T细胞受体信号转导通路的动力学分析
免疫学中的细胞信号通路
免疫学中的细胞信号通路免疫学是研究生物体如何适应内外环境变化,以保持其稳态,对抗外来侵略者的学科。
其中,细胞信号通路是免疫学中非常重要的一个方面,它涉及免疫细胞的各种信号传递,从而调节免疫反应的程度和方向。
在本文中,我们将探讨免疫学中的细胞信号通路。
1. 概述细胞信号通路是指从细胞膜到细胞核的一系列化学反应和物质转运过程。
它包括了多种信号分子和信号受体,这些分子与受体之间的结合才能激活信号通路。
在免疫学中,信号通路可以分为内源性和外源性两种。
内源性信号通路是指通过细胞内信号转导分子反应,从而改变细胞代谢、运动以及倍增等功能。
而外源性信号通路是由外部免疫刺激引发的一系列反应,导致免疫细胞的增殖和分化。
2. 细胞免疫信号通路的类型2.1 T细胞信号通路T细胞是主要的免疫细胞之一,它可以通过多种信号传导通路,如细胞内钙信号通路、PI3K信号通路、MAPK信号通路、AKT信号通路等,来完成其生物学功能。
在T细胞的激活过程中,T细胞受体(TCR)和共刺激分子(如CD28)的结合是启动信号转导通路的最重要的一步。
当T细胞受体与MHC-抗原复合物结合时,会激活酪氨酸激酶,进而激活多个信号传递通路。
2.2 B细胞信号通路B细胞能够通过免疫球蛋白(Ig)和其上的B细胞受体(BCR)来识别并结合抗原。
BCR信号通路的激活需要依赖于胞内钙、PKC、ras-MAPK等多个信号分子的参与。
当BCR与抗原结合时,会刺激B细胞受体聚集成信号复合体。
信号复合体能够通过激活线粒体呼吸链、改变胞膜的离子通道活性、增加ROS的浓度等多种机制参与BCR信号转导。
2.3 肥大细胞信号通路肥大细胞是一种重要的免疫细胞,对过敏反应和免疫反应起到至关重要的作用。
肥大细胞的信号转导通路包含PI3K、MAPK、AKT、mTOR、NF-κB等多个信号转导通路的参与。
当肥大细胞遇到抗原或IgE抗体时,会引起肥大细胞脱颗粒和所有素的释放。
这些反应的调节主要依赖于肥大细胞表面的IgE受体(FcεRI)和IgE修饰的抗原共同的参与。
T细胞受体信号转导通路的动力学分析
12 动力学建模 . 本研 究采用 系统方程 ( -ytm q ai sE 来 描述信 Ssse e ut n ) ] o
号转导的生化级联反 应过 程 。对 于含有 7个 因变 量 X X2 " / , , …, ( 其数 量随时间而变化) 优个 自变量 X , + , , 和 z… 咒+ 一般设定为某些 不变 常量) ( 的生 化级联 反应 系统 , 其动
何调控作 用 。
本研究 建立 了 T细 胞受体 信号 转导途 径 的动力 学模 型 , 通过模型仿真揭示 了 T细胞受体 信号途径各分子间 的动态调
关键词 : T细胞受体 ; 信号转导 ; 动力学模 型
T细胞特异性抗 原 或 T R/ D C C 3的细胞跨膜受体 以及膜附 近 的其它信 号分 子 的活化 , 引 起 T 并
细胞形态改变 、 胞 因子分 泌 、 细 细胞 粘附性 改变 等免 疫应 答 , 从 而调节 T细胞的增殖 、 分化 或凋亡 , 该过程涉及一 系列下游 1 1 T细胞受体信号转导途径 .
T细胞受体信 号转导途 径 ( 1 摘 自 KE 图 ) GG数据 库 ( t h— t:/ p / g nmej/ eg ) eo . p kg / 。本 研 究 根 据 相关 中 英 文 文
献 , 图中涉及 的信号 转导 相关分 子之 问 的作用 方式及 数量 对
信 号转 导和基因表达调控 。T细胞活化时信号传 递 由 T细胞
条 下游信号 途径 : 为磷脂酶 C 7 ( h sh l ae T , L 一 _I P o p oi s- 1 P @ p C 7) 1 介导 的信号途径 , 为 R s P 二 a- MA K途径 , 为共刺激 分子 三
介 导的磷 酸肌醇 激酶~ ( IK) 助信号 途径 。同时 , 3P3 辅 为保持 免疫 应答的平衡 , 避免过度 活化 , T细胞 的活化 过程还 受到抑
T细胞受体信号转导通路的动力学分析
T细胞受体信号转导通路的动力学分析刘顺会;肖兰凤;黄树林【期刊名称】《数理医药学杂志》【年(卷),期】2008(21)6【摘要】目的:建立T细胞受体信号转导途径的动力学模型,通过模型仿真揭示T细胞受体信号途径各分子间的动态调控过程,简要分析模型的动力学特性.方法:根据数据库KEGG及相关中英文文献,提取T细胞受体信号转导各条通路相关分子作用的方式及数量关系,利用Matlab7.0的Simulink工具箱构建信号途径的动力学模型并仿真.结果:模型仿真结果与文献符合得较好,能够从数量上反映T细胞受体信号转导途径中各分子问复杂的调控关系,并能通过模型仿真发现和验证该信号途径中的关键节点分子,结论:模型基本反映了T细胞受体信号转导途径的动力学特征,可以作为后续的精确定量关系研究的基础.【总页数】6页(P641-646)【作者】刘顺会;肖兰凤;黄树林【作者单位】广东药学院生命科学与生物制药学院,广州,510006;广东药学院临床医学院;广东药学院生命科学与生物制药学院,广州,510006【正文语种】中文【中图分类】R392.4【相关文献】1.基因片段扫描检测T细胞受体多样性运用于益艾康胶囊治疗艾滋病的效果观察[J], 李杰;桑锋;邓博文;岳静宇;李强;郭会军2.T细胞受体组库分析用于实体瘤的诊断和治疗:方法学和临床应用 [J], 李娜;袁佳妮;田文佳;蒙蔺;刘永煜3.T细胞受体嵌合型T细胞治疗肿瘤的研究进展 [J], 贺颖;金泽彬;李正祎;张宸豪4.T细胞受体嵌合型T细胞治疗肿瘤的研究进展 [J], 贺颖;金泽彬;李正祎;张宸豪5.免疫组库测序分析新生儿脓毒症患者外周血T细胞受体β链CDR3的多样性 [J], 黄循斌;叶淑珍;邬吉伟;符青松;刘碧华;丘惠娴;程国强因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
【推荐下载】浅谈T细胞受体基因转导及应用的研究进展
浅谈T细胞受体基因转导及应用的研究进展 【编者按】医药论文是科技论文的一种是用来进行医药科学研究和描述研究成果的论说性文章。
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浅谈T细胞受体基因转导及应用的研究进展 作者:牟艳芳张文峰邵红伟黄树林 【关键词】T细胞受体免疫治疗基因转导 近年来研究发现,针对特异性抗原的过继性免疫治疗对于包括肿瘤在内的很多疾病是一种很有潜力的治疗方法。
T细胞识别抗原的特异性主要由T细胞受体(TCR)决定的,TCR基因转导为肿瘤的过继免疫治疗提供了新途径。
通过转导某些疾病相关抗原反应性T细胞克隆的TCR基因,使人外周血淋巴细胞具有针对其相关抗原的靶向性,在疾病治疗方面取得了一定的成效。
T细胞受体(TCR)是T细胞表面能够识别和结合蛋白质抗原的特异性受体。
当机体受到肿瘤抗原刺激时,由TCR对APC呈递的靶细胞表面抗原肽?MHC复合物进行认知来识别抗原。
由抗原识别所引发的细胞毒作用或对细胞杀伤效应主要是由CD8+T细胞和NK细胞实现的,而T细胞表面的TCR和CD3分子组成的TCR复合物与肿瘤细胞的MHC?抗原肽结合,为T细胞活化提供了第一信号。
传统用于过继性免疫治疗的肿瘤抗原特异性的T细胞主要来自于TIL或病人PBMC 中分离的CTL单克隆,但是在体外培养T细胞单克隆是非常费力的工作,而且常不能达到所需要的治疗量[1]。
近年来,由于相继分离出肿瘤相关抗原和肿瘤抗原特异性TCR基因[2],这使通过转导TCR基因产生抗原特异性T细胞成为可能,也为得到有治疗价值的T细胞提供了有利的手段。
1 TCR基因的转导技术 1.1 病毒载体系统 利用病毒载体将TCR基因转导至T淋巴细胞,可以得到较高的转导效率,目前主要采用的病毒载体有逆转录病毒载体、腺病毒载体、慢病毒载体等。
目前在TCR基因转导过程中最常用的是以逆转录病毒作为载体。
逆转录病毒载体是第一个被允许用于临床的载体[3],也是广泛用于实验室研究和临床试验的载体。
T细胞中的免疫检查点受体信号通路
T细胞中的免疫检查点受体信号通路在肿瘤免疫治疗的成功推动下,对负调节淋巴细胞功能的受体的研究正在迅速发展。
人们的研究普遍集中在从功能角度表征这些免疫检查点受体,而对这些受体的信号传导机制的研究较少。
目前的研究已经证明,一些受体的细胞外部分充当激活配体的诱饵受体,而大多数情况下,其胞质尾部的酪氨酸磷酸化驱动关键的抑制信号。
这种负信号由一些关键信号转导子介导,如酪氨酸磷酸酶、肌醇磷酸酶和二酰甘油激酶,这使得它们能够抵消TCR介导的激活。
这些信号通路的特征对于开发新的免疫疗法,克服目前免疫检查点抑制剂的不足非常重要。
T细胞信号通路T细胞信号机制主要促进识别抗原呈递细胞(APC)上非自身抗原T淋巴细胞的快速扩增、分化和效应反应。
这种非比寻常的辨别能力来自激活和抑制信号的细胞内整合。
第一个激活信号由识别与主要组织相容性复合体(MHC)结合抗原的T细胞受体(TCR)传递。
激活的TCR触发信号体的组装,主要成分包括酪氨酸激酶(如Lck和Zap70)、骨架(如Lat、SLP76和Themis)以及磷脂酶Cγ1(PLC γ1),另外也包括酪氨酸磷酸酶和E3泛素连接酶,如SHP1如Cbl。
T细胞第二个激活信号由CD28等共刺激受体提供。
CD28增强TCR驱动的酪氨酸磷酸化,并与磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)和Grb2募集一起作用,分别触发Akt-mTor和Ras-MAPK途径。
淋巴细胞功能最具特征的负性调节受体是PD-1和CTLA-4,它们代表了T细胞抑制性受体的范例。
两者均持续抑制TCR诱导的细胞因子分泌和增殖,以及对葡萄糖的摄取和代谢。
这些抑制性受体的细胞质尾部带有基于酪氨酸的抑制基序(ITIM),具有共同的序列特征:(S/I/V/L)xYxx(I/V/L);以及基于酪氨酸的开关基序(ITSM),它们具有共同的序列特征:TxYxx(V/I)。
当受体被激活后,两个基序都被Src家族激酶(SFK)磷酸化,并在调节免疫系统中发挥重要作用。
免疫学中的T细胞识别和信号转导
免疫学中的T细胞识别和信号转导T细胞是身体免疫系统中的一种重要组成部分,其主要工作是在感染和肿瘤细胞等异质性细胞出现时,通过识别这些细胞表面的抗原,启动免疫应答机制,从而清除有害细胞。
而T细胞的识别和信号转导机制则是T细胞发挥作用的基础和保证,本文将从T细胞识别和T细胞信号转导两个方面来探讨免疫学中T细胞识别和信号转导的基本原理和相关研究进展。
一、T细胞识别机制T细胞识别机制是T细胞进行免疫应答的关键步骤之一,T细胞表面特异性受体(T细胞受体,TCR)通过识别抗原肽与主要组织相容性复合物(MHC分子)上形成的抗原复合物,来识别感染性病原体或肿瘤细胞表面的抗原物质。
其中,MHC分子通过在细胞表面展示特定的抗原肽来介导细胞免疫应答,而TCR则是识别MHC-抗原肽复合物的关键分子。
因此,T细胞识别能力的准确性和特异性依赖于MHC分子和TCR之间的精确结合,这一过程涉及到多种生物分子间的相互作用和信号传递过程。
TCR是一种膜绑定的异二聚体分子,由两个不等链组成,其中的α和β链充当了识别MHC-抗原肽复合物的关键棒形区域。
当TCR识别到与MHC-抗原肽复合物匹配的表位时,就会发生一系列的生物化学反应,最终激活T细胞并启动免疫应答。
最初TCR接触到MHC-抗原肽复合物并发生结合是通过三种基本模型来发生的:外层区分子接近模型,内层区分子接近模型和混合模型。
这些模型在复杂的分子动力学和结构方面仍然存在争议,但大多数实验数据中TCR和MHC-抗原肽复合物之间的结合会发生比较强的变形和移动,导致不同位点之间的相互作用表现出时变性质。
二、T细胞信号转导机制如何在识别到外来抗原后,将T细胞激活并启动免疫应答呢?这就需要T细胞信号传导系统的协助,同样是T细胞发挥作用的必要基础和保证。
T细胞信号转导通常可分为初始信号和扩增信号两个阶段,初始信号是指TCR与配体结合后特异性激活T细胞所输入的初始信号,扩增信号则是在细胞内进行的信号放大和转导过程。
普遍存在的免疫细胞分子信号转导路径
普遍存在的免疫细胞分子信号转导路径免疫系统是机体最重要的防御系统之一,依赖于免疫细胞对外来微生物和病原体的识别和消灭。
而这种认知、响应机制都需要免疫细胞内部复杂的分子信号转导通路的相互配合与串联。
以下将介绍几类免疫细胞特定信号转导通路及其在疾病发生中的作用。
T细胞信号转导通路T细胞是人体中一类至关重要的细胞,它们通过识别和消灭外来抗原帮助人体免疫系统有效应对外来侵袭。
而T细胞的识别过程则完全依赖于其表面受体上的信号转导通路。
此外,T细胞的分化、增殖、生死等过程都需要依赖特定的信号传递通路。
T细胞中最重要的信号传递通路如下:1)T细胞受体信号转导通路。
T细胞表面的受体是一种跨膜蛋白,当这种受体与一种抗原结合时,会激活该细胞内部的 T细胞受体信号转导通路。
在这个过程中,受体上的多种酶和附属蛋白会依次激活,引发钙离子浓度升高、蛋白酪氨酸磷酸化、活性氧产生等一系列细胞生化反应,从而使T细胞能够分化、增殖并杀死目标细胞。
T细胞信号转导的紊乱或错误会导致多种自身免疫疾病(例如风湿、狼疮等)的发生。
2)CD28-B7信号转导通路。
T细胞受体激活后,还有一个CD28-B7信号转导通路需要被激活。
这个通路是互相促进的,CD28激活能够使T细胞更有效地分化、增殖并产生细胞因子。
但在某些疾病(如移植排异)中,需要逆转这种通路以避免病情进一步恶化。
3)多种信号转导通路的串联。
除了T细胞受体和CD28-B7两个常见通路外,T细胞功能发挥还涉及其他多个信号传递通路,如NF-κB、MAPK、PI3K等等,在疾病治疗中对各种通路的阻断和激活是一项重要的研究领域。
巨噬细胞信号转导通路巨噬细胞是体内主要的吞噬细胞之一。
当巨噬细胞受到刺激时,会激活一系列信号转导通路,驱动许多生物学过程。
以下是其中最常见的几种:1)Toll样受体-IRF7信号转导通路。
Toll样受体(TLR)是一类识别外来抗原的膜受体,当它们受到激活后就能引导巨噬细胞启动一系列的信号传递通路。
免疫细胞中的受体与信号转导
免疫细胞中的受体与信号转导免疫系统是由各种复杂的机制组成,可以让我们的身体免受各种病毒、细菌、寄生虫和真菌入侵。
其中的免疫细胞充当着一个重要的角色,它们通过很多种不同的受体来识别外来病原体,并通过信号转导机制来抑制或激活各种免疫响应。
这篇文章将阐述免疫细胞中的受体与信号转导机制。
1. 免疫细胞与免疫受体免疫细胞存在于人体的各个组织和器官中,包括骨髓、胸腺、脾脏、淋巴结、血液及组织中的巨噬细胞、树突状细胞、B和T 淋巴细胞等等。
每个免疫细胞都有一组免疫受体,可以通过这些受体来监控和响应外界刺激。
其中最主要的受体包括T细胞受体和B细胞受体,它们都是通过识别抗原来触发免疫反应的。
2. T细胞受体和信号转导T细胞受体(TCR)是一种与主要组织相容性复合体(MHC)结合的受体,可以识别由MHC呈递的抗原多肽。
当TCR与抗原相结合时,它会与另一种受体CD3结合形成复合物,从而激活T细胞内的信号转导通路。
信号转导通路通过激活一系列的酶、蛋白质、离子通道和转录因子,从而调控T细胞的生长和分化。
一些关键的细胞因子,如白细胞介素-2(IL-2)、IL-4和IL-10等,也会通过这些信号途径转导到细胞内,进一步控制T细胞的响应和活力。
3. B细胞受体和信号转导B细胞受体(BCR)是一种跨膜抗体,可以通过它来识别并结合外来抗原。
由于抗原的多样性很大,每个B细胞只能表达一种种类的BCR,从而使得整个免疫系统具有相当的特异性。
相比于T细胞受体,BCR的信号转导机制更加复杂。
当BCR与抗原结合时,它会触发多种不同的信号途径和细胞因子的表达,从而促进或抑制B细胞的生长和分化。
其中一些信号途径包括磷酸化酶C(PKC)和成熟细胞活化因子(NF-κB)等。
4. 受体多样性与免疫应答免疫系统中的抗原和受体之间的相互作用非常复杂,涉及到各种不同的受体和信号转导通路。
受体的多样性也是免疫系统能够灵活应对各种病原体挑战的重要原因之一。
由于抗原的多样性和变异性,每个抗原都需要特异的受体来触发免疫反应。
免疫细胞信号转导途径的研究进展
免疫细胞信号转导途径的研究进展在机体与外界环境发生交互的过程中,免疫细胞的信号转导途径在保证机体正常运转方面起到了至关重要的作用。
这些信号转导途径是免疫系统的中枢机制,在免疫应答中调节免疫细胞的活动,是研究免疫学的热点领域。
本文将介绍免疫细胞信号转导途径的研究进展。
1. 免疫细胞信号转导途径的类型免疫细胞信号转导途径是指在外界刺激下,免疫细胞内部的一系列信号传递的过程。
这些信号传递的途径方式有多种,主要包括:1)磷酸化途径:免疫细胞通过磷酸化酶酶促反应,将蛋白质途径特定氨基酸进行磷酸化而发挥调节作用。
2)MAPK途径:是调节细胞生长、分化、凋亡和炎症反应的信号途径。
3)JAK/STAT途径:是介导细胞对细胞因子和生长因子等信号的响应和传递过程。
4)NF-κB途径:是介导免疫应答、炎症反应和细胞凋亡的信号通路。
2. 免疫细胞信号转导途径的调控分子免疫细胞信号转导途径需要依托于信号转导的调控分子,其中最主要的就是细胞的受体和下游的途径关键组分。
1)免疫受体:包括T细胞受体、针对抗原的B细胞受体、Toll样受体、NOD 样受体以及其他类型的受体。
免疫受体是免疫细胞感知外界刺激的关键部分。
2)途径调控分子:包括交感神经系统、细胞内激活后的酪氨酸激酶(Tyr)、丝裂原激酶(Ser/Thr)、G蛋白耦合受体以及其他信号转导路径的分子调控。
这些分子可以根据具体的需求,调节免疫细胞内的信号转导途径。
3. 在过去的几十年里,随着分子生物学、信号转导、免疫学、细胞生物学等领域的发展和技术的进步,免疫细胞信号转导途径的研究也取得了重大进展。
1)T细胞受体信号转导途径:T细胞受体信号转导途径是T细胞启动和扩增免疫应答的基础。
通过对T细胞受体的研究,科学家们发现,这个信号转导途径的活化过程是复杂和精细的,在活化过程中,DAGL、IP3R、PLCγ1、VAV1、Samm50等多个分子扮演了重要角色。
2)NF-κB途径:NF-κB途径调控着包括免疫应答、细胞凋亡、炎性反应在内的多种生理和病理过程。
免疫系统中的T细胞信号转导
免疫系统中的T细胞信号转导人类身体内的免疫系统是一个非常复杂的系统,由各种类型的细胞和分子组成。
其中一个关键组成部分是T细胞,它们具有识别病原体和异己物质的能力,并进行攻击和杀死它们的能力。
当我们感染细菌、病毒或其他外来物质时,我们的T细胞会被激活,从而协助我们的身体进行自我保护。
T细胞的激活是通过信号转导途径进行的。
T细胞的激活途径中,信号转导是必须的。
当T细胞接收到刺激,比如细菌感染,它们会释放细胞因子来提醒其他细胞,同时激活信号传递途径来增强免疫反应的效率。
信号转导主要包括了在T细胞增殖和发育中所涉及的多个步骤,包括:促进T细胞活化与增殖、目标基因的表达、细胞分化以及调节T细胞消毒作用的质量和数量等。
与免疫功能相关的很多基因调控和信号转导途径的功能在较为紧密的联系内。
T细胞中最重要的信号转导途径之一是T细胞受体信号转导途径。
这条路途关键的是起始位点,即T细胞受体(TCR)。
T细胞受体提供了T细胞活化所需的信息。
一旦它被识别,则会引发一连串的事件,如会激活酪氨酸和丝氨酸/苏氨酸的磷酸化级联反应,来调节T细胞的功能。
比如,T细胞受体靶向CD4分子与MHC-II分子的复合物,CD3链接触到α/β和ζ链的ITAM序列,可通过PI3K/Akt通路、NF-κB通路、ERK1/2通路等信号转导途径,来调控PD-L1表达。
一旦T细胞被激活,其他信号转导途径也开始参与其中,以确保T细胞的生存和生长。
一个例子是G蛋白偶联受体信号转导途径,或称GPCR信号途径。
G蛋白偶联受体(GPCR)是细胞表面的七跨膜蛋白,它们与多种类型的外源性物质及内源性信号分子结合,可切换几种类型的Gs、Gi和Gq/G11蛋白,进而启动相应的信号通路来调节T细胞对外来刺激的响应。
除了T细胞受体和GPCR信号转导途径外,还有其他信号转导途径对T细胞的功能具有重要作用。
其中最常见的是Jak/STAT途径。
这条途径在T细胞中主要是调节促炎症因子的反应,但也可以调节T细胞的发育和分化。
免疫系统的新视角——T细胞信号通路的调控
免疫系统的新视角——T细胞信号通路的调控免疫系统是人体重要的防御系统之一,它能够识别和排除入侵体内的病原微生物和癌细胞。
其中,T细胞是免疫系统中的核心细胞之一,扮演着重要的免疫调节角色。
T细胞信号通路的调控对于维持免疫系统平衡至关重要,在疾病预防、治疗和药物研发等领域具有重要意义。
T细胞信号通路的基本原理T细胞受到外界刺激后,通过膜受体与胞内信号分子相互作用,引发一系列的信号传导通路,从而使T细胞发生不同的生物学效应。
其中,抗原识别是T细胞信号通路的起点,由T细胞受体(T cell receptor, TCR)和CD4/CD8共受体形成复合物,与特定抗原分子结合,使T细胞产生特异性免疫响应。
随后,复合物上的发动机被所谓的共刺激分子结合,促进T细胞正常分化和功能的表达。
T细胞信号通路的调控机制T细胞信号通路调控机制多样,包括基因表达、蛋白质修饰、细胞信号通路及代谢调控等方面。
其中,细胞信号通路和蛋白质修饰是目前研究的热点和难点。
细胞信号通路是T细胞信号传导的最终展现形式,其复杂性和多样性也使其成为研究的难点之一。
T细胞的信号传导路径包括T 细胞受体信号传导通路、共刺激通路、钙信号途径和转录因子通路等,每个通路都包括多个信号分子和受体的相互作用。
另一方面,蛋白质修饰也是T细胞信号通路调控的主要机制之一。
蛋白质磷酸化、甲基化、泛素化和糖基化是T细胞信号传导过程中的典型修饰方式。
最近的研究表明,磷酸化和泛素化是T 细胞信号转导通路中最重要的修饰方式之一。
磷酸化可以改变受体的构象和活性,决定受体所处的细胞命运,而泛素化则是调节细胞信号传导的另一种重要机制。
免疫调节与疾病T细胞信号通路调控的紊乱与许多人类疾病相关。
T细胞极性失调、易激综合征和过敏性疾病是典型的T细胞免疫调节障碍。
除此之外,在自身免疫病、感染性疾病和肿瘤等多种疾病过程中,T细胞信号传导和调控机制也扮演着重要角色。
自身免疫疾病由于机体免疫系统失控,对自身组织过度攻击而导致的疾病。
白细胞介素通路和T细胞受体信号转导的调控机制
白细胞介素通路和T细胞受体信号转导的调控机制白细胞介素(IL)通路和T细胞受体(TCR)信号转导对于细胞的活动至关重要。
这两个信号通路主要调节着免疫系统的正常功能,而其异常恶化则会引起多种疾病。
在本文中,我们将探讨这两个信号通路的基本机制和调控方法。
白细胞介素通路IL是一组细胞因子,由许多不同类型的细胞产生。
它们在身体中扮演了多种生理和病理作用。
IL通路是免疫细胞与外部环境之间的桥梁,其能够刺激不同种类的白细胞,并调节抗病毒、抗细菌和抗肿瘤的反应。
IL通路的信号传导主要通过JAK-STAT通路实现。
当IL的受体结合对应的配体时,受体的跨膜区域会激活细胞内JAK蛋白激酶。
这两种酶会相互激活并进行磷酸化,导致STAT蛋白激活。
激活的STAT蛋白会被磷酸化,并迁移到细胞核内,转录相关基因,从而调节细胞增殖、分化和功能。
尽管JAK-STAT是IL通路的主要信号传导机制,但该通路的许多组分也可以通过与其他信号通路的交互作用来增强其效果。
如NF-κB和MAPKs等多种信号通路都与IL通路产生交互作用。
T细胞受体信号转导TCR是T细胞所表达的特异性抗原受体,它通过识别单一特异性的抗原与抗原呈递细胞表面的唯一受体MHC相结合,激活T细胞并诱导T细胞的分化和增殖。
这种受体激活的过程,需要复杂的信号转导通路来帮助递送信息和调节反应。
TCR信号传导主要通过酪氨酸激酶来实现。
当TCR受体与特异性抗原结合时,受体跨膜区域的ITAM序列会被泛素化,从而招募并激活Lck和Zap70这两种酪氨酸激酶。
Lck激活后磷酸化Zap70,从而引起多种下游信号传导途径的激活。
TCR通过多种信号分子,例如LAT、Sos和Vav等,调节了许多关键分子,如PLCγ、Ras、Raf、ERK、JNK和TXNIP等的活化。
这些分子的呈现和功能被认为是TCR信号传导中发挥重要作用的基础。
调控机制IL和TCR信号传导在正常细胞和许多疾病中发挥着关键作用,因此它们的调控机制异常会在不同疾病中引起显著的影响。
免疫细胞信号转导通路调控机制的探究
免疫细胞信号转导通路调控机制的探究免疫系统对于保护人体免受外界病原体侵害具有重要作用。
其中,免疫细胞在这个过程中扮演着重要的角色。
免疫细胞通过一系列信号转导通路的调节来完成免疫功能的发挥。
本文将从免疫细胞信号转导通路调控机制的角度进行探究。
一、免疫细胞信号转导通路简介免疫细胞信号转导通路是指一系列蛋白质相互作用所构成的信号传递网络,其主要作用是将外部信号转化为细胞内分子信号,并将其传递到细胞核中的基因进行转录和翻译。
免疫细胞信号转导通路的正常调节对于免疫系统的正常功能发挥非常重要。
目前,已经发现了多种免疫细胞信号转导通路,包括细胞因子介导的JAK/STAT信号通路、T细胞抗原受体(TCR)介导的T细胞信号转导通路、B细胞受体(BCR)介导的B细胞信号转导通路等。
二、信号转导通路的调控机制1.蛋白激酶蛋白激酶作为信号转导的重要调控分子,在免疫细胞信号转导通路中起着至关重要的作用。
目前已经发现的蛋白激酶包括丝裂原激活蛋白激酶(MAPK)家族、AKT蛋白激酶等。
丝裂原激活蛋白激酶(MAPK)家族是一个重要的信号转导分子家族,包括ERK1/2、JNK和p38等成员。
它们通过不同的信号途径被激活,并参与了多种生物学功能的调控,包括炎症反应、细胞增殖、细胞迁移等。
AKT蛋白激酶也是一种重要的信号转导分子,参与了多种生物学过程的调控,如细胞周期控制、细胞增殖、细胞凋亡抑制等。
2.激酶活性调节免疫细胞信号转导通路的调节涉及到多种分子机制。
以T细胞信号转导通路为例,T细胞受体萎缩酶(SHP-1)通过调节抗原识别和T细胞活化信号的平衡来影响T细胞的免疫应答。
SHP-1在T细胞信号转导通路中被认为是一个负调节子,可以通过抑制TCR复合物和共刺激分子的磷酸化来降低T细胞的活性。
CDC25c蛋白则是一个正调节因子,在细胞周期和DNA损伤修复等方面发挥作用。
CDC25c调控细胞周期的进程,可以通过促进细胞周期检查点的解除,从而导致细胞进入有丝分裂周期。
T细胞受体和核受体的作用机制和信号转导通路
T细胞受体和核受体的作用机制和信号转导通路T细胞受体和核受体是两类重要的膜受体,在细胞内扮演着不同的角色。
T细胞受体主要参与T细胞免疫应答,而核受体则是暴露于胞质或细胞核内的受体,可作为细胞活性的主要调节器。
这篇文章将探讨T细胞受体和核受体的作用机制及其信号转导通路。
一、T细胞受体的作用机制T细胞受体(T cell receptor, TCR)是T细胞在膜上表达的一种高度特异的膜受体。
它由α和β或γ和δ两个多肽链组成,其中α和β链的复合体占绝大多数。
这两个多肽链都带有变异的外在区域(即TCR的抗原结合部分),它可以识别在胞内或胞外的具体抗原,从而介导T细胞的免疫应答。
在T细胞被抗原激活后,TCR会与MHC分子(主要组织相容性复合体)上的抗原结合。
这种与抗原结合的TCR-MHC互作将在膜上激活T细胞,从而将T细胞激活的信号传导到细胞内。
这个过程是通过TCR的CD3链介导的。
CD3质量最高,县重要的是:是T细胞受体信号转导的核心分子。
当TCR与抗原结合时,CD3链的六个亚基之一(δ、ε、γ、ζ、η和ξ)将聚集成一个信号转导复合体,将外部的免疫信号转导到胞内。
此时,激活的T细胞可以被分化成⬆️/⬆️增殖,细胞因子产生,杀伤肿瘤或感染的细胞。
二、核受体的作用机制核受体(nuclear receptor, NR)是广泛存在于动物细胞中的一类转录因子。
它们最突出的特征是包含一个核心DNA结合结构域(DBD),使其能够结合到靶基因的特定核酸元件(核受体反应元件)。
核受体的功能存在于两种不同的位置:胞质和细胞核。
有些核受体存在于胞质中,由于不具有核定位信号,而调控位于胞质中的靶基因。
这些核受体仍然具有DNA结合结构,以及能够结合小分子化合物的配体结构域。
典型的示例是胆固醇受体。
在胞质中,胆固醇将与胆固醇受体结合,从而促进荷尔蒙合成和代谢通路的启动。
当胆固醇受体被激活时,它会从细胞质中转移到细胞核,以影响胆固醇的细胞代谢。
免疫应答的细胞信号转导通路
免疫应答的细胞信号转导通路免疫应答是机体的重要保护机制之一,它涉及细胞信号转导通路的复杂过程。
细胞信号转导通路从外部信号到内部物质的影响,涉及多种信号通路和分子。
本文将介绍与免疫应答相关的细胞信号转导通路,包括T细胞受体、B细胞受体、Toll样受体、细胞因子受体等。
1. T细胞受体信号通路T细胞受体是T细胞表面上的一种重要受体,它在免疫应答中扮演着重要的角色。
T细胞受体的激活将启动细胞信号转导通路,从而引发T细胞的免疫应答。
T细胞受体信号通路主要包括四个步骤:酪氨酸激酶(Lck)的激活、ζ链的磷酸化、耦联受体PCKζ的磷酸化和后继的信号转导。
其中,Lck的激活是通过CD4和CD8的协同作用来实现的。
2. B细胞受体信号通路B细胞受体是B淋巴细胞上的重要受体,它能够识别特定的抗原,并启动相应的免疫应答。
B细胞受体的激活将启动细胞信号转导通路,从而引发B细胞的免疫应答。
B细胞受体信号通路主要包括四个步骤:B细胞受体抗原内化、蛋白酪氨酸激酶的激活、血小板衍生生长因子β的激活、后继的信号转导。
其中,蛋白酪氨酸激酶的激活是由CD19、CD21和CD81三种协同作用来实现的。
3. Toll样受体信号通路Toll样受体是一类免疫系统中的重要受体,它能够识别细菌、病毒等外来入侵物质,并启动相应的免疫应答。
Toll样受体的激活将启动细胞信号转导通路,从而引发免疫应答。
Toll样受体信号通路主要包括四个步骤:Toll样受体联合配体的结合、介导TRAF6的招募、启动下游信号转导、后继的信号转导。
其中,介导TRAF6的招募是通过MyD88、IRAK和TRAF6三种协同作用来实现的。
4. 细胞因子受体信号通路细胞因子是细胞间的一类重要信号传递分子,它们通过细胞因子受体在细胞表面上识别特定的信号,并启动相应的细胞信号转导通路。
细胞因子受体信号通路主要包括四个步骤:细胞因子与受体的结合、启动下游信号转导、后继的信号转导。
其中,启动下游信号转导的过程中,JAK家族的激酶和STAT家族的转录因子是非常重要的分子。
人类T细胞免疫的基因转录调控和信号传导途径
人类T细胞免疫的基因转录调控和信号传导
途径
介绍
T细胞是免疫系统的重要组成部分,其具有识别和清除身体内异物的能力。
然而,这种能力需要T细胞内部的复杂机制对其进行调控和协同作用。
T细胞免疫的
基因转录调控和信号传导途径,在这一过程中起着至关重要的作用。
本文将就此展开探讨。
基因转录调控
T细胞免疫的基因转录调控可以分为两个主要过程,即激活态和耐受态。
在激
活态中,T细胞受到外部信号的刺激,从而体内的一部分DNA序列被转录成为mRNA分子,并通过翻译作用编码蛋白质。
这些蛋白质将参与到T细胞免疫反应
的各个方面,并在一段时间后逐渐消失。
而在耐受态中,T细胞经历了一系列的生化过程,从而导致其对某些外部刺激
错失反应能力。
这一状态的产生主要归因于T细胞维持HOMEOSTASIS的机制,
其保持了免疫系统的稳定状态。
信号传导途径
T细胞的免疫功能要依赖于其内部的信号传导途径。
当T细胞受到外部刺激时,其表面的T细胞受体(TCR)将与刺激源中的肽类配体结合,从而引发一连串的
反应机制。
这包括了多子集的信号转导和配体激活的机制,其中包括蛋白质磷酸化作用、蛋白质融合/分离以及信号能量的调控等等。
总结
T细胞的免疫功能和人体的整体健康息息相关。
在这一过程中,基因转录调控和信号传导途径的重要性不可忽视。
这不仅使得T细胞在面对外部刺激时可以做出及时和准确的反应,而且还可以通过耐受的机制保持身体免疫系统的稳定状态。
在未来,我们可以期待这种机制的进一步研究和探索能够为人类提供更好的健康保障。
免疫反应中的T细胞和B细胞信号转导网络分析
免疫反应中的T细胞和B细胞信号转导网络分析随着分子生物学、生物化学和生物信息学等学科的快速发展,深入研究不同信号通路在细胞免疫反应中的作用和机制,对于理解生命活动的本质和发掘相关疾病的治疗靶点具有重要的意义。
其中T细胞和B细胞信号转导网络是细胞免疫反应过程中的重要部分。
T细胞信号转导网络T细胞信号转导是指T细胞感受外界刺激,通过细胞内部信号传递网络引起细胞内部酶学和代谢变化的过程。
T细胞的信号转导网络主要包括T细胞受体(TCR)信号转导、辅助信号(CD28等)转导、共刺激分子和整合分子等相关信号通路。
其中,TCR信号转导是最核心的信号通路,主要包括TCR-MHC-peptide的杀伤信号和TCR-CD4/CD8的辅助信号。
通过细胞生物学和生物化学实验,目前已经发现了很多T细胞信号转导相关的蛋白质和分子,例如酪氨酸激酶、丝氨酸/苏氨酸激酶、细胞核转录因子NF-ATc1等。
研究表明,T细胞信号转导网络可以通过不同通路的互补作用,调节T细胞的活化、增殖和分化等生物学效应。
B细胞信号转导网络与T细胞信号转导网络类似,B细胞信号转导是指外界刺激信号通过细胞内部信号传递网络引起细胞内部酶学和代谢变化的过程。
B细胞的信号转导网络主要包括BCR(B细胞抗原受体)信号转导和辅助信号(CD19、CD21等)转导等。
BCR信号转导是B细胞信号转导网络的核心部分,主要包括B细胞抗原结合、BCR内部信号传递和BCR外部信号传递等多个环节。
其中B细胞抗原结合可引起单独或多聚B细胞抗原受体的聚合和固定,从而促进内部纤维网连接、酶反应和小键酶激活。
通过细胞生物学和生物化学实验,已经发现了许多B细胞信号转导相关的蛋白质和分子,例如蛋白激酶syk、石鲷酰化酶(PI3K)和Ras等。
研究表明,B细胞信号转导网络可以通过不同通路的互补作用,调节B细胞的活化、增殖和分化等生物学效应。
T细胞和B细胞信号转导网络交叉互通在实践中,T细胞和B细胞信号转导网络并非隔离的信号系统,而是存在交叉互通的现象。
免疫细胞的信号转导通路的研究进展
免疫细胞的信号转导通路的研究进展近年来,随着对免疫细胞的研究不断深入,人们对于免疫细胞内部信号转导通路的认识也不断增加。
免疫细胞的信号转导通路是细胞与环境交互作用的重要途径,通过这一通路,细胞能够感知到外部信号,从而调节自身的生理和病理状态。
因此,免疫细胞的信号转导通路已成为对于免疫疾病和肿瘤治疗的重要研究方向。
一、T细胞受体信号转导通路在T细胞受体(TCR)信号转导通路中,TCR与MHC重链复合物及内源性肽段结合后,产生许多信号分子的激活作用,如ζ链、Lck、Fyn、ZAP-70等,逐渐启动大范围的信号级联反应。
其中,ζ链是TCR复合物中的一种信号媒介,可以通过与具有免疫受体酪氨酸活化基序(ITAMs)的TCR共同参与T细胞的激活过程。
另外,Lck和Fyn则是因袭激酶,它们与ITAMs直接结合,激活(但不限于)ZAP-70,并参与整个信号转导过程。
目前,对于TCR信号转导的研究还比较深入,但是还有很多问题需要进一步研究。
二、B细胞受体信号转导通路B细胞受体(BCR)是一种高度特异性的蛋白质分子,可以识别抗原,并启动B细胞的活化。
BCR受体的信号转导通路是由分化抗原识别结构与肽片段的加工、结合MHC2分子等步骤所构成的。
BCR受体与抗原结合后,引起细胞膜上亚单位的聚集和信号酶的激活,并导致一系列后续反应。
这些反应包括,磷酸化、酰化和氧化还原等,最终调控RAS/MAPK、PI3K/AKT、JNK等多种途径的激活,控制B细胞进一步的生长和分化。
在BCR信号通路中,CD19是一个重要的信号转导分子,它能与BCR受体结合,通过下调磷酸肌醇3-激酶(PI3K)并激活RAS/MAPK通路等途径,调节B细胞的增殖、存活和分化。
三、趋化因子受体信号转导通路趋化因子是一类能够自发引导细胞移动和聚集的多肽分子,对于细胞的免疫应答和病理过程具有非常重要的影响。
趋化因子受体主要有G蛋白耦联受体(GPCR)和整合素家族受体(integrin family receptor)两种,都可以为基于细胞膜的信号转导机制提供关键的功能支持。
T细胞表面受体信号转导及辅助受体功能的研究的开题报告
T细胞表面受体信号转导及辅助受体功能的研究的开
题报告
一、研究背景
T细胞是机体免疫系统中最为重要的免疫细胞之一,其可以识别并
攻击入侵机体内的病原微生物。
T细胞的功能与其表面受体信号转导和辅助受体功能密切相关。
T细胞表面的受体包括T细胞受体(TCR)及其与抗原肽相结合的MHC分子以及多种辅助受体,如CD28、ICOS、OX40等。
这些受体通过信号转导途径,调节T细胞的增殖、分化、杀伤等功能,从而影响机体的免疫应答。
二、研究目的
本文旨在探究T细胞表面受体信号转导及辅助受体功能对机体免疫
应答的影响,为深入理解机体免疫调控机制提供理论基础。
三、研究方法
首先,本文将采用文献回顾法,对T细胞表面受体及其信号转导途
径进行梳理,并探讨其与免疫应答的关系。
其次,通过实验室技术手段,如细胞培养、ELISA、Western blot等,分析T细胞辅助受体CD28、ICOS、OX40等对T细胞功能的调节作用。
四、研究意义
T细胞表面受体及其辅助受体功能的研究,有助于深入了解机体的
免疫调控机制,并为免疫相关疾病的治疗和预防提供理论和实验依据。
此外,本研究还有望为基于免疫的肿瘤治疗策略的开发提供参考。
T细胞信号转导
T细胞在激活过程中的信号转导张括川生物技术2012012413[摘要] T细胞是构成机体细胞免疫反应的中心环节,而T细胞的激活、增殖、分化及凋亡均与细胞内引发的一系列信号通路直接相关。
本文就T细胞在激活过程中所涉及的主要细胞信号转导进行阐述。
[关键词] T细胞;信号转导;激活过程The Signal Transduction During The Activation ofT cell[Abstract]T cell is the core of body immune reaction, and the activation, proliferation, differentiation and apoptosis of T cell are all directly relevant to a series of signal transduction pathways.In this review, we summarize the pathways relevant to the activation directly.[key words]T cell; signal transduction; activation在免疫系统中淋巴细胞是最为重要的组成部分,由于其活化过程中分子基础和信号转导(signal transduction)过程极为复杂,一直以来都是科学家们研究的热点,本文将近年研究较为清晰的机理作简单阐述。
T细胞通过其表面的T细胞受体(TCR)识别由抗原提呈细胞(antigen presentation cell, APC)提供的抗原,经多种分子如蛋白激酶、衔接蛋白(LAT)或者受体间的相互作用等,激活T细胞若干信号途径,在各个途径中级联(cascade)反应分别发挥效力,激活并诱导T细胞的增殖和分化,从而参与到免疫反应当中。
1 T细胞激活的一般途径目前一般认为T细胞激活的途径主要有三种:磷脂酰肌醇(phosphatidylimositol)代谢途径、蛋白酪酸激酶途径以及T细胞活化旁路途径。
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收稿日期:200807 01 作者简介:刘顺会(1971 ),男,湖北荆州市人,博士,主要从事生物信息学研究。
基金项目:国家自然科学基金(30572124)、广东省科技厅(2004B31201001)、教育部科学技术研究重点项目(205116)、广东省自然科学基金(5002855)联合资助。
*广东药学院临床医学院文章编号:1004 4337(2008)06 0641 06 中图分类号:R392 4 文献标识码:A医学数学模型探讨T 细胞受体信号转导通路的动力学分析刘顺会 肖兰凤*黄树林(广东药学院生命科学与生物制药学院 广州510006)摘 要: 目的:建立T 细胞受体信号转导途径的动力学模型,通过模型仿真揭示T 细胞受体信号途径各分子间的动态调控过程,简要分析模型的动力学特性。
方法:根据数据库KEGG 及相关中英文文献,提取T 细胞受体信号转导各条通路相关分子作用的方式及数量关系,利用M atlab 7.0的S imulin k 工具箱构建信号途径的动力学模型并仿真。
结果:模型仿真结果与文献符合得较好,能够从数量上反映T 细胞受体信号转导途径中各分子间复杂的调控关系,并能通过模型仿真发现和验证该信号途径中的关键节点分子。
结论:模型基本反映了T 细胞受体信号转导途径的动力学特征,可以作为后续的精确定量关系研究的基础。
关键词: T 细胞受体; 信号转导; 动力学模型T 细胞特异性抗原或T CR/CD3的特异性抗体可引起T 细胞跨膜受体以及膜附近的其它信号分子的活化,并引起T 细胞形态改变、细胞因子分泌、细胞粘附性改变等免疫应答,从而调节T 细胞的增殖、分化或凋亡,该过程涉及一系列下游信号转导和基因表达调控。
T 细胞活化时信号传递由T 细胞表面抗原识别受体(T cell receptor ,T CR)介导,外来信号经受体及相关蛋白传递给胞内的蛋白酪氨酸激酶,此后启动三条下游信号途径:一为磷脂酶C 1(Phospholipase C 1,PL C 1)介导的信号途径,二为Ras M A PK 途径,三为共刺激分子介导的磷酸肌醇激酶 3(PI3K)辅助信号途径。
同时,为保持免疫应答的平衡,避免过度活化,T 细胞的活化过程还受到抑制性信号通路的调节,这些通路彼此交织,构成一个十分复杂的T 细胞活化调控网络[1]。
随着各种复杂的信号转导网络中各个分子通道的确定,如何从系统水平上定量地分析各信号转导网络的动态特征就成为当前系统生物学的研究重点。
除各种并行、高通量的实验技术外,数学建模和仿真是另外一种研究复杂生化网络的强有力手段,比如在细胞代谢研究领域已经很广泛地利用数学模型分析具有多个调控环的代谢网络[2]。
实践表明,通过建立生化网络的数学模型并进行计算机仿真能够拟合现有的实验数据,解释实验中观测到的现象,预测一些不能通过当前实验手段获得的结果,减少实验的强度和数量,并验证实验提出的可能机制。
本研究建立了T 细胞受体信号转导途径的动力学模型,通过模型仿真揭示了T 细胞受体信号途径各分子间的动态调控过程,并对模型的动力学特性进行了简要分析。
1 材料与方法1 1 T 细胞受体信号转导途径T 细胞受体信号转导途径(图1)摘自K EG G 数据库(ht tp://ww w.g eno me.jp/keg g/)。
本研究根据相关中英文文献,对图中涉及的信号转导相关分子之间的作用方式及数量关系进行了详细研究和确证,并据此定义整个信号转导途径的变量(包括自变量和因变量)和变量之间的关系。
1 2 动力学建模本研究采用S 系统方程(S system equations )[2]来描述信号转导的生化级联反应过程。
对于含有n 个因变量X 1,X 2,!,X n (其数量随时间而变化)和m 个自变量X n +1,X n +2,!,X n +m (一般设定为某些不变常量)的生化级联反应系统,其动力学时变方程可以表达为:d X i /d t =V +i -V -ii =1,2,!,n(1)式中X i 的生产函数V i +=V i +(X 1,!,X n ,X n +1,!,X n +m )和消耗函数V i -=V i -(X 1,!,X n ,X n +1,!,X n +m )是所有变量的函数,式(1)用S 系统方程可表达为:d X i /d t = i n +mj =1X g ij j - i n +mj =1X hij j i =1,2,!,n(2)式(2)中 i 和 i ( i 、 i >0)分别表示生产函数和消耗函数的速率常数,g ij 和h ij 分别表示变量X j 在因变量X i 的生产和消耗过程中的动力学阶,其中g ij 或h ij >0表示X j 在X i 的生产或消耗过程中起"正"调控作用,反之,如果g ij 或h ij <0则表示X j 在X i 的生产或消耗过程中起∀负#调控作用,而当g ij 或h ij =0时则表示X j 在X i 的生产或消耗过程中不起任何调控作用。
641No te:Based on K EG G database (ht tp://ww w.g enome.jp/kegg /)图1 T 细胞受体信号转导途径为简便起见,本研究以一个范例来概要整个建模过程。
图2显示了经典的带有∀正#∀负#调控作用的信号级联反应过程。
级联反应中前体X 3、X 4通过两步反应(比如磷酸化)衍生出活性产物X 1、X 2,其中上一级反应产物影响下一级反应。
该级联反应由系统输入X 5启动,而当终产物X 2足够多时,则通过负反馈作用抑制X 1的生成,从而整个过程得以减缓。
N ot e:!positive reg ulatio n;∃neg etiv e regulation图2 带有反馈的两步级联反应该过程中X 1、X 2是因变量,而X 3~X 5则被认为是自变量,其动力学用S 系统方程可表达为:d X 1/d t = 1X g 122X g 133X g 155- 1X h111d X 2/d t = 2X g 211X g 244- 2X h 222(3)X 3,X 4,X 5=常数由于式(3)中前体X 3、X 4是常数,其对X 1、X 2生产函数的贡献可以分别归并为速率常数 1、 2,因此为避免估计更多参数,可以不考虑活性产物前体的作用(但又不影响分析结果),式(3)可改写为:d X 1/d t = 1X g 122X g 155- 1X h111d X 2/d t = 2X g 211- 2X h 222(4)与上述范例类似,本研究对T 细胞受体信号途径的动力学模拟一律不考虑活性产物的前体,而只研究活性产物受到的∀正#∀负#调控作用。
事实上,图1所示即是不考虑前体分子的T 细胞受体信号转导途径。
基于图1,本研究首先总结出影响每个因变量分子的生产和消耗函数的∀正#∀负#调控分子,然后依照范例所示建立其S 系统方程。
1 3 参数估计除了定性的数据,目前还没有文献提供T 细胞受体信号转导途径中各分子间相互作用的数量关系。
另一方面,本研究并非旨在对该途径的精确定量特征进行模型研究,而只是试图通过建立∀数量级模型(or der of magnit ude model)#[2]来阐述模型结构的整个动力学性质,为从系统水平上进一步理解T 细胞受体信号转导途径奠定基础。
因此,本研究采用前人总结的经验来估计每一过程的速率常数和动力学阶的值。
实际上,对近年来的生化模拟系统所做的近1000次的动力学阶的分析表明,未受调节的过程其动力学阶常位于1或0.5,而受调节的过程其动力学阶通常要小一些。
一般来说,∀正#调控作用的动力学阶常处于0和1之间,而∀负#调控作642用的动力学阶常位于0和-0.5之间[2]。
本研究对模型中未受调节的过程(一般为单变量)取动力学阶为1;而对于受调节的过程(表现为多个变量),∀正#调控作用则采用动力学阶为0.5,∀负#调控作用则采用动力学阶为-0.5。
速率常数一般对模型结果不是那么敏感,其大小既与具体的反应过程有关,也取决于时间单位[2]。
由于本研究并非精确定量模型,故取各因变量分子的生产和消耗函数的速率常数为1。
各反应分子的初始浓度的确定,本研究采用了∀相对浓度#的概念,以避免浓度量纲对模型分析的影响。
所谓∀相对浓度#,即是指某时刻反应分子的浓度与其达到稳态时的浓度的比值:相对浓度=瞬时浓度/稳态浓度。
文中各自变量,由于其为系统外输入,启动或控制系统动力学过程之变量,故保持其相对浓度始终为一常数值1;而对于各因变量,由于皆为信号级联反应过程的产物,故取其相对浓度的初始值为0或无穷小(通常取1.0%10-10以避免模型运行中出现故障)。
1 4 模型运行通过科学计算软件M atlab7.0的仿真平台Simulink工具箱对已经建立的T细胞受体信号转导途径的S 系统动力学方程进行模型的搭建、调试和仿真运行。
仿真时间的设定以各因变量分子浓度达到其稳态浓度为上限。
值得注意的是,由于各因变量分子浓度采用了∀相对浓度#,无量纲,而且各因变量分子的生产和消耗函数的速率常数皆取值为1,因此仿真时间也只是一个相对概念,没有量纲。
对模型分别进行两方面的研究:模型基本特征的分析;模型的稳定性分析。
2 结果2 1 PL C 1介导的信号途径2 1 1 CD45 CD45为T细胞中蛋白酪氨酸磷酸酶(PT P ase)的一个典型代表。
研究发现,CD45可调节T细胞活化过程的一些起始关键酶如Lck、F yn的活性。
对于L ck,其催化区含有两个可供调节的酪氨酸残基(tyr394和ty r505), tyr394是一自身磷酸化位点,可通过自身磷酸化作用使Lck 激酶活性上调;而t yr505的磷酸化则可使Lck激酶活性下调。
当T CR/CD3识别抗原后,已知两种分子参与了ty r505的调节过程:&CD4/CD8胞内段具有蛋白酪氨酸磷酸酶活性,可以通过介导ty r505的去磷酸化来提高L ck激酶活性;∋CD4/ CD8和CD45发生共凝集,导致与CD4/CD8分子胞内段相连的L ck的T yr505位点受到CD45去磷酸化而被激活。
同时, CD45也可能导致了与CD3相连的F yn的酪氨酸残基去磷酸化而被激活[12]。
模型结果(图3A)显示,CD45经细胞外分子激活后,活性浓度迅速上升,与共受体CD4/CD8一起通过去磷酸化激活L ck,同时也通过去磷酸化激活F yn,导致L ck和Fyn的活性浓度迅速上升到高位,从而激活Z AP 70的下游级联。
2 1 2 ZA P 70 研究发现,当抗原或抗体与T CR/CD3特异结合后,CD3分子胞浆区的免疫受体酪氨酸活化基序(Immu nor ecepto r ty rosine based act ivation motif,IT A M)可被已活化的Sr c家族酪氨酸激酶L ck和Fyn磷酸化,成为SH2结构域的高亲和力结合位点,与含有SH2结构域的蛋白,如蛋白酪氨酸激酶ZA P 70相互结合。