生化技术复习资料
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生化制备概论
一制备主要对象及特点
蛋白质:易降解易变性多样性多种因素影响活性
核酸:分子量大,易被机械切割力破坏(基因组DNA)易降解(酶解)特别是RNA 常与核蛋白质结合
多糖:成分复杂多样,分析困难,糖苷同样也会被多种酶降解
脂类:种类多,成分复杂,分析仪器要求较高
二物质的提取与缓冲溶液
针对蛋白质的操作一般要注意的问题:
基本原则:防止生物分子变性、降解
1.控制适当的pH
2.控制低温
3.注意提取过程中的溶液环境
4.防止提纯过程中丟失一些辅助因子或亚基
1 低温0~4度。
2 缓冲溶液提取操作,适度的离子(盐)浓度。
3加保护剂\酶抑制剂,如巯基乙醇、DTT,,Vc,PVP,重金属络合剂,酶的底物蛋白酶抑制剂等等
4操作连续,尽量快速。
5 避免剧烈搅拌。
蛋白质的溶液提取(抽提)
水溶液提取:
大部分蛋白质均溶于水、稀盐、稀碱或稀酸溶液中。因此蛋白质的提取一般以水为主。
稀盐溶液和缓冲溶液对蛋白质稳定性好、溶度大,是提取蛋白质的最常用溶剂。
盐浓度
等渗盐溶液尤以0.02~0.05mol/L 磷酸盐缓冲液和碳酸盐缓冲液常用。
0.15mol/L 氯化钠溶液应用也较多。如6-磷酸葡萄糖脱氢酶用0.1mol/L 碳酸氢钠
液提取等。有时为了螯合某些金属离子和解离酶分子与其他杂质的静电结合,也
常使用枸橼酸钠缓冲液和焦磷酸钠缓冲液。有些蛋白质在低盐浓度下浓度低,如
脱氧核糖核蛋白质需用1mol/L 以上氯化钠液提取PH 值:
蛋白质提取液的PH 值首先应保证在蛋白质稳定的范围内,即选择在偏离等电点两侧。如碱性蛋白质则选在偏酸一侧,酸性蛋白质选择偏碱一侧,以增大蛋白质的溶解度,提高提取效果
●细胞破粹方法:1、高速组织捣碎:将材料剪小,放置于筒内约1/3体积,盖紧筒盖,
将调速器先拨至最慢处,开动开关后,逐步加速至所需速度。此法适用于动物内脏组织、植物肉质种子等
●2、玻璃匀浆器匀浆:先将剪碎的组织置于管中,再套入研杆来回研磨,上下移
动,即可将细胞研碎,此法细胞破碎程度比高速组织捣碎机为高,适用于量少和动物脏器组织。
●3、超声波处理法:用一定功率的超声波处理细胞悬液,使细胞急剧震荡破裂,此
法多适用于微生物材料,用大肠杆菌制备各种酶,常选用50-100 毫克菌体/毫升浓度,在1KG至10KG频率下处理10-15分钟,此法的缺点是在处理过程会产生大量
的热,应采取相应降温措施。对超声波敏感物质和核酸应慎用。
●4、反复冻融法:将细胞在-20度以下冰冻,室温融解,反复几次,由于细胞内冰粒
形成和剩余细胞液的盐浓度增高引起溶胀,使细胞结构破碎。
5、化学处理法:有些动物细胞,例如肿瘤细胞可采用十二烷基磺酸钠(SDS)、去
氧胆酸钠等细胞膜破坏,细菌细胞壁较厚,可采用溶菌酶处理效果更好。
6渗透冲击:用蒸馏水冲击细胞或经过高渗液处理(平衡)过的细胞,让细胞内容物释放出来
无论用哪一种方法破碎组织细胞,都会使细胞内蛋白质或核酸水解酶释放到溶液中,使大分子生物降解,导致天然物质量的减少,加入二异丙基氟磷酸(DFP)可以抑制或减慢自溶作用;加入碘乙酸可以抑制那些活性中心需要有疏基的蛋白水解酶的活性,加入对苯甲基磺酰氟(PMSF)也能清除蛋白水解酶活力,但不是全部。
表面活性剂的利用:
对于某些与脂质结合的蛋白质和酶,也有采用表面活性剂如胆酸盐及十二烷基磺酸钠等处理。表面活性剂有阴离子型(如脂肪酸盐、烷基苯磺酸盐及胆酸盐等),阳离子型(如氧化苄烷基二甲基铵等)及非离子型(Triton X-100 、NP-40等)、两性离子去污剂CHAPS、OBG等。其中CHAPS和SB3-10最好。非离子型表面活性剂比离子型温和,不易引起酶失活,使用较多。对于膜结构上的脂蛋白和结构,己广泛采用胆酸盐处理,两者形成复合物,并带上净电荷,由于电荷再排斥作用使膜破裂。近年来研究膜蛋白使用表面活性剂的稀溶液提取时,较喜欢用非离子型表面活性剂。
膜蛋白提取注意事项常用去垢剂:SDS Tween 20 40 …Triton X-100 CHAPS
三蛋白质的基本操作
盐析中性盐对蛋白质的溶解度有显著影响,一般在低盐浓度下随着盐浓度升高,蛋白质的溶解度增加,此称盐溶;当盐浓度继续升高时,蛋白质的溶解度不同程度下降并先后析出,这种现象称盐析
分段盐析,有机溶液沉淀
目的纯化浓缩保存
注意事项
影响盐析的因素有:(1)温度:除对温度敏感的蛋白质在低温(4度)操作外,一般可在室温中进行。一般温度低蛋白质溶解度降低。但有的蛋白质(如血红蛋白、肌红蛋白、清蛋白)在较高的温度(25度)比0度时溶解度低,更容易盐析。(2)pH值:大多数蛋白质在等电点时在浓盐溶液中的溶解度最低。(3)蛋白质浓度:蛋白质浓度高时,欲分离的蛋白质常常夹杂着其他蛋白质地一起沉淀出来(共沉现象)。因此在盐析前血清要加等量生理盐水稀释,使蛋白质含量在2.5-3.0%
。应用最多的硫酸铵,它的优点是温度系数小而溶解度大(25度时饱和溶液为4.1M,即767克/升;0度时饱和溶解度为3.9M,即676克/升),在这一溶解度范围内,许多蛋白质和酶都可以盐析出来;另外硫酸铵分段盐析效果也比其他盐好,不易引起蛋白质变性。硫酸铵溶液的pH常在4.5-5.5之间,当用其他pH值进行盐析时,需用硫酸或氨水调节。
样品保存
●溶液状态冷藏保、冷冻保存、液氮保存
●干粉状态真空干燥、喷雾干燥、冰冻干燥、脱脂样品、丙酮干粉
蛋白质含量的测定
变性不溶解蛋白质凯氏定氮法“可溶”蛋白质(蛋白质溶液)
1 双缩脲法(Biuret assay)
2 劳里反应(Lowry assay)Folin-酚法
3 巴福得测定法(Bradford assay )标准曲线
4 UV(紫外分光光度)法
●Absorbance assays
●Absorbance at 280 nm
–Range: 20 micrograms to 3 mg
–Volume: Depends on cuvette - volumes range from 200 microliters to 3 ml or greater
–Accuracy: Fair
–Convenience: Excellent, if equipment available
–Major interfering agents: Detergents, nucleic acids, particulates, lipid droplets
●Absorbance at 205 nm
–Range: Roughly 1 to 100 micrograms
–Volume: Depends on cuvette - volumes range from 200 microliters to 3 ml or greater
–Accuracy: Fair
–Convenience: Very good
–Major interfering agents: Detergents, nucleic acids, particulates, lipid droplets
●Colorimetric assays
●Modified Lowry
–Range: 2 to 100 micrograms
–Volume: 1 ml (scale up for larger cuvettes)
–Accuracy: Good