动物肝脏DNA提取和鉴定-实验技术

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DNA标准液200ug/ml:DNA钠 盐用5mmol/L的NaOH配制。

95%冷乙醇、 NaCl固体

0.14mol/L NaCl-0.05mol/L 柠檬酸钠缓冲液(PH=6.8)

二苯胺:称取纯二苯胺1g溶于 100ml冰醋酸中,加入10ml过 氯酸,混匀。临用时加 1ml1.6%乙醛溶液,所配置试 剂应为无色。
以吸光度A595nm对DNA含量(ug)作图,
绘制标准曲线。
从标准曲线上查出样品的DNA含量。 计算100g猪肝中DNA的含量:
待测样品中DNA的质量×25(稀释倍数)
=
称取猪肝的质量
注意事项
匀浆(破碎细胞)要充分,需剪成小块。 固体NaCl应磨碎,加入应分批缓慢加入,边加边摇,
避免局部浓度过大或者未及溶解而沉入氯仿层。
核酸在真核细胞中都是以与蛋白质结合的状态存在, 用DNP和RNP表示。
DNA-Pro(DNP)溶于高盐溶液(1mol/L), 微溶于低盐溶液(0.14mol/L) 细胞核 RNA-Pro(RNP) 核仁及细胞质
溶于低盐溶液(0.14mol/L)
微溶于高盐溶液(1mol/L)
核酸含量的测定方法:紫外吸收法、定磷法和分别针 对DNA和RNA的颜色反应方法。
脱氧核糖核酸中的脱氧核糖在酸性环境中变成ω-羟基γ-酮基戊醛与二苯胺试剂一起加热产生蓝色化合物,在 595nm处有最大的吸收 。
DNA20~400微克范围内,光密度与DNA的浓度成正比,
在反应液中加入少量乙醛,可以提高反应的灵敏度。
三、实验试剂
来自百度文库5% SDS

氯仿/异戊醇=20:1 (V/V)
变性蛋白质层易散,吸取上清液时应仔细,不要将蛋
白质及下层的氯仿吸入。
实验结束后将变性的蛋白质(肝糜)小心取出置于专
用的废物袋中,氯仿倒入回收瓶内。
THANK YOU

防止DNA酶的降解,提取时可 加入适量EDTA(乙二胺四乙 酸)、柠檬酸,以降低DNA酶 的活性

SDS(十二烷基硫酸钠)等去 污剂使蛋白质变性,可以直接 从生物材料中提取DNA
DNA的定量测定
DNA粗品用5mmol/LNaOH溶解并定容至50ml,作为待测品。
混匀,60℃水浴保温45min,冷却后,595nm处,比色。
组织捣碎匀浆机
猪肝8g 16ml的0.14mol/L NaCl-
0.05mol/L 柠檬酸钠缓冲液
沉淀
40ml的0.14mol/L NaCl-
0.05mol/L 柠檬酸钠缓冲液
匀 浆 离心, 4000r/min ,10min 上清(弃掉) 沉淀 25ml缓冲液洗涤 离心, 4000r/min ,20min
21ml氯仿/异戊醇 4ml 5% SDS 振荡 30 min(保鲜膜封口) 加入3.6gNaCl 固体, 终浓度为1mol/L 离心,3500r/min ,20min 吸取上清(量取体积) 95%冷乙醇(缓慢加入)边 加边朝一个方向缓慢搅动 DNA粗制品
上清(弃掉)
沉淀
除去蛋白质的方法

氯仿一异成醇使蛋白 质变性,离心除去变 性蛋白质
动物肝脏DNA的制备 和鉴定
甘肃中医药大学
核酸的分类

DNA (脱氧核糖核酸) 主要存在于细胞核的染色体中。 核外也有少量DNA,如线粒体DNA(mtDNA),叶绿 体DNA(cpDNA),质粒DNA。 RNA(核糖核酸) 存在于细胞质中,如mRNA, rRNA, tRNA等。 除上述DNA,RNA外,还有非细胞形式存在的病毒和噬 菌体,其或只含DNA,或只含有RNA。
核酸制备中常用的蛋白质变性剂
作用:
1.使蛋白质变性、沉淀,从核酸提取液中分离除去,以防造
成蛋白污染。
2.某些蛋白质变性剂也有抑制 RNase活性和破裂细胞的作用。
如:苯酚、氯仿、盐酸胍、DEPC
核酸制备中常用的酶
DNase:降解DNA
RNase:降解RNA
蛋白酶K:降解蛋白质
溶菌酶:破碎细胞

核酸制备中常用的去垢剂
核酸本身带负电荷,结合带正电荷的蛋白质。用于核 酸提取的去垢剂,一般都是阴离子去垢剂。 去垢剂的作用: 1.溶解膜蛋白及脂肪,使细胞膜破裂; 2.溶解核糖体上面的蛋白质,使其解聚,将核酸释放出 来; 3.对RNase、DNase有一定的抑制作用。 如:SDS、脱氧胆酸钠、4-氨基水杨酸钠、萘-1.5-二磺 酸钠、三异丙基萘磺酸钠
核酸提取的主要步骤

破碎细胞:研磨、组织匀浆、 超声、冻融;异硫氰酸胍、 碱裂解;酶解(溶菌酶)
除去其它不需要
的核酸分子

除去与核酸结合的蛋白质以及多糖、 脂类等生物大分子:酚/氯仿抽提、 蛋白变性剂(SDS、异硫氰酸胍 等)、蛋白酶处理、高盐洗涤

沉淀核酸,去除盐类, 有机溶剂等杂质
注意事项


核酸的理化性质

在细胞内通常与蛋白质结合,以复合物形式存在

微溶于水,不溶于乙醇,氯仿等有机溶剂 在酸性溶液中容易降解,在中性或弱碱性溶液中较稳定。 DNA溶液粘度很大,RNA的粘度较小 在强大离心力的作用下,可以从溶液中沉降下来

基因组DNA的提取方法
浓盐法:利用RNA和DNA在不同盐浓度溶液中的溶解 度不同将二者分离。

离子去污剂法:利用SDS、CTAB(十六烷基三甲基溴
化铵)等去污剂使蛋白质变性,直接从生物材料中提取 DNA。
苯酚抽提法:苯酚既是蛋白变性剂,又能抑制DNase 的降解。用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA连接键 已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相 溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。

避免过酸、 过碱及高温
蛋白变性剂反应
不宜过于剧烈

加入DNA酶抑制剂:柠 檬酸、氰化物、砷酸盐、 EDTA、SDS、苯酚等

加入RNA降解 酶除RNA
一、实验目的:
• 1、学习并掌握用浓盐法从动物组织中的提取DNA方法及 其原理。
• 2、学习和掌握二苯胺法测定DNA的原理和方法。
二、实验原理
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