一些计算化学相关的免费的在线数据库、分子结构库及工具
分子模拟软件简介
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怎样搜索化学结构式
怎样搜索化学结构式化学结构式是用来描述化合物构成和连接方式的图形表示方法。
在化学领域,结构式的搜索是非常重要的,可以用于寻找特定的化合物、了解其性质和应用等。
下面将介绍一些常用的方法和工具,来帮助大家进行化学结构式的搜索。
1. 化学数据库化学数据库是存储大量化合物信息的资源,其中包含了化合物的结构式、性质、制备方法等。
通过查询化学数据库,可以找到想要的化合物的结构式。
一些常用的化学数据库包括:PubMed、ChemSpider、PubChem等。
在这些数据库中,用户可以通过关键字、化学式、结构式等进行搜索,并且可以进行进一步的筛选和排序来获取满足条件的化合物。
同时,一些化学数据库还提供了化学品的商品信息和供应商等相关信息。
2. 结构搜索引擎结构搜索引擎是专门用于搜索、检索和比对化学结构式的工具。
它们通过将用户输入的结构式与数据库中的化合物进行比对,从而找到相似的化合物或满足特定条件的化合物。
常见的结构搜索引擎有:ChemSpider、SciFinder等。
这些工具可以根据用户的需求,进行精确搜索或模糊搜索,并提供相应的结果和相关信息,如物理性质、制备方法、毒性等。
3. 软件和应用程序除了化学数据库和结构搜索引擎外,还有一些软件和应用程序可以帮助进行化学结构式的搜索。
例如,ChemDraw是一款常用的化学作图软件,可以通过绘制结构式来搜索相应的化合物。
此外,一些化学计算软件和模拟工具也提供了结构式的搜索功能,如Gaussian、VASP等。
这些工具除了能够搜索化合物,还可以用于分子建模、计算性质等应用。
4. 文献和专业资源除了在线数据库和搜索引擎外,还可以通过查阅相关的文献和专业资源来获取化学结构式。
化学期刊、学术论文、专利文献等都是搜集化学结构式的重要来源。
通过查询相关文献,可以了解到已有的研究工作、新发现的化合物等信息。
此外,一些化学参考书和手册也提供了大量的化学结构式的资料,可以作为补充参考。
分子模拟软件简介
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化学行业免费的谱图数据库18个
化学专业免费的谱图数据库18个1、【名称】ChemExper化学品目录CDD (包括MSDS、5000张红外谱图)【资源简介】The database contains currently more than 70 000 chemicals, 16000 MSDS, 5000 IR spectra and more than 20 suppliers. It is the only chemical database that lets you SUBMIT your own data! 【检索途径】You can find a chemical by its molecular formula, IUPAC name, common name, CAS number, catalog number, substructure or physical characteristics【地址】http://www.chemexper.be/【名称】 (NMR谱图数据库及NMR谱图预测)【资源简介】This is a web-based approach implementing a new java applet that enables to assign a chemical structure to the corresponding NMR spectrum by simply drawing lines between atoms and automatically characterized signals.This NMR predictor allows to predict the spectrum from the chemical structure based on Spinus (Structure-based Predictions In NUclear magnetic resonance Spectroscopy), which is an on-going project for the development of structure-based tools for fast prediction of NMR spectra developed by Gasteiger (http://www2.chemie.uni-erlangen.de/services/spinus/index.html). SPINUS - WEB currently accepts molecular structures via a Java molecular editor, and estimates 1H NMR chemical shifts.【地址】/2、【名称】BioMagResBank (BMRB): 多肽、蛋白质、核酸等的核磁共振数据存储库【资源简介】IntroductionBioMagResBank (BMRB) is the publicly-accessible depository for NMR results from peptides, proteins, and nucleic acids recognized by the International Society of Magnetic Resonance and by the IUPAC-IUBMB-IUPAB Inter-Union Task Group on the Standardization of Data Bases of Protein and Nucleic Acid Structures Determined by NMR Spectroscopy. In addition, BMRB provides reference information and maintains a collection of NMR pulse sequences and computer software for biomolecular NMR. Access to data in BMRB is free directly from its web site (URL ) and ftp site () and will remain so as public funding permits. The concept of a biomolecular NMR data bank developed under a five-year research grant awarded to the University of Wisconsin-Madison from the National Library of Medicine, National Institutes of Health. This grant was phased out after that period, and a Request for Applications was issued by the NIH for future support of this activity. BMRB at t he University of Wisconsin-Madison won this competition, has been supported since 1 September 1996 by the National Library of Medicine, NIH under grant 1 P41 LM05799. The current award for five years expires on 31 August 2004.AimsIn collaboration with the Protein Data Bank (PDB, Brookhaven National Laboratories) and Nucleic Acid Data Bank (NDB, Rutgers University), BMRB aims to develop into the collection site for structural NMR data in proteins and nucleic acids. Steps are being taken at BMRB to achieve this capability, which will include transmission of all relevant data to the PDB and NDB collections. In addition, BMRB has the goal of archiving NMR-specific data including assigned chemical shifts, J-couplings, relaxation rates, and chemical information derived from NMR investigations (for example, hydrogen exchange rates and pKa values). In developing these collections BMRB intends to be responsive to the needs and priorities of the scientific community. The operating policy at BMRB is monitored and shaped by its Advisory Board which meets once each year to review progress and set priorities. The Advisory Board is composed ofrepresentatives from laboratories that originate and/or use data within the BMRB p urview.【地址】/3、【名称】NIST Chemistry WebBook【资源简介】The November 1998 release of The NIST WebBook is the fifth edition of the NIST Chemistry WebBook. It contains thermochemical data for over 5000 organic and small inorganic compounds, reaction thermochemistry data for over 8000 reactions, IR spectra for over 5000 compounds, mass spectra for over 10,000 compounds, electronic / vibrational spectra for over 3000 compounds, constants ofdiatomic molecules (spectroscopic data) for over 600 compounds, Ion energetics data for over 14,000 compounds, and thermophysical property data for 16 fluids There are many avenues for searching the database. Structures are given for most species, as well as common and commercial names.【检索途径】Formula NamePartial formulaCAS registry numberStructure basedIon energeticsVibrational and electronic spectraMolecular weightAuthor【地址】/chemistry4、【名称】粉末衍射模式数据库PowBase (Powder Patterns Database)【资源简介】PowBase is a "minimum database" of constant wavelength powder patterns. The data files (zipped) contain either a CIF file or a .dat file (the latter can be viewed by WinPLOTR, option INSTRM=0).The search output produces entry numbers with hyperlink to the raw data (zipped files), the formula, wavelength, a comment, and a reference with email address. Some pertinent hyperlinks may be added, and also a VRML 3D view, sometimes.【地址】http://sdpd.univ-lemans.fr/powbase/5、【名称】上海有机化学所:化学数据库【资源简介】上海有机化学研究所的化学专业数据库由多个数据库组成,注册后可免费使用。
化学材料工程师常用物性数据专业网站集锦
化学材料工程师常用物性数据专业网站集锦化学和材料工程师常常需要使用物性数据来进行实验设计、材料选择和工艺优化等工作。
这些数据包括物质的化学成分、物理性质、热力学参数和机械性能等。
为了方便工程师们查找和使用这些数据,一些专业网站提供了大量的实验数据和计算工具。
在本篇文章中,我将介绍一些化学、材料工程师常用的物性数据专业网站。
1. NIST化学物性数据库(NIST Chemistry WebBook)2.物性数据库网(物性网)物性数据库网是一个专门收集整理物性数据和提供计算工具的网站,涵盖了多个领域的物质和性质。
网站提供了大量的物性数据,包括金属材料的力学性能、塑料材料的热性能、化学物质的热力学参数以及液体和气体的传输性质等。
此外,物性数据库网还提供了丰富的计算工具,例如物质浓度计算、流体力学计算和燃烧特性计算等。
3.ASM材料数据库ASM国际是一个材料工程师的专业组织,他们维护了一个名为“ASM 材料数据库”的网站,提供了包括金属材料、陶瓷材料和聚合物材料在内的大量材料的物性数据和相关信息。
这个数据库包括了各类材料的力学性质、热物性、电子性质和腐蚀性质等。
ASM材料数据库还提供了材料选择工具、相图计算和材料热处理指南等实用工具和技术手册。
4.化学品物性查询(化学物质数据库)5. 化学信息资源中心(Chemical Information Resources Center)总结起来,化学和材料工程师常用的物性数据专业网站集锦包括NIST化学物性数据库、物性数据库网、ASM材料数据库、化学品物性查询和化学信息资源中心等。
这些网站提供了大量的物性数据和相关信息,帮助工程师们获得准确和及时的物性数据,促进化学和材料工程的研究和应用。
化学研究常用数据库
Journal of the Chemical Society, Perkin Transactions, Part 2: An International Journal of Physical Organic Chemistry《英国化学会志:柏尔金汇刊第二辑(物理有机化学)》英国
Chemical Communications《化学通讯》英国
Talanta《塔兰塔》荷兰
方正阿帕比-阅读分享
/idoican/index.html
ScienceDirect - Home(常用的外文论文数据库,推荐使用)
/
IEEE Xplore- Guest Home Page(IEEE数据库)
542B0006-1B Journal of Physical chemistry B: Materials, Surfaces, Interfaces & Biophysical《物理化学杂志,B辑:材料、表面、界面与生物物理》美国
International Journal of Chemical Kinetics《国际化学动力学杂志》美国
/Xplore/guesthome.jsp
Elsevier —— 全球(主要是欧洲)学术书刊出版集团,提供论文在线投稿服务
/wps/find/homepage.cws_home
Engineering Village (著名的EI数据库)
Synthetic Communications《合成通讯》美国
Synthesis(Text in English) 《合成》德国
Research on Chemical Intermediates《化学媒介物研究》荷兰
绝对干货分享200个免费化学化工网站
绝对干货分享200个免费化学化工网站1、Web of Knowledge中ISI proceedings(ISTP的网络版):/portal.cgi 它是检索国际著名会议、座谈会、研讨会及其他各种会议录用论文的综合性多学科的权威数据库。
2、IEL(IEEE/IEEE Electronic Library)全文库:收录了美国电气与电子工程师(IEEE)学会和英国电气工程师学会(IEE)自1988年以来出版的约6000多种会议录(全文)。
3、INSPEC(英国科学文摘):/portal.cgi 由英国电气工程师学会(IEE)出版的文摘数据库,是物理学、电子工程、电子学、计算机科学及信息技术领域的权威性文摘索引数据库。
4、国家科技图书文献中心(NSTL):/ 提供了其下属成员馆馆藏外文会议论文的题录文摘。
5、CALIS学术会议论文库:/ 收录来自于之前称为“211工程”的61所重点学术每年主持的国际会议的论文。
6、国家科技图书文献中心的中文学位论文数据库(免费-文摘):/NSTL/7、中国优秀博硕士学位论文全文数据库(文摘免费,全文收费):/kns/brief/result.aspx?dbPrefix=CDMD8、目前提供电子版中文学位论文全文的数据库主要包括:中国优秀博硕士学位论文全文数据库(),其题录文摘库是免费查询的,查询全文需购买。
9、人大复印库:/Home/RDFUKIndex中国人民大学“复印报刊资料”数据库,源自1958年,致力于为人文社科学者、学术机构提供精优学术资源。
10、查询国外学位论文的途径可使用PQDD-B(UMI博硕士论文数据库):/可查询欧美1000余所大学1861年以来的160多万篇学位论文的信息,其中1997年以来的部分论文不但能看到文摘索引,还可以看到前24页的原文。
11、NASA Scientific and Technical Information Program:NASA(National Aeronautices & Space Administrantion)提供的有关航空航天方面的丰富的科技报告全文。
一些计算化学相关的免费的在线数据库
一些计算化学相关的免费的在线数据库、分子结构库及工具1 在线信息数据库部分ChemSpider小分子信息整合数据库:简介:是当前众多的在线分子数据库的信息整合,便于用户搜索,数据来自200种数据库。
根据分子俗名、系统命名、Smile/InChI字符串、注册号、分子式等方式搜索,会列出分子平面结构、实验测定和实时估算的理化性质(含LogP等)、毒性、分子简介、Smile/InChI/InChIKey字符串、在其它分子数据库中的编号和链接、相关文章及专利、同义词、相关蛋白质、NMR/IR光谱图等,某些分子还可以链入web CSD获得三维结构。
√ SDBS光谱数据库:http://riodb01.ibase.aist.go.jp/sdbs/cgi-bin/direct_frame_top.cgi简介:很好的有机化合物光谱数据库,包含六类光谱:EI-MS、FT-IR、H-NMR、C13-NMR、ESR、Raman。
含3万余个化合物,其中以商业化学试剂为主,约2/3的数据是6碳至16碳的化合物。
数据大部分是其自行测定的,并不断添加。
可以通过化合物、分子式、分子量、CAS/SDBS注册号、元素组成、光谱峰值位置/强度方式搜索。
生物核磁共振数据库:http://bmrb.protein.osaka-u.ac.jp/depositCRYSTAL程序基组数据库:/~mdt26/crystal.htmlTURBOMOLE程序基组数据库:/TURBOMOLE_BASISSET_LIBRARY/tbl.html√ 计算化学比较和基准数据库(CCCBDB):简介:此数据库包括各种量子化学方法、各种基组下对不同分子的各种属性的计算结果,也包含实验数据。
可用来对比不同方法计算结果优劣,此数据库内容在不断增加。
√ 量化频率计算校正因子:/vibscale.asp简介:实际上就是CCCBDB的一个子页面,比较重要故单独列出。
IUPAC金属络合物稳定常数数据库:注:需要付费,可免费下载试用版。
计算化学的软件工具和数据资源
计算化学的软件工具和数据资源计算化学是一种基于计算机科学的化学研究方法,它利用计算机模拟来预测化学物质的物理化学性质和反应机理。
随着计算机科学和化学研究的迅速发展,计算化学的应用已经得到广泛的推广和应用。
为了更加有效地使用计算化学方法,研究人员需要掌握一些计算化学的软件工具和数据资源,让我们一起来看看这些有用的工具和资源。
1. 分子模拟软件分子模拟软件是计算化学研究的核心工具。
它可以用来模拟分子的运动和反应,预测分子的结构、能量和性质。
常用的分子模拟软件有Gromacs、Amber、LAMMPS、CHARMM等。
这些软件通常需要一定的计算机编程技能,但是它们提供了很强的自由度和控制力,可以满足不同研究需求的要求,同时也是训练计算化学研究人员的基本技能。
2. 密度泛函理论软件密度泛函理论(DFT)是一种计算电子结构的方法,它可以用来预测分子的几何构型、电子能级和电荷分布等。
常用的DFT软件有Gaussian、VASP、Quantum ESPRESSO等。
这些软件通常需要一定的物理、数学和计算机科学知识,但是它们提供了很强的准确性和可靠性,可以用来研究很多重要的化学问题。
3. 虚拟筛选软件虚拟筛选软件是用来寻找化学药物和分子杂交物的软件工具。
它利用基于计算机的分子模拟和化学信息检索技术,可以从大规模化学库中筛选出具有特定生物活性的化合物。
常用的虚拟筛选软件有Autodock、Vina、Glide等。
这些软件允许研究人员进行高通量筛选和分子设计,可以大大提高化学药物和分子杂交物的研发速度和成功率。
除了这些软件工具之外,计算化学研究人员还需要掌握一些数据资源,这些数据资源可以用来支持计算化学研究的可靠性和准确性。
4. 化合物数据库和手册化合物数据库和手册是计算化学研究人员必备的资源之一。
它们收集了大量的化学结构、性质和反应信息,包括分子式、结构式、物理化学性质、毒性信息、化学反应机理等。
常用的化合物数据库和手册有Beilstein、PubChem、ChemSpider、EPA等。
化学数据网站
最全的化学数据库zz1. 化合物毒性相关数据库Toxnet /2毒性物质与健康和环境数据库/efdb/TSCA TS.htm3. 急性毒性数据库/data/acute/acute.html4. SpectraOnline,Galact /SpectraOnline/Default_ie.htm5. 药物使用指南,USP DI /medlineplus/druginformatio n.html6。
美国常用药物索引库RxList /7. 有机化合物光谱资料库系统http://www.aist.go.jp/RIODB/SDBS/menu-e.html8. NIST的Chemistry WebBook /chemistry/9. 化合物基本物性库10. 化学物质热力学数据/databases/key1.html11. 溶剂数据库SOLV-DB /solvdb.htm12. 三维结构数据库NCI-3D /nci3d/13. 有机合成手册数据库/14. Beilstein Abstracts /databases/belabs15. 有机合成文献综述数据库/... als/info/index.html16. 预测LogP和LogW /17. 物性、质谱、晶体结构数据库http://factrio.jst.go.jp/18. 网上光谱资料库/SpectraOnline/Default_ie.htm19. 中国科学院学位论文数据库/cgrs全球实用化学化工期刊和数据库网址资源名称:AIChE(美国化学工程师协会)资源地址:/获取途径:部分资源可免费查阅资源名称:American Chemical Society(美国化学学会网站)资源地址:/获取途径:大部分资源可免费查阅,34种期刊(/about.ht ml)全部免费阅览全文。
精选网络化学资源之一常用资源? A. 元素周期表WebElements -/B. 化合物性质(MSDS)ChemFinder服务/化学专家站点/ccd/power/index.shtml化学快查站点/scripts/main.aspV ermont安全信息资源公司/msds/index.htmlCornell大学/msdssrch.aspMSDS查找/C. 光谱学数据和有机化合物的查找NIMC站点http://www.aist.go.jp/RIODB/SDBS/menu-e.html化学专家站点ChemExper Chem. Directory -/ccd/pow er/index.shtmlNIST站点/chemistry/银河网/spconline/有机化学数据库/chemistry/cmp/cmp.htmlD. 家庭教师索引/tutorial.htm#tutorialE. 化学练习题/Malone3... one_site/Malone.htmF. 化学教育期刊索引(JCE)/Journal/Search/i ndex.htmlG. 搜索引擎Google -Alta Vista -/Fast -Hotbot -/Ixquick -/Dog-pile -/H. 化学关键词查找期刊摘要/(free registration, go to databases)精选网络化学资源之二化学物质的性质? A. 元素周期表1. Web Elements -/2. 其他有图表的元素周期表a./viselements/pages/periodic_table.htmlb.http://chemlab.p/periodic/periodic.htmlc./periodictable.htmld./yogi/periodic/e./Chemicool/3. Mendeleev表-/~giunta/mendeleev.html4. 其它元素周期表*/okapi/periodic3.htm/CapeCanaveral/4693/index.html/periodic.htm/smarsden/elements.htm/~holler/periodic/periodic.html/Chemistry/Links/refperiodic.html/WebChem/ProjectFrameSet.html//eleme... s/chemistry/rushin/StudentProjects/ElementWebsites/ElectPeriodicTable.htm/pt.htm/wgbh/nova/kaboom/elemental/*/*http://www.tabulka.cz/english/*http://www.vcs.ethz.ch/chemglobe/ptoe/*/*/physics/2000/applets/a2.html5. 元素周期表的目录列表/chemdex/periodic-tables.htmlhttp://www.anachem.umu.se/cgi-bin/pointer.exe?/HSG/GradChemistry.html#TABLES/~swenger/#periodic/m03ptabl.htmlhttp://macedonia.nrcps.ariadne-t... y2.pl?select=01-390/Chemistry/Links/refperiodic.html/periodic_tables.htm#Periodic Tables/education/chemistry/msub9.htm6. 同位素知识/education/isotopes.htm/CoN/index.htmlhttp://140.198.18.108/periodic/isotopes.htmlB. 化合物o 1. MSDS的化合物性质a.ChemFinder服务/b.化学专家/ccd/power/index.shtmlc.化学快查-/scripts/main.aspd.化学飞速-/efdb/Chemfate.htme.Chemidplus -/chemidplus/2. 化学目录(包括部分性质) -a. Aldrich, Sigma, Fluka (now with MSDS) -/3. MSDS的化学目录-a. Arcos and Fisher -/b. JT Baker (&Mallinckrodt) -4. MSDS 的材料安全数据表a. MSDS在线?/b.牛津大学http://physchem.ox.a:80/MSDS/c. Directory of MSDS compilations, University of Kentucky - IkNeWFuZ2Rvbmd5dQ==FQG/msds/index.htmld. MSDS 搜索引擎V ermont 安全信息资源公司/msds/index.htmlCornell大学/msdssrch.asp MSDS搜索-http://w /e./Chemistry/Links/refmsds.html5. 查找有机化合物的性质a. 有机化学数据库/chemistry/cmp/cmp.htmlb. 点击强力搜索at:/ccd/power/index.shtmlc. 银河-/spconline/d. NIMC站点http://www.aist.go.jp/RIODB/SDBS/menu-e.html6. 化学物质的应用a. ChemExpo Commercial Chemical Profiles?/news/p rofile.cfm#menub. 化学与化工7. 有机物的溶解性/smurov/orgsoltab.htm/solvdb.htm/Data%20/Table_26.html8. 毒性/ngispgm3/iris/index.html/pubs/factsheets/toxnetfs.html/9. 环境保护基金会的化学物质“计分表”/chemical- profiles/10. 光谱和热力学性质NIST站点的红外、质谱和热力学数据/chemistry/NIMC站点的核磁共振、红外和质谱数据http://www.aist.go.jp/RIODB/SDBS/menu -e.html银河/spconline/化学专家主页/ccd/power/index.shtml红外谱图/~dls/ir/11. 酸碱的浓度、缓冲性质和平衡常数http://155.135.31.26/oliver/chemdata/12. 全美环境计划(UNEP)一个有关安全使用化学品的站点http://irptc.unep.ch/13. 全美癌症数据/nci99/index.asp精选网络化学资源之三化学事实和数据? A. 事实o 1. 基本常数(1986 CODA TA推荐值)/cuu/Constants/index.html?/codata86.html2.转换系数http://www.chemie.fu-berlin.de/chemistry/general/units.html/Cv_start.htm? B. 概念o 1. 物质的状态和磁性/cca/documents/dyoung/topics-orig/2. 化学概念和术语化学大百科/chem-ed/scidex.html词汇/high.htm#definitions of chemical/dictionary//chem/senese/101/glossary.shtmlhttp://netaccess.on.ca/~dbc/cic_hamilton/dictionary/a.html/chem/letters//wldchem/home/refer/aframe.htm//yogi/chemistry/dictionary/词汇和术语/iupac/参见十、化学教育资源3. 实验室操作/che... ety/resources.shtml4. Safety, Ira Remsen quotation -/smurov/remsen.htm5. 核-/3659/nucreact/6. 平衡常数http://www.chem.ualberta.ca/courses/plambeck/p101/p0040x.htmpusmart.ab.ca/plambeck/che/data/p0040x.htmhttp://155.135.31.26/oliver/chemdata//Data%20/Data.htmlhttp://155.135.31.26/oliver/pubdomdb.htm7. pH 值和滴定曲线http://www.science.ubc.ca/~chem/tutorials/pH/index.html/CWIS/DEP... utorial/phmenu.html8.第二定律//9. 有效数字、单位和单位换算a. 有效数字/~giunta/rayleigh.html/~giunta/acspaper.htmlb. 单位/sections/s... sclimate990930.htmlhttp://clive.canoe.ca/CNEWSHeyMartha9911/10_metric.html/sd/08/00101/02/99/10/01/165724.HTMc. 单位换算/vc2/2my/my2_143.html/flightzz.shtml10. 理论化学/TheoryPage/精选网络化学资源之四应用化学? A. 氮、食物和火焰/orgs/aiche/archive/history/ h_s_n2.htmlor .tr/~che/akman/history/h_s_n2.htmlB. 硫酸-硫酸制造、化学工业之门/orgs/aiche/archive/history/h_s_acid.htmlor .tr/~che/akman/history/h_s_acid.htmlC. 石油o 1. 石油:化工原料和能源/orgs/aiche/archive/hi story/h_energy.htmlor .tr/~che/akman/history/h_energy.html2. 现代的石油提炼-一个实例/orgs/aiche/archive/history/h_refine.htmlor .tr/~che/akman/history/h_refine.html3. 化石用于燃料/c... /fossils/index.html4. 石油勘探/c... findoils/index.htmlD. 化学工业o 1. 化学50强(1996)/hotartcl/cenear/960624/prod.html2. 1997 事实和数字/hotartcl/cenear/970623/facts.html3. 2000 事实和数字/hotartcl/cenear/000626/7826intro. htmlE. 化学应用参见二-B-F. 化工中的危险/news.release/osh.t01.htmG. 化工专业引擎-/。
物质物理化学性质查询网站汇总
物质物理化学性质查询网站汇总1化学工程师资源主页该站点由西弗吉尼亚大学校友Christopher M.A.Haslego维护。
该主页有非常丰富的化学工程方面的内容,其中包括一些查找物性数据比较好的站点:/physinternetzz.shtml1.1物性数据(( /data.xls)该数据库是浏览型数据库,含有470多种纯组分的物性数据,如分子量、冰点、沸点、临界温度、临界压力、临界体积、临界压缩、无中心参数、液体密度、偶极矩、气相热容、液相热容、液体粘度、反应标准热、蒸气压、蒸发热等。
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该站点不仅提供物理性质,还提供一些供估计物质物理性质的软件,如PhysProps from G&P Engineering、Prode's thermoPhysical Properties Generator(PPP)等。
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1.4/G&P Engineering是一个软件,提供物质的28种物理性质并估算其它18种物理性质。
2由美国国家标准技术研究院开发的数据库2.1标准参考数据库化学网上工具书( /chemistry/)该数据库是一种检索型数据库,检索方法非常简单,可通过化学物质名称、分子式、部分分子式、CAS登记号、结构或部分结构、离子能性质、振动与电子能、分子量和作用进行检索,可检索到的数据包括分子式、分子量、化学结构、别名、CAS登记号、气相热化学数据、凝聚相热化学数据、液态常压热容、固态常压热容、相变数据、汽化焓、升华焓、燃烧焓、燃烧熵、各种反应的热化学数据、溶解数据、气相离子能数据、气相红外光谱、质谱、紫外/可见光谱、振动/电子能及其参考文献。
chemoffice的介绍
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ChemOffice是一款综合性科学应用软件包,主要用于化学和生物研究领域的科研人员个人使用。
它主要包含以下几款软件:
1. ChemDraw:这是一款专业的化学结构绘图软件,提供完整的结构绘图解决方案,让用户可以快速绘制各种化学结构,包括分子、配合物、离子、微量元素、金属离子等。
同时,它还支持各种模拟实验,比如电荷分布、强度分析、结构优化等。
2. Chem3D:这是一款用于模拟分子结构的计算机程序,它能够用于建立、编辑和模拟分子结构,以及帮助科学家们对分子结构进行分析。
它使用一种称为Molecular Mechanics的技术来模拟分子结构,可以帮助科学家们更好地理解分子行为和性质。
3. ChemFinder:这是一款专业的化学信息检索软件,它可以帮助用户快速查找和获取有关化学物质的信息。
ChemFinder可以搜索和检索来自多种数据库的化学物质的数据,以及与化学有关的文献、图片、简介、结构式、分子量等信息。
它也可以帮助用户查找化学物质的物理性质、生物活性、生物类型、结构式等信息。
此外,ChemOffice还支持实验室科学家的实验、研究和教学活动,可以帮助科学家更有效地组织和管理实验数据,更有效地分析和可视化实验结果,更有效地分享实验结果。
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http://www.sc.ehu.es/powgep99/dcytp/teoricos/txoni/programak.htm 量子化学软件和其它有用的应用程序。
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化学物质性质查询网站汇总
1化学工程师资源主页该站点由西弗吉尼亚大学校友Christopher M.A.Haslego维护。
该主页有非常丰富的化学工程方面的内容,其中包括一些查找物性数据比较好的站点:(/physinternetzz.shtml) 1.1物性数据((/data.xls) 该数据库是浏览型数据库,含有470多种纯组分的物性数据,如分子量、冰点、沸点、临界温度、临界压力、临界体积、临界压缩、无中心参数、液体密度、偶极矩、气相热容、液相热容、液体粘度、反应标准热、蒸气压、蒸发热等。
1.2聚合物和大分子的物理性质数据库(/~athas/da tabank/intro.html) 该数据库是浏览型数据库。
含有200多种线性大分子的物性数据,如熔融温度、玻璃转换温度、热容等。
该站点不仅提供物理性质,还提供一些供估计物质物理性质的软件,如PhysProps from G&P Engineering、Prode's thermoPhysical Properties Genera tor(PPP)等。
1.3/~jrm/thermot.html 该站点可查294种组分的热力学性质,还可以根据Peng Robinson状态方程计算纯组分或混合物的性质:包括气液相图、液体与气体密度、焓、热容、临界值、分子量等数据。
1.4/ G&P Engineering是一个软件,提供物质的28种物理性质并估算其它18种物理性质。
2由美国国家标准技术研究院开发的数据库 2.1标准参考数据库化学网上工具书(/chemistry/) 该数据库是一种检索型数据库,检索方法非常简单,可通过化学物质名称、分子式、部分分子式、CAS登记号、结构或部分结构、离子能性质、振动与电子能、分子量和作用进行检索,可检索到的数据包括分子式、分子量、化学结构、别名、CAS登记号、气相热化学数据、凝聚相热化学数据、液态常压热容、固态常压热容、相变数据、汽化焓、升华焓、燃烧焓、燃烧熵、各种反应的热化学数据、溶解数据、气相离子能数据、气相红外光谱、质谱、紫外/可见光谱、振动/电子能及其参考文献。
常见化学结构下载(一)2024
常见化学结构下载(一)引言概述:在化学科研和教学中,常常需要使用特定的化学结构来进行分析和研究。
然而,很多时候我们很难找到合适的化学结构图片或文件。
因此,本文将介绍一些常见化学结构下载的方法和资源,以帮助科研人员和教师们更便捷地获取所需的化学结构。
正文:一、在线化学结构数据库下载1. PubChem:PubChem是一个免费且公开的化学信息数据库,其中包含了数百万化合物的化学结构和属性信息。
用户可以在PubChem网站上搜索特定的化合物并下载其结构文件。
2. ChemSpider:ChemSpider是由皇家化学学会管理的免费化学数据库,提供了数百万化合物的结构和属性信息。
通过ChemSpider网站,用户可以搜索所需化合物并下载其结构文件。
二、化学绘图软件下载1. ChemDraw:ChemDraw是一款流行的化学绘图软件,广泛用于绘制和编辑化学结构。
用户可以购买并下载ChemDraw软件,以方便地创建和导出化学结构的图片或文件。
2. MarvinSketch:MarvinSketch是一款免费的化学绘图软件,可以用于绘制和编辑化学结构。
用户可以在官方网站上下载并安装MarvinSketch以获得化学结构的图片或文件。
三、结构搜索引擎下载1. ChemSpider画图工具:ChemSpider画图工具是ChemSpider提供的在线服务,允许用户通过绘制或插入结构来搜索相关化合物的信息。
用户可以在ChemSpider网站上找到该工具,绘制结构并下载其文件。
2. ChemSpider Search:ChemSpider Search是一个基于化学结构搜索的在线工具,用户可以通过输入结构或上传文件来搜索相关的化合物信息。
该工具允许用户下载搜索结果中所需的化学结构文件。
四、学术期刊和数据库下载1. Wiley Online Library:Wiley Online Library是一个包含众多学术期刊和数据库的在线平台,其中包含了大量的化学结构信息。
科研必备的化学数据库都在这里了,拿走不谢
科研必备的化学数据库都在这⾥了,拿⾛不谢来源|化学数据联盟编辑|化学加导读⼤多数情况下,我们⼀般习惯使⽤互联⽹搜索引擎进⾏科学信息搜索。
⽐如说利⽤Google Scholar 查找科学⽂献。
还有维基百科,可能是先进覆盖⾯最⼴的⼀种百科资料,这⾥⾯可以快速提供你想要的信息,并帮助你进⼀步链接新的主题。
但是这些常见常⽤的搜索引擎检测到的信息只不过是沧海⼀粟。
对于科研⼈员⽽⾔,相对较为权威和专业的信息和资料的获取,则需要相应的搜索⽅法和技巧。
跳转阅读→化⼯企业的采购为什么很难⼲过三年?套路很深…跳转阅读→【⾼考40年】发展成为了院⼠的是哪些⼤学的哪些毕业⽣?“⼤数据”这个词同样也可以⽤来描述这⼏年不断积累的化学数据,唯⼀不同的就是化学领域内的数据量的“庞⼤”及其快速增长的速度,还有数据集的复杂性。
因此需要有专门的⼯具对这些数据进⾏收集和分析。
⽽数据的收集和分析对于数据的处理的提⾼越来越有价值。
为了让⼤家从更专业的⾓度搜集并使⽤数据,这⾥搜集并整理了⼀些⾮常有⽤的数据资源(库)。
资源??表⽰需要付费,表⽰需要付费,橘⾊资源橘⾊资源??表⽰免费获取。
紫⾊资源注:下⽂注:下⽂紫⾊BIOSIS Previews??这⾥不仅有Biological Abstracts的杂志内容,还包括⼀些未被期刊收录的报告、综述和会议等信息。
来源:汤森·路透(Thomas Reuters)Cambridge Structural Database (CSD)??这是⼀个专门汇总⼩分⼦有机物和⾦属有机晶体结构的资源库,包括了五⼗万个X光线和中⼦衍射分析结果。
来源:英国剑桥晶体学数据中⼼(The Cambridge Crystallographic Data Centre)ChEMBL??这⾥有⼤量的⽣物活性数据、功能数据以及ADMET(药物的吸收,分配,代谢,排泄和毒性)⽣物活性数据资源。
来源:英国欧洲⽣物信息学研究所(European Bioinformatic Institute)Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI)??专注于⼩分⼦化合物。
化学化工常用的几个网址
化学化工常用的几个网址化学化工常用的几个网址,转2009-10-18 17:471 1.NIST的Chemistry WebBook简介:是美国国家标准与技术研究院NIST的基于Web的物性数据库,Chemistry WebBook可以看作是NIST的标准参考数据库Standard Reference Data中一部分与化学有关的数据库的Web版本,可通过分子式检索、化学名检索、CAS 登录号检索、离子能检索、电子亲和力检索、质子亲和力检索、酸度检索、表面活化能检索、振动能检索、电子能级别检索、结构检索、分子量检索和作者检索等方法,得到气相热化学数据、浓缩相热化学数据、相变数据、反应热化学数据、气相离子能数据、离子聚合数据、气相IR色谱、质谱、UV/Vis色谱、振动及电子色谱等。
2 化合物基本物性库简介:该库除提供化合物的基本物性如熔点、沸点、闪点、密度、在水中的溶解度等外,更重要的是它建立了与Internet上其他节点的索引,通过查询该库,除获得基本物性外,还得到一些链接。
通过这些链接,获得其他节点的数据库或Web页面所包含的关于被查化合物的有关信息。
3 主要化学物质热力学数据简介:国际科学技术数据委员会CODATA的数据库,提供了主要化学物质热力学数据推荐值,虽然数据库规模小,但具有权威性。
内容包括关键化学物质的热力学特性,这个网站的内容公布了最新的结果。
使用推荐的这些数据,可用于热力学测定的分析、数据还原和制备其它的热力学数据表。
此表包括绝对温度下的分子标准焓值、熵值和H0(298.15K)-H0(0)。
焓变值栏目中元素的值为0可指示出此元素的参考状态。
标准压强为100000Pa(1 bar),可根据标准态气压的改变引起的气相熵值得到参考信息。
4 溶剂数据库SOLV-DB简介:美国非赢利组织National Center of Manufacturing Sciences的溶剂数据库提供了100余种常用溶剂的数据,虽然数据库不大却很实用。
计算化学相关的免费的在线数据库、分子结构库及工具
一些计算化学相关的免费的在线数据库、分子结构库及工具这是我平时收集的和计算化学/分子模拟有关的免费的在线的库和工具,这类网站是很有意义的。
下列网址于2009年7月8日验证皆可用,若无法访问可尝试代理。
前面有√的代表比较重要。
很多在线工具需要java运行环境。
如果有其它好的免费的化学相关的在线的库或工具欢迎回帖补充,我也会在日后逐渐补充。
1 在线信息数据库部分简介:很好的有机化合物光谱数据库,包含六类光谱:EI-MS、FT-IR、H-NMR、C13-NMR、ESR、Raman。
含3万余个化合物,其中以商业化学试剂为主,约2/3是6碳至16碳的化合物。
数据大部分是其自行测定的,并不断添加。
可以通过化合物、分子式、分子量、CAS/SDBS注册号、元素组成、光谱峰值位置/强度方式搜索。
简介:此数据库包括各种量子化学方法、各种基组下对不同分子的各种属性的计算结果,也包含实验数据。
可用来对比不同方法计算结果优劣,此数据库内容在不断增加。
简介:实际上就是CCCBDB的一个子页面,比较重要故单独列出。
注:需要付费,可免费下载试用版。
简介:是美国国家标准与技术研究院NIST的基于Web的物性数据库。
输入分子查找条件,可获得分子量、CAS登记号、各种热力学数据、谱图等信息,部分分子包含3D结构。
简介:分子的RESP电荷的数据库简介:用于评价蛋白质数据库中晶体结构电子密度。
输入pdb ID(比如1cbs)进入后可以对各种内容做图。
点击EDS Summary下面的Go按钮可以自动启动基于java的电子密度图可视化程序观看电子密度图,注意不要开启浏览器的弹出窗口过滤。
简介:十分有用的数据库,免费注册。
可获得分子的红外、质谱谱图、结构、物化性质、毒性、生物活性以及相关反应等。
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简介:根据分子质量、名称或者自行绘制结构,从几十万分子中搜索,得到二维结构、Smiles、InCHI 字符串、分子量等简单信息。
化工人员必备 化学数据库大全
化工人员必备 - 化学数据库大全简介化工领域是一个复杂且广泛的领域,化学工作者在实验、研发、生产等方面都需要具备丰富的化学知识。
为了提高工作效率和准确性,化学数据库成为化工人员必备的重要工具之一。
本文将介绍一些常用的化学数据库,并分析其特点和应用场景。
1. 化学物质数据库1.1 PubChemPubChem是一个由美国国立卫生研究院(NIH)开发和维护的免费、开放的化学物质数据库。
它收集了全球范围内上百个机构和实验室提供的几千万个化合物的数据,包括化合物的结构、性质、活性信息等。
化工人员可以通过PubChem查询特定化合物的基本信息和相关文献,并可以下载大量的化学结构文件。
PubChem提供了用户友好的网页界面和RESTful API,方便用户进行数据检索和集成。
1.2 ChemSpiderChemSpider是由皇家化学学会(RSC)开发的一个免费的在线化学物质数据库。
它收集了全球范围内众多出版物、实验室和专利提供的大量化合物的数据,包括化合物的结构、物理化学性质、活性等。
ChemSpider可以通过化合物的分子式、结构式等进行快速搜索,并提供了详细的化学信息和相关文献。
此外,ChemSpider还提供了自动化合物结构匹配、光谱解析等高级功能,方便化工人员进行更深入的研究。
1.3 Chemical Abstracts Service (CAS)CAS是一个全球领先的化学信息公司,其化学物质数据库是全球公认的最全面、最权威的化学数据库之一。
CAS收集了全球范围内数千家机构提供的大量化合物的数据,提供了化合物的标识号、结构、性质、合成方法等详细信息。
化工人员可以通过CAS号或关键词进行快速搜索,获取所需的化学信息。
此外,CAS还提供了化学文献数据库和化学专利数据库,方便用户进行文献查阅和专利分析。
2. 反应数据库2.1 ReaxysReaxys是由RELX集团旗下的Elsevier公司开发的一个综合性化学反应数据库。
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- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
一些计算化学相关的免费的在线数据库、分子结构库及工具1 在线信息数据库部分√ SDBS光谱数据库:http://riodb01.ibase.aist.go.jp/sdbs/cgi-bin/direct_frame_top.cgi简介:很好的有机化合物光谱数据库,包含六类光谱:EI-MS、FT-IR、H-NMR、C13-NMR、ESR、Raman。
含3万余个化合物,其中以商业化学试剂为主,约2/3是6碳至16碳的化合物。
数据大部分是其自行测定的,并不断添加。
可以通过化合物、分子式、分子量、CAS/SDBS 注册号、元素组成、光谱峰值位置/强度方式搜索。
生物核磁共振数据库:http://bmrb.protein.osaka-u.ac.jp/depositCRYSTAL程序基组数据库:/~mdt26/crystal.html√ 计算化学比较和基准数据库(CCCBDB):简介:此数据库包括各种量子化学方法、各种基组下对不同分子的各种属性的计算结果,也包含实验数据。
可用来对比不同方法计算结果优劣,此数据库内容在不断增加。
√ 量化频率计算校正因子:/vibscale.asp简介:实际上就是CCCBDB的一个子页面,比较重要故单独列出。
IUPAC金属络合物稳定常数数据库:注:需要付费,可免费下载试用版。
√ NIST化学数据库:/chemistry简介:是美国国家标准与技术研究院NIST的基于Web的物性数据库。
输入分子查找条件,可获得分子量、CAS登记号、各种热力学数据、谱图等信息,部分分子包含3D结构。
RESP ESP charge DDataBase(REDDB):/REDDB/index.php 简介:分子的RESP电荷的数据库Uppsala Electron Density Server:http://eds.bmc.uu.se/eds简介:用于评价蛋白质数据库中晶体结构电子密度。
输入pdb ID(比如1cbs)进入后可以对各种内容做图。
点击EDS Summary下面的Go按钮可以自动启动基于java的电子密度图可视化程序观看电子密度图,注意不要开启浏览器的弹出窗口过滤。
√ 上海有机所化学专业数据库:http://202.127.145.134/scdb/default.htm简介:十分有用的数据库,免费注册。
可获得分子的红外、质谱谱图、结构、物化性质、毒性、生物活性以及相关反应等。
还包括中英互译、药品名称检索等功能。
√ EMSL基组数据库:https:///bse/portalClarkson大学相对论有效势数据库:/~pac/reps.html含重原子全电子STO基组数据库:/Downloads/zorabasis/Welcome.html原子间势参数数据库:/PotentialsStuttgart赝势参数数据库:http://www.theochem.uni-stuttgar ... ls/clickpse.en.htmlChemBioFinder:http://chembiofinder.cambridgeso ... r/SimpleSearch.aspx简介:根据分子质量、名称或者自行绘制结构,从几十万分子中搜索,得到二维结构、Smiles、InCHI字符串、分子量等简单信息。
Sigma-Aldrich公司产品数据库:/Area ... /United_States.html 简介:主要用来获得化合物IR、NMR谱图。
右上角输入化合物的名字,搜索到后进入相应条目,如果在左侧有FT-IR Raman、FT-NMR字样,就可以进入察看,没有则说明此化合物无光谱数据。
也可以获得化合物的一些物性数据,但不全面。
基本物理常数数据库:/cuu/Constants/index.html简介;可以查到精确的计算化学中涉及的物理常数及换算关系,如hartree->eV百奥知识数据库:/html/sites/database/index.htm简介:一个生物信息数据库的比较全的列表,每个数据库有简单官方介绍。
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√ NDB核酸数据库:简介:根据NDB ID,获得核酸坐标文件、出处等信息,类似RCSB蛋白质数据库。
PDBbind-CN:/index.asp简介:收集了pdb数据库中的生物分子复合物。
给出受体、配体名称、亲和性、序列等信息,可在线观看或下载结构,可根据配体名称、结构搜索含有此配体的复合物。
PDB Wiki:/index.php/Main_Page简介:基于PDB数据库,对蛋白质进行了简单分类,访问者可以给每个蛋白添加注释。
sc-PDB:http://bioinfo-pharma.u-strasbg.fr/scPDB简介:收集了PDB数据库中含有可以为药物结合的位点的蛋白。
可根据配体、蛋白、结合方式为特征进行搜索。
√ RCSB PDB数据库:/pdb/home/home.doHPDB蛋白质数据库:简介:河北大学的蛋白质数据库,可通过此库间接下载到RCSB蛋白质数据库的文件。
有中文PDB文件格式的介绍,比较有用,还有另外一介绍蛋白质的些文章。
√ ZINC化合物虚拟筛选数据库:/index.shtml简介:根据自定义的化合物的性质,在800万种以上可买到的产品中进行筛选。
可以下载到结构文件。
√ PubChem:简介:NCBI下属的小分子数据库,包括化合物、物质、生物活性三大数据库,含上千万条目并不断增加。
可通过分子结构、名称、分子式、分子量、XLogP、氢键信息方式查询。
可以得到分子的简介、化学结构、XLogP(自动计算)、同义词、生物活性、毒性、药理学信息及分类、SMILE和InChI/key字符串、相似化合物、2D的SDF文件。
一些结构还有3D SDF 结构文件,进入条目后可在页面最下面点SDF按钮保存,可被一些软件直接读取,如ChemBio3D。
是一个很有用的获得小分子三维结构的方法。
SuperNature天然产物数据库:http://bioinformatics.charite.de/supernatural简介:几万种天然产物数据库,可通过名称、结构、相似度、LogP、分子量、分子式等信息搜索,也可以绘制结构或根据结构模版搜索,可在线观看结构,并获得净电荷、偶极矩、手形中心数目、可旋转键数目、氢键受/配体等信息。
蛋白质pKa数据库(PPD):/PPD蛋白质分类数据库(CATH):简介:其中结构来自PDB数据库,半自动地对每个结构根据二级结构、形状、拓扑、同源性进行了分类,可以根据这些特点进行分类查询。
蛋白质结构分类数据库(SCOP):/scop简介:和CATH的功能类似,包含几万个蛋白质结构。
但是是人工对每个蛋白结构进行分类,比CATH的分类更为合理。
结构分类基于四个层次:class、fold、superfamily、family。
结构相似蛋白质家族数据库(FSSP):/srsbin/cgi- ... i2u1RffMj+-lib+FSSP 简介:此数据库对pdb数据库中的结构使用Dali算法进行了相似度计算,用以找到相似蛋白质。
=========================3 在线工具部分√ Dali server:http://ekhidna.biocenter.helsinki.fi/dali_server简介:输入PDB ID或者上传PDB,服务器会对此结构与PDB数据库中的结构用dali算法计算,将其中有一定结构相似度的PDB列出。
通过复选框选择几个结构,可以对比序列,以及在线观看它们重叠后的3D结构。
Dali Database(http://ekhidna.biocenter.helsinki.fi/dali/start)每年更新两次,如果是在更新日期以前发布的pdb,可以直接在Dali Database里面查询之前已算好的结果,而不必在Dali server里面重新计算。
在线生成金刚石结构(包括同晶体结构的硅、锗):/research/diamondonline.html在线生成石墨结构:/research/graphiteonline.html在线生成碳纳米管结构:/research/tubegenonline.htmlADIT蛋白质检查工具:/adit简介:可以自行上传pdb文件,通过Validate操作,自动通过PROCHECK程序绘制出各种图表用以检查蛋白质。
包括ramachandran图,chi1-chi2图,主链/侧链信息图(解析度标准偏差、不合理接触等)、二级结构图、扭转角分布、键长距离分布、侧链上平面结构偏差分布、主链键长键角扭曲情况。
webPIPSA(Protein Interaction Property Similarity Analysis):/pipsa简介:上传pdb/pqr或输入pdb ID,自动调用APBS/UHBD计算它们的静电势,根据一定规则绘制成距离矩阵,并做簇分析。
可以分析不同蛋白质在相互作用上的相似性。
可以下载到运行期间的中间文件,包括转化后的pqr和计算得到的grid格点文件,可被vmd等软件读取。
CASTp:/castp/calculation.php简介:找出某蛋白所有口袋或孔洞,并得到它们的容积和表面积,有助于研究潜在的配体结合位点。
SFoldRate预测蛋白质折叠速率:/lab/tools/foldingrate/fr0.htmlALOGPS:/lab/alogps简介:在线上传分子结构,计算LogP、水溶性、PKa、SMILE字符串等信息。
支持分子结构格式十分多。
CORINA:/online_demos/corina_demo.html简介:通过SMILE字符串得到分子的结构文件一些有用的晶体学工具:http://www.cryst.ehu.esGETAREA:/getarea.html简介:计算分子SASA和溶解能,服务器不太稳健DockingServer:/web/?简介:在线分子对接,须注册,对免费用户功能有限制GLYCAM在线构建糖、糖蛋白结构:/ccrc/biombuilder/biomb_index.jspMolEdit:http://159.149.163.21/moledit.htm简介:在线绘制2D结构,自动转化为三维坐标文件,支持格式很多。
√ E-Babel:/lab/babel简介:相当于在线版的Babel,可以支持几十种结构文件格式的转换。