c-kit基因检测
髓系白血病患者SHP-1与c—kit基因检测的临床意义
Ａ ｓｒｃ：［ ｊｃｉｅ ｏｉｖｓｉａｅｔｅｅ ｐｅｓ ｎｏ ｅ ｔｐ ｉ ｉ ｃｌｐ ｏｐ ａａｅ（ＨＰ １ ｅ ｅａ ｄｃ ｂｔ ｔ Ｏｂｅｔ ］Ｔ ｅｔ ｔ ｈ ｘ ｒｓｉ ｆ ｍａｏ ｏｅ ｃ ｅｌ ｈ ｓｈ ｔｓ Ｓ ）ｇｎ ｎ 一 ａ ｖ ｎ ｇ ｏ ｈ ｔ 一
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ＣＰ ｔ ｅ ｍｅ ｎ ｌｖ １ｏ — ｉ ｗａ ｉ ｈ ｒ ｔ ａ ｈ ｔ ｏ ｈ ａ ｅ ｅ ｆｃ ｋ ｔ ． ｓ ｈ ｇ ｅ ｈ ｎ ｔ ａ ｆ ＮＣ，ｔ ｅ ｅ ｗａ ｔ ｔｓｉａ ｉ ｅ ｅ ｃ ｅ ｗｅ ｎ ＣＭ Ｌ— Ｐ ａ ｄ ｈ ｒ ｓ ｓ ａ ｉｔｃ ｌｄ ｆ ｒ ｎ ｅ ｂ ｔ ｅ ｆ Ｃ ｎ
系 白血 病 患 者 预 后 的 指 标 。
Ｌ 关键 词］ 白血病 ； 酸酶 ； 癌基 因蛋 白质 ｃ ｉ 基因 ； 磷 原 —ｔ ｋ； 聚合酶链反 应 ［ 中图分类 号］ Ｒ ５ ５ ［ 文献标识码］ Ａ ［ 文章编号］ １０—６Ｘ（０７１＇０８０ ０２２６ ２０）００１＇３
C-KIT基因突变在伴t(8;21)M2型急性髓系白血病中的分析
C-KIT基因突变在伴t（8；21）M2型急性髓系白血病中的分析【背景与目的】C-KIT受体是一种由C-KIT原癌基因编码的Ⅲ型跨膜受体酪氨酸激酶,其配体为干细胞因子(stem cell factor,SCF),C-KIT基因突变引起C-KIT受体的持续活化,从而赋予了造血前体细胞增殖或生存优势。
至今有多篇文章报道了在核心结合因子相关性急性髓系白血病(core binding factor-AML, CBF-AML)患者中C-KIT基因第8和17号外显子突变的发生率较高,成为目前CBF-AML患者中最常见的一种分子遗传学异常;且发生C-KIT基因突变的CBF-AML 患者具有相对特异的临床特征和预后。
鉴于现阶段国内尚无大样本病例的相关临床研究,我们收集了78例成人伴t(8;21)AML-M2患者的初诊骨髓标本,从以下三方面进行研究:(1)检测C-KIT基因第8和第17号外显子突变在78例伴t(8;21)AML-M2患者中的发生率及突变类型;(2)分析C-KIT基因突变阳性患者的临床资料探讨其临床特征及预后,了解此基因突变对临床预后的影响;(3)同时检测了JAK2V617F基因突变,了解这两种基因突变发生的关系及对预后的影响。
【病例与方法】78例成人t(8;21)AML-M2患者来自2004年2月～2008年1月我单位住院或门诊初诊病例,其中男性43例、女性35例;年龄在14～77岁之间,中位年龄为37岁。
所有患者经骨髓细胞形态学、免疫表型、染色体和融合基因检查确诊。
主要研究方法为:(1)应用基因组DNA-聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)扩增C-KIT基因第8和17号外显子,将PCR产物回收纯化后进行基因测序;(2)分析78例t(8;21)M2患者的临床及实验室资料,了解C-KIT基因突变阳性患者的临床特征;(3)随访上述患者了解其对治疗的反应、持续缓解以及生存情况,分析C-KIT基因突变对患者预后的影响;(4)采用等位基因特异性PCR(allele-specific PCR, AS-PCR)方法检测此78例患者的JAK2V617F基因突变发生情况,综合分析其临床资料了解两种基因突变发生的关系及对预后的影响。
胃肠道间质瘤临床病理及c-KIT基因检测
胃肠道间质瘤临床病理及c-KIT基因检测司海鹏;许红英;李惠;陈劼;王剑蓉【摘要】目的：探讨胃肠道间质瘤(Gastrointestinal stromal tumors，GIST)的临床病理、免疫组织化学和c-KIT基因突变情况。
方法收集我院2010年4月至2012年12月收治的26例经手术切除病理确诊的GIST患者，对26例病例采用免疫组织化学行c-KIT蛋白(CD117)、CD34、平滑肌肌动蛋白（SMA)、人S100蛋白(S-100)检测，以确诊为GIST。
采用直接测序方法对c-KIT基因11、9、13、17号的外显子突变进行序列分析。
结果26例病例中CD117阳性为22例，共14例(53.8%)检测到c-KIT突变，第11外显子是KIT基因最常见的突变位点，检测到的突变形式主要有缺失突变，点突变和插人突变，均为杂合性突变。
结论CD117阳性及c-KIT突变是GIST的普遍现象，突变位点有集中趋势，以梭形细胞型突变最常见。
%Objective To explore the clinicopathological, immunohistochemical features and c-KIT gene muta-tions of gastrointestinal stromal tumors (GIST). Methods Twenty-six patients of GIST confirmed pathologically in our hospital from Apr. 2010 to Dec. 2012 were detected for CD117, CD34, smooth muscle actin (SMA) and S-100 with im-munohistochemistry to confirm the diagnosis. Direct sequencing technique was used to identify the mutation of c-KIT (exon 9,11,13,17). Results Among the 26 patients, there were 22 patients with CD117 positive and 14 patients (53.8%) with mutations of c-KIT. Mutations of c-KIT exon 11 were mostly detected, mainly deletion, point mutation and inser-tion. Conclusion CD117 positivity and c-KIT mutation are common in GIST, and they are mostly detected in spin-dle-cell GISTs.【期刊名称】《海南医学》【年(卷),期】2016(027)005【总页数】4页(P706-708,709)【关键词】胃肠道间质瘤;病理;c-KIT基因;检测【作者】司海鹏;许红英;李惠;陈劼;王剑蓉【作者单位】南京中医药大学附属医院病理科，江苏南京 210029;南京中医药大学附属医院病理科，江苏南京 210029;南京中医药大学附属医院病理科，江苏南京 210029;南京中医药大学附属医院病理科，江苏南京 210029;南京中医药大学附属医院病理科，江苏南京 210029【正文语种】中文【中图分类】R735胃肠道间质瘤(Gastrointestinal stromal tumors，GIST)是梭形和或上皮样细胞组成的的间叶性肿瘤，起源于肠道的起搏细胞、消化道Cajal细胞[1](Intestinal cell of Cajal，ICC)。
《2024年CT影像组学分析鉴别胃肠道间质瘤c-kit基因9-11号外显子突变的初步研究》范文
《CT影像组学分析鉴别胃肠道间质瘤c-kit基因9-11号外显子突变的初步研究》篇一CT影像组学分析鉴别胃肠道间质瘤c-kit基因9-11号外显子突变的初步研究一、引言胃肠道间质瘤（Gastrointestinal Stromal Tumors，GISTs）是一种常见的胃肠道间叶性肿瘤，其发病机制与c-kit基因的突变密切相关。
c-kit基因的9/11号外显子突变是GISTs的主要驱动因素之一。
因此，准确鉴别GISTs的c-kit基因突变状态对于临床治疗和预后评估具有重要意义。
然而，传统的病理学检测方法耗时且具有一定的创伤性，因此，寻求一种无创、高效的鉴别方法显得尤为重要。
近年来，随着影像组学的发展，CT影像技术在GISTs 的鉴别诊断中显示出巨大的潜力。
本研究旨在通过CT影像组学分析，初步探讨鉴别GISTs c-kit基因9/11号外显子突变的可能性。
二、材料与方法1. 研究对象本研究纳入了一组GISTs患者，所有患者均接受CT检查，并进行了c-kit基因突变检测。
2. CT影像采集与处理采用多排螺旋CT扫描仪进行腹部扫描，获取患者的CT影像数据。
对CT影像进行预处理，包括噪声抑制、图像增强等操作，以提高图像质量。
3. 影像组学分析通过影像组学软件对预处理后的CT影像进行特征提取，包括形态学特征、纹理特征、密度特征等。
将提取的特征输入机器学习算法进行训练和测试，以鉴别GISTs的c-kit基因突变状态。
4. 统计学分析采用SPSS软件进行数据分析，比较不同c-kit基因突变状态患者在CT影像特征上的差异，评估机器学习模型的性能。
三、结果1. CT影像特征分析通过对CT影像进行特征提取，我们发现c-kit基因突变患者与非突变患者在肿瘤大小、形态、密度、边缘等方面存在显著差异。
具体而言，c-kit基因突变患者的肿瘤通常较大，形态不规则，密度不均匀，边缘模糊。
2. 机器学习模型性能评估我们将提取的CT影像特征输入机器学习算法进行训练和测试。
胃肠道间质瘤的ckit基因突变检测
胃肠道间质瘤的ckit基因突变检测作者：杨锋丁宝国杨堂斗贺慧颖钟镐镐李燕郑杰吴秉铨【摘要】目的探讨CD117阳性的胃肠道间质肿瘤c kit基因突变分布及类型。
方法采用免疫组化技术，对10例GIST标本行CD117、CD34、SMA和S100检测，以确诊为GIST；采用PCR 技术对CD117阳性的GIST进行c kit 基因突变检测；采用直接测序方法对突变c kit基因11、9、13和17号的外显子突变进行序列分析。
结果4例成功提取了肿瘤DNA，其中3例检出了ckit基因突变，均分布于第11号外显子，均为557～558的缺失性突变；其中2例为纯合子性突变，1例为杂合子性突变。
结论CD117阳性的GIST通常有c kit基因突变，其11号外显子是经典分布热点，变异纯合子和杂合子突变为常见类型。
【关键词】胃肠道间质肿瘤；DNA突变分析；c kit基因［ABSTRACT］ObjectiveTo explore the locus and types of c kit (CD117) mutations in gastrointestinal stromal tumors (GIST).MethodsSpecimens of 10 GIST cases were detected immunohistologically for CD117, CD34, SMA and S100 to confirm thediagnosis of GIST. For CD117positive GIST, the mutation of c kit was detected by PCR, and its exons 11, 9, 13 and 17 analyzed by direct sequencing was successfully isolated in four cases, inwhich, mutation of c kit was found in three cases, all the genes detected were at c kit exon 11 with codon 557-558(WK), homozygous mutation being noted in two cases and heterozygous in is usually ckit gene mutations in CD117positive GIST, the exon 11 being classic “hot spot” of the mutations. The homozygous and heterozygous are their common types.［KEY WORDS］Gastrointestinal stromal tumor; DNA mutationa analysis; c kit gene胃肠道间质瘤是近年来被认识并命名的新实体瘤，CD117是其特异性敏感标志物[1]。
各个基因检测的意义
基因检测各项指标意义1、肺癌靶标检测及化疗药物：检测指标检测指标意义ALK基因融合阳性可使用CrizontinibVEGFR mRNA VEGFR过表达→血管生成抑制因子，如BevacizumabEGFR突变 Exon19缺失, Exon21突变可使用EGFR-TKI药物，T790M突变易耐药KRAS突变突变→西妥昔单抗、帕尼单抗、吉非替尼、厄洛替尼易耐药BRAF突变突变→西妥昔单抗、帕尼单抗、吉非替尼、厄洛替尼易耐药PTEN表达NSCLC中PTEN在蛋白水平上的表达随NSCLC分化程度的降低、TNM 分期增高而降低，对NSCLC的浸润和转移有一定的促进作用，蛋白水平表达越低，恶性度越高，预后越差，可作为判断NSCLC预后的指标之一PIK3CA突变突变→拉帕替尼、曲妥珠单抗易耐药EGFR基因表达过表达→可使用西妥昔单抗，帕尼单抗MET拷贝数扩增-可使用CrizotinibERCC1 mRNA低表达-铂类敏感性增加BRCA1 mRNA低表达-铂类敏感性增加TYMS mRNA低表达-氟尿类敏感性增加TUBB3 mRNA低表达-紫杉醇类敏感性增加STMN1 mRNA低表达-紫杉醇类敏感性增加RRM1 mRNA低表达-吉西他滨敏感性增加TOP2A mRNA低表达-蒽环类不敏感TOP1 mRNA高表达-喜树碱类敏感二、胶质瘤靶标检测3、直肠癌靶标4、胃癌Her2基因过表达----赫赛汀（Herceptin）的使用Her2基因扩增----赫赛汀（Herceptin）的使用EGFR变异检测： TKI类药物西妥昔单抗（Cetuximab）的使用ＫＲＡＳ变异检测：耐药基因检测HERG1表达----瑞格非尼（Regorafenib）的使用MET扩增----ARQ-197(Tivantinib)的使用VEGFR2表达----瑞格非尼（Regorafenib）的使用5、胃肠间质瘤C-KIT基因突变----D816V突变的检测，携带有C-KIT突变的胃间质瘤病人服用伊马替尼（Imatinib格列卫）有显著治疗效果。
c-kit基因检测
注：图中显示c-kit基因11号外显子突变
C-kit基因
无锡四院c-kit基因检测情况
一般特征：共35例，其中男性23例，女性12例； 年龄最大85岁，最小33岁，中位年龄64岁；胃 间质瘤14例，肠间质瘤10例，另11例信息不全。 突变状况如下：
外显子 突变例数 突变率 9号 6 17.1% 11C-KIT基因
C-KIT基因
• C-KIT基因位于人染色体4q12-13，属于原癌基因，其产物是Ⅲ型酪氨酸激酶。 C-KIT原癌基因表达产物C-KIT受体与其配体细胞因子结合后，可激发酪氨酸残 基磷酸化，从而调节细胞的生长，对肿瘤的增殖、恶性演进及凋亡等方面都 有重要作用1。 格列卫（Glivec）是一种酪氨酸激酶抑制剂，经FDA批准可用于治疗C-KIT阳性、 不能手术切除和/或转移性的恶性GIST，其临床疗效令人振奋。其作用机理在 于药物结合于KIT蛋白胞浆内酪氨酸激酶功能区的ATP结合位点，阻断磷酸基 团由ATP向底物酪氨酸残基的转移，从而抑制细胞增殖并恢复细胞凋亡程序 2,3。 临床研究表明GIST中C-KIT基因的突变情况与格列卫分子靶向治疗的疗效相关： 存在11号外显子突变患者的疗效最好，存在9号外显子突变的患者疗效次之， 而野生型GIST的疗效最差。另外，对于9号外显子突变的患者，提高用药剂量 可显著提高疗效2-4。格列卫耐药相关突变主要发生在17号外显子D816V突变。 检测C-KIT基因突变对于指导GIST患者的合理用药，具有重要的参考价值1-4。 参考文献: 1.Jason L. Hornick et al. Human Pathology. 2007; 38: 679-687. 2.M. Pedersen et al. J. Cell Signa 2009; 21: 413-418. 3.Arturo Vega-Ruiz et al. J Leuk Res. 2009; 33: 1481-84. 4.Jianmin Sun et al. J Bio Che. 2009: 284: 11039-47.
50例胃肠道间质瘤中c-kit基因突变的检测及意义
50例胃肠道间质瘤中c-kit基因突变的检测及意义摘要】目的探讨c-kit基因在胃肠道间质瘤（GIST）中的突变状况。
方法用PCR扩增和直接测序的方法,检测50例GIST中c-kit基因11号外显子突变。
结果 50例GIST中c-kit基因突变率为54.0%。
不同侵袭危险组、部位、年龄组、性别、组织学分型、有无坏死及是否浸润至邻近器官等之间比较c-kit基因突变率均无显著性差异（P＞0.05）。
结论 c-kit基因突变参与了部分GIST的发生。
【关键词】胃肠道间质瘤 c-kit基因聚合酶链反应突变【中图分类号】R730 【文献标识码】A 【文章编号】2095-1752（2012）29-0097-02胃肠道间质瘤（gastrointestinal stromal tumor,GIST）是人类胃肠道最常见的间叶源性肿瘤，c-kit基因及血小板衍生生长因子受体A（platelet-derived growth factor receptor alpha, PDGFRA）基因突变是GIST发生的分子生物学基础[1]。
1 材料与方法1.1材料收集遂宁市中心医院病理科2000年1月—2012年1月的胃肠道间质瘤50例，标本均为10%的福尔马林溶液固定，常规石蜡包埋,HE染色，两位熟练病理医师复习切片。
1.2免疫组化采用SP法，实验常规设置阳性对照及阴性对照，部分使用内对照。
CD117、CD34、SMA、S-100、Desmin购自Dako公司，SP试剂盒购自福州迈新生物技术有限公司。
CD117、CD34阳性染色定位于细胞质和（或）细胞膜，SMA、Desmin定位于细胞质，S-100定位于细胞质和（或）细胞核。
1.3诊断标准 50例GIST中，48例CD117阳性而确诊，2例CD117阴性者有1例因CD34阳性，SMA、Desmin和S-100蛋白阴性而确诊，1例 CD117阴性者因SMA、Desmin和S-100蛋白均阴性,排除了平滑肌源性和神经源性肿瘤,形态符合GIST而纳入本研究。
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• C-kit基因检测的意义
• • • • 外显子9突变，服用格列卫的剂量需要加倍； 外显子11突变，对格列卫药物反应性好； 外显子13突变，对格列卫药物反应性好； 外显子17-D816V突变，对格列卫药物产生耐药。
C-kit基因检测方法
• 检测方法：Sanger测序法 • 检测仪器：ABI3500Dx 测序仪 • 检 测 内 容：C-KIT基因Exon9、Exon11、 Exon13、Exon17体细胞突变 • DNA抽提：石蜡包埋组织DNA提取试剂盒
C-KIT基因
C-KIT基因
• C-KIT基因位于人染色体4q12-13，属于原癌基因，其产物是Ⅲ型酪氨酸激酶。 C-KIT原癌基因表达产物C-KIT受体与其配体细胞因子结合后，可激发酪氨酸残 基磷酸化，从而调节细胞的生长，对肿瘤的增殖、恶性演进及凋亡等方面都 有重要作用1。 格列卫（Glivec）是一种酪氨酸激酶抑制剂，经FDA批准可用于治疗C-KIT阳性、 不能手术切除和/或转移性的恶性GIST，其临床疗效令人振奋。其作用机理在 于药物结合于KIT蛋白胞浆内酪氨酸激酶功能区的ATP结合位点，阻断磷酸基 团由ATP向底物酪氨酸残基的转移，从而抑制细胞增殖并恢复细胞凋亡程序 2,3。 临床研究表明GIST中C-KIT基因的突变情况与格列卫分子靶向治疗的疗效相关： 存在11号外显子突变患者的疗效最好，存在9号外显子突变的患者疗效次之， 而野生型GIST的疗效最差。另外，对于9号外显子突变的患者，提高用药剂量 可显著提高疗效2-4。格列卫耐药相关突变主要发生在17号外显子D816V突变。 检测C-KIT基因突变对于指导GIST患者的合理用药，具有重要的参考价值1-4。 参考文献: 1.Jason L. Hornick et al. Human Pathology. 2007; 38: 679-687. 2.M. Pedersen et al. J. Cell Signa 2009; 21: 413-418. 3.Arturo Vega-Ruiz et al. J Leuk Res. 2009; 33: 1481-84. 4.Jianmin Sun et al. J Bio Che. 2009: 284: 11039-47.
注：图中显示c-kit基因11号外显子突变
C-kit基因
无锡四院c-kit基因检测情况
一般特征：共35例，其中男性23例，女性12例； 年龄最大85岁，最小33岁，中位年龄64岁；胃 间质瘤14例，肠间质瘤10例，另11例信息不全。 突变状况如下：
外显子 突变例数 突变率 9号 6