第五讲 PUBMED

2.词汇自动转换
如果在短语上加半角双引号后，系统将只在 Phrase List中查找，不再进行自动转换。 例如： “single cell” “oxygen free radicals”
3.布尔逻辑运算
逻辑词符（AND、OR、NOT）必须大写。 lung AND apoptosis; vitamin c OR ascorbic acid；Lead poising NOT children 运算优先级为: ( )> NOT > AND > OR。 例如：drug therapy AND （asthma OR hay fever） 布尔逻辑检索允许在检索词后面附加字段标识 例如：dna[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]
1.简介
PubMed是由美国国立医学图书馆（National Library of Medicine, NLM）的下属机构国家 生物技术信息中心（National Center of Biotechnology Information, NCBI ）开发的 面向全世界免费开放的生物医学文献数据 库。 PubMed是生物医学领域的权威数据库之一 。
1.简介
PreMEDLINE
PreMEDLINE是一个临时性医学文献 数据库。它每天都在不断地接受新数据， 可为用户提供基本的文献条目和文摘，其 文献条目在标引和加工后每周向MEDLINE移 加一次。 记录标注[PubMed - in process]
1.简介
Publisher Supplied Citation
2.词汇自动转换
如果仍然找不到匹配词，PubMed就会把该词断开后再重 复上述自动词汇转换过程，直到找到与键入的词语相匹配 词语为止。若仍然没有匹配词，单个词会被联一起（用 AND）在全部字段中检索。 例：pressure point转换为("pressure"[MeSH Terms] OR "pressure"[All Fields]) AND point[All Fields]
基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 主题检索 - MeSH Database 检索结果过滤—Choose additional filter
内 容
一、概况介绍 二、检索规则 三、检索方法与技巧 四、检索结果处理
2011年重庆医科大学精品课程申报
三、检索方法与技巧
基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 主题检索 - MeSH Database 检索结果过滤—Choose additional filter
检索历史
•鼠标右键点击序号出现对话框， AND ，OR ，NOT进行逻辑 组配； •删除检索表达式； •显示检索结果； •显示检索详细情况； •保存检索表达式到my ncbi
高级检索——检索历史
பைடு நூலகம்
这里的Add作为逻辑组配的添加按钮， 仅仅是将该检索序号添加到检索表达 式中，逻辑关系默认为AND,检索者可 以在检索表达式生成器中更改
New England journal of medicine 转换为
“N Engl J Med”[Journal]
2.词汇自动转换
3. Phrase List
该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文 词汇书写形式的统一医学语言系统（UMLS: Unified Medical Language System）和补充概 念（物质）名称表[Supplementary Concept (Substance) Name]。 如果PubMed 系统在MeSH词表和刊名转换表中未发 现与检索词相匹配的词，就会查找该短语表。
4.截词检索
通配符：* 在词的末尾加*号，PubMed就会检索出以该词为 词根的所有词，譬如，infect*包括infections， infectious，infective，infectivity，infector等，但 不包括*号后有一个空格的词组。 截词检索将关闭自动词语匹配功能。
三、检索方法与技巧
基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 主题检索 - MeSH Database 检索结果过滤—Choose additional filter
（二）高级检索 界面
生成检索表达式 显示区域 检索表达式 生成器
检索历史
想要查验检索词的转换情况，并进行调整和保存检索策略，可参考网 页右边的“search details”部分
2.词汇自动转换
2. Journals Translation table
包括刊名全称、缩写和ISSN号。该转换表能把键 入的刊名全称转换为“MEDLINE的标准缩写 +[Journal Name]"后进行检索。
1.简介
PubMed的前身是Medline光盘数据库。 PubMed的数据构成： Medline（1966- ） PreMedline Publisher Supplied Citation Old Medline（ -1965）
1.简介
MEDLINE
收录了1950年以来全世界87个国家和 地区37种语言的5600余种生物医学期刊， 其报道的文献量占PubMed总的文献量达92.7%，英 文刊物约占80%；3/4的文献有英文摘要，每周更 新。 内容涉及：医学、药学、牙医学、护理学、卫生 保健、兽医学等专业。 MEDLINE的数据均进行过主题词标引，其可以使 检索结果更加准确和全面。 记录标注[PubMed - indexed for MEDLINE]
2.词汇自动转换
4、Author Index
当一个短语在前三个表中都找不到匹配词，并且有 1或2个字母在词后时，PubMed就会自动到作者索 引中查找。 姓前（全称）、名后（首字母缩写） smith jc自动转化成： Smith, Jc[Full Author Name] OR smith jc[Author] 对于作者检索，PubMed一般要求姓在前，名在后 ，姓用全称，名用缩写： Wang Zhi-Biao 应写成:Wang ZB[au] 或 Wang Z[au]
1.字段限制格式
smith jc[au] lancet[ta] gene therapy[ti] kidney failure[MH]
2.词汇自动转换
1. MeSH Translation table
系统会自动将检索词语转换为相应的MeSH词和 TextWord词（题名词和文摘词）进行检索。 Vitamin c 转换为: "ascorbic acid"[MeSH Terms] OR ("ascorbic"[All Fields] AND "acid"[All Fields]) OR "ascorbic acid"[All Fields] OR "vitamin c"[All Fields]
2.特色 PubMed是文摘型数据库，但是其跟 世界上主要的全文提供商进行合作，提供从文摘 到全文数据库商网站（PMC、Springer等）全文链 接，方便读者获取全文（包括免费和收费）。 PubMed提供对相关网站的检索 能从PubMed检索结果，查看NCBI相关数据库引用 当前检索结果的情况。 可以利用它进行科研课题跟踪
1.简介
目前，PubMed收录的文献量超过 2200万篇，近年报道文献呈逐年递增 的趋势,年报道文献量从以前的近40万条到近 些年稳定在80多万条，每周更新。 收录的其主要收录期刊以及部分在线图书。 学 科 范 围 ： 主 要 来 源 于 生 物 医 学 、 医 学 （ health），部分来源于生命科学、行为科学、 化学科学和生物工程。
对话框中的AND OR NOT in builder是直接 选择逻辑关系进行组配
高级检索——检索历史
高级检索——检索历史
显示检索结果
高级检索——检索历史
Show search details
高级检索——检索历史
功能：将检索表达式保存到my ncbi 中，需要注册MY NCBI，并登录
Save in my ncbi， 除了保存检 索表达式之 外，还具有 设置定题服 务——通过 电子邮件对 课题进行跟 踪
（二）高级检索
主要功能是提供字段进行字段限制检索，逻辑组 配检索，根据检索需要，进行逻辑组配，生成复 杂检索表达式
高级检索——检索表达式生成器
选择字 段
选择逻辑 关系
选择字 段 Crohn's disease
高级检索——检索表达式生成器
检索历史功能：
•显示检索过程 •可以进行逻辑组配 •可以对检索历史进行保存与删除
•PT-Publication Type •DP-Publication Date •SO-Source •EDAT-Entrez Date •TA-Journal Title Abbreviation •GS-GeneSymbo •TI-Title •IS-ISSN •UID-Unique Identifiers
(三)主题检索
(三)主题检索
•检索结果按相关性排序。
主题词 主题词注释
主题词变更时间
(三)主题检索
副主题词
为什么需要 选择副主题 词？ 对主题词进 行限定，可 以使检索结 果更加专指， 更加准确。
(三)主题检索
"Breast Neoplasms/complica tions"[Mesh]
三、检索方法与技巧
出版商直接向PubMed递送的电子文献。 记录标注[PubMed - as supplied by
publisher]
2.特色
PubMed中的主要数据来源于Medline 光盘数据库，而Medline光盘数据的特点是 所有数据均进行了主题标引，并提供了 MeSH主题词途径检索，使检索结果更加准 确。 PubMed具有强大的词语自动匹配转换功能 ，能对意义相同或相近的词语或词组进行 全面搜索，并自动转换后再进行检索。
4.界面 数据库 选择 检索框
个性化 服务
高级检索
帮助
工具
更多资源
内 容
一、概况介绍 二、检索规则 三、检索方法与技巧 四、检索结果处理
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二、检索规则
1.字段
AB-Abstract LA-Language AD-Affiliation MH-MeSH Terms AU-Authors PMID-PubMed Unique Identifier CY-Country
三、检索方法与技巧
基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 主题检索 - MeSH Database 检索结果过滤—Choose additional filter
(三)主题检索
(三)主题检索
问题：PubMed本身具有自动智能功能为什么 还需要单独用MeSH进行检索呢？
3.网址 http://www.pubmed.gov http://www.pubmed.net http://www.pubmed.org http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/m/pubm ed/ 手机
PubMed
黄成 信息管理系文献检索教研室 attila520@gmail.com
重庆医科大学信息管理系
内 容
一、概况介绍 二、检索规则 三、检索方法与技巧 四、检索结果处理
2011年重庆医科大学精品课程申报
内 容
一、概况介绍 二、检索规则 三、检索方法与技巧 四、检索结果处理
2011年重庆医科大学精品课程申报
（一）基本检索：Basic Search 直接输入检索词或检索式
1、基本检索特点 可以输入任何字词，包括关键词、标题、 作者、作者单位、主题词，甚至一句话，系统会 自动识别并自动匹配进行检索。 可以输入逻辑检索表达式 HIFU AND cancer 可以进行字段限制检索：ultrasound[MH]