异柠檬酸脱氢酶
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异柠檬酸脱氢酶
生物科学101 陈伟
学号:201001220231
摘要:异柠檬酸脱氢酶在三羧酸循环中将异柠檬酸转化为α-酮戊二酸。对生物
的生物体的能量代谢、生物合成以及抗氧化胁迫起重要作用.
关键词:异柠檬酸脱氢酶,三羧酸循环,限速酶
一、简介
异柠檬酸脱氢酶(isocit rate dehydrogenase , IDH) 在三羧酸( TCA) 循环中催化异柠檬酸生成α-酮戊二酸, 将NAD+ 或NADP + 还原成NADH 或NADPH. 根据空间结构特点, NADP-依赖性IDH 可分为同源二聚体IDH 和单体IDH , 它们对生物体的能量代谢、生物合成以及抗氧化胁迫起重要作用. 当碳源贫乏时, NADP-依赖性IDH 的可逆磷酸化对TCA 循环和乙醛酸旁路碳通量(carbon flux) 的分配起关键性调控作用. 因此目前IDH 是研究蛋白质的结构与功能关系、酶的催化与调节机制、蛋白质功能进化的最好模型之一.
异柠檬酸脱氢酶在生物体内有两种形式,即以NAD为电子受体的NAD-依赖型异柠檬酸脱氢酶和以NADP为电子受体的NADP-依赖型异柠檬酸脱氢酶广泛存在于真核生物各个细胞器(如叶绿体、线粒体、过氧化物酶体以及胞质)和原核细胞中,并表现出高活性,但它是一个小分子蛋白,不具有别构酶的性质,没有明显的调节作用,在真核生物中主要不是用于产能,而是在其它代谢中发挥作用。NAD-IDH 则普遍被认为仅仅存在于真核生物线粒体中,但由于在嗜酸硫细菌中也发现了NAD-IDH,因此它的分布也变得非常广泛。真核生物中的NAD-IDH 主要参与三羧酸循环,被认为是三羧酸循环的限速酶,负责催化异柠檬酸氧化脱羧成α-酮戊二酸,并将氧化型NAD还原成NADH.尽管真核生物NAD-IDH 是一个线粒体酶,但其基因却存在于细胞核染色体上,因此它是一个核编码的线粒体酶N2O。由于三羧酸循环在能量代谢中的重要作用,近年来国内外对其开展了大量深入的研究,包括酶的结构、酶学性质、基因克隆、蛋白的组装与转运、功能等各个方面,使人们对NAD-IDH 有了更多新的了解。
二、性质
①现已从多种生物中分离纯化了NAD-IDH 酶,并分析了酶的动力学性质,认为NAD-IDH 是一个别构酶,与异柠檬酸的关系呈S形曲线,而与NAD的关系则呈双曲线;NADH是竞争性抑制剂,NADPH 是非竞争性抑制剂,Mg2+、Mn2+都是激活剂。尽管不同来源的NAD-IDH 普遍表现这些酶学性质,但通过对真菌、高等动植物以及人NAD-IDH 的研究,发现影响酶活性的因素在不同物种中存在非常明显的差异,使NAD-IDH 的酶学性质变得非常复杂。哺乳动物的NAD-IDH 能够被钙离子激活,而在无脊椎动物、植物、酵母中不存在这种现象;研究者推测在哺乳动物NAD-IDH
的每个四聚体上可能有一个钙离子结合位点,但是将哺乳动物NAD-IDH 亚基的序列与酵母进行序列同源性比较后,并没有发现明显不同,也没有发现哺乳动物NAD-IDH 与其它钙结合蛋白存在明显的相似性,因此钙离子对哺乳动物NAD-IDH 活性影响的分子机理并不很清楚。
②腺苷酸等因子对酶活的影响也有很大差别。在酵母中,AMP、ADP 是NAD-IDH 的激活剂;但在豌豆中,AMP、ADP、ATP对酶活都没有任何正的或负的影响;在马铃薯中,AMP、ADP、ATP对酶活反而表现出一定程度的抑制作用;在哺乳
动物中,这个酶受ADP、ATP 浓度比的调控。
③Huang等发现Fe2+对猪NAD-IDH的酶活性产生影响,并在体外亲和切断亚基片段。在有氧与抗坏血酸存在的情况下,Fe2+能与猪NAD-IDHα亚基特异性结合,导致α亚基被切割成两个肽段而使酶完全失活;而且发现这种亲和切断仅仅发生在有活性的NAD-IDH上,如果用浓度为6mol/l的尿素使酶变性,Fe2+将不再把酶切割成两个片段,因此认为这种特异性切断与酶的结构有关。实验也发现这种亲和切断受Mn2+保护,但不受NAD、NADP等保护,因此认为是由于Mn2+与Fe2+竞争同一位点所致。在有异柠檬酸和氧存在的情况下,会促进Fe2+引起酶失活,但不会导致酶的亲和切断,表明在异柠檬酸存在下Fe2+离子导致失活另有原因,研究者认为可能是由于半胱氨酸氧化所致。
三、结构
真菌、细菌、高等动植物以及人NAD-IDH,的酶学性质表现明显差异,原因是其亚基组成在不同物种中也有很大差异。
现已从真菌、细菌、植物、动物等多个物种中实现了编码NAD-IDH基因的全长cDNA克隆,并在各物种间、同一物种各亚基间以及同一物种不同品种间进行了序列同源性比较。
四、功能与应用
随着NAD-IDH酶学结构、性质和基因克隆方面研究的深入,在生物学功能方面也开展了大量的研究,认为NAD-IDH是一个多功能酶,参与以下生物代谢途径。
I三羧酸循环中的限速酶
在真核生物中,NAD-IDH是三羧酸循环中的重要限速酶,催化异柠檬酸氧化脱羧成α-酮戊二酸并生成NADH等,在实验中发现缺失NAD-IDH活性的酵母菌株不能利用乙酸为碳源,而且在乳酸或者甘油为碳源的培养基上,生长速度也比野生型的慢很多,这个生长表型说明NAD-IDH确实在三羧酸循环中起着重要的作用。三羧酸循环作为能量代谢的重要途径,对生物体的生命活动起着重要的作用,能够提供远比糖酵解大得多的能量;而且不仅仅是糖代谢的重要途径,也是脂质、蛋白质和核酸代谢最终氧化成二氧化碳和水的重要途径。由于NAD-IDH是三羧酸循环的限速酶,因此NAD-IDH的活性对生物体的整个生命代谢都有很大影响。
II在氮代谢中的作用
烟草NAD-IDH的研究表明,NAD-IDH可能在氮代谢中起着重要作用。Lancien 等发现烟草经短期的氮饥饿后重新补给氮源时,编码NAD-IDH 基因的转录水平提高了,但是并没有发现表达的蛋白量出现增多,推测转录水平的提高可能是由于NAD-IDH催化异柠檬酸生成α-酮戊二酸,而α-酮戊二酸与谷氨酸合成有关;也