分子生物学--名词解释

1、半保留复制(semiconservative replication):DNA复制时,以亲代DNA的每一股做模板,以碱基互补配对原则,合成完全相同的两个双链子代DNA,每个子代DNA中都含有一股亲代DNA链,这种现象称为半保留复制。

2、复制子replicon:由一个复制起始点构成的DNA复制单位。

57、复制起始点(Ori C)DNA在复制时,需在特定的位点起始,这就是一些具有特定核苷酸序列顺序的片段,即复制起始点。

24、(35)复制叉(replication fork)就是DNA复制时在DNA链上通过解旋、解链与SSB蛋白的结合等过程形成的Y字型结构称为复制叉。

3、Klenow 片段klenow fragment:DNApol I(DNA聚合酶I)被酶蛋白切开得到的大片段。

4、外显子exon、extron:真核细胞基因DNA中的编码序列,这部分可转录为RNA,并翻译成蛋白质,也称表达序列。

5、(56) 核心启动子core promoter:指保证RNA聚合酶Ⅱ转录正常起始所必需的、最少的DNA序列,包括转录起始位点及转录起始位点上游TATA区。(Hogness 区)

6、转录(transcription):就是在DNA的指导下的RNA聚合酶的催化下,按照硷基配对的原则,以四种核苷酸为原料合成一条与模板DNA互补的RNA 的过程。

7、核酶(ribozyme):就是具有催化功能的RNA分子,就是生物催化剂,可降解特异的mRNA序列。

8、(59)信号肽signal peptide:常指新合成多肽链中用于指导蛋白质的跨膜转移(定位)的N-末端的氨基酸序列(有时不一定在N端)。

9、顺式作用元件(cis-acting element):真核生物DNA中与转录调控有关的核苷酸序列,包括增强子、沉默子等。

10、错配修复(mismatch repair,MMR):在含有错配碱基的DNA分子中,使正常核苷酸序列恢复的修复方式;主要用来纠正DNA双螺旋上错配的碱基对,还能修复一些因复制打滑而产生的小于4nt的核苷酸插入或缺失。修复的过程就是:识别出正确的链,切除掉不正确的部分,然后通过DNA聚合酶III与DNA连接酶的作用,合成正确配对的双链DNA。

直接修复direct repair:就是将被损伤碱基恢复到正常状态的修复。有三种修复方式:1光复活修复2、O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶修复3单链断裂修复。

切除修复 (excission repairing):也称核苷酸外切修复,这就是一种取代紫外线等辐射物质所造成的损伤部位的暗修复系统。对多种DNA损伤包括碱基脱落形成的无碱基点、嘧啶二聚体、碱基烷基化、单链断裂等都能起修复作用。此系统就是在几种酶的协同作用下,先在损伤的任一端打开磷酸二酯键,然后外切掉一段寡核苷酸;留下的缺口由修复性合成来填补,再由连接酶将其连接起来。不同的DNA损伤需要不同的特殊核酸内切酶来识别与切割。主要包括碱基切除修复与核苷酸切除修复两类

29、碱基切除修复(base excision repair):由DNA糖基化酶始发先识别受损碱基,通过DNA链的局部扭曲而使受损碱基突出,之后水解受损碱基与脱氧核糖之间的糖苷键,除去受损碱基,产生无嘌呤或无嘧啶位点,即AP位点。AP内切核酸酶能识别AP位点,在该位点的5’侧端将DNA链切断。

37、核苷酸切除修复(nucleotide excision repair NER)当DNA结构有较大损伤变形(包括胸腺嘧啶二聚体在内)或DNA链多处发生严重损伤时,将诱导短或长片段的修复。以NER的方式修复,无须DNA糖基化酶协助。在NER修复系统中,已损伤的片段由切除酶识别并切除,该酶就是一种内切核酸酶,但它就是在链损伤部位的两侧同时切开(有别于一般的内切核酸酶),切除包括含损伤区域在内的一段寡核苷酸链。

41、重组修复(recombination repairing):双链DNA中的一条链发生损伤,在DNA进行复制时,由于该损伤部位不能成为模板,不能合成互补的DNA链,所以产生缺口,而从原来DNA的对应部位切出相应的部分将缺口填满,从而产生完整无损的子代DNA的这种修复现象。重组修复的主要步骤有:1.复制2.重组3.再合成

36、SOS修复:易错修复、SOS反应应急(SOS response)许多造成DNA损伤或抑制DNA复制的过程能引起一系列复杂的诱导效应,称为应急反应。(SOS系统只在细胞受到严重损伤或复制系统受到抑制时才出现, 系统就是在DNA分子受到大范围的损伤情况下防止细胞死亡而诱导出的一种应急措施,就是使细胞通过一定水平的变异来换取最后幸存手段。)

11、半不连续复制(semi-discontinuous replication)就是指DNA复制时,前导链上DNA的合成就是连续的,后随链上就是不连续的,故称为半不连续复制。半不连续复制在DNA复制过程中,亲代DNA分子中以3’-->5’方向的母链作为模板指导新的链以5’-->3’ 方向连续合成; 另一股以5’-->3’ 为方向的母链则指导新合成的链以5’-->3’方向合成1000—2000

个核苷酸长度的许多不连续的片段(岗崎片段),这种复制方式称之为半不连续复制。

12、岗崎片段(Okazaki fragment):DNA复制时,一股以5’-->3’方向的母链作为模板,指导新合成的链沿5’-->3’合成1000—2000个核苷酸不连续的小片段称之为岗崎片段。

46、前导链(leading strand):DNA复制时,一股以3’-->5’方向的母链作为模板,指导新合成的链以5’-->3’方向连续合成的链称为前导链。(复制方向与解链方向一致)

40、后随链、随从链(lagging strand): DNA复制时,一股以5’-->3’方向的母链作为模板,指导新合成的链沿5’-->3’合成,1000—2000个核苷酸不连续的小片段的链称为随从链。(复制方向与解链方向相反)

13、内含子(intron):真核细胞基因DNA中的不编码序列,这部分序列并不编码蛋白质,又称间隔序列或插入序列。

外显子(exon or extron):真核细胞基因DNA中的编码序列,这部分序列可转录为RNA,并翻译成蛋白质,也称表达序列。

14、基因突变(genetic mutation)由于DNA分子中发生碱基对的增添、缺失或改变,而引起的基因结构的改变,就叫做基因突变。

15、转座子(transposon, Tn):转座子也叫做转座元件、跳跃基因。就是在基因组中可移动的DNA序列,不以独立的形式存在(如质粒或噬菌体DNA等),而在基因组内由一个部位直接转移到另一个部位。

60、转座:一个转座子由一个部位转移到另一个部位的过程称为转座。转座发生的频率很低,而且插入位点就是随机的,不依赖转座子与靶位点之间的任何同源性。

16、启动子(promoter)就是指RNA聚合酶识别,结合并开始转录的一段DNA序列。它包括4个区域:转录的起始点,-10区(pribnow box,富含A T,其一致序列为TATAAT),-35区一致序列为TTGACA,-10与-35之间的序列。

17、密码的简并性(degeneracy):同一种氨基酸具有两个或更多个密码子的现象称为密码子的简并性。

18、 SD序列 SD sequence:mRNA中用于结合原核生物核糖体的序列。SD序列在细菌mRNA起始密码子AUG上游10个碱基左右处,有一段富含嘌呤的碱基序列,能与细菌16SrRNA3’端识别,帮助从起始AUG处开始翻译。

19、反式作用因子(trans-acting factor):反式作用因子又称转录因子(transcriptionfactors,TF)。绝大多数真核转录调节因子由某一基因表达后,通过与特异的顺式作用元件相互作用反式激活另一基因的转录,故称反式作用因子。(就是指能直接或间接地识别或结合在各类顺式作用元件核心序列上参与调控靶基因转录效率的蛋白