猪脾中DNA的提取及含量测定
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1、二苯胺试剂:使用前称取0.8g二苯胺(需在70%乙醇 试剂中重结晶2次),溶于180ml冰乙酸中,再加入8ml过氯酸 (60%以上),混匀待用,临用前加入0.8ml 1.6%乙醛溶液,所 配试剂应为无色。 每组需56ml 共需2800ml 2、DNA标准溶液:(须经定磷法确定其浓度)取标准DNA 以0.01N NAOH配成200微克/毫升的标准液。 每组需12ml 共需600ml 3、1.6%乙醛:取47%乙醛3.4ml,加重蒸水定容至100ml (放于冰箱中,一周之内可以使用)。 共需70ml 4、待测样品液:准确称取猪脾DNA 5mg,用0.01mol/L的 氢氧化钠溶液配成100微克/毫升的溶液。 每组需4ml 共需200ml
②化学试剂法:用SDS处理细胞;
③酶解法:加入溶菌酶或蜗牛酶,都可使细胞壁 破碎。
高等动物的DNA 主要存在于细胞核与线粒体中, 所以提取时有两个困难(高等植物与此类似):
1)破碎细胞难,从处死动物分离组织器官到 破碎细胞费时长。在长时间内DNA可能会被DNase 降解; 2)因分子量大,在使用组织匀浆器破碎组织 时易造成DNA 断裂; 对不同生物材料,要根据具体情况选择适当 的分离提取方法。
强酸、加热条件下,可以使DNA中的嘌呤碱基与 脱氧核糖间的糖苷键断裂,而产生嘌呤碱基,脱氧核 糖与嘧啶核苷酸。 其中2ˊ脱氧核糖在酸性环境中成为ω―羟基 ―γ―酮基戊醛,此物与二苯胺反应生成蓝色化合物, 在595nm处有最大吸收。DNA在40-400μg范围内光密 度与DNA浓度成正比。 在反应液中加入少量乙醛可提高灵敏度,而且其 他化合物的干扰也显著降低。 当样品含少量RNA时不影响测定,而蛋白质、多 种糖及其衍生物芳香,羟基醛都能与二苯胺形成各种 有色物质,干扰测定。
二、DNA提取技术
技术1:基因组总DNA的大量提取
本方法通过液氮研磨粉碎动植物组织、裂 解液裂解细胞、有机溶剂抽提,使进入水相的 核酸与蛋白成分分开,在RNA酶作用下,降解 RNA,得纯度较高的DNA样品。
仪器: 高速冷冻离心机、台式离心机、恒温水浴、 低温冰箱或冰柜、冷冻真空干燥器、取液器、 电泳仪、水平电泳槽、紫外分光光度计。
(2)阴离子去污剂法: 用SDS或二甲苯酸钠等去污剂使蛋白质变性,可 以直接从生物材料中提取DNA。 由于细胞中DNA与蛋白质之间常借静电引力或 配位键结合,而阴离子去污剂能够破坏这种价键,所 以常用阴离子去污剂提取DNA。
(3)苯酚抽提法: 苯酚作为蛋白变性剂,同时抑制了DNase的 降解作用。 用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 连 接键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团 与苯酚相似相溶。 蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。离 心分层后取出水层,多次重复操作,再合并含 DNA 的水相。 利用核酸不溶于醇的性质,用乙醇沉淀 DNA 。此法的特点是使提取的DNA保持天然状 态 。
操作步骤
1、 鲜猪脾
去脂、血
5g
预冷的1×SSC洗2次 匀浆液
冰盐浴
剪碎, 1×SSC=1:5(W/V)
捣碎 (8×5s,间隔30s)
冷却10min
4℃,8000rpm,5min
弃上清(重复2次)
沉淀物
2V 1×SSC,搅匀
4℃,8000rpm,5min
沉淀
搅拌, 滴加
2、沉淀
固体NaCL
5V Na2EDTA
猪脾中提取DNA
1. 实验材料,仪器和试剂: (1) 实验材料:新鲜猪脾: (2)仪器: 量筒:10ml 、100ml 3个; 烧杯:100ml 2个、250ml 2个; 磨口锥形瓶: 250ml 1个、500ml 1个; 移液管:1ml 1支、10ml 1支; 滴管、玻棒、离心机、电动搅拌器、台秤、 剪刀、镊子。
外,还有质粒DNA 等。
对于低等生物。如从病毒中提取DNA 比较容易, 多数病毒DNA 分子量较小,提取时易保持其结 构完整性。
核酸提取的主要步骤:
1)破碎细胞; 2)去除与核酸结合的蛋白质以及多糖、脂 类等生物大分子; 3)去除其它不需要的核酸分子; 4)沉淀核酸,去除盐类,有机溶剂等杂质。
核酸提取的方案,应根据具体生物 材料和待提取的核酸分子的特点而定。 对于某特定细胞器中富集的核酸分 子,事先提取该细胞器,然后提取目的 核酸分子的方案,可获得完整性和纯度 两方面质量均高的核酸分子。
2.细胞的破碎
有坚硬的细胞壁的细胞,首先要破碎细胞。方法 有三种:
①机械方法:超声波处理法、研磨法、匀浆法;
所得混合液倒入磨口塞的锥形瓶中,加入同体 积氯仿—异戊醇,激烈振荡10分钟,8000r离 心10分钟,上层水相取出后倒入烧杯,以同 积氯仿—异戊醇重复去蛋白2次。
取出水相于烧杯中,逐渐加入2倍 体积95%乙醇,玻棒搅动,DNA纤维绕 于璃玻棒上后挤干,用70%乙醇洗DNA 纤维2次,用95%乙醇洗一次,再用乙 醚洗一次,取出并挤干。
沉淀物中再加2倍体积的1×SSC搅匀,离心,弃上清,
取↓,重复2次。
将所得沉淀悬于5倍体积的 PH8.0、0.15M NaCL-0.1Na2EDTA 溶液中。边搅拌边慢慢滴加 5%SDS最终浓度达1%为止。然后 加入固体氯化钠使其最终浓度达 1mol/L,继续搅拌,以确保氯化 钠全溶。
(3)试剂: ① 20×SSC:175.2gNaCL,88.2g柠檬酸 钠•2H2O,PH=7.0加水至1000ml; ② 1×SSC,0.1×SSC由①作相应的稀释 得来; ③ NaCL-Na2EDTA 液 : 8 . 7 7 gNaCL,3.72g Na2EDTA溶于800ml蒸馏水中,用固体NaOH调 PH=8后定容至1000; ④ 5%SDS(W/V):6gSDS溶于100ml45%乙 醇中; ⑤ 氯仿-异戊醇=24:1(体积比) ⑥ 其他:95%乙醇,盐,冰.
3.DNA提取的几种方法 (1)浓盐法
利用RNP和DNP在电解溶液中溶解度不同,将二者 分离。
1)用1M 氯化钠提取,得到的DNP粘液; 2) 与含有少量辛醇的氯仿一起摇荡,使乳化; 3) 离心除去蛋白质,此时蛋白质凝胶停留在水相 及氯仿相中间,而DNA位于上层水相中; 4) 用2倍体积95%乙醇可将DNA 钠盐沉淀出来.
核酸提取的原理
核酸包括DNA、RNA两种分子,在细胞中都是以与 蛋白质结合的状态存在,用DNP和RNP 表示; DNP和RNP在盐溶液中的溶解度受盐浓度的影 响而不同。 DNP在低浓度盐溶液中,几乎不溶解,如在0.14 mol/L的氯化钠溶解度最低,仅为在水中溶解度 的1%,随着盐浓度的增加溶解度也增加,至 1mol/L氯化钠中的溶解度很大,比纯水高2倍。
DNA产率: 测得的DNA的微克数 DNA%= X 100 原料的微克数
1.为什么在低温下进行?
2.加柠檬酸钠和EDTA的作用 ?
3.加SDS的作用?
4.加NaCL的作用,为什么要加到1mol/L? 5.加入异戊醇有什么作用?
1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9.
生物学基础实验教程. 滕利荣主编. 长春:吉林科学技术出版社, 1999.8, 573~578. 现代分子生物学实验手册. 张维铭主编. 北京: 科学出版社, 2003.6, 80~106. 精编分子生物学实验指南. 颜子颖、王海林译. 北京: 科学出版 社, 1998.6, 30~40. 生物化学与分子生物学实验技术. 厉朝龙主编. 杭州: 浙江大学 出版社, 2000.6, 107~116 分子克隆实验指南(第三版). 黄培堂等译.北京: 科学出版社, 2002.8,26~52. 生物化学与分子生物学实验教程. 梁宋平主编. 北京:高等教育出 版社,2003.3,16~19. 生物化学实验(第三版). 陈钧辉, 陶力等编. 北京: 科学出版社, 2003.4,128~130. 生物化学实验指导. 余冰宾 主编. 北京:清华大学出版社, 2004.1, 158~160. 生物化学实验方法和技术. 陈毓荃 主编.北京: 科学出版社, 2002.8, 127~132
核酸的分布:
95%的真核生物DNA主要存在于细胞核内,
其它5%为细胞器DNA,如线粒体、叶绿体等。 RNA分子则主要存在于细胞质中,约占75%, 另有10%在细胞核内,15%在细胞器中。
1、核酸的理化性质
DNA则为白色类似石棉样的纤维状物。
核酸和核苷酸 大都呈酸味(除肌苷酸、鸟苷酸具 有鲜味外)。
RNP在盐溶液中的溶解度受盐浓度的影响较 小,在0.14mol/L氯化钠中溶解度较大。因此, 在提取时,常用此法分离这两种核蛋白。
从不同材料中提取DNA的方法不同,分离
提取的难易程度也不同。
从高等动植物及细菌中提取DNA难度大一
些。由于其DNA 分子量较大。因此易被 机械张力剪断。
细菌DNA,除核DNA
DNA、RNA和核苷酸都微溶于水,不溶于乙醇、氯 仿等有机溶剂。
DNA钠盐在水中为10g/L,呈黏性胶体溶液。 RNA钠 盐在水中溶解度可达40g/L。
在酸性溶液中,DNA、RNA易水解,在中性 或弱碱性溶液中较稳定。
DNA溶液的粘度很大,而RNA溶液的粘度小 得多。核酸发生变性或降解后其粘度降低。 核酸受到强大离心力的作用时,可从溶液中 沉降下来,其沉降速度与核酸的大小和密度有 关。
1M
搅拌
5%SDS(终浓度达1%)
混合液
锥形瓶
NaCL全溶 激烈振荡10min
同体积氯仿-异戊醇
4℃,8000rpm,10min
上层水相 3、水相
70%乙醇 搅拌
同体积氯仿-异戊醇
重复去Pr,2次 DNA纤维
水相 挤干
95%乙醇
至溶液澄清
95%乙醇, 乙醚
洗DNAwenku.baidu.com维2次
取出并挤干DNA纤维
二苯胺显色法测定DNA含量
2. 操作步骤:
取鲜猪脾,去脂、血,称取5g,用预冷的1×SSC溶液 洗2次,剪碎; 按脾:1×SSC=1; 5W/V 加入25ml预冷的1×SSC, 用高速组织捣碎机破碎8次,每次5秒,中间间隔30秒; 将匀浆液放在烧杯中, 于冰盐浴中冷却10分钟。 4℃,8000rpm离心5分钟。去掉上清,取↓;
试剂 : 细胞裂解液(100mM Tris-HCl 5mM EDTA 500mM NaCl 1% SDS pH 7.5);饱和酚;氯仿 /异戊醇;异丙醇;70%及无水乙醇;3M NaAC (pH5.2);RNA酶;TAE缓冲液;载样缓冲液
提取DNA的主要来源:
1、动物组织及器官 脾、肝、胸腺、鱼类精子等。 2、植物 种子的胚芽等 3、微生物 细菌、酵母菌等
核酸的存在形式:
核酸包括DNA、RNA两种分子,在细胞中都是以 与蛋白质结合的状态存在; 真核生物的染色体DNA为双链线性分子; 原核生物的“染色体”、质粒及真核细胞器 DNA为双链环状分子; 有些噬菌体DNA有时为单链环状分子; 病毒的DNA、RNA分子,其存在形式多种多样, 有双链环状、单链环状、双链线状及单链线状 等。
猪脾中DNA的提取
指导教师:滕利荣
Email:tenglirong@mail.jlu.edu.cn
2005.03
二十世纪是 物理、化学和电子科学 的世纪
二十一世纪是 生命科学 生命是 的世纪
?
生命 = 核酸 + 蛋白质
二十一世纪是核酸、蛋白质的世纪
DNA提取的意义:
1、用于研制核酸类药物及保健品 2、用于基因诱变 3、用于DNA克隆 4、用于DNA测序 5、用于PCR扩增
操作方法:
1. DNA标准曲线的制定: 取10支试管,分成2组,依次加入0.4、0.8、1.2、 1.6和2.0mlDNA标准溶液。添加蒸馏水,使之都成为 2ml。另取2只试管,各加2ml蒸馏水作为对照。然后 各加入4ml二苯胺试剂,混匀。于60度恒温水浴中保 温1h,冷却后于595nm处进行比色测定。取两管平均 值,以DNA浓度为横坐标,光吸收值为纵坐标,绘制 标准曲线。
2. 制品的测定:
取2支试管,各加2ml待测液(内含 DNA应在标准曲线的范围之内)和4ml二 苯胺试剂,摇匀。其于操作同标准曲线 的制作。 3. 根据测得的光吸收值,从标准曲线待测 上查出相应该光吸收值DNA的含量,计算 出制品中的百分含量。
数据: DNA纯度: 待测液中测得的核酸微克数 DNA%= X 100 待测液中制品的微克数