药学学科药物化学专业硕士培养方案-兰州大学药学院

药学学科药物化学专业硕士培养方案

100701：药物化学

一、学科概况

药物化学是应用化学和生命科学原理研究药物和创制新药的学科。研究任务主要包括通过药物分子设计或对具有一定生物活性的化合物

分离、鉴定或结构改造，总结构效关系，创制可用于临床的新药；通过研究药物化学结构与理化性质的关系和化学稳定性，为药物的生产、剂型设计、贮存流通、质量控制及临床合理用药提供理论基础；通过研究药物化学结构与生物活性间的关系，在分子水平上讨论药物在体内的化学过程和化学作用原理，深入的阐明药物的作用机理、药物在体内代谢过程以及产生毒副作用的本质，为其它学科研究提供理论基础；通过对药物合成路线的设计和改进，为药物生产提供先进、合理的方法及工艺。

药物化学以化学合成药物、无机药物和天然药物为研究对象，研究药物的化学结构与药理作用之间关系；各类药物的作用和作用机制；药物的体内代谢及其产生毒副作用的本质；药物在体内吸收、分布与化学结构之间的关系；影响药物的药效、毒性、质量以及研究最佳剂型和药物制剂分析方法等的主要性质；药物的理化性质的变化规律和在体内的化学过程与合理用药之间的关系；药物结构修饰的原理和方法；新药创制的基本方法与理论；药物合成工艺路线和制备过程可能带来的特殊杂质。

二、培养目标

毕业生要能够掌握化学、生命科学和计算机技术等的基础理论和系统专业知识；至少掌握英语一门外国语，能熟练地阅读本专业的英文资料，具有进行国际学术交流的能力；熟悉新药研究的基本方法和现代新药研究的发展方向；具有基本的独立从事新药创制科学研究和科研管理能力。学位获得者能在高等院校、药物研发机构、药厂、医院等单位从事教学、新药研发、药品生产与质量控制等工作。

三、学习年限

硕士研究生在校学习年限为三年、最长在校年限（含休学）四年。

四、研究方向

1.新药设计与合成

2.化学生物学与药物设计

3.天然药物分离、修饰及全合成

4.新药评价

五、课程设置与学分安排

总学分不低于32.0学分，其中学位课不少于8门；

公共课计入总学分；

学科通开课总学分不低于6.0学分，其中学位课不少于2门，

计入总学分；

专业基础课总学分不低于3.0学分，其中学位课不少于1门，计入总学分；

方向选修课计入总学分；

专业外语计入总学分；

人文与科学素养选修课计入总学分；

必修环节计入总学分；

补本课不计入总学分；

六、必修环节

1、开题报告：必修，最晚于第三学期末完成。

2、学术研讨和学术活动：必修，每学年作报告1次，在学期间作报告不少于2次，参加学术活动不少于9次。

3、实践环节：必修，含科研实践、医疗实践、教学实践和社会实践。

七、课程简介及教学大纲

课程简介及教学大纲

计算机辅助药物设计

一、课程基本情况

二、课程内容简介

本课程主要介绍计算机辅助药物设计的基本概念、基本理论以及常用的药物设计技术和方法，并选用一些典型的实例，介绍最近的国内外研究成果，让研究

生了解现在学科的发展趋势，同时介绍常用软件，使本课程兼具理论性、前沿性、实用性。

三、课程教学内容

第一章绪论（3学时）

主要内容：讲述计算机辅助药物设计出现的背景、历史以及在药物研发中的应用、学科发展的前沿和趋势。

第二章基本概念和理论基础（6学时）

第一节药物与靶点相互作用理论

一、药物与靶点相互作用类型

二、药物与靶点分子的计算机图形显示

主要内容：药物的主要作用靶点类型，药物与靶点相互作用的类型及其相互作用理论，药物与靶点的计算机图形显示。

第三章理论计算基础（6学时）

第一节能量优化

1.构象搜索

2.分子力学方法

3.量子力学方法

主要内容：分子结构的能量优化、构象搜索以及分子力学和量子力学方法。第四章计算机辅助药物设计的方法学（15学时）

第一节定量构效关系

第二节药效团模型

第三节分子对接

第四节虚拟筛选

主要内容：基于配体的药物设计方法包括定量构效关系、药效团模型以及基于受体的药物设计方法分子对接以及这些方法的主要应用虚拟筛选。

第五章计算机辅助药物设计的应用实例（12学时）

第一节 HIV-1蛋白酶抑制剂的设计

第二节抗感冒药的设计

第三节计算机辅助药物设计最新应用进展、成果

主要内容：以计算机辅助药物设计在HIV-1蛋白酶抑制剂设计及抗感冒药设计中的成功应用为例使得学生了解计算机辅助药物设计的实际药物研发中的应

用。在此基础上报告计算机辅助药物设计的最新应用成果。

第六章上机实际操作相关软件（12学时）

主要内容：介绍并练习使用常用的大型计算机辅助药物设计软件的基本功能和使用方法，主要包括SYBYL、Discovery Studio等。

四、参考文献

1. 徐筱杰，侯廷军，乔学斌，章威；计算机辅助药物分子设计；化学工业出版社 2004.

2. 陈凯先, 蒋华良, 嵇汝运；计算机辅助药物设计--原理、方法及运用；上海科学技术出版社 2000.

3. A.R.Leach Molecular Modelling: Principles and Applications (2nd Edition) 世界图书出版公司2003.

课程简介及教学大纲

药物作用的化学原理

一、课程基本情况

二、课程内容简介

药物作用的化学原理是研究化学药物及其靶分子的化学结构以及药物理化性质、生物学性质（如吸收、分布、排泄、代谢）、药物作用（包括治疗作用和毒副作用）的化学机理和构效关系而寻找新药的途径和方法的一门学科，通过本课程的教学，回答的问题是怎样发现一个安全有效的药物和怎么用好药，使学生为如何发现新药和有效、合理使用现有的化学药物提供理论依据，为从事新药研究和指导临床合理用药等工作奠定理论基础。

三、课程教学内容