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生物信息学网站

分子生物学数据库综合目录

1. SRS序列查询系统(分子生物学数据库网络浏览器) http://www.embl-heidelberg.ed/srs5/

2. 分子生物学数据库及服务器概览/people/pkarp/mimbd/rsmith.html

3. BioMedNet图书馆

4. DBGET数据库链接http://www.genome.ad.jp/dbget/dbget.links.html

5. 哈佛基因组研究数据库与精选服务器

6. 约翰. 霍普金斯大学(Johns Hopkins University) OWL网络服器/Dan/proteins/owl.html

7. 生物网络服务器索引,USCS /network/science/biology/index.html

8. 分子生物学数据库列表(LiMB) gopher:///11/molbio/other

9. 病毒学的WWW服务器,UW-Madison /Welcome.html

10. UK MRC 人类基组图谱计划研究中心/

11. 生物学家和生物化学家的WWW资源http://www.yk.rim.pr.jp/~aisoai/index.html

12. 其他生物网络服务器的链接/biolinks.html

13. 分子模型服务器与数据库/lap/rsccom/dab/ind006links.html

14. EMBO实际结构数据库http://xray.bmc.uu.se/embo/structdb/links.html

15. 蛋白质科学家的网络资源/protein/ProSciDocs/WWWResources.html

16. ExPASy分子生物学服务器http://expasy.hcuge.ch/cgi-bin/listdoc

17. 抗体研究网页

18. 生物信息网址http://biochem.kaist.ac.kr/bioinformatics.html

19. 乔治.梅森大学(George Mason University)的生物信息学与计算分子生物学专业/~michaels/Bioinformatics/

20. INFOBIOGEN数据库目录biogen.fr/services/dbcat/

21. 国家生物技术信息研究室/data/data.html

22. 人类基因组计划情报/TechResources/Human_Genome

23. 生物学软件及数据库档案/Dan/software/biol-links.html

24. 蛋白质组研究:功能基因组学的新前沿(著作目录) http://expasy.hcuge.ch/ch2d/LivreTOC.html

序列与结构数据库

一.主要的公共序列数据库

1. EMBL WWW服务器http://www.EMBL-heidelberg.ed/Services/index.html

2. Genbank 数据库查询形式(得到Genbank的一个记录) /genbank/query_form.html

3. 蛋白质结构数据库WWW服务器(得到一PDB结构)

4. 欧洲生物信息学研究中心(EBI) /

5. EBI产业支持/

6. SWISS-PROT(蛋白质序列库) http://www.expasy.ch/sprot/sprot-top.html

7. 大分子结构数据库/cgi-bin/membersl/shwtoc.pl?J:mms

8. Molecules R Us(搜索及观察一蛋白质分子) /modeling/net_services.html

9. PIR国际蛋白质序列数据库/Dan/proteins/pir.html

10. SCOP(蛋白质的结构分类),MRC /scop/data/scop.l.html

11. 洛斯阿拉莫斯的HIV分子免疫数据库/immuno/index.html

12. TIGR数据库/tdb/tdb.html

13. NCBI WWW Entrez浏览器/Entrez/index.html

14. 剑桥结构数据库(小分子有机的及有机金属的结晶结构)

15. 基因本体论坛/GO/

二. 专业数据库

1. ANU生物信息学超媒体服务(病毒数据库、分类及病毒的命名法) .au/

2. O-GL YCBASE(O联糖基化蛋白质的修订数据库) http://www.cbs.dtu.dk/OGLYCBASE/cbsoglycbase.html

3. 基因组序列数据序(GSDB)(已注释的DNA序列的关系数据序)

4. EBI蛋白质拓扑图/tops/Serverintermed.html

5. 酶及新陈代谢途径数据库(EMP) /

6. 大肠杆菌数据库收集(ECDC)(大肠杆菌K12的DNA序列汇编) http://susi.bio.uni-giessen.de/ecdc.html

7. EcoCyc(大肠杆菌基因及其新陈代谢的百科全书) /ecocyc/ecocyc.html

8. Eddy实验室的snoRNA数据库/snoRNAdb/

9. GenproEc(大肠杆菌基因及蛋白质) /html/ecoli.html

10. NRSub(枯草芽胞杆菌的非冗余数据库) http://pbil.univ-lyonl.fr/nrsub/nrsub.html

11. YPD(酿酒酵母蛋白质) /YPDhome.html

12. 酵母基因组数据库/Saccharomyces/

13. LISTA、LISTA-HOP及LISTA-HON(酵母同源数据库汇编) /

14. MPDB(分子探针数据库) http://www.biotech.est.unige.it/interlab/mpdb.html

15. tRNA序列及tRNA基因序列汇编http://www.uni-bayreuth.de/departments/biochemie/trna/index/html

16. 贝勒医学院(Baylor College of Medicine)的小RNA数据库/dbs/SRPDB/SRPDB.html

17. SRPDB(信号识别粒子数据库) /dbs/SRPDB/SRPDB.html

18. RDP(核糖体数据库计划) /

19. 小核糖体亚蛋白RNA结构http://rrna.uia.ac.be/ssu/index.html

20. 大核糖体亚蛋白RNA结构http://rrna.uia.ac.be/lsu/index.html

21. RNA修饰数据库/RNAmods/

22. 16SMDB及23SMDB(16S和23S核糖体RNA突变数据库)

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