丙型肝炎病毒基因分型的研究进展

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丙型肝炎病毒基因分型方法研究进展

丙型肝炎病毒基因分型方法研究进展

率 约 8 , 因 1型为 4 45 _ 。 由于 HC 具 成 , 却 有 很 高 同 源性 ( O 基 O 0 1 ] V 但 同源性 ≥ 9 ) HC 变 异 5 的 V 有 高度 遗传 异 质 性 , 因 型众 多 , 个 患 者 都 代 表 着 株 群 体 , 为 HC 准种 。 基 每 称 基 因组 分 为 1 495 0 t V 3个 区域 : 非 编码 区( TR) 编码 区( F 及 3 非 5 5N 、 OR )
HC 基 因分型 系统 V
重要 原 因 。最 高侵染 率 可达 6 ~9 , O O 主要 发现 在
直接 、 复地 经 皮 肤 感 染 的人 群 中 , 血 友 病 患 者 和 反 如 静脉 注射 吸毒 者 。据统 计 , 丙型肝 炎 患者 中约 6 转 O 为慢性 肝 炎 , 中 又有 2 的患者 转 为肝 硬化 或肝 细 其 O 胞癌 。 目前 , HC 预 防和 治疗 还 没有 十分 有 效 的 对 V 方 法 。而不 同基 因型 与 HC 感 染后 的病 情 变化 以及 V 干 扰素 的疗效 有一 定相 关 性 。已证 明 HC 的基 因 型 V 能影 响抗 病毒 治 疗 的 效果 , 感染 HC 基 因 1型或 基 V 因 4型 的患 者 对 使 用 干 扰 素 和 病 毒 唑 ( 氮 唑 核 苷 , 三 r a i n 的标准 治 疗反应 较差 , i vr ) b i 至少 需 延 长治 疗期 一 年, 而且 感染 基 因 1型和基 因 4型 的患 者 比其 他基 因 型者能 更快 地 发 展 成 慢 性 肝 病 。最 近 发 现 一 种 新 的 化 合 物—— P G 干扰 素 ( 乙二 醇 化 的 干扰 素 a 2 , E 一 聚 a p g ltditreo — a P G— treo ) 合 病 毒 e yae — efrna2 , E i efr n 结 n n 唑治疗 感染基 因 2型 和基 因 3型 的患 者 , 维 持 反应 其

丙型肝炎病毒非结构基因NS5b研究进展

丙型肝炎病毒非结构基因NS5b研究进展
现 , 个 序列 的变 异并 不 是 随 机 和均 衡 的 , T 整 5u R就
性 的证 实 , 了解 病 毒 的复 制 及 开 发 抑 制 该 酶 活 性 对
相 当保 守 , 而包 膜 蛋 白基 因 E 和 E l 2变 异最 大 , 有 含 高变 区 ; 因 c和 N 2~N 5的变异 程 度 介 于两 者 之 基 S S
基 因 的变 异 与 病 情 及 干 扰 素 疗 效 有 一 定 的关 系 , 变 异 较 大者 常 出 现 明显 的临 床 表 现 , 干 扰 素 治 疗 可 且
能 趋 于失 败 ll 。 8
3N 5 . s b与基 因分 型
性的发挥有 重要的作用 , 突变将使 R P ̄ 其 D d 活性 消
功 能 区 基 序 ( L) 与 N 5 u工 , Sb蛋 白的 溶 解 性 显 著 相 关 , 发 现 MS 可提 高 N 5 还 Sb的 R P活性 , 2 DR Mn 可
部 分恢 复其 活性 , Z 2 抑 制 其 活性 。 而 n 则
2N S . S b的 变异 及 与 干扰 素治 疗
近年 ,o e 等 -也 证 实 , 于 缺 失 突 变 而 缺 Tm i 6 J 由
C端 疏水 区 的 N 5 S b蛋 白 的 溶 解 性 明 显 增 加 。进 一 步 研 究发 现 , 缺 失 区含 有 一 个 由 4 a组 成 的 疏 水 该 a
作一 综 述 。
1N S . S b的位 置 及功 能
失 , R A结 合 活性 仍 然 存 在 。表 明 结合 位 点 与 酶 但 N
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国外医学・ 流行病学传染痘学分避
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丙 型肝炎病毒非结构基 因 N 5 S b研 究 进 展

丙型病毒性肝炎基因分型及临床意义

丙型病毒性肝炎基因分型及临床意义

第48卷 第5期2012年10月青岛大学医学院学报ACTA ACADEMIAE MEDICINAE QINGDAO UNIVERSITATISVol.48,No.5October 2012[收稿日期]2012-04-12; [修订日期]2012-08-09[基金项目]青岛市卫生科技发展计划资助项目(2010WSZD08)[作者简介]黄艳秋(1979-),女,硕士研究生,主治医师。

[通讯作者]史昌河(1963-),男,副主任医师,硕士生导师。

丙型病毒性肝炎基因分型及临床意义黄艳秋,史昌河(青岛大学医学院传染病学教研室,山东青岛 266071)[摘要] 丙型病毒性肝炎病原体为丙型肝炎病毒(HCV),以输血为主要传播途径。

HCV基因组为单股正链RNA病毒,有较高的复制率及变异率,在人体内呈准种分布。

目前根据Simmonds命名系统可将其分为6个基因型。

HCV基因分型在丙型病毒性肝炎的流行病学研究、病毒载量、病情转归及抗病毒治疗等方面均有重要意义。

特别在抗病毒治疗方面,HCV基因分型是制定抗病毒治疗方案,预测抗病毒疗效的重要依据。

[关键词] 肝炎,丙型;基因分型;综述[中图分类号] R512.6 [文献标志码] A [文章编号] 1672-4488(2012)05-0468-03 丙型病毒性肝炎是临床工作中较为常见的一种病毒性肝炎,病原为丙型肝炎病毒(HCV),感染后可引起肝脏急、慢性炎症,极少数发展为重症肝炎。

输血及血制品曾是丙型病毒性肝炎最重要的传播途径,但近年来,随着筛查方法的改进,此种传播方式已得到明显控制,目前注射、器官移植、血液透析、性传播及母婴传播亦较常见。

人类对HCV普遍易感,而且感染后高达80%的病人转为慢性感染,如果不进行及时和正确的抗病毒治疗,有相当比例的病人会发展为肝硬化、肝癌和肝衰竭,产生严重的临床后果。

丙型病毒性肝炎在全球感染率为3%,因此全世界约有1.7亿人曾感染过HCV[1],但各国的感染率不尽相同,我国HCV感染率约为3.2%,属于高流行区。

哈尔滨市丙肝病毒基因分型分布及临床意义

哈尔滨市丙肝病毒基因分型分布及临床意义

哈尔滨市丙肝病毒基因分型分布及临床意义摘要】:目的观察分型哈尔滨市丙型肝炎患者的丙型肝炎病毒(HCV)基因分型情况。

方法选择我院2012年9月-2017年8月收治的158例丙型肝炎患者的血清样本作为研究对象,使用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增,PCR产物纯化后进行测序分析,测序结果与参考序列共同构建系统进化树,得到病毒的基因型并进行分析。

结果本组158例丙肝患者血清标本中,成功扩增core片段139例,扩增成功率为87.97%。

在139例片段中,HCV 1a型8例,占5.76%;HCV lb型67例,占48.20%;HCV 2a型42例,占30.22%;HCV 3a型11例,占7.91%;HCV 3b型5例,占3.60%;HCV 6a型6例,占4.32%。

结论哈尔滨市HCV基因型主要以1b型为主,其次为2a型,与中国其他地区HCV基因型的分布比较一致。

【关键词】:RT-PCR;丙型肝炎病毒;测序;基因分型Distribution and Clinical Significance of Hepatitis C Virus Gene Classification in Harbin bstract: Objective To observe the genotyping of hepatitis C virus(HCV) in patients with hepatitis C in Harbin. Methods The serum samples of 158 patients with hepatitis C admitted to our hospital from September 2012 to August 2017 were selected as the subjects for study, and were amplified using the reverse-polymerase chain reaction(RT-PCR) andpurified for sequencing analysis. Sequencing results and reference sequences were used to construct the phylogenetic tree to obtain the genotype of the virus and analyze it. Results in 158 patients with hepatitis C, 139 cases of core fragment were successfully amplified, and the success rate was 87.97 %. Of the 139 cases, 8 were HCV 1A, accounting for 5.76 %; 67 cases of HCVlb type, accounting for 48.20 %; 42 cases of HCV2a, accounting for 30.22 %; 11 cases of HCV3a, accounting for 7.91 %; 5 cases of HCV3b, accounting for 3.60 %; 6 cases of HCV6a, accounting for 4.32% Conclusion The genotype of HCV in Harbin is mainly type 1B, followed by type 2A, which is consistent with the distribution of HCV genotype in other parts of China.[Keywords]: RT-PCR; Hepatitis C virus; Sequencing; Gene typing丙型肝炎是临床上常见的肝炎类型之一,丙型肝炎病毒(HCV)是导致丙型病毒性肝炎的主要病原菌。

丙型肝炎的药物治疗进展和新疗法

丙型肝炎的药物治疗进展和新疗法

丙型肝炎的药物治疗进展和新疗法丙型肝炎是一种由丙型肝炎病毒(HCV)引起的肝炎,全球范围内有数百万人感染。

长期感染丙型肝炎病毒可能导致肝硬化和肝癌等严重并发症。

幸运的是,近年来,丙型肝炎的药物治疗进展迅速,出现了一系列新的疗法,为患者提供了更多的治疗选择。

1. 直接抗病毒药物(DAAs)的出现直接抗病毒药物(DAAs)是近年来丙型肝炎治疗的重大突破。

与传统的干扰素和利巴韦林等药物相比,DAAs具有更高的治愈率和更少的副作用。

DAAs通过直接抑制病毒的复制过程,有效地抑制了病毒的增殖,从而达到治疗的效果。

2. 不同基因型的差异丙型肝炎病毒有多个基因型,不同基因型对药物的敏感性存在差异。

目前,已经有了针对不同基因型的特异性药物。

例如,对于基因型1的患者,苏巴韦和阿巴韦韦是常用的治疗药物;而对于基因型3的患者,达卡他韦和阿索帕韦是更有效的选择。

因此,在进行药物治疗前,准确确定患者的基因型是非常重要的。

3. 个体化治疗的重要性个体化治疗是指根据患者的具体情况,包括基因型、病毒载量、肝功能等因素,制定个体化的治疗方案。

随着技术的进步,个体化治疗在丙型肝炎的治疗中起到了越来越重要的作用。

通过对患者进行基因检测和相关指标的评估,可以选择最合适的药物组合和治疗方案,提高治愈率并减少不良反应。

4. 新疗法的出现除了传统的DAAs,近年来还出现了一些新的疗法。

例如,RNA干扰疗法可以通过靶向病毒基因组的RNA分子来抑制病毒的复制和感染。

此外,疫苗研发也是一个重要的方向,通过疫苗接种可以预防丙型肝炎的感染,对于高风险人群来说具有重要意义。

总之,丙型肝炎的药物治疗进展迅速,为患者提供了更多的治疗选择。

直接抗病毒药物的出现以及针对不同基因型的特异性药物的研发,使得治愈丙型肝炎的可能性大大增加。

同时,个体化治疗和新疗法的不断发展也为丙型肝炎的治疗带来了新的希望。

然而,我们仍需持续努力,加强研究和临床实践,为患者提供更安全、有效的治疗方案。

系统进化树分析慢性丙型肝炎患者HCV基因分型

系统进化树分析慢性丙型肝炎患者HCV基因分型


善 ・
J eR , r0 , 11 o d eA 1V . . 性 丙 型 肝 炎 患 者 HC 基 因分 型 V
王 美霞 徐 斌 段 瑾 金 铭

要 目的 了解 浙 江 省慢 性丙 型 肝 炎 患 者 HC V基 因 型 分 布 情 况 。方 法 参 考 O n h o的 分 型 方 法 , 用 巢 式 R 采 T—P R C
2a g n t pe e o y s— ba e s d, mu tp e g o y e O— e s i ha a t rs i li l en t p s C xitng c r c e itc. Ke y wor He tts v r s; y ds pa ii iu C t pe; n t pe; l g ne i r e Ge o y Po y e tc t e
Re ut HCV RN p st ert s5 % ( 3c ss n6 eu .Ge oy e1 2 3 , ba d6 xse nte3 eu a ls a sl s A oiv aewa 5 i 3 ae )i 0 srms n tp b,a,a 3 n aeitdi h 3s rm smpe , —
q n e e er d t ue c d r f r e o Ohn t d The c o d s qu n e r h n b a t d a d g n t p d by u i g Cl s a w a e n po y e e i r e. o S me ho . l ne e e c s we e t e l s e n e o y c s n u t l b s d o l g n tc te
P lg nt e ayi o V Geoy ei hj n rvn e Wa g Mexa, n, a n,i ig Be ig Y u nHoptl oye ei TreAn ls f c s HC n tp nZ ei gP o ic. a n ii XuBi Du n f JnM n . in o a si , i j a

丙肝病毒的基因分型研究

丙肝病毒的基因分型研究

丙肝病毒的基因分型研究丙肝病毒(HCV)是一种由丙型肝炎病毒引起的肝炎。

HCV目前已知有7种基因型和数百个亚型,这些基因型和亚型的分布在世界各地不均。

在病毒的基因分型研究中,HCV的分型是很重要的一部分。

本文将介绍丙肝病毒的基因分型研究。

一、HCV基因分型的意义HCV感染与肝硬化、肝癌等肝脏疾病密切相关。

由于HCV的基因型和亚型分布不均,不同的基因型和亚型对治疗的反应和预后有所不同。

因此,HCV的基因分型对于合理治疗和预后的判断非常重要。

此外,基因分型也对疫苗的研发和应用有着重要的意义。

二、HCV基因分型研究方法1、序列比对法序列比对法是基于先前已知HCV序列,通过测序分析新的HCV标本,比对其序列的方法。

将新序列与已知序列比对后,可以判断其基因型和亚型。

2、基于引物的多重PCR法PCR技术能够扩增HCV基因组,通过设计一系列引物扩增不同区域的基因序列,从而得到标本中的基因组序列。

此方法准确性高,操作简便,是目前最为常用的分型方法之一。

3、序列共有分析法序列共有分析法是一种基于HCV基因组序列共有区域的分型方法,可以将不同基因型和亚型的序列分别分到足够的统计学群体中,判断其分类归属。

三、HCV基因型分布情况各地区的HCV基因分型和亚型分布存在差异,统计数据显示,目前已知的HCV基因型有1-7型,其中以1、2、3型最为常见。

众所周知,1b型与肝癌的关联度最高,且对标准干扰素基础治疗的反应最不理想。

然而,亚型的分布更加细致,目前已知的HCV亚型达数百种之多。

四、HCV基因分型对治疗的影响HCV感染后的治疗方法主要为干扰素联合利巴韦林等药物的抗病毒治疗。

不同基因型对于治疗的反应和预后有所不同。

研究表明,1型HCV治疗的成功率相对较低,而2、3型HCV的治疗响应相对较高。

此外,HCV基因型的分型也与治疗过程中出现的副作用有关。

总之,丙肝病毒的基因分型是进行丙肝治疗和疫苗研发的前提,对研究HCV感染的流行病学学和预后有着重要的意义。

丙型肝炎病毒基因分型与治疗效果关系的研究

丙型肝炎病毒基因分型与治疗效果关系的研究

c h r o n i c h e p a t i t i s C we r e e n r o l l e d a n d s u b j e c t e d t o s t a n d a r d r e g i me n o f r i b a v i r i n c o mb i n e d wi t h p e g y l a t e d i n t e r f e r o n d 一 2 a . Re a l — t i me
q u a n t i t a t i v e p o l y me r a s e c h a i n r e a c t i o n ( P CR) wa s p e r f o r me d t o c o n d u c t HCV- RNA q u a n t i t a t i v e d e t e c t i o n a n d t h e g e n e s e q u e n c i n g
关键词 : 肝 炎病 毒 , 丙型 ; 基 因型; 利 巴 韦林 ; 干扰 素 ; 治 疗 结 果
D O I : 1 0 . 3 9 6 9 / j . i s s n . 1 6 7 3 — 4 1 3 0 . 2 0 1 3 . 2 1 . 0 l 5 文献标识码 : A 文章 编 号 : 1 6 7 3 — 4 1 3 0 ( 2 0 1 3 ) 2 1 - 2 8 2 3 — 0 2
( S V R) 。结 果 1 7 9例 丙 型 肝 炎 患 者 中 , HC V 1 b型 占 7 9 . 3 , HC V 2 a型 占 8 . 4 , HC V 3 b型 占 5 . 0 , HC V 6 a型 占 2 . 2 ,
HC V I b 、 2 a混 合 型 占 1 . 1 , 其他 型 占 4 . 0 。 HC V 2 a型 患 者 获 得 S VR 率 明 显 高 于 HC V l b型, 差异 有统 计 学 意 义( ) . f 一 4 . 9 5 6 , P一0 . 0 2 6 ) 。结 论 该 院 HC V 基 因型 主 要 为 HC V 1 b和 Hc V 2 a型 , Hc V 1 b型 患者 对 标 准 治疗 方 案 的疗 效 较 2 a型 差 。

丙型肝炎病毒基因分型的研究进展

丙型肝炎病毒基因分型的研究进展

丙型肝炎病毒基因分型的研究进展解莹;谢晨【摘要】丙型肝炎病毒是一个高度异质性的RNA病毒,目前可分为6个基因型与不同的亚型.本文就 HCV基因型构成、HCV基因分型的检测方法与命名、HCV基因型的流行病学的意义、HCV基因型与疾病严重性、急性HCV感染的转归、IFN-α疗效、HCV基因分型与疫苗的研制等有关的研究作一综述.【期刊名称】《大连医科大学学报》【年(卷),期】2010(032)004【总页数】5页(P470-474)【关键词】丙型肝炎病毒;基因分型;研究进展【作者】解莹;谢晨【作者单位】大连医科大学附属第二医院,传染科,辽宁,大连,116023;大连医科大学附属第二医院,传染科,辽宁,大连,116023【正文语种】中文【中图分类】R512.6+3丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)感染呈全球分布,全世界人群HCV感染率为3.0 %(0.1%~10%)。

在中国HCV的感染率为3.2%,约3800万。

近年来,中国丙型肝炎的诊断率在不断的提高,丙型肝炎新报告病例也不断增加[1]。

HCV 感染后病情隐匿,50%~80%会转变成慢性肝炎,如未经合理治疗,其中10%~30%经10~20年后会发展成肝硬化,1%~3%会发展成原发性肝癌[2,3],严重危害患者的健康和生命。

HCV具有高度异质性,不同地区、不同患者,甚至同一患者在不同病程中HCV分离株,无论是核苷酸序列,还是氨基酸序列均有显著差异[4-6]。

本文就丙型肝炎病毒基因分型及其临床意义作一综述。

1 HCV基因型1.1 HCV基因型构成20世纪70年代初就提出了非甲非乙型肝炎(NANB肝炎)的概念,1975年,英国Lancet杂志首次使用这个名词。

1989年,美国Chiron公司Choo[7]等先采用分子生物学技术成功地将HCV cDNA克隆成功,并在日本东京召开的“国际非甲非乙型肝炎和经血传播的传染病学术会议”上正式命名HCV。

丙肝按基因分型治疗方案

丙肝按基因分型治疗方案

一、丙型肝炎基因型概述丙型肝炎病毒基因型主要分为6型,分别为1型、2型、3型、4型、5型和6型。

其中,1型、2型、3型较为常见,4型、5型和6型较少见。

不同基因型的丙型肝炎病毒在地理分布、病毒复制能力、耐药性等方面存在差异。

1. 1型:广泛分布于全球,是丙型肝炎的主要基因型。

1型病毒复制能力强,易产生耐药性,治疗难度较大。

2. 2型:主要分布在中东和北非地区,在我国较少见。

2型病毒复制能力较弱,治疗难度相对较低。

3. 3型:广泛分布于全球,在我国较为常见。

3型病毒复制能力中等,治疗难度适中。

4. 4型、5型和6型:分布范围较小,在我国较少见。

这三种基因型的病毒复制能力较弱,治疗难度相对较低。

二、丙型肝炎按基因分型治疗方案1. 1型丙型肝炎治疗方案(1)直接抗病毒药物(DAA)联合治疗方案:对于1型丙型肝炎患者,DAA联合治疗方案是目前主流的治疗方法。

常用的DAA药物有索非布韦、达拉他韦、奥比胆、索磷布韦等。

根据患者的具体情况,可选用以下方案:- 索非布韦+达拉他韦:适用于大多数1型丙型肝炎患者,疗程为12周。

- 索非布韦+奥比胆:适用于部分1型丙型肝炎患者,疗程为12周。

- 索非布韦+索磷布韦:适用于部分1型丙型肝炎患者,疗程为12周。

(2)干扰素联合DAA治疗方案:对于部分1型丙型肝炎患者,可采用干扰素联合DAA治疗方案。

干扰素可提高病毒清除率,降低复发风险。

常用方案为干扰素+索非布韦,疗程为12周。

2. 2型丙型肝炎治疗方案(1)DAA联合治疗方案:对于2型丙型肝炎患者,DAA联合治疗方案是首选。

常用方案为索非布韦+奥比胆,疗程为12周。

3. 3型丙型肝炎治疗方案(1)DAA联合治疗方案:对于3型丙型肝炎患者,DAA联合治疗方案是首选。

常用方案为索非布韦+达拉他韦,疗程为12周。

4. 4型、5型和6型丙型肝炎治疗方案(1)DAA联合治疗方案:对于4型、5型和6型丙型肝炎患者,DAA联合治疗方案是首选。

某地区丙型病毒性肝炎患者HCV基因分型研究

某地区丙型病毒性肝炎患者HCV基因分型研究

tc o ae fHC e o y e1 ,a 3 , Ca d 2 r 8 4 , 1 6 , . % , . a d 8 0 C n l i Th s c mm n e t n rtso V g n tp b 2 , a l n cwee5 . 2 . 3 2 4 0 i n . H. o c s n uo emo t o o
( 肃省 临床 检验 中心 , 肃 兰州 7 0 0 ) 甘 甘 3 0 0
摘 要 : 的 了解 该 地 区 丙型 病 毒 性 肝 炎 ( 目 以下 简称 丙型 肝 炎 ) 者 丙 型 肝 炎病 毒 ( V) 因 分 型 情 况 。 方 法 分 别 以 患 HC 基
E IA 和 重组 免 疫 印迹 试 进 行 血 清 标 本 抗 HC 抗 体 筛 查和 确认 , 抗 HC 抗 体 阳性 标 本 用 实 时 荧 光 定 量 P R 进 行 病 毒 载 量 LS V 对 V C 检 测 。对 病 毒 载 量 大 于 1 3cp / 0 o y mL的 标 本 用 多 重 P R进 行 Hc 基 因分 型 。结 果 1 5例 抗 Hc 抗 体 阳性 标 本 中 , V 基 C V 2 V HC
因型 主 要 为 1 、 a 3 、 c 2 b 2 、a 1 、 c的检 出率 分 别 为 5 . 、 1 6 、 . 、 . 和 8 0 。结 论 该 地 区 HC 感 染主 要 以 1 8 4 2 . 3 2 4 0 . V b型 为主 , 其次是 2 a和 3 a型 , 出其 他 地 区 少见 的 1 检 C和 2 型 , 明 该地 区 丙 型肝 炎流 行 的基 因型 呈 多样 性 。 c 说
H CV e t pei te s wih H CV n e ton w a b,o l w e a a g no y n pa int t if c i s l f lo d by 2 nd 3a, nd ge ot pe l n c, a e y d t c e n o he s a n y c a d 2 r r l e e t d i t rdi— tit we e a s o d b t ce i c tng t tt e yp s o pa ii i hi r a m i t b i e s . rc s, r l o c ul e de e t d,ndia i ha he g no t e fhe tts C n t s a e gh e d v r e Ke r s h pa ii a iodis; p y e a e c a n r a ton; ge y n y wo d : e ttsC ntb e ol m r s h i e c i no t pig

PCR-RDB 技术在 HCV 基因分型中的应用研究

PCR-RDB 技术在 HCV 基因分型中的应用研究

PCR-RDB 技术在 HCV 基因分型中的应用研究李步荣;张彤;李丽华;高宁;张毅【摘要】目的:评价 PCR-RDB 技术在丙型肝炎病毒(HCV)基因型检测中的临床实际应用价值。

方法:随机收集经实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)检测 HCV RNA 含量大于1×103 IU/ml 血清样本总计158份,其中无临床症状丙型肝炎病毒携带者90例,慢性丙型肝炎(CHC)患者48例,肝硬化(HS)患者16例,肝癌(LC)患者4例。

全部血清样本应用 PCR 和反向斑点杂交技术(RDB)进行 HCV 基因分型检测,并对检测结果进行统计学分析。

结果:所有标本 HCV 基因分型成功,其中1b 型78例,2a 型65份,3a 型3例,3b 型2例,6a 型2例,1b 和2a 混合感染型8例。

不同疾病组 HCV 不同基因型分布差异无统计学意义。

结论:HCV 基因型与疾病类型无相关性;PCR-RDB 杂交技术适用于临床实验室开展 HCV 基因型检测。

%Objective:To evaluate the clinical practical application value of polymerase chain reaction and reverse dot blot(PCR-RDB)method on genotyping HCV in different disease groups.Methods:We conducted a co-hort study with 1 58 participants including 90 HCV carriers without clinical symptom,48 patients with chronic hepa-titis C,1 6 patients with hepatic sclerosis and 5 patients with liver cancer.The HCV RNA levels of all sera samples were confirmed higher than 1 × 10 3 IU/ml by real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction(PCR). HCV genotyping was carried out using type-specific primers by means of polymerase chain reaction and reverse dot blot(RDB).And the results were statistically analyzed with GraphPad Prism 5.0 software.Results:All 1 58 speci-mens were genotyped successfully.Among them,78 cases were genotype 1b,65cases were genotype 2a,3 cases were genotype 3a,2 cases were genotype 3b,2 cases were genotype 6a,8 cases were mixed genotypes 1b and 2a. There was no significant difference among the different disease groups about the distribution of HCV genotypes. Conclusion:There is no relationship between the HCV genotypes and disease types.PCR-RDB was a suitable meth-od for the HCV genotyping in clinical laboratories.【期刊名称】《陕西医学杂志》【年(卷),期】2015(000)011【总页数】3页(P1551-1553)【关键词】丙型肝炎病毒;基因分型技术;聚合酶链式反应;荧光免疫测定【作者】李步荣;张彤;李丽华;高宁;张毅【作者单位】西安交通大学第二附属医院检验科西安 710004;西安交通大学第二附属医院检验科西安 710004;西安交通大学第二附属医院检验科西安 710004;西安交通大学第二附属医院检验科西安 710004;西安交通大学第二附属医院检验科西安 710004【正文语种】中文【中图分类】R446.6丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)感染后只有少数感染者可以凭借自身免疫系统清除体内病毒,大部分感染者表现为持续感染,持续感染常导致慢性肝炎、肝硬化、肝癌甚至死亡。

北京地区慢性丙型肝炎患者血清HCV-RNA定量检测与基因分型的研究

北京地区慢性丙型肝炎患者血清HCV-RNA定量检测与基因分型的研究

Y N Ya 。 I h o GU in h a ea.Heai s eerhI s tt e igY u nHop tl C ptl d cl A n L Z u , OX ag m ; t 1 p t iR s c nt ue fB i n o ' s i , a i Me i t a i o j a a a a
M eh d :TheH C RNA u tt t ed t c in wa d y u eo u r s e tq a tt t eP tos V- q a ia i e e t sma e b s f f o e c n u i i CR e h d ,a d g n — n v o l n a v m to s n e o t p sd t r n d wi e e s r ns rp a eP y e wa e e mi e t r v r e t a c i t s CR n e u n e s e ii p i rPCR n l ss Re u t :twa e n h a d s q e c p cf rme c a a y i. s l I sd mo — s
没有差异 。治疗前 HC V基因型与体 内病毒 的含量 密切相关。
关键词 丙型肝炎病毒 HC - NA定量检测 VR 基 因分 型 中图分类 号: 5 2 6 R 1. 3 文献标识 码 : 文章编号 :0 178 (O 7 O —760 A 10 —5 5 2 O ) 70 5—2
A Su y o V R a t a i eet n a dG n tp e i td nHC - NA Qu n i t e t i n e oy ei P kn t vD co n g
析, 结果显示没有 统计 学差 异( z .2 , <0 9 8 。2 9例 患者 的首 次血清病 毒 R Y :O 0 8 P . 7 ) 9 NA定量 测定 与基 因型之间有

丙型肝炎病毒逆向点杂交基因分型方法的建立及初步应用

丙型肝炎病毒逆向点杂交基因分型方法的建立及初步应用

实验研究丙型肝炎病毒逆向点杂交基因分型方法的建立及初步应用杨光 陈姝 崔金环 司建华 谭家驹摘要 目的 利用逆向点杂交技术建立丙型肝炎病毒(HCV)基因分型新方法。

方法 在HCV5 端非编码区(5 U T R)设计引物与分型探针,将活性氨基标记的分型探针依次固定在尼龙膜上,制成HCV基因分型逆向点杂交检测膜条。

分离纯化血清中的HCV R NA,经逆转录反应和生物素标记引物聚合酶链反应(PCR)巢式扩增后,将扩增产物与检测膜条杂交,过氧化物酶和四甲基联苯胺显色,判断基因分型结果。

最后,通过与基因测序结果比较确定新方法的有效性。

从佛山地区丙型肝炎患者中随机抽取60份经荧光定量PCR方法对HCV RN A进行过定量分析的血清,用新建方法进行HCV基因分型检测。

结果 新建HCV逆向点杂交基因分型方法可对所有60份HCV RN A拷贝数在102~106/ml之间的抽检血清进行基因分型,发现1b型50例,占83.3%;1a型2例,占3.3%;2a型2例,占3.3%;1a、1b混合型5例,占8.0%;1b、2a混合型1例,占1.7%;未发现2b、3a和3b型。

新方法基因分型结果与测序分型结果一致。

结论 P CR 逆向点杂交技术可以准确有效和简便经济地进行HCV基因分型,适用于临床检测与流行病学研究。

在佛山地区人群中感染的HCV以1b型为主。

关键词 丙型肝炎病毒;基因分型Development and application of a new hepatitis C virus genotyping method with polymerase chainreaction reverse blot dot technique YA N G Guang,CH EN Shu,CUI Jin huan,SI Jian hua,T A NJia j u.I nstitute of Medical Researches,the Firs t Peop le s H ospital of Foshan,Foshan528000,China Abstract Objective U sing polymerase chain reaction reverse blot dot(PCR R DB)technique toestablish a new method for hepatitis C v irus(HCV)genot yping and to study the distribution of HCVg enotypes in Foshan area.Methods HCV primers and pr obes were designed in5 untranslated reg ion(nt 1 nt 299)of HCV.HCV RN A in ser um was isolated and purified,and its cDNA was obtained byr ev ersed transcription.N ested PCR using biotin labelled primers,was done.PCR products were hybridizedw ith immobilized specific probes(genotype1a to3b)on Biodyne C membrane to genoty pe HCV by colordevelopment w hile adding POD and T M B.A certain judgment could be made according to the position ofcolor r eaction.T he r eliability of this new method was v er ified by sequencing.HCV RNA levels in serumw ere determined by r eal time fluor escent quantitativ e(F Q) PCR.60F Q P CR positive HCV sera fr omF oshan area w ere genotyped using this assay.Results All60sera could be successfully genotyped by PCRR BD.50(83.3%)cases w er e found to be g enotype1b,2(3.3%)as g enotype1a and2(3.3%)asg enotype2a while5(8.0%)to be mix ture of genoty pe1a and1b,and1(1.7%)to be mix ture ofg enotypes1b and2a.N o genotypes2b,3a and3b w ere found.T he results of PCR RDB g enotypingmethods coincided with sequence analysis.C onclusion N ew ly established HCV genotyping system w asproved to be sensitive,specific,pr ecise and economic,thus suitable for clinical and epidemiolo gic studies.T he results of HCV g enotyping show ed that g enotype1b was t he predominant g enotype in Foshan ar ea.Key words Hepatitis C virus;Genotyping丙型肝炎(丙肝)病毒(H CV)感染的慢性化率与肝癌诱变率均高于其他各型肝炎病毒。

辽宁地区丙型肝炎病毒基因分型特点及其临床意义

辽宁地区丙型肝炎病毒基因分型特点及其临床意义

辽宁地区丙型肝炎病毒基因分型特点及其临床意义【摘要】丙型肝炎病毒是一种常见的肝炎病原体,其基因分型对病毒变异和临床表现具有重要影响。

本文通过对辽宁地区丙型肝炎病毒基因分型特点及其临床意义的研究,总结了该地区基因分型的特征和临床表现,探讨了不同基因分型在病毒感染及治疗过程中的影响。

通过研究方法和结果的分析,揭示了丙型肝炎病毒基因分型在临床实践中的应用前景及挑战。

本文强调了辽宁地区丙型肝炎病毒基因分型的重要性,并提出了未来研究的方向。

这些结果对于丙型肝炎病毒的防控及治疗具有重要的指导意义,为临床实践提供了新的思路和策略。

【关键词】关键词:辽宁地区、丙型肝炎病毒、基因分型、特点、临床意义、研究方法、结果、临床应用、重要性、未来研究、结论总结1. 引言1.1 辽宁地区丙型肝炎病毒基因分型特点及其临床意义丙型肝炎病毒(HCV)是一种通过血液传播的病毒,全球范围内广泛感染,成为世界卫生组织认定的全球性公共卫生问题。

HCV的基因分型多样,目前已知有7种不同的主要基因型(Genotype 1-7),每种基因型又可细分为若干亚型。

这种基因的多样性不仅影响了患者的临床表现和疗效,还对临床医生的治疗策略提出了挑战。

辽宁地区作为中国东北地区的一个重要省份,丙型肝炎病毒感染的情况较为严重。

辽宁地区的HCV基因型分布具有一定的特点,其中以Genotype 1b和Genotype 2a为主要类型,占据了绝大多数的感染病例。

辽宁地区的HCV基因型亚型也呈现出一定的地域特异性,不同亚型的临床表现和传播途径也存在一定的差异。

对于丙型肝炎病毒基因分型的研究不仅可以帮助医生更好地了解病毒的传播规律和演变趋势,还可以为临床诊断提供更为准确的依据。

通过对病毒基因型的分析,可以指导临床医生选择更合适的治疗方案,提高治疗效果和预后情况。

对辽宁地区丙型肝炎病毒基因分型特点及其临床意义的研究具有重要的意义。

2. 正文2.1 丙型肝炎病毒基因分型概述丙型肝炎病毒(HCV)是一种导致慢性肝炎、肝硬化和肝细胞癌的RNA病毒。

丙型肝炎的全基因组测序与分型鉴定

丙型肝炎的全基因组测序与分型鉴定

丙型肝炎的全基因组测序与分型鉴定丙型肝炎是一种由丙型肝炎病毒(HCV)引起的肝炎,全球范围内广泛存在。

丙型肝炎的全基因组测序与分型鉴定是研究该病毒的重要手段,对于疾病的诊断、预防和治疗具有重要意义。

一、丙型肝炎病毒的全基因组测序丙型肝炎病毒的全基因组测序是通过对病毒基因组的高通量测序技术进行全面扫描,获取病毒基因组的完整序列信息。

这项技术的出现为研究丙型肝炎提供了重要的工具,可以深入了解病毒的遗传变异、流行病学特征以及与宿主之间的相互作用。

全基因组测序技术的发展使得研究者能够获得丙型肝炎病毒的完整基因组序列,包括核心区、非结构区以及外膜蛋白等。

这些序列信息对于深入了解病毒的生物学特性、传播途径以及抗病毒治疗的研究具有重要意义。

二、丙型肝炎病毒的分型鉴定丙型肝炎病毒的分型鉴定是通过对其基因组序列进行比对和分析,将其分为不同的亚型和基因型。

目前已经发现了丙型肝炎病毒的7个主要基因型(1-7型)和多个亚型。

不同的基因型和亚型在地理分布、传播途径以及病毒特性等方面存在差异。

分型鉴定对于丙型肝炎的流行病学研究和疫苗研发具有重要意义。

不同基因型和亚型的病毒在不同地区的流行程度存在差异,了解这些差异可以帮助制定针对性的预防和控制策略。

此外,分型鉴定还可以为疫苗的研发提供重要依据,因为不同基因型和亚型的病毒可能对疫苗的有效性产生影响。

三、全基因组测序与分型鉴定在丙型肝炎研究中的应用全基因组测序和分型鉴定在丙型肝炎的研究中发挥着重要作用。

通过全基因组测序,研究者可以获取大量的病毒序列信息,进而分析病毒的遗传变异和演化规律。

这有助于研究病毒的传播途径、感染机制以及抗病毒药物的研发。

同时,通过分型鉴定可以了解不同地区、不同人群中丙型肝炎病毒的基因型和亚型分布情况,为疫苗的研发和流行病学研究提供重要依据。

此外,全基因组测序和分型鉴定还可以帮助临床医生制定个体化的治疗方案,根据病毒的基因型选择最合适的抗病毒药物。

总结:丙型肝炎的全基因组测序与分型鉴定是研究该病毒的重要手段,可以深入了解病毒的遗传变异和流行病学特征。

丙型病毒性肝炎及其检测研究进展

丙型病毒性肝炎及其检测研究进展
丙 型肝 炎} 3 1 。
后, 根据颜色的变化进行结果判定。
丙 型 肝炎 病 毒抗 一 C 的检 测 目前 中 国多采 用 HV 第 三代 抗 一 C LS 试 剂 , 包 被抗 原 为 HC H V E IA 其 V抗 原 、 S、 S 和 N 原 , N N S抗 特异 性超 过 9 %, 出率 在 9 检
发现丙肝患者 , 特别是避免丙肝的输血传播 。 外周血 中检 出 H V N C R A表 明 HC V复制 活跃 , 在感染 丙 肝
病 毒 l2周 内血 清 中可 检测 到 HC N 在 丙肝 自 ~ V R A, 然 恢 复 前 血 清 中 HC N 将 达 到 一 个 高 峰 , VR A 但
和恢 复期 血清 中找 到了丙型肝 炎病毒特 异性 的抗原 和
抗体 ;随后不少学者利用放射免疫 ( I )和酶疫 RA (LS )等方法也曾找到丙型肝炎病毒抗原和抗体 ; EI A 18 年 C o 等用分子克隆技术获得 H V的基因克 98 ho C 隆:99 18 年建立了特异性抗- C H V血清学的检测方法。 丙 型肝 炎 病 毒抗 一 C H V的 检测 , 常用 的抗 一 C HV
分型和血清 中 H V核心抗原检测。 C 17 年 ,用双向免疫扩散法在输 血后肝炎 急性期 98
维普资讯
口岸 卫 生控 制
第 l 2卷 第 2期
其 检测 应 用 的局 限性 主要 是 有一 定 的 假 阴性 或假 阳 性 , 要较 高 的设 备条 件 和技 术力 量 , 宜 在基 层 医 需 不
பைடு நூலகம்
丙型 肝炎 属 黄病 毒科 丙 型肝 炎病 毒 属 f其 基 本 】 J , 结 构 与人 类 黄病 毒如 黄热 病 病毒 、登革 热病 毒 和 乙 型脑炎 病毒 相似 , 由结 构 蛋 白和非 结构 蛋 白组成 。丙 型 肝 炎 病 毒 的基 因分 为 6个 型 和 10多 个 亚 型 , 0 基 因 1型 呈 全 球 分 布 , 占 7 %;b占 中 国 感 染 率 的 0 l 8%。不 同基 因型对 治疗 的反应性 不 同 , 染 1 和 0 感 型 4型 H V患者对 干扰 素 的反应 性较 低 f C 2 J 。

天津地区丙型肝炎病毒基因分型的研究

天津地区丙型肝炎病毒基因分型的研究

天津地区丙型肝炎病毒基因分型的研究武玉晶;练明建;刘爽;范志娟;刘树业【期刊名称】《中国实验诊断学》【年(卷),期】2016(020)010【摘要】目的:研究天津地区丙型肝炎病毒(HCV)基因型的分布。

方法收集HCV 感染者的 HCV 基因分型、性别、年龄、临床诊断等临床资料,分析 HCV 基因型在人群中的分布,以及与临床资料的相关性。

结果天津地区最常见的 HCV 基因型是1b 型,占人群比例77.88%;其次是2a 型,占人群比例20.07%。

在肝炎患者,不同基因型感染者的平均年龄之间存在差异。

在肝硬化患者,不同性别的 HCV 基因型分布存在差异。

结论天津地区 HCV 基因型以1b 型最为常见。

【总页数】3页(P1696-1698)【作者】武玉晶;练明建;刘爽;范志娟;刘树业【作者单位】天津医科大学三中心临床学院,天津 300170;天津医科大学三中心临床学院,天津 300170;天津医科大学三中心临床学院,天津 300170;天津市第三中心医院检验科,天津 300170;天津市第三中心医院检验科,天津 300170【正文语种】中文【中图分类】R512.6+3【相关文献】1.新疆地区丙型肝炎病毒基因分型及临床意义的研究 [J], 石绣江;范晓棠;梁晓萍;阿丽亚·热哈提;何方平2.黑龙江地区丙型肝炎病毒基因分型研究 [J], 张怡;陈思3.浙江地区丙型肝炎患者的丙型肝炎病毒基因分型研究 [J], 陈奕磊;孙翠莲;王淑一4.福建地区慢性丙型肝炎患者丙型肝炎病毒基因分型研究 [J], 张宇;柳丽娟;张启云5.太原地区188例丙型肝炎患者丙型肝炎病毒基因分型研究 [J], 李卓奇;赵晓青;张玲荣因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

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丙型肝炎病毒基因分型的研究进展
丙型肝炎病毒是输血后感染肝炎常见的一种病毒,目前其分为6型,其亚型已经超过100个,由于其复制依赖的酶缺乏校对功能,所以易发生突变,这也是丙型肝炎病毒基因组分型的基础。

其分型的命名因为采取的标准及使用的分析方法不一样也有不同的命名系统。

丙型肝炎病毒基因的检测方法很多,但是不简便经济,而且其与丙型肝炎有很大的关系。

标签:丙型肝炎病毒;基因分型;进展研究在如今生活中,除了乙肝是常见肝病外,丙肝患者的比例越来愈高,究其原因主要是人们对于丙肝的感染途径不了解,未对丙肝给予足够的重视。

其传播途径主要有:①输血及血制品,尤其是反复输血及使用血制品者,据统计,输血后肝炎70%以上是丙型肝炎。

②不正规注射。

③伤口未护理。

④性接触。

⑤母婴传播。

在这几种传播途径中,①④⑤最易感染丙肝。

在日常生活中,人们需要采取相关防范措施,以免感染丙肝。

1 HCV的结构
HCV的RNA大约有9500-10000bp组成,其5′非编码区有319-341bp,3′非编码区有27- 55bp。

在5′非编码区下有一开放阅读框(ORF),其基因排列顺序为5’C-E1-E2-p7-NS2-NS3-NS4-NS5-3,能编码多聚蛋白前体(一长3014个的氨基酸)。

经宿主细胞及自身蛋白酶作用可裂解成三种结构蛋白,其分别为核心蛋白、糖蛋白、非结构蛋白三种。

HCV基因标记有很多种,如GP72,其基因标记为E2/NS1。

其糖蛋白能产生抗HCV的中和作用。

还有NS2、NS3、NS4等基因标记。

NS2和NS4的功能可能与细胞膜紧密结合在一起。

NS3参与解旋HCV-RNA 分子,具有螺旋酶活性,以辅助RNA复制,NS5参与HCV基因组复制,依赖于RNA的聚合酶活性。

2 HCV的分型及地理差异
目前HCV分型尚无统一的定论,这是因为在研究的过程中采取的技术及研究的位置不一致,因而出现了很多基因分型,这些基因分型没有同一的标准。

综合各个国家的研究结果,大致上可分为6型,其亚型很多。

而且HCV感染有很大的地域差异。

比如欧洲国家主要是HCV-Ⅰ型感染,亚洲国家主要感染Ⅱ型。

在我国,很多患者为Ⅱ型感染,其次为Ⅲ型感染,但是有些地区Ⅲ型感染率超过Ⅱ型感染率,从这里来看,丙肝感染并不是一成不变的,还跟地区有很大的关系。

3 HCV基因检测方法
关于HCV的检测方法有很多,主要有分子学方法和血清学方法两种,其中分子学方法占主要方面,其有:①直接测序法;②限制性片段长度多态性分析法;
③特异性探针杂交法;④基因芯片;⑤遗传系统进化树分析方法;⑥型特异性引
物PCR法;⑦荧光共振能量转移探针的解离曲线分析法;⑧引物特异的延伸分析法;⑨异源分子迁移率分析(HMA)法。

而血清学方法有:①重组免疫印迹试验(RIBA)②酶免疫试验(EIA)。

其中第②种已经被第一种取代。

4 HCV基因与疾病的关系
HCV基因与疾病的关系没有直接及明确的证据,但是目前普遍认为HCV与重型肝炎有关,与肝硬化、肝癌也有一定的关系,肝移植术后易复发的患者HCV 感染率也很高。

在这一层次上来讲,HCV基因可能在一定程度上促进了这些疾病的进展,可能在肝病的患者损伤肝细胞,从而导致患者肝功能持续下降,产生严重的后果。

5抗HCV药物及疫苗制备
5.1抗HCV药物标准治疗方案是聚乙二醇干扰素联合利巴韦林,聚乙二醇干扰素又称为长效干扰素。

临床用药试验研究表明,使用长效干扰素对丙型肝炎患者的疗效明显比普通A-干扰素明显。

在临床上,对于丙肝患者首选聚乙二醇干扰素。

5.2疫苗制备像很多疾病一样,丙肝的疫苗不容易研制[1~5]。

这与HCV基因的高度变异性有关,HCV基因其复制依赖的酶缺乏校对功能,这样很容易产生免疫逃逸,而且其基因具有高度异源性,这为疫苗的研制带来了很大的困难。

在世界上很多国家都在尝试使用一种新的方法来研制疫苗,可是结果并不理想,当一种疫苗研制出来后HCV基因已经产生变异,这种疫苗就失去了其临床价值,这样不仅花费了财力,还消耗了研究人员很多精力,结果并不理想。

所以,如果相关部门不投入大量的财力是无法继续研究疫苗这项事业的。

6结论
对于丙型肝炎病毒基因分型的研究远远还没有结束[6~10],虽然其基因具有显著异源性和高度变异性,其检测方式既不简便也不经济,需要投入大量的人力物力财力对其分型有进一步的突破性研究,但是对丙型肝炎病毒基因分型的研究不能止步,對其疫苗的制备不能停止,因为研究HCV基因不仅有助于人们对丙型肝炎有更深入的认识,而且可以为丙型肝炎病毒基因有关的丙肝疾病疫苗的制备提供依据,本着对人类健康负责的态度,预防丙肝的爆发流行,我们要继续为丙肝基因的研究付出努力,为人类战胜丙肝迈出更重要的一步。

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