组蛋白翻译后修饰的类型
组蛋白的翻译后修饰的研究
组蛋白的翻译后修饰的研究组蛋白是蛋白质的一类,是精细结构的主要成分,也是细胞内基因表达的重要组成部分。
组蛋白的翻译后修饰是调控基因表达和细胞分化的重要机制之一,在该领域的研究不断深入,为新药研发和治疗疾病提供了新思路。
组蛋白后转移酶催化组蛋白修饰形成,而这些修饰形式——如酰化、甲基化、泛素化等——对组蛋白DNA相互作用及相互之间的纤维结构产生影响。
这些修饰还能与其他蛋白质诸如转录因子相互作用修饰,从而影响基因的表达和内部信号传递。
对于组蛋白的翻译后修饰,近年来研究者通过多种高通量技术如质谱和DNA测序等进行了广泛研究。
一些实验表明,糖基化修饰似乎是组蛋白修饰领域最新的研究热点之一。
该修饰是利用异硫氰酸酯偶联方法使组蛋白与糖基修饰剂发生偶联,获得糖基化修饰的组蛋白样品。
研究人员还发现,与不同组织或正常和异常状态相关的组蛋白与修饰不同。
在病理学研究领域,组蛋白的修饰变化和多种癌症的发生相关联,如乳腺癌和肝癌等。
这些变化有时是可逆的,并有可能是深层次修饰物的调控产物。
组蛋白翻译后修饰数据的处理和分析,伴随着革命性的Next Generation Sequencing技术的迅猛发展,也被强化,并且变得更加准确。
一系列分析工具包括FindPeaks、MACS、HOMER、ChIPseeker等已经被开发出来处理这些数据,便于特定修饰及其在基因表达调控机制中的作用的探知。
在多学科合作的前景下,以表观遗传学、分子生物学、细胞生物学等领域为基础的组蛋白修饰研究将不断深入发展,这些研究将为制定新的治疗策略和新药物发现提供支持。
例如,再生医学领域的研究者使用组蛋白的后修饰来促进干细胞分化成不同种类的细胞。
此外,还可应用组蛋白修饰在脑科学中,研究人员可以利用特定修饰来破解记忆的形成和调控机制。
总之,组蛋白翻译后修饰的研究在生物医学领域中具有重要的地位,对于深入了解基因表达和细胞分化的调控在疾病治疗中的应用,具有十分重要作用和意义。
蛋白质翻译后修饰对蛋白质功能的影响
蛋白质翻译后修饰对蛋白质功能的影响蛋白质是细胞内最重要的分子之一,其定制化的结构和功能使其成为生命体系的关键组成部分。
蛋白质在翻译过程中会经历多种修饰,这些修饰可以影响蛋白质的功能和稳定性。
本文将介绍蛋白质翻译后修饰对蛋白质功能的影响。
一、翻译后修饰的种类蛋白质翻译后修饰的种类非常多,其中包括磷酸化、甲基化、乙酰化、泛素化等。
这些修饰方式都是通过特定的酶对蛋白质上的氨基酸进行化学修饰而实现的。
修饰可以改变蛋白质的电性、亲水性、空间结构和化学属性等,在调节蛋白质的表现、功能和交互中起关键作用。
例如,磷酸化是最常见的修饰方式之一。
磷酸化可以改变蛋白质的电性和空间结构,从而调节蛋白质的活性和亲和性。
其他的修饰方式如乙酰化和泛素化则可以改变蛋白质的稳定性,防止其在细胞内被降解。
二、修饰对蛋白质功能的影响各种修饰方式对蛋白质功能的影响差异很大,且不同类型的修饰方式可以影响同一种蛋白质的不同功能。
下面将介绍几种常见的修饰方式及其影响。
1. 磷酸化磷酸化是最常见的修饰方式之一。
它可以改变蛋白质的电性和空间结构,使蛋白质发生构象变化,从而调节蛋白质的活性和亲和性。
例如,磷酸化可以激活一些酶类蛋白质,使其在反应中起催化作用。
而在细胞凋亡时,磷酸化则会促进蛋白质的降解和促进细胞死亡。
2. 乙酰化乙酰化是增加蛋白质稳定性的一种修饰方式。
这种修饰方式可以改变蛋白质的电性和化学属性,从而防止蛋白质在细胞内被降解。
例如组蛋白就在乙酰化反应中,从而增加它们在染色质结构中的稳定性。
3. 泛素化泛素化是被修饰的蛋白质被细胞内泛素酰化酶附加于肽链末端,使泛素与蛋白质共价结合的过程。
这个修饰过程不仅使被修饰蛋白质被自身细胞降解,而且还通过信号通路影响其它细胞过程。
这个修饰方式特别重要,因为它们是负责调控蛋白质降解的主要机制。
例如,某些蛋白质的泛素化可以促进其在细胞中的降解,从而减少不必要的代谢产物的堆积。
三、总结蛋白质翻译后的修饰对蛋白质的功能起着关键作用,不同类型的修饰方式对蛋白质功能的影响也不同。
蛋白组学翻译后修饰
先用糖苷内切酶消化,再用蛋白酶消化,通过 分析糖苷酶作用前后MS发生位移的肽段,即 可确定含糖基化的肽段 结合串联质谱,可进一步分析糖基化肽段的氨 基酸序列,从而发现糖基化位点
核糖核酸酶B中糖基化位点的分析
糖苷键酶F作用前
糖苷键酶F作用后 剩一个GlcNAc
氨基酸序列的测定
m/z=4792.23
翻译后化学修饰的生物学效应
泛素化对于细胞分化与凋亡、DNA 修复、免疫应 答和应激反应等生理过程起着重要作用; 磷酸化涉及细胞信号转导、神经活动、肌肉收缩 以及细胞的增殖、发育和分化等生理病理过程; 糖基化在许多生物过程中如免疫保护、病毒的复 制、细胞生长、炎症的产生等起着重要的作用; 脂基化对于生物体内的信号转导过程起着非常关 键的作用; 组蛋白上的甲基化和乙酰化与转录调节有关。
TSAASSSNYCNQM
RQHMDSSTSAASSSNYCNQ MMKSRNLTKDRCKPVNTF VHE
糖基化类型的分析
糖蛋白进行蛋白酶切,得到含糖肽段,对肽段直接 进行ESI-MS/MS,以及MALDI-TOF-MS的PSD, 可以直接得到单糖碎片,从而确定糖链结构。
凝集素在糖蛋白研究中的作用
真核生物的Ser,Thr,Tyr 残基. 原核生物的His,Asp,Glu
蛋白质组学在磷酸化分析中的困难
磷酸化蛋白质在细胞内的蛋白质中是相对较 低丰度的; 即使我们找到一种磷酸化蛋白质,也不能排 除有该蛋白质的其他磷酸化形式存在; 细胞内有很多磷酸酯酶,在样品处理时,这 些酶很容易将磷酸基团脱掉; 磷酸化蛋白质酶解后的磷酸化肽段,因为其 化学性质的负电性,在质谱技术中面临着难 以质子化的困难。
组蛋白的修饰及其在基因调控中的作用
组蛋白的修饰及其在基因调控中的作用组蛋白是染色体结构的重要组成部分,它们能够与DNA分子形成核小体。
组蛋白能够通过一系列的化学修饰来调节染色体结构和功能,影响DNA的转录和表达。
在这篇文章中,我们将探讨组蛋白的修饰以及它在基因调控中的作用。
一、组蛋白的修饰组蛋白的修饰主要包括翻译后修饰和核糖体蛋白(histone variant)替代。
翻译后修饰是指组蛋白通过化学修饰改变蛋白质的性质,包括乙酰化、甲基化、泛素化、磷酸化和丝氨酸/苏氨酸磷酸化等。
这些化学修饰能够改变组蛋白的电荷、结构和亲和力,调节染色体的结构和功能。
乙酰化是最常见的一种组蛋白修饰方式。
乙酰化改变组蛋白的电荷,使其变得更为亲水性,从而影响组蛋白的结构和功能。
甲基化则是另一种重要的修饰方式,它通过添加甲基基团改变组蛋白的结构和电子表现。
甲基化能够产生不同的效应,包括启动基因转录、沉默基因表达、维持基因沉默等。
除了翻译后修饰,核糖体蛋白(histone variant)替代也是组蛋白修饰的一种方式。
核糖体蛋白与核小体结构紧密相关,由于它们的不同序列和独特的性质,它们能够影响染色体的结构和功能。
二、组蛋白的修饰对基因调控的作用组蛋白的修饰对基因调控有着重要的作用。
在 DNA 转录和表达过程中,组蛋白修饰是一个重要的关键步骤。
不同的组蛋白修饰方式会对基因的转录和表达产生不同的影响。
例如,乙酰化能够促进染色体开放,使 RNA聚合酶更容易接触到需要转录的 DNA和核小体。
相反,去乙酰化能够使染色体更加紧密,阻碍基因的表达。
这就是为什么组蛋白乙酰化和去乙酰化在细胞增殖、凋亡和分化过程中发挥关键作用的原因之一。
组蛋白的甲基化是另一个影响基因调控的重要因素。
高度甲基化的组蛋白通常与基因沉默有关,而低度甲基化则通常与基因启动有关。
甲基化水平的变化可以调节基因表达的程度,影响细胞的分化和功能。
最近有研究表明,组蛋白衍生物在恶性肿瘤和其他疾病的发展中起着重要的作用。
生物大分子理论201年 硕士生课程 蛋白质翻译后修饰
真核生物蛋白质功能的一种主要调节机制。
特点及其意义
蛋白质翻译后修饰是调节蛋白质生物活性的重 要方式
蛋白质翻译后修饰异常导致人类众多的疾病 蛋白质翻译后修饰是蛋白质组研究的一个重要
内容
1、蛋白质翻译后修饰是调节蛋白生物活性的 重要方式
• MAPK信号通路介导的转录调控
• NF-κB信号通路
• 膜系统-胞核间的信号传导 JAKs and STATs
CREB的转录激活
Protein kinase A and DNA结合蛋白
MAPK信号通路介导的转录调控
MAPK信号通路介导的转录调控
膜系统-胞核间的信号传导 JAKs and STATs
• 组蛋白修饰种类
乙酰化--组蛋白乙酰化能选择性的使某些染色 质区域的结构从紧密变得松散,开放某些基因 的转录,增强其表达水平 。
甲基化-- 发生在H3、H4的 Lys 和 Arg 残基 上,可以与基因抑制有关,也可以与基因的激 活相关,这往往取决于被修饰的位置和程度。
磷酸化-- 发生在Ser 残基,一般与有丝分裂和 凋亡相关。
• 在老年痴呆和其它TAU异常导致的相关疾病中,各种因素(遗传因素、 代谢异常等)导致细胞内信号传导通路异常,磷酸化-去磷酸化之间 的动态平衡被打破,即大脑中某些的磷酸酶如PP2A蛋白水平下调,
继而导致TAU蛋白磷酸化水平升高,称为TAU的超磷酸化 (hyperphosphorylation);大脑葡萄糖摄取和代谢异常亦可导致
• 全美国约有四百万人被诊断为患有AD 。阿尔茨海默氏病 最常发生在 65 岁以上的人身上;但是,更年轻的人士也 可能患此病。当年龄超过 65 岁后,失智症患者的人数迅 速增加。2019 年,患有中度或重度记忆损伤的人数在 65 至 69 岁人群中为 4%,而在 85 岁以上的老年人中,该比 例则为 36%。在导致 65 岁以上老人死亡的原因中,AD 位居第九。
蛋白翻译后修饰
凋亡,从而最终发展成为癌细胞 .
2.5 磷酸化
DNA新陈代谢的研究中:细胞中DNA损伤可导致人的复制蛋 白 A(RPA)32 kD 亚基 N 端的过度磷酸化, 这有助于调控 DNA 的新陈代谢, 促进DNA 修复. 有数据显示, 过度磷酸化会 导致 RPA 构象改变 , 降低 DNA 复制的活性 , 但不会影响
泛素-蛋白酶系统是存在于所有真核生物细胞的调控
系统。降解过程中需要三种酶的参与: 泛素激活酶(E1)、
泛素结合酶(E2)和泛素蛋白质连接酶(E3)。泛素化降解
蛋白的过程中对蛋白的特异性识别依赖 E3. 由 E2s 和 E3s 介导的泛素化过程可以被去泛素化酶(DUBs)逆转.。
2.4 泛素化
目前发现的 DUBs 可分为两大类 : 泛素碳端水解酶 (ubiquitin C-terminal hydrolases,UCHs)和泛素特异性
DNA 的修复。
2.6 SUMO 化
SUMO为小泛素相关修饰物 (small ubiquitin- related modifier,SUMO)分子,是一种近年发现的泛素样分子,也参与 蛋白质翻译后修饰,但是不介导靶蛋白的蛋白酶体降解, 而 是可逆性修饰靶蛋白,参与靶蛋白的定位及功能调节过程。
3 研究方法及关键技术
蛋白酶 (ubiquitin-spicific processing proteases,
UBPs) ,两者都是半胱氨酸水解酶。泛素化降解蛋白 的过程中对蛋白的特异性识别依赖E3. 由E2s 和E3s 介导的泛素化过程可以被去泛素化酶 (DUBs)逆转通常 情况下, UCHs 主要水解羰基端的酯和泛素的氨基键,
2.3 糖基化
发生在高尔基体上:起始于丝氨酸和苏氨酸羟基 上连接N-乙酰半乳糖胺、N-乙酰葡萄糖胺、甘露糖及
蛋白质的翻译后修饰
蛋白质的翻译后修饰蛋白质是生物体内最为重要的分子之一,其功能与结构多种多样,而这些功能与结构的多样性与蛋白质的翻译后修饰密切相关。
在蛋白质翻译过程结束后,细胞内往往还需要对蛋白质进行进一步的后修饰,以实现其功能的发挥。
这些后修饰包括糖基化、磷酸化、乙酰化等,它们能够调节蛋白质的结构与功能,从而对细胞的生理过程发挥重要作用。
一、糖基化修饰糖基化修饰是指在蛋白质分子上附加糖基的过程。
这种修饰可以发生在蛋白质的Asn残基上,形成N-糖基化,也可以发生在蛋白质的Ser或Thr残基上,形成O-糖基化。
糖基化修饰能够调节蛋白质的稳定性、可溶性和定位,还可以影响蛋白质与其他分子的相互作用。
例如,MUC1蛋白质的糖基化修饰在肿瘤细胞的侵袭和转移中起到重要的调节作用。
二、磷酸化修饰磷酸化修饰是指在蛋白质分子上附加磷酸基团的过程。
磷酸化修饰通过蛋白激酶的作用来实现,它能够调节蛋白质的活性、稳定性和相互作用,影响蛋白质的信号传导、细胞周期和调控等生理过程。
例如,磷酸化修饰能够激活转录因子NF-κB,参与细胞对炎症和免疫反应的应答。
三、乙酰化修饰乙酰化修饰是指在蛋白质分子上附加乙酰基的过程。
这种修饰通常发生在蛋白质的赖氨酸残基上,通过乙酰转移酶来实现。
乙酰化修饰能够调节蛋白质的稳定性、DNA结合能力和转录调控活性,对细胞发育、增殖和分化等过程具有重要作用。
例如,乙酰化修饰通过调控组蛋白交换和染色质结构的紧凑性,影响基因的表达。
四、其他修饰形式除了糖基化、磷酸化和乙酰化修饰外,蛋白质的翻译后修饰还包括甲基化、泛素化、酰化等多种形式。
这些修饰过程能够进一步改变蛋白质的结构与功能,从而参与调控细胞内的生物学过程。
例如,泛素化修饰能够调节蛋白质的降解和稳定性,参与细胞凋亡和细胞周期控制。
总结蛋白质的翻译后修饰是细胞内多种生物学过程的关键环节,它能够调节蛋白质的结构与功能,从而对细胞的生理过程发挥重要作用。
糖基化、磷酸化、乙酰化以及其他形式的修饰能够改变蛋白质的特性,对细胞信号传导、基因表达和细胞周期等起到调控作用。
研究蛋白质翻译后修饰的机制和功能
研究蛋白质翻译后修饰的机制和功能蛋白质是构成生物体细胞的基本组成部分,其功能多种多样,包括参与代谢、传递信号、构建细胞结构等。
蛋白质的功能受到其修饰状态的影响,而这种修饰过程往往发生在翻译后的蛋白质分子上。
蛋白质翻译后修饰是指在蛋白质合成完成后,通过化学反应或酶催化等方式对蛋白质进行特定区域的修饰,从而改变蛋白质的结构和功能。
本文将从蛋白质翻译后修饰的机制和功能两方面对其进行深入探讨。
蛋白质翻译后修饰的机制是指蛋白质合成完成后,通过不同的修饰途径和机制对蛋白质进行特定的化学变化。
蛋白质翻译后修饰可以分为多种类型,包括磷酸化、甲基化、醋酰化、糖基化等。
其中,磷酸化是最常见的一种修饰方式,通常通过激酶催化蛋白质上的氨基酸残基与磷酸基团发生配位作用,从而改变蛋白质的结构和功能。
磷酸化修饰可以调节蛋白质的活性、稳定性和亚细胞定位,是细胞信号传导网络中重要的调控机制之一。
除了磷酸化修饰外,甲基化修饰也是一种常见的蛋白质翻译后修饰方式。
甲基化修饰通常通过甲基转移酶催化,将甲基基团添加到蛋白质的氨基酸残基上。
甲基化修饰可以影响蛋白质的稳定性、亚细胞定位以及与其他蛋白质的相互作用,从而调节蛋白质的功能。
研究表明,甲基化修饰在基因表达调控、染色质结构调节以及细胞周期调控等生命活动中发挥重要作用。
另外,醋酰化修饰也是一种重要的蛋白质翻译后修饰方式。
醋酰化修饰通常通过组蛋白脱乙酰酶催化,将乙酰基团添加到组蛋白的赖氨酸残基上。
醋酰化修饰可以调节染色质的结构和稳定性,影响基因的表达和染色质复制,从而在细胞发育和疾病发生中发挥作用。
研究表明,异常的组蛋白醋酰化修饰与癌症、心血管疾病等疾病的发生和发展密切相关,为相关疾病的治疗提供了新的靶点。
此外,糖基化修饰也是一种重要的蛋白质翻译后修饰方式。
糖基化修饰通常通过糖化酶催化,将糖基团添加到蛋白质的氨基酸残基上。
糖基化修饰可以调节蛋白质的生物活性、稳定性以及与其他分子的相互作用,影响蛋白质的功能和细胞信号传导。
组蛋白的修饰和沉默调控
组蛋白的修饰和沉默调控对于细胞内基因表达的调控,组蛋白修饰在其中起到了极为重要的作用。
组蛋白是染色质的主要组成成分之一,它能够紧密包裹DNA,使其难以被RNA聚合酶转录。
组蛋白修饰是指对组蛋白分子的翻译后修饰进行化学上的变化,如去乙酰、甲基化、乙酰化、泛素化等,通过这些修饰可以在染色质水平上调控基因的表达水平。
本文将分别从组蛋白的修饰和组蛋白的沉默调控两个方面,来详细介绍组蛋白的生物学意义。
一、组蛋白的修饰组蛋白修饰对基因表达的调控机理较为复杂,主要分为活化修饰、沉默修饰和无明显作用的修饰三类。
1.活化修饰组蛋白去乙酰化修饰一般会导致染色质松弛,从而利于基因的转录,是一种常见的活化修饰。
去乙酰化修饰的主要方法是通过组蛋白去乙酰化酶来实现。
例如,去乙酰化酶CBP/p300可以与转录因子联系,启动基因的转录过程。
组蛋白的泛素化修饰也可以在基因表达中起到一定的激活作用。
泛素化修饰不但可以促使氨基酸对间的体积变小,而且还能促进组蛋白的磷酸化,可以加速基因的转录。
2.沉默修饰组蛋白的甲基化修饰是一种常见的沉默修饰。
甲基化的方法是通过甲基转移酶来实现,主要是在某些位点上加上苯基-(CH3)3N+,从而使磷酸氢酯位点上的聚合酶不能与特定位置的DNA结合,导致基因沉默。
许多研究表明,甲基化的位点主要出现在CpG岛上。
3.无明显作用的修饰对于一些组蛋白修饰而言,它们本身对基因的表达没有直接的影响。
例如,组蛋白泛素化修饰就属于这种现象,虽然组蛋白的泛素化修饰可以激活特定的转录因子,但是这种修饰的活化效应不如组蛋白的去乙酰化修饰和甲基化修饰。
二、组蛋白的沉默调控组蛋白修饰不仅可以直接作用于基因表达,还可以通过与一些其他细胞分子相互作用来达到沉默调控的目的。
1.基因沉默修饰复合物基因沉默修饰复合物指的是某些特定物质将某些酶或蛋白质聚合在一起增加其工作效率的现象。
如通过某些蛋白质的缠绕、褶皱和定位,实现对特定位点的沉默,从而控制特定基因的表达。
蛋白质翻译后修饰——末端修饰(氨基末端、羧基末端)——加密版
蛋白质翻译后修饰——末端修饰(氨基末端、羧基末端)(~~by luckyboy)(微生物班、精简打印、元旦巨献版)在核糖体上翻译的时候,当氨基酸添加到新生多肽之后,在体内氨基酸残基会发生各种各样的共价修饰。
I、氨基端的修饰初生蛋白的第一个氨基酸的命运:在细菌中:在细菌中生物合成蛋白质的第一步一般是甲酰甲硫氨酰-tRNAfmet和第二个氨酰tRNA通过肽键合成,因此初生蛋白质存在一个甲酰甲硫氨酰位点。
在真核生物中:虽然N末端甲硫氨酰位点从第一个甲硫氨酸获取在成熟蛋白质中很常见,N末端的α-甲基一般很快会被移除,接着在大多数情况下甲硫氨酸残基会被断裂下来。
这个作用是依靠甲硫氨酸氨基肽酶的作用,并且这个裂解过程由第二个残基控制。
(1)在酵母中(啤酒酵母):如果倒数第二个氨基酸残基有一个0.129nm或更小的回转半径的时候,甲硫氨酸会被完完全全的裂解掉(这些氨基酸有:Gly, Ala, Ser, Cys, Thr, Pro, Val)(3)在真菌或哺乳动物的线粒体中:起始甲硫氨酸的不被去除,但在植物的线粒体中还是会发生的。
在工程菌中:在大肠杆菌中过量表达的蛋白质通过质粒技术会导致一种甲硫氨酸残基保留的不正常现象。
一、乙酰化1.N端a-乙酰基修饰(a-acetyl)在蛋白质中是很普遍的在Ehrlich ascite 细胞中:大概有80%的可溶蛋白是N端a-乙酰基修饰的。
在高等真核生物中:有证据表明在这些细胞中氨基酸末端乙酰化是非常普遍的,几乎可以作为高等真核生物蛋白质的一个典型标志。
在低等真核生物中:N端a-乙酰基的比例比较低,但还是存在的2. N端a-乙酰基化修饰通常是翻译中同时发生的,一般发生在新生肽链大约40个残基长的时候3.N端残基乙酰化修饰的频率(概率)是不同的:一般Ala,Ser > Met,Gly, Asp > Asn,lle,Thr,Val > 其他氨基酸残基(1)在高等真核生物中的蛋白质比细菌或真菌中的蛋白质更可能发生乙酰基修饰(2)在大肠杆菌中表达的真核细胞蛋白部分发生乙酰化。
组蛋白特点
组蛋白特点组蛋白是一类存在于细胞核中的蛋白质,它在维持染色质结构和调控基因表达中起着重要的作用。
组蛋白具有多个特点,通过这些特点,它能够实现对基因的调控和染色质的组织。
下面将详细解释组蛋白的特点,并从不同角度展开描述。
1. 多样性:组蛋白是一类多样性极高的蛋白质,它包括了不同种类的变体和亚型。
这些变体和亚型在氨基酸序列、翻译后修饰和功能上存在差异。
不同的组蛋白变体和亚型能够定位到染色质的不同区域,从而实现对基因表达的精确调控。
2. 翻译后修饰:组蛋白的氨基酸序列可以通过翻译后修饰来进行调控。
翻译后修饰包括乙酰化、甲基化、磷酸化等多种类型,这些修饰可以影响组蛋白的结构和亲水性,进而对其功能发挥起调控作用。
不同的翻译后修饰在不同的组蛋白上发生,从而实现对基因表达的时空调控。
3. DNA包装:组蛋白通过与DNA相互作用,参与了染色质的组织和DNA的包装。
组蛋白以八聚体形式结合在DNA上,形成核小体,多个核小体进一步组装形成染色质纤维。
这种紧密的包装方式可以有效地压缩DNA,从而使得细胞核内的大量DNA能够装载在有限的空间内。
4. 染色质可及性:组蛋白调控了染色质的可及性,即决定了基因是否可以被转录。
染色质中的一些区域会被特定的组蛋白修饰,使得这些区域对转录因子和其他调控蛋白的结合更加容易,从而促进基因的转录。
而染色质中的其他区域则会被特定的组蛋白修饰,使得这些区域对转录因子和调控蛋白的结合难度增加,从而抑制基因的转录。
5. 遗传稳定性:组蛋白参与了维持染色质结构和遗传稳定性的过程。
染色质在DNA复制和细胞分裂过程中需要保持结构的稳定性,以确保基因的正确复制和传递。
组蛋白通过与DNA相互作用,参与了染色质的复制和分离,从而维持了遗传信息的稳定性。
6. 转录调控:组蛋白通过与转录因子和其他调控蛋白相互作用,参与了基因的转录调控。
组蛋白的翻译后修饰状态和结构可以影响其与转录因子和其他调控蛋白的结合能力,从而调控基因的转录。
翻译后修饰蛋白组分析
翻译后修饰蛋白组分析蛋白质翻译后修饰(PTMs)是指蛋白质在翻译中或翻译后的化学修饰过程。
蛋白质翻译后修饰(PTMs)通过给蛋白质添加磷酸酯,乙酸酯,酰胺基或甲基等官能团增加蛋白质组的功能多样性,并影响正常细胞生物学和发病机理的几乎所有方面。
蛋白质翻译后修饰在许多细胞过程中起着关键作用,如细胞分化、蛋白质降解、信号传导和调节过程、基因表达调节以及蛋白质相互作用。
蛋白质翻译后修饰PTMs通常包括磷酸化,糖基化,泛素化,亚硝基化,甲基化,乙酰化,脂质化和蛋白水解。
因此,PTM的特征(包括修饰类别和修饰位点)在细胞生物学以及疾病诊断和预防研究中至关重要。
蛋白质翻译后修饰(PTMs)受许多因素影响,鉴定过程比较繁琐。
例如:大多数翻译后修饰水平很低。
因此,在鉴定之前必须对修饰蛋白进行富集。
此外,修饰的稳定性以及质谱的检测效率也是PTMs分析过程中的关键因素。
百泰派克生物科技搭建有高级的分析平台,可用于表征各种翻译后修饰(PTM)。
BTP-蛋白质翻译后修饰鉴定能够解决的生物学问题百泰派克公司采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF质谱平台,Orbitrap Fusion质谱平台,Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,为广大科研工作者提供磷酸化/糖基化/泛素化/乙酰化/甲基化/二硫键/亚硝基化等翻译后修饰鉴定。
蛋白质氨基酸序列的特定位置可以与化学基团或者小分子量的蛋白共价结合从而发生蛋白质翻译后修饰(post-translational modifications,PTMs),相较于没有发生修饰的蛋白,PTMs会导致特定序列分子量的增加。
在蛋白翻译后修饰方式的鉴定过程中,蛋白会首先被酶切成肽段,然后进入质谱进行分析;通过质谱分析,得到的是一系列肽段的分子质量信息。
对于某一个特定肽段而言,在没有发生任何翻译后修饰的情况下,其序列信息和分子量是确定的;蛋白质翻译后修饰方式鉴定示意图当它发生了某种翻译后修饰之后,例如磷酸化修饰,由于序列信息和分子量是确定的,磷酸根的分子量也是确定的;在质谱检测过程中发现其中的部分肽段的分子量刚好增加了一个磷酸根的分子量,假设这个肽段就发生了磷酸化修饰,再通过二级质谱图进行二次确认。
蛋白质翻译后修饰的生理和病理作用
蛋白质翻译后修饰的生理和病理作用蛋白质是生命体的重要组成部分,它通过不同的修饰形式发挥着重要的生理和病理作用。
蛋白质翻译后修饰是指在蛋白质翻译完成后,通过各种方式对蛋白质结构或功能的改变,包括糖基化、磷酸化、乙酰化、甲基化、泛素化等。
这些修饰可以调节蛋白质的稳定性、活性、局部化和相互作用,从而影响蛋白质的生理和病理过程。
1. 糖基化修饰糖基化修饰是指在蛋白质表面添加糖分子,形成糖蛋白。
这种修饰在细胞表面重要的生理过程中起着重要作用。
例如,糖蛋白在细胞信号传导、凝集素介导的细胞间相互作用等生理过程中都有着重要的作用。
同时,糖基化也参与到许多疾病的发生和发展中。
例如,糖尿病中的糖基化终产物可以引发炎症反应和细胞凋亡。
2. 磷酸化修饰磷酸化修饰是指向蛋白质添加磷酸基团,通过激酶和磷酸酶的相互作用实现。
磷酸化可以调控蛋白质的活性和相互作用。
例如,细胞周期中的多种丝裂原激活激酶等都是通过磷酸化调控蛋白质的活性。
同时,磷酸化还可以影响蛋白质的局部化,例如支持蛋白质在通道中的传输。
3. 乙酰化修饰乙酰化修饰是指向蛋白质添加乙酰基团,调节蛋白质的稳定性、局部化以及相互作用。
乙酰化和脱乙酰化作用相互抵消,调节着蛋白质的活性和功能。
例如核转录因子CREB和p53促进乙酰化增加蛋白质的稳定性,提高其转录和抑制活性。
4. 甲基化修饰甲基化修饰是指向蛋白质添加甲基基团,通过甲基转移酶的作用实现。
这种修饰可以调节蛋白质相互作用、定位和稳定性。
例如,组蛋白的赖氨酸残基甲基化或去甲基化调象整个染色质结构和转录调控。
5. 泛素化修饰泛素化修饰是指向蛋白质添加泛素蛋白质,实现泛素分子和特定的酶机构相互作用,调节蛋白质的降解和相互作用。
例如,泛素化可以将蛋白质定位到蛋白酶体或自噬溶酶体中。
综上所述,蛋白质翻译后修饰对于调节蛋白质的生理和病理过程起着至关重要的作用,这些过程缺陷往往会损害生命的重要机能,造成多种疾病,涉及到生物学从基础到临床的各个领域。
组蛋白翻译后修饰的类型
组蛋白翻译后修饰的类型组蛋白翻译后修饰的类型组蛋白和组蛋白翻译后修饰通过影响染色质的结构来调控基因的表达,目前已成为表观遗传学研究的焦点之一。
染色质是一系列核小体相互连接成的念珠状结构。
核小体的核心是由组蛋白H2A 、H2B、H3 、H4各两个分子构成的八聚体, 在八聚体的表面缠绕有圈的双螺旋DNA。
相邻的两个核小体之间由DNA连接, 称为纤丝(fiber), 在纤丝部位结合有组蛋白分子H1。
在组蛋白H1存在时,核小体之间紧密接触,形成直径为10nm的纤维状结构。
这就是染色体构型变化的一级结构。
在染色质中, DNA 和组蛋白是染色质的稳定成分,组蛋白与DNA的含量之比接近1∶1 。
组蛋白是染色质的主要蛋白质成分,通过带正电荷的氨基末端区域与带负电荷的DNA骨架相互作用, 对基因的表达有重要调控作用。
染色体活性调控的一个重要的机制是组蛋白的可逆共价修饰,通常容易发生在组蛋白H3和H4的N端尾部,组蛋白H2A和H2B的N和C末端,包括甲基化,乙酰化,磷酸化,ADP-核糖基化,泛素化和小分子类泛素化修饰,这些翻译后修饰可改变组蛋白与DNA之间的相互作用,影响调控复合物与染色质结合的能力及染色质重塑,进而影响着细胞的多种功能。
⒈甲基化组蛋白甲基化是由组蛋白甲基化转移酶(histonemethyltransferase,HMT)完成的。
甲基化可发生在组蛋白的赖氨酸和精氨酸残基上,而且赖氨酸残基能够发生单、双、三甲基化,而精氨酸残基能够单、双甲基化,这些不同程度的甲基化极大地增加了组蛋白修饰和调节基因表达的复杂性。
甲基化的作用位点在赖氨酸(Lys)、精氨酸(Arg)的侧链N原子上。
组蛋白H3的第4、9、27和36位,H4的第20位Lys,H3的第2、l7、26位及H4的第3位Arg都是甲基化的常见位点。
研究表明·,组蛋白精氨酸甲基化是一种相对动态的标记,精氨酸甲基化与基因激活相关,而H3和H4精氨酸的甲基化丢失与基因沉默相关。
组蛋白翻译后修饰在癌症中的作用
组蛋白翻译后修饰在癌症中的作用组蛋白是细胞核中的主要蛋白质之一,也是基因表达的关键因素。
组蛋白分子可以通过染色体的调控来影响基因的表达和功能。
在绝大多数情况下,组蛋白是在转录后发挥作用的。
然而,最近的研究表明组蛋白在转录之前就已经发挥了重要的功能,特别是在癌症中。
组蛋白翻译后修饰是一种细胞过程,其目的是调节基因表达。
这种修饰可以包括化学修饰,如甲基化、乙酰化和磷酸化等等。
这些修饰可以影响组蛋白的结构和功能。
这些化学修饰还可以吸引各种蛋白质结合组蛋白,以影响转录和基因表达。
组蛋白翻译后修饰的种类非常丰富,涉及到数百种化学修饰,它们可以通过不同的方式影响基因表达。
组蛋白翻译后修饰在癌症中的作用非常显著。
例如,研究表明,在许多癌症中,组蛋白的乙酰化水平显著增加。
这会导致染色体结构的变化,从而使基因表达失调。
另一方面,许多癌症的组织样本显示了非常明显的组蛋白甲基化缺失的现象。
因此,这些癌症细胞失去了正常的基因表达调控,导致基因的过度活化或抑制。
一些研究还发现了一些新的组蛋白翻译修饰,这些修饰与癌症发生和发展密切相关。
例如,组蛋白β紧密相关于肝癌、前列腺癌和骨髓瘤等癌症。
与此相似,组蛋白ε在乳腺癌中显示出高度表达。
这些结果表明,组蛋白翻译后修饰已经成为识别并治疗癌症的新颖标志物。
除了与癌症相关的生理作用,组蛋白翻译后修饰也在协调细胞发育和分化中发挥重要作用。
通过对组蛋白乙酰化和甲基化状态的调节,细胞可以通过调节特定基因的表达来识别和分化出成熟的细胞。
这为未来研究组蛋白修饰在癌症发展中的作用提供了重要线索。
总的来说,组蛋白翻译后修饰是调节基因表达的重要机制,对细胞生长和分化有着至关重要的影响。
最近的研究证明组蛋白翻译后修饰在癌症的发展中也发挥了至关重要的作用。
未来的研究将继续深入探讨组蛋白翻译后修饰如何调节癌症细胞生长和发展,以便更好地识别和治疗癌症。
蛋白质翻译后修饰对其生物活性的影响
蛋白质翻译后修饰对其生物活性的影响生物体内的蛋白质翻译后通常会被修饰,这些修饰会对蛋白质的结构和功能产生影响。
这些修饰可以是化学修饰或者结构调整,主要包括甲基化、磷酸化、酰化、硫化、糖基化等。
这些修饰是生物系统中重要的调节机制之一,在维持细胞内稳态、调控代谢和维持组织和器官功能中都扮演着至关重要的角色。
甲基化是最常见的修饰形式之一。
在蛋白质翻译后,甲基转移酶在特定位置上加上一个甲基基团,从而改变蛋白质的电荷分布和生物活性。
例如,在组蛋白质上甲基化可以影响到染色质的结构和DNA的可读性,从而影响基因表达和细胞功能。
在信号转导通路中,如ERK1/2磷酸化激酶,磷酸基团的添加可以改变其活性,而且经常用于细胞响应环境变化或刺激的过程。
磷酸化是另一种常见的修饰方式。
磷酸化是通过酪氨酸、苏氨酸和丝氨酸的磷酸化酶或激酶作用在蛋白质上加上一个磷酸基团。
这个修饰方式可以改变蛋白质的电子亲和力,从而影响其稳定性、相互作用和生物活性。
举例来说,磷酸化可以调节G蛋白偶联受体的细胞信号传导,从而影响细胞的增殖和分化。
很多细胞因子受体,如EGFR、FGFR,也可以通过磷酸化状态进一步调节其下游信号通路。
另一个重要的修饰方式是酰化。
酰化是通过不同类型的酰化酶和基因上的acyltransferase加上一个酰基基团的修饰。
这种修饰方式可以影响蛋白质的稳定性、亲和力和编码等性质。
举个例子,在转录因子中,去甲基化综合症蛋白(TET)可以通过酰化来调整转录因子的DNA结合活性,从而影响基因表达。
服务于激素呈现和识别的MHC类I分子,也需要酰化来满足其细胞识别和转运的功能。
除此之外,还有许多其他的化学修饰或结构调整,如硫化、糖基化、氧化和糖基化等。
不同的修饰方式可能会共同作用于一个蛋白质,共同影响其结构和功能。
例如,前列腺特异性抗原(PSA)是一个糖蛋白,它不仅在前列腺癌的诊断和预后中起关键作用,而且PSA的糖基化状态也与其生物活性密切相关。
蛋白翻译后修饰(研究生高级生化)
蛋⽩翻译后修饰(研究⽣⾼级⽣化)蛋⽩翻译后修饰(齐以涛⽼师)上课⽼师没说重点1.蛋⽩的概念:由许多氨基酸通过肽键相连形成的⾼分⼦含氮化合物。
2.蛋⽩后修饰概念和意义(PPT4-5)3.蛋⽩后修饰种类1. 切除加⼯2. 糖基化3. 羟基化4. 甲基化5. 磷酸化6. ⼄酰化7. 泛素化8. 类泛素化9. …200. …磷酸化修饰1.概念:磷酸化是通过蛋⽩质磷酸化激酶将ATP的磷酸基转移到蛋⽩的特定位点上的过程。
⼤部分细胞过程实际上是被可逆的蛋⽩磷酸化所调控的,⾄少有30%的蛋⽩被磷酸化修饰2.作⽤位点:丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸是主要的磷酸化氨基酸,⼤多数磷酸化蛋⽩质都有多个磷酸化位点,并且其磷酸化位点是可变的。
3.实例(MAPK途径):分裂原活化的蛋⽩激酶(MAPK)、分裂原活化的蛋⽩激酶的激酶(MAPKK)、分裂原活化的蛋⽩激酶的激酶之激酶(MAPKKK)。
在真核细胞中,这3种类型的激酶构成⼀个MAPK级联系统(MAPK cascade),通过MAPKKK-MAPKK-MAPK逐级磷酸化,将外来信号级联放⼤并传递下去。
具体过程如下:MAPKKK位于级联系统的最上游,能够通过胁迫信号感受器或者信号分⼦的受体,或者其本⾝就直接感受胞外信号刺激⽽发⽣磷酸化?MAPKKK磷酸化后变为活化状态,可以使MAPKK磷酸化?MAPKK始终存在于细胞质中,MAPKK磷酸化以后通过双重磷酸化作⽤将MAPK激活MAPK被磷酸化后有3种可能的去向:(1)停留在细胞质中,激活⼀系列其它的蛋⽩激酶(2)在细胞质中使细胞⾻架成分磷酸化(3)进⼊细胞核,通过磷酸化转录因⼦,调控基因的表达4.功能和意义:⼀:调节酶蛋⽩及⽣理代谢①糖分解代谢中糖原磷酸化酶活性的调节,被磷酸化的酶具有活性,去磷酸化的酶⽆活性②磷酸化或去磷酸化使胞内已存在酶的活性被激活或失活,调节胞内活性酶的含量⼆:调节转录因⼦活性转录因⼦通常包含DNA结合结构域和转录激活结构域.转录因⼦在转录激活结构域或调控结构域发⽣磷酸化,直接影响其转录活性. c-Jun转录激活结构域的两个丝氨酸残基磷酸化,正调控c-Jun的转录活性.三:调节转录因⼦核转位TGF-b与其I型、II型受体结合,结合后的TGF-b I型受体识别R-Smad包括Smad2和Smad3,作⽤于C末端的丝氨酸使其磷酸化⽽被激活,激活后的R-Smad与Smad4结合转⼊细胞核内,发挥转录调节活性NF-kB与其抑制因⼦IkB形成复合体时存在于胞质。
蛋白质表达过程中翻译后修饰作用的阐述
蛋白质表达过程中翻译后修饰作用的阐述蛋白质是生物体内最基本的功能分子之一,扮演着许多生命过程中重要的角色。
蛋白质的合成包括转录和翻译两个主要步骤。
在翻译过程中,mRNA的编码信息被转化成具有功能和结构的蛋白质。
然而,翻译仅仅是蛋白质合成的第一步,翻译后修饰则是决定蛋白质功能和结构的重要环节。
翻译后修饰是指蛋白质在翻译完成后,通过一系列的化学反应和修饰酶的作用,调整其结构和功能。
这些修饰可以包括磷酸化、甲基化、乙酰化、酰化和糖基化等不同类型的化学修饰。
下面将详细介绍其中的几种修饰作用。
一、磷酸化修饰磷酸化是蛋白质翻译后修饰中最常见的一种类型。
磷酸化修饰通过将磷酸基团添加到特定的氨基酸残基上,如丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸,改变蛋白质的电荷性质和结构,从而影响其功能和相互作用。
磷酸化修饰在细胞信号传导、基因表达调控和细胞凋亡等生物过程中起着重要的调控作用。
二、甲基化修饰甲基化修饰是一种将甲基基团添加到蛋白质氨基酸残基上的修饰方式。
这种修饰通常发生在赖氨酸、精氨酸和组氨酸残基上。
甲基化修饰可以调节蛋白质的结构和功能,影响其相互作用和定位。
举例来说,组蛋白的甲基化修饰在染色质结构和基因表达调控中起到了重要的作用。
三、乙酰化修饰乙酰化修饰是一种将乙酰基团添加到蛋白质氨基酸残基上的修饰方式。
乙酰化修饰常见于赖氨酸残基上。
乙酰化修饰可以改变蛋白质的电荷性质和结构,影响蛋白质的稳定性、活性和亲和力。
例如,组蛋白在染色质重塑和基因表达调控中的乙酰化修饰是非常重要的。
四、酰化修饰酰化修饰是一种将酰基团(如丁酰、戊酰等)添加到蛋白质氨基酸残基上的修饰方式。
酰化修饰可以调节蛋白质的结构和功能,改变其活性、稳定性和亲和力。
例如,转录因子的酰化修饰可以调控基因的表达水平。
五、糖基化修饰糖基化修饰是指将糖基团添加到蛋白质上的修饰方式。
糖基化修饰通常发生在赖氨酸、赖氨酸和苏氨酸残基上。
糖基化修饰可以影响蛋白质的稳定性、定位和相互作用。
组蛋白的主要修饰类型
组蛋白的主要修饰类型组蛋白是构成染色体的基本单位,形成纤维状结构。
组蛋白修饰是在基因转录调控、染色体构象变化、DNA复制和修复等基本生物学过程中起重要作用的一种生物化学修饰。
组蛋白修饰通常包括翻译后修饰和修饰后翻译两个步骤。
其中重要的是后续修饰,包括甲基化、乙酰化、泛素化、Phospho修饰、天冬氨酸酰化和葡萄糖甘酰化等。
其中,甲基化和乙酰化是最常见的组蛋白修饰种类之一。
一、组蛋白甲基化组蛋白甲基化是一种重要的翻译后修饰,影响染色质动态,参与细胞分化、基因表达调控和癌癌转化等过程。
组蛋白甲基化是通过甲基转移酶对组蛋白的赖氨酸残基进行甲基化,形成的酰胺结构。
不同的组蛋白甲基化状态在染色质功能上有不同的含义,例如,二甲基化的赖氨酸可以形成静默染色质的标志。
二、组蛋白乙酰化组蛋白乙酰化是一种广泛存在于真核生物中的翻译后修饰。
组蛋白乙酰化是由组蛋白乙酰转移酶对组蛋白赖氨酸残基进行乙酰化,形成一个酯键,同时将正电荷中心中的部分减少,影响染色质的构象和作用。
组蛋白乙酰化被认为是染色质“松弛”的标志之一,这种松弛状态有利于基因表达、DNA修复和DNA复制等过程的进行。
三、组蛋白泛素化组蛋白泛素化是一种重要的翻译后修饰。
这种修饰是通过酶系统将一个21kD的泛素蛋白共价连接到组蛋白分子上,形成共价酯键。
组蛋白泛素化可以产生不同的效应,包括染色质紧缩、染色质开放、DNA特异性修复和DNA复制。
除此之外,组蛋白泛素化还参与了DNA损伤应答、转录调控和染色质动态调节等生物学过程。
四、组蛋白Phospho修饰组蛋白phospho修饰是一种重要的后翻译修饰。
通过磷酸酶将磷酸基团附着在特定的残基上,从而产生组蛋白phospho修饰。
组蛋白Phospho修饰参与细胞周期、细胞增殖和转录调控等生物学过程。
五、组蛋白天冬氨酸酰化组蛋白天冬氨酸酰化是一种后翻译修饰。
这种修饰是通过组蛋白转移酶将天冬氨酸残基与乙酰CoA共同作用,形成氨基酸残基的酰化,从而产生组蛋白天冬氨酸酰化。
蛋白质翻译后修饰对生物学功能的影响分析
蛋白质翻译后修饰对生物学功能的影响分析蛋白质是生物体内最重要的分子之一,其参与了生命体系的各种生物学活动。
但是,生物体内产生的蛋白质都不是完整的,它们需要进行修饰后才能够发挥出正常的功能。
这种修饰过程被称为蛋白质翻译后修饰。
本文通过对蛋白质翻译后修饰的分析,探讨其对生物学功能的影响。
一、蛋白质翻译后修饰的常见类型蛋白质翻译后修饰分为多种类型,其中包括糖基化、磷酸化、甲基化、乙酰化等。
这些修饰过程都会改变蛋白质结构和功能。
糖基化是指蛋白质上的特定位点被糖基化酶催化生成糖链结构。
这种修饰过程在许多生物学过程中都是必要的。
例如,糖基化可加强蛋白质的稳定性,并提高蛋白质在细胞和组织中的拓展性。
磷酸化是指蛋白质中的酪氨酸、苏氨酸或苯丙氨酸残基上加上磷酸分子。
这种修饰过程在很多细胞信号传导途径中都扮演了关键角色。
例如,磷酸化作为一种可逆的修饰方式,能够调节蛋白质的空间构象,影响蛋白质与其他分子的相互作用关系。
甲基化是指蛋白质中存在的赖氨酸、精氨酸、组氨酸等位置发生甲基基团的加入。
这种修饰方式通常用于DNA修饰和染色质调控。
例如,组蛋白H3的赖氨酸甲基化能够改变染色质的结构,从而影响基因表达。
乙酰化是指蛋白质中的特定赖氨酸残基被乙酰基转移酶催化生成乙酰化基团。
这种修饰过程在蛋白质稳定性、功能和调节中都发挥着重要作用。
例如,某些转录因子在乙酰化修饰后,其转录激活能力会增强,从而调节基因表达。
二、蛋白质翻译后修饰对功能的影响蛋白质翻译后修饰对蛋白质的结构、功能和定位位置都会产生影响。
这种影响是多方面的,从蛋白质静态结构到其参与生命体系中的动态变化都会有所变动。
在蛋白质稳定性和折叠上,糖基化、磷酸化和乙酰化可以改变蛋白质的结构,从而影响其稳定性和折叠状态。
例如,磷酸化修饰通常会导致蛋白质的构象改变,使其变得更容易降解。
在刺激应答和信号传导上,蛋白质翻译后修饰能够影响特定蛋白质在细胞内的活性和定位。
例如,某些磷酸化对转录因子的修饰能够增强其DNA结合活性,增强其转录激活能力。
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组蛋白翻译后修饰的类型
组蛋白和组蛋白翻译后修饰通过影响染色质的结构来调控基因的表达,目前已成为表观遗传学研究的焦点之一。
染色质是一系列核小体相互连接成的念珠状结构。
核小体的核心是由组蛋白H2A 、H2B、H3 、H4各两个分子构成的八聚体, 在八聚体的表面缠绕有圈的双螺旋DNA。
相邻的两个核小体之间由DNA连接, 称为纤丝(fiber), 在纤丝部位结合有组蛋白分子H1。
在组蛋白H1存在时,核小体之间紧密接触,形成直径为10nm的纤维状结构。
这就是染色体构型变化的一级结构。
在染色质中, DNA 和组蛋白是染色质的稳定成分,组蛋白与DNA的含量之比接近 1∶1 。
组蛋白是染色质的主要蛋白质成分,通过带正电荷的氨基末端区域与带负电荷的DNA骨架相互作用, 对基因的表达有重要调控作用。
染色体活性调控的一个重要的机制是组蛋白的可逆共价修饰,通常容易发生在组蛋白
H3和H4的N端尾部,组蛋白H2A和H2B的N和C末端,包括甲基化,乙酰化,磷酸化,ADP-核糖基化,泛素化和小分子类泛素化修饰,这些翻译后修饰可改变组蛋白与DNA之间的相互作用,影响调控复合物与染色质结合的能力及染色质重塑,进而影响着细胞的多种功能。
⒈甲基化
组蛋白甲基化是由组蛋白甲基化转移酶(histonemethyltransferase,HMT)完成的。
甲基化可发生在组蛋白的赖氨酸和精氨酸残基上,而且赖氨酸残基能够发生单、双、三甲基化,而精氨酸残基能够单、双甲基化,这些不同程度的甲基化极大地增加了组蛋白修饰和调节基因表达的复杂性。
甲基化的作用位点在赖氨酸(Lys)、精氨酸(Arg)的侧链N原子上。
组蛋白H3的第4、9、27和36位,H4的第20位Lys,H3的第2、l7、26位及H4的第3位Arg都是甲基化的常见位点。
研究表明·,组蛋白精氨酸甲基化是一种相对动态的标记,精氨酸甲基化与基因激活相关,而H3和H4精氨酸的甲基化丢失与基因沉默相关。
相反,赖氨酸甲基化似乎是基因表达调控中一种较为稳定的标记。
例如,H3第4位的赖氨酸残基甲基化与基因激活相关,而第9位和第27位赖氨酸甲基化与基因沉默相关。
此外,H4—K20的甲基化与基因沉默相关,H3—K36和H3—K79的甲基化与基因激活有关。
但应当注意的是,甲基化个数与基因沉默和激活的程度相关。
⒉乙酰化
组蛋白乙酰化主要发生在H3、H4的N端比较保守的赖氨酸位置上,是由组蛋白乙酰转移酶和组蛋白去乙酰化酶协调进行。
组蛋白乙酰化呈多样性,核小体上有多个位点可提供乙酰化位点,但特定基因部位的组蛋白乙酰化和去乙酰化是以一种非随机的、位置特异的方式进行。
乙酰化可能通过对组蛋白电荷以及相互作用蛋白的影响,来调节基因转录。
早期对染色质及其特征性组分进行归类划分时就有人总结指出:异染色质结构域组蛋白呈低乙酰化,常染色质结构域组蛋白呈高乙酰化。
最近有研究发现,某些HAT复合物含有一些常见的转录因子,某些HDAC复合物含有已被证实的阻遏蛋白。
这些发现支持了高乙酰化与激活基因表达、低乙酰化与抑制基因表达有关的看法。
3.磷酸化
组蛋白H3在有丝分裂过程中,两个丝氨酸残基Ser10和Ser28发生了磷酸化作用。
Ser10磷酸化组蛋白H3首先出现在G2晚期的核周缘,Ser28磷酸化组蛋白H3紧随其后出现,两个位点的磷酸化在中期到达高峰,并扩展到染色体的所有部分。
当细胞有丝分裂进入后期和末期,组蛋白H3Ser28的磷酸化逐渐消退,而组蛋白H3Ser10磷酸化的荧光信号也逐渐从染色体上消失,此时在纺锤体中央部位出现Ser10磷酸化H3.研究结果表明,组蛋白H3Ser10和Ser28的磷酸化与细胞有丝分裂染色体的凝集和解凝集过程有着时间和空间上的相关性。
Ser10和Ser28这两个位点发生磷酸化作用,可使组蛋白H3氨基末端的正电荷数降低,改变了组蛋白一DNA间的相互作用,这可能是导致染色质变构凝集的原因之一。
根据激光共聚
焦显微分析表明,在有丝分裂后期和末期,Ser10磷酸化组蛋白H3的荧光信号出现在中体位置,在纺锤体中央形成梯状区带,随后凝集成点状成直线排列,和分开的两套染色体形成“三明治”样结构。
4.泛素化
组蛋白H2A在1975年被首次发现有泛素化修饰, 其泛素化修饰位点是高度保守的赖氨酸残基119 (K119)位点。
研究发现在大量高等真核生物中H2A总量的5%~15%被泛素化,除了在芽殖酵母中没有发现泛素化的组蛋白H2A(ubiquitinated-H2A,uH2A)以外, 在许多组织
和细胞中都发现有多聚泛素化(polyubiquitination)的H2A。
研究还发现, 组蛋白H2A的泛素化能够促进组蛋白H1与核小体的结合,促进多聚梳群蛋白(polycomb group protein)的沉默,还在X染色体失活的起始过程中有重要作用。
除了H2A以外,组蛋白H2B也可以被泛素化修饰。
尽管染色质中泛素化的组蛋白H2B量并不多,约占1%~2%,但是在从芽殖酵母到人类的真核生物中广泛分布。
研究还发现H2B的123位赖氨酸的泛素化还能影响H3的79位赖氨酸的甲基化。
5.组蛋白的其他修饰方式
相对而言,组蛋白的甲基化修饰方式是最稳定的,所以最适合作为稳定的表观遗传信息。
而乙酰化修饰具有较高的动态,另外还有其他不稳定的修饰方式,如腺苷酸化、ADP核糖基化等等。
这些修饰更为灵活的影响染色质的结构与功能,通过多种修饰方式的组合发挥其调控功能。
所以有人称这些能被专识别的修饰信息为组蛋白密码。
这些组蛋白密码组合变化非常多,因此组蛋白共价修饰可能是更为精细的基因表达方式。
另外,研究发现H2B的泛素化可以影响H3K4和H3K79的甲基化,这也提示了各种修饰间也存在着相互的关联。