亲权指数的计算 ppt课件

三、STR分型技术亲权关 系鉴定的标准
三联体判断
• 不对实验室的要求和分析技术体系的要求 进行总结，只总结STR分型结果。
• STR 分型结果符合下述条件者可做出否定 亲生关系的结论：
– 出现4个或更多矛盾 STR 基因座 – 累计PI值＜1／1000
三联体判断
• STR分型结果符合下述条件者可以描述为肯定或支持 亲生关系：
• 简化后PI=LR=争议父为生父的概率/随机男子为生父 的概率
1.父权指数与父权概率
• PI=LR=争议父为生父的概率/随机男子为生父的概率 • 若争议父为生父的概率=X • 随机男子为生父的概率=Y • PI=X/Y
• 父权概率W=X/(X+Y)=PI/(1+PI)
2.父权指数的计算
2.1三联体父权指数的计算 • PI=X/Y • X=嫌疑父基因频率*母亲基因频率*嫌疑父把基因遗传
故PI=1/（4q）
2.父权指数的计算
2.3双亲皆疑父权指数的计算
• PI=X/Y • X=孩子为嫌疑父与嫌疑母所生概率 • Y=孩子为随机男与随机母所生概率
二、PI算法与ITO算法
1.二者的描述
• 父权指数PI=LR=P(争议父为生父)/P(随机男子为生父)
• 亲缘关系指数=LR=P(该亲缘关系)/P(无亲缘关系)
母亲基因型 孩子基因型 嫌疑父基因 PI 型
PR
PQ
QS
PI=1/(2q)
PR
PQ
QQ
PI=q/2
PQ
PQ
QR
PI=1/[2(p+q)]
PQ
PQ
PQ
PI=1/(p+q)
例如第一种情况时
X=0.5*0.5+0*0 Y=0.5*q+0*p 故PI=1/（2q）
2.父权指数的计算
2.2二联体父权指数的计算
GeneMaker HID应用:
a.亲子鉴定（二联体、三联体亲子鉴定） b.亲缘关系鉴定（父子、同胞、半胞、祖孙、叔侄等亲缘关系） c.混合样本分析（用于犯罪现场和不明的人类遗骸等混合样本身份鉴定） d.细胞系鉴定
• PI=X/Y，母亲没有参加检验，基因型不确定，看成一 个随机个体。
孩子基因型
PQ PQ PQ QQ QQ
嫌疑父基因型
QR QQ PQ PQ QQ
PI
PI=1/(4q) PI=1/(2q) PI=1/(4p)+1/(4q) PI=1/(2q) PI=1/q
例如第一种情况时
X=0.5*p+0*q Y=pq+pq=2pq
• 起码检测15个来自百度文库TR基因座争议父与孩子之间没有发现 矛盾基因座；
• 或检测19个STR基因座只发现1个矛盾基因座； • 或检测28个STR基因座只发现2个矛盾基因座； • 或检测35个STR基因座只发现3个矛盾基因座； • 累计PI值≥10000，（亲权概率W≥0.9999假定前概
率＝0.5）
二联体判断
率＝0.5）
STR分型软件GeneMaker HID
GeneMaker HID为美国FBI认定的专家系 统，基于微卫星（STR）原理的DNA分型 分析技术，获得的图形数据，经过一系 列算法处理获得生物DNA特征数据。
美国FBI指定的13个STR位点及对 GeneMaker HID认定的网址
美国多位专家发文章将GeneMaker HID与同类软件进行比较，并 指出GeneMaker HID以其他软件相比可减少18%-73%分析工作量， 节约40%的时间。
• 两种算法之间的关系？？？ （PI为二联体时）
2.二者计算结果
3.结论
• A.两种算法在结果上具有一致性 • B.两种算法的生物学意义不同：
– ITO两个个体不赋予任何生物学意义。 – 二联体PI计算首先考虑了二者存在相同的等位
基因；若无相同的等位基因，在不考虑突变的 情况下，二者的关系是不成立的。
给孩子的概率*母亲把基因遗传给孩子的概率 • Y=嫌疑父基因频率*母亲基因频率*随即男子把基因遗
传给孩子的概率*母亲把基因遗传给孩子的概率
• 公式再进行简化： • X=嫌疑父把基因遗传给孩子的概率 • Y=随即男子把基因遗传给孩子的概率
2.父权指数的计算
2.1三联体父权指数的计算 • PI=X/Y
亲权指数的计算
一、父权指数的计算
1.父权指数与父权概率
• 父权概率：被检测男子与孩子之间不排除亲子关系时， 被检测男子是真正生父可能性的大小。（常用W表示）
• 父权指数：被检测男子与孩子之间不排除亲子关系时， 嫌疑男子作为生父的机会是随机男子的作为生父的机 会的多少倍。（常用PI表示）
• PI=似然比（LR）*前概率比 • (在没有明确的非遗传证据时,前概率比为0.5/0.5=1)
• STR 分型结果符合下述条件者可做出否定 亲生关系的结论：
– 出现3个或更多矛盾 STR 基因座 – 累计PI值＜1／1000
二联体判断
• STR分型结果符合下述条件者可以描述为肯定或支持 亲生关系：
• 起码检测18个STR基因座争议父与孩子之间没有发现 矛盾基因座；
• 或检测29个STR基因座只发现1个矛盾基因座； • 或检测41个STR基因座只发现2个矛盾基因座； • 累计PI值≥10000，（亲权概率W≥0.9999假定前概