20种氨基酸遗传密码子表
密码子表及对应氨基酸英文缩写
Valine/Val/V 缬氨酸
Alanine/Ala/A 丙氨酸
Glycine/Gly/G 甘氨酸
U UUU U UUC UUA UUG CUU C First Base A CUC CUA CUG AUU AUC AUA AUG GUU G GUC GUA GUG
Phenylalanine/Phe/F 苯丙氨酸 Leucine/Leu/L 亮氨酸
C UCU UCC UCA UCG CCU CCC CCA CCG ACU
G UGU UGC UGA UGG CGU CGC CGA CGG AGU AGC AGA AGG GGU GGC GGA GGG
Cysteine/Cys/C 半胱氨酸 stop codon Tryptophan/Trp/W 色氨酸
U C A G U C A G Third Base U C A G U C A G
Second Base A UAU
Serine/Ser/S 丝氨酸
UAC UAA UAG CAU CAC CAA CAG AAU AAC AAA AAG GAU GAC GAA GAG
Tyrosine/Tyr/Y 酪氨酸 stop codon stop codon Histidine/His/H 组氨酸 Glutamine/Gln/Q 谷氨酰胺 Asparagine/Asn/N 天冬酰胺 Lysine/Lys/K 赖氨酸 Aspartic acid/Asp/D 天冬氨酸 Glutamic acid/Glu/E 谷氨酸
Leucine/Leu/L 亮氨酸
Proline/Pro/P 脯氨酸
Arginine/Arg/R 精氨酸
Isoleucine/Ile/I 异亮氨酸 Methionine/Met/M 甲硫氨酸(Start)
遗传密码表以及氨基酸详表
遗传密码表以及氨基酸详
表
Prepared on 24 November 2020
密码子反表
除此之外,还有一些三字母或单字母符号可用来表示未明确定义的缩写:•Asx、B可代表天冬氨酸(Asp、D)或天冬酰胺(Asn、N)。
•Glx、Z可代表谷氨酸(Glu、E)或谷氨酰胺(Gln、Q)。
•Xle、J可代表亮氨酸(Leu、L)或异亮氨酸(Ile、I)。
•Xaa(亦用Unk)、X可代表任意氨基酸或未知氨基酸。
结构[]
以下是标准所用来直接合成蛋白质的20种氨基酸的结构及表示符号。
•
(Ala/A)
•
(Arg/R)
•
(Asn/N)
•
(Asp/D)
•
(Cys/C)
•
(Glu/E)
•
(Gln/Q)
•
(Gly/G)
•
(His/H)
•
(Ile/I)
•
(Leu/L)
•
(Lys/K)
•(Met/M)
•
(Phe/F)
•
(Pro/P)
•
(Ser/S)
•
(Thr/T)
•
(Trp/W)
•
(Tyr/Y)
•
(Val/V)
•
(Sec/U)
•
(Pyl/O)
主要化学性质[]
以下的分子量是根据各元素的在自然界的所做的平均值。
此外由于形成时,会减少一个,因此蛋白质中单一氨基酸的分子量,比下表数值少了 Da。
支链性质[]
以下列表中的pKa值,可能与这些氨基酸在蛋白质内部时有所不同。
基因表达与生物化学[]。
20种氨基酸遗传密码子表
氨基酸简写和密码子表
缬氨酸V
丙氨酸A
天冬氨酸D
甘氨酸G
C
缬氨酸V
丙氨酸A
谷氨酸E
甘氨酸G
A
缬氨酸V
丙氨酸A
谷氨酸E
甘氨酸G
G
谷氨酸E
甘氨酸G
A
缬氨酸V
丙氨酸A
谷氨酸E
甘氨酸G
G
氨基酸简写和密码子表
第一个
核苷酸5′
第二个核苷酸
第三个
核苷酸3
U
C
A
G
U
苯丙氨酸F
丝氨酸S
酪氨酸Y
半胱氨酸C
U
苯丙氨酸F
丝氨酸S
酪氨酸Y
半胱氨酸C
C
亮氨酸L
丝氨酸S
终止密码子
终止密码子
A
亮氨酸L
丝氨酸S
终止密码子
色氨酸W
G
C
亮氨酸L
脯氨酸P
组氨酸H
精氨酸R
U
亮氨酸L
脯氨酸P
组氨酸H
精氨酸R
C
亮氨酸L
脯氨酸P
谷氨酰胺Q
精氨酸R
A
亮氨酸L
脯氨酸P
谷氨酰胺Q
精氨酸R
G
A
异亮氨酸I
苏氨酸T
天冬酰胺N
丝氨酸S
U
异亮氨酸I
苏氨酸T
天冬酰胺N
丝氨酸S
C
异亮氨酸I
苏氨酸T
赖氨酸K
精氨酸R
A
甲硫氨酸M
苏氨酸T
赖氨酸K
精氨酸R
G
G
缬氨酸V
丙氨酸A
天冬氨酸D
甘氨酸G
氨基酸简写和密码子表
第一个
核苷酸5′
氨基酸密码子对照表
双螺旋 DNA 的断裂和愈合
misc_RNA 不能用其他 RNA 关键词 (prim_transcript,precursor_RNA,mRNA,5'clip,3'clip,5'UTR,3'UTR,exon,CDS,
sig_peptide,transit__ __peptide,mat_peptide,intron,polyA_site,
小的细胞质 RNA;几个小的细胞质RNA分子中的任何一个存在于真核生物的 细胞质和(有时)核中
sig_peptide 信号肽编码序列;被分泌的蛋白质的N-末端结构域的编码序列;此结构域涉 及新生多肽与膜的结合;前导序列
SnRNA
小的核 RNA;很多小的 RNA 种类中的任何一个都被局限于核中;几个 snRNA 参与剪接或其它 RNA 加工反应
Promoter 参与 RNA 聚合酶的结合以启动转录的 DNA 分子区域
protein_bin 核酸上非-共价的蛋白质结合位点
d
RBS
核糖体结合位点
repeat_regi 含有重复单位的基因组区域 on repeat_unit 单个重复元件
rep_origin 复制起点;复制核酸以得到两个相同拷贝的起始位点
J_segment 免疫球蛋白轻链和重链的连接区段,和 T-细胞受体 α,β 和 γ 链
LTR
长的末端重复,在确定序列的两端直接重复的序列, 类型典型地见于逆转录病毒
中
mat_peptide 成熟的肽或蛋白质的编码序列;翻译后修饰之后成熟的或最终的肽或蛋白质产物 的编码序列;位置不包括终止密码子(与相应的 CDS 不同)
序列;通过测定 STS 系列的次序即可作出图谱的基因组区域
氨基酸密码子对照表
gene
鉴定为基因的生物学意义的区域,并已经指定名称
iDNA
间插DNA;通过几种重组中的任何一种能被消除的DNA
intron
被转录的DNA区段,但通过同时剪接位于其两侧的序列(外显子)即可从转录本内部将其除去
J_segment
免疫球蛋白轻链和重链的连接区段,和T-细胞受体α,β和γ链
LTR
长的末端重复,在确定序列的两端直接重复的序列,类型典型地见于逆转录病毒中
Conflict
在这一位点或区域,单独确定的“相同”序列有所不同
D-loop
置换环;线粒体DNA内的一个区域,其中RNA的短的序列与DNA的一条链配对,代替了这一区域的原始配对DNA链;也用于说明在RecA蛋白质催化的反应中,侵入的单链替代双链DNA的一条链的区域
D-segment
免疫球蛋白重链的多变区,和T-细胞受体的β链
misc_difference
特征序列与记载中存在的有所不同,并且不能用任何其它不同关键词(conflict,unsure,old_sequence,mutation,variation,allele或modified_base)表述
misc_feature
不能用任何其它的特征关键词表述的具有生物学意义的区域;新的或少见的特征
Enhancer
顺式-作用序列,它增强了(一些)真核生物启动子的作用,并能在任一方向和与启动子相关的任何位置处(上游或下游)起作用
Exon
编码剪接mRNA部分的基因组区域;可以含有5'UTR,所有CDS,和3'UTR
GC_signal
GC盒;位于真核生物转录单位起始点上游的保守的富含GC区域,可以以多重拷贝或任一方向存在;共有序列=GGGCGG
遗传密码表以及氨基酸详表
遗传密码表以及氨基酸详表Company Document number:WTUT-WT88Y-W8BBGB-BWYTT-19998密码子反表除此之外,还有一些三字母或单字母符号可用来表示未明确定义的缩写:•Asx、B可代表天冬氨酸(Asp、D)或天冬酰胺(Asn、N)。
•Glx、Z可代表谷氨酸(Glu、E)或谷氨酰胺(Gln、Q)。
•Xle、J可代表亮氨酸(Leu、L)或异亮氨酸(Ile、I)。
•Xaa(亦用Unk)、X可代表任意氨基酸或未知氨基酸。
结构[]以下是标准所用来直接合成蛋白质的20种氨基酸的结构及表示符号。
•(Ala/A)•(Arg/R)•(Asn/N)•(Asp/D)•(Cys/C)•(Glu/E)•(Gln/Q)•(Gly/G)•(His/H)•(Ile/I)•(Leu/L)•(Lys/K)•(Met/M)•(Phe/F)•(Pro/P)•(Ser/S)•(Thr/T)•(Trp/W)•(Tyr/Y)•(Val/V)•(Sec/U)•(Pyl/O)主要化学性质[]以下的分子量是根据各元素的在自然界的所做的平均值。
此外由于形成时,会减少一个,因此蛋白质中单一氨基酸的分子量,比下表数值少了 Da。
支链性质[]以下列表中的pKa值,可能与这些氨基酸在蛋白质内部时有所不同。
基因表达与生物化学[]。
氨基酸密码子对照表
芳香族类
脯氨酸
Proline
P或Pro
115.117
-N-(CH 2 ) 3 -CH-
|_________|
亚氨基酸
丝氨酸
Serine
S或Ser
105.078
HO-CH 2 -
羟基类
苏氨酸
Threonine
T或Thr
119.105
CH 3 -CH(OH)-
羟基类
色氨酸
Tryptophan
Promoter
参与RNA聚合酶的结合以启动转录的DNA分子区域
protein_bind
核酸上非-共价的蛋白质结合位点
RBS
核糖体结合位点
repeat_region
含有重复单位的基因组区域
repeat_unit
单个重复元件
rep_origin
复制起点;复制核酸以得到两个相同拷贝的起始位点
RRNA
成熟的核糖体RNA;将氨基酸装配成蛋白质的核糖核蛋白颗粒(核糖体)中的RNA成份
133.089
HOOC-CH 2 -
酸性氨基酸类
半胱氨酸
Cysteine
C或Cys
121.145
HS-CH 2 -
含硫类
谷氨酰胺
Glutamine
Q或Gln
146.131
H 2 N-CO-(CH 2 ) 2 -
酰胺类
谷氨酸
Glutamic acid
E或Glu
147.116
HOOC-(CH 2 ) 2 -
misc_structure
不能用其他Structure关键词(stem_loop和D-loop)表述的任何二级或三级结构或构象
遗传密码子表
1.遗传密码子表第一个核苷酸(5′端)第二个核苷酸第三个核苷酸(3′端)U C A GU 苯丙氨酸丝氨酸酪氨酸半胱氨酸U 苯丙氨酸丝氨酸酪氨酸半胱氨酸 C 亮氨酸丝氨酸终止码终止码 A 亮氨酸丝氨酸终止码色氨酸GC 亮氨酸脯氨酸组氨酸精氨酸U 亮氨酸脯氨酸组氨酸精氨酸 C 亮氨酸脯氨酸谷氨酰胺精氨酸 A 亮氨酸脯氨酸谷氨酰胺精氨酸GA 异亮氨酸苏氨酸天冬酰胺丝氨酸U 异亮氨酸苏氨酸天冬酰胺丝氨酸 C 异亮氨酸苏氨酸赖氨酸精氨酸 A 蛋氨酸苏氨酸赖氨酸精氨酸GG 缬氨酸丙氨酸天冬氨酸甘氨酸U 缬氨酸丙氨酸天冬氨酸甘氨酸 C 缬氨酸丙氨酸谷氨酸甘氨酸 A 缬氨酸丙氨酸谷氨酸甘氨酸GAUG位于mRNA启动部位时为启动信号。
真核生物中此密码子代表蛋氨酸,原核生物中代表甲酰蛋氨酸。
2.氨基酸的特性氨基酸名称三字母缩写单字母缩写质量侧链电离的pHa值结构式丙氨酸(alanine)Ala A 89.09精氨酸Arg R 174.2 12.48 (arginine)天冬酰氨Asn N 132.1 (asparagine)天冬氨酸Asp D 133.1 3.86 (asparticacid)半胱氨酸Cys C 121.12 (systeine)谷氨酰胺Gln Q 146.15 (glutamine)谷氨酸Glu E 147.13 4.25 (glutamicacid)甘氨酸Gly G 75.07 (glycine)组氨酸His H 155.16 6.0 (histidine)异亮氨酸lle I 131.17 (isoleucine)亮氨酸Leu L 131.17 (leucine)赖氨酸Lys K 146.19 (lycine)甲硫氨酸Met M 149.21 (methionine)苯丙氨酸Phe P 165.19 (phenylanaline)脯氨酸Pro P 115.13 (proline)丝氨酸Ser S 105.06 (serine)苏氨酸Thr T 119.12 (threonine)色氨酸Trp W 204.22 (tryptophan)酪氨酸Tyr Y 181.19 10.07 (tyrosine)缬氨酸(valine)Val P 117.151.核苷三磷酸的物理常数化合物分子量λmax(pH7.0)1摩尔溶液(pH7.0)中λmax时的最大吸收值OD280/OD260ATP 507 259 15400 0.15 CTP 483 271 9000 0.97 GTP 523 253 13700 0.66 UTP 484 262 10000 0.38 dATP 494 259 15200 0.15 dCTP 467 271 9300 0.98 dGTP 507 253 13700 0.66 dTTP 482 267 9600 0.712.常用核酸的长度与分子量核酸核苷酸数分子量λDNA48502(双链环状)3.0×107pBR3224363(双链) 2.8×10628SrRNA4800 1.6×10623SrR3700 1.2×106NA18SrR1900 6.1×105 NA19SrR1700 5.5×105 NA125SrRNA3.6×104tRNA(大肠杆75 2.5×104菌)3.常用核酸蛋白换算数据(1)重量换算1μg=10-6g 1pg=10-12g1ng=10-9g 1fg=10-15g(2)分光光度换算:1A260双链DNA=50μg/ml1A260单链DNA=30μg/ml1A260单链RNA=40μg/ml(3)DNA摩尔换算:1μg 100bp DNA=1.52pmol=3.03pmol末端1μg pBR322 DNA=0.36pmol1pmol 1000bp DNA=0.66μg1pmol pBR322=2.8μg1kb双链DNA(钠盐)=6.6×105道尔顿1kb单链DNA(钠盐)=3.3×105道尔顿1kb单链RNA(钠盐)=3.4×105道尔顿(4)蛋白摩尔换算:100pmol分子量100,000蛋白质=10μg100pmol分子量50,000蛋白质=5μg100pmol分子量10,000蛋白质=1μg氨基酸的平均分子量=126.7道尔顿(5)蛋白质/DNA换算:1kb DNA=333 个氨基酸编码容量=3.7×104MW蛋白质10,000MW蛋白质=270bp DNA30,000MW蛋白质=810bp DNA50,000MW蛋白质=1.35kb100,000MW蛋白质=2.7kb DNA4.常用蛋白质分子量标准参照物(1)高分子量标准参照(2)中分子量标准参照(3)低分子量标准参照肌球蛋白分子量磷酸化酶B 97,400 碳酸酐酶31,00 肌球蛋白212,000 牛血清白蛋白66,200 大豆脻蛋白酶21,500 β-半乳糖甘酶B 116,000 谷氨酶脱氢酶55,000 抑制剂磷酸化酶B 97,400 卵白蛋白42,700 马心肌球蛋白16,900 牛血清白蛋白66,200 醛缩酶40,000 溶菌酶14,400 过氧化氢酶` 57,000 碳酸酐酶31,000 肌球蛋白(F1)8,100 醛缩酶40,000 大豆脻蛋白酶21,500 肌球蛋白(F2)6,200抑制剂肌球蛋白(F3)2,500溶菌酶14,4005.常用蛋白质等电点参考值(单位:pH)蛋白质等电点蛋白质等电点鲑精蛋白[salmine] 12.1 α1-粘蛋白[α1-mucoprotein] 1.8-2.7 鲱精蛋白[clupeine] 12.1 卵黄类粘蛋白[vitellomucoid] 5.5鲟精蛋白[sturline] 11.71 尿促性腺激素[urinary3.2-3.3gonadotropin]胸腺组蛋白[thymohistone] 10.8 溶菌酶[lyso zyme] 11.0-11.2 珠蛋白(人)7.5 肌红蛋白[myoglobin] 6.99 [globin(human)]7.07卵白蛋白[ovalbuin] 4.71; 4.59 血红蛋白(人)[hemoglobin(human)]伴清蛋白[conal bumin] 6.8;7.1 血红蛋白(鸡)[hemoglobin(hen)] 7.23血清白蛋白[serum albumin] 4.7-4.9 血红蛋白(马)[hemoglobin(horse)]6.92肌清蛋白[myoal bumin] 3.5 血蓝蛋白[hemerythrin] 4.6-6.4 肌浆蛋白[myogen A] 6.3 蚯蚓血红蛋白[chlorocruorin] 5.6β-乳球蛋白[β-lactoglobulin]5.1-5.3 血绿蛋白[chlorocruorin] 4.3-4.5卵黄蛋白[livetin] 4.8-5.0 无脊椎血红蛋白[erythrocruorins]4.6-6.2γ1—球蛋白(人)[γ1-globulin(human)]5.8;6.6 细胞色素C[cytochrome C] 9.8-10.1γ2—球蛋白(人)[γ2-globulin(human)]7.3;8.2 视紫质[rhodopsin] 4.47-4.57 肌球蛋白A[myosin A] 5.2-5.5 促凝血酶原激酶[thromboplastin] 5.2原肌球蛋白[myosin A] 5.1 α1-脂蛋白[α1-lipoprotein] 5.5铁传递蛋白[siderophilin] 5.9 β1-脂蛋白[β1-lipoprotein] 5.4胎球蛋白[fetuin] 3.4-3.5 β-卵黄脂磷蛋白[β-lipovitellin]5.9血纤蛋白原[fibrinogen] 5.5-5.8 芜菁黄花病毒[turnip yellowvvirus]3.75α-眼晶体蛋白[α-crystallin]4.8 牛痘病毒[vaccinia virus]5.3β-眼晶体蛋白[β-crystallin]6.0 生长激素[somatotropin] 6.85胰岛素[insulin] 5.35 催乳激素[prolactin] 5.73花生球蛋白[arachin] 5.1 胃蛋白酶[pepsin] 1.0左右伴花生球蛋白[conarrachin] 3.9 糜蛋白酶(胰凝乳蛋白酶[chymotrypsin]8.1角蛋白类[keratins] 3.7-5.0 牛血清白蛋白[bovine serumalbumin]4.9还原角蛋白[keratein] 4.6-4.7 核糖核酸酶(牛胰)[ribonuclease或Rnase(bovine pancreas)]7.8胶原蛋白[collagen] 6.5-6.8 甲状腺球蛋白[thyroglobulin] 4.58鱼胶[ichthyocol] 4.8-5.2 胸腺核组蛋白[thymonucleohistone]4左右白明胶[gelatin] 4.7-5.0 β-酷蛋白[β-casein] 4.5α-酷蛋白[α-casein] 4.0-4.1 γ-酷蛋白[γ-casein] 5.8-6.0 α-卵清粘蛋白[α-ovomucoid]3.83-4.416.常用DNA分子量标准参照物λDNA/Hi ndⅢλDNA/EcoRⅠλ/HindⅢ+EcoRⅠpBR322/HaeⅢ23130 21226 21227 587 123 9416 7421 5148 405 104 6557 5804 4973 504 89 4361 5643 4268 458 80 2322 4843 3530 434 64 2027 3530 2027 267 57 564 1904 234 51 125 1584 213 211375 192 18974 184 11831 124 75641257.核苷和脱氧核苷三磷酸的物化常数化合物相对分子质量最大吸收波长(pH7)×10-3摩尔消光系数(pH7)吸收比值(280/260)碱基pKaATP 507.2 259 15.4 0.15 4.1CTP 483.2 271 9.1 0.97 4.8GTP 523.2 253 13.7 0.66 3.3,9.3 UTP 484.2 262 10.0 0.38 9.5dATP 491.2 259 15.2 0.15 4.1dCTP 467.2 271 9.1 0.97 4.8dGTP 507.2 253 13.7 0.67 3.3,9.3 TTP 482.2 267 9.6 0.73 9.38.嘌呤、嘧啶碱基、核苷和核苷酸相对分子质量嘌呤、嘧啶碱基核苷核苷酸H-型Na2-型腺嘌呤135.11 腺苷267.24 腺苷酸347.22 391.22 鸟嘌呤151.15 鸟苷283.26 二磷酸腺苷427.20黄嘌呤152.11 黄苷284.24 三磷酸腺苷507.20次黄嘌呤136.11 次黄苷268.24 3’,5’-环腺苷酸329.20胞嘧啶111.10 胞苷243.23 鸟苷酸363.24 407.22 尿嘧啶112.09 尿苷244.20 肌苷酸348.22胞腺嘧啶126.11 脱氧腺苷251.24 尿苷酸323.21 367.31 脱氧鸟苷267.24 脱氧腺苷酸324.18 368.18脱氧肌苷252.24 脱氧鸟苷酸331.22脱氧胞苷227.22 脱氧胞苷酸347.23脱氧尿苷228.20 脱氧胞腺苷酸307.20脱氧胸腺苷242.223 332.211.放射性核素衰变表3H35S32P125I131I时间(年)剩余活性(%)时间(年)剩余活性(%)时间(年)剩余活性(%)时间(年)剩余活性(%)时间(年)剩余活性(%)194.5298.4195.3495.50.298.3 289.3596.1290.8891.20.496.6 384.41092.3386.51287.10.695.0 479.81588.7482.51683.1 1.091.8 575.42085.3578.52079.4 1.687.2 671.32582.0674.82475.8 2.381.2 767.43178.1771.22872.4 3.176.7 863.73774.5867.83269.1 4.071.0 960.24371.0964.73666.0 5.065.2 1056.95067.01061.24063.0 6.159.3 1153.85763.61158.74460.27.353.4 1250.96559.61255.94857.48.150.0 12.350.07356.01353.25254.88152.51450.75652.487.150.014.350.06050.02.放射性测定单位单位定义换算吸收放射线剂量(拉得rad)100尔格/克(电离辐射传给单位质量物质的能量)0.87rad=1r伦琴(r)使1克空气产生1.6×1012离子对的X或γ-射线的照射剂量r/0.87=1rad居里(Ci)每秒放射性衰变3.7×1010个原子的量1Ci=103mCi=106μCi 毫居(mCi)千分之一居里1mCi=10-3Ci=103μCi 微居(μCi)百万分之一居里(每分钟衰变2.2×106次)1μCi=10-6Ci=10-3M Ci 伯克莱尔(Bq)每秒衰变1个原子的量1Bq=3.7×10-10Ci千伯克莱尔(kBq)1kBq=103Bq百万伯克莱尔(MBq)1MBq=106Bq兆伯克莱尔(GBq)1GBq=109Bq每分钟衰变数(dpm)每分钟衰变的原子数 2.2×106dpm=1μCi每分钟计数(cpm)测量仪测出每分钟β粒子数Cpm=dpm×计数器效率常用的缓冲液[作者:佚名转贴自:本站原创更新时间:2004-3-25 编辑:supi]常用缓冲溶液的配制方法测序凝胶加样缓冲液常用的电泳缓冲液2×SDS凝胶加样缓冲液凝胶加样缓冲液各种pH值的Tris缓冲液常用缓冲液的pKa值温度对常用缓冲液pH的影响标准缓冲液pH值与温度对照表常用作缓冲剂的酸解离常数1.常用缓冲溶液的配制方法(1)甘氨酸–盐酸缓冲液(0.05mol/L)X毫升0.2 mol/L甘氨酸+Y毫升0.2 mol/L HCI,再加水稀释至200毫升pH X Y pH X Y2.0 50 44.03.0 50 11.42.4 50 32.43.2 50 8.22.6 50 24.23.4 50 6.42.8 50 16.83.6 50 5.0甘氨酸分子量 = 75.07,0.2 mol/L甘氨酸溶液含15.01克/升。
密码子表和氨基酸缩写
UGGTrpW色氨酸
U
C
CUULeuL亮氨酸
CUCLeuL亮氨酸
CUALeuL亮氨酸
CUGLeuL亮氨酸
CCUProP脯氨酸
CCCProP脯氨酸
CCAProP脯氨酸
CCGProP脯氨酸
CAUHisH组氨酸
CACHisH组氨酸
CAAGlnQ谷氨酰胺
CAGGlnQ谷氨酰胺
CGUArgR精氨酸
CGCArgR精氨酸
D AspAspartic Acid天冬氨酸P Pro Proline脯氨酸IIleIsoleucine异亮氨酸V Valvaline缬氨酸
E Glu Glutamic Acid谷氨酸Q Gln Glutamine谷氨酰胺K Lys Lysine赖氨酸W Trp Tryptophan色氨酸
F Phe Phenylalanine苯丙氨酸R Arg Arginine精氨酸L Leu Leucine亮氨酸Y Tyr Tyrosine酪氨酸
GGUGlyG甘氨酸
GGCGlyG甘氨酸
GGAGlyG甘氨酸
GGGGlyG甘氨酸
G
A Ala Alanine丙氨酸M Met Methionine甲硫氨酸G Gly Glycine甘氨酸S SerSerine丝氨酸
C CysCysteine半胱氨酸N Asn Asparagine天冬酰胺H His Histidine组氨酸T ThrThreonine苏氨酸
AGCSerS丝氨酸
AGAArgR精氨酸
AGGArgR精氨酸
氨基酸所对应的密码子表
第二个字母
第一个字母
U
C
A
G
第三个字母
U
苯Байду номын сангаас氨酸
F Phe Phenylalanine
丝氨酸
S Ser
Serine
酪氨酸
Y Tyr Tyrosine
半胱氨酸
C Cys Cysteine
U
C
亮氨酸
L Leu
Leucine
终止
终止
A
终止
色氨酸
W Trp Tryptophan
G
C
亮氨酸
Serine
U
C
赖氨酸
KLys
Lysine
精氨酸
R Arg Arginine
A
甲硫氨酸
M Met Methionine
(起始)
G
G
缬氨酸
V Val
Valine
丙氨酸
AAla
Alanine
天冬氨酸
D Asp Aspartic acid
甘氨酸
G Gly Glycine
U
C
谷氨酸
E Glu Glutamic acid
L Leu
Leucine
脯氨酸
P Pro
Proline
组氨酸
H His Histidine
精氨酸
R Arg Arginine
U
C
谷氨酰胺
Q Gln Glutamine
A
G
A
异亮氨酸
I Ile Isoleucine
苏氨酸
T Thr Threonine
天冬酰胺
N Asn Asparagine
氨基酸密码子对照表和点突变引物设计
氨基酸密码子对照表和点突变引物设计Alanine 89.079 CH 3 - 丙氨酸 A 或 Ala 脂肪族类碱性氨基酸HN=C(NH 2 )-NH-(CH 2 ) 3 精氨酸 Arginine R 或 Arg 174.188 - 类 Asparagine 132.104 H 2 N-CO-CH 2 - 天冬酰胺 N 或 Asn 酰胺类酸性氨基酸Aspartic acid 133.089 HOOC-CH 2 - 天冬氨酸 D 或 Asp 类Cysteine 121.145 HS-CH 2 - 半胱氨酸 C 或 Cys 含硫类 Glutamine 146.131 H 2 N-CO-(CH 2 ) 2 - 谷氨酰胺 Q 或 Gln 酰胺类酸性氨基酸谷氨酸 Glutamic acid E 或 Glu 147.116 HOOC-(CH 2 ) 2 - 类Glycine 75.052 H- 甘氨酸 G 或 Gly 脂肪族类碱性氨基酸N=CH-NH-CH=C-CH 2 - Histidine 155.141 组氨酸 H 或 His|__________| 类 Isoleucine 131.160 CH 3 -CH 2 -CH(CH 3 )- 异亮氨酸 I 或Ile 脂肪族类 Leucine 131.160 (CH 3 ) 2 -CH-CH 2 - 亮氨酸 L 或 Leu 脂肪族类碱性氨基酸赖氨酸 Lysine K 或 Lys 146.17 H 2 N-(CH 2 ) 4 - 类Methionine 149.199 CH 3 -S-(CH 2 ) 2 - 蛋氨酸 M 或 Met 含硫类Phenylalanine 165.177 Phenyl-CH 2 - 苯丙氨酸 F 或 Phe 芳香族类-N-(CH 2 ) 3 -CH- 脯氨酸 Proline P 或 Pro 115.117 亚氨基酸|_________|丝氨酸 Serine S 或 Ser 105.078 HO-CH 2 - 羟基类 Threonine 119.105 CH 3 -CH(OH)- 苏氨酸 T 或 Thr 羟基类Phenyl-NH-CH=C-CH 2 - Tryptophan 204.213 色氨酸 W 或 Trp 芳香族类|___________|Tyrosine 181.176 4-OH-Phenyl-CH 2 - 酪氨酸 Y 或 Tyr 芳香族类 Valine 117.133 CH 3 -CH(CH 2 )- 缬氨酸 V 或 Val 脂肪族类TorR PRMPHHIVIVEDEPVTQARLQSYFTQEGYTVSVTASGAGLREIMQNQSVDLILLDINLPDENGLMLTRALRERSTVGIILVTGRSDRIDRIVGLEMGADDYVTKPLELRELVVRVKNLLWRIDLARQAQPHTQDNCYRFAGYCLNVSRHTLERDGEPIKLTRAEYEMLVAFVTNPGEILSRERLLRMLSARRVENPDLRTVDVLIRRLRHKLSADLLVTQHGEGYFLAADVCTorR 核酸1 ATG CCA CAT CAC ATT GTT ATT GTT GAA GAT31 GAG CCG GTT ACC CAG GCG CGA TTA CAA TCC 61 TAC TTC ACT CAG GAG GGG TAT ACC GTT TCC 91 GTT ACG GCG AGC GGT GCT GGG CTA CGG GAA 121 ATT ATG CAG AAT CAG TCG GTA GAT TTA ATT 151 CTG CTG GAT ATC AAC TTA CCC GAT GAA AAT 181 GGC CTG ATG TTA ACC CGC GCC CTG CGA GAA 211 CGC TCA ACG GTG GGG ATT ATT CTG GTT ACC 241 GGA CGC AGC GAT CGG ATT GAC CGT ATT GTT 271 GGG CTG GAA ATG GGC GCA GAC GAT TAC GTC 301 ACC AAA CCG CTG GAA CTG CGC GAA CTG GTA 331 GTA CGG GTG AAA AAT CTG CTC TGG CGA ATC 361 GAC CTC GCG CGA CAA GCT CAA CCG CAC ACT 391 CAG GAC AAC TGC TAT CGC TTT GCC GGT TAT 421 TGC CTG AAT GTG TCG CGC CAT ACG CTG GAG 451 CGG GAT GGC GAG CCG ATT AAA CTG ACC CGC 481 GCA GAG TAT GAA ATG TTG GTG GCA TTT GTG 511 ACG AAT CCG GGC GAA ATT CTC AGC CGT GAA 541 CGT CTG CTA CGT ATG CTT TCT GCG CGT CGG 571 GTG GAA AAC CCT GAC CTG CGC ACC GTC GAT601 GTG TTA ATT CGT CGT TTA CGT CAT AAA CTC 631 AGC GCG GAT TTA CTG GTG ACG CAA CAT GGT 661 GAA GGT TAT TTC TTA GCC GCT GAT GTG TGC 691 TGA点突变后TORR1 ATG CCA CAT CAC ATT GTT ATT GTT GAA GAT31 GAG CCG GTT ACC CAG GCG CGA TTA CAA TCC 61 TAC TTC ACT CAG GAG GGG TAT ACC GTT TCC 91 GTT ACG GCG AGC GGT GCT GGG CTA CGG GAA 121 ATT ATG CAG AAT CAG TCG GTA GAT TTA ATT 151 CTG CTG CAT ATC AAC TTA CCC GAT GAA AAT 181 GGC CTG ATG TTA ACC CGC GCC CTG CGA GAA 211 CGC TCA ACG GTG GGG ATT ATT CTG GTT ACC 241 GGA CGC AGC GAT CGG ATT GAC CGT ATT GTT 271 GGG CTG GAA ATG GGC GCA GAC GAT TAC GTC 301 ACC AAA CCG CTG GAA CTG CGC GAA CTG GTA 331 GTA CGG GTG AAA AAT CTG CTC TGG CAA ATC 361 GAC CTC GCG CGA CAA GCT CAA CCG CAC ACT 391 CAG GAC AAC TGC TAT CGC TTT GCC GGT TAT 421 TGC CTG AAT GTG TCG CGC CAT ACG CTG GAG 451 CGG GAT GGC GAG CCG ATT AAA CTG ACC CGC 481 GCA GAG TAT GAA ATG TTG GTG GCA TTT GTG 511 ACG AAT CCG GGC GAA ATT CTC AGC CGT GAA 541 CGT CTG CTA CGT ATG CTT TCT GCG CGT CGG 571 GTG GAA AAC CCT GAC CTG CGC ACC GTC GAT 601 GAG TTA ATT CGT CGT TTA CGT CAT AAA CTC 631 AGC GCG GAT TTA CTG GTG ACG CAA CAT GGT 661 GAA GGT TAT TTC TTA GCC GCT GAT GTG TGC 691 TGA突变ASP53-ARG1191 ATG CCA CAT CAC ATT GTT ATT GTT GAA GAT31 GAG CCG GTT ACC CAG GCG CGA TTA CAA TCC 61 TAC TTC ACT CAG GAG GGG TAT ACC GTT TCC 91 GTT ACG GCG AGC GGT GCT GGG CTA CGG GAA 重叠区延伸区 F: 5` CG GTA GAT TTA ATT CTG121 ATT ATG CAG AAT CAG TCG GTA GAT TTA ATT CTG CAT ATC AAC T 3` 延伸重区 R: 5` G CAG CAG AAT TAA ATC 151 CTG CTG CAT ATC AAC TTA CCC GAT GAA AAT 叠TAC CGA CTG ATT CTG 3` 区 F 30bp 58? 37% 181 GGC CTG ATG TTA ACC CGC GCC CTG CGA GAAR 31 bp 60? 42%211 CGC TCA ACG GTG GGG ATT ATT CTG GTT ACC241 GGA CGC AGC GAT CGG ATT GAC CGT ATT GTT 271 GGG CTG GAA ATG GGC GCA GAC GAT TAC GTC301 ACC AAA CCG CTG GAA CTG CGC GAA CTG GTA重叠区延伸区331 GTA CGG GTG AAA AAT CTG CTC TGG CAA ATC F: 5` GTG AAA AAT CTG CTC TGG 延伸361 GAC CTC GCG CGA CAA GCT CAA CCG CAC ACT CAA ATC GAC CTC 3` 区R: 5`TG CCA GAG CAG ATT TTT 391 CAG GAC AAC TGC TAT CGC TTT GCC GGT TATCAC CCG TAC TAC C 3`F 30 62? 47% 421 TGC CTG AAT GTG TCG CGC CAT ACG CTG GAG R 30 63? 50% 451 CGG GAT GGC GAG CCG ATT AAA CTG ACC CGC 481 GCA GAG TAT GAA ATG TTG GTG GCA TTT GTG 511 ACG AAT CCG GGC GAA ATT CTC AGC CGT GAA 541 CGT CTG CTA CGT ATG CTT TCT GCG CGT CGG 571 GTG GAA AAC CCT GAC CTG CGC ACC GTC GAT 601 GAG TTA ATT CGT CGT TTA CGT CAT AAA CTC 631 AGC GCG GAT TTA CTG GTG ACG CAA CAT GGT 661 GAA GGT TAT TTC TTA GCC GCT GAT GTG TGC 691 TGA总结:ASP53F: 5` CG GTA GAT TTA ATT CTG CTG CAT ATC AAC T 3`3` GTC TTA GTC A GC CAT CTA AAT TAA GAC GAC G 5`ARG119F: 5` GTG AAA AAT CTG CTC TGG CAA ATC GAC CTC 3`3` C CAT CAT GCC CAC TTT TTA GAC GAG ACC GT5`F: 5` CG GTA GAT TTA ATT CTG F: 5` GTG AAA AAT CTG CTC TGGCTG CAT ATC AAC T 3` AA ATC GAC CTC 3` CR: 5`TG CCA GAG CAG ATT TTT R: 5` G CAG CAG AAT TAA ATCTAC CGA CTG ATT CTG 3` CAC CCG TAC TAC C 3`F 30bp 58? 37% F 30 62? 47%R 31 bp 60? 42% R 30 63? 50%ASP53-P1 CGGTAGATTTAATTCTGCTGCATATCAACT ASP53-P2 GCAGCAGAATTAAATCTACCGACTGATTCTG ARG119-P1 GTGAAAAATCTGCTCTGGCAAATCGACCTC ARG119-P2 TGCCAGAGCAGATTTTTCACCCGTACTACC ASP53-P1 CggTAgATTTAATTCTgCTgCATATCAACTASP53-P2 gCAgCAgAATTAAATCTACCgACTgATTCTgARG119-P1 gTgAAAAATCTgCTCTggCAAATCgACCTCARG119-P2 TgCCAgAgCAgATTTTTCACCCgTACTACC。
氨基酸密码子对照表
丙氨酸 Ala nine A 或 Ala 89.079 CH 3 - 脂肪族类精氨酸 Argi nineR 或 Arg174.188HN=C(NH 2 )-NH-(CH 2 ) 3 碱性氨基酸 类天冬酰胺 Asparag ine N 或 Asn 132.104 H 2 N-CO-CH 2 - 酰胺类 天冬氨酸 Aspartic acid D 或 Asp 133.089 HOOC-CH 2 - 酸性氨基酸 类 半胱氨酸 Cystei ne C 或 Cys 121.145 HS-CH 2 -含硫类 谷氨酰胺 Glutami ne Q 或 Gln 146.131 H 2 N-CO-(CH 2 ) 2 - 酰胺类—寸谷氨酸 Glutamic acid E 或 Glu 147.116 HOOC-(CH 2 ) 2 - 酸性氨基酸 类 甘氨酸 Glyc ine G 或 Gly 75.052H-脂肪族类 组氨酸 Histidi ne H 或 His 155.141 N=CH-NH-CH=C-CH 2 - | | 碱性氨基酸 类 异亮氨酸 Isoleuc ine I 或 Ile 131.160 CH 3 -CH 2 -CH(CH 3 )- 脂肪族类 亮氨酸 Leuci ne L 或 Leu 131.160 (CH 3 ) 2 -CH-CH 2 - 脂肪族类 赖氨酸 Lysine K 或 Lys146.17H 2 N-(CH 2 ) 4 -碱性氨基酸 类 蛋氨酸 Methio nineM 或 Met 149.199 CH 3 -S-(CH 2 ) 2 -含硫类 苯丙氨酸 Pheny lala ni ne F 或 Phe 165.177 Phe nyl-CH 2 - 芳香族类 脯氨酸 Proli ne P 或 Pro 115.117 -N-(CH 2 ) 3 -CH- | | 亚氨基酸 丝氨酸 Serine S 或 Ser 105.078 HO-CH 2 - 羟基类苏氨酸 ThreonineT 或 Thr119.105 CH 3 -CH(OH)-羟基类色氨酸 Tryptopha n W 或 Trp 204.213 Phe nyl-NH-CH=C-CH 2 - | | 芳香族类 酪氨酸Tyros ine Y 或 Tyr 181.176 4-OH-Phe nyl-CH 2 - 芳香族类 缬氨酸Vali ne V 或 Val117.133 CH 3 -CH(CH 2 )-脂肪族类uCAGcotte Amino Acid codeAmino Acid codeAmino Ackf codeAmino Aciduuu pbeucuUAU加UGUcys UuucuccUAC UGCcUUA leuOCAUAASTOP □GASTOP A UUGIK ;GUAGSTOP UGG trpG cnuecuCAMliis CGUueye levCCCproCAC CGC argcCVACCACAA gbrtCGAA eucCCGCAGCGGG AUUACUMVacriAGU ser U Al*CiteACCth 『AACAGCC AUAACA AAA 1声AGA argA AUGmetACGAAG AGGG GUUGCUGAU□Lttn,GGU□ GUCvalGCCakaGACGGCgtyC GUAGCA 3g*uGGAA GUGGCGGAGGGGGSeconed PosHion与核苷酸序列相关的特征关键词表与蛋白质序列相关的特征关键词表。
看懂遗传密码蛋白质合成的字母表
看懂遗传密码蛋白质合成的字母表遗传密码是指在生物体中,RNA分子通过识别DNA上的密码编码信息,并将其转化为特定的氨基酸序列,进而参与蛋白质的合成过程。
这个过程中,存在着一种由三个碱基组成的密码字母表,被称为遗传密码。
遗传密码的破译对于我们理解生命的起源和发展过程具有重要意义。
本文将详细解读遗传密码的组成和遗传密码蛋白质合成的过程。
一、遗传密码的组成遗传密码是由四种碱基(腺嘌呤、胸腺嘧啶、鸟嘌呤和胞嘧啶)组成的,通过它们按照特定的规则排列组合,可以编码出20种常见的氨基酸。
具体组成如下:腺嘌呤(A):- AAA:赖氨酸(Lys)- AAC:天冬氨酸(Asp)- AAG:天冬氨酸(Asp)- AUG:蛋氨酸(Met)胸腺嘧啶(T):- UAA:终止密码子- UAC:酪氨酸(Tyr)- UAG:终止密码子- UGU:硫氨酸(Cys)鸟嘌呤(G):- GAA:谷氨酸(Glu)- GAC:天冬氨酸(Asp)- GAG:谷氨酸(Glu)- GGU:甘氨酸(Gly)胞嘧啶(C):- CAA:谷氨酰胺(Gln)- CAC:组氨酸(His)- CAG:谷氨酰胺(Gln)- CGU:精氨酸(Arg)通过将这些碱基按照特定的编码规则排列组合,生物体能够合成出各种各样的蛋白质。
二、遗传密码蛋白质合成的过程遗传密码蛋白质合成的过程主要包括转录和翻译两个阶段。
1. 转录(Transcription)转录是遗传密码蛋白质合成的第一步,即将DNA上的遗传信息转录成RNA分子。
转录过程主要包括以下几个步骤:(1)启动子结合:RNA聚合酶会在DNA上找到一个称为启动子的特定序列,并与启动因子结合,形成转录复合体。
(2)RNA合成:RNA聚合酶将在DNA的反义链上,根据遗传密码进行配对,将RNA链逆向合成,直到遇到终止密码子。
(3)终止:当RNA聚合酶读取到终止密码子时,RNA链会与DNA分离。
转录过程中生成的RNA分子被称为信使RNA(mRNA),它将作为蛋白质合成的模板。
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第一位 5'端 第二位(中间) U 苯丙氨酸 Phe F 苯丙氨酸 Phe F U 亮氨酸 Leu L 亮氨酸 Leu L 亮氨酸 Leu L 亮氨酸 Leu L C 亮氨酸 Leu L 亮氨酸 Leu L 异亮氨酸 Ile I 异亮氨酸 Ile I A 异亮氨酸 Ile I 甲硫氨酸 Met M 缬氨酸 Val V 缬氨酸 Val V G 缬氨酸 Val V 缬氨酸 Val V 丙氨酸 Ala A 丙氨酸 Ala A 谷氨酸 Glu E 谷氨酸 Glu E 甘氨酸 Gly G 甘氨酸 Gly G A G 苏氨酸 Thr T 苏氨酸 Thr T 丙氨酸 Ala A 丙氨酸冬氨酸 Asp D 精氨酸 Arg R 精氨酸 Arg R 甘氨酸 Gly G 甘氨酸 Gly G A G U C 脯氨酸 Pro P 脯氨酸 Pro P 苏氨酸 Thr T 苏氨酸 Thr T 谷氨酰胺 Gln Q 谷氨酰胺 Gln Q 天冬酰胺 Asn N 天冬酰胺 Asn N 精氨酸 Arg R 精氨酸 Arg R 丝氨酸 Ser S 丝氨酸 Ser S A G U C 丝氨酸 Ser S 丝氨酸 Ser S 脯氨酸 Pro P 脯氨酸 Pro P 终止 stop @ 终止 stop @ 组氨酸 His H 组氨酸 His H 终止 stop @ 色氨酸 Trp W 精氨酸 Arg R 精氨酸 Arg R A G U C C 丝氨酸 Ser S 丝氨酸 Ser S A 酪氨酸 Tyr Y 酪氨酸 Tyr Y G 半胱氨酸 Cys C 半胱氨酸 Cys C 第三位 3'端 U C