酵母转化手册(译自Yeastmaker
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新转化的酵母菌株的储存 1. 如果要保存新转化的酵母菌株,用接种环(牙签)接种单菌落。 2. 用包含 15–30% 无菌甘油的 0.5 ml YPD 或 YPDA 液体培养基(或者适宜的 SD 培养基)重悬菌体,接入 2mL 离心管 3. 用封口膜封紧盖子,轻轻混匀,速冻后放入‐70℃冰箱保存。 4. 如需使用该菌株,在冰上充分溶解后,挑适量菌液,在 YPD 或 YPDA 固体 培养基(或者适宜的 SD 培养基)上划线培养。(在划线前要充分混匀菌液)
PEG/LiAc 溶液(聚乙二醇 3350/醋酸锂 溶液) 先配置母液:50% PEG 3350、10X TE Buffer 和 1 M LiAc (10X),转化前再配置工作液,
现配现用。
母液
工作液各组分 配置 10mL 工作液所 要求的终浓度 需各组分母液体积
50% PEG 3350
40%
8 ml
本手册仅供学习交流,不做其他用途,如需 word 版本请发送站内信。
6. 酵母转化方法 A. 方法:酵母感受态细胞的制备 1. 材料 Yeastmaker Yeast Transformation System 2 (Cat. No. 630439) 1.1x TE/LiAc (Section 4) YPDA 固体培养基 YPDA 液体培养基 适宜的 SD 筛选培养基 酵母细胞 (S. cerevisiae)冷冻保存液 无菌(去离子)水(去离子水就是超纯水) 2. 挑酵母菌株(Y1HGold)在 YPDA 固体培养基上划板,30℃倒置培养,待菌生长至 适宜大小(约 3 天)。 注意:此时可以暂停实验,将平板转入暗下,4℃可保持 1 个月,待继续实验时将 平板再放入 30℃,菌落会继续生长。 3. 挑单菌落(直径 2–3 mm,储存时间<4 周),接种于有 3 ml YPDA 液体培养基的三 角瓶(规格:15mL)中。 (温馨提示:同时挑 4 个单菌落,接种到 4 个三角瓶中,最后挑生长速度最快的 菌落继续实验) 4. 在 30℃摇床中,以 250rpm 摇 8–12 小时。 5. 转大瓶:吸取 5uL 菌液转入有 50mL YPDA 液体培养基的三角瓶(规格:250mL)中。 6. 在 30℃摇床中,以 250rpm 继续摇 16–20 小时,期间测 OD,待 OD600 达到 0.15–0.3 时停止摇菌。 注意:一定要持续摇菌至 OD 值合适时停止,但培养时间不能过长。 7. 室温下,700 g 离心 5 min 收集菌体,弃上清,用滤纸吸干残余液体,加入 100mL YPDA 液体重悬菌体。 8. 在 30℃摇床中,以 250rpm 继续摇 3–5 小时至 OD600 达到 0.4–0.5。 注意:一定要持续摇菌至 OD 值合适时停止,但培养时间不能过长。 9. 将菌液分装至 2 个灭过菌的 50mL 离心管中,室温下 700 g 离心 5 min 收集菌体。 弃上清,用滤纸吸干残余液体,2 个离心管中各加入 30mL 灭过菌的超纯水,重悬 菌体。 10. 室温下 700 g 离心 5 min 收集菌体。弃上清,用滤纸吸干残余液体,2 个离心管中 各加入 1.5 ml 1.1xTE/LiAc 重悬菌体, 11. 将菌液分别转至 2 个 1.5mL 离心管中,高速离心 15s。 12. 弃上清,2 个 1.5mL 离心管各加入 600 µl 1.1xTE/LiAc,重悬菌体,酵母感受态细胞 已制备好,可用于转化质粒 DNA。 注意:为了使转化效率尽可能的高,感受态要现配现用,但是此感受态细胞在冰 上储存几个小时并不会明显降低转化效率。
(**变性方法: 用 95–100°C 高温处理 5 min,迅速置入冰上数分钟,待温度降至 4℃再重复一次此步骤)
3. 加入感受态细胞,轻柔混匀 4. 加入 PEG/LiAc,轻柔混匀 5. 置于 30℃恒温箱孵化
(注意:期间 Small‐Scale 每隔 10min,Library‐Scale 每隔 15min,轻轻倒混几次)
高速离心 15s 700 g 离心 5 min
12. 弃上清,加入 0.9% (w/v) NaCl 溶液重悬菌体
1 ml
15 ml
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C. 方法:涂板、判定转化效率 1. 将菌液分别稀释 10 倍、100 倍,分别吸取 100 µl 稀释液,涂布到相应的 SD 筛选 培养基上。例如: pGBKT7 载体用 SD/‐Trp 培养基 pGADT7 载体用 SD/‐Leu 培养基 pGBKT7 和 pGADT7 共转,用 SD/‐Leu/‐Trp 培养基 注意:不要直接用未稀释的菌液涂板。
50 µl 500 µl 30 min
600 µl 2.5 ml 45 min
6. 加入 DMSO,轻柔混匀
20 µl
160 µl
7. 在 42℃水浴锅中温浴
(注意:期间 Small‐Scale 每隔 5 min,Library‐Scale 每隔 10 min,轻轻倒混几次)
15 min
20 min
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B. 方法:转化酵母感受态细胞 1. 材料 Yeastmaker Yeast Transformation System 2 酵母感受态细胞(Section 6.A) PEG/LiAc (Section 4) 0.9% (w/v) NaCl DMSO 2. 将下列组分加入到已经预冷的无菌离心管中,混合均匀。
2. 30℃恒温箱倒置培养 3–5 天,待菌落长至适宜大小 3. 用下列公式计算转化效率
转化效率 = 单菌落数 X 悬浮细胞液总体积(mL) 涂板的菌液体积(mL) X DNA 总量(ug)
(如果是用 10 倍稀释液或 100百度文库倍稀释液涂板,还要乘以相应的倍数)
例如:转化 100 ng pGBT9 空载体(Yeastmaker Yeast Transformation System 2 的阳性对照质粒),将 1 ml 菌液稀释 10 倍,吸取 100 uL 涂板,培养 3 天后,在 SD/Trp 上长出 300 个单菌落,其转化效率为:
10X TE Buffer
1X
1 ml
1 M LiAc(10X)
1X
1 ml
0.9% (w/v) NaCl 溶液 称取 0.9g NaCl,溶解于 80mL 超纯水中,用容量瓶定容至 100mL,过滤灭菌。
5. 酵母菌株储存条件 如果想要了解更多关于酵母的知识,推荐去看 Guide to Yeast Genetics and Molecular
2. 组分内容
3. 所需的附加材料 A. Clontech 的 Ready‐to‐Go Media Pouches Clontech 提供提供预先混合好的培养基,以方便使用 表 1 酵母转化实验所需要的培养基组分
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B.培养基的配法 配置好的培养基溶于 500mL ddH2O,121℃高压蒸汽灭菌 15min,在使用前要降 至常温,(液体培养基也可以过滤灭菌)。灭菌时间不能过长。
8. 离心收集菌体
高速离心 15s 700 g 离心 5 min
9. 弃上清,加入 YPD Plus 培养基
(注意:使用 YPD Plus 可提高转化效率 50‐100%,此步骤不要使用普通 YPD 培养基)
1 ml
3 ml
10. 30° C 摇床震荡培养
可忽略此步骤 90 min
11. 离心收集菌体
Clontech 公司提供的预先混合好的培养基不需要调 pH,但是如果配置使用的 ddH2O 偏酸性,就要将 pH 调到 5.8。
关于培养基配置的更多细节可以查询 Clontech Yeast Media Protocol‐at‐a‐Glance (PT4057‐2)。
4. 酵母转化所需溶液 1.1X TE/LiAc 溶液 先配置母液:10X TE buffer 和 1 M LiAc (10X),转化前再配置工作液,现配现用。 混合 1.1 mL 10X TE buffer 和 1.1 mL 1 M LiAc (10X),再加入 8.8mL 灭过菌的超纯水, 定容至 10mL,混合均匀。
质粒 DNA(浓度、纯度高) 变性的**Yeastmaker 宿主 DNA (10 µg/µl)
Small‐Scale (1.5 ml tube) 100 ng 5 µl
Library‐Scale (15 ml tube) 5–15 µg* 20µl
(* For example, use 5 µg of bait + 10 µg of prey for yeast two‐hybrid library cotransformation. )
Biology, by Guthrie & Fink (1991) and Molecular Biology and Genetic Engineering of Yeasts, edited by Heslot & Gailardin (1992).
酵母菌在用封口膜封住的 YPD 或 YPDA 培养皿上,4℃可以保持 2 个月。但是新 鲜的菌种(1‐3 周)接菌到液体培养基上后活力更佳。
转化效率=
300 x 1 x 10(稀释倍数) 0.1 x 0.1
=3x105 cfu/μg
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酵母转化手册 译自 Clontech Yeastmaker™ Yeast Transformation 目录 1. 简介 2. 组分内容 3. 所需的附加材料
A. Clontech 的 Ready‐to‐Go Media Pouches B. 培养基配方 4. 酵母转化所需溶液 5. 酵母菌株储存条件 6. 酵母转化方法 A. 方法:酵母感受态细胞的制备 B. 方法:转化酵母感受态细胞 C. 方法:涂板、判定转化效率 7. 参考文献
System 2
User Manual(PT1172‐1)
图表 表 1:酵母转化实验所需要的培养基组分
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1. 简介
Yeastmaker™ Yeast Transformation System 2 提供了一种高效的 PEG/醋酸锂 酵母细胞转化法,本方法适用于所有的酵母转化,包括酵母单杂交系统和酵母双 杂交系统。 此方法提供了一种比常规转化方法更为高效,转化效率更高也更为可信的技术, 如果要筛文库,较高的转化效率是必要的条件,你的文库包含的克隆数越多,你 就越有可能发现新的、稀有的相互作用,此方法之所以较其他方法转化效率更高, 是因为该方法包含一个特殊又重要的步骤:在加入 DNA 和 DMSO 处理后,加入 YPD Plus 液体培养基培养酵母细胞(帮助酵母细胞摄取更多的质粒 DNA)。使用此方 法,可以获得≥3 X 105 转化子/ug 质粒 DNA。
PEG/LiAc 溶液(聚乙二醇 3350/醋酸锂 溶液) 先配置母液:50% PEG 3350、10X TE Buffer 和 1 M LiAc (10X),转化前再配置工作液,
现配现用。
母液
工作液各组分 配置 10mL 工作液所 要求的终浓度 需各组分母液体积
50% PEG 3350
40%
8 ml
本手册仅供学习交流,不做其他用途,如需 word 版本请发送站内信。
6. 酵母转化方法 A. 方法:酵母感受态细胞的制备 1. 材料 Yeastmaker Yeast Transformation System 2 (Cat. No. 630439) 1.1x TE/LiAc (Section 4) YPDA 固体培养基 YPDA 液体培养基 适宜的 SD 筛选培养基 酵母细胞 (S. cerevisiae)冷冻保存液 无菌(去离子)水(去离子水就是超纯水) 2. 挑酵母菌株(Y1HGold)在 YPDA 固体培养基上划板,30℃倒置培养,待菌生长至 适宜大小(约 3 天)。 注意:此时可以暂停实验,将平板转入暗下,4℃可保持 1 个月,待继续实验时将 平板再放入 30℃,菌落会继续生长。 3. 挑单菌落(直径 2–3 mm,储存时间<4 周),接种于有 3 ml YPDA 液体培养基的三 角瓶(规格:15mL)中。 (温馨提示:同时挑 4 个单菌落,接种到 4 个三角瓶中,最后挑生长速度最快的 菌落继续实验) 4. 在 30℃摇床中,以 250rpm 摇 8–12 小时。 5. 转大瓶:吸取 5uL 菌液转入有 50mL YPDA 液体培养基的三角瓶(规格:250mL)中。 6. 在 30℃摇床中,以 250rpm 继续摇 16–20 小时,期间测 OD,待 OD600 达到 0.15–0.3 时停止摇菌。 注意:一定要持续摇菌至 OD 值合适时停止,但培养时间不能过长。 7. 室温下,700 g 离心 5 min 收集菌体,弃上清,用滤纸吸干残余液体,加入 100mL YPDA 液体重悬菌体。 8. 在 30℃摇床中,以 250rpm 继续摇 3–5 小时至 OD600 达到 0.4–0.5。 注意:一定要持续摇菌至 OD 值合适时停止,但培养时间不能过长。 9. 将菌液分装至 2 个灭过菌的 50mL 离心管中,室温下 700 g 离心 5 min 收集菌体。 弃上清,用滤纸吸干残余液体,2 个离心管中各加入 30mL 灭过菌的超纯水,重悬 菌体。 10. 室温下 700 g 离心 5 min 收集菌体。弃上清,用滤纸吸干残余液体,2 个离心管中 各加入 1.5 ml 1.1xTE/LiAc 重悬菌体, 11. 将菌液分别转至 2 个 1.5mL 离心管中,高速离心 15s。 12. 弃上清,2 个 1.5mL 离心管各加入 600 µl 1.1xTE/LiAc,重悬菌体,酵母感受态细胞 已制备好,可用于转化质粒 DNA。 注意:为了使转化效率尽可能的高,感受态要现配现用,但是此感受态细胞在冰 上储存几个小时并不会明显降低转化效率。
(**变性方法: 用 95–100°C 高温处理 5 min,迅速置入冰上数分钟,待温度降至 4℃再重复一次此步骤)
3. 加入感受态细胞,轻柔混匀 4. 加入 PEG/LiAc,轻柔混匀 5. 置于 30℃恒温箱孵化
(注意:期间 Small‐Scale 每隔 10min,Library‐Scale 每隔 15min,轻轻倒混几次)
高速离心 15s 700 g 离心 5 min
12. 弃上清,加入 0.9% (w/v) NaCl 溶液重悬菌体
1 ml
15 ml
本手册仅供学习交流,不做其他用途,如需 word 版本请发送站内信。
C. 方法:涂板、判定转化效率 1. 将菌液分别稀释 10 倍、100 倍,分别吸取 100 µl 稀释液,涂布到相应的 SD 筛选 培养基上。例如: pGBKT7 载体用 SD/‐Trp 培养基 pGADT7 载体用 SD/‐Leu 培养基 pGBKT7 和 pGADT7 共转,用 SD/‐Leu/‐Trp 培养基 注意:不要直接用未稀释的菌液涂板。
50 µl 500 µl 30 min
600 µl 2.5 ml 45 min
6. 加入 DMSO,轻柔混匀
20 µl
160 µl
7. 在 42℃水浴锅中温浴
(注意:期间 Small‐Scale 每隔 5 min,Library‐Scale 每隔 10 min,轻轻倒混几次)
15 min
20 min
本手册仅供学习交流,不做其他用途,如需 word 版本请发送站内信。
B. 方法:转化酵母感受态细胞 1. 材料 Yeastmaker Yeast Transformation System 2 酵母感受态细胞(Section 6.A) PEG/LiAc (Section 4) 0.9% (w/v) NaCl DMSO 2. 将下列组分加入到已经预冷的无菌离心管中,混合均匀。
2. 30℃恒温箱倒置培养 3–5 天,待菌落长至适宜大小 3. 用下列公式计算转化效率
转化效率 = 单菌落数 X 悬浮细胞液总体积(mL) 涂板的菌液体积(mL) X DNA 总量(ug)
(如果是用 10 倍稀释液或 100百度文库倍稀释液涂板,还要乘以相应的倍数)
例如:转化 100 ng pGBT9 空载体(Yeastmaker Yeast Transformation System 2 的阳性对照质粒),将 1 ml 菌液稀释 10 倍,吸取 100 uL 涂板,培养 3 天后,在 SD/Trp 上长出 300 个单菌落,其转化效率为:
10X TE Buffer
1X
1 ml
1 M LiAc(10X)
1X
1 ml
0.9% (w/v) NaCl 溶液 称取 0.9g NaCl,溶解于 80mL 超纯水中,用容量瓶定容至 100mL,过滤灭菌。
5. 酵母菌株储存条件 如果想要了解更多关于酵母的知识,推荐去看 Guide to Yeast Genetics and Molecular
2. 组分内容
3. 所需的附加材料 A. Clontech 的 Ready‐to‐Go Media Pouches Clontech 提供提供预先混合好的培养基,以方便使用 表 1 酵母转化实验所需要的培养基组分
本手册仅供学习交流,不做其他用途,如需 word 版本请发送站内信。
B.培养基的配法 配置好的培养基溶于 500mL ddH2O,121℃高压蒸汽灭菌 15min,在使用前要降 至常温,(液体培养基也可以过滤灭菌)。灭菌时间不能过长。
8. 离心收集菌体
高速离心 15s 700 g 离心 5 min
9. 弃上清,加入 YPD Plus 培养基
(注意:使用 YPD Plus 可提高转化效率 50‐100%,此步骤不要使用普通 YPD 培养基)
1 ml
3 ml
10. 30° C 摇床震荡培养
可忽略此步骤 90 min
11. 离心收集菌体
Clontech 公司提供的预先混合好的培养基不需要调 pH,但是如果配置使用的 ddH2O 偏酸性,就要将 pH 调到 5.8。
关于培养基配置的更多细节可以查询 Clontech Yeast Media Protocol‐at‐a‐Glance (PT4057‐2)。
4. 酵母转化所需溶液 1.1X TE/LiAc 溶液 先配置母液:10X TE buffer 和 1 M LiAc (10X),转化前再配置工作液,现配现用。 混合 1.1 mL 10X TE buffer 和 1.1 mL 1 M LiAc (10X),再加入 8.8mL 灭过菌的超纯水, 定容至 10mL,混合均匀。
质粒 DNA(浓度、纯度高) 变性的**Yeastmaker 宿主 DNA (10 µg/µl)
Small‐Scale (1.5 ml tube) 100 ng 5 µl
Library‐Scale (15 ml tube) 5–15 µg* 20µl
(* For example, use 5 µg of bait + 10 µg of prey for yeast two‐hybrid library cotransformation. )
Biology, by Guthrie & Fink (1991) and Molecular Biology and Genetic Engineering of Yeasts, edited by Heslot & Gailardin (1992).
酵母菌在用封口膜封住的 YPD 或 YPDA 培养皿上,4℃可以保持 2 个月。但是新 鲜的菌种(1‐3 周)接菌到液体培养基上后活力更佳。
转化效率=
300 x 1 x 10(稀释倍数) 0.1 x 0.1
=3x105 cfu/μg
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酵母转化手册 译自 Clontech Yeastmaker™ Yeast Transformation 目录 1. 简介 2. 组分内容 3. 所需的附加材料
A. Clontech 的 Ready‐to‐Go Media Pouches B. 培养基配方 4. 酵母转化所需溶液 5. 酵母菌株储存条件 6. 酵母转化方法 A. 方法:酵母感受态细胞的制备 B. 方法:转化酵母感受态细胞 C. 方法:涂板、判定转化效率 7. 参考文献
System 2
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图表 表 1:酵母转化实验所需要的培养基组分
本手册仅供学习交流,不做其他用途,如需 word 版本请发送站内信。
1. 简介
Yeastmaker™ Yeast Transformation System 2 提供了一种高效的 PEG/醋酸锂 酵母细胞转化法,本方法适用于所有的酵母转化,包括酵母单杂交系统和酵母双 杂交系统。 此方法提供了一种比常规转化方法更为高效,转化效率更高也更为可信的技术, 如果要筛文库,较高的转化效率是必要的条件,你的文库包含的克隆数越多,你 就越有可能发现新的、稀有的相互作用,此方法之所以较其他方法转化效率更高, 是因为该方法包含一个特殊又重要的步骤:在加入 DNA 和 DMSO 处理后,加入 YPD Plus 液体培养基培养酵母细胞(帮助酵母细胞摄取更多的质粒 DNA)。使用此方 法,可以获得≥3 X 105 转化子/ug 质粒 DNA。