化学软件chemoffice安装和基本教程共60页文档
化学软件chemoffice安装和基本教程
双击需要改变元素符号的原子，弹出输入框，输入元素符号，按回车 键完成原子序号的更改。若原子的三维结构中显示孤对电子，执行关闭 “Tools”菜单中的“Show H’s ans Lp’s”命令，可不显示氢原子和孤对电子。
ChemDraw结构式与3D模型的转换
（1）ChemDraw结构式转换为3D模型 （2）3D模型转换为平面结构式
化学物质检索方法
“ChemFinder”对话框
图 4-40分子结构信息对话框
请按
化学反应的检索
查找免费网络资源
免费资源查找链接
分子模型及仿真软件Chem3D
主界面
3D模型绘制与编辑
（1）利用键工具建立模型 （2）利用文本工具建立模型
（3）利用子结构建立3D模型
子结构模型库
使用模板建立3D模型
利用模板建立富勒烯 3D模型
改变元素序号与替换元素 ➢ 改变元素序号:
首先选中模型。执行“Edit”菜单中的“Select All”命令或ctrl + A快捷键； 然后整理结构，执行“Tools”菜单中的“Clean Up Structure”菜单命令。 使用垂直工具栏中 的工具，双击需要改变序号的原子，弹出输入框， 输入原子序号，按回车键完成原子序号的更改。
结构式 名称
(2) 结构式名称
预测核磁共振化学位移（structure---predict 1H-NMR shifts）
Structure—predict 1H-NMR shifts
分析结构估计性质
（3）化学反应方程式绘制举例
OH
(CH3CO)2 70°C80°C 15min水浴
COOH
OOCCH3 COOH
➢环己烷的椅式构型直接点击为水平放置，按Shift键点 击可由水平变为垂直。
(精品)化学软件应用---ChemOffice
以心安得化合物为例：
【Analysis】窗口 【Chemical Properties】】窗口
• 1.3.9 元素周期表
ChemDraw提供了一张使用起来十分方便的元素周 期表。 【View】/【Show Periodic Table Window】即可打 开元素周期表窗口。 单击周期表上的元素符号，就可以得到该元素的物理 性质。单击表中的 按钮，可以打开或关闭周期表下 方的物理性质详细列表。
菜单栏
套索 结构透视
实线单键 多重箭
虚线键 碎线键 碎线楔键 粗键
楔形键 空楔形键 波浪键
序列工具 脂肪族链
环丙烷 环戊烷 环庚烷
椅式环己烷 环戊二烯
选取框
质谱碎片 橡皮
文本工具
笔 箭头
轨道 绘图元素
括号 化学符号
询问工具
高级工具
模板
环丁烷
环己烷 环辛烷
椅式环己烷 苯环
常用工具栏 格式工具栏
绘图窗口
【File】/【Save As】，弹出【另存为】对话框， 即可保存。【保存类型】有多种选项，可另存为Chem Draw 3.x版的格式（“chm”），或“gif”、“bmp”图形 格式，或另存为ISIS格式。
• 3.1.3.3 图形的旋转或缩放
如果不改变图形模板的话，在绘图区每单击一次鼠标， 就会出现一个选定模板的图形。单击鼠标左键后不松 手，则可以通过移动鼠标使图形旋转，待转动到希望的 位置时松手即可。
垂直工具栏上的【模板】包含了多种较复杂的分子种
类和玻璃仪器模板。分别如下：
氨基酸（Amino Acids Side Chains）
氨基酸（Amino Acids）
芳香族（Aromatics）
化工过程仿真软件安装说明
化工过程仿真实习软件安装说明一、软件运行环境本软件核心程序仅占用15MB左右硬盘容量，软件经编译后的执行文件只有200到300KB，可以在486 以上微机（包括无硬盘工作站及局域网络）上运行。
本软件可运行于MS－DOS 、WINDOWS 3.x、WINDOWS 95、WINDOWS 98、WINDOWS NT/2000、WINDOWS XP操作系统之下。
注：当使用WINDOWS XP/2000 sever操作系统时,需要按照软件向导使用“初始化程序”，进入MS－DOS环境来运行本软件，同时需要使用串口或PS/2型鼠标。
在其他系统下可以直接运行本软件。
二、软件安装安装光盘插入光驱后，将自动运行安装向导，可以通过此安装向导进行安装，也可以在光盘根目录下双击SETUP.EXE直接进行安装。
三、文件结构为了方便用户使用，核心程序（SIMLY文件夹和SIMU文件夹）已固定安装于C盘根目录下（大约15MB）；初始化程序及相关文档在软件安装过程中由用户自己指定安装位置。
核心程序目录结构如下：C：\SIMU \PUM 离心泵模块（PUM.EXE）\HEX 热交换器模块（HEX.EXE）\FUR 加热炉模块（FUR.EXE）\WFY 往复压缩模块（WFY.EXE）\BAT 间歇反应模块（BAT.EXE）\JBX 连续反应模块（JBX.EXE）\TDW 二元精馏模块（TDW.EXE）\XST 吸收模块（XST.EXE）\GL 锅炉模块（GL.EXE）\ZH 转化模块（ZH.EXE）C：\SIMLY \ CJ 常减压蒸馏模块（CJ.EXE）\FCC 催化裂化模块（FCC.EXE）四、运行仿真软件成功安装软件后，双击桌面相应快捷方式即可启动软件向导。
第一个界面为欢迎界面，第二个界面为操作系统选择画面，如下图所示：当使用WINDOWS NT/2000以下操作系统时，选中“其他windows系统”，单击“下一步”进入如下画面，可以通过鼠标左键单击进入相应模块。
ChemCAD5.2的安装以及使用方法
ChemCAD5.2的使用教程
1.ChemCAD的安装
找到压缩包，解压，如这张图片
点击SETUP图标，然后一直点击下去，强调一点，安装之前，必须将360安全卫士等一些杀毒软件关闭！！！
安装好之后，进行下一步，将图片上的第一个文件夹crack打开，找到这个图标，复制一下，然后到C盘找到文件夹CC5(前提是你将ChemCAD安装在C盘了),将复制的图标放进这个文件夹里，在双击运行一下！这样安装完成了，在程序中找到ChemCAD就可以运行了。
2.ChemCAD的使用技巧
（1）运行CAD之后，必须先进行文件夹的命名与存放的位置，画好工艺流程图之后，就可以将图保存。
再次想看你画的流程图，必须先运行CAD，然后在file选项中找到open job，在选择你画的流程图的文件夹！
（2）强调一点，下面这张图片里找不到的设备图，你可以在这些图标上点击右键，在左边窗口会出现更多的图标。
具体ChemCAD的使用方法，请参照pdf版！。
化学常用软件应用简介(ChemOffice) ppt课件
包含三种工具：
碎片工具 离解工具 合成工具
：破坏指定化学键，使分子成为两部分。 ：破坏化学键画出一个离解反应。 ：破坏化学键画出一个逆向合成反应。
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• 环工具：画环状结构。
• 楔形键工具： 画楔形键。
• 制表工具： 用于多重网格制表。其中 薄层色谱板（TLC）可以画出
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多面体（Polyhedra）
RNA
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立体中心（Stereocenters） 超分子（Supramolecules）
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ChemBioDraw包括了众多的模板，我们想画 的东西多数已经包括在其中了，熟悉这些模板， 我们可以根据这些模板迅速组合成希望的分子 形状。
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7. 选中垂直工具栏 中的文本工具，分 别将鼠标移至应该 出现羟基或氧原子 的位置，待出现连 接点后，点击键盘 上的O键。
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在绘制过程中，化学键键角难以精确掌握，且 拖拉化学键或键点的过程中难免会造成键长的变 化和图形的扭曲，因此需要对图形进行整理。除 了手动调整外，还可以通过ChemDraw的相关菜 单命令进行整理。
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• 增加了对文件系统的支持
（1）对SD文件支持。SD文件是一种许多化学软 件都通用的格式文件，可在一个文件中包括许多 结构。
（2）对数据库连接的支持。可及时与Internet连 接并不断更新化学数据。
化学软件 ChemOffice 的使用
蓬罩 橡皮 文本 笔 箭头 轨道 绘图元素 基元 化学符号 弧形 原子反应 模板 环丁烷环 环己烷环 环辛烷环 环己烷椅式 苯环
ChemDraw——工具 键工具
模板工具
8
箭头工具
轨道工具
画图工具
基元工具符号工具Leabharlann 弧形工具原子反应工具
键及元素文本属性的设置
4. ChemDraw——主要操作
主要绘制一些结构式、反应方程式、搭建化学反应仪器等。
13CNMR预测
13CNMR预测结果
部分预测结果
四、绘制化学反应方程式：
化学反应方程式的绘制
四、搭建实验装置：
化学软件 ChemOffice 的使用
2013/09/24
主要内容
1
Chemoffice 的概述
2
ChemDraw 介绍及操作
ChemDraw 的界面
ChemDraw 的工具
ChemDraw 主要操作
1. ChemOffice 概述
ChemOffice 软件是由剑桥化学软件公司开发的集成化学软件桌面系 统，集成了Chem3D、ChemDraw、ChemFinder 和 ChemInfo，以及Chem TableEditor等软件，具有强大的高端开发功能。
➢ ChemDraw Ultra 11.0 化学结构绘图 ➢ Chem3D Ultra 11.0 分子模型及仿真 ➢ ChemFinder Pro11.0 化学信息搜寻整合系统 ➢ E2Notebook Ultra11.0 ➢ BioAssay Pro11.0 ➢ 量化软件MOPAC、Gaussian 和GAMESS 的界面 ➢ ChemSAR Server Exce ➢ ClogP，CombiChemPExcel
chemoffice安装和基本教程
结构式、立体图形、对称图形、轨道等，并能对图形进行
编辑、翻转、旋转、缩放、存储、复制、粘贴等多种操作。 用它绘制的图形可以直接复制粘贴到Word 软件中使用。最 新版本的软件还可以生成分子模型、建立和管理化学信息 库、增加了光谱化学工具等功能。
Chemdraw主界面
（1）菜单栏
菜单栏共有11个下拉菜单，每一个下拉菜单中都包括相应的命令。 其中如果相应的命令前有√，则该条命令已经被执行；若命令后有小 三角表示该指示条有子菜单；指示条灰色表示该命令未激活。
选择键命令或环命令，直接在环的任何一个节点处点击 或拖动可以实现键的连接或环与环的点连接。
选择环的一个节点，按住鼠标左键，从一个节点拖至另 一个节点，可以实现环与环的双点连接。 元素符号的输入与目标参数的设置与键操作类似，同样 在“Structure”菜单中可以对选择的键的属性进行设定。
（3）链工具
图4-18复制修改得到的乙酰水杨酸结构式
乙酰水杨酸合成反应方程式
图4-20符号窗口
图4-21 字体选项
图4-22“Color”菜单选项
图4-23调色板
绘制实验装置
利用实验仪器模板工具1和实验仪器模板工具2进行实验装置的绘制，在模板 中选择所需的实验仪器，单击产生相应的玻璃仪器。玻璃仪器连接处为阴影。通 过旋转选择框改变角度和大小进行玻璃仪器的连接。示范图例见下图4-24。
化学软件ChemOffice
概述
ChemOffice软件是由剑桥化学(Cambridge Soft)软件公司开 发的集成化学软件桌面系统，集成了Chem3D、ChemDraw、 ChemFinder和ChemInfo，以及Chem TableEditor等软件，具有强 大的高端开发功能。
自-chemwindows使用方法
化学绘图软件—Ｃｈemwinｄｏw一、CｈemWｉndｏw软件的特点及功能该软件具有快速便捷的操作工具、用来画分子图形的各种常用操作均用图标示于工具箱中，不必记忆任何操作口令，亦不必采用下拉式菜单(虽然也配有此功能)。
如对分子图形的组合、水平、垂直翻转及任意角度旋转等操作直接从工具箱中用鼠标点相应图标即可完成。
该软件还提供了大量画分子式或分子图形所需的各种“散装元件”，如各种类型的化学键、分子母环(从三元到八元环,包括六元环的船式和椅式构型)、化学分子轨道、圆电荷、球（椭球)等。
在模板工具中存储有大量常用的杂环、稠环供选择。
使用户在使用过程中变得象小孩子玩积木那样简单，在３.0版中具有丰富的图形屏幕显示,对图形不同部分可用不同的颜色进行显示。
该软件另一大特点就是强大的分子图形编辑功能。
对分子图形可进行组合,分块处埋,即可将许多物体结合成一个物体进行处理，或将一个物体分解成许多部分，使得在编辑时可根据需要用不同的方式来编辑。
对整体分于图形既可进行放大、缩小、旋转等操作也能对局部进行精确微调。
其还具有一般绘图软件所不具备的化学分子式的上下标标记功能及每个操作对象都有“敲击箱”(hｉt ｂox),这对于图形的各种操作处理,特别是局部处理提供了很大的灵活性。
需要画分子结构式的三维平面图时，该仪件具有将图形中重叠部分进行断开处理的功能,使之呈现出立体感。
但是,ＣhemWindｏw 不具有OＬE(对象链接与嵌入)的界面支持,使得它与其它软件之间的共享受到限制，尤其是在其它软件中（如Word，PowerPoｉnt等)需对ＣhemWindow图形进行修改时，更显得繁琐。
二、ChｅmWindｏw 的使用方法和技巧ＣｈｅmWｉｎdow 的操作绝大部分由鼠标便可完成,基本使用方法借助Hｅｌｐ亦可较快学会。
下面介绍作者在使用过程中的一些点滴经验和体会１．绘制ChemWiｎdoｗ图形的几点技巧在绘制复杂分子结构式时,利用复制、水平或垂直翻转等操作可绘出对称协调的分子结构式图形。
ChemOffice软件使用简介
第一部分 ChemDraw简介
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第一部分 ChemDraw简介
优选项 显示设置
错误警告
30
优选项
第一部分 ChemDraw简介
打开/存盘
默认路径
默认打开 文件格式
默认存盘 文件格式
31
第一部分 ChemDraw简介
国外化学刊物默认文档格式
32
第一部分 ChemDraw简介
1
第一部分 ChemDraw简介
ChemDraw 起始界面
2
第一部分 ChemDraw简介
菜单栏
工具栏
图形工具板
编辑区
滚ChemDraw简介
套索 实键 双键 虚键 切割键 切割楔键 黑体键 黑体楔键 空心楔键 波浪键 表格 长链 环丙烷环 环戊烷环 环庚烷环 环己烷椅式 环戊二烯环 蓬罩 橡皮 文本 笔 箭头 轨道 绘图元素 基元 化学符号 弧形 原子反应 模板 环丁烷环 环己烷环 环辛烷环 环己烷椅式 苯环
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第一部分 ChemDraw简介
模板工具
RNA模板工具
20
第一部分 ChemDraw简介
特殊符号模板工具
模板工具
立体中心模板工具
21
第一部分 ChemDraw简介
快捷键
命令
灰色表 示命令 未激活
小三角 表示 子菜单
22
省略号表示新对话框
第一部分 ChemDraw简介
文档设置
页面规划
23
第一部分 ChemDraw简介
模板工具
脂环模板工具
14
第一部分 ChemDraw简介
模板工具 DNA模板工具
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第一部分 ChemDraw简介
WRFChem安装及使用说明手册
3. 使用过程
这里以 2009 年 11 月 30 日陆雾个例为例，选取 GOCART 气溶胶机制进行使 用的说明。
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3.1 WPS 数据准备说明
首先进入 run_wps 目录（最新的地形数据已经添加了 erod 数据，所以不需 要自己手动添加，如果没有，需要自己手动加入）下的 geogrid 文件夹，将 GEOGRID.TBL 重 新 链 接 为 GEOGRID.TBL.ARW_CHEM ， 执 行 wps_real_cycle_3dvar.csh，在生成的 RESULT_seafog_FNL 中，会有新的 erod（灰 尘）变量生成。
4）将人为排放源数据改名为 wrfchemi_12z_d01，另外两种数据通过附录 2 中的 ncl 程序添加进原有的 wrfinput_d01。执行完 ncl 后，可以在原有的 wrfinput 中看 到新添加的数据种类，见下图
ChemBioOffice教程0
M2 Constant Value Quality Cubic stretch constant-2.000 4 Quartic stretch constant2.333 4 X-B,C,N,O-Y Stretch-Bend interaction force constant0.120 X-B,C,N,O-H Stretch-Bend interaction force constant0.090 Sextic bending constant (* 10**8)7.000 4 Cutoff distance for charge/charge interactions35.000 4 Cutoff distance for charge/dipole interactions25.000 4 Cutoff distance for dipole/dipole interactions18.000 4 Cutoff distance for van der Waals interactions10.000 4
Chem3D详解
计算模块 Mopac计算界面
作业类型 方法 波函数 优化方法 溶剂模型 限制性优化 收敛要求 坐标
Chem3D详解
计算模块 Mopac计算界面 电荷 偶极 静电势 生成焓 超精细耦合常数 电离能 极化率 电荷 溶剂介电常数
Chem3D详解
分子面模块
分子面 探测半径 显示模式 颜色模式 分辨率 选择分子轨道 等值面值 溶剂面 总电子密度面 总自旋密度面 静电势面 分子轨道 清除所有面
Chem3D详解
计算方法
计算模块
GAMESS 密 度 泛 函 理 论
基 态
从头算理论 激 发 态
Chem3D详解
化学软件ChemOffice的使用说明
具进行结构绘制操作的基本操作：首先在命令面板中选 取键命令，绘制的基本操作是“点位”、 “拖动”和 “点击”。
图4-8 绘制分子结构的基本操作
① 键的产生：
点位后，向某个方向拖动可以产生。 直接单击，产生所选择类型的化学键，连续点击两键相连默 认角度为120度。 点位位于一键的起点（显示小蓝块），沿键拖动会产生重键。 点位为于键中间，单击同样可以产生重键（三键点击后变单 键）。
H3C
CH3
CH3
CH3 H3C
图12 胡萝卜素结构
图13 连接点及单键的产生
图14 长链的生成
•结构的复制及旋转
• 两个结构的连接
连接前的胡萝卜素结构
4、化合物结构与命名
图17 命名示例图示表
5、 绘制化学反应方程式
（1）反应物结构式的绘制 • 普通分子结构的绘制 • 离子结构的绘制
• 中间体结构的绘制 • 立体结构的绘制
图18 复制修改得到的乙酰水杨酸结构式
图19 乙酰水杨酸合成反应方程式
图20 符号窗口
图21 字体选项
图22 “Color”菜单选项
图23 调色板
6、绘制实验装置
利用实验仪器模板工具1和实验仪器模板工具2进行实验装置的绘制，在模板 中选择所需的实验仪器，单击产生相应的玻璃仪器。玻璃仪器连接处为阴影。通 过旋转选择框改变角度和大小进行玻璃仪器的连接。示范图例见下图4-24。
选择键命令或环命令，直接在环的任何一个节点处点击 或拖动可以实现键的连接或环与环的点连接。 选择环的一个节点，按住鼠标左键，从一个节点拖至另 一个节点，可以实现环与环的双点连接。 元素符号的输入与目标参数的设置与键操作类似，同样 在“Structure”菜单中可以对选择的键的属性进行设定。
chemoffice讲义1
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安装好了Chemoffice软件之后，点击“程 序”，点击Chemoffice，即可出现其子菜 单，如下图：
主要学习内容： Chem Draw Ultra8.0：化学结构式绘图 Chem3D Ultra8.0：分子模型及仿真 ChemFinder Pro8.0：化学信息搜寻整合系统 E-Notebook Ultra8.0：整理化学信息、文件和数据，并 从中取得所要的结果
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绘图
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标题
ChemDraw V7.0 Times New Roma字体 ChemDraw V7.0 Arial字体
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原子标记
OH
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N
31
颜色
设置背景颜色
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“键＋单击”：按下特殊的键和单击鼠标键同时进行。 如，“Shift＋单击”意思是按下”Shift”键和单击鼠标键；
“键＋拖动”：按下特殊的键和鼠标键，移动鼠标。
如，“Shift＋拖动”意思是按下”Shift”键和拖动鼠标光标。
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套索 实键 双键 虚键 切割键 切割楔键 黑体键 黑体楔键 空心楔键 波浪键 表格 长链 环丙烷环 环戊烷环 环庚烷环 环己烷椅式 环戊二烯环
光标块
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选择：用鼠标的光标选中某种选择，使对象产生光标。选择对 象并不意味着动作，只是标记要操作的对象和点位； 单击：快速按下鼠标键(左或右键)，然后快速抬起； 双击：快速操作两次单击； 拖动：由三部分动作组成——按下鼠标左键选择对象，