基因克隆-256页PPT
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基因的克隆方法ppt课件

1)直接从基因组中扩增过程: (1)提取基因组DNA作模板 (2)根据目的基因序列设计引物 (3)PCR扩增及产物鉴定
31
提取基因组DNA
PCR引物设计
PCR扩增
基因序列分析
此法适合扩增原 核生物基因。
真核生物基因组含有内含子32 !
2)从mRNA中扩增: RT-PCR
(1)提取基因组 total RNA (2)反转录合成总cDNA作模板 (3)根据目的基因序列设计引物 (4)PCR扩增及序列分析
工作量大。 无法定量研究。 扩出的条带往往是3`端比较短的UTR区的一
段序列,提供的信息较少。
19
优点:
简便、灵敏、高效、省时,能快速显示 mRNA的组成。
所需的mRNA量少。 各样本mRNA的差异可同时进加标签的基因克隆 方法野生株构建基因组 基因苗构建基因组文 库基因苗
阳性克隆
获得阳性克隆 目的基因
基因序列分析,24 确定为基因
转座子标签法
转座子又称转座因子或者跳跃因子,实 际上也是DNA片段,它可以在生物的染色 体组中移动,从染色体的一个位点跳到另 一个位点,或从一条染色体跳到另一条染 色体上,引起基因功能的改变。
mRNA
5` RP
A T C G
AAAAAAAA
A C
TTTTTTTTTT
G
3`
15
mRNA
5` RP
A T C G
AAAAAAAA
A C
TTTTTTTTTT
G
3`
AATTTTTTTT ACTTTTTTTT AGTTTTTTTT TATTTTTTTT
TCTTTTTTTT TGTTTTTTTT CATTTTTTTT CCTTTTTTTT CGTTTTTTTT GATTTTTTTT
31
提取基因组DNA
PCR引物设计
PCR扩增
基因序列分析
此法适合扩增原 核生物基因。
真核生物基因组含有内含子32 !
2)从mRNA中扩增: RT-PCR
(1)提取基因组 total RNA (2)反转录合成总cDNA作模板 (3)根据目的基因序列设计引物 (4)PCR扩增及序列分析
工作量大。 无法定量研究。 扩出的条带往往是3`端比较短的UTR区的一
段序列,提供的信息较少。
19
优点:
简便、灵敏、高效、省时,能快速显示 mRNA的组成。
所需的mRNA量少。 各样本mRNA的差异可同时进加标签的基因克隆 方法野生株构建基因组 基因苗构建基因组文 库基因苗
阳性克隆
获得阳性克隆 目的基因
基因序列分析,24 确定为基因
转座子标签法
转座子又称转座因子或者跳跃因子,实 际上也是DNA片段,它可以在生物的染色 体组中移动,从染色体的一个位点跳到另 一个位点,或从一条染色体跳到另一条染 色体上,引起基因功能的改变。
mRNA
5` RP
A T C G
AAAAAAAA
A C
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3`
15
mRNA
5` RP
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基因克隆操作过程PPT课件

Takara网站提供的同尾酶信息
.
12
2011-10-23
基因克隆操作过程
12
5'
TGATCA
ACTAGT
5'
BclI
5'
GGATCC
CCTAGG
BamHI
GGATCC
CCTAGG
5'
5'
T
5' GATCA
ACTAG 5'
T
5'
a)获得连接方 向不同的两种 5' 产物;
退火
T GATCC ACTAG G
5'
GCATGCCCCCC G
C GGGGGGACGTC
CTGCAGGGGGG C
G CCCCCCGTACG
5'
CTGCAGGGGGG C
G CCCCCCGTACG
5'
Klenow
T4-DNA ligase
PstI
5'
GCATGCCCCCCTGCAG
CGTACGGGGGGACGTC
PstI
CTGCAGGGGGGCATGC
C
C
3' CCCCCCGTACG
G 3' GGGGGGACGTC
CTGCAGGGGGG 3' G
退火
5'
GCATGCCCCCC G
C GGGGGGACGTC
CTGCAGGGGGG C
G CCCCCCGTACG
5'
Klenow
T4-DNA ligase
5'
GCATGCCCCCCTGCAG
CGTACGGGGGGACGTC
.
12
2011-10-23
基因克隆操作过程
12
5'
TGATCA
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5'
BclI
5'
GGATCC
CCTAGG
BamHI
GGATCC
CCTAGG
5'
5'
T
5' GATCA
ACTAG 5'
T
5'
a)获得连接方 向不同的两种 5' 产物;
退火
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CTGCAGGGGGG C
G CCCCCCGTACG
5'
CTGCAGGGGGG C
G CCCCCCGTACG
5'
Klenow
T4-DNA ligase
PstI
5'
GCATGCCCCCCTGCAG
CGTACGGGGGGACGTC
PstI
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C
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3' CCCCCCGTACG
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退火
5'
GCATGCCCCCC G
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CTGCAGGGGGG C
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5'
Klenow
T4-DNA ligase
5'
GCATGCCCCCCTGCAG
CGTACGGGGGGACGTC
基因的克隆与表达PPT课件

2.真核表达系统:使外源基因在真核细 胞中表达的体系。
.
32
二.原核生物基因结构和表达特点
.
33
1. 原核生物染色体DNA是裸露的环形 DNA,其转录和翻译是偶联的连续 进行。
2. 原核生物形成多顺反子mRNA: mRNA在合成过程中和多个核糖体 结合,翻译形成多条肽链。
.
34
3、一般不含内含子(intron),没有转 录及翻译后加工系统
• PCR过程中,普通的Taq酶可在产 物的3’端多加一个A
.
17
五、基因克隆的工作流程
(一)目的基因的获得
1、直接分离3、构建cDNA4、PCR5、人工合成
6、差异显示
.
18
1、直接物的基因组DNA切割成一定大 小的片段,并与合适的载体重组后 导入宿主细胞,进行克隆。这些存 在于所有重组
11
三、受体细胞
1、定义:外源DNA导入的细胞,是 重组体扩增的场所。
2、要求:易于接纳外源DNA
无特异的内源性核酸内切酶
载体复制、扩增不受阻
与载体有互补性
.
12
四、体外重组的策略
1、粘末端连接 1)全同源粘末端连接 • 最方便简单 • 高背景-载体自身环化 • 双向插入
.
13
2)定向克隆:使外源基因定向插入到载体 中的克隆策略
基因的克隆与表达
.
1
➢基因克隆(gene cloning) ➢基因表达(gene expression)
-原核基因表达 -真核基因表达
.
2
基因克 隆 Gene Cloning
.
3
➢概述 ➢克隆载体 ➢受体细胞 ➢体外重组的策略 ➢基因克隆工作流程
.
32
二.原核生物基因结构和表达特点
.
33
1. 原核生物染色体DNA是裸露的环形 DNA,其转录和翻译是偶联的连续 进行。
2. 原核生物形成多顺反子mRNA: mRNA在合成过程中和多个核糖体 结合,翻译形成多条肽链。
.
34
3、一般不含内含子(intron),没有转 录及翻译后加工系统
• PCR过程中,普通的Taq酶可在产 物的3’端多加一个A
.
17
五、基因克隆的工作流程
(一)目的基因的获得
1、直接分离3、构建cDNA4、PCR5、人工合成
6、差异显示
.
18
1、直接物的基因组DNA切割成一定大 小的片段,并与合适的载体重组后 导入宿主细胞,进行克隆。这些存 在于所有重组
11
三、受体细胞
1、定义:外源DNA导入的细胞,是 重组体扩增的场所。
2、要求:易于接纳外源DNA
无特异的内源性核酸内切酶
载体复制、扩增不受阻
与载体有互补性
.
12
四、体外重组的策略
1、粘末端连接 1)全同源粘末端连接 • 最方便简单 • 高背景-载体自身环化 • 双向插入
.
13
2)定向克隆:使外源基因定向插入到载体 中的克隆策略
基因的克隆与表达
.
1
➢基因克隆(gene cloning) ➢基因表达(gene expression)
-原核基因表达 -真核基因表达
.
2
基因克 隆 Gene Cloning
.
3
➢概述 ➢克隆载体 ➢受体细胞 ➢体外重组的策略 ➢基因克隆工作流程
第六基因克隆张幻灯片(共65张PPT)

E.coli + 0.1M CaCl2
0-4℃
Low-osmosis makes cell expanding
competent cells (E.coli)
Recombinant DNA + 42 ℃
Heat makes cell more expanding and membrane more permeable
those
转化步骤后,转进重组质粒的细胞是较少的。 因此需要挑选出含有重组子的细胞。
31
第三十一页,共65页。
1. Direct selection
直接筛选
• Antibotic resistance
抗菌素抗性
• Marker rescue selection
• In situ hybridization
重新筛选插入的片断困难
11
第十一页,共65页。
A1 A
2
vector
B
2 A
vector
1 B
平齐末端连接时,插入的方向是
随机的,称为双向插入。会给后续的 工作造成很多麻烦。
12
第十二页,共65页。
单酶切粘末端连接
EcoRI
EcoRI
13
第十三页,共65页。
14
第十四页,共65页。
单酶切粘末端连接的特点
氯化钙法 :利用氯化钙和热休克使受体菌成为
感受态细胞,促进外源 DNA的进入。
24
第二十四页,共65页。
宿主细胞与重组DNA在00C的低渗氯化钙溶 液中孵育,快速转入420C造成热休克。经此处 理后的细胞“容易”接受外源的DNA,一般叫
做感受态细胞。
25
第二十五页,共65页。
0-4℃
Low-osmosis makes cell expanding
competent cells (E.coli)
Recombinant DNA + 42 ℃
Heat makes cell more expanding and membrane more permeable
those
转化步骤后,转进重组质粒的细胞是较少的。 因此需要挑选出含有重组子的细胞。
31
第三十一页,共65页。
1. Direct selection
直接筛选
• Antibotic resistance
抗菌素抗性
• Marker rescue selection
• In situ hybridization
重新筛选插入的片断困难
11
第十一页,共65页。
A1 A
2
vector
B
2 A
vector
1 B
平齐末端连接时,插入的方向是
随机的,称为双向插入。会给后续的 工作造成很多麻烦。
12
第十二页,共65页。
单酶切粘末端连接
EcoRI
EcoRI
13
第十三页,共65页。
14
第十四页,共65页。
单酶切粘末端连接的特点
氯化钙法 :利用氯化钙和热休克使受体菌成为
感受态细胞,促进外源 DNA的进入。
24
第二十四页,共65页。
宿主细胞与重组DNA在00C的低渗氯化钙溶 液中孵育,快速转入420C造成热休克。经此处 理后的细胞“容易”接受外源的DNA,一般叫
做感受态细胞。
25
第二十五页,共65页。
基因克隆简介ppt课件

5’3’-
5’3’-
GAATTC CTTAAG
G AATTC CTTAA G
-3’ -5’
-3’ -5’
14
(4)粘性末端的意义 ①连接便利
i)不同的DNA双链: 只要粘性末端碱基互补就可以连接。 这比连接两个平齐末端容易的多。
ii)同一个DNA分子内连接: 通过两个相同的粘性末端可以连接成环 形分子。
pBR322质粒
pBR322质粒是由三个不同来源的部分组成的:第 一部分来源于pSF2124质粒的氨苄青霉素抗性基 因(ampr);
第二部分来源于pSC101质粒的四环素抗性基因 (tetr);
第三部分则来源于ColE1的派生质粒pMB1的DNA
复制起点(ori)。
27
PstI
ScaI
Ampr
HindIII BamHI
④ lacZ的a肽互补 1)a-肽( lacZ’ ):
b-半乳糖苷酶N端的一段氨基酸片断 (11-41氨基酸),该段基因序列连接到 pUC载体上。
受体菌基因组的b-半乳糖苷酶基因的 缺失a肽(氨基端有缺失),不能形成 活性酶,不能分解Xgal
37
⑤ 载体lacZ’与a互补
pUC质粒载体上的lacZ’ 编码a肽与这个 缺失突变的b-半乳糖苷酶“互补”,又 能分解Xgal。产生蓝色物质。
15
16
2. DNA 连接酶 3.1 DNA连接酶(ligase)的发现
从细菌DNA环化现象推测,必定存在一种能 把两条DNA双链连接到一起的酶。
DNA复制一定有断口。 17
3.2 DNA ligase的特点
1. 两种DNA连接酶
(1)大肠杆菌连接酶 只能连接粘性末端。
(2)T4噬菌体的连接酶 不但能连接粘性末端, 还能连接齐平末端。
基因克隆PPT课件

(1)构建 由 pBR 质 粒 与 M13 噬 菌 体 构 建 成 的 双 链 DNA质粒载体,长2674bp,1983年构建。
.
14
主要特点:氨苄青霉素抗性基因、lac Z基因、
复制起始点(ori)
.
15
(2)筛选原理及方法
含 有 来 自 大 肠 杆 菌 的 lacZ 操 纵 子 的 DNA 片 段 (lacZ基因),编码β-半乳糖苷酶氨基端的一个片 段。此片段能与宿主细胞所编码的缺陷型β-半乳糖 苷酶实现基因内互补(α互补),形成完整的β-半乳 糖苷酶。该酶能分解X-gal,形成蓝色菌落。
基因工程及体外表达体系 (2).载体
心血管病研究所 王佐
.
1
一、概述
外源DNA一般没有明显的遗传标志,如果 将其导入宿主细胞,没有有效的方法将导 入了外源DNA的细胞和未导入外源DNA的 细胞区分开来。
外源DNA导入宿主细胞后,不能随宿主细 胞的繁殖而复制,达不到使外源DNA片段 扩增的目的。
.
2
.
35
YAC载体序列包括着丝粒序列(CEN1)、端粒序列(TEL 使
线形DNA的完全复制和保护染色体末端免于核酸酶的降解)、
自主复制序列(ARS1 主导染色体DNA的自主复制)、氨苄青
霉素抗性基因(Amp)、源于E.coli的复制起始区(ori)。
.
36
由于酵母细胞内真正必需的DNA片段主要 限于几百碱基对,因而就可以用酵母染色体 复 制 子 ARS 元 件 构 建 新 型 的 克 隆 载 体 。
.
21
λ噬菌体载体在细菌中以溶菌状态生长。它有两种 形式:插入载体和替代载体。
DNA与λ噬菌体载体组成重组DNA分子后,还不能直接 转染宿主细胞,必须首先包装成有活性的成熟噬菌体颗粒 后才具有转染宿主细胞的能力,重组DNA分子能否被噬菌 体包装蛋白、头部所识别而被包装,除必须含有cos位点 外,就是对重组DNA分子长度有严格的限制,必须不能大 于野生型基因组长度的105%或小于75%,否则均不能被 包装成有活性的噬菌体颗粒,因此噬菌体载体大致允许插 入外源基因的长度范围为15~25kb。
.
14
主要特点:氨苄青霉素抗性基因、lac Z基因、
复制起始点(ori)
.
15
(2)筛选原理及方法
含 有 来 自 大 肠 杆 菌 的 lacZ 操 纵 子 的 DNA 片 段 (lacZ基因),编码β-半乳糖苷酶氨基端的一个片 段。此片段能与宿主细胞所编码的缺陷型β-半乳糖 苷酶实现基因内互补(α互补),形成完整的β-半乳 糖苷酶。该酶能分解X-gal,形成蓝色菌落。
基因工程及体外表达体系 (2).载体
心血管病研究所 王佐
.
1
一、概述
外源DNA一般没有明显的遗传标志,如果 将其导入宿主细胞,没有有效的方法将导 入了外源DNA的细胞和未导入外源DNA的 细胞区分开来。
外源DNA导入宿主细胞后,不能随宿主细 胞的繁殖而复制,达不到使外源DNA片段 扩增的目的。
.
2
.
35
YAC载体序列包括着丝粒序列(CEN1)、端粒序列(TEL 使
线形DNA的完全复制和保护染色体末端免于核酸酶的降解)、
自主复制序列(ARS1 主导染色体DNA的自主复制)、氨苄青
霉素抗性基因(Amp)、源于E.coli的复制起始区(ori)。
.
36
由于酵母细胞内真正必需的DNA片段主要 限于几百碱基对,因而就可以用酵母染色体 复 制 子 ARS 元 件 构 建 新 型 的 克 隆 载 体 。
.
21
λ噬菌体载体在细菌中以溶菌状态生长。它有两种 形式:插入载体和替代载体。
DNA与λ噬菌体载体组成重组DNA分子后,还不能直接 转染宿主细胞,必须首先包装成有活性的成熟噬菌体颗粒 后才具有转染宿主细胞的能力,重组DNA分子能否被噬菌 体包装蛋白、头部所识别而被包装,除必须含有cos位点 外,就是对重组DNA分子长度有严格的限制,必须不能大 于野生型基因组长度的105%或小于75%,否则均不能被 包装成有活性的噬菌体颗粒,因此噬菌体载体大致允许插 入外源基因的长度范围为15~25kb。
基因克隆的基本理论及实验技术ppt课件

CTG GAC 连接酶 CTGATT GACTAA
ATT TAA
GAATTC CTTGGA
内切酶和连接酶是基因克隆实验中两种 重要的工具酶,它们如同分子生物学家剪刀
和针线,可以任意地将感兴趣的基因片段进
行切割和连接,实现DNA序列的重组。
质粒(plasmid)和载体(vector)有什么区别?
质粒是指细菌细胞质中的小型环状DNA分子,是
2686 bp
P(LAC) O RI
A pa LI (1121)
A pa LI (178)
P(BLA)
A pa LI (2367)
ALPHA
E co RI (397) A va I (413) X m aI (413) Sm a I (415)
EcoR I
Hind III
PCR扩增
AP r
pU C 19
co coli
DNA连接酶
DNA连接酶是1967年在三个实验室同时发现的,最初是在大
肠杆菌细胞中发现的。它是一种封闭DNA链上缺口酶,借助
ATP或NAD水解提供的能量催化DNA链的5’-PO4与另一DNA 链的3’-OH生成磷酸二酯键将两条紧邻DNA链连接起来。
G CTTGG 连接酶
AATTC A
质粒的重要特征
(1) 是染色质外的环形双链DNA分子; (2)能自主复制,是能独立复制的复制子;
(3)质粒对宿主生存并不是必需的;
(4)质粒上常带有耐抗生素基因; (5)质粒DNA上有多个酶切位点。
限制性核酸内切酶
限制性核酸内切酶(restriction endonuclease):是从细菌中分离 出来的一种识别并切割特异的双链DNA序列的内切核酸酶。 目前已从多种细菌中分离出超过400种,识别各自不同的核苷 酸顺序。
基因克隆常用的方法PPT演示文稿

12
图3真核生物12种mRNA的序列特点
13
根据这12种mRNA序列可合成12种相应的反转录引物,即 M’N’TTTTTTTT……,用其分别进行反转录,即可将所有mRNA分类合成 12种cDNA(于12个试管内),然后再用随机引物,以这12种cDNA分别做 模板进行PCR扩增(见图1和图4),那么与表型相关的mRNA就很容易被 发现并克隆出来。但不论AP-PCR还是DD-PCR,都适用于2种种源近似生 物或不同发育阶段的同一个体之间的比较。因而,其PCR的模板必须是 来自2个生物或同一生物的不同发育阶段的mRNA。DD-PCR的优点是快 速、方便,可以检测表达量极低的mRNA,但其技术条件要求较高,所 扩增的mRNA的质量不能有差异,即mRNA不应降解。目前这一方法已广 泛应用于生物表型相关基因的克隆及比较研究。
2
目前,以Genbank的应用最频繁。这些基因库是相互联 系的,在Genbank注册的基因序列,也可能在Swissport注册。 要克隆某个基因可首先通过Internet查询一下该基因或相 关库中拿出来,根据整 个基因序列设计特异的引物,通过PCR从基因组中克隆该基 因,也可以通过RT-PCR克隆cDNA。值得注意的是,由于物 种和分离株之间的差异,为了保证PCR扩增的准确性,有必 要采用两步扩增法,即nested PCR。
基因克隆的几种常用方法
根据已知序列克隆基因 未知序列的基因打靶 根据已知探针克隆基因 用特异抗体克隆基因 特异基因的功能克隆
1
1、根据已知序列克隆基因
对已知序列的基因克隆是基因克隆方法中最为简便的一种。获取基因 序列多从文献中查取,即将别人报道的基因序列直接作为自己克隆的依据。 目前,世界上主要的基因库有: (1)EMBL,为设在欧洲分子生物学实验室的基因库,
图3真核生物12种mRNA的序列特点
13
根据这12种mRNA序列可合成12种相应的反转录引物,即 M’N’TTTTTTTT……,用其分别进行反转录,即可将所有mRNA分类合成 12种cDNA(于12个试管内),然后再用随机引物,以这12种cDNA分别做 模板进行PCR扩增(见图1和图4),那么与表型相关的mRNA就很容易被 发现并克隆出来。但不论AP-PCR还是DD-PCR,都适用于2种种源近似生 物或不同发育阶段的同一个体之间的比较。因而,其PCR的模板必须是 来自2个生物或同一生物的不同发育阶段的mRNA。DD-PCR的优点是快 速、方便,可以检测表达量极低的mRNA,但其技术条件要求较高,所 扩增的mRNA的质量不能有差异,即mRNA不应降解。目前这一方法已广 泛应用于生物表型相关基因的克隆及比较研究。
2
目前,以Genbank的应用最频繁。这些基因库是相互联 系的,在Genbank注册的基因序列,也可能在Swissport注册。 要克隆某个基因可首先通过Internet查询一下该基因或相 关库中拿出来,根据整 个基因序列设计特异的引物,通过PCR从基因组中克隆该基 因,也可以通过RT-PCR克隆cDNA。值得注意的是,由于物 种和分离株之间的差异,为了保证PCR扩增的准确性,有必 要采用两步扩增法,即nested PCR。
基因克隆的几种常用方法
根据已知序列克隆基因 未知序列的基因打靶 根据已知探针克隆基因 用特异抗体克隆基因 特异基因的功能克隆
1
1、根据已知序列克隆基因
对已知序列的基因克隆是基因克隆方法中最为简便的一种。获取基因 序列多从文献中查取,即将别人报道的基因序列直接作为自己克隆的依据。 目前,世界上主要的基因库有: (1)EMBL,为设在欧洲分子生物学实验室的基因库,
基因的克隆PPT课件

载体的种类
质粒
1.大肠杆菌质粒 2.革兰氏阳性菌的质粒
噬菌体 真核细胞为宿主的克隆载体
1.酵母为宿主的载体 2.植物细胞为宿主的载体 3.DNA病毒载体
反转录病毒载体
大肠杆菌的质粒
pBR322质粒:它是由4361个核苷酸组成,属于松弛型质粒, 可以用抗氨苄西林和抗四环素基因作为标记,具有多种常用 内切酶的切点。
基因表达产物的鉴定
基因表达:指某基因在细胞中转录为mRNA继而翻译 成蛋白质的过程。
DNA
RNA
Protein
转录
翻译
研究基因表达的手段
1、RT-PCR (RNA) 2、Northern blot (RNA) 3、Western blot (蛋白质) 4、免疫组化 (蛋白质)
1、RT-PCR
基因的克隆 -----DNA重组技术。
克隆:是用无性繁殖的方法产生一组遗传上相同的细 胞或生物群体的过程,而这些细胞或个体均来自无性 繁殖的单一原型细胞。
基因的克隆:用DNA重组技术使一个基因或DNA片 段产生出很多相同拷贝的过程。
基因克隆的技术路线的大体步骤
得出结论
步骤三: 步骤二: 步骤一:
多 克 隆 位 点
X-gal :5-溴-4-氯-3-吲哚-B-D-半乳糖苷
表示 外源 基因 插入 编码 半乳 糖苷 酶的 基因 区段
带有正确插入目的基因序列的菌落,白色菌落
不对 能照 是目 培的 养基 基因 变本 色身
使用含Amp+X-Gal的琼脂糖平板筛选克隆,可能出现三种情况。 1 . 载体自身环化,产生蓝色菌落; 2 带有正确插入目的基因序列的菌落,白色菌落。 3 未转化的细胞,不能生长。
目的基因插入 到抗四环素基 因的位置,则 导入菌体后的 菌株则不能在 有四环素的培 养基上生长
《基因克隆操作过程》PPT课件

CGATCC GCTAGG
GGATCG CCTAGC
基因克编隆辑操pp作t 过程
GGATC CCTAG 5'
c)目的产物中 对应位置的序 5' 列不再是原来 的酶切位点
5'
14
(4)双酶联合酶切产生的不同粘性末端的连接
CTGCAGNNNNNNNNNGGATCC GACGTCNNNNNNNNNCCTAGG
PstI
BamHI
GGATCC CCTAGG
BamHI
CTGCA G
a)连接产物中 目的基因的方 向是确定的。
2011-10-23
GATCC G
退火
GATCC G
CTGCA G G ACGTC
G GATCC CCTAG G
T4-DNA ligase
CTGCAG GACGTC
GGATCC CCTAGG
Takara网站提供的同尾酶信息
编辑ppt
12
2011-10-23
基因克隆操作过程
12
5'
TGATCA
ACTAGT
5'
BclI
5'
GGATCC
CCTAGG
BamHI
GGATCC
CCTAGG
5'
5'
T
5' GATCA
ACTAG 5'
T
5'
a)获得连接方 向不同的两种
5'
产物;
退火
T GATCC ACTAG G
DNA ligase
切
接
转
增 检
2011-10-23
基因克编隆辑操pp作t 过程
基因克隆载体PPT幻灯片

二、基因克隆载体
(一)载体的功能及特征 (二)质粒 (三)噬菌体或病毒DNA (四)Cos质粒与噬菌粒 (五)人工染色体载体
(一)载体的功能及特征
载体(vector):
在基因工程操作中,能携带外源DNA 进入受体细胞的DNA分子。
载体的功能: 运送外源基因高效转入受体细胞; 为外源基因提供复制能力或整合能力; 为外源基因的扩增或表达提供必要的条件。
2、不相容性(incompatibility)
指任何两种含相似复制子结构的不同 质粒,不能同时存在于一个细胞中。
分子机制:
两种含不同复制子结构的不同质粒,在 复制时受各自的拷贝数控制系统调节,致使 两种质粒的最终拷贝数恒定,经若干复制周 期和细胞分裂周期后,仍能共处于同一细胞 内。
两种含相似复制子结构的不同质粒,在 复制时受同一拷贝数控制系统的干扰,致使 两种质粒的最终拷贝数不同,其中拷贝数多 的质粒在以后的细胞分裂周期中更具优势。
1)接合型质粒:
除带有自我复制所必需的遗传信息外,还带 有一套控制细菌配对和质粒接合转移的基因。
能在天然条件下自发地从一个细胞转移到另 一个细胞,如F质粒。
2)非接合型质粒:
虽带有自我复制所必需的遗传信息,但失 去了控制细菌配对和质粒接合转移的基因。
不能在天然条件下独立地发生接合作用, 如ColE1质粒。
2)存在于细菌、真菌、 蓝藻、酵母等细胞中。
plasmid DNA
Genomic DNA
The genomic DNA of E.coli: a single circular double-stranded DNA, with the contour length about 850 times longer than the cell
(一)载体的功能及特征 (二)质粒 (三)噬菌体或病毒DNA (四)Cos质粒与噬菌粒 (五)人工染色体载体
(一)载体的功能及特征
载体(vector):
在基因工程操作中,能携带外源DNA 进入受体细胞的DNA分子。
载体的功能: 运送外源基因高效转入受体细胞; 为外源基因提供复制能力或整合能力; 为外源基因的扩增或表达提供必要的条件。
2、不相容性(incompatibility)
指任何两种含相似复制子结构的不同 质粒,不能同时存在于一个细胞中。
分子机制:
两种含不同复制子结构的不同质粒,在 复制时受各自的拷贝数控制系统调节,致使 两种质粒的最终拷贝数恒定,经若干复制周 期和细胞分裂周期后,仍能共处于同一细胞 内。
两种含相似复制子结构的不同质粒,在 复制时受同一拷贝数控制系统的干扰,致使 两种质粒的最终拷贝数不同,其中拷贝数多 的质粒在以后的细胞分裂周期中更具优势。
1)接合型质粒:
除带有自我复制所必需的遗传信息外,还带 有一套控制细菌配对和质粒接合转移的基因。
能在天然条件下自发地从一个细胞转移到另 一个细胞,如F质粒。
2)非接合型质粒:
虽带有自我复制所必需的遗传信息,但失 去了控制细菌配对和质粒接合转移的基因。
不能在天然条件下独立地发生接合作用, 如ColE1质粒。
2)存在于细菌、真菌、 蓝藻、酵母等细胞中。
plasmid DNA
Genomic DNA
The genomic DNA of E.coli: a single circular double-stranded DNA, with the contour length about 850 times longer than the cell
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构成:质粒复制起始点、一个或多个限制性 内切酶位点、抗药性基因、λ噬菌体的cos位 点。粘粒载体大小为4~6kb。
粘粒克隆外源DNA的步骤:
外源DNA与粘粒载体用同一种内切酶酶切; 连接酶连接,外源DNA插入到两个线状粘粒之间; 离体包装,组成成熟的噬菌体颗粒。该过程对DNA分子长 度有严格的限制,过长或过短均不能被包装,所以虽然粘 粒只有几千个碱基,但要求插入的外源基因却必须是大片 段(25~45kb)。 体外包装好的颗粒感染宿主菌,重组载体由于缺乏噬菌体 其他部分基因,故不能像噬菌体一样复制,只能像质粒一 样扩增。
克隆载体与表达载体
克隆载体:主要用来获得大量纯化的目的DNA 片段(目的基因),以便进一步研究其结构和 功能;本章主要以克隆载体为例讲解。 表达载体:主要用来产生插入基因和mRNA, 进而合成相关蛋白质。
二、质粒载体
1 概念
Plasmid : 细 菌 染 色 体 外小型双链环状DNA,对 细菌的某些代谢活动和抗 药性的表型具有一定的作 用。
宿主细胞,常见的有大肠杆菌、酵母等。
2载体的特征:
能自主复制; 具备筛选标记; 适当大小的分子量和适当限制性内切酶 酶切位点; 在细胞中拷贝数高 除上述特征外,表达载体还应配备有与 宿主细胞相适应的启动子、前导顺序、 加尾信号、增强子等调控DNA元件。
3 载体的分类
按来源分:质粒、噬菌体、病毒载体等; 按用途和功能分:克隆载体和表达载体。
外源基因插入载体后,lacZ被破坏,不能分解 X-gal,菌落呈白色。——“蓝白斑”筛选法。
7质粒载体的主要用途
保存和扩缺点:所能接受的DNA片段容量小;转化效率低。
三、λ噬菌体载体
λ噬菌体的基因组是约50kb的线性双链 DNA分子,两端各有12个核苷酸的5’突 出,碱基互补(cos位点,又称粘端)。 λ噬菌体感染宿主菌后,其粘端通过碱基 配对而结合,形成环状DNA分子。
1λ噬菌体在细菌内的生长方式:
裂菌性生长(lytic pathway):在宿主菌中大 量复制并组装成子代噬菌体颗粒,导致宿主菌 裂解。 溶菌性生长(lysogenic pathway):整合到 宿主菌DNA分子中,随宿主菌DNA复制并转到 子代细菌中。
2λ噬菌体结构
野生型的λ噬菌体基因组庞大而复杂,有约48.5kb,约占基因组总长 度30%的中间部分的基因对噬菌体生长是非必需的,可以直接插入外源 基因或切除该区域而由外源基因代替而不影响噬菌体的生存。
主要特点:氨苄青霉素抗性基因、lac Z基因、 复制起始点(ori)
(2)筛选原理及方法
含 有 来 自 大 肠 杆 菌 的 lacZ 操 纵 子 的 DNA 片 段 (lacZ基因),编码β-半乳糖苷酶氨基端的一个片 段。此片段能与宿主细胞所编码的缺陷型β-半乳糖 苷酶实现基因内互补(α互补),形成完整的β-半乳 糖苷酶。该酶能分解X-gal,形成蓝色菌落。
Autonomously replicating DNA molecules
(have an origin of replication)
Selectable marker, such as drug resistance Insertion site for foreign DNA
(often a genetically engineered multiple cloning region with sites for several restriction enzymes)
λ噬菌体载体在细菌中以溶菌状态生长。它有两种 形式:插入载体和替代载体。
DNA与λ噬菌体载体组成重组DNA分子后,还不能直接 转染宿主细胞,必须首先包装成有活性的成熟噬菌体颗粒 后才具有转染宿主细胞的能力,重组DNA分子能否被噬菌 体包装蛋白、头部所识别而被包装,除必须含有cos位点 外,就是对重组DNA分子长度有严格的限制,必须不能大 于野生型基因组长度的105%或小于75%,否则均不能被 包装成有活性的噬菌体颗粒,因此噬菌体载体大致允许插 入外源基因的长度范围为15~25kb。
multiple cloning sites
人工合成的DNA序列,含有密 集排列的多种限制性内切酶识别 序列,以利于不同来源的外源 DNA片段插入载体。
Hale Waihona Puke pBR系列载体4 pBR质粒载体筛选的原理
5 pBR质粒载体的筛选方法——双抗生素对照筛选法
6 pUC系列载体
(1)构建 由 pBR 质 粒 与 M13 噬 菌 体 构 建 成 的 双 链 DNA质粒载体,长2674bp,1983年构建。
一、概述
外源DNA一般没有明显的遗传标志,如果 将其导入宿主细胞,没有有效的方法将导 入了外源DNA的细胞和未导入外源DNA的 细胞区分开来。 外源DNA导入宿主细胞后,不能随宿主细 胞的繁殖而复制,达不到使外源DNA片段 扩增的目的。
1载体(vector)
携带靶DNA片段(外源DNA片段) 进入宿主细胞进行扩增和表达的工具。
2 严紧型质粒与松驰型质粒的区别
严紧型质粒
松驰型质粒
质粒复制所需的酶
每个细胞中所含的质 粒数 质粒复制与细菌复制 的关系 在基因克隆中的应用 前景
DNA聚合酶 Ⅲ
1~5个
密切
小
DNA聚合酶Ⅰ
10~200个以上 能在没有蛋白质合成 的情况下继续复制
大
3 Specificity of Plasmid Vectors
此载体中央部分两端有三个酶切位点。可插 入片段的行真核基因组文 库构建时,其容量仍然受到一定的限 制。最大插入片段不能超过23kb。
四、粘粒载体
1978年构建,由质粒和噬菌体的cos粘 性末端构建而成。插入片段29~45kb。 可根据载体携带的抗药性标记筛选阳性 克隆细胞株。
3 插入载体
经人工改造而成,具有单一的 EcoRⅠ 酶 切 位 点 , 该 酶 切 位 点 位 于 lacZ基因内,使用蓝白斑筛选法。插入 片 段 长 度 约 几 个 k 替代载体
λ噬菌体基因组中央部分约有14kb主要 编码抑制性因子,非裂菌性生长所必需, 作为载体这部分可被外源DNA所替代。