荧光定量PCR实验操作流程
荧光定量PCR实验操作流程
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荧光定量PCR实验操作流程1. 检查实验室条件在进行荧光定量PCR实验前,首先要检查实验室的环境是否适合实验。
实验室应该保持干燥、清洁和无菌。
检查PCR仪和读板器是否能正常运转,并准备所有必需的试剂和器械。
2. DNA/RNA的提取和纯化从组织和细胞中提取和纯化DNA/RNA是实验的第一步。
在提取和纯化DNA/RNA的过程中,需要保持无菌和正确的技术。
同时需要注意使用适当的缓冲液和酶切剂,以避免DNA/RNA的损伤和降解。
3. DNA/RNA质量检测检测DNA/RNA的质量和浓度,以确保实验结果的准确性。
可以使用紫外线光谱仪或其他质量检测设备。
同时,需要记录下每个样本的质量和浓度值。
4. 反转录如果需要检测RNA,需要首先进行反转录(Reverse Transcription,RT)。
反转录反应将RNA转录成相应的cDNA,可以使用逆转录酶和随机引物进行反转录反应。
5. 荧光定量PCR反应体系和引物设计荧光定量PCR反应体系包括模板DNA/RNA,荧光探针,引物和PCR反应缓冲液。
引物的设计是至关重要的,需要确保引物与目标序列的特异性和敏感性。
引物的设计可以使用NCBI或其他引物设计软件进行。
6. PCR反应设置PCR反应参数:温度梯度,反应时间和DNA量,浓度和样本装载量等。
注意反应器核心温度的控制,以确保反应的准确性和重复性。
7. 数据分析使用荧光定量PCR的结果进行数据分析。
可以使用数据分析软件,例如GenEx或其他软件。
计算出每个样本的阈值循环数(Ct值),并使用标准曲线法进行定量计算。
总之,荧光定量PCR是一种高灵敏度和高特异性的分子生物学检测技术,不仅可以用于基础研究,还可以用于临床诊断和治疗监测等领域。
在实验前需要认真准备,操作流程中需要注意无菌和正确的技术,以确保实验结果的准确性。
荧光定量PCR实验操作流程
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荧光定量PCR实验操作流程1、实验器材多样品研磨珠均质仪台式高速冷冻型微量离心机荧光定量PCR仪超净工作台分光光度计离心管TIP头2、主要实验试剂及耗材RNA提取液三氯甲烷异丙醇无水乙醇引物75%乙醇:HyPure TMMolecular Biology Grade Water配制离心管、TIP头均购湿热灭菌40min,干燥。
二、荧光定量PCR实验步骤1、总RNA抽提(枪头和离心管均经过湿热灭菌,无RNA酶)1)取匀浆器,加入1ml的Trizol Reagent,置冰上预冷。
2)取100mg组织,加入到匀浆器中。
3)充分研磨直至无可见组织块。
4)12000rpm离心10min取上清。
5)加入250 μl三氯甲烷,颠倒离心管15s,充分混匀,静置3min。
6)4℃下12000rpm离心10min。
7)将上清转移到一新的离心管中,加入0.8倍体积的异丙醇,颠倒混匀。
8)-20℃放置15min。
9)4℃下12000rpm离心10min,管底的白色沉淀即为RNA。
10)吸除液体,加入75%乙醇1.5ml洗涤沉淀。
11)4℃下12000rpm离心5min。
12)将液体吸除干净,将离心管置于超净台上吹3min。
13)加入15μl无RNA酶的水溶解RNA。
14)55℃孵育5min。
15)使用UV1800检测RNA浓度及纯度:仪器空白调零后取2.5μl 待测RNA溶液于检测基座上,放下样品臂,使用电脑上的软件开始吸光值检测。
16)将浓度过高的RNA进行适当比例的稀释,使其终浓度为200ng/μl.左右。
2、反转录(枪头和PCR均经过湿热灭菌,无RNA酶)1)取一PCR管,加入含2μg RNA的溶液。
2)加入1μl 逆转录引物。
3)用无核糖核酸酶的去离子水补足至12μl。
4)于PCR仪上65℃保温5min,迅速置冰上冷却。
5)依次加入4μl 5×buffer,2μl 10mM dNTPs,1μl RNA inhibitor和1μl 反转录酶,用枪抽吸混匀。
荧光定量pcr实验步骤
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荧光定量pcr实验步骤荧光定量PCR实验步骤引言:荧光定量PCR(qPCR)是一种广泛应用于生物学研究和临床诊断的技术,可用于准确、快速地定量检测DNA的含量。
本文将介绍荧光定量PCR实验的步骤,以及注意事项和数据分析方法。
一、实验准备1. 准备所需试剂和仪器:包括PCR反应体系的各种试剂(如引物、探针、酶等)和实时荧光定量PCR仪。
2. 根据实验设计,制定合适的实验方案。
确定需要扩增的目标序列,设计引物和探针。
二、样品处理1. 提取待测样品中的DNA,确保提取得到高质量的DNA。
可以使用商业DNA提取试剂盒进行提取,按照厂家说明进行操作。
2. 测定DNA的纯度和浓度,确保测量到的DNA适用于PCR扩增反应。
使用比色法或分光光度计检测DNA的纯度和浓度。
3. 对提取得到的DNA进行稀释,以便在PCR反应中使用。
确保稀释后的DNA浓度恰当,以避免PCR反应的干扰。
三、荧光定量PCR反应体系的准备1. 根据实验设计和目标序列的长度,计算出所需的试剂和反应体系的配比。
2. 根据计算结果,将引物、探针和模板DNA按照适当的比例加入PCR反应管中。
注意保持反应管的清洁和无菌。
3. 加入合适的PCR反应缓冲液、酶和核酸酶抑制剂等试剂。
根据实验设计的需要,可以在反应体系中添加适当的试剂,如酶切酶、胶束等。
四、PCR扩增反应1. 将PCR反应管放入实时荧光定量PCR仪中,设置好PCR反应的程序和参数。
通常包括预热、变性、退火和延伸等步骤。
2. 启动PCR反应,开始扩增。
在反应过程中,实时监测PCR产物的荧光信号强度,并记录下来。
五、数据分析与结果解读1. 在实时荧光定量PCR仪中,可以实时获得PCR反应体系中荧光信号的强度和变化趋势。
根据实验设计的需要,可以选择合适的荧光信号通道进行监测。
2. 根据荧光信号和PCR反应的周期数,可以绘制荧光增幅曲线。
通过观察曲线的形态和特征,可以初步判断PCR反应的特异性和效果。
荧光定量PCR实验使用方法
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第一部分一、基本步骤:1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;2、引物、探针的设计;3、引物探针的合成;4、反应体系的配制;5、反应条件的设定;6、反应体系和条件的优化;7、荧光曲线和数据分析;8、标准品的制备;二、技术关键:1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;从/网点的genbank中下载所需要的序列。
下载的方式有两种:一为打开某个序列后,直接点击“save”,保存格式为“.txt”文件。
保存的名称中要包括序列的物种、序列的亚型、序列的注册号。
然后,再打开DNAstar软件中的Editseq软件,点击“file”菜单中的“import”,打开后点击“save”,保存为“.seq”文件。
另一种直接用DNAstar 软件中的Editseq软件,点击“file”菜单中的“open entrez sequence”,导入后保存为“.seq”文件,保存的名称中要包括序列的物种、序列的亚型、序列的注册号。
然后要对所有的序列进行排序。
用DNAstar软件中的Seqman软件,点击“sequence”菜单中的“add”,选择要比较的“.seq”的所有文件,点击“add”或“add all”,然后点击“Done”导入要比较的序列,再点击“assemble”进行比较。
横线的上列为一致性序列,所有红色的碱基是不同的序列,一致的序列用黑色碱基表示。
有时要设定比较序列的开始与结尾。
有时因为参数设置的原因,可能分为几组(contig),若想全部放在一组中进行比较,就调整“project”菜单下的“parameter”,在“assembling”内的“minimum math percentage”默认设置为80,可调低即可。
再选择几个组,点击“contig”菜单下的“reassemble contig”即可。
选择高低的原则是在保证所分析的序列在一个“contig”内的前提下,尽量提高“minimum math percentage”的值。
荧光定量PCR操作流程
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荧光定量PCR操作流程1.目的基因引物的合成设计合成200-300bp目的基因片段的引物,利用primer 5.0引物设计工具或者手工合成,引物合成过程中注意上下游的Tm值要相似、GC碱基在上下游的引物里均匀、引物与模板序列紧密互补、引物间避免形成稳定的二聚体或发夹结构等事项。
2 总RNA提取(1)准备研钵(灭菌)、离心管(1.5ML),枪头、手套(一次性)、异丙醇、乙醇,三氯甲烷2)取适量家蚕组织,加液氮充分研磨;匀浆加1ml RNAiso Plus后匀浆;3)室温放置5min (可在-70℃下保存1个月)4)加0.2ml氯仿(chloroform),振荡混匀,室温放置5分钟;5)12000g,15min,4℃;6)取上清(约0.6ml),加与上清等体积异丙醇,室温放置10分钟;7)12000g,10min,4℃;8)取沉淀(RNA呈胶状沉淀),加1ml 75%乙醇(可在-20℃保存1年)洗涤;9)12000g,5min,4℃;10)取沉淀,室温干燥10min;11)溶解于DEPC处理水中12)-80℃保存,尽快使用,或在8)保存。
3 反转录(TOYOBO试剂盒)Nuclease-free water up to 10ul5ⅹRT buffer 2ulRT Enzyme Mix 0.5ulPrimer Mix 0.5ulRNA 0.5-1ug4定量PCR反应(本实验室7300系统)SYBR 10ulForward Primer 1ulReverse Primer 1ulROXⅠ 0.4ulc DNA模板2ul一个模板重复三次以尽量减小误差;每个模板都要设内参。
内参是生物体或者细胞中稳定表达的基因,表达量几乎不变。
而后按照试剂盒说明操作流程设定仪器参数即可。
abi quantstudio 荧光定量pcr仪操作规程
![abi quantstudio 荧光定量pcr仪操作规程](https://img.taocdn.com/s3/m/a0bf025ec381e53a580216fc700abb68a882ad63.png)
abi quantstudio 荧光定量pcr仪操作规程以下是abi quantstudio 荧光定量pcr仪的操作规程:1. 打开仪器:确保电源线插入到电源插座中,按下电源开关,荧光定量PCR仪开始启动。
启动完成后,屏幕会显示主界面。
2. 准备样品:将待测样品按照实验方案进行处理和准备,包括提取和纯化核酸、制备反应体系等,确保样品标签的正确性。
3. 设置反应模板:在主界面上选择“新建实验”的选项,并选择荧光定量PCR反应模板。
根据实验需求设置反应模板,包括样品的位置、引物和探针的浓度和体积等。
4. 加载样品:根据设置的标本位置,使用注射器或微量移液器将样品逐一加载到相应的孔中。
确保每个孔都正确对应到相应的标本。
5. 设置PCR反应参数:通过点击“设置反应参数”按钮,进入PCR反应参数设置界面。
根据实验需求设置温度、时间和周期等参数。
设置完成后,保存反应参数。
6. 开始PCR反应:点击“开始实验”按钮,启动PCR反应。
仪器会自动根据设置的参数进行PCR反应。
在PCR反应过程中,可实时监测反应的进展和荧光信号的变化。
7. 数据分析:PCR反应结束后,仪器会自动停止反应。
通过点击“数据分析”按钮,可查看PCR反应结果,包括荧光信号曲线、阈值循环数和浓度等数据。
可以保存数据文件或导出结果。
8. 关机:实验结束后,点击主界面上的“关机”选项,按照仪器提示进行关机操作。
拔下电源线,清理实验平台和反应模板,保持仪器的整洁。
以上是abi quantstudio 荧光定量pcr仪的操作规程,一定要按照实验方案和操作规程进行实验,以保证实验结果的准确性和可靠性。
实时荧光定量PCR具体实验步骤
![实时荧光定量PCR具体实验步骤](https://img.taocdn.com/s3/m/6452b3b1f80f76c66137ee06eff9aef8941e4898.png)
实时荧光定量PCR具体实验步骤
实时荧光定量(Real Time quantitative PCR)是检测RNA或DNA的一种常用技术,通过检测特定目标的增加(或减少),可以用来测定RNA 或DNA的表达水平,或者基因等的转录水平。
下面我们就对实时荧光定量PCR(RT-qPCR)的实验步骤进行具体介绍。
1.搭建实验
第一步是搭建实验,即准备实验所需的干燥试剂,第二步是准备RNA 样本,第三步是准备标准曲线,最后是根据实验需要准备实验板和实验试管。
2、RNA样品提取
在实验中,会使用到多种RNAs,一般情况下使用TRIzol或Phenol 抽提方法进行RNA抽提,不同的细胞、组织中RNA的杂质含量不一样,因此需要根据实验需求进行适当调整抽提浓度。
3、RT-qPCR反转录
在RT-qPCR反转录之前,首先要准备反转录试剂,一般采用qPCR反转录试剂盒,这种试剂盒含有足够的反转录荧光探针以及反转录引物,它可以有效帮助反转录过程。
反转录过程通过复制DNA片段的过程完成,最终转录出的cDNA存在细胞核中。
4、qPCR扩增实验
qPCR扩增实验是在反转录完成后进行,一般来说,这个步骤可以采用qPCR扩增试剂盒,该试剂盒中包含所需的扩增物质如DNA聚合酶、前驱核苷酸、dNTPs,检测细胞核中的cDNA。
qpcr的操作流程
![qpcr的操作流程](https://img.taocdn.com/s3/m/f679b8c4690203d8ce2f0066f5335a8102d266ba.png)
qpcr的操作流程
实时荧光定量PCR(qPCR)是一种高效、准确的分子生物学技朧,广泛应用于基因表达分析、病原体检测、基因型鉴定等领域。
下面将介绍qPCR的操作流程。
1. 样品处理:首先需要从样品中提取RNA或DNA,并进行适当
的纯化处理。
确保提取的核酸质量和浓度符合实验要求。
2. 质控检测:对提取的核酸进行质控检测,包括测定纯度、浓
度和完整性。
确保核酸的质量符合实验要求。
3. 反转录:对RNA进行反转录反应,将RNA转录为cDNA。
反
转录反应需要使用逆转录酶和引物,确保反转录产物的质量和完整性。
4. 准备qPCR反应体系:根据实验设计和引物设计,准备qPCR
反应体系。
包括模板DNA或cDNA、引物、探针、核酸酶、缓冲液等。
确保反应体系的配比准确。
5. 进行qPCR反应:将准备好的反应体系加入到qPCR仪器中,
进行PCR扩增反应。
根据实验设计和引物特性,设置合适的PCR程
序和参数。
6. 数据分析:分析qPCR反应的数据,包括计算Ct值、绘制标
准曲线、计算目标基因的相对表达量等。
确保数据的准确性和可靠性。
7. 结果解读:根据数据分析结果,解读实验结果。
判断目标基因的表达水平、基因型等信息,为后续实验和研究提供参考。
总的来说,qPCR操作流程包括样品处理、质控检测、反转录、准备反应体系、进行PCR反应、数据分析和结果解读等步骤。
通过严格的实验设计和操作规范,可以获得准确、可靠的实验结果,为分子生物学研究提供重要的数据支持。
实时荧光定量PCR具体实验步骤
![实时荧光定量PCR具体实验步骤](https://img.taocdn.com/s3/m/6134492d571252d380eb6294dd88d0d232d43c74.png)
实时荧光定量PCR具体实验步骤1.提取样本RNA/DNA:首先,从研究对象中提取出所需的RNA或DNA样本。
可以使用商业化的提取试剂盒来完成这一步骤。
2. 反转录酶链反应(RT):如果提取的样本为RNA,则需要先进行反转录酶链反应,将RNA转录成cDNA(即DNA拷贝),反转录酶具有多样性(M-MLV逆转录酶)和过程性(RTase)。
3.准备PCR反应体系:根据实验所需的扩增模板和引物,将PCR反应体系按照厂家提供的信息制备,通常需要包括PCR反应缓冲液、dNTPs、引物、酶、模板DNA/cDNA和稀释水。
4. 调整荧光探针的浓度:如果实验中使用到了荧光探针(如TaqMan探针、MGB探针等),需要根据实验要求对荧光探针的浓度进行调整。
5.放置PCR板:将所需的PCR试管或板放置在适当的位置,以便加载反应体系。
6.反应体系加载:按照实验所需的样品数量和模板浓度,依次向PCR反应管或板中加入反应体系。
注意,需要设置相应的阳性对照和阴性对照。
7.封闭PCR反应管/板:闭合PCR反应管或板,以防止反应体系的挥发和样品的交叉污染。
8.准备PCR仪:根据PCR仪的要求,调整PCR仪的温度和时间参数。
9.PCR扩增:将已封闭的PCR反应管或板放置在预热的PCR仪中,开始PCR扩增。
根据实验需要,设置不同的PCR程序(如热启动PCR、两步PCR和三步PCR等)。
10. 实时监测PCR过程:在PCR反应过程中,实时监测PCR反应管或板中产生的荧光信号,并记录下每个周期(cycle)的荧光值。
11. 数据分析:根据荧光信号的变化,结合标准曲线法或相对表达量法,对PCR反应中目标序列的数量进行定量分析。
常见的分析软件包括Stratagene MxPro QPCR软件和Applied Biosystems SDS软件等。
12.结果分析和解释:根据数据分析的结果,对实验结果进行解释和讨论,并在图表中呈现。
13. 结果验证:可以使用其他方法验证RT-qPCR的结果,如Western blotting、细胞免疫化学分析等。
荧光定量pcr原理和操作方法
![荧光定量pcr原理和操作方法](https://img.taocdn.com/s3/m/9d07e94f6d85ec3a87c24028915f804d2b168728.png)
荧光定量pcr原理和操作方法荧光定量PCR(Fluorescence quantitative PCR)是一种基于PCR技术,通过荧光信号来实时监测和定量PCR反应中的目标序列数量的方法。
本文将从原理和操作方法两个方面来详细介绍荧光定量PCR。
一、原理:荧光定量PCR的原理基于PCR反应进行,但其独特之处在于在PCR反应中引入荧光探针,通过荧光信号的实时监测来定量PCR反应中的目标序列数量。
1.引物设计:荧光定量PCR中仍需要设计引物。
引物是一对DNA片段,分别位于目标序列的上下游,用于对目标序列进行扩增。
扩增反应是由引物特异性地结合到目标序列上,并在PCR过程中进行DNA链的合成,增加DNA片段的数量。
2.荧光标记探针:与常规PCR不同的是,荧光定量PCR还需要引入荧光标记的探针。
探针是一个具有荧光标记物和荧光猝灭物(quencher)的特殊DNA片段。
探针要与目标序列上某一特定区域的序列互补,使探针与目标序列结合。
在探针结合的情况下,荧光标记物和荧光猝灭物相互靠近,导致荧光信号被猝灭。
3.荧光信号监测:荧光定量PCR在PCR反应过程中,实时检测荧光信号。
在荧光信号监测仪器的作用下,对PCR试管中的荧光强度进行连续采样。
在PCR初期,目标序列数量较少,探针与目标序列结合较少,荧光信号较小。
随着PCR反应的进行,目标序列数量增加,探针与目标序列结合增多,荧光信号增强。
通过监测PCR过程中荧光信号的变化,可以得到PCR反应过程中目标序列的实时数量。
二、操作方法:荧光定量PCR的具体操作步骤如下:1.实验室准备:准备好PCR试剂盒,包括引物、探针、聚合酶、dNTPs等。
根据实验需要,配制PCR试剂的工作液。
2.样品提取:根据实验的需要,从样本中提取出DNA模板。
如血液、组织、细胞等。
3.PCR反应体系的配制:根据实验需求和试剂盒说明书,配制PCR反应体系。
包括目标序列特异性的引物和探针,以及其他试剂如聚合酶、dNTPs等。
荧光定量PCR(染料法)实验操作SOP
![荧光定量PCR(染料法)实验操作SOP](https://img.taocdn.com/s3/m/aad5d4c6d5bbfd0a7956731d.png)
荧光定量PCR实验操作SOP一、 实验目的:通过本操作获得准确、无误差、客观的样品基因扩增数据,用于下一步实验结果的分析;二、 实验准备:A.进行荧光定量PCR实验操作之前,荧光定量PCR操作实验室需紫外灯照射15分钟,关闭紫外灯后开启通风系统抽风15分钟。
B.进入荧光定量PCR操作实验室后需要佩戴一次性无菌口罩、无菌乳胶手套、实验中尽量避免与同事交谈,防止PCR模板污染;C.实验前将70%乙醇涂布于操作台及器具(移液器等)表面,两分钟后用纸巾擦除。
D.准备实验中放污染材料的器皿、用于荧光定量PCR实验操作的耗材(要求无菌)1ml 枪头、200ul枪头、10ul枪头、1.5ml离心管,用荧光定量PCR操作的试剂: 荧光定量PCRMaster Mix、Taqman Probe(实验前预先稀释浓度至25pmol)、H2O,DNA或CDNA模板(注意必须在配置完荧光定量PCR所需MIX后才可以取出);E.一个实验区域在同一时间段只进行一种实验。
F.实验结束后移出个人专用材料(实验记录本)至个人专用区域保管;封好污染材料盛放器皿并移出至污物袋;移出共用器具至专门区域保管;将70%乙醇涂布于操作台或器具表面,两分钟后用纸巾擦除;打开紫外灯照射至少15分钟。
三、 实验步骤:1、荧光定量PCR MIX的配置:在实验记录本上记录下要进行实验的样品内容、日期、探针名称、实验样品孔信息(无特殊要求每样品每基因均按照3倍平行孔实验),然后计算出所需MIX 体积,分别加入后混匀分装至PCR扩增板,单孔荧光定量PCR孔Master Mix内容如下:Primer F: 0.5ul( 25pmol)Primer R: 0.5ul(25pmol)20×SYBER GREEN : 1.5uldNTP: 1ul(2.5mM)10*Buffer(含Mg2+) 3ulBT Taq: 0.5ulH2O: 22ulTotal: 29ul2、MIX配置好后混匀快速分装至PCR反应板,快速准确的将样品DNA/cDNA小心加入装有反应液体的反应管内,:DNA/CDNA Template: 1ul(200ng)荧光定量PCR 反应总体积:30ul3、模板加好后, 盖紧盖子并做好标记, 写上编号(用防水笔书写);4、严格按照荧光定量PCR仪的操作手册启动机器,设置实验扩增程序(包含荧光定量PCR扩增程序、荧光定量PCR样品孔及探针激发荧光程序、反应孔体系程序),保存文件,最好以日期及样品名称命。
荧光定量pcr操作流程
![荧光定量pcr操作流程](https://img.taocdn.com/s3/m/e4035944773231126edb6f1aff00bed5b8f37348.png)
荧光定量pcr操作流程荧光定量PCR操作流程。
荧光定量PCR(Quantitative PCR,qPCR)是一种用于定量检测DNA或RNA的技术,通过测定PCR反应过程中的荧光信号来定量目标分子的含量。
本文将介绍荧光定量PCR的操作流程,希望能对相关研究工作者提供一些帮助。
1. 实验前准备。
在进行荧光定量PCR实验前,首先要准备好所需的试剂和设备。
包括PCR试剂盒、引物、模板DNA或RNA样品、荧光定量PCR仪等。
确保所有试剂和设备的质量良好,避免对实验结果产生影响。
2. 反应体系设计。
根据实验需要,设计好PCR反应体系,包括引物浓度、模板DNA或RNA浓度、试剂盒成分等。
合理的反应体系设计是保证实验成功的关键,需要根据目标分子的特性和实验要求进行合理的优化。
3. PCR反应条件设置。
根据所用的PCR试剂盒和目标分子的特性,设置好PCR反应的温度、时间和循环次数等条件。
合理的PCR反应条件能够提高PCR 反应的特异性和效率,减少非特异性产物的形成。
4. 荧光定量PCR仪操作。
将混合好的PCR反应体系加入到荧光定量PCR仪中,按照仪器操作手册设置好检测参数,并启动荧光定量PCR仪进行检测。
在检测过程中,要及时观察荧光信号的变化,并根据实验要求进行数据记录和分析。
5. 数据分析与结果解读。
根据荧光定量PCR仪输出的数据,进行数据分析和结果解读。
通过标准曲线法或绝对定量法,计算出目标分子的含量,并进行结果的统计和图表展示。
同时,对实验结果进行科学的解读和讨论,得出合理的结论。
6. 实验后清理。
实验结束后,要对实验台面和仪器进行清理,保持实验环境的整洁。
同时,对实验数据进行归档和整理,做好实验记录和报告。
以上就是荧光定量PCR的操作流程,希望能为相关研究工作者提供一些参考和帮助。
在进行实验时,一定要严格按照操作流程进行,确保实验结果的准确性和可靠性。
祝实验顺利!。
荧光定量pcr实验步骤
![荧光定量pcr实验步骤](https://img.taocdn.com/s3/m/21789840178884868762caaedd3383c4bb4cb4ca.png)
荧光定量pcr实验步骤荧光定量PCR实验步骤荧光定量PCR(Quantitative PCR,qPCR)是一种用于测量特定DNA序列数量的技术。
它可以快速、准确地定量检测目标DNA的含量,广泛应用于基因表达分析、病原体检测、遗传变异分析等领域。
下面将介绍荧光定量PCR实验的步骤。
一、实验前准备在进行荧光定量PCR实验之前,需要做好实验前的准备工作。
1. 设计引物和探针:根据目标DNA序列设计引物和探针,确保其特异性和互补性。
2. 准备模板DNA:从样品中提取目标DNA,并进行纯化和定量。
3. 制备PCR反应体系:根据PCR反应的需要,准备好PCR反应体系,包括引物、探针、模板DNA、Taq DNA聚合酶、缓冲液和dNTP等。
4. 验证引物和探针的特异性:使用目标DNA和非目标DNA进行聚合酶链式反应,通过凝胶电泳验证引物和探针的特异性。
二、荧光定量PCR实验步骤1. 反应体系配置:按照实验设计,配置好PCR反应体系。
将引物、探针、模板DNA、Taq DNA聚合酶、缓冲液、dNTP等加入反应管中,然后加入适量的去离子水。
2. PCR反应条件设定:根据引物和探针的特性,设定PCR反应的温度和时间参数。
一般来说,PCR反应包括预变性、变性、退火和延伸四个阶段,其中变性温度为95℃,变性时间为30秒,退火温度为60℃,退火时间为30秒,延伸温度为72℃,延伸时间根据目标片段的长度而定。
3. PCR反应体系装入仪器:将装有PCR反应体系的反应管放入荧光定量PCR仪器中。
4. 荧光定量PCR实验运行:启动荧光定量PCR仪器,按照预设的PCR反应条件进行PCR反应。
仪器会根据设定的温度和时间参数进行PCR反应,并实时检测荧光信号。
5. 数据分析与结果解读:荧光定量PCR仪器会自动记录PCR反应过程中的荧光信号,根据荧光信号的变化可以计算出目标DNA的数量。
通过对比不同样品的荧光信号差异,可以定量分析目标DNA 的含量。
荧光定量PCR操作流程总结
![荧光定量PCR操作流程总结](https://img.taocdn.com/s3/m/1cc0758204a1b0717fd5ddac.png)
荧光定量PCR操作流程一、RNA提取准备物品:无RNA酶大中小枪头;一套枪;trizol试剂;无RNA酶EP管(1.5mL、200uL);DEPC水;氯仿;75%DEPC乙醇;异丙醇等1、1mLTrizol样品加200uL氯仿,用力晃动15s2、冰上静置5min3、4℃12000rpm 离心15min4、小心吸取上清水相400-500uL至新的无酶EP管5、按照体积1:1加异丙醇,颠倒混匀6、置于冰上30min7、4℃12000rpm 离心10min8、倒掉上清,加入500uL75%DEPC乙醇,轻弹管底使RNA沉淀漂起9、4℃12000rpm 离心5min10、吸上清弃掉,尽量吸干净11、12000rpm 离心5min12、吸上清弃掉,尽量吸干净,开盖超净台内凉置5min13、每管加20uLDEPC水溶解,弹管底使溶解混匀14、56℃助溶10min15、置于冰上测RNA浓度(Gen5 核酸检测执行)16、擦手纸蘸蒸馏水擦RNA浓度检测板加样孔,再用擦镜纸擦干17、1234孔各加2uLDEPC水,检测,本底为绿色即可继续测样本(2uL)18、依次按编号加入2uL样本,软件关闭后重新打开,选择样本检测19、批准出结果260/280=1.8-2则样品合格二、反转录qPCR准备物品:无RNA酶大中小枪头;无RNA酶EP管(1.5mL、200uL);RTmix;DEPC水1、计算1000ng(反转录RNA上样量1000ng)的RNA体积,必要时稀释2、反转录体系20uL(RTmix 4uL ;RNA样品约2uL ;DEPC水补齐20uL )3、弹管底混匀瞬时离心4、Bio-rad 中间选项takaraRT run 16min5、dd水稀释cDNA,使cDNA浓度约为10ng/uL,100uL分装后-20℃保存三、荧光定量PCR准备物品:8联管;引物;cDNA;200uLEP管;无菌枪头1、引物稀释dd水溶解稀释引物,旋涡混匀,引物储存浓度10nM/uL2、定量PCR10uL体系引物F 0.4uL引物R 0.4uLcDNA 1uL(终浓度为1ng/uL)SYBR 5uL(含染料、DNA扩增酶、DNTP、Mg2+、扩增缓冲液等)dd水3.2uL3、布板一个指标三个重复4、取10个200uL无酶EP管,按顺序编号123456789105、按照一个指标:六个孔+2个孔(防止枪误差导致各孔不均)=8孔的剂量配制混合:引物F 0.4uL*8=3.2 uL引物R 0.4uL*8=3.2 uLSYBR 5uL*8=40 uLdd水3.2uL*8=25.6 uL6、按照布板依次加入8联管中(置于冰上),最后每孔加1 uL cDNA(P5 P10 cDNA不同),设置不加cDNA模板的阴性对照。
荧光定量PCR标准操作程序
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荧光定量PCR标准操作程序ABI 7500荧光定量PCR仪标准操作程序1.打开UPS电源。
2.UPS电源稳定后,依次打开电脑和PCR仪,PCR仪开机时绿、黄、红3个灯全亮,最终绿灯常亮(如果是红灯常亮,则仪器运行不正常需联系仪器维护工程师排除仪器故障)。
3.双击桌面7500Sofeware V2.0.4图标,弹出Login界面,输入用户名,单击OK,进入实验设计主界面。
4.依次Set up→Advanced Setup→Experiment Menu,进入实验手动设计界面。
5.Setup→Experiment Properties→Experiment Name输入实验名称,选择染料类型,(如需选择SYBR Green Reagents,则必须选上溶解曲线选项)。
6.Setup→Plate Setup→Define Targets and samples设定染料探针名称、添加或删除探针和选择染料探针的报告基团和猝灭基团。
→Define s amples选择添加或删除样品。
→Assign Targets and samples 图标,可设定样品(S)、阴性对照(N)和标准品(S),并在右侧的96孔显示界面中设置每管的具体位置,尽量将样品管集中于96孔界面的中央位置。
注意:每管中都需选择加入染料探针。
7.Setup→Run Method→Graphical view设定PCR反应体系总体积、循环次数、添加或删除反应的阶段和步骤,以及反应的各个阶段和步骤的时间和温度。
(注意:由于数据的采集是在实验的延伸阶段,因此延伸阶段一定要选上数据采集图标,并且延伸时间不能少于35s。
)8.设置完毕后,向样品板中加入样品,单个样品管8连管需用专用平盖封好,96孔管用专用封膜封好,轻按样品槽右侧按钮,弹出样品槽,放入样品板,使A1朝向左上角,单手按住样品槽右侧按钮,将样品槽轻轻送进机体即可。
9.单击右上角绿色START RUN图标,开始实验。
实时荧光定量PCR详细操作步骤
![实时荧光定量PCR详细操作步骤](https://img.taocdn.com/s3/m/648c9b1d814d2b160b4e767f5acfa1c7aa0082b7.png)
实时荧光定量PCR详细操作步骤1.实验前准备a.首先,准备所需的引物和探针。
引物是用于扩增待测DNA或RNA序列的短链DNA片段,而探针是荧光标记的DNA分子,用于标记和检测扩增产物。
可以使用商业引物和探针,或者设计自定义的引物和探针。
b.准备样品。
样品可以是DNA或RNA提取物,也可以是cDNA反应产物。
确保样品的质量和纯度,避免污染和降解。
c. 准备Master Mix。
Master Mix是一个预混合的反应液,包含引物、探针、核酸酶、逆转录酶、聚合酶和其他所需的试剂。
根据实验设计确定Master Mix的配方和浓度。
2.反应管设定a. 将适量的Master Mix加入每个反应管中。
根据实验设计,确定每个反应管中所需Master Mix的体积。
b.加入适量的模板DNA或RNA溶液。
根据实验设计,确定每个反应管中所需模板溶液的体积。
c.加入适量的引物和探针。
根据实验设计,确定每个反应管中所需引物和探针的体积。
d.加入适量的缓冲溶液和其他试剂。
根据实验设计,确定每个反应管中所需缓冲溶液和其他试剂的体积。
3.PCR程序设定a.设定PCR程序。
根据引物和探针的特性,确定PCR程序的温度和时间参数。
通常包括一个初始变性步骤(95°C,5分钟),40个循环的扩增步骤(95°C,30秒;温度调节,30秒;扩增,30秒-1分钟),以及最终的降温步骤(4°C或25°C)。
b.设定数据采集方式。
实时荧光定量PCR系统可以实时监测PCR反应过程中的荧光信号变化,并实时记录和分析数据。
根据实验设计和PCR程序,选择合适的数据采集方式,在合适的时间点记录荧光信号。
4.实验操作a.将反应管安置在实时荧光定量PCR仪中。
确保反应管正确放置在PCR仪的样品槽中,并密封好。
b.启动PCR程序。
根据PCR仪的操作说明,启动PCR程序并开始反应。
c. 监测PCR反应过程。
实时观察PCR反应过程中的荧光信号变化。
荧光定量PCR实验操作流程
![荧光定量PCR实验操作流程](https://img.taocdn.com/s3/m/5286f5d2ad02de80d5d8404b.png)
➢用ddH2O,对仪器进行调零;取1ul的RNA溶液进行测定; ➢测定样品纯度和浓度。 ➢ 纯度:OD260/OD280 = 1.9-2.1 <1.8 蛋白质或酚类污染 >2.2 RNA水解 ➢ 浓度:RNA(ug/ml)=40﹡OD260*稀释倍数
逆转录
实验材料:HiFi-MMLV cDNA第一链合成试剂盒,RNA 实验步骤:
➢ 重复步骤8;12,000rpm离心2min,弃废液,吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干;
Hale Waihona Puke 细胞RNA提取5. 洗涤:
➢ 将吸附柱置于一个新的无RNase离心管(CollectionTube1.5ml)中向吸附柱的 中间部位加入30-50μl•RNase-FreeWater,室温放置1min,12,000rpm离心1min,
做5个样本,配制8个样本的预混体系,配制方式如下:
3. 将配制的预混体系,分装到八连管中。共加6个孔,每个孔中加 入18 μl的预混体系。
荧光定量PCR
4. 模板加入:
每个孔中分别加入2 μl模板,加样顺序如下:
5. 混匀,短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底 6. P。CR反应程序:
注意事项: 1.首先配制预混体系,再将预混体系分
4. 洗涤:
➢ 向吸附柱加入700 μl Buffer RW1,12,000rpm离心20s,倒掉收集管中的废液, 将吸附柱重新放回收集管中;
➢ 向吸附柱中加入500μl•Buffer•RW2(使用前检查是否已加入无水乙醇), 12,000rpm离心20s,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中;
上层无色水相, 中间白色蛋白质相, 下层红色有机相,
RNA在上层水相中
探针法荧光定量pcr实验流程
![探针法荧光定量pcr实验流程](https://img.taocdn.com/s3/m/3bb58c77182e453610661ed9ad51f01dc28157b6.png)
探针法荧光定量pcr实验流程下载温馨提示:该文档是我店铺精心编制而成,希望大家下载以后,能够帮助大家解决实际的问题。
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细胞RNA提取
5. 洗涤:
将吸附柱置于一个新的无RNase离心管(CollectionTube1.5ml)中向吸附柱的 中间部位加入30-50μl• RNase-FreeWater,室温放置1min,12,000rpm离心1min, 收集RNA溶液,进行后续试验或-70℃保存RNA,防止降解。• 注意:1)RNase-FreeWate体积不应小于30μl,体积过小影响回收率。 • 2)若提高RNA的产量,可用30-50 μl新的RNase-FreeWater重复步骤5。 • 3)若提高RNA浓度,可将得到的溶液重新加入到吸附柱中,重复步骤5。•
人cDNA RNase-Free Water
0 μl 57.6 μl
2 μl 7.2 μl
3. 将配制的预混体系,分装到八连管中。共加6个孔,每个孔中加 入18 μl的预混体系。
荧光定量PCR
4. 模板加入:
每个孔中分别加入2 μl模板,加样顺序如下:
加样孔 样品 1 原液 2 稀释10倍 3 稀释100 倍 4 稀释1000 倍 5 稀释10000 倍 0 水
6. RNA检测:
用ddH2O,对仪器进行调零;取1ul的RNA溶液进行测定;
测定样品纯度和浓度。
纯度:OD260/OD280 = 1.9-2.1 <1.8 蛋白质或酚类污染 >2.2 RNA水解 浓度:RNA(ug/ml)=40﹡OD260*稀释倍数
逆转录
实验材料:HiFi-MMLV cDNA第一链合成试剂盒,RNA 实验步骤:
荧光定量PCR
北京康为世纪生物科技有限公司
细胞RNA提取
样品:293T细胞 试剂:超纯RNA提取试剂盒、氯仿、70%乙醇 方法:柱式
原理:
• • 细胞在变性剂异硫氰酸胍的作用下被裂解,核蛋白体上的蛋白变性,核酸释放。 释放出来的DNA和RNA由于在特定pH和盐浓度下溶解度的不同而分别位于整个 体系中的中间相和水相,从而得以分离。
Thank You !
加入体 积
2 μl
2 μl
2 μl
2 μl
2 μl
2 μl
5. 混匀,短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。 6. PCR反应程序:
步骤 预变性 变性 退火/延伸 融解曲线分 析 温度 95℃ 95℃ 60℃ 95℃ 60℃ 95℃ 60℃ 时间 10min 15s 1 min 15s 1 min 15s 15s 注意事项: 1.首先配制预混体系,再将预混体系分 装到八连管中。 2. 稀释模板时,需要混匀。 不要直接在八连管管壁或管盖上做标
原液 5 μl (从1号管取) 5 μl(从2号管取) 5 μl(从3号管取) 5 μl(从4号管取)
6
45ul
对照
荧光定量PCR
2. 配制PCR预混反应体系:
做5个样本,配制8个样本的预混体系,配制方式如下:
试剂 2×UltraSYBR Mixture Forward Primer,10 µ M Reverse Primer,10 µ M 配制的8个孔的预混 体系 80 μl 6.4 μl 20 μl反应体系 10 μl 0.8 μl
材料:2×UltraSYBR Green Mixture,cDNA,actin引物
实验步骤:
1. 稀释模板:每稀释一个倍数,需要将溶液混匀,并短暂离心。
编号
1 2 3 4 5
模板稀释 倍数
1倍 10倍 100倍 1000倍 10000倍
水用量
0ul 45 μl 45 μl 45μl 45 μl
模板用量
细胞RNA提取
3. 过柱子:
吸取上层水相,至新的RNase-Free管中(注:不要吸到中层) 加入等体积70%的乙醇,颠倒混匀; 将溶液全部加入到已装入收集管(CollectionTube 2ml)的吸附柱 (Spin• Column RM)中。若一次(700ul)不能加完溶液,可分多次入; 12,000rpm离心20s,弃废液,将吸附柱重新放回收集管中;
1. 将 RNA模板、Primer Mix、dNTP Mix、DTT、RT Buffer、HiFi-MMLV和
RNase- Free Water溶解并置于冰上备用。
2. 根据以下表格配置反应体系,总体积为20 μl。
试剂 dNTP Mix,2.5 mM Each Primer Mix RNA Template 5×RT Buffer DTT,0.1 M HiFi-MMLV,200 U/μl RNase-Free Water 20 μl 反应体系 4 μl 2 μl 2 μl 4 μl 2 μl 1 μl 5 μl
4. 洗涤:
向吸附柱加入700 μl Buffer RW1,12,000rpm离心20s,倒掉收集管中的废液, 将吸附柱重新放回收集管中; 向吸附柱中加入500μl• Buffer• RW2(使用前检查是否已加入无水乙醇), 12,000rpm离心20s,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中; 重复步骤8;12,000rpm离心2min,弃废液,吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干;
冰上配制 短暂离心
42℃ 50min 70℃ 15min
逆转录
3. 涡旋震荡混匀,短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。
4. 42℃孵育3Байду номын сангаас~50分钟,70℃孵育15分钟。反应结束后,短暂离心,置于
冰上冷却。 5. 逆转录产物可直接用于PCR和荧光定量PCR,或置于-20℃长期保存。
荧光定量PCR
细胞RNA提取
1. 裂解: 细胞悬液离心,倒掉上清,加入1ml RLT; 反复吹打,使样本充分裂解; 室温放置5min,使核酸蛋白复合物完全分离 2. 抽提: Ø 加入200ul氯仿,剧烈振荡15s,室温放置2min; Ø4℃ 12,000 rpm 离心10分钟,此时样品分为三层; 上层无色水相, 中间白色蛋白质相, 下层红色有机相, RNA在上层水相中