生物化学(人卫版)名词解释整理
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生物化学名词解释整理版
章节根据人民卫生出版社第7版《生物化学》划分
参考教学PPT、各教辅术后习题及试卷标准答案
整理录入/清水秋香
第一章蛋白质结构与功能
isoelectric point, pI:氨基酸的等电点:在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。Peptide bond:肽键。由一个氨基酸的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基脱水缩合而形成的酰胺键。
Glutathione,GSH:谷胱甘肽。由谷氨酸,半胱氨酸,甘氨酸组成的三肽。是体内重要的还原剂。
peptide unit:肽单元。参与肽键的6个原子Cα1、C、O、N、H、Cα2位于同一平面,Cα1和Cα2在平面上所处的位置为反式(trans)构型,此同一平面上的6个原子构成了所谓的肽单元。peptide plane:肽平面。肽链主链的肽键C-N具有部分双键的性质,因而不能自由的旋转,使连接在肽键上的六个原子共处于一个平面上,此平面称为肽单位平面,又称酰胺平面。通常是反式的。
α-helix:α-螺旋。常见的蛋白质二级结构之一。为具有最大氢键联系的右手螺旋,侧链伸向螺旋外侧,每3.6个氨基酸残基螺旋上升一圈,螺距0.54nm。
motif:模体。在一个或几个蛋白质中出现的2个或2个以上二级结构元件的不同折叠形式,又称折叠或超二级结构。也是在DNA中对特殊序列的描述。
zinc finger:锌指结构。一种常见的模体。由1个α-螺旋和2个反平行的β-折叠共3个肽段组成,形似手指, 能够结合锌离子,锌指具有结合DNA的功能。
Domain:结构域:大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或数个球状或纤维状的区域,折叠得较为紧密,各行使其功能,称为结构域(domain) 。
Molecular chaperon:分子伴侣。是细胞内一类可识别肽链的非天然构象、促进各功能域和整体蛋白质正确折叠的保守蛋白质。
Cooperativity:协同效应。一个寡聚体蛋白质的一个亚基与其配体结合后,能影响此寡聚体中另一个亚基与配体结合能力的现象,称为协同效应。
如果是促进作用则称为正协同效应
如果是抑制作用则称为负协同效应
allosteric effect:变构效应。蛋白质因与小分子物质相互作用而发生空间结构的改变,导致蛋白质功能的变化,称为变构效应。
Protein PI:蛋白质等电点。当蛋白质溶液处于某一pH时,蛋白质解离成正、负离子的趋势相等,即成为兼性离子,净电荷为零,此时溶液的pH称为蛋白质的等电点。Denaturation:蛋白质的变性。在某些物理和化学因素作用下,其特定的空间构象被破坏,即有序的空间结构变成无序的空间结构,从而导致其理化性质改变和生物活性的丧失。Renaturation:蛋白质的复性。若蛋白质变性程度较轻,去除变性因素后,蛋白质仍可恢复或部分恢复其原有的构象和功能
第二章核酸的结构与功能
gene基因:位于染色体上遗传基本单位或单元,是负载特定遗传信息的DNA片段,可以编码单个具有生物功能的产物,包括RNA和多肽链。
genome基因组:一个生物体的全部遗传信息,即DNA的全部核苷酸序列。但有些病毒是RNA。snmRNA:非mRNA小RNA,包括snRNA(核内小RNA),snoRNA(核仁小RNA),scRNA(胞质小RNA),催化性小RNA,siRNA(小片段干扰RNA)。这些小RNA在hnRNA和rRNA的转录后加工、转运以及基因表达过程的调控等方面有非常重要的生理作用。
DNA denature :DNA变性。双链DNA在变性因素(如加热、过酸性条件、过碱性条件等)影响下,解离成为两条单链的过程称之为DNA变性。
Hyperchromic effect增色效应:DNA变性时,双螺旋变得松解,碱基暴露,使得含有DNA的溶液在260nm的光吸收值升高的效应。
Tm解链温度:DNA在解链过程中,紫外吸光度的变化△A260达到最大变化值的一半时对应的温度称为DNA的解链温度。在此温度时,50%的DNA双链被打开。
renaturation复性:当变性条件缓慢地除去后,两条解离的互补链可重新配对,恢复原来的双螺旋结构,这一现象称为复性。
RNAi:RNA干涉。是由双链siRNA介导的抑制靶基因表达的现象。
annealing退火:变性的双链DNA经缓慢冷却后,两条互补链重新恢复天然的双螺旋构象的过程。
Nucleosome核小体:染色质的基本组成单位,由DNA和5种组蛋白组组成。各2分子的H2A,H2B,H3,H4共同构成了核小体的核心,DNA以左手螺旋的形式缠绕在这一核心上构成了核小体。
Hybridization核酸分子杂交:不同种类的DNA单链或RNA放在同一溶液中,只要两种单链分子之间存在这一定程度的碱基配对关系,他们就有可能形成杂化双链,这种现象称为核酸分子杂交。
第三章酶
Ribozyme:核酶。是具有催化作用的核糖核酸。
Km 米氏常数。是单底物反应中酶与底物可逆地生成中间产物和中间产物转化为产物这三个反应的速度常数的综合。米氏常数等于反应速度为最大速度一半时的底物浓度。Coenzyme:辅酶。结合酶中的辅助因子为小分子有机化合物称为辅酶。参与酶的催化过程。与酶蛋白共价结合的部分称为辅基。
Essential group:酶的必需基团。酶分子中氨基酸残基侧链的化学基团中,一些与酶活性密切相关的化学基团。分为结合基团和催化基团两类。
Active center活性中心:指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合并将底物转化为产物。
Isoenzyme,isozyme:同工酶。指催化相同化学反应,但酶蛋白的分子结构、理化性质乃至免疫学性质不同的一组酶。是由不同基因编码的多肽链,或同一基因转录生成的不同mRNA所翻译的不同多肽链组成的的蛋白质。
Optimum temperature最适温度:酶促反应速率最快时反应体系的温度称为酶促反应的最适温度。
Activator激活剂:使酶由无活性变为有活性或使酶活动性增加的物质称为酶的激活剂。Allosteric regulation:变构调节。代谢物与关键酶分子活性中心以外的某个部位可逆的结合,使酶发生变构而改变其催化活性的这种调节方式称为变构调节。
Chemical modification化学修饰:酶蛋白上的一些基团可与某种化学基团发生可逆的共价结合,从而改变酶的活性,这一过程称为酶的化学修饰。包括磷酸化与脱磷酸化,乙酰化与脱