医学图像格式转换及读取与显示

医学图像格式转换及读取与显示

1.医学图像格式转换

通常从机器拷贝出来的医学图像数据为DICOM格式，如果是多种模态图像混合，则需要使用Dcm2AsiszImg.exe工具把多模态图像分类出来，软件如下图所示：

Dcm2AsiszImg 是一个接收、发送DICOM 图像、把DICOM 图像进行分类、把DICOM 转化为安科Img 图像格式的软件工具。

用法：

“输出目录”选择待转化的图像保存路径，“DICOM图像分类”选择要转化的原始图像目录，最后点击“DICOM图像分类”，输出图像分辨率为256*256。

常用的图像格式还有ANALYZE和NIFTI，ANALYZE格式的图像包括图像文件.img 和头文件.hdr，应用于SPM2。NIFTI把图像文件和头文件合并为.nii文件，应用于SPM8、FSL、FreeSurfer等。可以利用MRICron软件的dcm2niigui.exe插件把DICOM格式转化为ANALYAZE 和NIFTI格式。

在Help下的preference处可设置输出参数：

2.读取与显示DICOM图像

Matlab提供了dicominfo、dicomdict、dicomdisp、dicomread、dicomuid 、dicomwrite函数，可实现DICOM格式图像的读取、显示、保存等操作，以及查看扫描信息。

3.读取与显示NIFTI格式图像

MRIcro软件可以显示NIFTI图像

① NIfTI这个Matlab程序可以读取显示、保存、制作核磁共振图像。

具体如下：

>> [hdr,filetype,fileprefix,machine] = load_nii_hdr('output.hdr');

>> [img,hdr] = load_nii_img(hdr,filetype,fileprefix,machine);

>> save_nii(nii, filename, [old_RGB]);

②SPM方法：

help spm_read_vols

V = spm_vol_nifti('output.hdr')

[Y,XYZ] = spm_read_vols(V);

4.Freesurfer的mgh图像读取与显示

Freesurfer安装目录下有一个matlab程序包，提供了load_mgh, save_mgh等函数实现该文件的读取与显示。