pcr鉴定转基因小鼠原理
基因敲除小鼠的PCR鉴定
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基因敲除⼩⿏的PCR鉴定基因敲除⼩⿏的 PCR 鉴定⼀、实验⽬的:通过PCR T增程序及琼脂糖凝胶电泳⽅法鉴定凝⾎因⼦IX基因敲除⼩⿏的基因型。
⼆、实验原理:真核⽣物的⼀切有核细胞(包括培养细胞)都能⽤来制备基因DNA真核⽣物的DNA是以染⾊体的形式存在于细胞核内,因此,制备DNA的原则是既要将DNA与蛋⽩质、脂类和糖类等分离,⼜要保持DNA分⼦的完整。
提取DNA勺⼀般过程是将分散好的组织细胞在含SDS(⼗⼆烷基硫酸钠)和蛋⽩酶K的溶液中消化分解蛋⽩质,再⽤酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋⽩质,得到的DNA溶液经⼄醇沉淀使DNA从溶液中析出。
1.PCR原理:PCF技术的基本原理类似于DNA勺天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。
PCF由变性-退⽕-延伸三个基本反应步骤构成:1)模板DNA的变性:模板DNA S加热⾄93C左右⼀定时间后,使模板DNA双链或经PCF T增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;2)模板DNA与引物的退⽕(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降⾄55C 左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;3)引物的延伸:DNA模板-引物结合物在TaqDNA聚合酶的作⽤下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成⼀条新的与模板DNA 链互补的半保留复制链重复循环变性-退⽕-延伸三过程,就可获得更多的“半保留复制链”,⽽且这种新链⼜可成为下次循环的模板。
每完成⼀个循环需2?4分钟,2?3⼩时就能将待扩⽬的基因扩增放⼤⼏百万倍2.琼脂糖凝胶电泳原理:在pH8.0~8.3 的缓冲液中,核酸分⼦带负电荷,向正极移动。
由于不同⼤⼩和构象的核酸分⼦电荷密度⼤致相同,因此在⾃由泳动时,各种核酸分⼦的迁移率相似,⽆法分开。
然⽽,在浓度适当的凝胶中,由于分⼦筛效应,使⼤⼩和构象不同的核酸迁移率出现差异,从⽽把它们分开。
生物技术本科毕业论文pcr方法在apoe基因敲除小鼠基因型鉴定中的应用
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湖北中医药大学本科生毕业论文题目:PCR方法在ApoE基因敲除小鼠基因型鉴定中的应用姓名:学号:专业:生物技术年级:2008级实习单位:武汉大学心血管病研究所指导老师:完成日期:2012 年5 月1 日PCR方法在ApoE基因敲除小鼠基因型鉴定中的应用作者肖明瑶指导者张艳摘要目的为ApoE基因敲除鼠探索快速、简单的基因型PCR检测方法。
方法设计两对引物扩增野生型ApoE基因和ApoE缺陷突变基因的DNA片段,用PCR仪梯度方案测试最佳退火温度,然后用PCR鉴定方案检测小鼠基因型并将所得基因型结果与已经过经典的Southern blot方法检测得到的基因型结果比较。
结果野生型仅在155 bp处有一条条带,突变纯舍子仅在245 bp处有一条条带,杂合子则在155和245bp处出现两条条带。
用PCR方法获得的ApoE基因分析结果与经典的Southern blot方法获得的结果完全一致。
结论用PCR方法分析ApoE基因敲除鼠的基因型具有快速、简单、廉价和适用的特点。
关键词聚合酶链反应基因型基因打靶载脂蛋白EGenotype identification of ApoE Gene Knockout Mice withPolymerase Chain ReactionObjective This study was to explore a simple and quick polymerase chain reaction(PCR)method for genotyping of ApoE knockout mice.Method Two pairs of primers were designed to amplify genomic DNA fragment of wild-type ApoE gene and the same region on ApoE targeting veceor respectively.A gradient PCR strategy was used to test the best annealing temperature. Results A 155bp band was found in wild-type ApoE mice,a 245 bp band in homozygous mutated ApoE mice and both bands in hetemzygous mice.The genotyping results were completely coincided with those from typical Southern blot. Conclusion PCR is a simple,fast and practical method for the genotyping of ApoE gene knockout mice.Key words Poiymerase Chain Reaction genotype gene targeting ApoE载脂蛋白(apolipoprotein,ApoE)是清除乳糜微粒和极低密度脂蛋白的受体的配体,因此,缺乏ApoE则会导致血液循环中富含胆同醇的物质积累而更加容易引起动脉粥样硬化(atl-rosclerosis,AS)病灶形成。
转基因小鼠的鉴定
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转基因小鼠的鉴定一、剪鼠尾1.剪鼠尾的时间当新生的小鼠年龄达到两到三周耳朵已经长开时剪鼠尾较好,此时鼠尾剪起来比较容易且小鼠的生命力比较强;2.分辨小鼠的年龄a当小鼠整个身体较红且腹部无奶时,此小鼠当天出生或前一晚出生;b当小鼠腹部有奶腹部有一小团白色物质,此小鼠出生2~3天;c当小鼠背部长出皮毛时,此小鼠出生3~4天;d当小鼠毛长全,但眼未开时,此小鼠出生10天左右;e当小鼠眼刚开,耳未开时,此小鼠出生12天左右;f当小鼠耳刚开时,此小鼠出生14天左右;3.剪鼠尾后对小鼠的标记:打耳孔法二、从鼠尾中提取DNA采用鼠尾基因组DNA提取试剂盒康为世纪:cw2094提取DNA,操作如下:1.剪取小鼠长度为的尾巴,放入灭菌后的离心管中,加入180μL Buffer GTT;震荡混匀;2.加入20μL proteinase K,涡旋震荡,彻底混匀;3.置于56℃水浴,直到组织溶液完全清澈,一般需消化6-8h,赋予过程中涡旋震荡,使样品均匀分离;注意:1 如果赋予和涡旋震荡后仍然有胶状物质,必要时过夜消化再加入20μl proteinaseK消化,不会影响后续操作;2 如需去除RNA,可在上述步骤完成后,加入4μl浓度为100mg/μl的RNase A溶液,震荡混匀,室温放置5-10min;4.14000rpm 离心 1min,以消除未消化的类似于鼠毛等组织,将上清转移到一个新的灭过菌的离心管中;5.加入200μl Buffer GL,涡旋震荡,充分混匀,加入200μl 无水乙醇,涡旋振荡,充分混匀,短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底;注意:1加入Buffer GL 和无水乙醇后要立即涡旋震荡混匀;2 如果多个样品一起操作,Buffer GL 和无水乙醇可以等比例混匀后一起加入样品;3加入Buffer GL 和无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续操作;6.将步骤5中所得到的溶液全部加入到已装入收集管的吸附柱中,若以此不能加完溶液,可分多次转入;10000rpm 离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中;7.向吸附柱中加入500μl Buffer GW1使用前检查是否已加无水乙醇,10000 rpm 离心 1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中;8.向吸附柱中加入500μl Buffer GW2使用前检查是否已加无水乙醇,10000 rpm 离心 1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中;如需进一步提高DNA纯度,可重复步骤8;9.12000rpm 离心 2min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干;注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶促反应酶切,PCR等;10.将吸附柱置于一个新的灭过菌的离心管中,向吸附柱的中间部位悬空加入50-200μl Buffer GE或灭菌水,室温放置2-5min,10000rpm 离心 1min,收集DNA溶液,-20℃保存DNA;注意:1如果下游实验对PH值或EDTA敏感,可以用灭菌水洗脱,洗脱液的PH值对洗脱效率有很大影响,若用水作洗脱液应保证其PH值在直接,PH值低于时洗脱效率不高;2离心前室温孵育5min可增加产量;3用另外的50-200μL Buffer GE或灭菌水再次洗脱可以增加产量;4如果需要提高DNA的终浓度,可以将步骤10所得的DNA洗脱液重新加至吸附膜上,重复步骤10;若洗脱体积小于200μL,可以增加DNA的终浓度,但可能会减少总产量;三、PCRPCR程序设定:1= 94.0℃ for 5:00 2= 94.0℃ for 1:00 3= 59.0℃ for 0:50 4= 72.0℃ for 1:00 5= Goto 2 2times6= 94℃ for0:507= 58℃ for 0:508=72℃ for 1:009=Goto 6 2times10= 94.0℃ for 0:50 11=56.0℃ for 0:50 12= 72.0℃ for 1:00 13= Goto10 32times 14= 72.0℃ for 10:00 15= 4.0℃ for 5:00 16=END目前实验室的双转基因小鼠AD体系采用:PCR反应的体系12μl:APPPrimer APP-1 μlPrimer APP-2 μlO 2μlddH2mixCW0682 6μlDNA 1μlPCR反应的体系12μl:PS1Primer PS1-1 μlPrimer PS1-2 μl内参-1 1μl内参-2 1μlmixCW06826μlDNA 1μl先在的EP管中加入总的体系再平均分装入各个PCR管中一般多加两小管的量,将移液器调到总量的1/3到1/2体积在EP管中缓慢抽吸若干次尽量避免产生气泡以便Taq酶混合均匀,最后再在各PCR管中依次加入DNA样品;引物处理方法:引物在安基生物有限公司合成后,EP管上会有标记,一般为x nmol,使用O,涡旋振动混匀,微型离心机离心,即可得前先用12000rpm 离心 1min,加入10x μl ddH2O稀释10倍,即加入90μl,混匀后即可得到到100μM的母液,取10μl 的母液,用ddH210μM的引物工作液;四、电泳1.配胶:鉴定用的胶板有大、中、小3种,分别用的梳子为50、25、11齿;分别用的TBE的量为90ml、45ml、25ml;用%的琼脂糖凝胶;2.点样:12μl的DNA,Marker加5μl;点样时注意逐个点样,不要点错,最好把中间的那个孔留着点Marker,这样可避免点样的出错;Marker的选择依基因片段大小而定;3.跑电泳:打开电源,150v电压,30min左右即可;4.照胶:看是否有目的条带,即可判断对应小鼠是阳性、阴性或是杂合子;5.保存;。
转基因小鼠和显微注射以及验证
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转基因小鼠和显微注射以及验证目录转基因小鼠制备实验方法 (2)Southern Blot原理及实验方法 (4)Northern Blot原理及实验方法 (6)RFLP标记 (12)1.点的多态性 (13)2.序列多态性 (14)显微注射实验操作 (14)转基因小鼠制备实验方法1、选取7~8周龄雌性小鼠,阴道口封闭,作为供体,下午3:00左右,每只小鼠腹腔注射PMSG(10 IU)。
2、 47~48小时后,每只小鼠腹腔注射HCG(0.8 IU),并与正常公鼠合笼;另取数只适龄母鼠(2月龄以上)作为受体,阴道口潮红,与结扎公鼠合笼。
3、第二天上午9:00前观察供体、受体,有精栓者拿出备用。
受体笼拿出作好隔离措施。
4、10:30左右,断颈处死供体,手术取出整个输卵管,放入透明质酸酶~0.3mg/M2液中。
显微镜下,用镊子撕开输卵管壶腹部,受精卵随同颗粒细胞即一同流出。
5、仔细观察放在透明质酸酶M2液中的受精卵,当受精卵周围的颗粒细胞脱离时,将受精卵吸出,放入M2液中洗涤,最后放在M16液中放入5% CO2,37C0培养箱培养。
6、在显微镜下观察,挑选细胞饱满,透明带清晰,雄原核清晰可见的受精卵待用。
7、安装持卵针和注射针,使其末端平行于载物台,在凹玻片的中央滴入一滴M2液,覆盖石蜡油,移入待注射的受精卵。
DNA在注射针中的气泡应在先前全部弹走。
8、在高倍镜下,将注射针轻触持卵管,使DNA缓慢流出并控制其流量;反复吹吸受精卵,使其处于最佳位置,将注射针刺入受精卵的雄原核,直至看到原核膨大即退出。
将注射过的和未注射过的受精卵上下分开放置,不致于混搅,注射完毕后,放入5% CO2,37C0培养箱培养。
9、将受体麻醉,注射计量为1%戊巴比妥钠0.01ml/g,腹腔注射。
手术取出卵巢连接输卵管,用脂肪镊固定,在显微镜下找到输卵管开口。
吸取注射后经培养成活的受精卵,吸取方法是先吸一段较长的M2,吸一个气泡,然后吸取受精卵,尽量紧密排列,再吸一段液体,吸一个气泡,再吸一段液体,共四段液体三个气泡。
Vegfr2-luc转基因子代小鼠的鉴定
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Vegfr2-luc转基因子代小鼠的鉴定王伟强;周清华;刘红雨;宋志涛;王玉丽;王竞;李颖;李永文;王岷;陈军【摘要】背景与目的Vegfr2-Iuc转基因小鼠体内血管内皮生长因子受体2(vascular endothelial growth factor recep-tot 2,VEGFR2)的表达可以驱动荧光素酶报告基因(luciferase,luc)的表达,是活体动物水平实时监测血管生成情况的有利工具.本研究旨在对子代Vegfr2-luc转基因小鼠进行鉴定,以确定能否用于血管生成研究.方法PCR检测新生小鼠基因组内luc基因;利用活体成像技术观察新生Vegfr2-luc转基因小鼠生长发育过程中以及皮肤伤口修复过程中luc基因表达水平的变化情况;荧光素酶报告基因检测试剂盒检测成年(8N龄)转基因小鼠各脏器荧光素酶的活性和Real-time PCR检测各器官VEGFR2 mRNA的表达水平.结果PCR结果显示50%(56/112)的新生小鼠携带luc基因.活体成像结果显示随着Vegfr2-luc转基因小鼠发育成熟,luc表达量逐渐降低(P<0.001);在皮肤伤口修复过程中,伤口处luc表达水平先增强后降低(P<0.001).雌性成年转基因小鼠各脏器VEGFR2 mRNA的表达水平与荧光素酶活性呈正相关(r=0.948,P<0.001).将睾丸组织除外,雄性成年转基因小鼠各脏器vEGFR2 mRNA的表达水平与荧光素酶活性同样呈正相关(r=0.836,P<0.001).结论 Vegfr2-luc转基因子代小鼠体内luc表达水平的变化可以反映VEGFR2的表达情况.%Background and objective A transgenic mouse, Vegfr2-Iuc, in which a luciferase reporter (luc) is under control of the murine VEGFR2 promoter, can be used to track angiogenesis in vivo.-lhe aim of this study is to identify the offspring of Vegfr2-luc transgenic mouse.Methods Luc was detected with PCR in genomic DNA of the new-born mouse.Luc expression in the offspring of Vegfr2-Iuc transgenic mouse was monitored with MS in vivo imaging system duringpost-natal development.Wound-healing models of Vegfr2-luc transgenic mouse offspring were established and the expression of luc was monitored during the wound-healing process.Luc activity and VEGFR2 mRNA expression in different organs were detected with luc Assay System and Real-time PCR respectively Results PCR showed that 50% (56/112) of the offspring of Vegfr2luc transgenic mouse carry luc.IVIS in vivo imaging results demonstrated that luc expression in Vegfr2-luc transgenic mouse dropped dramatically with age increase (P<0.001) and luc expression in the wound first increased and then decreased during the wound-healing process (P<0.001).Luc activity in female Vegfr2-luc transgenic mouse organs was positively correlated with VEGFR2 mRNA expression (r=0.948, P<0.001).Except testis, luc activity in male Vegfr2-luc transgenic mouse organs was also positively correlated with VEGFR2 mRNA expression(r=0.836, P<0.001).Conclusion The offspring of Vegfr2-luc transgenic mouse is applicable to tracking angiogenesis in vivo.【期刊名称】《中国肺癌杂志》【年(卷),期】2011(014)005【总页数】5页(P391-395)【关键词】动物模型;血管新生;荧光素酶报告基因【作者】王伟强;周清华;刘红雨;宋志涛;王玉丽;王竞;李颖;李永文;王岷;陈军【作者单位】300052,天津,天津医科大学总医院,天津市肺癌研究所,天津市肺癌转移与肿瘤微环境实验室;300052,天津,天津医科大学总医院,天津市肺癌研究所,天津市肺癌转移与肿瘤微环境实验室;300052 天津,天津医科大学总医院胸部肿瘤中心;300052,天津,天津医科大学总医院,天津市肺癌研究所,天津市肺癌转移与肿瘤微环境实验室;300052,天津,天津医科大学总医院,天津市肺癌研究所,天津市肺癌转移与肿瘤微环境实验室;300052,天津,天津医科大学总医院,天津市肺癌研究所,天津市肺癌转移与肿瘤微环境实验室;300052,天津,天津医科大学总医院,天津市肺癌研究所,天津市肺癌转移与肿瘤微环境实验室;300052,天津,天津医科大学总医院,天津市肺癌研究所,天津市肺癌转移与肿瘤微环境实验室;300052,天津,天津医科大学总医院,天津市肺癌研究所,天津市肺癌转移与肿瘤微环境实验室;300052,天津,天津医科大学总医院,天津市肺癌研究所,天津市肺癌转移与肿瘤微环境实验室;300052,天津,天津医科大学总医院,天津市肺癌研究所,天津市肺癌转移与肿瘤微环境实验室;300052 天津,天津医科大学总医院胸部肿瘤中心【正文语种】中文【中图分类】R734.2血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor, VEGF)家族有三个受体,即VEGFR1、VEGFR2和VEGFR3。
小鼠转基因实验报告(3篇)
![小鼠转基因实验报告(3篇)](https://img.taocdn.com/s3/m/3d52b5ad0408763231126edb6f1aff00bfd57019.png)
第1篇一、实验背景随着生物技术的飞速发展,转基因技术在医学、农业等领域发挥着越来越重要的作用。
小鼠作为生物医学研究中常用的实验动物,其基因编辑技术的应用为疾病模型构建、药物筛选和基因功能研究提供了有力工具。
本实验旨在通过基因编辑技术构建转基因小鼠模型,研究特定基因在小鼠体内的表达和功能。
二、实验材料1. 实验动物:C57BL/6小鼠,雄性,8周龄。
2. 基因构建材料:目的基因(GFP基因)、启动子(CMV启动子)、荧光素酶报告基因(Luc基因)、pEGFP-C1质粒载体、pGL3-Basic质粒载体。
3. 实验试剂:限制性内切酶、DNA连接酶、T4 DNA连接酶、DNA聚合酶、PCR引物、Trizol试剂、RNA提取试剂盒、反转录试剂盒、荧光定量PCR试剂盒、细胞培养试剂等。
4. 仪器设备:PCR仪、凝胶成像系统、实时荧光定量PCR仪、细胞培养箱、显微镜等。
三、实验方法1. 目的基因构建:将GFP基因和Luc基因分别插入到pEGFP-C1和pGL3-Basic质粒载体中,构建重组质粒。
2. 重组质粒转染:将构建好的重组质粒通过脂质体转染法转染C57BL/6小鼠胚胎干细胞(ES细胞)。
3. 转基因小鼠胚胎细胞筛选:通过GFP荧光筛选,得到阳性细胞克隆。
4. 胚胎细胞传代培养:将阳性细胞克隆进行传代培养,筛选出稳定表达的细胞系。
5. 胚胎细胞冻存:将稳定表达的细胞系进行冻存,以备后续实验使用。
6. 胚胎移植:将冻存后的胚胎细胞进行移植,获得转基因小鼠。
7. 转基因小鼠表型鉴定:通过GFP荧光显微镜观察转基因小鼠体内GFP表达情况,并通过实时荧光定量PCR检测GFP基因在转基因小鼠体内的表达水平。
四、实验结果1. 重组质粒构建:成功构建了含有GFP基因和Luc基因的重组质粒。
2. 转基因小鼠胚胎细胞筛选:通过GFP荧光筛选,得到阳性细胞克隆。
3. 胚胎细胞传代培养:成功传代培养出稳定表达的细胞系。
4. 胚胎移植:成功获得转基因小鼠。
基因敲除小鼠技术
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转基因、基因敲入/敲除动物技术已经成为现代生命科学基础研究和药物研发领域不可或缺的重要技术,该技术从上世纪七八十年代诞生以来,已有近四十年的历史,经典技术如DNA原核显微注射、胚胎干细胞显微注射技术一直以来经久不衰,并逐渐从基础研究实验室转向商业模式,成为一项高度标准化的新兴产业一、技术介绍与研究进展转基因、基因敲入/敲除动物技术已经成为现代生命科学基础研究和药物研发领域不可或缺的重要技术,该技术从上世纪七八十年代诞生以来,至今已有近四十年的历史,经典技术如DNA原核显微注射、胚胎干细胞显微注射技术一直以来经久不衰,在小鼠模型构建方面日趋完善,并且如同剪切酶和抗体等常规分子生物学试剂的制备技术一样,逐渐从基础研究实验室转向商业模式,成为一项高度标准化的新兴产业,催生了数以百计的创新药物和数以千计的优秀文章。
尽管如此,传统技术仍然存在一些难以克服的缺陷,如步骤繁琐、周期漫长、成功率低、费用高昂等,而ZFN和TALEN等新技术的出现,或有可能将这一局面彻底改变。
二、同源重组技术原理基因敲除鼠技术是上世纪80年代中后期基于DNA同源重组的原理发展起来的,Capecchi和Smithies在1987年根据同源重组(homologous recombination)的原理,首次实现了ES的外源基因的定点整合(targeted integration),这一技术称为"基因打靶"(gene targeting)或"基因敲除"(gene knockout),利用这种ES的显微注射就可以制作出基因敲出小鼠(KO Mice: knockout mice);由于这一工作,Capecchi和Smithies于2007年与Evans分享了诺贝尔医学奖。
同源重组(homologous recombination)定义:是指发生在姐妹染色单体(sister chromatin) 之间或同一染色体上含有同源序列的DNA分子之间或分子之内的重新组合。
使用 CRISPR-Cas9 创建转基因小鼠的方案
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使用 CRISPR-Cas9 创建转基因小鼠的方案虽然近年来已经开发了几种基因组编辑工具,包括锌指结构和 TALENs(转录激活物样效应物核酸酶),但没有一种能像CRISPR/Cas9系统那样高效,该系统由一个RNA引导的DNA内切酶 (Cas9) 和对应的引导RNA(CRISPR) 组成。
利用该系统,研究人员能够实现一步敲除多个基因的等位基因的突变小鼠1。
只需两三周的时间,即可创造出子携带条件性等位基因和报告基因的小鼠2,并且该方案。
特别要注意的是,该过程不需要创建修改的小鼠ES细胞过程,该过程有时会十分困难3。
随着 Cas9 敲入和敲除小鼠的发展,预计越来越多的实验室将选择 CRISPR/Cas9 系统来生成转基因小鼠模型。
使用CRISPR-Cas9创建转基因小鼠的方案动物学研究。
2016 年 7 月 18 日;37(4): 205–213.利用 CRISPR/Cas9 和单倍体胚胎干细胞系统产生基因修饰的小鼠。
图 1.在小鼠胚胎上使用 CRISPR/Cas9 基因组编辑创建转基因小鼠的示意图。
通过共注射 Cas9 mRNA 和向指导 RNA,多个基因靶标可以在小鼠胚胎中一次敲除。
(改编自Yang H,Wang H 和 Jaenisch R. Nat Protoc。
2014 年 8 月;9(8):1956-68.)Sigma-Aldrich 是为基因组编辑提供工具和定制服务的领导者,包括 ZFN 和CRISPR/cas9。
默克还提供了广泛的小鼠胚胎验证培养基和试剂组合,用于储存、转移和扩增用于在EmbryoMAX™名下创建转基因小鼠模型的小鼠胚胎。
浏览所有的基因组编辑产品浏览所有经小鼠胚胎验证的试剂小鼠胚胎和ES细胞培养基小鼠ES细胞培养基实验方案和过程成功的小鼠模型项目的提示1.了解实验目的并开展研究。
生成正确的小鼠需要完全理解被测试依据的假设。
例如,研究者可能希望验证这样的假设:突变肝脏中的转运蛋白可能会减轻特定药物的肝毒性作用。
Wip1过表达转基因小鼠模型的制备与鉴定
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p o l y me r a s e c h a i n r e a c t i o n( RT— P CR),wh i c h we r e u s e d f o r t h e n e x t PCR a mp l i f i c a t i o n t e mp l a t e 。
Wi p l过表 达转 基 因小 鼠模 型 的 制备 与鉴 定
高 倩 , 胡言青 , 唐 懿挺 , 牟 玉 莲
( 中 国农 业 科 学 院北 京 畜 牧 兽 医研 究所 , 北京 1 0 0 1 9 3 )
摘 要: 本 研 究 旨在 构 建 Wi p l 过 表 达 转 基 因小 鼠 , 并对 Wi p l 过 表 达 转 基 因 小 鼠进 行 R NA 水 平 上 的筛 选 , 为 研 究
pcr的原理应用领域
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PCR的原理应用领域1. 引言聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)是一种重要的分子生物学技术,被广泛应用于生物医学研究、医学诊断、农业和环境科学等领域。
PCR能够在体外迅速扩增DNA序列,从而获得足够多的试样以进行进一步的分析和研究。
本文将重点介绍PCR的原理和其在不同应用领域的具体应用。
2. PCR的原理PCR是一种通过体外复制DNA的技术,其基本原理包括三个步骤:变性(denaturation)、退火(annealing)和延伸(extension)。
2.1 变性首先,将待扩增的DNA样品加热至高温,使其双链DNA分离为单链,即变性。
这一步骤通常在94-98摄氏度进行,以保证DNA的完全变性。
这样做是为了使得DNA的两个链分开,以便于后续的扩增。
2.2 退火在退火阶段,将体系中加入引物(primers),引物是长度为15-30个碱基的寡聚核苷酸。
引物在退火时与目标DNA序列上的互补序列结合,将DNA分子的两个链连接在一起。
引物的结合是朝向目标序列两侧延伸的。
2.3 延伸经过退火后,一个热稳定的DNA聚合酶(如Taq聚合酶)加入到体系中。
DNA聚合酶能够在适宜的温度下,沿着引物向3’端延伸,合成与模板DNA互补的新链。
该延伸过程称为扩增,它是通过循环多轮变性、退火和延伸步骤的方式进行的。
3. PCR的应用领域PCR的高效、快速、精确的扩增特性使其成为许多领域的重要工具。
以下是PCR在不同应用领域的具体应用:3.1 生物医学研究PCR广泛应用于生物医学研究中的多个方面,例如:•基因表达研究:通过扩增目标基因的cDNA,可以进一步研究目标基因的表达水平和调控机制;•突变检测:PCR可以快速检测基因中的突变,帮助研究人员了解突变基因与疾病之间的关系;•基因克隆:PCR可以扩增目标DNA序列,方便进行基因克隆和构建重组DNA;•DNA测序:PCR可以扩增DNA片段,为后续的DNA测序提供足够的模板。
小鼠基因型鉴定原理
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竭诚为您提供优质文档/双击可除小鼠基因型鉴定原理篇一:小鼠表型鉴定小鼠发育阶段特点出生为红色(若要换窝,要带一点周围的木屑,否则鼠妈不认识)→生后4-5天开始长毛→生后7天剪脚趾和剪尾巴做基因型鉴定→生后10天开眼→生后20天断奶→生后40天可以合笼→怀孕20天后产崽。
小鼠性别判断:雌鼠的后腹部左右两侧有明显的乳头。
小鼠发情判断:雌鼠一般出生后40天开始发情,发情时肛门(或阴道口)为红色。
之后一直处于可以生育阶段。
一般繁殖合笼为一雄配二三雌,一般不将两只雄鼠和一只雌鼠放在一起,因为两只雄鼠会打架。
在做完基因型鉴定之后要尽快把不需要的小鼠处死,因为小鼠太多雌鼠会奶水不足,当雌鼠奶水不足时,会吃掉鼠崽。
小鼠基因型鉴定配方:bufferA0.5meDTA(ph8.0)10mol/Lnaoh双蒸水定容到250mL室温储存100uL625uLbufferbTribase浓盐酸调ph到3.0室温储存40mm步骤:1.小鼠出生7天后剪尾巴(一小点就行),若出生30天后剪耳朵;2.75uLbufferA100℃煮40min,每20min摇一次;3.225uLbufferb12000r/min3min,上清为DnA,跑pcR 鉴定。
篇二:转基因小鼠鉴定实验转基因小鼠鉴定实验在刚出生产出的鼠仔中,属转基因小鼠者,约占全部仔小鼠的20%-30%。
因此,对转基因小鼠必须进行鉴定筛选。
1.转基因整合检测鉴定转基因小鼠最简单的方法是从小鼠尾尖提取基因组DnA,检测其基因型。
检测方法包括pcR和shouthern杂交。
(1)基因组DnA的提取:1)将离乳期小鼠(>4周龄)麻醉标记。
2)用一只手抓住小鼠,另一只手持消毒剪剪下约1cm的鼠尾。
(2)pcR检测:转基因的初始筛选通常采用pcR检测技术。
该技术操作简便、快速、费用低而有效,适合大量标本的分析。
由于该技术特别敏感,可能产生假阳性结果。
因此,在操作过程中必须特别小心,避免质粒DnA或其它标本的基因组DnA的污染。
PCR步骤
![PCR步骤](https://img.taocdn.com/s3/m/d25bcb370066f5335a81219e.png)
转基因小鼠的鉴定一,剪鼠尾1,剪鼠尾的时间当新生的小鼠年龄达到两到三周(耳朵已经长开)时剪鼠尾较好,此时鼠尾剪起来比较容易且小鼠的生命力比较强。
2,分辨小鼠的年龄a当小鼠整个身体较红且腹部无奶时,此小鼠当天出生或前一晚出生;b当小鼠腹部有奶(腹部有一小团白色物质),此小鼠出生2~3天;c当小鼠背部长出皮毛时,此小鼠出生3~4天;d当小鼠毛长全,但眼未开时,此小鼠出生10天左右;e当小鼠眼刚开,耳未开时,此小鼠出生12天左右;f当小鼠耳刚开时,此小鼠出生14天左右。
3,剪鼠尾后对小鼠的标记一般在小鼠的耳朵或指甲上做标记,如果在用剪指甲来标记的话,时间过长则不易分辨。
所以一般还是选择用左右耳朵上剪的刀数来标记,正常情况下一笼小鼠不会超过10只,依次标记为左1刀,右1刀,左2刀,右2刀,左1右1刀,左2右1刀,左1右2刀,左2右2刀,左3刀,最后一只不剪耳。
二,从鼠尾中提取DNA1,剪0.5cm的鼠尾,放入1.5ml的EP管中。
2,加入500μlSNET,其中蛋白酶K浓度是400μl/ml。
注:SNET鼠尾裂解液配方(100ml):200mM的Tris-Cl 取1M的Tris-Cl(PH8.0)2ml5mM的EDTA 取0.5M的EDTA(PH8.0)1ml400mM的NaCl 取2.34g1%(m/v)SDS 取10ml 10%SDS加水定容至100ml临用时加蛋白酶K400μg/ml,即100ml的SNET加40mg。
3,放入550C孵育过夜(最好放入摇床550C振荡过夜,也可放入550C烘箱过夜,第2天摇床550C振荡2~3个小时)。
4,消化好后,每只EP管内加入14μl 6M NaCl溶液,涡轮振荡仪上剧烈振荡30s-1min。
5,12000rpm离心10min,取上清400μl 到另一1.5mlEP管内。
注:a离心时EP管对称放置且最好开口处靠近轴部;b取“另一1.5mlEP管”时,选择盖子内部正常无多余部分,以免第6步的絮状沉淀挂在多余部分。
转基因筛选实验报告
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竭诚为您提供优质文档/双击可除转基因筛选实验报告篇一:转基因小鼠鉴定实验转基因小鼠鉴定实验在刚出生产出的鼠仔中,属转基因小鼠者,约占全部仔小鼠的20%-30%。
因此,对转基因小鼠必须进行鉴定筛选。
1.转基因整合检测鉴定转基因小鼠最简单的方法是从小鼠尾尖提取基因组DnA,检测其基因型。
检测方法包括pcR和shouthern杂交。
(1)基因组DnA的提取:1)将离乳期小鼠(>4周龄)麻醉标记。
2)用一只手抓住小鼠,另一只手持消毒剪剪下约1cm 的鼠尾。
(2)pcR检测:转基因的初始筛选通常采用pcR检测技术。
该技术操作简便、快速、费用低而有效,适合大量标本的分析。
由于该技术特别敏感,可能产生假阳性结果。
因此,在操作过程中必须特别小心,避免质粒DnA或其它标本的基因组DnA的污染。
假阳性的产生对转基因小鼠的筛选工作将是致命的。
pcR实验应采用双复管,甚至三复管。
阳性结果最好用southern杂交技术进一步证实。
(3)southernblot分析:该技术虽然没有pcR技术那样敏感,且费力费时,但是避免了因污染导致假阳性结果的麻烦,可以得到目的基因整合后的基因组、整合位点数目、转基因拷贝数等的确切信息。
southernblot的实验操作参见第一章的第八节。
2.转基因表达检测转基因整合检测是确定目的基因是否整合到了小鼠的基因组中,同时可确定整合的位点和拷贝数,这在遗传学上是十分重要的。
而转基因表达检测是确定目的基因在转基因小鼠器官组织中表达的时空分布。
其检测包括RnA分析技术和蛋白质检测技术。
篇二:转基因技术综述动物转基因技术研究进展及其应用前景孙凤俊张佳谊韩广文(北京奶牛中心北京延庆102100)摘要:转基因技术作为生命科学的前沿技术之一,已经逐渐走入了人们的生活。
转基因技术可以认为是在一定程度上通过科学技术手段让其他生物、植物朝着对人类有利方向发展的技术。
本文介绍了转基因技术及其应用研究现状,并预测了未来发展前景,阐述了该技术的利弊关系,指出只有通过正确的引导和规范管理,才能很好地利用该技术,使它为人类服务。
转基因小鼠的制备
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转基因小鼠的制备显微注射法这一方法的实验程序如下:⑴准备假孕母鼠(养母):将可育雌鼠与输精管结扎后绝育的雄鼠交配,剌激雌鼠发生一系列妊娠变化而得到假孕母鼠作为受精卵转基因后的养母;⑵受精卵的准备:可育雌鼠注射孕马血清与绒毛膜促性腺激素(hcg)促使超排卵。
处理后与可育雄鼠交配。
次日从输卵管内收集受精卵备用;⑶基因导入:用显微注射装置将目的基因溶液导入受精卵雄性原核内;⑷胚胎移植:将已转入基因的受精卵自背部植入假孕母鼠的输卵管内,使胚胎在养母体内发育成熟;⑸对幼鼠的鉴定:①幼鼠发生断乳后自尾部提取DNA,与目的基因探针作分子杂交,鉴定外源基因是否整合,有整合的鼠称为首建鼠(founder);②建立鼠系,将带有外源基因的小鼠与未经转基因的小鼠交配、传代后,后代有50%机率带有整合的基因供实验用。
也可将合适的组织进行细胞培养建立细胞系;③自小鼠内脏提取rna,与目的基因探针做分子杂交,比鉴定外源基因的表达和表达的组织特异性。
表达产物可以测定活性的,也可直接自血液或组织测定活性蛋白质,常用的方法如酶联免疫吸附试验(elisa)或放射免疫测定(ria)等。
亦可取胚胎进行分析。
显微注射法简化的实验过程如图23-2所示。
我国已有少数实验室(如中国医学科学院基础医学研究所)应用此法进行载脂蛋白tgm研究。
基因打靶与基因剔除技术ES细胞是从哺乳动物早期胚胎发育产生的内胚团(inner cell mass)中分离出来的。
它本身是二倍体,能在体外培养,具有高度的全能性,可以形成包括生殖细胞在内的所有组织,并且在不同的培养条件下表现出不同的功能状态。
这种细胞有两个特点,一是它本身可以分裂、增殖,形成细胞集落;另一特点是经过发育可以形成正常的动物后代。
因此,借用ES细胞系可将人们企望的某种不完整的、无功能基因直接引入到ES细胞中,通过细胞增殖、筛选可得到丧失了某种基因功能的动物后代。
正是由于ES细胞的研究成功与广泛应用,才使得基因打靶与基因剔除技术在转基因动物中的应用成为可能而且近来取得长足发展。
小鼠基因组DNA抽提原理、仪器试剂和操作步骤
![小鼠基因组DNA抽提原理、仪器试剂和操作步骤](https://img.taocdn.com/s3/m/de921f7bff4733687e21af45b307e87101f6f893.png)
小鼠基因组DNA抽提原理、仪器试剂和操作步骤第一篇:小鼠基因组DNA抽提原理、仪器试剂和操作步骤小鼠基因组DNA抽提原理、仪器试剂和操作步骤一、原理与意义先用细胞裂解液对已制备好的组织匀浆充分裂解,然后用蛋白酶去除其中的蛋白,再用氯仿一次抽提(无需用酚抽提)、预备液沉淀、RNase去除RNA、乙醇再沉淀即可得到完整DNA。
该方法适用于从人或动物的各种组织、血液、培养细胞、G+/G-细菌中快速抽提基因组DNA。
抽提出来的DNA能用于几乎所有的分子生物学实验,如DNA梯度分析、PCR、限制性内切酶反应、克隆、Southern Blot分析等。
二、试剂及其配制抽提试剂盒购于上海生工公司,内含以下试剂:1、TE缓冲液:PH8.0,由10 mM Tris HCl和1 mM EDTA配成。
2、RNase A(3 mg):使用前加入300 ul无菌双蒸水,煮沸10 min后使其自然冷却后使用,-20 ℃冻存。
3、Proteinase K(12 mg):使用前加入600 ul无菌水,分装成小份,-20 ℃冻存。
4、Cell Lysis Solution与Precipitation Solution:溶液出现絮状沉淀50 ℃加热溶解后使用。
5、1.2 mol/L NaCl。
冰冷乙醇和氯仿自备。
三、实验器材水浴锅、普通冰箱、1.5/2 ml离心管、移液器及枪头、紫外分光计、离心管架、剪刀、镊子、滤纸等。
四、操作步骤1、组织匀浆制备:取30 mg左右新鲜组织,加600 ul TE缓冲液,手工匀浆数次。
2、细胞裂解:吸取300 ul匀浆加600 ul Cell Lysis Solution,混匀。
3、消化蛋白:再加入9 ul Proteinase K(可适当增加)混匀,置于55 ℃水浴30 min以上(可达2.5 h),其间上下混匀几次。
4、氯仿抽提:加入600 ul氯仿(用户自备),轻柔上下混匀,不能太剧烈,以保证DNA的完整性。
Cramp转基因小鼠的构建及鉴定
![Cramp转基因小鼠的构建及鉴定](https://img.taocdn.com/s3/m/6bd54e563b3567ec102d8aaf.png)
( 国医 学科 学 院北 京 协 和 医学 院实 验 动物 研 究 所 , 京 中 北 10 2 ) 0 0 1
【 要 】 目 的 建 立 系统 性 表 达 Ca p转基 因模 型 小 鼠 , 研 究 Ca p在 衰老 中 的作 用 提供 模 型 动 物 。方 法 摘 rm 为 rm
了系 统 表 达 Ca p 基 因小 鼠 , 入 的 Ca p基 因在 骨髓 、 脏 、 脏 等 组 织 高 表 达 , 研 究 Ca p 因 在 衰 老 中 rm 转 rm 脾 肝 为 rm 基 的作 用 及 机 制提 供 了动 物 模 型 。
【 关键词 】 Ca p 转基因小鼠; rm ; 衰老 【 中图分类号】R3 一3 【 文献标识码】A 【 文章编号 】17 -8 6 2 1 )90 1 - 6 175 (0 0 0 — 20 0 4
i nt id b de i e y PCR n h x r s in lv lo h e e wa tr n d b f a d t e e p e so e e ft e g n sdeemi e y RT・ PCR n e tr lti g Re uls Cr mp a d W sen botn . s t a e DNA r n g nc v co s u c sf ly c n tu td a d Cr mp ta s e c mi e we e c e td. Th e g x r sin ln s ta s e i e trwa s c e sul o sr ce n a r n g ni c r ra e r e hih e p e so i e we e c n r d y r o f me b RT— i PCR a we tr bltig Co l so nd se n otn . ncu in Th s se c x e so Cr mp r n g ne e y tmi e prs in a ta s e i mo s wa ue s
PCR检测转基因小鼠样品处理
![PCR检测转基因小鼠样品处理](https://img.taocdn.com/s3/m/cd3fe0d53186bceb19e8bbfb.png)
PCR鉴定转基因小鼠一、试剂与仪器:(1)试剂:1、制备DNA样品:Reagents A:500mM EDTA(pH 8.0) 0.02mL in 50mL Milli-Q H2O100mM NaOH 12.5mL in 50mL Milli-Q H2OReagents B:1M Tris-HCl (pH 8.8) 2mL in 50mL Milli-Q H2ONote:1.500mM EDTA(pH 8.0): 称取18.61 g EDTA-Na2溶于80mL Milli-Q H2O中,用NaOH 粉末调节pH 至8.0,将溶液定容至100 mL(量筒即可),灭菌后4℃保存。
2.1M Tris-HCl (pH 8.8): 称取12.11 g Tris于烧杯中,加入80 mL Milli-Q H2O,加入约4.2 mL 浓盐酸调pH至8.0,将溶液定容至100 mL(量筒即可),灭菌后4℃保存。
3.100mM NaOH: 80mL Milli-Q H2O中加入0.4g NaOH,再稀释至100mL。
二、方法1 取样1.1准备数管装有100µL Reagents A的 0.5mL离心管、一个装有半杯水的140mL烧杯、卷筒纸和眼科剪刀。
1.2剪取老鼠组织(尾巴3mm左右,耳朵米粒大小,手指或脚趾一根),放入装有Reagents A的小管中,溶液没过组织。
每一次取样后需将剪刀刀口在烧杯中震荡几次清洗,然后用干净的卷筒纸擦干表面。
(老鼠出生后即可取样鉴定,这时取四肢组织要适量,取样过多老鼠容易致残;三周以上的老鼠有攻击性,取样时须戴帆布手套固定老鼠;老鼠出生一周后,其耳朵长出,手指脚趾已经分开,而且不咬人,这时取样相对合适)1.3将装有样品的小管插在浮板上,放入97℃水浴中保温1h(水浴温度不宜为100℃,否则水沸腾产生的气泡容易撞开管盖;在煮样品前注意检查样品是否被溶液没过)。
1.4震荡,将煮过的组织分散开。
小鼠基因型鉴定说明书Mouse Genotyping
![小鼠基因型鉴定说明书Mouse Genotyping](https://img.taocdn.com/s3/m/152ef7661eb91a37f1115c72.png)
One Step Mouse Genotyping Kit
PD101-01
Vazyme biotech co., ltd.
产品简介
本试剂盒包含整套的DNA粗提取以及PCR扩增体系,可用于小鼠基因型快速鉴定(Rapid Genotyping)。该试剂盒可用于从 小鼠尾巴、耳朵以及脚趾等组织快速提取基因组DNA,提取产物可直接进行PCR扩增,无需匀浆、破碎、过夜消化、酚氯 仿抽提、DNA沉淀或柱式纯化等操作,极大缩短了实验耗时。使用时,将组织浸泡在预添加了Proteinase K的裂解液中, 55oC孵育20 min再95oC加热5 min灭活Proteinase K。裂解产物经离心后可直接用做PCR扩增模板,经反复测试广泛适用于 2 kb以内目标片段扩增,并适用于4对引物以内的多重PCR反应。 试剂盒中配有2 × Taq Plus Master Mix(Dye Plus)(P212),包含高性能的Taq Plus DNA Polymerase,dNTP以及优化的缓 冲体系。PCR反应时只需加入引物和模板即可进行扩增,减少了开管/移液等操作,显著降低了样品交叉污染并且提高了检 测通量和结果的重现性。独特的保护剂使得Taq Plus Master Mix经过反复冻融后仍可保持稳定的活性。体系中预混有电泳 缓冲液和染料,可在反应结束后直接进行电泳,使用方便快捷。PCR产物的3’端带A,可克隆至T载体,并适用于 ClonExpressTM快速克隆试剂盒(C112/C113)。
应用实例
操作注意事项: - 用70%的乙醇(自备)预先清洗组织分离过程中所使用的所有工具; - Proteinase K灭活步骤(95oC,5min)必须进行,其残留活性会抑制后续PCR反应; - PCR反应体系配制过程应于冰水浴中进行,以提高扩增特异性(热启动)。
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pcr鉴定转基因小鼠原理
PCR(聚合酶链反应)是一种常用的分子生物学技术,它在转基因小鼠的鉴定和识别中起着重要的作用。
本文将介绍PCR鉴定转基因小鼠的原理和步骤。
转基因小鼠是通过将外源基因导入小鼠基因组中而得到的一种模型动物。
在转基因小鼠的研究中,需要对其进行鉴定和识别,以确认是否成功导入目标基因。
PCR鉴定是一种常用的方法,它可以快速、准确地检测出转基因小鼠中的外源基因。
PCR鉴定转基因小鼠的原理基于DNA的复制和扩增。
PCR反应需要以下三个关键组分:DNA模板、引物和聚合酶。
DNA模板是待检测的转基因小鼠的DNA样本;引物是用于引导PCR反应的两条短链DNA片段,其中一条称为前向引物,另一条称为反向引物;聚合酶是一种酶类物质,能够在一定的温度条件下,将DNA模板和引物结合,引导DNA的复制和扩增。
PCR鉴定的步骤包括三个主要的温度阶段:变性、退火和延伸。
首先,在变性阶段,将PCR反应混合液加热至94-96°C,使DNA模板的双链结构解开,得到两条单链DNA。
然后,在退火阶段,将反应体系温度降至50-65°C,使前向引物和反向引物与DNA模板的特定区域互补结合,形成引物-模板复合体。
最后,在延伸阶段,将温度升高至72°C,聚合酶开始在引物的引导下合成新的DNA链。
这一过程持续多个循环,每个循环都会在DNA的复制和扩增上产生指数
级增加。
在PCR反应结束后,可以通过凝胶电泳等方法对PCR产物进行分析。
如果转基因小鼠中存在目标基因,PCR反应将产生与目标基因特异性序列相对应的DNA片段。
通过观察PCR产物的大小和数量,可以判断转基因小鼠是否成功导入目标基因。
PCR鉴定转基因小鼠的优点是快速、准确、灵敏。
它可以在短时间内得到结果,并且对于少量的DNA样本也能进行分析。
此外,PCR 鉴定还可以进行定量分析,用于检测目标基因在转基因小鼠中的表达水平。
然而,PCR鉴定也存在一些限制和注意事项。
首先,PCR反应的选择性和特异性是关键,需要设计合适的引物以确保只扩增目标基因。
其次,PCR反应的条件和参数需要严格控制,包括温度、时间和酶的浓度等。
最后,PCR反应的结果可能受到样本质量和处理方法的影响,需要选择适当的DNA提取方法和检测技术。
PCR鉴定是一种常用的方法,可以快速、准确地鉴定转基因小鼠中的外源基因。
通过合理设计引物和严格控制反应条件,可以得到可靠的PCR结果,为转基因小鼠研究提供有力支持。
在未来的研究中,PCR技术还将不断发展和完善,为转基因研究提供更多的可能性。