丙型肝炎病毒基因分型的研究进展
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丙型肝炎病毒基因分型的研究进展
丙型肝炎病毒是输血后感染肝炎常见的一种病毒,目前其分为6型,其亚型已经超过100个,由于其复制依赖的酶缺乏校对功能,所以易发生突变,这也是丙型肝炎病毒基因组分型的基础。其分型的命名因为采取的标准及使用的分析方法不一样也有不同的命名系统。丙型肝炎病毒基因的检测方法很多,但是不简便经济,而且其与丙型肝炎有很大的关系。
标签:丙型肝炎病毒;基因分型;进展研究在如今生活中,除了乙肝是常见肝病外,丙肝患者的比例越来愈高,究其原因主要是人们对于丙肝的感染途径不了解,未对丙肝给予足够的重视。其传播途径主要有:①输血及血制品,尤其是反复输血及使用血制品者,据统计,输血后肝炎70%以上是丙型肝炎。②不正规注射。③伤口未护理。④性接触。⑤母婴传播。在这几种传播途径中,①④⑤最易感染丙肝。在日常生活中,人们需要采取相关防范措施,以免感染丙肝。
1 HCV的结构
HCV的RNA大约有9500-10000bp组成,其5′非编码区有319-341bp,3′非编码区有27- 55bp。在5′非编码区下有一开放阅读框(ORF),其基因排列顺序为5’C-E1-E2-p7-NS2-NS3-NS4-NS5-3,能编码多聚蛋白前体(一长3014个的氨基酸)。经宿主细胞及自身蛋白酶作用可裂解成三种结构蛋白,其分别为核心蛋白、糖蛋白、非结构蛋白三种。HCV基因标记有很多种,如GP72,其基因标记为E2/NS1。其糖蛋白能产生抗HCV的中和作用。还有NS2、NS3、NS4等基因标记。
NS2和NS4的功能可能与细胞膜紧密结合在一起。NS3参与解旋HCV-RNA 分子,具有螺旋酶活性,以辅助RNA复制,NS5参与HCV基因组复制,依赖于RNA的聚合酶活性。
2 HCV的分型及地理差异
目前HCV分型尚无统一的定论,这是因为在研究的过程中采取的技术及研究的位置不一致,因而出现了很多基因分型,这些基因分型没有同一的标准。综合各个国家的研究结果,大致上可分为6型,其亚型很多。而且HCV感染有很大的地域差异。比如欧洲国家主要是HCV-Ⅰ型感染,亚洲国家主要感染Ⅱ型。在我国,很多患者为Ⅱ型感染,其次为Ⅲ型感染,但是有些地区Ⅲ型感染率超过Ⅱ型感染率,从这里来看,丙肝感染并不是一成不变的,还跟地区有很大的关系。
3 HCV基因检测方法
关于HCV的检测方法有很多,主要有分子学方法和血清学方法两种,其中分子学方法占主要方面,其有:①直接测序法;②限制性片段长度多态性分析法;
③特异性探针杂交法;④基因芯片;⑤遗传系统进化树分析方法;⑥型特异性引
物PCR法;⑦荧光共振能量转移探针的解离曲线分析法;⑧引物特异的延伸分析法;⑨异源分子迁移率分析(HMA)法。而血清学方法有:①重组免疫印迹试验(RIBA)②酶免疫试验(EIA)。其中第②种已经被第一种取代。
4 HCV基因与疾病的关系
HCV基因与疾病的关系没有直接及明确的证据,但是目前普遍认为HCV与重型肝炎有关,与肝硬化、肝癌也有一定的关系,肝移植术后易复发的患者HCV 感染率也很高。在这一层次上来讲,HCV基因可能在一定程度上促进了这些疾病的进展,可能在肝病的患者损伤肝细胞,从而导致患者肝功能持续下降,产生严重的后果。
5抗HCV药物及疫苗制备
5.1抗HCV药物标准治疗方案是聚乙二醇干扰素联合利巴韦林,聚乙二醇干扰素又称为长效干扰素。临床用药试验研究表明,使用长效干扰素对丙型肝炎患者的疗效明显比普通A-干扰素明显。在临床上,对于丙肝患者首选聚乙二醇干扰素。
5.2疫苗制备像很多疾病一样,丙肝的疫苗不容易研制[1~5]。这与HCV基因的高度变异性有关,HCV基因其复制依赖的酶缺乏校对功能,这样很容易产生免疫逃逸,而且其基因具有高度异源性,这为疫苗的研制带来了很大的困难。在世界上很多国家都在尝试使用一种新的方法来研制疫苗,可是结果并不理想,当一种疫苗研制出来后HCV基因已经产生变异,这种疫苗就失去了其临床价值,这样不仅花费了财力,还消耗了研究人员很多精力,结果并不理想。所以,如果相关部门不投入大量的财力是无法继续研究疫苗这项事业的。
6结论
对于丙型肝炎病毒基因分型的研究远远还没有结束[6~10],虽然其基因具有显著异源性和高度变异性,其检测方式既不简便也不经济,需要投入大量的人力物力财力对其分型有进一步的突破性研究,但是对丙型肝炎病毒基因分型的研究不能止步,對其疫苗的制备不能停止,因为研究HCV基因不仅有助于人们对丙型肝炎有更深入的认识,而且可以为丙型肝炎病毒基因有关的丙肝疾病疫苗的制备提供依据,本着对人类健康负责的态度,预防丙肝的爆发流行,我们要继续为丙肝基因的研究付出努力,为人类战胜丙肝迈出更重要的一步。
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