重组蛋白表达系统的选择
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重组蛋白表达系统的选择、表达策略和方法学研究
张宁
1. 前言
在生命科学的很多研究和应用领域中,如何获得大量、均一、高纯、有活性的蛋白质都是一个关键问题。现代重组蛋白表达技术为我们提供了多种选择:传统的大肠杆菌、酵母、昆虫和哺乳动物细胞表达系统以及较新的植物和体外表达系统。每种表达系统都有很多成功的例子,但重组蛋白的个性不尽相同,没有任何一个系统和方法是普遍适用的,为目的蛋白选择一个恰当的表达系统也就成为表达工作的重中之重。
关于目的蛋白的一切信息,对表达系统的选择都是有帮助的,有几个最基本的问题一定要在表达之前回答清楚:目的蛋白的来源是原核还是真核生物?具有什么样的功能?分子量和聚合状态?是膜蛋白还是水溶蛋白?胞内表达还是分泌表达?是否需要以及需要何种翻译后修饰?有没有配体、底物或产物类似物可以利用?对蛋白酶是否敏感?有多少分子内及分子间二硫键?对目的蛋白的表达量、活性、表达速度和成本有怎样的要求?除了摸清目的蛋白的脾性,还要清楚各个表达系统的特点、优势和局限性,才能找到表达工作的大略方向,要获得最适合目的蛋白的表达方案,还需要在具体实验中调整优化。
表1比较了目前常用的表达系统的特点,并给出了粗略的适用范围。
大肠杆菌酵母昆虫细胞哺乳动物细胞流程简单简单复杂复杂
培养基简单简单复杂复杂
成本低低中高
产率高中中低
表达量高高较高较低
蛋白折叠中较好较好好
胞外表达周质空间分泌至培养基分泌至培养基分泌至培养基
细胞增殖周期30min 90min 18H 24H 折叠常有错误折叠偶有不当折叠正确折叠正确
二硫键难以形成有有有
N-糖基化无甘露糖残基,高无唾液酸,简单复杂
O-糖基化无有有有
磷酸化无有有有
酰化无有有有
γ-羧基化无无无有
适用原核蛋白、简单
真核蛋白
真核蛋白、分泌
表达蛋白
真核蛋白、分泌
表达蛋白
复杂高等真核生
物蛋白
表1:常用表达系统比较
2. 原核表达系统
原核表达系统发展完善、流程简单快速、成本低、产量高,对大部分蛋白来说都值得一试,尤其适宜于表达原核来源的以及不需要翻译后修饰的真核蛋白。
2.1 表达菌株
原核表达系统刚用的宿主菌有E. coli,Bacillus等。其中革兰式阳性的Bacillus更适宜在其周质空间分泌表达重组蛋白;革兰氏阴性的E. coli能够广谱表达异源蛋白。
大肠杆菌表达系统是目前发展最完善的重组蛋白表达系统。常用大肠杆菌菌株有BL21(DE3)、BL21(DE3)Star、B834(DE3)等,这些菌株都敲除了蛋白酶,并溶源了噬菌体DE3。DE3是的一种衍生λ噬菌体,带有噬菌体21抗性区和lacI基因,lac UV5启动子,以及T7 RNA聚合酶基因。这一区段被插入int基因,因此阻止了DE3在没有辅助噬菌体时整合到染色体上或从染色体切出。一旦形成DE3溶原状态,就只有受IPTG诱导的lac UV5启动子指导T7 RNA聚合酶基因转录,在溶原培养体系中加入IPTG诱导T7 RNA聚合酶生产,继而质粒上的目的DNA开始转录。同时,还有一些特殊设计的菌株以表达有特殊需要的重组蛋白,如甲硫氨酸营养缺陷型表达硒代甲硫氨酸蛋白,溶解性增强的菌株表达毒性蛋白,补充了稀有密码子的菌株表达真核蛋白等,表2给出了常用的大肠杆菌表达菌株。
常用表达菌株应用抗生素抗性
B834 met营养缺陷性,对照株,不能使
用T7启动子,蛋白酶敲除
无
B834(DE3) met营养缺陷性,蛋白酶敲除无
BL21 对照株,不能使用T7启动子,蛋
白酶敲除
无
BL21(DE3) 常规表达宿主菌,蛋白酶敲除无
BL21(DE3) 高严紧表达宿主菌,蛋白酶敲除氯霉素(34μg/ml)
BL21trxB(DE3) 常规表达宿主菌,在E.coli胞质中
形成二硫键,蛋白酶敲除
卡那霉素(15μg/ml)
BL21trxB(DE3)pLysS 高严紧表达宿主菌,在E.coli胞质
内形成二硫键,蛋白酶敲除
卡那霉素(15μg/ml)
氯霉素(34μg/ml)
Origami 对照株,不能使用T7启动子四环素(12.5μg/ml)卡那霉素(15μg/ml)
Origami(DE3) 常规表达宿主菌,更好的在E.coli
中形成二硫键
四环素(12.5μg/ml)
卡那霉素(15μg/ml)
Origami(DE3)pLysS 高严紧表达宿主菌,更好的在
E.coli中形成二硫键
四环素(12.5μg/ml)
卡那霉素(15μg/ml)
氯霉素(34μg/ml)
Rosetta 对照株,不能使用T7启动子,蛋
白酶敲除
氯霉素(34μg/ml)
Rosetta(DE3)
常规表达宿主菌,lac
透性酶突变,可以控制表达水平,
提供稀有密码子tRNAs,蛋白酶敲
除
氯霉素(34μg/ml)
Rosetta(DE3)pLysS 高严紧表达宿主菌,lac透性酶突
变,可以控制表达水平,提供稀有
密码子tRNAs,蛋白酶敲除
氯霉素(34μg/ml)
Rosetta-gami 对照株,不能使用T7启动子四环素(12.5μg/ml)卡那霉素(15μg/ml)氯霉素(34μg/ml)
Rosetta-gami(DE3) 常规表达宿主菌,更好的在E.coli
胞质内形成二硫键,提供稀有密码
子tRNAs
四环素(12.5μg/ml)
卡那霉素(15μg/ml)
氯霉素(34μg/ml)
Rosetta-gami(DE3)pLysS
高严紧表达宿主菌,更好的在
E.coli胞质内形成二硫键,提供稀
有密码子tRNAs
四环素(12.5μg/ml)
卡那霉素(15μg/ml)
氯霉素(35μg/ml)表2:常用E. coli表达菌株
2.2 质粒载体:
大肠杆菌表达系统采用质粒为表达载体,质粒上的重要元件包括复制子,启动子,终止子,多克隆位点,信号肽,融合标签,筛选标记等(图1)。原核表达载体已经发展得比较完善,有多种质粒可供选择(表4)。
复制子:
复制子决定着质粒载体在宿主中的拷贝数。通常情况下质粒拷贝数越高,重组蛋白的表达量就越高,但是高拷贝的质粒也会严重影响宿主的生长,质粒本身也不稳定,容易丢失和突变。克隆载体常采用拷贝数低、严谨复制的复制子,如pSC101;表达载体通常选用高拷贝的复制子,如pCoE1,pMBI(pUC),等。如果需要进行多个质粒的共转化,就要根据复制子的相容性选用不同复制系统的复制子,如pSC101和pUC共表达。
启动子:
表达重组蛋白时,我们需要考虑启动子的强弱、作用方式、调控方式和本底表达水平。表达载体通常选用强启动子以提高表达量,但弱启动子也有其优点,如降低本底表达、增加可溶表达、表达小量伴侣蛋白等。按照作用方式,启动子可以分为两类:组成型表达的启动