复旦大学医学遗传学课件case_control_TDT分析
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《医学遗传学》PPT课件 (2)-PPT精选文档151页
3 ATTITUDES All health professionals should:
3.1 appreciate the sensitivity of genetic information and the need for privacy and confidentiality. 3.2 seek coordination and collaboration with an interdisciplinary team of health professionals.
2.1 gather genetic family history information, including at minimum a three-generation history.
2.2 identify and refer clients who might benefit from genetic services or from consultation with other professionals for management of issues related to a genetic diagnosis.
1.10 the ethical, legal and social issues related to genetic testing and recording of genetic information (e.g., privacy, the potential for genetic discrimination in health insurance and employment).
BASELINE COMPETENCIES
At a minimum, each health-care professional should be able to:
《医学遗传学》ppt课件
3
基因突变影响基因表达和调控 突变影响基因的表达和调控，导致细胞生长、分 化和凋亡异常，进而引发疾病。
常见基因突变导致疾病案例
镰状细胞贫血
由β-珠蛋白基因突变引起，导致 红细胞形态异常和功能缺陷。
囊性纤维化
由囊性纤维化跨膜传导调节因子 （CFTR）基因突变引起，导致 呼吸道、消化道和生殖道黏液分 泌异常。
重要性
随着医学和遗传学的发展，越来越多的遗传性疾病被发现和认识，医学遗传学 在医学领域中的地位日益重要。它对于疾病的预测、诊断、治疗和预防具有重 要意义，有助于提高人类健康水平和生活质量。
医学遗传学发展历史及现状
发展历史
医学遗传学的发展经历了从经典遗传学、分子遗传学到现代遗传学的历程。随着人 类基因组计划的完成和精准医疗的提出，医学遗传学正迎来新的发展机遇。
教学要求
要求学生系统掌握医学遗传学的基本概念和基本理论，熟悉常见遗传性疾病的临床表现、诊断方法和治疗 措施，了解遗传性疾病的预防策略和最新研究进展。同时，要求学生具备独立思考和自主学习的能力，能 够运用所学知识分析和解决临床实际问题。
02
遗传物质基础
染色体结构与功能
染色体的化学组成
主要由DNA和蛋白质组成，其中 DNA是遗传信息的载体，蛋白质 则对DNA的包装、稳定和调控起
X连锁隐性遗传病
致病基因位于X染色体上，且为隐性 基因。男性患者多于女性患者，且女 性患者多为携带者。如红绿色盲、血 友病等。
04
人类基因组计划与基因组学
人类基因组计划背景及意义
人类基因组计划的提出
揭示人类生命奥秘，探索基因与疾ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ 关系
人类基因组计划的意义
推动生命科学、医学等领域的发展，为 个性化医疗和精准治疗奠定基础
《医学遗传学概论》课件
对高风生育建议
为有遗传病家族史的夫妇提供 遗传咨询，指导其生育决策。
群体筛查与预防
对特定人群进行遗传病筛查， 及早发现并采取预防措施。
遗传咨询与伦理问题
保护隐私
确保咨询过程中涉及的 个人隐私得到保护。
提供真实信息
为咨询者提供准确、客 观的遗传病信息，避免
误导。
尊重咨询者意愿
尊重咨询者的自主权， 不强迫其做出任何决策
。
避免歧视
避免因遗传信息而歧视 或排斥某些人群。
05
基因治疗与遗传性疾病的 未来展望
基因治疗的基本原理与技术
基因治疗的基本原理
基因治疗是一种通过修改人体基因来治疗遗传性疾病的技术。它通过将正常的基因导入病变细胞，以替代或矫正 缺陷基因，从而达到治疗目的。
VS
未来展望
随着技术的不断进步和研究的深入，基因 治疗有望在未来成为遗传性疾病的重要治 疗手段，为患者带来更好的生活质量。同 时，随着伦理和法律问题的逐步解决，基 因治疗的应用范围也将不断扩大。
THANKS
感谢观看
基因治疗的技术
目前，基因治疗主要采用基因转移技术，包括病毒载体和非病毒载体。病毒载体如反转录病毒、腺病毒等，可将 正常基因插入到病变细胞中；非病毒载体如纳米颗粒、脂质体等，通过包裹DNA或RNA，将正常基因导入细胞 。
基因治疗在遗传性疾病中的应用与挑战
应用领域
基因治疗在遗传性疾病的治疗中具有广泛的应用前景，如囊性纤维化、镰状细胞贫血、血友病等。通 过基因治疗，这些遗传性疾病有望得到根治。
详细描述
单基因遗传病是指由单个基因的突变所引起的疾病，如镰状细胞贫血、囊性纤 维化等。这些疾病通常具有明显的家族聚集性，由一个基因的缺陷导致。
为有遗传病家族史的夫妇提供 遗传咨询，指导其生育决策。
群体筛查与预防
对特定人群进行遗传病筛查， 及早发现并采取预防措施。
遗传咨询与伦理问题
保护隐私
确保咨询过程中涉及的 个人隐私得到保护。
提供真实信息
为咨询者提供准确、客 观的遗传病信息，避免
误导。
尊重咨询者意愿
尊重咨询者的自主权， 不强迫其做出任何决策
。
避免歧视
避免因遗传信息而歧视 或排斥某些人群。
05
基因治疗与遗传性疾病的 未来展望
基因治疗的基本原理与技术
基因治疗的基本原理
基因治疗是一种通过修改人体基因来治疗遗传性疾病的技术。它通过将正常的基因导入病变细胞，以替代或矫正 缺陷基因，从而达到治疗目的。
VS
未来展望
随着技术的不断进步和研究的深入，基因 治疗有望在未来成为遗传性疾病的重要治 疗手段，为患者带来更好的生活质量。同 时，随着伦理和法律问题的逐步解决，基 因治疗的应用范围也将不断扩大。
THANKS
感谢观看
基因治疗的技术
目前，基因治疗主要采用基因转移技术，包括病毒载体和非病毒载体。病毒载体如反转录病毒、腺病毒等，可将 正常基因插入到病变细胞中；非病毒载体如纳米颗粒、脂质体等，通过包裹DNA或RNA，将正常基因导入细胞 。
基因治疗在遗传性疾病中的应用与挑战
应用领域
基因治疗在遗传性疾病的治疗中具有广泛的应用前景，如囊性纤维化、镰状细胞贫血、血友病等。通 过基因治疗，这些遗传性疾病有望得到根治。
详细描述
单基因遗传病是指由单个基因的突变所引起的疾病，如镰状细胞贫血、囊性纤 维化等。这些疾病通常具有明显的家族聚集性，由一个基因的缺陷导致。
医学遗传学PPT课件
郭锋助教,承担医 学遗传学的实验教学, 参加了《医学遗传 学》、《基因诊断与 基因治疗》等多媒体 课件的制作。
医学遗传学课程的建设已经取得了 瞩目的成绩,相信在全体同仁的共后可以修改编辑，欢迎下载收藏。
，成为世界医学史上的主流。
可见中西医学，一个是以“功能人” 为概念 的独特 的哲学 医学理 论体系 ，一个 是以“ 解剖人 、肉体 人”为 概念的 新兴的 现代医 学科学 理论体 系，二 者都不 是以完 整人为 研究对 象的科 学，从 理论讲 二者都 不是科 学的， 势必影 响各自 发展。 事实也 证明这 一切， 中医长 期停滞 不前、 疗效也 不确实 。西医 尽管发 展到目 前的基 因分子 层次， 但疾病 发病率 居高不 下，对 绝大部 分疾病 发病原 因认识 不清、 ⒉
左伋教授是医学遗传学领域的著名学者;从事医学遗传学 研究和教学多年,具有丰富的教学经验;目前担任全国规划教 材《医学遗传学》和《医学生物学》的主编;同时还担任了 中国优生科学协会副会长、中国细胞生物学会常务理事、中 华医学遗传学会委员及该学会教育学组副组长、中华医学会 医学教育学会医学生物学组副组长等职务。
1998年左伋教授主编了 《医学遗传学》第二版,带入 了国外的先进教学理念和本 学科的最新进展,该教材获得 1999年上海市普通高校优秀 教材三等奖
2003年由左伋教授 主编的《医学遗传学》 第三版是复旦大学十五 本科教材建设项目,根据 医学专业的发展和需要、 总结前两版教材和历年 教学中的成功与不足,将 第三版的教材内容与结 构作了较大的调整,将全 书分为医学遗传学基础 和临床两部分,并在教材 中插入了英文原文的材 料,希望有助于学生专业 英语的学习。
容。
八十年代后期, 就针对临床医学专 业,开设了《医学遗 传学》这一课程,以 理论课为主,时任主 任为李采娟教授。
2024版医学遗传学课件
整倍体变异
染色体组数目的整倍增加或减少，如 三倍体、四倍体等，通常导致严重发 育异常。
非整倍体变异
个别染色体增加或减少，如21三体综合 征（唐氏综合征）等，导致特定遗传病。
遗传病诊断方法和治疗策略
临床检查
观察患者体征、症状和家族史。
细胞遗传学检查
分析染色体结构和数目异常。
遗传病诊断方法和治疗策略
医学遗传学在药物基因组学领域的应用，有助于实现药物的 个体化治疗，提高药物治疗效果和安全性。
疾病预防与健康管理
医学遗传学为疾病预防提供了重要的手段，如基因检测可以 预测个体患病风险，为制定健康管理计划提供依据。
02 遗传物质与遗传 信息传递
DNA结构与功能
DNA的分子结构
01
由两条多脱氧核苷酸链围绕一个共同的中心轴盘绕成双螺旋结
以DNA为模板合成RNA的过程，包括启动子 识别、RNA聚合酶结合、转录泡的形成与移 动等步骤。
遗传信息翻译
基因表达调控
以mRNA为模板，在核糖体上合成蛋白质的 过程，包括起始、延长和终止三个阶段。
通过转录因子、表观遗传修饰、microRNA 等方式对基因表达进行调控，实现细胞功能 和发育过程的精确控制。
04 染色体变异与遗 传病诊断治疗
染色体结构变异类型及影响
缺失
染色体片段丢失，导致 基因缺失和表型异常。
重复
染色体片段重复，可能 导致基因剂量效应和表
型异常。
倒位
染色体片段颠倒，可能 影响基因表达和表型。
易位
染色体片段在不同染色 体之间交换，可能导致 基因重组和表型异常。
染色体数目变异导致遗传病类型
拓展延伸：表观遗传学简介
表观遗传学的概念
染色体组数目的整倍增加或减少，如 三倍体、四倍体等，通常导致严重发 育异常。
非整倍体变异
个别染色体增加或减少，如21三体综合 征（唐氏综合征）等，导致特定遗传病。
遗传病诊断方法和治疗策略
临床检查
观察患者体征、症状和家族史。
细胞遗传学检查
分析染色体结构和数目异常。
遗传病诊断方法和治疗策略
医学遗传学在药物基因组学领域的应用，有助于实现药物的 个体化治疗，提高药物治疗效果和安全性。
疾病预防与健康管理
医学遗传学为疾病预防提供了重要的手段，如基因检测可以 预测个体患病风险，为制定健康管理计划提供依据。
02 遗传物质与遗传 信息传递
DNA结构与功能
DNA的分子结构
01
由两条多脱氧核苷酸链围绕一个共同的中心轴盘绕成双螺旋结
以DNA为模板合成RNA的过程，包括启动子 识别、RNA聚合酶结合、转录泡的形成与移 动等步骤。
遗传信息翻译
基因表达调控
以mRNA为模板，在核糖体上合成蛋白质的 过程，包括起始、延长和终止三个阶段。
通过转录因子、表观遗传修饰、microRNA 等方式对基因表达进行调控，实现细胞功能 和发育过程的精确控制。
04 染色体变异与遗 传病诊断治疗
染色体结构变异类型及影响
缺失
染色体片段丢失，导致 基因缺失和表型异常。
重复
染色体片段重复，可能 导致基因剂量效应和表
型异常。
倒位
染色体片段颠倒，可能 影响基因表达和表型。
易位
染色体片段在不同染色 体之间交换，可能导致 基因重组和表型异常。
染色体数目变异导致遗传病类型
拓展延伸：表观遗传学简介
表观遗传学的概念
复旦大学遗传学课件
公元前1900年
撒拉 以撒
埃及人
亚伯拉罕 夏甲
易斯马易
阿拉伯人
问题：
物种进化是渐进式还是爆发式？ 比目鱼化石 非对称性进化是在自然界中逐步形成的？
大连旅顺的蛇岛上只有蝮蛇，周围其他地区 都有多种蛇类，为什么？
海蛇有很多共同特征，色灰，有斑带，溶血 性蛇毒，和陆地金环蛇的特征很像。你认为 是金环蛇起源于海蛇，还是海蛇起源于陆地 蛇，为什么？
• 在人类基因组中，全部基因序 列只占基因组的2％左右。基因 组内的非基因序列曾一度被研 究者称为“垃圾DNA”（junk DNA）。
种类
大肠杆菌 啤酒酵母 线虫 果蝇 蝗虫 小鼠 豌豆 玉米 小麦
人
Mb
4.64 12.1 100 140 5000 3300 4800 5000 17000
3000
• 6. 人是由古猿类进化而来，现 代猿类还可以进化为人吗？
我们和所有生命共享一个世界，地球上所有生 命都是与人类共存的伙伴。尊重生命，敬畏生命， 热爱生命就是尊重自然和人类本身。今天，当我们 为了人类的发展需要另一种生命为我们服务的时 候，我们以一种崇敬，感恩的心情抚慰所有为人类 奉献生命的灵魂，感谢你们为人类作出巨大的牺 牲，你们的生命将与人类永存。
《遗传学实验教程》前言
疾病的遗传分析（6学时） 基因与发育（5学时） 群体与进化遗传学（6学时）
遗传学教学思想
遗传学教学应使学生知道什么？ 遗传学教学应使学生思考什么？ 遗传学教学会使学生感兴趣吗？ 遗传学教学能使学生具有哲学思维吗？ 经过遗传学课程的教育，学生具有传播遗传
学知识的愿望和能力吗？
遗传学学术体系的困惑与未来
现代遗传学的发展推翻了经典遗传学的理 论吗？（孟德尔遗传，连锁遗传，复杂性 状遗传，进化遗传……）
医学遗传学概论教学课件ppt
转录
遗传信息从DNA传递到RNA的过程，生成RNA 分子。
翻译
遗传信息从RNA传递到蛋白质的过程，合成相应 的蛋白质。
基因表达与调控
基因表达
指将遗传信息转化为蛋白质的过程，包括转录和翻译两个阶 段。
基因表达调控
指对基因表达的量和时间进行调节控制，以保证细胞正常功 能和代谢的需要。
突变与变异
突变
指基因内部发生碱基对的增添、缺失或替换，导致基因结构改变的现象。
02
医学遗传学的基本理论
基因与基因组
1 2
基因的概念
基因是具有遗传效应的DNA片段，是决定生物 性状的基本单位。
基因的组成
基因由编码区和非编码区组成，编码区负责编 码蛋白质，非编码区则参与基因表达的调控。
3
基因组
指一个细胞或生物体所携带的全部基因的总和 。
遗传信息的传递
DNA复制
DNA复制是遗传信息从亲代传递到子代的过程， 保证遗传信息的稳定性和连续性。
数据挖掘
通过生物信息学方法对大量数据进行挖掘，发现隐藏在数据 中的规律和知识。
生物网络分析
利用生物网络分析方法，研究基因、蛋白质等生物分子之间 的学遗传学
精准医疗是一种基于个体基因、环境和生活方式等 特征，通过精确分析制定个性化疾病预防和治疗方
案的方法。
揭示人类遗传性疾病的传递规律和发病机制，为预防 和治疗提供理论支持和实践指导；
为其他生命科学领域的研究提供基础数据和方法，促 进生命科学整体发展；
研究特定基因或基因组的异常与疾病发生发展的关系 ，为基因诊断和基因治疗提供依据；
为制定个性化医疗方案提供科学依据，提高医疗服务 的质量和效率。
医学遗传学的发展历程
遗传信息从DNA传递到RNA的过程，生成RNA 分子。
翻译
遗传信息从RNA传递到蛋白质的过程，合成相应 的蛋白质。
基因表达与调控
基因表达
指将遗传信息转化为蛋白质的过程，包括转录和翻译两个阶 段。
基因表达调控
指对基因表达的量和时间进行调节控制，以保证细胞正常功 能和代谢的需要。
突变与变异
突变
指基因内部发生碱基对的增添、缺失或替换，导致基因结构改变的现象。
02
医学遗传学的基本理论
基因与基因组
1 2
基因的概念
基因是具有遗传效应的DNA片段，是决定生物 性状的基本单位。
基因的组成
基因由编码区和非编码区组成，编码区负责编 码蛋白质，非编码区则参与基因表达的调控。
3
基因组
指一个细胞或生物体所携带的全部基因的总和 。
遗传信息的传递
DNA复制
DNA复制是遗传信息从亲代传递到子代的过程， 保证遗传信息的稳定性和连续性。
数据挖掘
通过生物信息学方法对大量数据进行挖掘，发现隐藏在数据 中的规律和知识。
生物网络分析
利用生物网络分析方法，研究基因、蛋白质等生物分子之间 的学遗传学
精准医疗是一种基于个体基因、环境和生活方式等 特征，通过精确分析制定个性化疾病预防和治疗方
案的方法。
揭示人类遗传性疾病的传递规律和发病机制，为预防 和治疗提供理论支持和实践指导；
为其他生命科学领域的研究提供基础数据和方法，促 进生命科学整体发展；
研究特定基因或基因组的异常与疾病发生发展的关系 ，为基因诊断和基因治疗提供依据；
为制定个性化医疗方案提供科学依据，提高医疗服务 的质量和效率。
医学遗传学的发展历程
《医学遗传学》课件
特点
1）个体与群体遗传学兼顾；2）宏观与微观研究并重；3）基 础与应用结合；4）多学科交叉，综合性强。
医学遗传学的重要性
1
为遗传病的诊断、预防和治疗提供理论依据；
2
为医学其他学科的发展提供重要的理论基础和 研究手段；
3
为探索人类生命奥秘和解决人类健康问题作出 重要贡献。
医学遗传学的发展趋势
基因组学与医学遗 传学的结合
基因测序
通过DNA序列分析，检测基因变异和异常，预测 遗传疾病风险。
单基因遗传病检测
针对特定基因进行突变检测，为遗传疾病的诊断 和治疗提供依据。
全基因组关联分析
通过对全基因组进行扫描，寻找与疾病相关的基 因变异。
细胞培养技术
细胞株建立
01
通过细胞培养技术建立人类或动物的细胞系，用于研究遗传变
异和疾病发生机制。
04
医学遗传学在临床上的应用
常见疾病的发生机制
遗传因素在常见疾病的发生和发展过程中起着重要作用。医 学遗传学通过研究这些疾病的遗传基础和机制，有助于深入 了解疾病的本质和发生规律。
常见疾病的发生机制包括基因突变、染色体异常、基因组印 记和表观遗传学等多个方面。医学遗传学通过研究这些机制 ，有助于发现新的诊断和治疗方法。
这些问题包括基因信息的保护与利用、基因歧视、基因治疗与 基因编辑的规范和管理等。
为保障个体权益和社会公共利益，需要在法律和伦理框架内规 范医学遗传学的应用和发展。同时，需要加强相关研究和国际 合作，共同推动医学遗传学的可持续发展。
05
医学遗传学研究展望
未来研究方向
基因组编辑技术
利用CRISPR等技术对基因进行精确 编辑，为遗传病治疗、农业改良等 领域提供新手段。
1）个体与群体遗传学兼顾；2）宏观与微观研究并重；3）基 础与应用结合；4）多学科交叉，综合性强。
医学遗传学的重要性
1
为遗传病的诊断、预防和治疗提供理论依据；
2
为医学其他学科的发展提供重要的理论基础和 研究手段；
3
为探索人类生命奥秘和解决人类健康问题作出 重要贡献。
医学遗传学的发展趋势
基因组学与医学遗 传学的结合
基因测序
通过DNA序列分析，检测基因变异和异常，预测 遗传疾病风险。
单基因遗传病检测
针对特定基因进行突变检测，为遗传疾病的诊断 和治疗提供依据。
全基因组关联分析
通过对全基因组进行扫描，寻找与疾病相关的基 因变异。
细胞培养技术
细胞株建立
01
通过细胞培养技术建立人类或动物的细胞系，用于研究遗传变
异和疾病发生机制。
04
医学遗传学在临床上的应用
常见疾病的发生机制
遗传因素在常见疾病的发生和发展过程中起着重要作用。医 学遗传学通过研究这些疾病的遗传基础和机制，有助于深入 了解疾病的本质和发生规律。
常见疾病的发生机制包括基因突变、染色体异常、基因组印 记和表观遗传学等多个方面。医学遗传学通过研究这些机制 ，有助于发现新的诊断和治疗方法。
这些问题包括基因信息的保护与利用、基因歧视、基因治疗与 基因编辑的规范和管理等。
为保障个体权益和社会公共利益，需要在法律和伦理框架内规 范医学遗传学的应用和发展。同时，需要加强相关研究和国际 合作，共同推动医学遗传学的可持续发展。
05
医学遗传学研究展望
未来研究方向
基因组编辑技术
利用CRISPR等技术对基因进行精确 编辑，为遗传病治疗、农业改良等 领域提供新手段。
复旦大学医学遗传学课件casecontrolTDT分析
association – Exploits LD between markers and unobserved
disease variants • Examples of direct and indirect association studies • Study designs for direct and marker-based (LD)
…CC?CCG…CAG …CC?CCG…CAG
…CC?CCG…CAG …CC?CCG…CGG
…CC?CCG…CGG …CC?CCG…CGG
Marker Case
AA
a
AG
c
GG
e
Total
nd
Control b d f nh
Total m1 m2 m3 N
• Use marker genotypes as surrogate for ‘functional’ genotype
..GACTAAGGCCC CCGTTCAAG…GA CCTG..
C/T
A/G
Rely on correlation (LD) between these alleles to detect association!
Indirect Association Studies in Epidemiology
Applications:
• Localization (what is the best estimate of the disease gene location?) – Fine mapping – Whole genome scan
• Candidate gene effects • Gene – environment effects • Drug response modification
disease variants • Examples of direct and indirect association studies • Study designs for direct and marker-based (LD)
…CC?CCG…CAG …CC?CCG…CAG
…CC?CCG…CAG …CC?CCG…CGG
…CC?CCG…CGG …CC?CCG…CGG
Marker Case
AA
a
AG
c
GG
e
Total
nd
Control b d f nh
Total m1 m2 m3 N
• Use marker genotypes as surrogate for ‘functional’ genotype
..GACTAAGGCCC CCGTTCAAG…GA CCTG..
C/T
A/G
Rely on correlation (LD) between these alleles to detect association!
Indirect Association Studies in Epidemiology
Applications:
• Localization (what is the best estimate of the disease gene location?) – Fine mapping – Whole genome scan
• Candidate gene effects • Gene – environment effects • Drug response modification
医学遗传学-PPT课件 (2)
Educating health-care professionals about genetics and genomics
To biomedical researchers, this is the ‘genome era’. Advances in genetics and genomics such as the sequence of the human genome, the human haplotype map, open access databases, cheaper genotyping and chemical genomics have already transformed basic and translational biomedical research. However, for most clinicians, the genome era has not yet arrived. For genomics to have an effect on clinical practice that is comparable to its impact on research will require advances in the genomic literacy of health-care providers
A sampling of resources for genetics education
for health-care professionals
From the US-based National Coalition for Health Professional Education in Genetics(NCHPEG): • Core Competencies in Genetics Essential for All Health Care Professionals (2019) • Core Principles in Genetics (2019) • Genetics and Common Disorders: Implications for Primary Care and Public Health Providers(2019) • Genetics, Race, and Health Care: What We Know and What It Means for Your Practice (2019) • Psychiatric Genetics: A Program for Genetic Counselors (2019) • Family history newsletter (ongoing) • Genetics Resources On the Web (GROW) — a targeted search engine • Genetics in Dentistry (2019) • Genetics for Speech-Language Therapists and Audiologists (2019) From other sources: • Genetics in Clinical Practice: A Team Approach (developed by the US Centers for Disease Control and Prevention and Dartmouth College of Medicine) • Gene Tests and Gene Clinics • National Genetics Education and Development Centre (UK National Health Service)
复旦大学医学遗传学casecontrolTDT分析幻灯片
…CCCCCG … …CCCCCG …
…CCCCCG … …CCTCCG …
…CCTCCG … …CCTCCG …
CC CT TT Total
Case a c e nd
Control b d f nh
Total m1 m2 m3 N
• Directly measure potentially predisposing alleles
2. ‘LD Mapping’ (indirect method)
– ‘exposure status’ not directly measured
– Rely on markers correlated with true exposure status
• This correlation is due to linkage disequilibrium Eg: Genotype a nearby genetic marker among study participants
Direct Method: Candidate Allele Testing
• Must know potentially functional polymorphisms • SNPs may offer set of candidate loci for this method
– Eg, look at non-synonymous cSNPs (those in coding regions that are likely to be functional)
Indirect Tests
• Test for association between marker genotypes and disease outcome
复旦大学医学遗传学课件 case_control_TDT分析(精选)共24页
46、我们若已接受最坏的，就再没有什么损失。——卡耐基 47、书到用时方恨少、事非经过不知难。——陆游 48、书籍把我们引入最美好的社会，使我们认识各个时代的伟大智者。——史美尔斯 49、熟读唐诗三百首，不会作诗也会吟。——孙洙 50、谁和我一样用功，谁就会和我一样成功。——莫扎特
复旦大学医学遗传学课件 case_control_TDT分析（精选）
16、自己选择的路、跪着也要把它走 完。 17、一般情况下)不想三年以后的事， 只想现 在的事 。现在 有成就 ，以后 才能更 辉煌。
18、敢于向黑暗宣战的人，心里必须 ຫໍສະໝຸດ 满光 明。 19、学习的关键--重复。
20、懦弱的人只会裹足不前，莽撞的 人只能 引为烧 身，只 有真正 勇敢的 人才能 所向披 靡。
医学遗传学课件PPT文档63页
染色体病在临床上和遗传上一般 有如下特点
染色体病患者均有先天性多发畸形（包括 特殊面容）、生长、智力或性发育落后、 特殊肤纹
绝大多数染色体病患者呈散发性，这类患 者往往无家族史
少数染色体结构畸变的患者是由表型正常 的双亲遗传而得，这类患者常伴有家族史。
线粒体遗传病
线粒体是细胞内的一个重要细胞器， 是除细胞核之外惟一含有DNA的 细胞器，具有自己的蛋白质翻译系 统和遗传密码。线粒体遗传病就是 由线粒体DNA缺陷引起的疾病， 包括Leber遗传性视神经病等。
03基因突变
诱发基因突变的因素
根据基因突变发生的原因，可将突变分为自发突 变和诱发突变。
在自然条件下，未经人工处理而发生的突变为自 发突变（spontaneous mutation）。
经人工处理而发生的突变是诱发突变（induced mutaion）。
能诱发基因突变的各种内外环境因素统称为诱变 剂（mutagen）。
大多数恶性肿瘤细胞的染色体为非整 倍体，而且在同一肿瘤内染色体数目 波动的幅度较大。
在肿瘤细胞内常见到结构异常的染色 休，如果一种异常的染色体较多地出 现在某种肿瘤的细胞内，就称为标志 染色体（marker chromosome）。
肿瘤特异的染色体标志
四、某些遗传性缺陷或疾 病具有易患肿瘤的倾向性
先天性代谢缺陷
多基因遗传
微效基因（minor gene）
人类的一些遗传性状或某些遗传 病的遗传基础不是一对主基因，而 是几对基因，每一对基因对遗传性 状或遗传病形成的作用是微小的。
多基因遗传
多基因遗传 性状或疾病的遗传方式取决于两
个以上微效基因的累加作用，还受 环境因子的影响，因此这类性状也 称为复杂性状或复杂疾病 （complex disease）。
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alleles/genotypes and disease – Designs to be used
Learning Objectives for This Lecture
• Applications for genetic association analyses • Direct versus indirect association • Indirect association: marker-based disease
association
Genetic Association Studies in Epidemiology
Applications:
• Fine mapping • Candidate gene effects • Whole genome scan • Gene – environment effects • Drug response modification
Eg: Genotype a nearby genetic marker among study participants
APOE gene on c19
..GACTAAGGCCC CCGTTCAAG…GA CCTG..
C/T
A/G
Rely on correlation (LD) between these alleles to detect association!
– Exploits LD • Examples of direct and indirect association studies • Study designs for direct and marker-based (LD)
association
Genetic epidemiology studies – two different concepts
2. ‘LD Mapping’ (indirect method) – ‘exposure status’ not directly measured – Rely on markers correlated with true exposure status • This correlation is due to linkage disequilibrium
Direct Tests
• Test for association between observed genotypes and disease outcome
…CCCCCG … CCG …
…CCTCCG … …CCTCCG …
CC CT TT Total
case-control) • Case-family (trios, sibs, extended families) • Case-only
Learning Objectives for This Lecture
✓ Applications for association analyses • Direct versus indirect association • Indirect association: marker-based association
Case a c e nd
Control b d f nh
Total m1 m2 m3 N
• Directly measure potentially predisposing alleles
Indirect Tests
• Test for association between marker genotypes and disease outcome
Genetic Association Studies in Epidemiology
Common Designs:
• Cross-sectional • Case-control • Cohort • Clinical Trial (drug response hypothesis is really a
1. Direct method – Testing whether a particular allele is a disease predisposing (causative) allele – ‘exposure status’ directly measured
Eg: A particular APOE allele (e4) changes protein isoform
association – Exploits LD between markers and unobserved
disease variants • Examples of direct and indirect association studies • Study designs for direct and marker-based (LD)
• Assessing risk for disease due to specific alleles/genotypes
– Contrast direct / indirect genetic association studies
– Discuss genetic models – Tests and estimates of association between
APOE gene on c19
..GACTAAGGCCC CCGTTCAAGGAA.. C/T
• Genotype that particular site for association study
Genetic epidemiology studies – two different concepts
Fudan Genetic Workshop 2005 Genetic Epidemiology in Populations
Genetic Association Studies: Studies with Unrelated Individuals
Yin Yao
yyao@
Fudan Genetic Workshop, Jan 04 2005
Learning Objectives for This Lecture
• Applications for genetic association analyses • Direct versus indirect association • Indirect association: marker-based disease
association
Genetic Association Studies in Epidemiology
Applications:
• Fine mapping • Candidate gene effects • Whole genome scan • Gene – environment effects • Drug response modification
Eg: Genotype a nearby genetic marker among study participants
APOE gene on c19
..GACTAAGGCCC CCGTTCAAG…GA CCTG..
C/T
A/G
Rely on correlation (LD) between these alleles to detect association!
– Exploits LD • Examples of direct and indirect association studies • Study designs for direct and marker-based (LD)
association
Genetic epidemiology studies – two different concepts
2. ‘LD Mapping’ (indirect method) – ‘exposure status’ not directly measured – Rely on markers correlated with true exposure status • This correlation is due to linkage disequilibrium
Direct Tests
• Test for association between observed genotypes and disease outcome
…CCCCCG … CCG …
…CCTCCG … …CCTCCG …
CC CT TT Total
case-control) • Case-family (trios, sibs, extended families) • Case-only
Learning Objectives for This Lecture
✓ Applications for association analyses • Direct versus indirect association • Indirect association: marker-based association
Case a c e nd
Control b d f nh
Total m1 m2 m3 N
• Directly measure potentially predisposing alleles
Indirect Tests
• Test for association between marker genotypes and disease outcome
Genetic Association Studies in Epidemiology
Common Designs:
• Cross-sectional • Case-control • Cohort • Clinical Trial (drug response hypothesis is really a
1. Direct method – Testing whether a particular allele is a disease predisposing (causative) allele – ‘exposure status’ directly measured
Eg: A particular APOE allele (e4) changes protein isoform
association – Exploits LD between markers and unobserved
disease variants • Examples of direct and indirect association studies • Study designs for direct and marker-based (LD)
• Assessing risk for disease due to specific alleles/genotypes
– Contrast direct / indirect genetic association studies
– Discuss genetic models – Tests and estimates of association between
APOE gene on c19
..GACTAAGGCCC CCGTTCAAGGAA.. C/T
• Genotype that particular site for association study
Genetic epidemiology studies – two different concepts
Fudan Genetic Workshop 2005 Genetic Epidemiology in Populations
Genetic Association Studies: Studies with Unrelated Individuals
Yin Yao
yyao@
Fudan Genetic Workshop, Jan 04 2005