蛋白灰度分析软件使用
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(5)count/size---edit-----convert AOI to object---得出IOD 值
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(6)若测下一条带,则点NEW AOI 按钮,再按以上方法选 择AOI (7)可以count/size---view---measurement data 显示或 输出测量值
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Thank you
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百度文库
如图),保存为TIFF 格式文件。
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2. Image-Pro Plus 打开文件,剔除背景:
(1) 放大镜放大目的区域
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(2) Measure---calibration---intensity--options----image,选择背景最大value 值-----ok-------ok----system----close
蛋白灰度分析
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蛋白灰度分析软件
•蛋白灰度分析软件有:Image-Pro Plus,Quantity One,Image J 等~~ (1)Image-Pro Plus 综合性能最好,操作简便结果可靠!因为它 有强大的IOD 算法,能准确反应蛋白灰度~~但需要靠魔棒或轨迹法 选取目的蛋白区域,有一定的主观性,不过蛋白灰度测定本身就是 半定量分析-----测量值本身就没有一定标准,不同软件测量值不 同,即使相同软件重复测量数值也不一定相同,因此只要测定数值 能反应目的蛋白变化趋势,测量值相对偏差不大即可~~~
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(3)Measure---count/size---measure---select measurements, 选择IOD 为测量值, 调整结果显示方式:Options-label style 改为mesurement,选择 IOD 为显示值。
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(4)接下来有2 种方法选择目的蛋白区域(即找出 AOI,area of interest, IPP 核心元件):魔棒和 手绘轨迹法。
• ⅱ.等高线-手绘选取目的区域测定法:通过等高线或手绘选取目 的蛋白区域,最简便,但重复性不太好。
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(3)Image J 最坑爹,它用魔棒选取区 域测定灰度,可是有时很难选中所需区域, 而且方法繁琐,不推荐!!
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Image-Pro Plus 分析蛋白灰度教程
• 说明:目的蛋白的灰度=目的蛋白IOD 值/ 相应内参IOD 值 • 1. 使用Photoshop 剪切出目的区域(只含western bolt 条带,
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(2) Quantity One :有泳道-轨迹测定 法,等高线/手绘选取目的区域测定法等 方法
• ⅰ.泳道-轨迹测定法:先剔除一系列背景,再选择泳道(lane), 然后分析条带(band),最后使用高斯建模得出灰度分析值 (Gauss Model trace)特点:感觉比较科学,重复性好,但十 分繁琐,而且有时不能正确反应灰度。
(5)count/size---edit-----convert AOI to object---得出IOD 值
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(6)若测下一条带,则点NEW AOI 按钮,再按以上方法选 择AOI (7)可以count/size---view---measurement data 显示或 输出测量值
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如图),保存为TIFF 格式文件。
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2. Image-Pro Plus 打开文件,剔除背景:
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(2) Measure---calibration---intensity--options----image,选择背景最大value 值-----ok-------ok----system----close
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蛋白灰度分析软件
•蛋白灰度分析软件有:Image-Pro Plus,Quantity One,Image J 等~~ (1)Image-Pro Plus 综合性能最好,操作简便结果可靠!因为它 有强大的IOD 算法,能准确反应蛋白灰度~~但需要靠魔棒或轨迹法 选取目的蛋白区域,有一定的主观性,不过蛋白灰度测定本身就是 半定量分析-----测量值本身就没有一定标准,不同软件测量值不 同,即使相同软件重复测量数值也不一定相同,因此只要测定数值 能反应目的蛋白变化趋势,测量值相对偏差不大即可~~~
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(3)Measure---count/size---measure---select measurements, 选择IOD 为测量值, 调整结果显示方式:Options-label style 改为mesurement,选择 IOD 为显示值。
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(4)接下来有2 种方法选择目的蛋白区域(即找出 AOI,area of interest, IPP 核心元件):魔棒和 手绘轨迹法。
• ⅱ.等高线-手绘选取目的区域测定法:通过等高线或手绘选取目 的蛋白区域,最简便,但重复性不太好。
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(3)Image J 最坑爹,它用魔棒选取区 域测定灰度,可是有时很难选中所需区域, 而且方法繁琐,不推荐!!
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• 说明:目的蛋白的灰度=目的蛋白IOD 值/ 相应内参IOD 值 • 1. 使用Photoshop 剪切出目的区域(只含western bolt 条带,
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(2) Quantity One :有泳道-轨迹测定 法,等高线/手绘选取目的区域测定法等 方法
• ⅰ.泳道-轨迹测定法:先剔除一系列背景,再选择泳道(lane), 然后分析条带(band),最后使用高斯建模得出灰度分析值 (Gauss Model trace)特点:感觉比较科学,重复性好,但十 分繁琐,而且有时不能正确反应灰度。