基因工程原理(徐晋麟) 课件归纳总结要点
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第一章基因工程的分子生物学基础
1、基因工程(遗传工程、基因操作、重组DNA技术等):细胞外用各种方法产
生的核酸分子插入载体分子中,形成遗传物质的新组合,最终整合掺入到本来不含这些核酸分子的宿主生物中,并进行复制繁衍。
基因工程诞生的理论基础:①DNA双螺旋模型;②基因是可以转移的;③操作子模型的建立;④遗传密码子的破译。
基因工程的技术基础:①工具酶(DNA连接酶、内切酶、反转录酶);②PCR 技术;③载体技术;基因转移技术。
2、DNA复制:①两条互补的反向平行的DNA单链之间由众多氢键连接(G-C、
A-T)形成稳定DNA双链分子;②DNA合成的起始需要引物提供3,羟基,DNA聚合酶按照5→3方向合成DNA。
3、限制性内切酶:
I类酶II类酶III类酶
酶分子三亚基双功能内切酶与甲基化酶分
离
二亚基双功能识别位点二分非对称序列4-8bp序列,回文结构5-7bp非对称序列
切割位点距识别位点1000bp 在识别位点中或靠识
别位点在识别位点下游24-26bp
限制性反应与甲基化反应互斥分开反应同时竟争
限制作用需要需要不需要
限制酶剪切:
黏性末端:指DNA分子在限制酶的作用下形成的具有互补碱基的单链延伸末端
结构,它们能够通过互补碱基间的配对而重新环化起来。(①5’突出的黏性末端;②3’突出的黏性末端。)
③平末端:两条链上的断裂位置是处在一个对称结构的中心,形成的DNA片段
具有平末端。
产生黏性末端的酶:
a、同尾酶:一组来源不同识别序列各异的,但能够切割形成相同粘性末端的核
酸内切限制酶。
b、同裂酶:有一些来源不同的限制性内切酶能识别并切割相同的核苷酸靶序列,
这类酶称为同裂酶。
4、连接酶:能够催化两条双链DNA链之间形成5′,3′磷酸二酯键的酶
①E. coli DNA 连接酶(只连接粘末端)
利用NAD(烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)作为能量供体,主要来源于原核生物。
②T4 DNA连接酶(粘末端和平末端)
利用ATP作为能量供体,主要来源于真核生物,T4噬菌体也属于此类。
在基因工程的实验中主要用T4 DNA连接酶。
5、核酸的分离纯化:通过各种方法将生物材料破碎,释放DNA(RNA)至溶
液中,去除杂质(如用苯酚萃取蛋白质),再用乙醇沉淀核酸,通过离心,分离纯化核酸,最后用低浓度盐溶液溶解核酸。
细菌DNA的提取:细菌培养物的生长和收集→细胞提取物的制备→从细胞提取物中纯化DNA→DNA取样的浓缩→DNA浓度的测量(A260/A280=1.8)。凝胶电泳:(弱碱性条件)根据DNA或RNA 分子的大小,形状和拓扑结构,将DNA和RNA进行分离的技术。
6、链终止法测序,技术路线与要求:
制备单链模板→将单链模板与一小段引物退火→加入DNA多聚酶,4种脱氧核苷酸,分别加入少量4种双脱氧核苷酸→将4种反应产物分别在4条泳道电泳→根据4个碱基在4条泳道的终止位置读出基因序列。
7、Southern印迹(DNA印迹):
(1) 提取组织中的DNA,并用内切酶消化,进行琼脂糖凝胶电泳;
(2) 将DNA片段转移到固体支持物(硝酸纤维素滤膜或尼龙膜)上;
(3) 预杂交滤膜,掩盖滤膜上非特异性位点;
(4) 让探针与同源DNA片段杂交,然后漂洗除去非特异性结合的探针;
(5) 通过显影检查目的DNA所在的位置,以及信号的强度。
应用:限制性片段长度多态性;确定基因组中基因的拷贝数。
Northern(RNA)印迹:检测基因的表达。
Western (蛋白质)印迹:把电泳分离的组分从凝胶转移到一种固相支持体,并以针对特定氨基酸序列的特异性试剂作为探针检测之。(蛋白表达量的检测,组织特异性蛋白定位的检测等)
8、实验:鉴定特定基因转录物的转录起点:
(通过核酸酶处理来研究DNA-RNA(RNA-RNA)杂交物)
a、确定转录起始的位置(首先将可能的包含转录起始点以及上游的DNA克隆
进入载体,获得单链的DNA片段;加入转录物,进行温育,退火,杂交;
用S1核酸酶降解单链部分,获得RNA-DNA杂合双链;通过碱变性,降解RNA;检测被RNA保护的DNA片段的长度;判断所克隆的DNA片段中转录起始点的位置。)
b、通过引物延伸来研究转录物,确定转录起始点(获知转录物的部分序列;设
计引物;通过反转录对引物延伸;对产物进行检测;确定转录的起始点位置。)
第二章原核生物分子克隆的宿主和载体系统
1、E. coli K12 的生物学:①革兰氏阴性细菌;②没有核膜和染色体;③一个环
状双链DNA分子,有一个复制起点;④细胞中能维持质粒DNA的复制;⑤生活周期较短,20min分裂一次;⑥能在发酵罐中高密度生长;⑦能在平板上培养出单克隆。
2、乳糖操纵子
利用β-半乳糖苷酶及其基因;
β-半乳糖苷酶能分解乳糖的类似物X-gal形成蓝色物质,可用此反应来检测细胞中β-半乳糖苷酶的活性。
3、X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-B-D-半乳糖苷)
①当细菌不携带质粒时,在抗生素培养基上无法生长;
②当有质粒时,(1)多克隆位点MCS无外源片段插入,ɑ+w=完整lacZ;(2)MCS有外源片段插入(ɑ无功能,不能与ɑ互补,故不能分解X-gal),形成白色菌斑。
4、质粒的生物学:共价闭环,双链DNA分子;具有复制原点,能独立进行复
制,不依赖寄主的细胞复制周期;赋予寄主一些表型特征,如抗生素抗性;
选择性标记。
拷贝数:①严谨型:少数拷贝存在于细胞中(1~几个);②松弛型:多个拷贝存在于细胞中(≥10)。严谨型与松弛型是相对的。