生物信息学的应用

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BT基因的杀虫机理
Bt的致病机理——杀虫机理
Bt伴胞晶体被敏感昆虫摄食后，在中肠蛋白酶的作用下溶解并激活，释 放出毒素核心肽段；而后毒素作用于中肠上皮细胞，引起细胞膨胀和裂 解，由此引起昆虫肠道麻痹和肠道穿孔，消化道细胞的离子和渗透压平
衡遭到破坏，最终导致昆虫死亡，这在昆虫致死作用中占主导地位。
了 指导作 用。 为
SARS病毒
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HIV 病毒
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比如
为什么艾滋病毒选择性地侵染某一物种（人类）， 而与之具有紧密关联的另一病毒（猿的免疫缺陷 病毒）只侵染猿猴而不侵染人类？对病毒及宿主 细胞受体进行序列分析有可能解决这个问题。
一些病毒为什么能够改变它们的天然宿主？1997 年，一种禽流感病毒感染了18个人并导致其中6人 死亡。对从这种感染人类的流感病毒中得到的基 因进行序列分析，发现这些基因似乎并不决定其 病毒的宿主特异性
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我们是不是可以用疫苗来防御HIV病毒呢？
HIV
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可惜的是HIV是RNA病毒， RNA病毒冠状病毒直径为80～160nm， 为有包膜的单股RNA病毒RNA的复制过程中，其错误修复机制的酶的 活性很低很低，几乎是没有的，所以其变异很快。而疫苗是要根据病 毒的固定基因或蛋白进行开发制作的，而且RNA提取难度也比较大， 所以RNA病毒 疫苗较难开发。
陷病毒（SIV什么）以及
缺陷病毒
HIV-1
(SIVlhost).suntailed猴的
2 来自黑色非洲白眉猴的
猿免疫缺陷病毒(SIVsun)，
猿免疫缺陷病毒（SIVsm） 以及来自西非洲大狒狒的
以及HIV-2和短尾猿猿免
猿免疫缺陷病毒(SIVmnd)
疫缺陷病毒(SIVmac)
3 来自非洲绿猴的猿免疫 缺陷病毒（SIVagm）
另外，芽胞可以经虫口进入消化道，在毒素破坏中肠后，菌体可以进入 体腔进行大量繁殖，引起幼虫败血症。
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生物信息学的应用
一、病毒基因的测序与应用 重点介绍HIV病毒
二、生物信息学与农业
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病毒基因的测序与应用
生物信息学工具非常适合于解决一些尚未 获得答案的病毒学问题
卫生 院民主 评议党 员个人 的开展 能使卫 生院整 体工作 进展顺 利并有 特点。 卫 生 院 民 主 评 议党员 是小编 想跟大 家分享 的，欢 迎大家 浏览。 【 1】 卫 生 院民 主 评议党 员个人 工作总 结根据 《大学 医学院 关于做 好民主 评议党 员工作 的通知 》 的 精神和 医学院 党委的 有关工 作部署 ，我院 自年月 日进入 民主评 议党员 工作以 来 ， 在医学 院党委 的指导 下，院 党委精 心设计 ，合理 安排， 周密组 织，结 合我院 支 部 工作的 实际情 况，认 真研究 布置了 民主评 议党员 工作。 各支部 先后进 行了学 习 教 育、听 取意见 、自我 总结、 民主评 议等工 作。在 民主评 议的整 个过程 中，工 作 开 展顺利 ，党员 和群众 态度真 诚，工 作成效 明显， 达到了 预期的 目的， 取得了 良 好 的效果 。具体 表现在 以下几 个方面 ： 一、精 心组织 ，统一 思想认 识 进 入 民主评 议工作 后，我 院紧紧 抓住提 高党员 思想认 识这个 关键， 对此次 工作做 出 全 面部署 。通过 层层宣 传发动 、组织 讨论， 使每位 党员充 分认识 到民主 评议是 新 时 期加强 党的建 设的一 项重要 制度， 是对党 员进行 党性教 育、管 理和监 督的有 效 方 法，是 从严治 党，提 高党员 素质的 重要途 径。院 党委根 据上级 党委要 求，对 民 主 评议工 作的内 容、时 间做了 具体安 排，并 制定了 详细日 程，为 活动的 开展起 到
生物信息学可以帮助我们了解更多HIV的基因信息。从中找出 最适合HIV的方法。
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生物信息学对克制HIV也有很大 帮助
通过NCBI网站的数据库，查询HIV序列的相关信 息 通过BLAST，查找HIV的同源基因 通过树状图查找出与HIV最相似的基因 研究其相似基因，找出其中克制HIV的方法
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找寻与HIV最为相似的片段基因， 通过其同源基因,找出编码侵入人 体的蛋白或者酶的基因序列。然 后研究同源基因与HIV相似性，分 析出编码序列，找寻某种物质阻 碍该序列的表达。最后在HIV中进 行实践。
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农业生物信息学基因图谱研究为加快转基因作物育种和生物 信息学的农业应用打下了良好基础，对作物进行基因组分析需要 生物信 息学工具。生物信息学的特殊作用主要体现在以下３个方面：
通过比较基因组学、表达分析和功能基因组分析识别重要基因， 为培育转基因作物、改良作物的质量和数量性状奠定基础；
以信号受体和转录途径组分分析为基础，进行农业化合物设计， 结合化学信息学方法，鉴定可用于杀虫剂和除草剂的潜在化学 成分；
利用植物遗传资源，保护农作物遗传多样性。
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通过生物信息学了解一些植物的抗虫基因，比如BT基因
BT基因： BT基因即是苏云金芽胞杆菌基因。苏云金芽胞杆菌
可以分泌一种毒蛋白，对鳞翅目鞘翅目昆虫（比如小菜 蛾）有很强的杀伤作用。人类很早就研究利用BT菌来 杀灭害虫，总共有100多年历史。随着分子生物学技术 的发展和基因克隆、DNA操作等技术出现，人类开始从 BT菌中克隆其毒蛋白基因到工程菌中，制作生物农药。 不过现在随着广泛的应用，害虫也大量出现抗药性。
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HIV通过血液，侵入人体，潜藏在T淋 巴细胞，破坏人体免疫细胞，然后集体失 去免疫能力，各种病菌，病毒使人死去。 HIV病毒侵染一般都先附着在细胞上，然后 通过分泌酶或者其他蛋白质破坏细胞膜， 将RNA注入细胞中，在进行逆转录转录，翻 译等过程。
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血
液
破裂的
T淋巴
潜藏
淋巴细
细胞
胞
HI
HI
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4 来自赛克斯猴的猿免疫 缺陷病毒(SIVsyk)
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关于艾滋病种类
艾滋病毒1型病毒（HIV-1）和艾滋2型病毒（HIV-2） 是属于慢病毒亚科的逆转录病毒。病毒可能来自撒哈拉以南 非洲，在那里艾滋病毒的株型最多和感染率也最高。
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HIV传染途径
众所周知HIV传染途径有血液传播，性 传播，母婴垂直传播等，一般传染病我们 可以通过切断其中的传染途径中的环节来 控制其病情。
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为什么某些病毒株比其他病毒株具有更高 的致命性？1918年的一次世界范围的流感 爆发造成全球约4000万至1亿人死亡。研究 人员通过收集的1918年病毒样品和现代的 流感病毒进行序列比较来研究这一问题
病毒躲避宿主免疫系统的机制是什么？
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病毒是小的、具有感染性的、必须在细胞内生存 的寄生生物。病毒体由一个核酸基因组以及封装 这个基因组的蛋白质（衣壳体）构成，其外侧还 可能有来源于宿主细胞的并布满病毒糖蛋白的脂 双层包被
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利用生物信息学可以更方便更快捷的找到比较正确的方向，避 免了很多盲目性，实现了世界内研究成果的共享。更有利用HIV的控 制，及其其他病毒的控制。
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生物信息学与农业
拟南芥、水稻等模式植物的全基因组测序工作完成之后，其序列图谱 完全可以在基因组数据库中查询。玉米、棉花等农作物的基因组数据库也 正在构建之中。在功能基因组研究方面，有关农作物生长发育、细胞信号 和基因调控的网络资源层出不穷。对于得到的全基因组序列，也就是规模 的序列数据，必须用全新的视角来观察，考虑怎样才能更好的组织和解读 好这些数据。对于一个特定的农作物，如果还没有它的全基因组序列，可 以用 相关的亲缘关系近的同线物种的基因组来替代。由于水稻、高粱和其他重 要的农作物有相似的基因组水平，水稻和高粱基因组全基因组测 序完成已经对农作物生物技术学和农作物生物信息学产生了重大的 影响
病毒的基因组只能是DNA，或者只能是RNA。此 外，它们可能是单链、双链或部分双链，而且可 能是环形、线形或分为多段（不同的基因分布在 不同的核酸片段上）
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在以POL蛋白全序列为基础建立的系统发生树 中，灵长且慢病毒亚科分布在五个方面的谱
系中，分别为以下：
1 来自黑猩猩的猿免疫缺 5 来自弯钩长尾猴的猿免疫