DNA拷贝数的计算方法

DNA拷贝数的计算方法

分步推理如何计算核酸拷贝数

1A260吸光度值=dsDNA 50ug/ml=ssDNA 33ug/ml=ssRNA 40ug/ml

核酸浓度＝(OD260)×稀释倍数×(33 或40 或50)=ng/ul

MW 代表克/摩尔，单位dolton：1dolton 即表示1g/mol

1 摩尔=6.02×1023摩尔分子(拷贝数)

平均分子量(MW)：dsDNA=碱基数×660 道尔顿/碱基

ssDNA=碱基数×330 道尔顿/碱基

ssRNA=碱基数×340 道尔顿/碱基

得到拷贝数计算公式：6.02×1023拷贝数/摩尔×(浓度)/(MW g/mol)= copies/ml.

即(6.02×1023)×(g/ml)/(DNA length×660)=copies/ml.

或(6.02×1023)×(ng/ul×10-9)/(DNA length×660)=copies/ul.

例：3000 碱基质粒，浓度100 ng/ul

MW=3000bp×660dalton/bp=1.98×106daltons，即1mol=1.98×106g(100ng×10-9)g/1.98×106＝摩尔数

copy 数＝摩尔数×6.02×1023＝3×1010copies/ul.

1. dsDNA : (6.02×1023)×(ng/ul×10-9)/(DNA length×660)=copies/ul= (9.12×1011)×(ng/ul)/(DNA length)

2. ssDNA: (6.02×1023)×(ng/ul×10-9)/(DNA length×330)=copies/ul= (1.82×1012)×(ng/ul)/(DNA length)

3. ssRNA: (6.02×1023)×(ng/ul×10-9)/(DNA length×340)=copies/ul= (1.77×1012)×(ng/ul)/(DNA length)