2015-高级生物化学及实验技术试题答案

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高级动物生化试题

问答题:

1. 简述非编码RNA(non-coding RNA)的种类、结构特点及其主要功能。

非编码RNA的种类结构和功能

1 tRNA 转运RNA(transfer RNA,tRNA)

结构特征之一是含有较多的修饰成分,核酸部分修饰成分是在tRNA中发现的。修饰成分在tRNA分子中的分布是有规律的,但其功能不清楚。5’末端具有G(大部分)或C。3’末端都以ACC的顺序终结。有一个富有鸟嘌呤的环。有一个反密码子环,在这一环的顶端有三个暴露的碱基,称为反密码子(anticodon).反密码子可以与mRNA链上互补的密码子配对。有一个胸腺嘧啶环。tRNA具有三叶草型二级结构以及“L”型三级结构,tRNA的不同种类及数量可对蛋白质合成效率进行调节。tRNA负责特异性读取mRNA中包含的遗传信息,并将信息转化成相应氨基酸后连接到多肽链中。tRNA为每个密码子翻译成氨基酸提供了结合体,同时还准确地将所需氨基酸运送到核糖体上。鉴于tRNA在蛋白质合成中的关键作用,又把tRNA称作第二遗传密码。tRNA还具有其他一些特异功能,例如,在没有核糖体或其他核酸分子参与下,携带氨基酸转移至专一的受体分子,以合成细胞膜或细胞壁组分;

作为反转录酶引物参与DNA合成;作为某些酶的抑制剂等。有的氨酰-tRNA 还能调节氨基酸的生物合成。

2rRNA核糖体RNA(ribosomal RNA, rRNA)

核糖体RNA是细胞中最为丰富的RNA,在活跃分裂的细菌细胞中占80%以上。

他们是核糖体的组分,并直接参与核糖体中蛋白质的合成。核糖体是rRNA 提供了一个核糖体部的“脚手架”,蛋白质可附着在上面。这种解释很直接很形象,但是低估了rRNA在蛋白质合成中的主动作用。较后续的研究表明,rRNA并非仅仅起到物理支架作用,多种多样的rRNA可起到识别、选择tRNA 以及催化肽键形成等多种主动作用。例如:核糖体的功能就是,按照mRNA 的指令将氨基酸合成多肽链。而这主要依靠核糖体识别tRNA 并催化肽键形成而实现。可以说核糖体是一个大的核酶( ribozyme)。而核糖体的催化功能主要是由rRNA来完成的,蛋白质并没有直接参与。

3 tmRNA tmRNA主要包括12个螺旋结构和4个“假结”结构,同时还包括一

个可译框架序列的单链RNA结构。tmRNA中H1由5’端和3’端两个末端形成,与tRNA的氨基酸受体臂相似。H1和H2的5’部分之间有一个由10-13nt 形成的环,类似tRNA中的二氢尿嘧啶环,称为“D”环。H3和H4,H6和H7,H8和H9,H10和H11之间分别形成Pk1,pK2,pK3,pK4。H4和H5之间则由一段包含编码标记肽ORF的单链RNA连接。H12由5个碱基对和7nt 形成的环组成,类似tRNA中的TΨC臂和TΨC环,称为“T”环。tmRNA 结构按照功能进行划分可分为tRNA类似域(TLD)和mRNA类似域(MLD),TLD主要包括H1,H2,H12,“D”环和“T”环,MDL则包括ORF和H5,这两部分分别具有类似tRNA和mRNA的功能。tmRNA是一类普遍存在于各种细菌及细胞器(如叶绿体,线粒体)中的稳定小分子RNA。它具有mRNA分子和tRNA分子的双重功能,它在一种特殊的翻译模式——反式翻译模式中发挥重要作用。同时,它与基因的表达调控以及细胞周期的调控等生命过程密切相关,是细菌体蛋白质合成中起“质量控制”的重要分子之一。识别翻译或读码有误的核糖体,也识别那些延迟停转的核糖体,介导这些有问题

的核糖体的崩解。

4 核仁小RNA(snoRNA) 绝大多数snoRNA可归为两类boxC/D snoRNA和

box H/ACA snoRNA,均具有保守的特征二级结构,boxC/D snoRNA类能形成“发夹-铰链-发夹-尾部”状二级结构。boxC/D snoRNA其分子两端的box C,boxD以及末端配对序列能形成保守的“茎-环-茎”状二级结构,称为“K-turn”结构。大多数boxC/D snoRNA和box H/ACA snoRNA分别具有指导rRNA,snRNA或tRNA前体中特定核苷2’-O-核糖甲基化修饰与假尿嘧啶化修饰的功能;少部分snoRNA参与rRNA前体的加工剪切,与rRNA 的正确折叠和组装相关。

5 微RNA(microRNAs;miRNA,小分子RNA)它是一类长度为21~25 nt 的

单链RNA分子片段,有一个很有趣的共同特点,就是它的序列存在于茎环结构中的茎上。这种茎环结构通常是由70 多个核苷酸组成的不完全的发夹结构,上面有一些凸起和环状结构。茎部形成双链RNA ,但不是严格互补,可存在错配和GU摆动配对。据其作用模式的不同可以分为三类:第一类如lin4,与mRNA不完全互补,当miRNA与靶mRNA不完全配对结合时,主要影响其翻译过程而对mRNA的稳定性无影响。第二类如miR39 和miR171,与其靶mRNA完全互补,当其与mRNA完全配对结合后,分裂切割靶mRNA。第三类作用模式如let7,当其与靶RNA完全互补配对时,直接靶向切割mRNA,而不完全互补配对时起调节基因表达的作用。

6 小干扰RNA(Small interfering RNA;siRNA)siRNA是长度20到

25个核苷酸的双股RNA,在生物学上有许多不同的用途。目前已知siRNA 主要参与RNA干扰(RNAi)现象,以带有专一性的方式调节基因的表达。

此外,也参与一些与RNAi相关的反应途径,例如抗病毒机制或是染色质结

构的改变。其生理意义在于,生物的抗御机制,调控细胞分化与胚胎发育,维持基因组的稳定以及RNA 水平上的调控机制。

7 snRNA(小核RNA):它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体

(spilceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。另外,还有端体酶RNA(telomerase RNA),它与染色体末端的复制有关;以及反义RNA(antisense RNA),它参与基因表达的调控。还参与RNA剪接和RNA修饰。

8 eRNA eRNA从含子或DNA非编码区转录的RNA分子,精细调控基因的转

录和翻译效率。

9 SNP RNA 信号识别颗粒RNA,细胞质中与含信号肽mRNA识别,决定分

泌的RNA功能分子,它是一种核糖核酸蛋白复合体。能够识别并结合刚从游离核糖体上合成出来的信号肽,暂时中止新生肽的合成,又能与其在质网上的受体(即停靠蛋白质)结合而将新生肽转移入质网腔,防止蛋白水解酶对其损害

另外,还有端体酶RNA(telomerase RNA),它与染色体末端的复制有关;

以及反义RNA(antisense RNA),它参与基因表达的调控。还参与RNA剪接和RNA修饰。

10 gRNA又称引导RNA 真核生物中参与RNA编辑的具有与mRNA互补序列的

RNA ,具有3'寡聚U的尾巴,中间有一段与被编辑mRNA精确互补的序列,5'端是一个锚定序列,它同非编辑的mRNA序列互补。在编辑时,形成一个编辑体(editosome),以gRNAs部的序列作为模板进行转录物的校正, 同时产生编辑的mRNA。gRNA3'端的oligo(U)尾可作为被添加的U的供体。

11 piRNA piRNA主要存在于哺乳动物的生殖细胞和干细胞中,通过与

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