B基因为例,进行克隆和纯化实验。
三、实验材料1. 实验器材:PCR仪、电泳仪、凝胶成像系统、离心机、移液器、培养箱等。
2. 试剂:DNA提取试剂盒、PCR试剂盒、限制性内切酶、DNA连接酶、Taq酶、载体、质粒提取试剂盒、琼脂糖、DNA marker、Tris-HCl缓冲液、NaCl等。
四、实验步骤1. 目的基因的扩增(1)提取肿瘤组织中的淋巴细胞,抽提RNA。
(2)以RNA为模板,进行RT-PCR,扩增人颗粒酶B基因全长。
(3)将扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,观察结果。
2. 重组质粒的构建(1)将扩增产物与pGEX24T21载体进行连接。
(2)将连接产物转化到大肠杆菌DH5α中,进行菌落培养。
(3)挑选阳性克隆,进行PCR验证。
3. 重组质粒的鉴定(1)提取重组质粒,进行限制性内切酶酶切。
(2)进行琼脂糖凝胶电泳,观察结果。
(3)对阳性克隆进行DNA测序,验证基因序列的正确性。
4. 重组质粒的表达与纯化(1)将重组质粒转化到大肠杆菌BL21中,进行菌落培养。
(2)以IPTG诱导重组质粒表达。
(3)进行SDS-PAGE电泳,观察表达产物。
(4)采用Ni亲和树脂对表达产物进行纯化。
5. 纯化产物的鉴定(1)对纯化产物进行SDS-PAGE电泳,观察结果。
(2)对纯化产物进行Western blot分析,验证其特异性。
五、实验结果与分析1. RT-PCR扩增结果:成功扩增出人颗粒酶B基因全长。
2. 重组质粒构建结果:成功构建了pGEX2GrB重组质粒。
3. 重组质粒鉴定结果:限制性内切酶酶切结果与预期相符,DNA测序结果与GenBank数据库中的人颗粒酶B基因序列一致。
克隆技术的实验步骤
克隆技术的实验步骤克隆技术是一种重要的生物学实验技术,它可以复制生物体的基因或细胞,从而实现基因工程、疾病研究等多个领域的应用。
下面将介绍克隆技术的实验步骤。
1. 购买实验所需材料和试剂进行克隆实验需要准备一系列的实验材料和试剂,包括质粒DNA、目的基因片段、酶切酶、连接酶、DNA聚合酶、DNA电泳仪等。
这些材料和试剂可以在生物实验室或相关供应商处购买。
2. 提取DNA首先需要提取所需的DNA,可以通过细菌培养物或其他细胞来源获得。
提取DNA的方法有多种,常用的是酚氯仿法或商用DNA提取试剂盒。
3. 酶切DNA将提取的DNA与酶切酶一起反应,酶切酶可以识别特定的DNA序列并切割。
酶切酶的选择要根据所需的实验目的来确定,常用的有限制性内切酶。
4. 准备载体和目的基因片段同时进行酶切的还有载体DNA和目的基因片段。
载体是一种可以承载目的基因的DNA分子,常用的载体有质粒、病毒等。
目的基因片段是需要复制的基因或DNA序列。
5. 进行DNA连接将酶切后的载体DNA和目的基因片段进行连接,可以使用连接酶催化这一反应。
连接酶可以将两段DNA的末端连接起来,形成一个新的DNA分子。
6. 转化宿主细胞将连接好的DNA转化入宿主细胞中,使其能够复制和表达。
转化的方法有多种,常用的是化学法或电穿孔法。
转化后的细胞称为重组细胞。
7. 筛选重组细胞为了筛选出成功转化了目的基因的细胞,可以在培养基中添加适当的筛选物质,如抗生素。
只有带有目的基因的细胞才能在含有筛选物质的培养基中存活下来。
8. 验证克隆结果通过PCR扩增、DNA测序等方法,对筛选出的重组细胞进行验证,确认其是否成功克隆了目的基因。
PCR扩增可以扩增出目的基因特异性的DNA片段,而DNA测序可以确定目的基因的序列是否正确。
9. 扩大培养将验证通过的重组细胞进行扩大培养,获得足够数量的目的基因复制体。
10. 应用实验结果获得目的基因复制体后,可以进行进一步的应用。
整个基因克隆实验流程完整
一、组织总R N A的提取有关试剂: Trizol ;氯仿;苯酚;异丙醇;75%乙醇; RNase-free水有关仪器:制冰机;液氮 & 研钵 /生物样品研磨仪;高速离心计;移液器(1ml、200μl、100μl/50 μl);涡旋振荡仪;恒温金属浴。
有关耗材:解剖工具,冰盒,离心管,离心管架,吸头(1ml, 200μl/300 μl),一次性手套,实验手套。
实验步骤1. 取暂养草鱼,冰上搁置一段时间,而后解剖,剪取肠道 50~100mg,放入研钵中,加入液氮快速研磨,而后加入 1ml 预冷 TRIzol 试剂,充足研磨至无颗粒物存在。
2.转移到离心管中,室温搁置 5min,使细胞充足裂解;3.按 1ml Trizol 加入 200μl 氯仿,盖上盖子,快速充足摇匀15s,而后室温搁置 3min ;4.4℃, ,12000g 离心 15min;RNA 存在此时混淆物分为三层,基层红色的苯酚氯仿层,中间层和上层无色水相;于无色水相中;5.当心汲取上清液,千万不要汲取中间界面,不然有 DNA 污染;转移至一个新的离心管,加入等体积的异丙醇,轻轻混匀;6.室温搁置 10min; 4℃, ,12000g 离心 10min;7.弃上清,加入 1ml 75%乙醇清洗;涡旋,悬浮积淀; 4℃, ,12000g 离心 5min;8.弃上清;能够再次用 75%乙醇清洗积淀;9.弃上清;用移液器轻轻汲取管壁或管底的剩余乙醇,注意不要汲取积淀;室温搁置5min 晾干积淀;( RNA 样品不要过于干燥,不然极难溶解)10.积淀中加入 30μlRNase-free 水,轻弹管壁,使 RNA 溶解。
RNA 质量检测有关试剂:溴酚蓝,TEB/TAE 电泳缓冲液,溴乙锭( EB)有关仪器:(超微量分光光度计,移液器(μl 或 2μl 规格, 10μl 规格),电子天平,电泳仪,电泳槽,凝胶成像仪,微波炉,制冰机)有关耗材:(无菌无绒纸,吸头,离心管架, PCR 管, PCR 管架,锥形瓶,烧杯,一次性手套,实验手套,冰盒)(1) RNA 纯度的检测:测定其 OD260和 OD280的值,依据其 OD260/ OD280的比值,当其比值在 ~之间,说明提取的总 RNA 纯度比较高,没有蛋白质和基因组的污染。
基因克隆实验实验报告
一、实验目的本实验旨在学习基因克隆的基本原理和操作步骤,掌握DNA提取、限制性核酸内切酶酶切、连接、转化、筛选等基因克隆技术,并对实验结果进行分析。
二、实验原理基因克隆是指将目的基因片段插入到载体中,使其在宿主细胞中复制、表达的过程。
本实验采用以下原理:1. DNA提取:利用细胞裂解、蛋白酶K处理、酚/氯仿抽提等方法提取目的基因片段。
2. 限制性核酸内切酶酶切:利用限制性核酸内切酶识别特定的核苷酸序列,并在这些序列上切割DNA分子,产生具有黏性末端或平末端的DNA片段。
3. 连接:利用DNA连接酶将目的基因片段与载体连接,形成重组DNA分子。
4. 转化:将重组DNA分子导入宿主细胞,使其在细胞内复制、表达。
5. 筛选:通过分子生物学方法筛选出含有目的基因的细胞株。
三、实验材料与仪器1. 实验材料:大肠杆菌DH5α、质粒pUC19、目的基因片段、限制性核酸内切酶、DNA连接酶、Taq DNA聚合酶、PCR引物、酚/氯仿、无水乙醇、氯仿等。
2. 实验仪器:PCR仪、电泳仪、凝胶成像系统、离心机、紫外分光光度计、DNA纯化仪、PCR仪、电热恒温培养箱等。
四、实验步骤1. DNA提取:取一定量的大肠杆菌DH5α菌液,加入细胞裂解液,充分振荡,加入蛋白酶K,37℃水浴30min,加入酚/氯仿抽提,离心,取上清液,加入无水乙醇沉淀,离心,洗涤,溶解,得到目的基因片段。
2. 限制性核酸内切酶酶切:将目的基因片段和载体pUC19分别进行限制性核酸内切酶酶切,酶切产物经电泳鉴定后,切胶回收酶切产物。
3. 连接:将切胶回收的目的基因片段和载体pUC19在连接酶的作用下连接,连接产物经电泳鉴定后,取适量连接产物转化大肠杆菌DH5α。
4. 转化:将连接产物加入大肠杆菌DH5α菌液中,在冰浴中振荡,加入CaCl2,热冲击,涂布于含有抗生素的琼脂平板上,37℃培养过夜。
5. 筛选:挑选单菌落,进行PCR扩增,鉴定阳性克隆。