中国海洋大学本科生课程大纲

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中国海洋大学本科生课程大纲

一、课程基本信息

二、预期学习成果

在课程结束时学生能够:

1)掌握计算机辅助药物设计的意义、作用和基本研究方法;

2)了解国内外开展计算机辅助药物设计的成功案例;

3)了解新药研究过程中所使用的关键技术方法与原理;

4)读懂相关领域的文献;

5)学会使用Chemdraw等进行构建化合物分子,并能执行分子优化,并了解常见分子模拟软件的使用。

三、教学日历

四、教材及参考资料

1、选用教材:

计算机辅助药物设计导论(第二版)付伟、叶德泳编著,化学工业出版社2、主要参考书:

(1)Molecular modeling: Principles and Applications”, Andrew R. Leach, 世界图书出版公司的影印本

(2)“Computational Chemistry: A Practical Guide for Applying Techniques to Real-World Problems”, David C. Young

(3)计算机辅助药物设计,原理方法及应用,上海科学技术出版社,陈凯先主编

(4)计算机辅助药物分子设计,化学工业出版社,徐筱杰主编

五、考核方式及评分标准

目的是让学生开课前明确考核方式,科学合理安排时间,是学生预习复习及

完成各个考核环节的参考。各环节何时实施应在“基本教学内容与学时安排”进

行体现;希望与授课助手协同,与成绩评定协同;

六、学习要求

本课程以活性分子与靶点作用原理为基础,系统学习各类计算机辅助药物设计技术的原理、方法与应用,同时介绍计算机辅助药物设计的常用软件包,能够开展基本的上机操作,为有效药物设计提供依据,为从事新药研究奠定基础。课程内容涉及药物化学、生物化学、物理化学、计算机技术等课程。学生应具备这些相关课程的理论知识和基本的上机操作技能

要完成所有的课程任务,学生必须:

(1)按时上课,上课认真听讲,积极参与课堂讨论、随堂练习和测试。本课程将包含较多的随堂提问与小组讨论等课堂活动,课堂表现和出勤率是成绩考核的组成部分。

(2)按时完成常规练习作业。这些作业要求学生按书面形式提交,只有按时提交作业,才能掌握课程所要求的内容。延期提交作业需要提前得到任课教师的许可。

(3)完成教师布置的一定量的阅读文献和背景资料、案例分析、理论探讨和算法软件应用等作业,其中大部分内容要求以小组合作形式完成。这些作业能加深对课程内容的理解、促进同学间的相互学习、并能引导对某些问题和理论的更深入探讨。

七、学术诚信规定

学习成果不能造假,如考试作弊、盗取他人学习成果、一份报告用于不同的课程等,均属造假行为。他人的想法、说法和意见如不注明出处按盗用论处。本课程如有发现上述不良行为,将按学校有关规定取消本课程的学习成绩。

八、其它

1)出勤与迟到:每缺勤与迟到一次按相应的成绩比例扣除期末成绩,如需请假须持有辅导员签字并盖章的请假条。2)未提交作业或者错过测验:按相应的成绩比例扣除期末成绩,如请假期间未提交作业或者错过测验可以补交或补测。3)课堂不礼貌行为:禁止课堂上接听手机、吃东西、喝饮料、睡觉、看手机、聊天。4)课堂表现:课堂积极发言和参与讨论将获期末成绩加分。5)作业完成:小组作业要求组内每个学生都参与其中,且承担不同的任务。

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